一种治疗慢性支气管炎中药的机理分析方法与流程

技术特征：
1.一种治疗慢性支气管炎中药的机理分析方法，其特征在于，包括以下步骤：s1、以慢性支气管炎为关键字，对中药药方数据进行数据挖掘，获取合理的中药组合；s2、分别以中药组合的各种中药为关键字检索，得到中药活性成分及其中药相关靶点；s3、挖掘genecards数据库、omim数据库、ttd数据库，获取慢性支气管炎相关靶点；s4、将中药相关靶点与慢性支气管炎相关靶点进行向量交集intersect运算，得到中药
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慢性支气管炎共同靶点，并将中药
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慢性支气管炎共同靶点上传至string数据库以构建ppi网络，根据靶点间相互作用强度筛选得到核心靶点；s5、构建中药、活性成分、核心靶点、疾病之间的调控拓扑网络图，以从整体层面展现中药的作用路径；s6、将慢性支气管炎相关靶点输入metascape数据库分析，以分析生物学过程与代谢通路并进行富集分析，采用微生信在线平台对分析结果进行可视化；s7、将ppi网络中度值排名前n位的靶点与其对应的活性成分进行分子对接，根据docking score值评价靶点与活性成分的结合强度与活性；其中，n为大于1的整数。2.根据权利要求1所述的一种治疗慢性支气管炎中药的机理分析方法，其特征在于，所述步骤s1，具体包括：s11、从医院中药药方大数据中，以慢性支气管炎为关键字筛选出相关药方；s12、统计所有相关药方中各中药的出现频次，根据出现频次筛选出前10
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15％的目标中药；s13、对目标中药在所有相关药方中的出现情况进行标记，出现则标记为t，未出现则标记为f，以作为数据预处理文件；s14、采用数据挖掘软件spss modeler，选择apriori算法模型；在spss modeler软件中导入数据预处理文件，得到前项和后项；根据置信度、支持度进行从大到小排序，筛选出前m个置信度、支持度对应的前项和后项对应的中药，再结合聚类结果得出合理的中药组合；其中，m为大于1的整数。3.根据权利要求2所述的一种治疗慢性支气管炎中药的机理分析方法，其特征在于，所述步骤s2，具体包括：通过中药系统药理学数据库与分析平台tcmsp，分别以合理的中药组合中的各种中药为关键字检索中药活性成分；以口服生物利用度ob≥30％以及类药性dl≥0.18作为筛选标准进行活性成分筛选，得到活性成分及其作用的蛋白质靶点。4.根据权利要求3所述的一种治疗慢性支气管炎中药的机理分析方法，其特征在于，筛选结束后，为标准化蛋白质靶点信息，统一在uniport蛋白质数据库将活性成分作用的蛋白质靶点进行规范。5.根据权利要求3或4所述的一种治疗慢性支气管炎中药的机理分析方法，其特征在于，所述步骤s3，具体包括：以chronic bronchitis为关键词，挖掘genecards数据库、omim数据库、ttd数据库中治疗慢性支气管炎的潜在靶点，若靶点的数量大于目标阈值，则设定score大于中位数的靶点作为潜在靶点，合并各数据库靶点后删除重复值，得到慢性支气管炎相关靶点。6.根据权利要求5所述的一种治疗慢性支气管炎中药的机理分析方法，其特征在于，所述步骤s4，还包括：
根据中药
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慢性支气管炎共同靶点绘制veen图。7.根据权利要求5所述的一种治疗慢性支气管炎中药的机理分析方法，其特征在于，所述步骤s4，还包括：通过cytoscape v3.7.2中的mcode插件对ppi网络进一步分析，得到潜在蛋白质功能模块，并通过分析其参与的生物学进程对其功能进行描述。8.根据权利要求5所述的一种治疗慢性支气管炎中药的机理分析方法，其特征在于，所述步骤s5中，采用cytoscape v3.7.2绘制中药、活性成分、核心靶点、疾病之间的调控拓扑网络图。9.根据权利要求5所述的一种治疗慢性支气管炎中药的机理分析方法，其特征在于，所述步骤s6，具体包括：将慢性支气管炎相关靶点输入metascape数据库，设置p<0.01，分析其主要的生物学过程go与代谢通路kegg并进行富集分析；保存分析结果并采用微生信在线平台对分析结果进行可视化。10.根据权利要求1所述的一种治疗慢性支气管炎中药的机理分析方法，其特征在于，所述步骤s7中的分子对接，包括：根据ppi网络中度值排名前n位的靶点，查找其pdb id，登入systems dock web site将n个靶点与其对应的活性成分进行对接。

技术总结
本发明涉及一种治疗慢性支气管炎中药的机理分析方法，包括：S1、以慢性支气管炎对中药药方数据进行数据挖掘，获取合理的中药组合；S2、获取中药组合的各种中药的活性成分及中药相关靶点；S3、获取慢性支气管炎相关靶点；S4、将中药相关靶点与慢性支气管炎相关靶点进行交集，得到共同靶点，并构建PPI网络，筛选核心靶点；S5、构建中药、活性成分、核心靶点、疾病之间的调控拓扑网络图，以从整体层面展现中药的作用路径；S6、将慢性支气管炎相关靶点输入Metascape数据库分析，以进行富集分析；S7、分子对接，并评价靶点与活性成分的结合强度与活性。本发明提升了慢性支气管炎中药机理分析的可靠性、准确性。准确性。准确性。


技术研发人员：杨勇 沈坤龙 孙芳芳
受保护的技术使用者：杭州电子科技大学
技术研发日：2021.06.29
技术公布日：2021/10/15