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水稻稻瘟病抗性基因Pid3-A4的KASP分子标记开发及其应用的制作方法

2021-10-24 09:55:00 来源:中国专利 TAG:稻瘟病 水稻 抗性 基因 及其应用

技术特征:
1.一种水稻稻瘟病抗性基因pid3

a4的kasp分子标记,其特征在于:所述kasp分子标记为kasp

a4,所述kasp

a4为基于水稻基因组中的一个snp位点而开发的kasp引物,且kasp

a4的多态性为t或a。2.根据权利要求1所述的kasp分子标记,其特征在于,所述kasp分子标记的多态性位点位于chr6.13058850。3.一种用于检测根据权利要求1所述的kasp分子标记kasp

a4的引物组,其特征在于,所述引物组包括正向引物和反向引物,所述正向引物包括primer x和primer y,所述反向引物包括primer r,其中,所述primer x的核苷酸序列如seq id no.1所示;所述primer y的核苷酸序列如seq id no.2所示;所述primer r的核苷酸序列如seq id no.3所示。4.根据权利要求3所述的引物组的应用,其特征在于,所述应用包括:在鉴定或辅助鉴定水稻稻瘟病抗性中的应用;或,在制备鉴定或辅助鉴定抗稻瘟病水稻产品中的应用;或,在水稻辅助育种或制备水稻辅助育种产品中的应用;或,在选育抗稻瘟病的水稻资源中的应用。5.一种根据权利要求1所述的kasp分子标记的检测方法,其特征在于,所述检测方法包括以下步骤:s10,设计并选择引物primer x、primer y以及primer r;s20,从水稻叶片中提取引物primer x、primer y以及primer r对应的基因组dna;s30,以提取的所述基因组dna为模板,利用snp分子标记kasp

a4的引物primer x、primer y以及primer r,对kasp

a4分子标记进行kasp反应测试;s40,若所述待测水稻的扩增产物的荧光信号数据经douglas基因分型软件分析靠近x轴,则待测水稻基因组中kasp

a4引物的基因型为t/t纯合型,水稻为抗稻瘟病或者候选为抗稻瘟病;若待测水稻的扩增产物的荧光信号数据经douglas基因分型软件分析靠近y轴,则待测水稻基因组中kasp

a4引物的基因型为a/a纯合型,水稻为稻瘟病或者候选为稻瘟病;若待测水稻的扩增产物的荧光信号数据经douglas基因分型软件分析位于x轴和y轴中间,则待测水稻基因组中kasp

a4引物的基因型为t/a杂合型,水稻为抗稻瘟病或者候选为抗稻瘟病。6.根据权利要求1或2所述的kasp分子标记的应用,其特征在于,所述应用包括:在鉴定或辅助鉴定水稻稻瘟病抗性中的应用;或,在制备鉴定或辅助鉴定抗稻瘟病水稻产品中的应用;或,在水稻辅助育种或制备水稻辅助育种产品中的应用。或,在选育抗稻瘟病的水稻资源中的应用。7.根据权利要求6所述的kasp分子标记的应用,其特征在于,在水稻辅助育种或制备水稻辅助育种产品中的应用中,选择kasp

a4引物的基因型为t/a或t/t的水稻进行辅助育种或制备辅助育种产品。8.根据权利要求6所述的kasp分子标记的应用,其特征在于,在选育抗稻瘟病的水稻资源中的应用中,选择kasp

a4引物的基因型为t/a或t/t的水稻进行育种。
9.一种试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括核苷酸序列如seq id no.1

3所示的引物。10.一种基因芯片,其特征在于,所述基因芯片包括核苷酸序列如seq id no.1

3所示的引物。

技术总结
本发明提供了一种水稻稻瘟病抗性基因Pid3


技术研发人员:马江涛 颜光华
受保护的技术使用者:华美瑞康(北京)国际生物技术研究院有限公司
技术研发日:2021.08.23
技术公布日:2021/10/23
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