具有细胞壁的生物的存在状态的判定方法以及具有细胞壁的生物的鉴定方法与流程

技术特征：

1.具有细胞壁的生物的存在状态的判定方法，所述方法包括：

将测定试样浸泡在水性溶剂中制作液体试样，或将作为水性溶剂的测定试样以液体试样的形式准备，和

检测所述液体试样中的1种或多种sRNA的存在状态，

基于所述1种或多种sRNA的存在状态来判定具有细胞壁的生物的存在状态。

2.如权利要求1所述的判定方法，其中，所述1种或多种sRNA在所述具有细胞壁的生物中表现出特异性的表达状态。

3.如权利要求1或权利要求2所述的判定方法，其中，判定所述具有细胞壁的生物的存在状态包括判定具有细胞壁的2种以上的生物的总体的存在状态。

4.如权利要求1～权利要求3中任一项所述的判定方法，其中，检测所述sRNA的存在状态包括检测所述sRNA的丰度。

5.如权利要求1～权利要求4中任一项所述的判定方法，其中，所述具有细胞壁的生物包括选自由大肠杆菌、弗氏柠檬酸杆菌以及鸡沙门氏菌组成的组中的至少1种。

6.如权利要求1～权利要求4中任一项所述的判定方法，其中，所述具有细胞壁的生物包括植物。

7.如权利要求1～权利要求4中任一项所述的判定方法，其中，所述具有细胞壁的生物包括维罗毒素生产菌。

8.如权利要求1～权利要求7中任一项所述的判定方法，其中，所述测定试样为收集空气悬浮物而得的测定试样，判定所述具有细胞壁的生物的存在状态包括判定存在于空气中的具有细胞壁的生物的存在状态。

9.如权利要求1～权利要求8中任一项所述的判定方法，其中，在0℃～50℃的温度范围内的温度实施所述浸泡。

10.如权利要求1～权利要求9中任一项所述的判定方法，其中，所述1种或多种sRNA各自的碱基数在5～500的范围内。

11.如权利要求1～权利要求10中任一项所述的判定方法，其中，所述1种或多种sRNA包括选自由具有序列号1所示的核苷酸序列的EC-5p-36、具有序列号2所示的核苷酸序列的EC-3p-40、具有序列号11所示的核苷酸序列的EC-5p-79、具有序列号12所示的核苷酸序列的EC-3p-393、具有序列号10所示的核苷酸序列的fox_milRNA_5、具有序列号4所示的核苷酸序列的miR156以及具有序列号5所示的核苷酸序列的miR716b组成的组中的至少1种。

12.如权利要求1～权利要求11中任一项所述的判定方法，其中，所述水性溶剂包括核酸扩增用试剂。

13.如权利要求1～权利要求12中任一项所述的判定方法，其中，通过等温基因扩增实施对所述1种或多种sRNA的存在状态的检测。

14.如权利要求13所述的判定方法，其中，于10℃～40℃的温度范围内的温度实施所述等温基因扩增。

15.如权利要求1～权利要求12中任一项所述的判定方法，其中，通过PCR实施对所述1种或多种sRNA的存在状态的检测。

16.具有细胞壁的生物的鉴定方法，所述方法包括：

将测定试样浸泡在水性溶剂中制作液体试样，或将作为水性溶剂的测定试样以液体试样的形式准备；和

检测所述液体试样中的1种或多种sRNA的存在状态，

基于所述1种或多种sRNA的存在状态来鉴定存在于所述测定试样中的具有细胞壁的生物。

17.如权利要求16所述的鉴定方法，其中，所述1种或多种sRNA表现出与具有细胞壁的生物相对应的特异性的表达状态。

18.如权利要求16或权利要求17所述的鉴定方法，其中，鉴定存在于所述测定试样中的具有细胞壁的生物包括鉴定2种以上候选生物中的1种以上存在。

19.如权利要求16～权利要求18中任一项所述的鉴定方法，其中，检测所述sRNA的存在状态包括检测所述sRNA的丰度。

20.如权利要求16～权利要求19中任一项所述的鉴定方法，其中，所述测定试样为收集空气悬浮物而得的测定试样，鉴定所述具有细胞壁的生物包括鉴定存在于空气中的具有细胞壁的生物。

21.如权利要求16～权利要求20中任一项所述的鉴定方法，其中，于0℃～50℃的温度范围内的温度实施所述浸泡。

22.如权利要求16～权利要求21中任一项所述的鉴定方法，其中，所述1种或多种sRNA各自的碱基数在5～500的范围内。

23.如权利要求16～权利要求22中任一项所述的鉴定方法，其中，所述1种或多种sRNA包括选自由具有序列号1所示的核苷酸序列的EC-5p-36、具有序列号2所示的核苷酸序列的EC-3p-40、具有序列号11所示的核苷酸序列的EC-5p-79、具有序列号12所示的核苷酸序列的EC-3p-393、具有序列号10所示的核苷酸序列的fox_milRNA_5、具有序列号4所示的核苷酸序列的miR156以及具有序列号5所示的核苷酸序列的miR716b组成的组中的至少1种。

24.如权利要求16～权利要求23中任一项所述的鉴定方法，其中，所述水性溶剂包括核酸扩增用试剂。

25.如权利要求16～权利要求24中任一项所述的鉴定方法，其中，通过等温基因扩增实施对所述1种或多种sRNA的存在状态的检测。

26.如权利要求25所述的鉴定方法，其中，于10℃～40℃的温度范围内的温度实施所述等温基因扩增。

27.如权利要求16～权利要求24中任一项所述的鉴定方法，其中，通过PCR实施所述1种或多种sRNA的存在状态的检测。

技术总结
具有细胞壁的生物的存在状态的判定方法，所述方法包括：将测定试样浸泡在水性溶剂中制作液体试样，或将作为水性溶剂的测定试样以液体试样的形式准备；和检测前述液体试样中的1种或多种sRNA的存在状态，基于前述1种或多种sRNA的存在状态来判定具有细胞壁的生物的存在状态。具有细胞壁的生物的鉴定方法，所述方法包括：将测定试样浸泡在水性溶剂中制作液体试样，或将作为水性溶剂的测定试样以液体试样的形式准备；和检测前述液体试样中的1种或多种sRNA的存在状态，基于前述1种或多种sRNA的存在状态来鉴定存在于前述测定试样中的具有细胞壁的生物。

技术研发人员：藤井亮太;
受保护的技术使用者：三井化学株式会社;
技术研发日：2020.03.04
技术公布日：2021.10.22