抗前-S1HBV抗体的制作方法

抗前
‑
s1 hbv抗体
1.本发明是申请日为2016年05月23日、申请号为201680029377.7、发明名称为“抗前
‑
s1 hbv抗体”的分案申请。


背景技术：

2.三分之一以上的世界人口已感染b型肝炎病毒(hbv)，且240百万人目前受长期感染。hbv感染和相关疾病导致每年约一百万人死亡。
3.hbv的表面抗原由大(l)、中(m)和小(s)蛋白构成。与仅具有s结构域的s蛋白相比，l和m蛋白在其n末端具有额外结构域。l含有前
‑
s1,前
‑
s2和s结构域；m含有前
‑
s2和s结构域；s蛋白仅含s结构域。l蛋白中的前
‑
s1结构域是在人类肝细胞表面上表达的hbv受体的靶分子，且业内已报道针对hbv的前
‑
s1结构域的抗体，例如瓦特史(watashi)等人，国家分子科学杂志(int.j.mol.sci.)2014,15,2892
‑
2905,参考文献22
‑
27。相关文献包括wo2013159243a1中的hbv受体、us 7115723中的来自小鼠杂交瘤的人类化抗体kr127和us7892754中的前
‑
s1肽的描述。


技术实现要素：

4.本发明提供通过抑制hbv和/或hdv进行免疫活化的方法和组合物。在一个方面中，本发明提供抗体抗原结合结构域，其特异性结合hbv前
‑
s1且包含呈选自如下(a)
‑
(r)的组合的互补决定区(cdr)1、cdr2和cdr3，其中衍生出cdr组合的抗体(ab)、重链(hc)或轻链(lc)和cdr命名系统(卡巴(kabat)、imgt或复合系统)显示于第一列中，且粗体文字中的残基是卡巴系统，且加下划线的残基是imgt系统：
5.独特hbv前
‑
s1特异性抗体的hcdr
6.[0007][0008]
衍生自2h5 vh链改组文库的抗体的hcdr
[0009]
mabshcdr1hcdr2hcdr3
编号4 vhgdsvssksvtwnrtyyrskwfndyavsarakmggmdv k：seq id no：101，res 6
‑
12k：seq id no：102k：seq id no：103，res 3
‑
10 i：seq id no：101，res.1
‑
10i：seq id no：102，res.2
‑
10i：seq id no：103 c：seq id no：101c：seq id no：102c：seq id no：103编号31 vhgdsvssnsaawnrtyyrskwyndyavstrqswhgmev k：seq id no：104，res 6
‑
12k：seq id no：105k：seq id no：106，res 3
‑
10 i：seq id no：104，res.1
‑
10i：seq id no：105，res.2
‑
10i：seq id no：106 c：seq id no：104c：seq id no：105c：seq id no：106编号32 vhgdsvssnsaawnrtyyrskwyndyavsarsiatgtdy k：seq id no：107，res 6
‑
12k：seq id no：108k：seq id no：109，res 3
‑
10 i：seq id no：107，res.1
‑
10i：seq id no：108，res.2
‑
10i：seq id no：109 c：seq id no：107c：seq id no：108c：seq id no：109编号69 vhgdsvsssratwnrtyyrskwfndyavsarakmggmdv k：seq id no：110，res 6
‑
12k：seq id no：111k：seq id no：112，res 3
‑
10 i：seq id no：110，res.1
‑
10i：seq id no：111，res.2
‑
10i：seq id no：112 c：seq id no：110c：seq id no：111c：seq id no：112a14 vhgdsvssnsaawnrtyyrskwyndyav8argtrwgmdv k：seq id no：113，res 6
‑
12k：seq id no：114k：seq id no：115，res 3
‑
10 i：seq id no：113，res.1
‑
10i：seq id no：114，res.2
‑
10i：seq id no：115 c：seq id no：113c：seq id no：114c：seq id no：115a21 vhgdsvssnsaawnrtyyrskwyndyavsarakvygvdv k：seq id no：116，res 6
‑
12k：seq id no：117k：seq id no：118，res 3
‑
10 i：seq id no：116，res，1
‑
10i：seq id no：117，res.2
‑
10i：seq id no：118 c：seq id no：116c：seq id no：117c：seq id no：118b103 vhgdsvssksatwnrtyyrsrwfndyavsargnmgamdv k：seq id no：119，res 6
‑
12k：seq id no：120k：seq id no：121，res 3
‑
10 i：seq id no：119，res.1
‑
10i：seq id no：120，res.2
‑
10i：seq id no：121 c：seq id no：119c：seq id no：120c：seq id no：121b129 vhgdrvssnraawnrtyyrsqwyndyavsargtamg
‑
da k：seq id no：122，res 6
‑
12k：seq id no：123k：seq id no：124，res 3
‑
9 i：seq id no：122，res.1
‑
10i：seq id no：123，res.2
‑
10i：seq id no：124 c：seq id no：122c：seq id no：123c：seq id no：124b139 vhgdsvssnsaawnrtyyrskwyndyavsarqasngfdi k：seq id no：125，res 6
‑
12k：seq id no：126k：seq id no：127，res 3
‑
10 i：seq id no：125，res，1
‑
10i：seq id no：126，res.2
‑
10i：seq id no：127 c：seq id no：125c：seq id no：126c：seq id no：127b172 vhgdsvssnsaawnrtyyrskwyndyavsarqgttgfdy
[0010] k：seq id no：128，res 6
‑
12k：seq id no：129k：seq id no：130，res 3
‑
10 i：seq id no：128，res.1
‑
10i：seq id no：129，res.2
‑
10i：seq id no：130 c：seq id no：128c：seq id no：129c：seq id no：130
[0011]
衍生自a14 vl链改组文库的抗体的hcdr
[0012]
mabslcdr1hcdr2hcdr3编号8 vhsgsssnignyyvswydnakrpsqsydnslsgiv k：seq id no：131k：seq id no：132k：seq id no：133
ꢀ
i：seq id no：131，res.4
‑
11i：seq id no：132，res.1
‑
3i：seq id no：133 c：seq id no：131c：seq id no：132c：seq id no：133编号20 vlsgtssnigskyvywytndqrpsqsydsslravv k：seq id no：134k：seq id no：135k：seq id no：136 i：seq id no：134，res.4
‑
11i：seq id no：135，res.1
‑
3i：seq id no：136 c：seq id no：134c：seq id no：135c：seq id no：136编号20
‑
ml vlsgtssnigsfyvywytndqrpsqsydsslravv k：seq id no：137k：seq id no：138k：seq id no：139 i：seq id no：137，res.4
‑
11i：seq id no：138，res.1
‑
3i：seq id no：139 c：seq id no：137c：seq id no：138c：seq id no：139编号20
‑
m2 vlsgtssnigsfyvywytndqrpsqsydsslravv k：seq id no：140k：seq id no：141k：seq id no：142 i：seq id no：140，res.4
‑
11i：seq id no：141，res.1
‑
3i：seq id no：142 c：seq id no：140c：seq id no：141c：seq id no：142编号20
‑
m3 vlsgtssnigsyyvywytndqrpsqsydsslravv. k：seq id no：143k：seq id no：144k：seq id no：145 i：seq id no：143，res.4
‑
11i：seq id no：144，res.1
‑
3i：seq id no：145 c：seq id no：143c：seq id no：144c：seq id no：145
[0013]
在实施例中，本发明提供抗体抗原结合结构域，其包含包括cdr1、cdr2和cdr3组合的重链可变区(vh)和包括cdr1、cdr2和cdr3组合的轻链可变区(v1)，或包含选自以下的重链可变区(vh)和/或轻链可变区(v1)：m36、71、76、t47、m1q、2h5、m150；和4、31、32、69、a14、a21、b103、b129、b139、b172；和8、20、20
‑
m1、20
‑
m2、20
‑
m3。
[0014]
在实施例中，抗体抗原结合结构域特异性结合前
‑
s1的aa11
‑
28或aa19
‑
25。
[0015]
本发明还提供抗体、具体来说单克隆抗体和包含标的结合结构域的f(ab)或f(ab)2。
[0016]
本发明还提供编码标的抗原结合结构域的新颖多核苷酸(例如cdna和表达载体)和包含所述多核苷酸的细胞以及包含所述细胞的非人类动物。多核苷酸可操作连接至异源转录调控序列用于表达，且可纳入所述载体、细胞等中。
[0017]
本发明提供使用标的结构域治疗hbv或hdv感染、或诱导抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(adcc)的方法，其包含将结构域给予经测定患有hbv或hdv感染、已暴露于hbv或hdv、具有高hbv或hdv暴露或感染风险、需要前
‑
s1结构域拮抗作用、或其它有需要的个人。本发明进一步提供标的组合物的用途，其用来制造任选地与病毒复制抑制剂结合用于hbv或hdv感染的药剂。
[0018]
本发明包括所列举具体实施例的所有组合。根据下文所给出的详细描述将明了其它实施例和本发明应用的全部范围。然而，应理解，尽管详细描述和特定实例指示本发明的优选实施例，但其仅以说明方式给出，这是因为所属领域技术人员根据此详细描述将明了本发明精神和范围内的各种改变和修改。出于所有目的，本文所引用的所有公开案、专利和专利申请案(包括其中的引用)的全文均以引用方式并入本文中。
附图说明
[0019]
图1.来自2h5 vh链改组文库选择的10种抗体对hbv的中和。
具体实施方式
[0020]
除非上下文另外指示，否则术语“抗体”是在最广泛意义上使用且明确涵盖抗体(包括全长单克隆抗体)和抗体片段，只要其识别hbv/hdv前
‑
s1或以其它方式抑制hbv/hdv即可。抗体分子通常为单特异性，但也可描述为个体特异性(idiospecific)、异源特异性(heterospecific)或多特异性。抗体分子借助特异性结合位点结合至特异性抗原决定簇或抗原表位。“抗体片段”包含全长抗体的一部分，通常为其抗原结合区或可变区。抗体片段的实例可包括fab、fab'、f(ab')2和fv片段；双价抗体；线性抗体；单链抗体分子；和自抗体片段形成的多特异性抗体。
[0021]
天然和工程改造的抗体结构为业内所熟知，例如斯绰(strohl)等人，治疗抗体的工程改造：推动医药工业中增长最快的领域的当前和将来进步(therapeutic antibody engineering:current and future advances driving the strongest growth area in the pharmaceutical industry)，伍德海德出版社生物医学系列(woodhead publishing series in biomedicine)第11期，2012年10月；霍利格(holliger)等人，自然生物技术(nature biotechnol)23,1126
‑
1136(2005)；查尔斯(chames)等人，英国药理学杂志(br j pharmacol.)2009年5月；157(2):220
‑
233。
[0022]
单克隆抗体(mab)可通过所属领域技术人员已知的方法获得。参见例如科勒(kohler)等人(1975)；us4,376,110；奥苏贝尔(ausubel)等人(1987
‑
1999)；哈洛(harlow)等人(1988)；和考利甘(colligan)等人(1993)。本发明的mab可为任一免疫球蛋白类别，包括igg、igm、ige、iga和其任一子类。产生mab的杂交瘤可在试管内或在活体内培养。mab的高效价可在活体内产生中获得，其中将来自个别杂交瘤的细胞腹膜内注射至小鼠(例如降植烷致敏(pristine
‑
primed)的balb/c小鼠)中以产生含有高浓度的所需mab的腹水。可使用所属领域技术人员所熟知的柱色谱方法从所述腹水或从自培养物上清液提纯同种型igm或igg的mab。
[0023]“分离的多核苷酸”是指与在天然状态下侧接其的序列分离的多核苷酸区段或片段，例如从正常情况下与所述片段邻接的序列(例如在其中天然存在所述片段的基因组中与所述片段邻接的序列)脱离的dna片段。因此，所述术语包括例如重组dna，其纳入载体中、纳入自主复制质粒或病毒中或纳入原核生物或真核生物的基因组dna中，或以独立于其它序列的单独分子(例如，以cdna或通过pcr或限制酶消化产生的基因组或cdna片段)存在。其还包括作为编码其它多肽序列的杂合基因的一部分的重组dna。
[0024]“构筑体”意指衍生自任一来源的能够进行基因组整合或自主复制的任何重组多核苷酸分子，例如质粒、粘粒、病毒、自主复制多核苷酸分子、噬菌体或线性或环状单链或双链dna或rna多核苷酸分子，包含其中一或多个多核苷酸分子以功能操作方式连接(即可操作连接)的多核苷酸分子。重组构筑体通常将包含本发明的多核苷酸，其可操作连接至转录起始调控序列，所述转录起始调控序列引导多核苷酸在预期宿主细胞中的转录。可采用异源和非异源(即内源)启动子来引导本发明核酸的表达。
[0025]“载体”是指可用于转化目的、即将异源dna引入宿主细胞中的任一重组多核苷酸
构筑体。一类载体为“质粒”，其是指其它dna区段可连接至其中的环状双链dna环。另一类载体为病毒载体，其中其它dna区段可连接至病毒基因组中。某些载体能够在已引入其的宿主细胞中进行自主复制(例如，具有细菌复制起点的细菌载体和游离型哺乳动物载体)。其它载体(例如，非游离型哺乳动物载体)可在引入宿主细胞中时整合至宿主细胞的基因组中，并由此与宿主基因组一同复制。另外，某些载体能够引导与其可操作连接的基因的表达。所述载体在本文中称为“表达载体”。
[0026]
如本文所用“表达载体”是指在转化、转染或转导至宿主细胞中时能够复制和表达所关注基因的核酸分子。表达载体包含一或多种表型可选择标记物和复制起点以确保维持载体且(若需要)提供宿主内的扩增。表达载体进一步包含启动子以驱动细胞内的多肽表达。适宜表达载体可为衍生自例如pbr322或多个市售puc质粒的质粒。其它表达载体可衍生自噬细菌体、噬菌粒或粘粒表达载体。
[0027]
实例
[0028]
人类单克隆抗体阻断b型和d型肝炎病毒的病毒感染在此处揭示可阻断hdv和hbv病毒感染的人类单克隆抗体。这些抗体是自大噬菌体展示抗体文库鉴别而来，所述文库是使用来自93个健康供体的末梢血单核细胞建立。通过使用hbv包膜蛋白的前
‑
s1结构域作为靶来选择和筛选抗体文库，鉴别出具有针对hbv和hdv感染的中和活性的人类单克隆抗体组。其中，2h5显示针对hbv和hdv感染的最好的中和活性。2h5与其靶(前
‑
s1结构域的8个氨基酸)的复合物的共晶体结构已解出。通过链改组方法最佳化2h5，研发出甚至更强效的中和抗体。这些抗体识别与2h5相似的表位且所述表位在hbv的不同基因型中高度保守。在带有人类化ntcp的小鼠中测试实例性抗体a14并为小鼠提供全面保护免于hdv感染，且动物研究确认针对hbv感染的保护。
[0029]
抗原靶：前
‑
s1肽.使用衍生自hbv的前
‑
s1结构域的两个肽作为抗原用于选择。其是通过中科亚光(scilight
‑
peptide)(中国北京)以大于95％的纯度合成。nc36b：在其c末端具有生物素修饰的包含hbv l蛋白的前
‑
s1结构域的残基4
‑
38的肽。m47b：具有c末端生物素修饰和n末端肉豆蔻酰化修饰的包含前
‑
s1结构域的氨基酸2
‑
48的肉豆蔻酰化脂肽。
[0030][0031]
基于修改的噬菌体展示抗体技术[1、2]产生针对前
‑
s1肽的人类单克隆抗体.
[0032]
噬菌体展示抗体文库.自93个健康供体的末梢血单核细胞(pbmc)构筑人类非免疫scfv(单链可变片段)抗体文库。所述文库具有总共1.1
×
10
10
个成员的大小。
[0033]
选择和筛选噬菌体抗体文库.自文库制备在其表面上表达scfv的噬菌体粒子(噬菌体
‑
scfv)且将其用于选择针对合成nc36b和m47b的scfv。在抗生蛋白链菌素偶联的磁m
‑
280(生命技术(life technologies))上捕获各肽，且然后分别与5
×
10
12
个自文库制备的噬菌体粒子一起培育。对于每一肽，进行两轮选择。对于每轮选择，为获得高亲和力抗体，使捕获至磁珠上的肽量最佳化且施加大量洗涤步骤。另外，为自磁珠回收高亲和
力结合物且增加所回收噬菌体
‑
scfv的多样性，使用两种洗脱方法，包括肽竞争洗脱和常规碱性三乙醇胺溶液。随后，挑选且拯救总共约2000个单克隆以在细菌培养物上清液中产生噬菌体
‑
scfv，并通过酶联免疫吸附分析(elisa)筛选与m47b和/或nc36b的特异性结合。在450nm下以>1.0的光密度值结合至m47b和/或nc36b的克隆评分为阳性，而阴性克隆给出<0.1的值。对于m47b和/或nc36b特异性结合克隆，对重链(vh)和轻链(vl)可变区的基因进行测序且比对其相应氨基酸序列以消除重复克隆并鉴别出具有不同序列的抗体以供进一步表征。鉴别出总共109个具有独特序列的克隆。
[0034]
进一步表征具有独特抗体序列的抗体以鉴别出最好的候选抗体.以经提纯噬菌体
‑
scfv粒子原样产生具有独特序列的抗体克隆或将其转化成scfv
‑
fc微小抗体或全长人类igg1，且然后通过elisa测试其结合活性以及细胞培养物中的hbv和hdv中和活性。通过这些分析，基于抗体的结合活性和中和活性对其分级。选择具有最高中和活性的顶级抗体来进一步研发。
[0035]
制备经提纯噬菌体
‑
scfv用于elisa或中和分析.通过peg/nacl使10
‑
30ml细菌培养物的上清液中的噬菌体
‑
scfv沉淀且然后通过光谱仪量化。基于正规化至相同浓度的经连续稀释的噬菌体
‑
ab的剂量
‑
反应评估不同噬菌体
‑
scfv对抗原结合或中和病毒感染的活性。
[0036]
制备scfv
‑
fc微小抗体.将来自噬菌体
‑
scfv表达载体的scfv编码基因亚克隆至在scfv的c末端含有人类igg1 fc片段的表达载体中。为产生scfv
‑
fc，用scfv
‑
fc表达质粒瞬时转染293f(生命技术)或293t细胞(atcc)，在转染后72小时，收获细胞培养物上清液且通过蛋白a亲和色谱(蛋白a sepharose cl
‑
4b,ge医疗(ge healthcare))提纯scfv
‑
fc。
[0037]
制备全长igg1抗体.将scfv的vh和vl编码序列单独亚克隆至抗体重链(hc)表达载体和轻链(lc)表达载体中。为制备igg1抗体，用1:1比率的两种表达质粒(hc lc质粒)瞬时共转染293f或293t细胞。在转染后72小时，收获细胞培养物上清液以通过蛋白a亲和色谱提纯igg1。
[0038]
elisa分析.将磷酸盐缓冲盐水(pbs)中的5μg/ml抗生蛋白链菌素(西格玛(sigma))以100μl/孔涂布于u形底96孔板(nunc,maxisorp
tm
)中，在4℃下过夜或在37℃下保持1小时。然后通过在30℃下培育0.5
‑
1小时将2μg/ml(370nm)的m47b或nc36b肽以100μl/孔捕获至板上。对于基于噬菌体
‑
scfv的elisa，将含有2％脱脂奶粉的pbs中的经连续稀释的非噬菌体
‑
scfv以100μl/孔添加至每孔中。通过添加hrp偶联的小鼠抗m13抗体(ge医疗)检测特异性结合的噬菌体
‑
scfv且在30℃下培育30min。在每一培育步骤之间，用pbst溶液(含有0.05％tween20的pbs)以200μl/孔将elisa板洗涤6次。在hrp偶联的抗体培育后，通过在30℃下与tmb底物(西格玛)一起培育5
‑
10min使elisa信号显影且然后用2m h2so4以25μl/孔终止反应。通过微量板读数器(伯乐(bio
‑
rad))读取450nm下的吸光度。对于基于scfv
‑
fc或igg1的elisa，所述方法与上文针对噬菌体
‑
scfv所描述基本上相同，只是结合抗体是通过hrp偶联的小鼠抗人类igg fc抗体(西格玛)来检测。
[0039]
制备hbv和hdv病毒.hbv和hdv是如先前所描述产生[3]。hdv.简单来说，在cmv启动子控制下用从头合成的hdv cdna构筑含有基因型i病毒(基因库登录号：af425644.1)的1.0
×
hdv cdna的头至尾三聚体的质粒以产生hdv rnp。使用含有hbv(基因型d，基因库登录号：u95551.1)的核苷酸2431～1990的puc18质粒在内源hbv启动子控制下表达hbv包膜蛋白。如
苏瑞(sureau)等人先前所描述[4]通过转染huh
‑
7中的质粒产生hdv病毒体。收获经转染的细胞培养物上清液且直接用于hdv中和分析。hbv.通过在cmv启动子控制下用含有1.05个拷贝的hbv基因组的质粒转染huh
‑
7细胞产生hbv基因型b、c和d病毒。基因型b或c hbv病毒还来自hbv患者的血浆。
[0040]
hbv和hdv中和分析.中和分析是如先前所描述[3、5]并在少量修改后进行。将hepg2
‑
hntcp细胞(稳定表达hbv和hdv受体hntcp(人类牛磺胆酸钠共转运多肽)的hepg2细胞系)用于这些分析中。在48孔板中将hepg2
‑
hntcp细胞于pmm培养基[3]中培养12
‑
24小时，然后进行病毒感染。在5％peg8000存在下用hepg2
‑
hntcp细胞接种混有不同形式的抗体：噬菌体
‑
scfv、scfv
‑
fc或igg1的约500基因组当量倍数(multiplicities of genome equivalents,mge)的hdv或200mge的hbv且培育16小时。然后用培养基将细胞洗涤三次且维持于pmm中。每2
‑
3天将细胞培养基更换为新鲜pmm培养基。对于hdv感染，在感染后(dpi)7天，在室温下用100％甲醇将hdv感染的细胞固定10min，用5μg/ml的fitc偶联的4g5(小鼠抗hdvδ抗原单克隆抗体)对细胞内δ抗原染色且用dapi对核染色。通过荧光显微镜(尼康(nikon))收集影像。基于染色的δ抗原量和强度确定针对hdv的中和活性。对于hbv感染，在dpi 3、5和7，收集培养物上清液且用商业elisa试剂盒(万泰(wantai)，中国北京)测试hbv分泌性病毒抗原hbsag和/或hbeag。使用hbeag和/或hbsag的含量来评估抗体的hbv中和活性。
[0041]
通过上述elisa和hbv中和分析，鉴别出一些顶级抗体，其显示与nc36b以及m47b和47b(所述肽与m47b类似但未肉豆蔻酰化且显示hbv中和活性)的特异性结合。
[0042]
在这些顶级抗体中，m36、2h5和m1q是显示最好hbv(基因型d)中和活性的前三种抗体。m36自进一步测试排除，此乃因其在转化成全长igg1时显示减少的表达。进一步比较2h5和m1q的hdv中和活性，2h5显示较好的中和hdv感染的活性。基于与肽的高结合活性和针对hbv和hdv的强效中和活性，选择2h5来进一步研发。另外，2h5显示大于先前公开的前
‑
s1肽抗体kr127[6
‑
8]的hbv和hdv中和活性。在hbv感染分析中，2h5
‑
igg1比kr127强效11倍，如通过ic
50
(引起50％hbv感染抑制的抗体浓度)所指示；2h5还显示对hdv感染分析的较大抑制作用。
[0043]
映射2h5抗体的结合表位.为映射2h5的前
‑
s1区域上的表位，合成涵盖前
‑
s1结构域的不同区域的短肽且通过竞争elisa分析测试其竞争2h5与m47b结合的能力。可竞争结合的最短肽是ln16肽(对应于hbv l蛋白(基因型d)的前
‑
s1结构域的nt氨基酸(aa)11
‑
28)，此指示2h5的结合表位位于此区域内。ld15和la15肽还显示一定程度的竞争活性，但水平低于ln16。由三种肽ln16、ld15和la15共享的共用氨基酸是前
‑
s1的aa19
‑
25。因此测试各自在19位、20位、22位和23位携载单丙氨酸突变的ln16肽ln16
‑
l19a、ln16
‑
d20a、ln16
‑
p21a、ln16
‑
f23a的竞争活性，结果显示其均具有降低的竞争活性(ln16
‑
l19a)或完全丢失此活性(ln16
‑
d20a、ln16
‑
p21a、ln16
‑
f23a)，此指示这些氨基酸对前
‑
s1与2h5结合至关重要。
[0044]
2h5表位在大多数hbv基因型中高度保守.8个hbv基因型的前
‑
s1肽的序列比对显示，表位在其中高度保守。主要可变氨基酸处于24位：基因型a和c中的甘氨酸、基因型d和其它基因型中的赖氨酸或精氨酸。为测试此氨基酸变化是否会影响2h5与前
‑
s1肽的结合，合成含有24位精氨酸的nc36b肽且通过elisa测试与2h5的结合。结果显示，此氨基酸变化对结合仅具有最小作用。此与2h5中和基因型d的hbv和携载hbv基因型d包膜的hdv的hbv和hdv病
毒中和结果一致。
[0045]
2h5 scfv和前
‑
s1肽复合物的结构表征.还测定与前
‑
s1肽59c复合的2h5(呈scfv片段形式，所述片段在其n末端与his6标签融合)的晶体结构。59c的氨基酸序列对应于基因型c的前
‑
s1的aa
‑
10～48：
[0046]
ggwsskprqgmgtnlsvpnplgffpdhqldpafgansnnpdwdfnpnkdhwpeanqv(seq id no:147)。使2h5
‑
scfv和59c在大肠杆菌(e.coli)中共表达。通过使用ni
‑
nta琼脂糖珠粒(凯杰(qiagen))的固定化金属离子亲和色谱(imac)、然后通过使用superdex s200 10/300柱(ge医疗)的粒径排阻色谱
‑
hplc(sec
‑
hplc)将所述复合物提纯为复合物。然后通过将1μl蛋白质(29mg/ml于10mm tris
‑
hcl(ph 8.0)和100mm nacl中)和1μl含有2.8m乙酸钠的储藏溶液(ph 7.0)混合，使用悬滴蒸汽扩散方法使经提纯的2h5
‑
scfv/59c复合物在20℃下浓缩且结晶。在10天后出现针状晶体。在上海光源(shanghai synchrotron radiation facility)束线bl17u收集x射线衍射数据且通过hkl2000处理[9]。在分辨率下通过分子置换在相位器[10、11]中使用衍生自贺癌平(herceptin)
‑
fab复合物的结构(pdb 3h0t)[12]的vh和vl作为起始模型来确定结构。在phenix中进一步优化得自分子置换的初始模型[13]且用coot人工重建[14]。最终模型包括2h5 scfv的220个残基、59c肽的残基20
‑
27。rampage分析显示，96.71％的残基处于有利区域中且3.29％的残基处于容许区域中[15]。结构揭露2h5 scfv的vh和vl均参与与肽的相互作用。结构中所包括的肽的八个氨基酸是d
20
p
21
a
22
f
23
g
24
n
25
a
26
s
27
。其中，d
20
、p
21
、a
22
、f
23
、a
26
和s
27
引起与2h5的相互作用。三个氨基酸d
20
、p
21
和f
23
对2h5结合引起至关重要的相互作用。
[0047]
通过vh链改组提高2h5亲和力和中和活性.
[0048]
从2h5的vh链改组文库鉴别出前四种抗体。接下来使用链改组来提高2h5的结合亲和力和中和活性，其中固定两个链(vh和vl)中的一个且与另一链谱系组合以产生可针对优异活性进行选择的二级文库。首先，进行vh链改组，其中固定2h5的vl且与vh链的文库配对。构筑两个vh
‑
lib/2h5vl噬菌体呈现文库。一个文库大小为约2
×
108，另一个为约9
×
108。通过使用捕获于抗生蛋白链菌素偶联的磁性m
‑
280(生命技术)上的肽作为靶，分开选择两个vh
‑
lib/2h5vl文库，各自一轮。在两个文库的一轮选择结束时，随机挑选总共576个个别克隆且通过elisa针对与m47b的结合进行筛选。选择elisa中的阳性克隆且测序。鉴别出10个具有独特vh序列的克隆(表1)且显示等于或强于2h5的与呈噬菌体抗体形式的m47
b
的结合活性。然后将这10个克隆转化成全长人类igg1且通过elisa验证与m47b的结合，通过试管内中和分析中和hbv(基因型d)(图1)和hdv。基于与m47b结合、中和hbv和hdv的总体活性来选择前四种抗体编号31、编号32、a14和a21。
[0049]
表1. 2h5 vh链改组文库选出的10种抗体的vh序列比对.
[0050][0051]
图1.显示来自2h5 vh链改组文库选择的10种抗体对hbv的中和。通过在不同浓度的抗体存在下与hbv(基因型d)一起培育16小时来感染hepg2
‑
hntcp细胞。随后洗掉抗体和病毒且继续培养7天，每2天更换细胞培养基。在感染后7天通过elisa检测分泌性hbeag。基于hbeag含量的减少，计算hbv中和活性且表示为受感染细胞在抗体存在下相对于对照(在对照抗体存在下感染的细胞)的变化％。
[0052]
来自2h5 vh链改组文库的4种顶级抗体的表位映射.如上文所描述，使用肽竞争elisa方法来映射自2h5 vh链改组文库鉴别出的4种顶级抗体的结合表位。使用ln16肽(对应于前
‑
s1结构域的nt氨基酸(aa)11
‑
28)和ln16肽突变体ln16
‑
l19a、ln16
‑
d20a、ln16
‑
p21a、ln16
‑
f23a来竞争这些抗体与m47b肽的结合。数据揭露，其均具有与2h5相似的肽竞争模式，氨基酸l19、d20、p21和f23对这些抗体结合至关重要。d20和f23对所有抗体最重要，而l19和p21对于不同抗体所起作用稍有不同。
[0053]
进一步表征来自2h5 vh链改组文库的4种顶级抗体.与亲代2h5抗体相比，这些抗
rt
‑
pcr试剂盒(塔克拉(takara))将rna样品反转录成cdna。为量化hdv总rna(基因组当量)和编辑的ntcp rna拷贝，使用自20ng rna获得的cdna作为模板进行实时pcr分析。在abi快速7500实时系统仪器(应用生物系统(applied biosystems)，美国)上进行实时pcr。利用标准曲线计算编辑的ntcp和hdv病毒基因组当量拷贝且使用细胞gapdh rna作为内部对照。a14 mab完全阻断hdv感染，而在对照组中hdv感染达到1
‑
10
×
106个拷贝/20ng肝rna。两组中的小鼠在肝组织中具有相当的ntcp mrna拷贝。
[0061]
a14在预防小鼠模型中保护小鼠免于hbv感染且在治疗小鼠模型中抑制hbv感染.使用移植有人类肝细胞的frg(fah
‑
/
‑
rag2
‑
/
‑
/il2rg
‑
/
‑
)三敲除小鼠建立小鼠hbv感染模型[19、20]。frg小鼠容许移植的人类肝细胞在小鼠肝中复制以形成具有高达98％人类肝细胞的嵌合肝，这是因为所述肝人类化frg小鼠(frgc)对hbv感染高度敏感。为测试a14的预防作用，将10只frgc小鼠分成两组，每组5只小鼠。在hbv病毒激发之前通过每天单次ip给予向a14预防组小鼠注射15mg/kg剂量的a14，同时向对照组中的小鼠注射相同体积的pbs。在第0天时，通过尾静脉向所有小鼠各自注射10e9 ge(基因组当量)hbv。为测试a14的治疗作用，在第0天时通过尾静脉用10e9 ge/小鼠的hbv激发frgc小鼠，在感染后第5天时，用恩替卡韦(entecavir，etv)对照或a14或hbig治疗小鼠。etv是以0.1mg/kg每天经口给予；a14或hbig分别是以20mg/kg和72mg/kg(40iu/kg)每3天通过i.p.注射给予。对于预防和治疗模型二者，每3天自所有小鼠收集血液样品用于测量血清中的hbsag和hbv dna效价。在实验结束时杀死小鼠，保存dpi35和肝组织用于hbsag和hbcag的免疫组织化学染色(ihc)。a14显示在预防模型中100％保护frgc小鼠免于hbv感染；其还显示在治疗模型中显著抑制hbv感染。
[0062]
总之，结果明确展示a14 mab是动物模型中强效的hdv和hbv进入抑制剂。a14mab可用于替代hbig来预防hdv和hbv感染。另一方面，小鼠中已建立hbv感染的a14治疗显著抑制hbv感染，另外a14显示针对hbv感染的细胞、而非非hbv感染细胞的特异性adcc活性。这些结果指示，a14 mab可与etv组合治疗长期感染hbv的患者。由于a14阻断新病毒进入宿主细胞中且具有针对受感染细胞的adcc活性，而etv抑制病毒复制，所以a14与病毒复制抑制剂(例如etv、拉米夫定(lamivudine)、阿德福韦(adefovir)、阿德福韦(tenofovir)、替比夫定(telbivudine)或其它核苷酸和核苷酸类似物(nuc))的组合为患者提供新的治疗和预防选择且可实现较好的病毒血症控制和hbsag减少。
[0063]
通过vl链改组改良a14亲和力和中和活性.为进一步改良a14活性，制备a14
‑
vl链改组噬菌体展示文库，其中固定a14的vh且与vl链的文库配对。构筑的最终文库(a14vh/vllib)具有约3
×
108的大小。通过使用捕获于抗生蛋白链菌素偶联的磁m
‑
280(生命技术)上的m47b肽作为靶，对a14vh/vllib文库进行两轮选择。通过elisa针对与m47b的结合筛选196个克隆。所有克隆均呈阳性，但挑选24个具有最高od450读数的克隆进行测序。鉴别出2个克隆编号8和编号20，其具有不同于a14的vl的vl链序列。将这两种抗体转化成全长人类igg1且通过elisa测试与m47b的结合。其均显示强于a14的与m47b的结合活性。在hbv(基因型d)的hbv中和分析中，编号8显示中和hbv感染的5倍改良，而编号20显示与a14相似的活性。编号20的vl(编号20
‑
m1、20
‑
m2、20
‑
m3)的进一步诱变使其中和活性与a14相比改良约3
‑
5倍，达到与编号8相似的水平。展示与a14相比，这些编号20突变体的hdv中和活性升高。因此，这些具有进一步改良活性的a14衍生的抗体可如上文所描述以与a14相似的方式单独或与病毒复制抑制剂组合使用。
[0064]
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‑
30页。
[0085]
衍生自幼稚文库的7种抗体的抗体序列
[0086]
m36
[0087]
m36 vh dna：
[0088][0089]
m36 vl dna：
[0090][0091]
m36 vh氨基酸：
[0092][0093]
m36 vl氨基酸：
[0094][0095]
71：
[0096]
71 vh dna：
[0097][0098]
71 vl dna：
[0099][0100]
71 vh氨基酸：
[0101][0102]
71 vl氨基酸：
[0103][0104]
76：
[0105]
76 vh dna：
[0106][0107]
76 vl dna：
[0108][0109]
76 vh氨基酸：
[0110][0111]
76 vl氨基酸：
[0112][0113]
t47：
[0114]
t47 vhdna：
[0115][0116]
t47 vl dna：
[0117][0118]
t47 vh氨基酸：
[0119][0120]
t47 vl氨基酸：
[0121][0122]
m1q
[0123]
m1q vh dna
[0124][0125]
m1q
‑
vl dna
[0126][0127]
m1q vh氨基酸：
[0128][0129]
m1q vk氨基酸：
[0130][0131]
2h5：
[0132]
2h5 vh dna：
[0133][0134]
2h5 vl dna：
[0135][0136]
2h5 vh氨基酸：
[0137][0138]
2h5 vl氨基酸：
[0139][0140]
m150
[0141]
m150 vh dna：
[0142][0143]
m150 vk dna：
[0144]
[0145][0146]
m150 vh氨基酸：
[0147][0148]
m150 vk氨基酸：
[0149][0150]
衍生自2h5 vh链改组文库选择的10个抗体的抗体序列。应注意，这些抗体具有与2h5相同的vl序列，因此下文仅列示这些抗体的vh序列。
[0151]
编号4
[0152]
编号4 vh dna：
[0153][0154]
编号4 vh氨基酸：
[0155][0156]
编号31 vh dna：
[0157][0158]
编号31 vh氨基酸：
[0159][0160]
编号32 vh dna：
[0161][0162]
编号32 vh氨基酸：
[0163]
[0164]
编号32 vh dna：
[0165][0166]
编号69 vh氨基酸：
[0167][0168]
a14 vh dna：
[0169][0170]
a14 vh氨基酸：
[0171][0172]
a21 vh dna：
[0173][0174]
a21 vh氨基酸：
[0175][0176]
b103 vh dna：
[0177][0178]
b103 vh氨基酸：
[0179][0180]
b129 vh dna：
[0181][0182]
b129 vh氨基酸：
[0183][0184]
b139 vh dna：
[0185][0186]
b139 vh氨基酸：
[0187][0188]
b172 vh dna：
[0189][0190]
b172 vh氨基酸：
[0191][0192]
衍生自a14 vl链改组文库选择的两个抗体的抗体序列。应注意，这些抗体具有与a14相同的vh序列，因此下文仅列示这两个抗体的vl序列。
[0193]
编号8 vl dna：
[0194][0195]
编号8 vl氨基酸：
[0196][0197]
编号20 vl dna：
[0198][0199]
编号20 vl氨基酸：
[0200][0201]
编号20
‑
m1 vl dna：
[0202][0203]
编号20
‑
m1 vl氨基酸：
[0204][0205]
编号20
‑
m2 vl dna：
[0206][0207]
编号20
‑
m2 vl氨基酸：
[0208][0209]
编号20
‑
m3 vl dna：
[0210][0211]
编号20
‑
m3 vl氨基酸：
[0212]