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用于骨肉瘤分型和评估骨肉瘤预后的基因及其应用的制作方法

2021-10-19 20:36:00 来源:中国专利 TAG:检测 预后 骨肉瘤 基因 及其应用

技术特征:
1.一种用于骨肉瘤分型和评估骨肉瘤预后的基因集,其特征在于,所述基因群包括44个基因,如下表所示:
2.一种用于骨肉瘤分型和评估骨肉瘤预后的基因集,其特征在于,所述基因群是由840个基因组成的基因群,所述基因群如表1所示。3.如权利要求1或2所述的基因集在制备用于骨肉瘤分型和评估预后的检测试剂盒中的应用,所述检测试剂盒包括:扩增权利要求1或2所述评估用于骨肉瘤分型和评估预后的基因集的基因的引物;和/或特异性结合权利要求1或2所述评估用于骨肉瘤分型和评估预后的基因集的基因和/或其互补序列的探针;和/或特异性结合权利要求1或2所述评估用于骨肉瘤分型和评估预后的基因集的基因表达的蛋白的抗体。4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,所述引物包括:核苷酸序列如seq id no.1

seq id no.88所示的引物。5.如权利要求1或2所述的基因集在制备用于骨肉瘤分型和评估预后的蛋白检测芯片中的应用,其特征在于,所述基因芯片包括固相载体和检测抗体,在所述固相载体上固定有与权利要求1或2所述的基因集的基因特异性结合的捕获抗体,所述检测抗体与抗体标记物连接。6.根据权利要求5所述的应用,其特征在于,所述抗体标记物为:酶标记、荧光素标记、同位素标记或生物素标记。7.一种用于骨肉瘤分型和评估骨肉瘤预后的试剂盒,其特征在于,包括1)扩增权利要求1或2所述评估用于骨肉瘤分型和评估预后的基因集的基因的引物;和/或2)特异性结合权利要求1或2所述评估用于骨肉瘤分型和评估预后的基因集的基因和/或其互补序列的探针;和/或3)特异性结合权利要求1或2所述评估用于骨肉瘤分型和评估预后的基因集的基因表达的蛋白的抗体。8.根据权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,所述检测试剂盒包括:总rna抽提试剂、逆转录试剂和/或测序试剂。9.根据权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,所述检测试剂盒包括:dntp溶液和/或rna逆转录酶。10.根据权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,所述的测序试剂包括二代测序试剂或单细胞测序试剂。11.根据权利要求7

10任一项所述的试剂盒,其特征在于,所述引物包括:核苷酸序列如seq id no.1

seq id no.88所示的引物。12.一种用于骨肉瘤分型和评估骨肉瘤预后的基因检测芯片,其特征在于,所述基因芯片所述基因芯片包括固相载体和检测抗体,在所述固相载体上固定有与权利要求1或2所述的基因集的基因特异性结合的捕获抗体,所述检测抗体与抗体标记物连接。13.一种非诊断、非治疗目的的骨肉瘤分型方法,其特征在于,检测样本中的权利要求1
或2所述评估用于骨肉瘤分型和评估预后的基因含量或所述基因表达的蛋白的含量。14.根据权利要求13所述的骨肉瘤分型方法,其特征在于,采用权利要求8

11所述的试剂盒或权利要求12所述的基因检测芯片,检测样本中的基因表达水平,并通过数据分析得到骨肉瘤分型结果。15.根据权利要求13所述的骨肉瘤分型方法,其特征在于,abcf1、adamts1、aldh3a2、alkbh5、atpaf2、c19orf12、cenpv、cpne3、drg2、epn2、flii、fscn1、gid4、hist1h2bd、lsm2、mprip、myo15a、pemt、pi15、prame、prr3、tom1l2、ttc19、vars中的任意2个以上基因高表达时,其骨肉瘤分型为1型,该型骨肉瘤患者预后好;和/或aebp1、aspn、c1r、c1s、col12a1、col5a1、col6a3、olfml2b、postn、sfrp4、thbs2中的任意2个以上基因高表达时,其骨肉瘤分型为2型,该型骨肉瘤患者预后尚可;和/或atp1b3、cdk4、dnajc3、ggh、hspb11、lmo7、pfn2、sgo2、upf3a中的任意2个以上基因高表达时,其骨肉瘤分型为3型,该型骨肉瘤患者预后差。16.根据权利要求15所述的骨肉瘤分型方法,其特征在于,abcf1、adamts1、aldh3a2、alkbh5、atpaf2、c19orf12、cenpv、cpne3、drg2、epn2、flii、fscn1、gid4、hist1h2bd、lsm2、mprip、myo15a、pemt、pi15、prame、prr3、tom1l2、ttc19和vars基因高表达时,其骨肉瘤分型为1型,该型骨肉瘤患者预后好;和/或aebp1、aspn、c1r、c1s、col12a1、col5a1、col6a3、olfml2b、postn、sfrp4和thbs2基因高表达时,其骨肉瘤分型为2型,该型骨肉瘤患者预后尚可;和/或atp1b3、cdk4、dnajc3、ggh、hspb11、lmo7、pfn2、sgo2和upf3a基因高表达时,其骨肉瘤分型为3型,该型骨肉瘤患者预后差。

技术总结
在本发明用于骨肉瘤分型和评估骨肉瘤预后的基因及其应用中,针对肿瘤异质性,我们比较了常规骨肉瘤和正常松质骨之间细胞动力学和分子特征的差异,基于单细胞RNA测序(scRNA


技术研发人员:肖建如 魏海峰 周旺 张浩 龚海熠 王霆
受保护的技术使用者:上海理工大学
技术研发日:2021.06.15
技术公布日:2021/10/18
再多了解一些

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