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一种虫草粉棒束孢高灵敏度检测试剂盒及检测方法与流程

2021-10-30 02:02:00 来源:中国专利 TAG:地说 虫草 分子生物学 检测方法 试剂盒

技术特征:
1.一种虫草粉棒束孢高灵敏度检测试剂盒,其特征是,所述试剂盒包括:进行第一轮pcr扩增的外巢引物,外巢引物为its1f/its4r、its5f/its2r、ns3f/ns6r引物对中的至少一种;所述its1f/its4r引物对的序列如seq id no.1和seq id no.2所示;所述its5f/its2r引物对的序列如seq id no.3和seq id no.4所示;所述ns3f/ns6r引物对的序列如seq id no.5和seq id no.6所示;以及,进行第二轮pcr扩增的内巢引物,内巢引物为2ha0

粉棒束孢

f/r、5hao

粉棒束孢

f/r引物对中的至少一种;所述2ha0

粉棒束孢

f/r引物对的序列如seq id no.7和seq id no.8所示;所述5hao

粉棒束孢

f/r引物对的序列如seq id no.9和seq id no.10所示。2.一种虫草粉棒束孢高灵敏度检测方法,其特征是,包括以下步骤:以如权利要求1中所述的外巢引物对中的至少一种作为外巢引物,提取的样本总核酸为反应模板,配制25ul反应体系进行第一轮pcr扩增;以如权利要求1中所述的内巢引物对中的至少一种作为内巢引物,第一轮pcr扩增的产物为模板,配制25ul反应体系进行第二轮pcr扩增;将第二轮pcr扩增产物进行电泳检测,检测获得条带则表明样品中含有粉棒束孢,反之则无。3.根据权利要求2所述的一种虫草粉棒束孢高灵敏度检测方法,其特征是,所述第一轮pcr扩增条件具体为:95℃预变性3min;94℃变性25s,60℃退火35s,72℃延伸60s,37个循环;72℃延伸5min,最后4℃保存。4.根据权利要求2所述的一种虫草粉棒束孢高灵敏度检测方法,其特征是,所述第二轮pcr扩增条件具体为:95℃预变性3min;94℃变性25s,57.3℃退火35s,72℃延伸60s,37个循环;72℃延伸5min,最后4℃保存。5.根据权利要求2所述的一种虫草粉棒束孢高灵敏度检测方法,其特征是,所述25ul反应体系包括:pcr mix 22ul;上下游引物各0.5ul;dna模板2ul。6.根据权利要求5所述的一种虫草粉棒束孢高灵敏度检测方法,其特征是,所述pcr反应的mix包括:0.18mm脱氧核苷酸;1.8mm氯化镁;60.3mm氯化钾;18.9mm tris

hcl;0.6%甘油;5%二甲基亚砜;2.5%甲酰胺;5%甜菜碱;以无核酶水为溶剂。7.根据权利要求2所述的一种虫草粉棒束孢高灵敏度检测方法,其特征是,所述样本总核酸为土壤样本核酸、组织样本核酸中的至少一种。8.根据权利要求7所述的一种虫草粉棒束孢高灵敏度检测方法,其特征是,所述土壤样本核酸的提取步骤为:a.称取1g土壤,放入研钵中,倒入适量的液氮,立即研磨;再倒入适量的液氮,研磨,重复3次,使土壤颗粒研成粉末;b.将13.5ml的提取缓冲液、50μl的蛋白酶k与5g土壤置于50ml的离心管中,放入37℃恒温摇床,225r
·
min
‑1振荡30min;提取缓冲液包括:0.1mol/l磷酸盐,ph为8.0;0.1mol/ledta,ph为8.0;0.1mol/l tris

hcl,ph为8.0;1.5mol/l nacl;1.0%ctab;蛋白酶k的浓度为10g/l;c.加入1.5ml的20%sds,轻轻混匀,65℃水浴加热2h,每隔15

30min轻轻摇匀1次;
5000r
·
min
‑1离心10min,将上清液转入新的50ml离心管中;取4.5ml提取缓冲液加入原离心管,摇匀泥浆,加入0.5ml的20%sds,65℃水浴15min,用同样的离心速度离心10min,将上清液与原上清液合并;再重复此步骤1次;d.用与上清液等量的三氯甲烷于离心管中混匀,5000r
·
min
‑1离心20min;收集上清液,并加入0.6倍体积的异丙醇,室温静置1h;25℃下12000r
·
min
‑1离心20min,倒出上清液,干燥后加入500μl去离子水,溶解粘附于离心管壁的dna和杂质,并收集于1.5ml的微型离心管中。9.根据权利要求7所述的一种虫草粉棒束孢高灵敏度检测方法,其特征是,所述组织样本核酸的提取步骤为:a.取0.5g或0.5ml3的组织材料,双蒸水洗净,并用滤纸吸干;b.组织材料剪成1cm左右碎片,放入预冷的瓷研钵中;c.加入液氮速冷,研磨成细粉;d.在5ml离心管中加入抽提缓冲液2.5ml,60℃保温1小时;e.15000rpm,离心10分钟,上清转入另一个新的离心管中;f.加入等体积的氯仿:异戊醇(24:1),混匀抽提至水乳胶融状;j.15000rpm,离心10分钟;h.上清转入另一个新的离心管中;i.加入2/3倍体积预冷异丙醇,

20℃保温30min

1h,缓缓混匀dna成絮状折出;j.15000rpm,离心10分钟,弃上清;k.dna沉淀用70%乙醇洗2次;l.加入400ul te buffer溶解dna。10.根据权利要求7所述的一种虫草粉棒束孢高灵敏度检测试剂盒及检测方法,其特征是,所述组织样本为植物、昆虫、微生物中的任意一种。

技术总结
本发明公开了一种虫草粉棒束孢高灵敏度检测试剂盒及检测方法,涉及分子生物学领域,其技术方案要点是:包括进行第一轮PCR扩增的外巢引物,外巢引物为ITS1F/ITS4R、ITS5F/ITS2R、NS3F/NS6R引物对中的至少一种;以及,进行第二轮PCR扩增的内巢引物,内巢引物为2HA0


技术研发人员:卫秋阳 邓小书 贺元川 陈仕江 邢康康
受保护的技术使用者:重庆市中药研究院
技术研发日:2021.06.10
技术公布日:2021/10/29
再多了解一些

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