油茶自交不亲和关联基因、SNP分子标记及应用的制作方法

技术特征：
1.油茶自交不亲和关联基因comapk9，其cdna序列为：seq id no.1，基因组序列为：seq id no.2。2.根据权利要求1所述的油茶自交不亲和关联基因comapk9，其特征在于，该基因在油茶雌蕊中特异表达；能不可逆地抑制花粉萌发和花粉管的生长，导致油茶自交不亲和现象发生，最终油茶不能正常形成果实和种子，进而降低油茶座果率。3.油茶自交不亲和关联的snp分子标记，其特征在于，所述的分子标记建立基础是在权利要求1或2所述的基因comapk9基因组序列的开放阅读框中snp071031位置上存在一个snp错义突变，碱基由c变成a，对应氨基酸从pro变为gln，snp181968位置上存在一个snp错义突变，碱基由a变成g，对应氨基酸从thr变为ala。4.根据权利要求3所述的油茶自交不亲和关联的snp分子标记，其特征在于，两个位点snp多态性与油茶自交不亲和性状之间有显著相关性，表现为授粉后形成的合子中snp071031位点基因型为cc或ca，为自交亲和性状表型，基因型为aa，为自交不亲和性状表型；授粉后形成的合子中snp181968位点基因型aa或ag，为自交亲和性状表型；基因型gg，为自交不亲和性状表型。5.根据权利要求3所述的油茶自交不亲和关联的snp分子标记，其特征在于，comapk9中的2个snp分子标记的引物对：snp多态性位点snp071031的引物对：上游引物序列如：seq id no.3所示，下游引物序列如：seq id no.4所示；snp多态性位点snp181968的引物对，上游引物序列如：seq id no.5所示，下游引物序列如：seq id no.6所示。6.根据权利要求3所述的油茶自交不亲和关联的snp分子标记，其特征在于，若授粉后合子2个snp多态性位点的基因型均为自交亲和性状表型对应的基因型，或只含有1个snp多态性位点的基因型为自交亲和性状表型对应的基因型，则油茶植株为自交亲和性状表型，个体呈现高座果率；若2个snp多态性位点的基因型均为自交不亲和性状表型对应的基因型，则油茶植株为自交不亲和性状表型，个体呈现低座果率。7.根据权利要求6所述的油茶自交不亲和关联的snp分子标记，其特征在于，授粉后合子2个snp多态性位点的基因型均为自交亲和性状表型对应的基因型的自交亲和性高于只含有1个snp多态性位点的基因型为自交亲和性状表型对应的基因型的油茶植株，即授粉后合子2个snp多态性位点的基因型均为自交亲和性状表型对应的基因型的植株的座果率高于只含有1个snp多态性位点的基因型为自交亲和性状表型对应的基因型的植株的座果率。8.权利要求3
‑
7任一项所述的油茶自交不亲和关联的snp分子标记的应用，其特征在于，包括以下至少一种：(1)鉴定油茶林地配置品种授粉亲和性状表型；(2)早期预测油茶新造林地油茶品种配置授粉亲和性状表型；(3)油茶新造林地科学配置品种；(4)油茶种质资源鉴定和改良。9.根据权利要求8所述的应用，其特征在于，选择授粉后合子snp071031多态性位点基因型为cc或ca和/或snp181968多态性位点基因型为aa或ag的油茶品种为油茶林地高座果率的配置品种。
10.根据权利要求8所述的应用，其特征在于，若授粉后合子2个snp多态性位点的基因型均为自交亲和性状表型对应的基因型，或只含有1个snp多态性位点的基因型为自交亲和性状表型对应的基因型，则油茶植株为自交亲和性状表型；若2个snp多态性位点的基因型均为自交不亲和性状表型对应的基因型，则油茶植株为自交不亲和性状表型；进一步地，授粉后合子2个snp多态性位点的基因型均为自交亲和性状表型对应的基因型的自交亲和性高于只含有1个snp多态性位点的基因型为自交亲和性状表型对应的基因型的油茶植株；对应油茶个体座果率，授粉后合子2个snp多态性位点的基因型均为自交亲和性状表型对应的基因型的植株的座果率高于只含有1个snp多态性位点的基因型为自交亲和性状表型对应的基因型的植株的座果率。

技术总结
本发明公开了一种油茶自交不亲和关联基因、SNP标记及应用。CoMAPK9的基因组序列的OFR中SNP071031位置上存在SNP错义突变，碱基由C变成A，SNP181968位置上存在SNP错义突变，碱基由A变成G，两个位点SNP突变与油茶自交不亲和性状之间有显著相关性，表现为授粉后SNP071031位点基因型CC或CA的座果率显著高于基因型AA的座果率，授粉后SNP181968位点基因型AA或AG的座果率显著高于基因型GG的座果率。利用该基因SNP组合分子标记可进行油茶座果率表型苗期鉴定，有效提高油茶新造林地品种配置选择效率和油茶单位面积产量。选择效率和油茶单位面积产量。


技术研发人员：江南 谭晓风 周俊琴
受保护的技术使用者：中南林业科技大学
技术研发日：2021.08.25
技术公布日：2021/10/15