用于骨髓恶性肿瘤诊断的突变钙网蛋白的制作方法

技术特征：
1.对钙网蛋白基因的至少一种突变等位基因具有特异性的探针、引物、引物对、抗体和/或适配体在制备用于评估患者是否患有骨髓恶性肿瘤或易于患有骨髓恶性肿瘤的组合物中的用途，所述评估包含：
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确定钙网蛋白基因的一种或多种突变等位基因在来自所述患者的样品中的存在；和
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当所述钙网蛋白基因的一种或多种突变等位基因存在时，评定所述患者患有骨髓恶性肿瘤或易于患有骨髓恶性肿瘤。2.根据权利要求1所述的用途，其中所述一种或多种突变等位基因包含编码突变钙网蛋白蛋白质的核酸。3.根据权利要求2所述的用途，其中所述突变钙网蛋白蛋白质选自于由以下各项组成的组：(a)包含在seq id no:4中示出的氨基酸序列的蛋白质；(b)在(a)中定义的蛋白质，其中缺失、插入、添加或取代了一个或多个氨基酸；(c)由编码包含在seq id no:4中示出的氨基酸序列的蛋白质的核酸分子所编码的蛋白质；(d)与(a)
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(c)中任一项的蛋白质具有至少70％同一性的蛋白质；和(e)包含由如下核酸编码的氨基酸序列的蛋白质，所述核酸由于遗传密码而与在(c)中定义的核酸的核苷酸序列是简并的。4.根据权利要求2或3所述的用途，其中所述突变钙网蛋白蛋白质选自于由以下各项组成的组：(a)包含在seq id no:4、8、12、16、20、24、28、32、36、40、44、48、52、56、60、64、68、72、76、80、84、88、92、96、100、104、108、112、116、120、124、128、132、136、140或144中示出的氨基酸序列的蛋白质；(b)在(a)中定义的蛋白质，其中缺失、插入、添加或取代了一个或多个氨基酸；(c)由编码包含在seq id no:4、8、12、16、20、24、28、32、36、40、44、48、52、56、60、64、68、72、76、80、84、88、92、96、100、104、108、112、116、120、124、128、132、136、140或144中示出的氨基酸序列的蛋白质的核酸分子所编码的蛋白质；(d)与(a)
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(c)中任一项的蛋白质具有至少70％同一性的蛋白质；和(e)包含由如下核酸编码的氨基酸序列的蛋白质，所述核酸由于遗传密码而与在(c)中定义的核酸的核苷酸序列是简并的。5.根据权利要求2
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4中任一项所述的用途，其中所述突变钙网蛋白蛋白质选自于由以下各项组成的组：(a)由具有在seq id no:291、292、293、295、296、297、299、300、301、303、304、305、307、308、309、311、312、313、315、316、317、319、320、321、323、324、325、327、328、329、331、332、333、335、336、337、339、340、341、343、344、345、347、348、349、351、352、353、355、356、357、359、360、361、363、364、365、367、368、369、371、372、373、375、376、377、379、380、381、383、384、385、387、388、389、391、392、393、395、396、397、399、400、401、403、404、405、407、408、409、411、412、413、415、416、417、419、420、421、423、424、425、427、428、429、431、432或433中描绘的核酸序列的核酸分子编码的蛋白质；(b)包含在seq id no:294、298、302、306、310、314、318、322、326、330、334、338、342、
346、350、354、358、362、366、370、374、378、382、386、390、394、398、402、406、410、414、418、422、426、430或434中示出的氨基酸序列的蛋白质；(c)在(a)或(b)中定义的蛋白质，其中缺失、插入、添加或取代了一个或多个氨基酸；(d)由编码包含在seq id no:294、298、302、306、310、314、318、322、326、330、334、338、342、346、350、354、358、362、366、370、374、378、382、386、390、394、398、402、406、410、414、418、422、426、430或434中示出的氨基酸序列的蛋白质的核酸分子所编码的蛋白质；(e)与(a)
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(d)中任一项的蛋白质具有至少70％同一性的蛋白质；和(f)包含由如下核酸编码的氨基酸序列的蛋白质，所述核酸由于遗传密码而与在(a)或(d)中定义的核酸的核苷酸序列是简并的。6.根据权利要求2
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5中任一项所述的用途，其中所述突变钙网蛋白蛋白质选自于由以下各项组成的组：(a)由具有在seq id no:145、146、147、149、150、151、153、154、155、157、158、159、161、162、163、165、166、167、169、170、171、173、174、175、177、178、179、181、182、183、185、186、187、189、190、191、193、194、195、197、198、199、201、202、203、205、206、207、209、210、211、213、214、215、217、218、219、221、222、223、225、226、227、229、230、231、233、234、235、237、238、239、241、242、243、245、246、247、249、250、251、253、254、255、257、258、259、261、262、263、265、266、267、269、270、271、273、274、275、277、278、279、281、282、283、285、286或287中描绘的核酸序列的核酸分子编码的蛋白质；(b)包含在seq id no:148、152、156、160、164、168、172、176、180、184、188、192、196、200、204、208、212、216、220、224、228、232、236、240、244、248、252、256、260、264、268、272、276、280、284或288中示出的氨基酸序列的蛋白质；(c)在(a)或(b)中定义的蛋白质，其中缺失、插入、添加或取代了一个或多个氨基酸；(d)由编码包含在seq id no:148、152、156、160、164、168、172、176、180、184、188、192、196、200、204、208、212、216、220、224、228、232、236、240、244、248、252、256、260、264、268、272、276、280、284或288中示出的氨基酸序列的蛋白质的核酸分子所编码的蛋白质；(e)与(a)
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(d)中任一项的蛋白质具有至少70％同一性的蛋白质；和(f)包含由如下核酸编码的氨基酸序列的蛋白质，所述核酸由于遗传密码而与在(a)或(d)中定义的核酸的核苷酸序列是简并的。7.根据权利要求1
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6中任一项所述的用途，其中所述突变等位基因具有在所述钙网蛋白基因的外显子9中的突变。8.根据权利要求1
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7中任一项所述的用途，其中所述突变等位基因与野生型钙网蛋白基因相比具有移码突变。9.根据权利要求8所述的用途，其中所述移码突变处在所述钙网蛋白质基因的外显子9中。10.根据权利要求8或9所述的用途，其中所述移码突变是一个核苷酸的缺失或者两个核苷酸的添加。11.根据权利要求8或9中任一项所述的用途，其中从所述钙网蛋白基因缺失(1 (3
×
n0))个核苷酸。12.根据权利要求8、9和11中任一项所述的用途，其中缺失1、4、19、22、31、34、46、52个
核苷酸。13.根据权利要求8、9、11和12中任一项所述的用途，其中缺失1个核苷酸并且其中插入6个核苷酸；其中缺失2个核苷酸并且其中插入4个核苷酸；其中缺失3个核苷酸并且其中插入5个核苷酸；其中缺失12个核苷酸并且其中插入5个核苷酸；其中缺失18个核苷酸并且其中插入11个核苷酸；其中缺失18个核苷酸并且其中插入14个核苷酸；其中缺失20个核苷酸并且其中插入1个核苷酸；其中缺失28个核苷酸并且其中插入6个核苷酸；其中缺失35个核苷酸并且其中插入1个核苷酸；或者其中缺失36个核苷酸并且其中插入2个核苷酸。14.根据权利要求8或9所述的用途，其中在所述钙网蛋白基因中插入(2 (3
×
n0))个核苷酸。15.根据权利要求14所述的用途，其中插入5个核苷酸。16.根据权利要求1
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15中任一项所述的用途，其中野生型钙网蛋白基因包含选自于由以下各项组成的组中的序列：(a)编码在seq id no:290中描绘的氨基酸序列的多肽的核酸；(b)包含在seq id no:289中描绘的核苷酸序列的核酸；(c)在严格条件下杂交到在(a)或(b)中定义的核酸的互补链的核酸；(d)包含与(a)
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(c)中任一项的核酸的核苷酸序列具有至少70％同一性的核苷酸序列的核酸；和(e)包含由于遗传密码而与(a)
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(d)中任一项的核酸的核苷酸序列是简并的核苷酸序列的核酸。17.根据权利要求10
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16中任一项所述的用途，其中所述核苷酸是从所述钙网蛋白基因的外显子9中缺失的和/或被插入到所述钙网蛋白基因的外显子9中。18.根据权利要求9
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17中任一项所述的用途，其中野生型钙网蛋白基因的所述外显子9包含选自于由以下各项组成的组中的序列：(a)编码包含在seq id no:436中描绘的氨基酸序列的多肽的核酸；(b)包含在seq id no:435中描绘的核苷酸序列的核酸；(c)在严格条件下杂交到在(a)或(b)中定义的核酸的互补链的核酸；(d)包含与(a)
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(c)中任一项的核酸的核苷酸序列具有至少70％同一性的核苷酸序列的核酸；和(e)包含由于遗传密码而与(a)
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(d)中任一项的核酸的核苷酸序列是简并的核苷酸序列的核酸。19.根据权利要求1
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18中任一项所述的用途，其中所述突变等位基因包含由以下各项组成的组中的核酸：(a)编码包含在seq id no:4、8、12、16、20、24、28、32、36、40、44、48、52、56、60、64、68、72、76、80、84、88、92、96、100、104、108、112、116、120、124、128、132、136、140、144、148、152、
156、160、164、168、172、176、180、184、188、192、196、200、204、208、212、216、220、224、228、232、236、240、244、248、252、256、260、264、268、272、276、280、284、288；294、298、302、306、310、314、318、322、326、330、334、338、342、346、350、354、358、362、366、370、374、378、382、386、390、394、398、402、406、410、414、418、422、426、430或434中描绘的氨基酸序列的多肽的核酸；(b)包含在seq id no:145、149、153、157、161、165、169、173、177、181、185、189、193、197、201、205、209、213、217、221、225、229、233、237、241、245、249、253、257、261、265、269、273、277、281、285、291、295、299、303、307、311、315、319、323、327、331、335、339、343、347、351、355、359、363、367、371、375、379、383、387、391、395、399、403、407、411、415、419、423、427或431中描绘的核苷酸序列的核酸；(c)包含与(a)或(b)中任一项的核酸的核苷酸序列具有至少70％同一性的核苷酸序列的核酸；和(d)包含由于遗传密码而与(a)
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(c)中任一项的核酸的核苷酸序列是简并的核苷酸序列的核酸。20.根据权利要求1
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19中任一项所述的用途，其中所述突变等位基因是dna，优选基因组dna。21.根据权利要求20所述的用途，其中通过测序来确定所述dna的存在。22.对钙网蛋白基因的一种或多种突变等位基因的基因产物具有特异性的探针、引物、引物对、抗体和/或适配体在制备用于评估患者是否患有骨髓恶性肿瘤或易于患有骨髓恶性肿瘤的的组合物中的用途，所述评估包含：
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确定钙网蛋白基因的一种或多种突变等位基因的基因产物在来自所述患者的样品中的存在；和
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当所述基因产物存在时，评定所述患者患有骨髓恶性肿瘤或易于患有骨髓恶性肿瘤。23.根据权利要求22所述的用途，其中所述一种或多种突变等位基因包含编码突变钙网蛋白蛋白质的核酸。24.根据权利要求23所述的用途，其中所述突变钙网蛋白蛋白质选自于由以下各项组成的组：(a)包含在seq id no:4中示出的氨基酸序列的蛋白质；(b)在(a)中定义的蛋白质，其中缺失、插入、添加或取代了一个或多个氨基酸；(c)由编码包含在seq id no:4中示出的氨基酸序列的蛋白质的核酸分子所编码的蛋白质；(d)与(a)
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(c)中任一项的蛋白质具有至少70％同一性的蛋白质；和(e)包含由如下核酸编码的氨基酸序列的蛋白质，所述核酸由于遗传密码而与(c)中定义的核酸的核苷酸序列是简并的。25.根据权利要求23或24所述的用途，其中所述突变钙网蛋白蛋白质选自于由以下各项组成的组：(a)包含在seq id no:4、8、12、16、20、24、28、32、36、40、44、48、52、56、60、64、68、72、76、80、84、88、92、96、100、104、108、112、116、120、124、128、132、136、140或144中示出的氨基酸序列的蛋白质；
(b)在(a)中定义的蛋白质，其中缺失、插入、添加或取代了一个或多个氨基酸；(c)由编码包含在seq id no:4、8、12、16、20、24、28、32、36、40、44、48、52、56、60、64、68、72、76、80、84、88、92、96、100、104、108、112、116、120、124、128、132、136、140或144中示出的氨基酸序列的蛋白质的核酸分子所编码的蛋白质；(d)与(a)
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(c)中任一项的蛋白质具有至少70％同一性的蛋白质；和(e)包含由如下核酸编码的氨基酸序列的蛋白质，所述核酸由于遗传密码而与(c)中定义的核酸的核苷酸序列是简并的。26.根据权利要求23
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25中任一项所述的用途，其中所述钙网蛋白蛋白质选自于由以下各项组成的组：(a)由具有在seq id no:291、292、293、295、296、297、299、300、301、303、304、305、307、308、309、311、312、313、315、316、317、319、320、321、323、324、325、327、328、329、331、332、333、335、336、337、339、340、341、343、344、345、347、348、349、351、352、353、355、356、357、359、360、361、363、364、365、367、368、369、371、372、373、375、376、377、379、380、381、383、384、385、387、388、389、391、392、393、395、396、397、399、400、401、403、404、405、407、408、409、411、412、413、415、416、417、419、420、421、423、424、425、427、428、429、431、432或433中描绘的核酸序列的核酸分子编码的蛋白质；(b)包含在seq id no:294、298、302、306、310、314、318、322、326、330、334、338、342、346、350、354、358、362、366、370、374、378、382、386、390、394、398、402、406、410、414、418、422、426、430或434中示出的氨基酸序列的蛋白质；(c)在(a)或(b)中定义的蛋白质，其中缺失、插入、添加或取代了一个或多个氨基酸；(d)由编码包含在seq id no:294、298、302、306、310、314、318、322、326、330、334、338、342、346、350、354、358、362、366、370、374、378、382、386、390、394、398、402、406、410、414、418、422、426、430或434中示出的氨基酸序列的蛋白质的核酸分子所编码的蛋白质；(e)与(a)
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(d)中任一项的蛋白质具有至少70％同一性的蛋白质；和(f)包含由如下核酸编码的氨基酸序列的蛋白质，所述核酸由于遗传密码而与(a)或(c)中定义的核酸的核苷酸序列是简并的。27.根据权利要求23
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26中任一项所述的用途，其中所述突变钙网蛋白蛋白质选自于由以下各项组成的组：(a)由具有在seq id no:145、146、147、149、150、151、153、154、155、157、158、159、161、162、163、165、166、167、169、170、171、173、174、175、177、178、179、181、182、183、185、186、187、189、190、191、193、194、195、197、198、199、201、202、203、205、206、207、209、210、211、213、214、215、217、218、219、221、222、223、225、226、227、229、230、231、233、234、235、237、238、239、241、242、243、245、246、247、249、250、251、253、254、255、257、258、259、261、262、263、265、266、267、269、270、271、273、274、275、277、278、279、281、282、283、285、286或287中描绘的核酸序列的核酸分子编码的蛋白质；(b)包含在seq id no:148、152、156、160、164、168、172、176、180、184、188、192、196、200、204、208、212、216、220、224、228、232、236、240、244、248、252、256、260、264、268、272、276、280、284或288中示出的氨基酸序列的蛋白质；(c)在(a)或(b)中定义的蛋白质，其中缺失、插入、添加或取代了一个或多个氨基酸；
(d)由编码包含在seq id no:148、152、156、160、164、168、172、176、180、184、188、192、196、200、204、208、212、216、220、224、228、232、236、240、244、248、252、256、260、264、268、272、276、280、284或288中示出的氨基酸序列的蛋白质的核酸分子所编码的蛋白质；(e)与(a)
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(d)中任一项的蛋白质具有至少70％同一性的蛋白质；和(f)包含由如下核酸编码的氨基酸序列的蛋白质，所述核酸由于遗传密码而与(a)或(d)中定义的核酸的核苷酸序列是简并的。28.根据权利要求22
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27中任一项所述的用途，其中所述等位基因包含选自于由以下各项组成的组中的核酸：(a)编码包含在seq id no:4、8、12、16、20、24、28、32、36、40、44、48、52、56、60、64、68、72、76、80、84、88、92、96、100、104、108、112、116、120、124、128、132、136、140、144、148、152、156、160、164、168、172、176、180、184、188、192、196、200、204、208、212、216、220、224、228、232、236、240、244、248、252、256、260、264、268、272、276、280、284、288；294、298、302、306、310、314、318、322、326、330、334、338、342、346、350、354、358、362、366、370、374、378、382、386、390、394、398、402、406、410、414、418、422、426、430或434中描绘的氨基酸序列的多肽的核酸；(b)包含在seq id no:145、149、153、157、161、165、169、173、177、181、185、189、193、197、201、205、209、213、217、221、225、229、233、237、241、245、249、253、257、261、265、269、273、277、281、285、291、295、299、303、307、311、315、319、323、327、331、335、339、343、347、351、355、359、363、367、371、375、379、383、387、391、395、399、403、407、411、415、419、423、427或431中描绘的核苷酸序列的核酸；(c)包含与(a)或(b)中任一项的核酸的核苷酸序列具有至少70％同一性的核苷酸序列的核酸；和(d)包含由于遗传密码而与(a)
‑
(c)中任一项的核酸的核苷酸序列是简并的核苷酸序列的核酸。29.根据权利要求22
‑
28中任一项所述的用途，其中所述基因产物包含选自于由以下各项组成的组中的核酸：(a)编码包含在seq id no:4中描绘的氨基酸序列的多肽的核酸；(b)包含与(a)的核酸的核苷酸序列具有至少70％同一性的核苷酸序列的核酸；和(c)包含由于遗传密码而与(a)
‑
(b)中任一项的核酸的核苷酸序列是简并的核苷酸序列的核酸。30.根据权利要求22
‑
29中任一项所述的用途，其中所述基因产物包含选自于由以下各项组成的组中的核酸：(a)编码包含在seq id no:4、8、12、16、20、24、28、32、36、40、44、48、52、56、60、64、68、72、76、80、84、88、92、96、100、104、108、112、116、120、124、128、132、136、140或144中描绘的氨基酸序列的多肽的核酸；(b)包含与(a)的核酸的核苷酸序列具有至少70％同一性的核苷酸序列的核酸；和(c)包含由于遗传密码而与(a)或(b)中任一项的核酸的核苷酸序列是简并的核苷酸序列的核酸。31.根据权利要求22
‑
30中任一项所述的用途，其中所述基因产物包含选自于由以下各
项组成的组中的核酸：(a)编码在seq id no:294、298、302、306、310、314、318、322、326、330、334、338、342、346、350、354、358、362、366、370、374、378、382、386、390、394、398、402、406、410、414、418、422、426、430或434中描绘的氨基酸序列的多肽的核酸；(b)包含在seq id no:293、297、301、305、309、313、317、321、325、329、333、337、341、345、349、353、357、361、365、369、373、377、381、385、389、393、397、401、405、409、413、417、421、425、429或433中描绘的核苷酸序列的核酸；(c)包含与(a)或(b)中任一项的核酸的核苷酸序列具有至少70％同一性的核苷酸序列的核酸；和(d)包含由于遗传密码而与(a)
‑
(c)中任一项的核酸的核苷酸序列是简并的核苷酸序列的核酸。32.根据权利要求22
‑
31中任一项所述的用途，其中所述基因产物包含选自于由以下各项组成的组中的核酸：(a)编码包含在seq id no:148、152、156、160、164、168、172、176、180、184、188、192、196、200、204、208、212、216、220、224、228、232、236、240、244、248、252、256、260、264、268、272、276、280、284或288中描绘的氨基酸序列的多肽的核酸；(b)包含在seq id no:147、151、155、159、163、167、171、175、179、183、187、191、195、199、203、207、211、215、219、223、227、231、235、239、243、247、251、255、259、263、267、271、275、279、283或287中描绘的核苷酸序列的核酸；(c)包含与(a)
‑
(b)中任一项的核酸的核苷酸序列具有至少70％同一性的核苷酸序列的核酸；和(d)包含由于遗传密码而与(a)
‑
(c)中任一项的核酸的核苷酸序列是简并的核苷酸序列的核酸。33.根据权利要求22
‑
28中任一项所述的用途，其中所述基因产物包含选自于由以下各项组成的组中的多肽：(a)包含在seq id no:4中示出的氨基酸序列的蛋白质；(b)在(a)中定义的蛋白质，其中缺失、插入、添加或取代了一个或多个氨基酸；(c)由编码包含在seq id no:4中示出的氨基酸序列的蛋白质的核酸分子所编码的蛋白质；(d)与(a)
‑
(c)中任一项的蛋白质具有至少70％同一性的蛋白质；和(e)包含由如下核酸编码的氨基酸序列的蛋白质，所述核酸由于遗传密码而与(c)中定义的核酸的核苷酸序列是简并的。34.根据权利要求22
‑
28和33中任一项所述的用途，其中所述基因产物包含选自于由以下各项组成的组中的多肽：(a)包含在seq id no:4、8、12、16、20、24、28、32、36、40、44、48、52、56、60、64、68、72、76、80、84、88、92、96、100、104、108、112、116、120、124、128、132、136、140或144中示出的氨基酸序列的蛋白质；(b)在(a)中定义的蛋白质，其中缺失、插入、添加或取代了一个或多个氨基酸；(c)由编码包含在seq id no:4、8、12、16、20、24、28、32、36、40、44、48、52、56、60、64、
68、72、76、80、84、88、92、96、100、104、108、112、116、120、124、128、132、136、140或144中示出的氨基酸序列的蛋白质的核酸分子所编码的蛋白质；(d)与(a)
‑
(c)中任一项的蛋白质具有至少70％同一性的蛋白质；和(e)包含由如下核酸编码的氨基酸序列的蛋白质，所述核酸由于遗传密码而与(c)中定义的核酸的核苷酸序列是简并的。35.根据权利要求22
‑
28、33和34中任一项所述的用途，其中所述基因产物包含由以下各项组成的组中的多肽：(a)由具有在seq id no:291、292、293、295、296、297、299、300、301、303、304、305、307、308、309、311、312、313、315、316、317、319、320、321、323、324、325、327、328、329、331、332、333、335、336、337、339、340、341、343、344、345、347、348、349、351、352、353、355、356、357、359、360、361、363、364、365、367、368、369、371、372、373、375、376、377、379、380、381、383、384、385、387、388、389、391、392、393、395、396、397、399、400、401、403、404、405、407、408、409、411、412、413、415、416、417、419、420、421、423、424、425、427、428、429、431、432或433中描绘的核酸序列的核酸分子编码的蛋白质；(b)包含在seq id no:294、298、302、306、310、314、318、322、326、330、334、338、342、346、350、354、358、362、366、370、374、378、382、386、390、394、398、402、406、410、414、418、422、426、430或434中示出的氨基酸序列的蛋白质；(c)在(a)或(b)中定义的蛋白质，其中缺失、插入、添加或取代了一个或多个氨基酸；(d)由编码包含在seq id no:294、298、302、306、310、314、318、322、326、330、334、338、342、346、350、354、358、362、366、370、374、378、382、386、390、394、398、402、406、410、414、418、422、426、430或434中示出的氨基酸序列的蛋白质的核酸分子所编码的蛋白质；(e)与(a)
‑
(d)中任一项的蛋白质具有至少70％同一性的蛋白质；和(f)包含由如下核酸编码的氨基酸序列的蛋白质，所述核酸由于遗传密码而与(a)或(d)中定义的核酸的核苷酸序列是简并的。36.根据权利要求22
‑
28和33
‑
35中任一项所述的用途，其中所述基因产物包含选自于由以下各项组成的组中的多肽：(a)由具有在seq id no:145、146、147、149、150、151、153、154、155、157、158、159、161、162、163、165、166、167、169、170、171、173、174、175、177、178、179、181、182、183、185、186、187、189、190、191、193、194、195、197、198、199、201、202、203、205、206、207、209、210、211、213、214、215、217、218、219、221、222、223、225、226、227、229、230、231、233、234、235、237、238、239、241、242、243、245、246、247、249、250、251、253、254、255、257、258、259、261、262、263、265、266、267、269、270、271、273、274、275、277、278、279、281、282、283、285、286或287中描绘的核酸序列的核酸分子编码的蛋白质；(b)包含在seq id no:148、152、156、160、164、168、172、176、180、184、188、192、196、200、204、208、212、216、220、224、228、232、236、240、244、248、252、256、260、264、268、272、276、280、284或288中示出的氨基酸序列的蛋白质；(c)在(a)或(b)中定义的蛋白质，其中缺失、插入、添加或取代了一个或多个氨基酸；(d)由编码包含在seq id no:148、152、156、160、164、168、172、176、180、184、188、192、196、200、204、208、212、216、220、224、228、232、236、240、244、248、252、256、260、264、268、
272、276、280、284或288中示出的氨基酸序列的蛋白质的核酸分子所编码的蛋白质；(e)与(a)
‑
(d)中任一项的蛋白质具有至少70％同一性的蛋白质；和(f)包含由如下核酸编码的氨基酸序列的蛋白质，所述核酸由于遗传密码而与(a)或(d)中定义的核酸的核苷酸序列是简并的。37.根据权利要求22
‑
36中任一项所述的用途，其中所述基因产物是mrna。38.根据权利要求37所述的用途，其中通过实时pcr、逆转录酶pcr、全转录组鸟枪法测序(rnaseq)、原位杂交或微阵列来确定所述mrna的存在或量。39.根据权利要求38所述的用途，其中通过实时pcr或逆转录酶pcr的确定进一步包含以下步骤：(i)使所述样品中的核酸与一种或两种寡核苷酸接触；(ii)产生含有靶序列的扩增产物。40.根据权利要求22
‑
28和33
‑
36中任一项所述的用途，其中所述基因产物是蛋白质。41.根据权利要求40所述的用途，其中通过免疫组织化学(ihc)，通过基于免疫测定、凝胶或印记的方法，ihc，质谱测定法，流式细胞术或facs来确定所述蛋白质的存在或量。42.根据权利要求1
‑
41中任一项所述的用途，其中所述患者是人类患者。43.根据权利要求1
‑
42中任一项所述的用途，其中所述样品是骨髓样品。44.根据权利要求1
‑
42中任一项所述的用途，其中所述样品是血液样品。45.根据权利要求43所述的用途，其中所述骨髓样品是通过活组织检查获得的。46.一种核酸，其中所述核酸选自于由以下各项组成的组：(a)编码包含在seq id no:294、298、302、306、310、314、318、322、326、330、334、338、342、346、350、354、358、362、366、370、374、378、382、386、390、394、398、402、406、410、414、418、422、426、430或434中描绘的氨基酸序列的多肽的核酸；(b)包含在seq id no:292、296、300、304、308、312、316、320、324、328、332、336、340、344、348、352、356、360、364、368、372、376、380、384、388、392、396、400、404、408、412、416、420、424、428或432中描绘的核苷酸序列的核酸；(c)包含与(a)
‑
(b)中任一项的核酸的核苷酸序列具有至少70％同一性的核苷酸序列的核酸；和(d)包含如下核苷酸序列的核酸，所述核苷酸序列由于遗传密码而与(a)
‑
(c)中任一项的核酸的核苷酸序列是简并的。47.一种核酸，其中所述核酸选自于由以下各项组成的组：(a)编码包含在seq id no:148、152、156、160、164、168、172、176、180、184、188、192、196、200、204、208、212、216、220、224、228、232、236、240、244、248、252、256、260、264、268、272、276、280、284或288中描绘的氨基酸序列的多肽的核酸；(b)包含在seq id no:146、150、154、158、162、166、170、174、178、182、186、190、194、198、202、206、210、214、218、222、226、230、234、238、242、246、250、254、258、262、266、270、274、278、282或286中描绘的核苷酸序列的核酸；(c)包含与(a)
‑
(b)中任一项的核酸的核苷酸序列具有至少70％同一性的核苷酸序列的核酸；和(d)包含如下核苷酸序列的核酸，所述核苷酸序列由于遗传密码而与(a)
‑
(c)中任一项
的核酸的核苷酸序列是简并的。48.根据权利要求46
‑
47中任一项所述的核酸，其中所述核酸是cdna。49.一种核酸，其中所述核酸选自于由以下各项组成的组：(a)编码包含在seq id no:294、298、302、306、310、314、318、322、326、330、334、338、342、346、350、354、358、362、366、370、374、378、382、386、390、394、398、402、406、410、414、418、422、426、430或434中描绘的氨基酸序列的多肽的核酸；(b)包含在seq id no:293、297、301、305、309、313、317、321、325、329、333、337、341、345、349、353、357、361、365、369、373、377、381、385、389、393、397、401、405、409、413、417、421、425、429或433中描绘的核苷酸序列的核酸；(c)包含与(a)
‑
(b)中任一项的核酸的核苷酸序列具有至少70％同一性的核苷酸序列的核酸；和(d)包含如下核苷酸序列的核酸，所述核苷酸序列由于遗传密码而与(a)
‑
(c)中任一项的核酸的核苷酸序列是简并的。50.一种核酸，其中所述核酸选自于由以下各项组成的组：(a)编码包含在seq id no:148、152、156、160、164、168、172、176、180、184、188、192、196、200、204、208、212、216、220、224、228、232、236、240、244、248、252、256、260、264、268、272、276、280、284或288中描绘的氨基酸序列的多肽的核酸；(b)包含在seq id no:147、151、155、159、163、167、171、175、179、183、187、191、195、199、203、207、211、215、219、223、227、231、235、239、243、247、251、255、259、263、267、271、275、279、283或287中描绘的核苷酸序列的核酸；(c)包含与(a)
‑
(b)中任一项的核酸的核苷酸序列具有至少70％同一性的核苷酸序列的核酸；和(d)包含如下核苷酸序列的核酸，所述核苷酸序列由于遗传密码而与(a)
‑
(c)中任一项的核酸的核苷酸序列是简并的。51.根据权利要求49
‑
50中任一项所述的核酸，其中所述核酸是mrna。52.一种核酸，其中所述核酸选自于由以下各项组成的组：(a)编码包含在seq id no:294、298、302、306、310、314、318、322、326、330、334、338、342、346、350、354、358、362、366、370、374、378、382、386、390、394、398、402、406、410、414、418、422、426、430或434中描绘的氨基酸序列的多肽的核酸；(b)包含在seq id no:291、295、299、303、307、311、315、319、323、327、331、335、339、343、347、351、355、359、363、367、371、375、379、383、387、391、395、399、403、407、411、415、419、423、427或431中描绘的核苷酸序列的核酸；(c)包含与(a)
‑
(b)中任一项的核酸的核苷酸序列具有至少70％同一性的核苷酸序列的核酸；和(d)包含如下核苷酸序列的核酸，所述核苷酸序列由于遗传密码而与(a)
‑
(c)中任一项的核酸的核苷酸序列是简并的。53.一种核酸，其中所述核酸选自于由以下各项组成的组：(a)编码包含在seq id no:148、152、156、160、164、168、172、176、180、184、188、192、196、200、204、208、212、216、220、224、228、232、236、240、244、248、252、256、260、264、268、
272、276、280、284或288中描绘的氨基酸序列的多肽的核酸；(b)包含在seq id no:145、149、153、157、161、165、169、173、177、181、185、189、193、197、201、205、209、213、217、221、225、229、233、237、241、245、249、253、257、261、265、269、273、277、281或285中描绘的核苷酸序列的核酸；(c)包含与(a)
‑
(b)中任一项的核酸的核苷酸序列具有至少70％同一性的核苷酸序列的核酸；和(d)包含如下核苷酸序列的核酸，所述核苷酸序列由于遗传密码而与(a)
‑
(c)中任一项的核酸的核苷酸序列是简并的。54.根据权利要求52
‑
53中任一项所述的核酸，其中所述核酸是基因组dna。55.一种蛋白质，选自于由以下各项组成的组：(a)包含在seq id no:4中示出的氨基酸序列的蛋白质；(b)在(a)中定义的蛋白质，其中缺失、插入、添加或取代了一个或多个氨基酸；(c)与(a)
‑
(b)中任一项的蛋白质具有至少70％同一性的蛋白质；和(d)在seq id no:4中示出的蛋白质的片段，所述片段包含在seq id no:4中示出的蛋白质的15
‑
40个连续氨基酸或由其组成，优选包含在seq id no:4中示出的蛋白质的25
‑
40个连续氨基酸或由其组成，更优选包含在seq id no:4中示出的蛋白质的36个连续氨基酸或由其组成。56.根据权利要求55所述的蛋白质，其中所述蛋白质选自于由以下各项组成的组：(a)包含在seq id no:4、8、12、16、20、24、28、32、36、40、44、48、52、56、60、64、68、72、76、80、84、88、92、96、100、104、108、112、116、120、124、128、132、136、140或144中示出的氨基酸序列的蛋白质；(b)在(a)中定义的蛋白质，其中缺失、插入、添加或取代了一个或多个氨基酸；(c)与(a)
‑
(b)中任一项的蛋白质具有至少70％同一性的蛋白质；和(d)在seq id no:4、8、12、16、20、24、28、32、36、40、44、48、52、56、60、64、68、72、76、80、84、88、92、96、100、104、108、112、116、120、124、128、132、136、140或144的任一项中示出的蛋白质的片段，所述片段包含在seq id no:4、8、12、16、20、24、28、32、36、40、44、48、52、56、60、64、68、72、76、80、84、88、92、96、100、104、108、112、116、120、124、128、132、136、140或144的任一项中示出的蛋白质的15
‑
40个连续氨基酸或由其组成，优选包含在seq id no:4、8、12、16、20、24、28、32、36、40、44、48、52、56、60、64、68、72、76、80、84、88、92、96、100、104、108、112、116、120、124、128、132、136、140或144的任一项中示出的蛋白质的25
‑
40个连续氨基酸或由其组成，更优选包含在seq id no:4、8、12、16、20、24、28、32、36、40、44、48、52、56、60、64、68、72、76、80、84、88、92、96、100、104、108、112、116、120、124、128、132、136、140或144的任一项中示出的蛋白质的36个连续氨基酸或由其组成。57.根据权利要求55或56所述的蛋白质，其中所述蛋白质选自于由以下各项组成的组：(a)由具有在seq id no:291、292、293、295、296、297、299、300、301、303、304、305、307、308、309、311、312、313、315、316、317、319、320、321、323、324、325、327、328、329、331、332、333、335、336、337、339、340、341、343、344、345、347、348、349、351、352、353、355、356、357、359、360、361、363、364、365、367、368、369、371、372、373、375、376、377、379、380、381、383、384、385、387、388、389、391、392、393、395、396、397、399、400、401、403、404、405、407、408、
409、411、412、413、415、416、417、419、420、421、423、424、425、427、428、429、431、432或433中描绘的核酸序列的核酸分子编码的蛋白质；(b)包含在seq id no:294、298、302、306、310、314、318、322、326、330、334、338、342、346、350、354、358、362、366、370、374、378、382、386、390、394、398、402、406、410、414、418、422、426、430或434中示出的氨基酸序列的蛋白质；(c)在(a)或(b)中定义的蛋白质，其中缺失、插入、添加或取代了一个或多个氨基酸；(d)由编码包含在seq id no:294、298、302、306、310、314、318、322、326、330、334、338、342、346、350、354、358、362、366、370、374、378、382、386、390、394、398、402、406、410、414、418、422、426、430或434中示出的氨基酸序列的蛋白质的核酸分子所编码的蛋白质；(e)与(a)
‑
(d)中任一项的蛋白质具有至少70％同一性的蛋白质；和(f)包含如下核酸编码的氨基酸序列的蛋白质，所述核酸由于遗传密码而与在(a)或(d)中定义的核酸的核苷酸序列是简并的。58.根据权利要求55
‑
57中任一项所述的蛋白质，其中所述蛋白质选自于由以下各项组成的组：(a)由具有在seq id no:145、146、147、149、150、151、153、154、155、157、158、159、161、162、163、165、166、167、169、170、171、173、174、175、177、178、179、181、182、183、185、186、187、189、190、191、193、194、195、197、198、199、201、202、203、205、206、207、209、210、211、213、214、215、217、218、219、221、222、223、225、226、227、229、230、231、233、234、235、237、238、239、241、242、243、245、246、247、249、250、251、253、254、255、257、258、259、261、262、263、265、266、267、269、270、271、273、274、275、277、278、279、281、282、283、285、286或287中描绘的核酸序列的核酸分子编码的蛋白质；(b)包含在seq id no:148、152、156、160、164、168、172、176、180、184、188、192、196、200、204、208、212、216、220、224、228、232、236、240、244、248、252、256、260、264、268、272、276、280、284或288中示出的氨基酸序列的蛋白质；(c)在(a)或(b)中定义的蛋白质，其中缺失、插入、添加或取代了一个或多个氨基酸；(d)由编码包含在seq id no:148、152、156、160、164、168、172、176、180、184、188、192、196、200、204、208、212、216、220、224、228、232、236、240、244、248、252、256、260、264、268、272、276、280、284或288中示出的氨基酸序列的蛋白质的核酸分子所编码的蛋白质；(e)与(a)
‑
(d)中任一项的蛋白质具有至少70％同一性的蛋白质；和(f)包含如下核酸编码的氨基酸序列的蛋白质，所述核酸由于遗传密码而与在(a)或(d)中定义的核酸的核苷酸序列是简并的。59.一种疫苗，包含根据权利要求55或56所述的蛋白质。60.一种抗体，特异性地结合权利要求55
‑
58中任一项所述的蛋白质。61.一种sirna，特异性地靶向权利要求49
‑
51中任一项所述的核酸。62.根据权利要求61所述的sirna，其中所述sirna由包含至少十个连续碱基的核酸分子组成。63.根据权利要求61或62所述的sirna，其中所述连续碱基的多达10％是非互补的。64.根据权利要求61
‑
63中任一项所述的sirna，其中所述sirna进一步包含在5’末端的至少一个碱基和/或在3’末端的至少一个碱基。
65.一种突变钙网蛋白的抑制剂，在骨髓恶性肿瘤的治疗中使用。66.有效量的突变钙网蛋白的抑制剂在制备用于治疗骨髓恶性肿瘤患者的药物中的用途，所述治疗包含向所述患者给予所述药物。67.根据权利要求65所述的抑制剂或者根据权利要求66所述的用途，其中所述突变钙网蛋白是权利要求55
‑
58中任一项所限定的突变钙网蛋白蛋白质。68.根据权利要求65或67所述的抑制剂或者根据权利要求66或67中任一项所述的用途，其中所述抑制剂是抗体。69.根据权利要求65或67所述的抑制剂或者根据权利要求66或67中任一项所述的用途，其中所述抑制剂选自于由细胞外结合伴侣、小结合分子、适配体和内适体组成的组。70.根据权利要求65所述的抑制剂或者根据权利要求66所述的用途，其中所述突变钙网蛋白是权利要求49
‑
51中任一项所限定的核酸。71.根据权利要求65或70所述的抑制剂或根据权利要求66和70中任一项所述的用途，其中所述抑制剂选自于由sirna、mirna、dsrna、shrna、strna和反义分子组成的组。72.根据权利要求65和67
‑
71中任一项所述的抑制剂或者根据权利要求1
‑
45和66
‑
71中任一项所述的用途，其中所述骨髓恶性肿瘤是骨髓增殖性肿瘤。73.根据权利要求72所述的抑制剂或者根据权利要求72所述的用途，其中所述骨髓增殖性肿瘤是原发性骨髓纤维化(pmf)。74.根据权利要求73所述的抑制剂或者根据权利要求73所述的用途，其中所述骨髓增殖性肿瘤是原发性血小板增多症(et)。75.根据权利要求65和67
‑
71中任一项所述的抑制剂或者根据权利要求1
‑
45和66
‑
71中任一项所述的用途，其中所述骨髓恶性肿瘤是骨髓发育异常综合征。76.根据权利要求75所述的抑制剂或者根据权利要求75所述的用途，其中所述骨髓发育异常综合征是难治性贫血伴环形铁粒细胞增多和血小板增多(rars
‑
t)。77.根据权利要求65和67
‑
76中任一项所述的抑制剂或者根据权利要求66
‑
76中任一项所述的用途，其中待治疗的所述患者根据权利要求1
‑
45中任一项被评定为患有骨髓恶性肿瘤或者易于患有骨髓恶性肿瘤。78.根据权利要求55
‑
58中任一项所述的蛋白质、根据权利要求60所述的抗体、根据权利要求61
‑
64中任一项所述的sirna或者权利要求65
‑
71中任一项所限定的突变钙网蛋白的抑制剂，用作药物。79.一种载体，包含根据权利要求46
‑
48和52
‑
54中任一项所述的核酸。80.一种宿主细胞，包含根据权利要求46
‑
48和52
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54中任一项所述的核酸或者根据权利要求79所述的载体。81.一种用于生产根据权利要求55
‑
58中任一项所述的多肽的方法，所述方法包含在允许表达所述多肽的条件下培养根据权利要求80所述的宿主细胞，以及从培养物中回收所产生的多肽。

技术总结
本发明涉及用于骨髓恶性肿瘤诊断的突变钙网蛋白。具体公开了一种用于诊断骨髓恶性肿瘤的方法，该方法包含确定钙网蛋白基因的突变等位基因的存在。另外，所述突变钙网蛋白的基因组序列、cDNA序列、mRNA序列和蛋白质序列也是本发明的主题。再者，本发明涉及突变钙网蛋白的抑制剂的医疗用途。白的抑制剂的医疗用途。白的抑制剂的医疗用途。


技术研发人员：罗伯特
受保护的技术使用者：分子医学研究中心责任有限公司
技术研发日：2014.09.15
技术公布日：2021/10/29