一种生物标志物及其在肝内胆管细胞癌预后预测中的应用的制作方法

技术特征：
1.一种生物标志物，其特征在于，所述生物标志物选自lix1l、linc01822、tuba4a、ac023481.1、mfsd1、ac097173.1、fam153b、steap2/steap2
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as1、cdkn2b、fam205bp、gad2、letmd1、rassf3、ac073592.4、golga6b、orc6、tmem106a中的至少一种基因的基因区域，所述基因区域为基因的增强子、启动子、外显子、内含子、5’非翻译区或3’非翻译区。2.根据权利要求1所述的一种生物标志物，其特征在于，所述ac097173.1、steap2/steap2
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as1、rassf3、ac073592.4、golga6b的基因区域为增强子，所述mfsd1、fam153b、gad2、orc6的基因区域为内含子，所述lix1l、tuba4a的基因区域为外显子，所述linc01822的基因区域为启动子，所述tmem106a的基因区域为5’非翻译区，所述ac023481.1、cdkn2b、fam205bp的基因区域为5’非翻译区或外显子，所述letmd1的基因区域为3’非翻译区或外显子。3.根据权利要求1或2所述的一种生物标志物，其特征在于，所述lix1l的基因区域为chr1:145957635
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145958017，linc01822的基因区域为chr2:21710623
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21712623，tuba4a的基因区域为chr2:219251586
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219251713，ac023481.1的基因区域为chr3:8365593
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8365799，mfsd1的基因区域为chr3:158804371
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158805340，ac097173.1的基因区域为chr4:119872612
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119873113，fam153b的基因区域为chr5:176114061
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176115592，steap2/steap2
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as1的基因区域为chr7:90178863
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90179364，cdkn2b的基因区域为chr9:22005202
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22006271，fam205bp的基因区域为chr9:34838349
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34838586，gad2的基因区域为chr10:26223977
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26224538，letmd1的基因区域为chr12:51056370
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51056502，rassf3的基因区域为chr12:64671189
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64671690，ac073592.4的基因区域为chr12:124626183
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124626684，golga6b的基因区域为chr15:72237361
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72237862，orc6的基因区域为chr16:46689829
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46690990，tmem106a的基因区域为chr17:43213020
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43213041。4.根据权利要求3所述的一种生物标志物，其特征在于，包括lix1l、ac097173.1、steap2/steap2
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as1、cdkn2b、orc6和tmem106a的基因区域。5.根据权利要求1～4中任一项所述的生物标志物在肝内胆管细胞癌预后预测中的应用，其特征在于，检测所述生物标志物的甲基化水平，基于所述甲基化水平计算基因组甲基化评分，根据所述基因组甲基化评分进行肝内胆管细胞癌预后。6.根据权利要求5所述的应用，其特征在于，所述基因组甲基化评分的计算公式为：其中，n为用于计算基因组甲基化评分的基因区域数量，gr
i
为第i个基因区域的甲基化水平，w
i
为第i个基因区域的系数，i＝1,2,
…
,n。7.一种肝内胆管细胞癌预后产品，其特征在于，所述预后产品包括检测试剂，所述检测试剂用于检测权利要求1～4中任一项所述的生物标志物的甲基化水平。8.一种肝内胆管细胞癌预后系统，其特征在于，包括检测单元、计算单元和分析单元，其中：所述检测单元，用于检测生物样本中的如权利要求1～4中任一项所述的生物标志物的甲基化水平；所述计算单元，用于基于所述甲基化水平计算基因组甲基化评分；所述分析单元，用于比较所述基因组甲基化评分和截断值的大小，根据比较结果将患者分入低值组和高值组，所述低值组的患者的预后优于所述高值组的患者的预后。
9.根据权利要求8所述的系统，其特征在于，所述计算单元计算基因组甲基化评分的计算公式为：其中，n为用于计算基因组甲基化评分的基因区域数量，gr
i
为第i个基因区域的甲基化水平，w
i
为第i个基因区域的系数，i＝1,2,
…
,n。10.根据权利要求9所述系统，其特征在于，所述基因区域的甲基化水平为生物样本中甲基化胞嘧啶的百分比。

技术总结
一种生物标志物及其在肝内胆管细胞癌预后预测中的应用，所述生物标志物选自LIX1L、LINC01822、TUBA4A、AC023481.1、MFSD1、AC097173.1、FAM153B、STEAP2/STEAP2


技术研发人员：曾勇 高强 孙德强 袁克非 陈璐 陈星
受保护的技术使用者：四川大学华西医院
技术研发日：2021.07.15
技术公布日：2021/10/23