肽基甘氨酸α-羟基化单加氧酶突变体、多肽C端酰胺化酶及其应用的制作方法
本发明涉及酶催化领域,具体而言,涉及一种肽基甘氨酸α-羟基化单加氧酶突变体、多肽c端酰胺化酶及其应用。
背景技术:
1、多肽c端酰胺化是提升多肽稳定性与药效的常用修饰手段。已上市药物如替尔泊肽,艾塞那肽,利司那肽,玛仕度肽,普兰林肽,齐考诺肽,特利加压素,鲑鱼降钙素等都在c端进行了酰胺化,此外在研的单靶点glp 1r(胰高血糖素样肽-1受体)激动剂或多靶点glp1r共激动剂,胰淀素药物超过50%也都进行了c端酰胺化修饰,足见该修饰的重要性。多肽c端酰胺化酶(也称为肽基甘氨酸α-酰胺化单加氧酶,peptidyl-glycine alpha-amidatingmonooxygenase, pam)主要由2个结构域组成,分别是肽基甘氨酸α-羟基化单加氧酶(peptidylglycine alpha-hydroxylating monooxygenase, phm)和肽基-α-羟基甘氨酸α-酰胺化裂解酶(peptidyl-alpha-hydroxyglycine alpha-amidating lyase, pal),通过两个结构域之间的协同作用将多肽c末端的gly催化形成末端的酰胺,在一些高等动物中两个结构域之间通过linker(联接子)连接形成单一蛋白,而在一些低等动物中会是2个结构域分别表达,甚至只存在phm结构域。但是这类酶普遍存在表达困难,活性低等问题。
2、目前多肽c端酰胺化修饰的技术主要包括:化学法,采用特定的树脂在spps法合成多肽后,直接切割生成c端酰胺;电化学氧化-水解法(malins et al., j. am. chem. soc.2021, 143, 11811-11819);光催化半胱氨酸法(novo nordisk, nat. commun. 2024, 15,1-8);光催化硒醚法(shen peng et al., angew. chem. int. ed. 2025, e202502233)。这些方法在工业化放大过程中普遍存在问题,比如spps需要用到大量有机试剂,产品有消旋风险,成本较高;另外两种化学方法则有工艺复杂,副反应显著等问题。而酶修饰策略,以c端含有额外甘氨酸的多肽为底物,利用肽基甘氨酸α-酰胺化单加氧酶(pam)对多肽c端的甘氨酸进行氧化、裂解,从而特异性的在c端形成酰胺。具有高选择性,绿色等优势。尤其适合通过发酵法生产的无侧链保护多肽的酰胺化修饰,具备良好的工业化应用前景。
3、然而由于pam主要来源于动物,其表达主要在中国仓鼠卵巢细胞(chinesehamster ovary cells,cho)中进行,成本高昂,此外天然pam的活性普遍偏低,限制了其规模化应用。
技术实现思路
1、本发明的主要目的在于提供一种肽基甘氨酸α-羟基化单加氧酶突变体、多肽c端酰胺化酶及其应用,以解决现有技术中多肽c端酰胺化酶的活性较低问题。
2、为了实现上述目的,根据本发明的第一个方面,提供了一种肽基甘氨酸α-羟基化单加氧酶突变体,上述肽基甘氨酸α-羟基化单加氧酶突变体包括:(a)以野生型肽基甘氨酸α-羟基化单加氧酶为基础发生突变的蛋白,上述突变选自如下任意一个或多个位点的突变:d62、g64、e65、n67、p69、d71、e72、p74、p83、k144、l145、v152、t153、g154、m254、a256或y282,上述野生型肽基甘氨酸α-羟基化单加氧酶的氨基酸序列如seq id no:1所示;或(b)与(a)中限定的氨基酸序列具有70%以上同一性且具有肽基甘氨酸α-羟基化单加氧酶活性的蛋白质。
3、进一步地,上述突变选自如下任意一种或多种突变:d62g、d62a、d62v、d62l、d62i、d62p、d62m、d62e、g64a、g64v、g64l、g64i、g64p、g64m、e65g、e65a、e65v、e65l、e65i、e65p、e65m、e65d、n67g、n67a、n67v、n67l、n67i、n67p、n67m、n67s、n67c、n67t、n67q、p69g、p69a、p69v、p69l、p69i、p69m、d71g、d71a、d71v、d71l、d71i、d71p、d71m、d71e、e72g、e72a、e72v、e72l、e72i、e72p、e72m、e72d、p74g、p74a、p74v、p74l、p74i、p74m、p83g、p83a、p83v、p83l、p83i、p83m、p83s、p83c、p83t、p83n、p83q、k144r、k144h、k144f、k144y、k144w、k144g、k144a、k144v、k144l、k144i、k144p、k144m、l145a、l145v、l145i、l145p、l145m、l145f、l145y、l145w、v152g、v152a、v152l、v152i、v152p、v152m、t153c、t153n、t153q、g154v、g154l、g154i、g154p、g154m、m254g、m254a、m254v、m254l、m254i、m254p、a256v、a256l、a256i、a256p、a256m、y282a、y282v、y282l、y282i、y282p、y282m、y282f、y282w、y282s、y282c、y282t、y282n或y282q,其中,数字前字母代表原始氨基酸,数字后字母代表突变氨基酸。
4、进一步地,上述突变包括如下任意一种氨基酸突变:d62g、d62g+e65g、d62g+p69g、d62g+d71g、d62g+e72g、d62g+e65a、d62g+l145f、d62g+v152m、d62g+e65g+p69g、d62g+e65g+d71g、d62g+e65g+e72g、d62g+p69g+d71g、d62g+p69g+e72g、d62g+d71g+e72g、d62g+e65a+p69g、d62g+e65a+d71g、d62g+e65a+e72g、d62g+e65a+l145f、d62g+e65a+v152m、d62g+e65g+l145f、d62g+p69g+l145f、d62g+d71g+l145f、d62g+e72g+l145f、d62g+e65g+v152m、d62g+p69g+v152m、d62g+d71g+v152m、d62g+e72g+v152m、d62g+l145f+v152m、d62g+e65g+p69g+d71g、d62g+e65g+p69g+e72g、d62g+e65g+d71g+e72g、d62g+p69g+d71g+e72g、d62g+e65a+p69g+d71g、d62g+e65a+p69g+e72g、d62g+e65a+d71g+e72g、d62g+e65g+p69g+l145f、d62g+e65g+d71g+l145f、d62g+e65g+e72g+l145f、d62g+p69g+d71g+l145f、d62g+p69g+e72g+l145f、d62g+d71g+e72g+l145f、d62g+e65a+p69g+l145f、d62g+e65a+d71g+l145f、d62g+e65a+e72g+l145f、d62g+e65g+p69g+v152m、d62g+e65g+d71g+v152m、d62g+e65g+e72g+v152m、d62g+p69g+d71g+v152m、d62g+p69g+e72g+v152m、d62g+d71g+e72g+v152m、d62g+e65a+p69g+v152m、d62g+e65a+d71g+v152m、d62g+e65a+e72g+v152m、d62g+e65g+l145f+v152m、d62g+e65a+l145f+v152m、d62g+p69g+l145f+v152m、d62g+d71g+l145f+v152m、d62g+e72g+l145f+v152m、d62g+e65g+p69g+d71g+e72g、d62g+e65a+p69g+d71g+e72g、d62g+e65g+p69g+d71g+l145f、d62g+e65g+p69g+e72g+l145f、d62g+e65g+d71g+e72g+l145f、d62g+p69g+d71g+e72g+l145f、d62g+e65a+p69g+d71g+l145f、d62g+e65a+p69g+e72g+l145f、d62g+e65a+d71g+e72g+l145f、d62g+e65g+p69g+d71g+v152m、d62g+e65g+p69g+e72g+v152m、d62g+e65g+d71g+e72g+v152m、d62g+p69g+d71g+e72g+v152m、d62g+e65a+p69g+d71g+v152m、d62g+e65a+p69g+e72g+v152m、d62g+e65a+d71g+e72g+v152m、d62g+e65g+p69g+l145f+v152m、d62g+e65g+d71g+l145f+v152m、d62g+e65g+e72g+l145f+v152m、d62g+p69g+d71g+l145f+v152m、d62g+p69g+e72g+l145f+v152m、d62g+d71g+e72g+l145f+v152m、d62g+e65a+p69g+l145f+v152m、d62g+e65a+d71g+l145f+v152m、d62g+e65a+e72g+l145f+v152m、d62g+e65g+p69g+d71g+e72g+l145f、d62g+e65g+p69g+d71g+e72g+v152m、d62g+e65a+p69g+d71g+e72g+l145f、d62g+e65a+p69g+d71g+e72g+v152m、d62g+e65g+p69g+d71g+l145f+v152m、d62g+e65g+p69g+e72g+l145f+v152m、d62g+e65g+d71g+e72g+l145f+v152m、d62g+p69g+d71g+e72g+l145f+v152m、d62g+e65a+p69g+d71g+l145f+v152m、d62g+e65a+p69g+e72g+l145f+v152m、d62g+e65a+d71g+e72g+l145f+v152m、d62g+e65g+p69g+d71g+e72g+l145f+v152m、d62g+e65a+p69g+d71g+e72g+l145f+v152m、e65g+p69g、e65g+d71g、e65g+e72g、p69g+d71g、p69g+e72g、d71g+e72g、e65a+p69g、e65a+d71g、e65a+e72g、e65a+l145f、e65a+v152m、e65g+l145f、p69g+l145f、d71g+l145f、e72g+l145f、e65g+v152m、p69g+v152m、d71g+v152m、e72g+v152m、l145f+v152m、e65g+p69g+d71g、e65g+p69g+e72g、e65g+d71g+e72g、p69g+d71g+e72g、e65a+p69g+d71g、e65a+p69g+e72g、e65a+d71g+e72g、e65a+p69g+l145f、e65a+d71g+l145f、e65a+e72g+l145f、e65a+p69g+v152m、e65a+d71g+v152m、e65a+e72g+v152m、e65a+l145f+v152m、e65g+p69g+l145f、e65g+d71g+l145f、e65g+e72g+l145f、p69g+d71g+l145f、p69g+e72g+l145f、d71g+e72g+l145f、e65g+p69g+v152m、e65g+d71g+v152m、e65g+e72g+v152m、p69g+d71g+v152m、p69g+e72g+v152m、d71g+e72g+v152m、e65g+l145f+v152m、p69g+l145f+v152m、d71g+l145f+v152m、e72g+l145f+v152m、e65g+p69g+d71g+e72g、e65a+p69g+d71g+e72g、e65g+p69g+d71g+l145f、e65g+p69g+e72g+l145f、e65g+d71g+e72g+l145f、p69g+d71g+e72g+l145f、e65a+p69g+d71g+l145f、e65a+p69g+e72g+l145f、e65a+d71g+e72g+l145f、e65g+p69g+d71g+v152m、e65g+p69g+e72g+v152m、e65g+d71g+e72g+v152m、p69g+d71g+e72g+v152m、e65a+p69g+d71g+v152m、e65a+p69g+e72g+v152m、e65a+d71g+e72g+v152m、e65g+p69g+l145f+v152m、e65g+d71g+l145f+v152m、e65g+e72g+l145f+v152m、p69g+d71g+l145f+v152m、p69g+e72g+l145f+v152m、d71g+e72g+l145f+v152m、e65a+p69g+l145f+v152m、e65a+d71g+l145f+v152m、e65a+e72g+l145f+v152m、e65g+p69g+d71g+e72g+l145f、e65a+p69g+d71g+e72g+l145f、e65g+p69g+d71g+e72g+v152m、e65a+p69g+d71g+e72g+v152m、e65g+p69g+d71g+l145f+v152m、e65g+p69g+e72g+l145f+v152m、e65g+d71g+e72g+l145f+v152m、p69g+d71g+e72g+l145f+v152m、e65a+p69g+d71g+l145f+v152m、e65a+p69g+e72g+l145f+v152m、e65a+d71g+e72g+l145f+v152m、e65g+p69g+d71g+e72g+l145f+v152m、e65a+p69g+d71g+e72g+l145f+v152m、d62a、d62v、d62l、d62i、d62p、d62m、d62e、g64a、g64v、g64l、g64i、g64p、g64m、e65g、e65a、e65v、e65l、e65i、e65p、e65m、e65d、p69g、p69a、p69v、p69l、p69i、p69m、d71g、d71a、d71v、d71l、d71i、d71p、d71m、d71e、e72g、e72a、e72v、e72l、e72i、e72p、e72m、e72d、p74g、p74a、p74v、p74l、p74i、p74m、p83g、p83a、p83v、p83l、p83i、p83m、p83s、p83c、p83t、p83n、p83q、k144r、k144h、k144f、k144y、k144w、k144g、k144a、k144v、k144l、k144i、k144p、k144m、l145a、l145v、l145i、l145p、l145m、l145f、l145y、l145w、v152g、v152a、v152l、v152i、v152p、v152m、t153c、t153n、t153q、g154v、g154l、g154i、g154p、g154m、m254g、m254a、m254v、m254l、m254i、m254p、a256v、a256l、a256i、a256p、a256m、y282a、y282v、y282l、y282i、y282p、y282m、y282f、y282w、y282s、y282c、y282t、y282n或y282q。
5、为了实现上述目的,根据本发明的第二个方面,提供了一种多肽c端酰胺化酶,上述多肽c端酰胺化酶包括:上述的肽基甘氨酸α-羟基化单加氧酶突变体,和肽基-α-羟基甘氨酸α-酰胺化裂解酶。
6、进一步地,上述肽基-α-羟基甘氨酸α-酰胺化裂解酶包括:(c)以seq id no:3所示的野生型肽基-α-羟基甘氨酸α-酰胺化裂解酶;或(d)与(c)中限定的氨基酸具有70%以上同一性且具有肽基-α-羟基甘氨酸α-酰胺化裂解酶活性的蛋白质。
7、为了实现上述目的,根据本发明的第三个方面,提供了一种dna分子,上述dna分子编码上述的肽基甘氨酸α-羟基化单加氧酶突变体、或上述的多肽c端酰胺化酶。
8、为了实现上述目的,根据本发明的第四个方面,提供了一种重组质粒,上述重组质粒含有上述的dna分子。
9、进一步地,上述重组质粒包括ppic9k或pet-28a(+)。
10、为了实现上述目的,根据本发明的第四个方面,提供了一种宿主细胞,上述宿主细胞内含有上述的dna分子或上述的重组质粒。
11、进一步地,上述宿主细胞包括酵母或大肠杆菌。
12、为了实现上述目的,根据本发明的第五个方面,提供了一种酰胺化多肽的制备方法,上述制备方法包括:利用上述的多肽c端酰胺化酶,对多肽进行酰胺化修饰,制备获得上述酰胺化多肽。
13、进一步地,上述多肽包括c末端为甘氨酸的多肽。
14、进一步地,上述c末端为甘氨酸的多肽包括胰淀素、利司那肽或艾塞那肽。
15、进一步地,上述多肽的c端到n端方向起第二位氨基酸为:甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸、蛋氨酸、丝氨酸、半胱氨酸、苏氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸、天冬氨酸、谷氨酸、赖氨酸、精氨酸或组氨酸。
16、为了实现上述目的,根据本发明的第六个方面,提供了一种上述的肽基甘氨酸α-羟基化单加氧酶突变体、上述的多肽c端酰胺化酶、上述的dna分子、上述的重组质粒、上述的宿主细胞、或上述酰胺化多肽的制备方法在多肽的酰胺化修饰中的应用。
17、进一步地,上述多肽包括多肽药物;上述多肽药物包括艾塞那肽、利司那肽、齐考诺肽、特利加压素、鲑鱼降钙素或胰淀素。
18、应用本发明的技术方案,利用上述肽基甘氨酸α-羟基化单加氧酶突变体,其能够较好地与肽基-α-羟基甘氨酸α-酰胺化裂解酶发挥协同作用,实现多肽c端酰胺化酶的催化活性,能够实现对多肽进行高效酰胺化修饰的技术效果,能够较好的制备获得酰胺化的多肽。上述多肽c端酰胺化酶相较于野生型酶,在多肽或药物的酰胺化修饰效率较高,高度契合现代制药工业对绿色、高效和安全生产的迫切需求。
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