一种用于鉴定团头鲂雌雄性别的引物对、试剂盒及其应用、方法

摘要: 本发明属于分子生物学,具体地涉及一种用于鉴定团头鲂雌雄性别的引物对、试剂盒及其应用、方法。背景技术:1、团头鲂(megalobramaamblycephala)...
一种用于鉴定团头鲂雌雄性别的引物对、试剂盒及其应用、方法

本发明属于分子生物学,具体地涉及一种用于鉴定团头鲂雌雄性别的引物对、试剂盒及其应用、方法。

背景技术:

1、团头鲂 (megalobrama amblycephala) 属鲤形目,又称武昌鱼,其肉质鲜美且成活率高,是我国特有的草食性经济鱼类,全国每年的养殖产量约80万吨,是主要的淡水养殖品种之一。但是近年来,由于过度捕捞以及环境污染等问题,团头鲂天然种质资源遭到了破坏,种群数量锐减。获取团头鲂性别信息,对种群资源保护、选种保种、增养殖和科学研究极为重要。团头鲂群体两性的外部形态差异不明显,尤其是在非繁殖季节,此外也没有异形性染色体。传统的团头鲂性别鉴定方法主要包括繁殖季节外部特征观察、血浆性激素水平测定和性腺解剖观察。繁殖季节通过珠星有无、腹部形态及柔软程度判别雌雄,但该方法受时间的限制,且受性腺发育程度影响,准确性难以保证;血浆性激素水平测定虽可辅助判断性别,但在幼鱼阶段实用性不强;解剖观察性腺虽最为直接,但受到鱼类个体大小及性腺发育阶段影响,且这种方法导致个体不能存活和再次利用。

2、随着分子生物学技术的发展,基于pcr的分子标记鉴定方法因其操作简便、结果可靠、对鱼体损伤小等优势,逐渐成为鱼类性别鉴定的重要手段。目前已经公开的团头鲂性别鉴定方法中,均依赖于对团头鲂自身进行大规模全基因组重测序、雌雄基因组差减比较或全基因组关联分析,存在成本高、周期长等不足。

技术实现思路

1、发明目的:为了克服现有技术中团头鲂性别鉴定方法成本高、周期长、依赖大规模测序的不足,本发明提供了一种新型、高效、低成本的用于鉴定团头鲂雌雄性别的引物对、试剂盒及其应用、方法。

2、技术方案:本发明所述的引物对包括正向引物m86-f和反向引物m86-r,其核苷酸序列为:

3、正向引物m86-f:5’-tatgtcaccttgtcccagcg-3’;

4、反向引物m86-r:5’-catgaatgatgcggacgagc-3’。

5、本发明还提供一种用于鉴别团头鲂雌雄性别的试剂盒,包括上述的引物对,还包括pcr所需试剂。

6、上述试剂盒中,优选的,还包括10×pcr 缓冲液、脱氧核苷酸混合物、taq dna聚合酶和灭菌水。

7、本发明还提供一种上述引物对在鉴定团头鲂雌雄性别中的应用。

8、本发明还提供一种pcr鉴定团头鲂雌雄性别的方法,包括以下步骤:

9、(1)提取待鉴定的团头鲂的基因组dna样品;

10、(2)以团头鲂的基因组dna样品为模板,利用权利要求1所述的引物对进行pcr扩增;

11、(3)将pcr扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳检测;

12、(4)根据电泳检测结果判断团头鲂雌雄性别,其中能扩增出86 bp片段的为雄性,不能扩增出相应片段为雌性。

13、上述方法中,优选的,步骤(1)中,dna样品来源于待鉴定的团头鲂的鳍条。

14、上述方法中,优选的,步骤(2)中,所述pcr扩增的反应体系如下:总体系为50 μl,10×pcr 缓冲液 5 μl,taq dna聚合酶0.25 μl,dna模板0.5 μl,上游引物0.5 μl,下游引物0.5 μl,脱氧核苷酸混合物4 μl,灭菌水补足至50 μl。

15、上述方法中,优选的,步骤(2)中,所述pcr扩增的反应程序为:95℃预热1 min,95℃变性30 s,63℃退火30 s,72℃延伸反应45 s,循环35次。72℃延伸5 min,4℃保存。

16、有益效果:与现有技术相比,本发明具有如下显著优点:本发明基于已公开的鱼类雄性特异片段,通过生物信息学同源比对定位至团头鲂基因组,获得团头鲂的同源序列并设计扩增引物,具有来源明确、成本低、周期短、操作简便等优势。本发明通过生物信息学同源比对获得性别特异标记,成本显著降低,并且引物扩增产物仅为86 bp,扩增效率更高。

1.一种用于鉴定团头鲂雌雄性别的引物对,其特征在于:所述引物对包括正向引物m86-f和反向引物m86-r,其核苷酸序列为:

2.一种用于鉴别团头鲂团头鲂雌雄性别的试剂盒,其特征在于:包括权利要求1中所述的引物对。

3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于:还包括10×pcr 缓冲液、脱氧核苷酸混合物、taq dna聚合酶和灭菌水。

4.一种权利要求1所述引物对在鉴定团头鲂雌雄性别中的应用。

5.一种pcr鉴定团头鲂雌雄性别的方法,其特征在于,包括以下步骤:

6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于:步骤(1)中,dna样品来源于待鉴定的团头鲂的鳍条。

7.根据权利要求5所述的方法,其特征在于:步骤(2)中,所述pcr扩增的反应体系如下:总体系为50 μl,10×pcr 缓冲液 5 μl,taq dna聚合酶0.25 μl,dna模板0.5 μl,上游引物0.5 μl,下游引物0.5 μl,脱氧核苷酸混合物4 μl,灭菌水补足至50 μl。

8.根据权利要求5所述的方法,其特征在于:步骤(2)中,所述pcr扩增的反应程序为:95℃预热1 min,95℃变性30 s,63℃退火30 s,72℃延伸反应45 s,循环35次。72℃延伸5min,4℃保存。