分析RNA用于诊断感染类型的制作方法

技术特征：
1.确定受试者中的感染类型的方法，其包括测量受试者的样品中至少一种rna决定子的表达，其中所述测量在一个外显子或多个外显子处实现，所述外显子的表达水平以高于预定水平的准确性程度区分细菌和病毒感染，由此确定受试者的感染类型。2.权利要求1的方法，其中所述外显子在细菌感染的受试者和病毒感染的受试者之间提供高于预定水平的差异表达。3.权利要求1的方法，其中与rna的所有外显子相比，所述外显子在源自细菌感染的受试者的样品中提供了与病毒感染的受试者相比最高程度的差异表达。4.权利要求1的方法，其中所述rna列于表10a或10b中。5.权利要求4的方法，其中如表10a或10b中所述选择所述rna的外显子。6.选择其表达水平提供关于受试者的感染类型的信息的rna的外显子的方法，其包括比较源自细菌感染的受试者的样品和源自病毒感染的受试者的样品中在多个外显子处的rna的表达水平，其中选择在细菌感染的受试者和病毒感染的受试者之间提供高于预定水平的差异表达的外显子作为其表达提供关于感染类型的信息的rna的外显子。7.权利要求6的方法，其中所述样品包含rna。8.权利要求6的方法，其中所述样品包含cdna。9.权利要求6的方法，其中使用多种寡核苷酸实现所述比较。10.权利要求6的方法，其包括：(a) 使用多种与所述rna或由其产生的cdna的不相同外显子杂交的寡核苷酸分析源自所述细菌感染的受试者的样品中所述rna的表达水平；(b) 使用多种与所述不相同外显子杂交的寡核苷酸分析源自所述病毒感染的受试者的样品中所述rna的表达水平，其中步骤(a)的所述多种寡核苷酸对所述外显子与步骤(b)的多种寡核苷酸对所述外显子具有相同的结合严格性。11.权利要求10的方法，其中步骤(a)的所述寡核苷酸的核酸序列与步骤(b)的所述寡核苷酸的核酸序列相同。12.权利要求6的方法，其进一步包括比较所述rna的每个外显子上的所述rna的表达水平。13.权利要求1或6的方法，其中选择提供最高程度的差异表达的外显子作为其表达提供关于感染类型的信息的rna的外显子。14.权利要求1或6的方法，其中在相同的实验条件下进行比较。15.权利要求1-14中任一项的方法，其中所述样品是全血或其级分。16.权利要求15的方法，其中所述血液级分样品包含选自淋巴细胞、单核细胞和粒细胞的细胞。17.权利要求15的方法，其中所述血液级分样品包含血清或血浆。18.权利要求1-17中任一项的方法，其中所述多个外显子包含不超过2个外显子。19.权利要求18的方法，其中所述多个外显子包含不超过5个外显子。20.包含至少两种寡核苷酸的试剂盒，其中所述至少两种寡核苷酸中的第一种在第一外显子处与第一rna特异性杂交，且所述至少两种寡核苷酸中的第二种在第二外显子处与所述第一rna特异性杂交，选择所述第一和所述第二外显子，从而使得来自所述第一外显子的表达水平以高于预定水平的准确性程度区分细菌和病毒感染，且来自所述第二外显子的
表达水平以高于所述预定水平的准确性程度区分细菌和病毒感染。21.包含至少两种寡核苷酸的试剂盒，其中所述至少两种寡核苷酸中的第一种在第一外显子处与第一rna特异性杂交，且所述至少两种寡核苷酸中的第二种在第二外显子处与第二rna特异性杂交，选择所述第一和所述第二外显子，从而使得来自所述第一外显子的表达水平以高于预定水平的准确性程度区分细菌和病毒感染，且来自所述第二外显子的表达水平以高于所述预定水平的准确性程度区分细菌和病毒感染。22.权利要求20或21的试剂盒，其中所述寡核苷酸附着于可检测部分。23.权利要求20或21的试剂盒，其中所述试剂盒包含与不超过3个所述第一rna的外显子杂交的寡核苷酸。24.权利要求20或21的试剂盒，其中所述试剂盒包含与不超过20种rna杂交的寡核苷酸。25.权利要求20或21的试剂盒，其中所述试剂盒包含与不超过10种rna杂交的寡核苷酸。26.权利要求20或21的试剂盒，其中所述试剂盒包含与不超过3种rna杂交的寡核苷酸。27.在外显子处与rna杂交的引物对，所述外显子的表达水平以高于预定水平的准确性程度区分细菌和病毒感染。28.阵列，其包含固体支持体和在预定外显子处与第一rna特异性杂交的多核苷酸，所述多核苷酸附着于固体支持体，选择所述预定外显子，从而使得来自其的表达水平以高于预定水平的准确性程度区分细菌和病毒感染，其中所述阵列包含与不超过3个所述第一rna的外显子杂交的寡核苷酸。29.权利要求28的阵列，其包含与不超过20种不相同的rna杂交的寡核苷酸。30.阵列，其包含固体支持体、在第一外显子处与第一rna特异性杂交的第一多核苷酸和与第二rna的第二外显子特异性杂交的第二多核苷酸，所述第一和第二多核苷酸附着于固体支持体，选择所述第一外显子，从而使得来自其的表达水平以高于预定水平的准确性程度区分细菌和病毒感染，且选择所述第二外显子，从而使得来自其的表达水平以高于预定水平的准确性程度区分细菌和病毒感染，其中所述阵列包含与不超过20种不相同rna杂交的寡核苷酸。31.权利要求30的阵列，其中所述阵列包含与不超过3个所述第一rna和/或所述第二rna的外显子杂交的寡核苷酸。32.权利要求20-30中任一项的试剂盒、引物对或阵列，其中所述rna列于表10a或10b中。33.权利要求32的试剂盒、引物对或阵列，其中所述寡核苷酸中的至少一种与表10a或10b中所述的rna的外显子杂交。

技术总结
本发明涉及分析RNA用于诊断感染类型。公开了选择其表达水平提供关于受试者的感染类型的信息的RNA的外显子的方法。所述方法包括比较源自细菌感染的受试者的样品和源自病毒感染的受试者的样品中在多个外显子处的RNA的表达水平，其中选择在细菌感染的受试者和病毒感染的受试者之间提供高于预定水平的差异表达的外显子作为其表达提供关于感染类型的信息的RNA的外显子。息的RNA的外显子。息的RNA的外显子。


技术研发人员：E.艾登 K.奥维德 A.科恩-多坦 R.纳冯 O.博埃科 G.克罗内菲尔德 E.西蒙
受保护的技术使用者：米密德诊断学有限公司
技术研发日：2017.03.02
技术公布日：2022/8/30