合成人参皂苷F1的糖基转移酶突变体及其应用的制作方法

摘要: 本发明涉及生物技术和植物生物学领域,具体地,涉及合成人参皂苷f1的糖基转移酶突变体及其应用。背景技术:1、人参皂苷f1在人参中的含量极低(<0.3%),却具有显...
合成人参皂苷F1的糖基转移酶突变体及其应用的制作方法

本发明涉及生物技术和植物生物学领域,具体地,涉及合成人参皂苷f1的糖基转移酶突变体及其应用。

背景技术:

1、人参皂苷f1在人参中的含量极低(<0.3%),却具有显著的抗衰老、益智和免疫调节等多种药理活性。传统的人参皂苷生产方法依赖于人参植物资源,不仅生产周期长达5-6年,且成本高昂(市场价格超过1000元/g)。人参皂苷rg1是三七中含量最为丰富的ppt型皂苷,其含量占到了三七总皂苷的20%-40%。合成生物学技术的应用为这一问题提供了新的解决方案,通过构建微生物细胞工厂可实现人参皂苷f1的高效合成。研究表明,人参皂苷f1可通过糖基转移酶pgugt71a53催化前体物质原人参三醇(ppt)转化而成。现有技术中已成功构建了高产ppt的工程菌株,其发酵罐产量可达8g/l以上,为人参皂苷f1的合成提供了充足的前体供应。然而,pgugt71a53在酿酒酵母表达系统中表现出双功能酶特性,不仅能够催化ppt生成f1,还能进一步将f1转化为rg1,这一特性严重制约了f1的生物合成效率。

2、因此,通过蛋白质工程技术对pgugt71a53进行定向改造,旨在获得特异性催化ppt生成f1且不产生副产物rg1的高效突变体。

技术实现思路

1、本发明的目的是提供一种生产人参皂苷f1且不产生副产物rg1的糖基转移酶突变体。

2、本发明的第一方面,提供了一种分离的多肽,所述分离的多肽的氨基酸序列在对应于seq id no:3所示氨基酸序列的第85位的氨基酸残基为非phe和/或在对应于seq idno:3所示氨基酸序列的第187位的氨基酸残基为非ser。

3、在另一优选例中,所述分离的多肽的氨基酸序列在对应于seq id no:3所示氨基酸序列的第85位的氨基酸残基为leu和/或在对应于seq id no:3所示氨基酸序列的第187位的氨基酸残基为ala。

4、在另一优选例中,所述分离的多肽选自下组:

5、(i)具有如seq id no:3所示氨基酸序列的第85位的氨基酸残基为leu和/或在对应于seq id no:3所示氨基酸序列的第187位的氨基酸残基为ala;

6、(ii)具有(i)所限定的序列经过一个或几个氨基酸残基,优选1-20个、更优选1-15个、更优选1-10个、更优选1-3个、最优选1个氨基酸残基的取代、缺失或添加而形成的序列,且基本具有(i)所限定的分离的多肽功能的由(i)衍生的分离的多肽;

7、(iii)序列中含有(i)或(ii)中所述多肽序列的衍生多肽。

8、在另一优选例中,所述分离的多肽具有(i)所限定的序列经过一个或几个氨基酸残基,优选1-20个、更优选1-15个、更优选1-10个、更优选1-3个、最优选1个氨基酸残基的添加而形成的序列,且基本具有(i)所限定的分离的多肽功能的由(i)衍生的分离的多肽。

9、在另一优选例中,所述分离的多肽为糖基转移酶。

10、在另一优选例中,所述糖基转移酶来源于人参属植物。

11、在另一优选例中,所述糖基转移酶来源于人参、西洋参和/或三七。

12、在另一优选例中,所述的多肽选自下组:

13、(1)具有如seq id no:4所示氨基酸序列的多肽;

14、(2)将seq id no:4所示氨基酸序列的多肽经过一个或几个氨基酸残基,优选1-20个、更优选1-15个、更优选1-10个、更优选1-3个、最优选1个氨基酸残基的取代、缺失或添加而形成的、或是添加信号肽序列后形成的、并具有糖基转移酶活性的衍生多肽;

15、(3)序列中含(1)或(2)中所述多肽序列的衍生多肽;

16、(4)氨基酸序列与seq id no:4所示氨基酸序列的同源性≥85%(较佳地≥90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%),并且具有糖基转移酶活性的衍生多肽。

17、在另一优选例中,所述的序列(3)为由(1)或(2)添加了标签序列、信号序列或分泌信号序列后所形成的融合蛋白。

18、在另一优选例中,所述糖基转移酶能提高人参皂苷f1的产量。

19、在另一优选例中,在人工构建的菌株中,所述糖基转移酶能提高人参皂苷f1的产量;优选地,提高50-150%;更优选地,提高70-130%;更优选地,提高80-120%;最优选,提高90-110%。

20、在另一优选例中,所述人工构建的菌株选自下组:酿酒酵母菌株、大肠杆菌菌株、毕赤酵母菌株、裂殖酵母菌株、克鲁维酵母菌株。

21、本发明第二方面,提供了一种分离的多核苷酸,所述多核苷酸为选自下组的序列:

22、(a)编码如本发明第一方面所述多肽的核苷酸序列;

23、(b)编码如seq id no:4所示多肽或其衍生多肽的核苷酸序列;

24、(c)如seq id no:2所示的核苷酸序列;

25、(d)与seq id no:2所示序列的同源性≥90%(较佳地≥91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%)的核苷酸序列;

26、(e)在seq id no:2所示核苷酸序列的5’端和/或3’端截短或添加1-60个(较佳地1-30,更佳地1-10个)核苷酸所形成的核苷酸序列;

27、(f)与(a)-(e)任一所述的核苷酸序列互补的核苷酸序列。

28、本发明第三方面,提供了一种载体,所述载体含有如本发明第二方面所述的多核苷酸。

29、在另一优选例中,所述载体包括表达载体、穿梭载体、整合载体。

30、本发明第四方面,提供了一种工程化的宿主细胞,所述宿主细胞含有如本发明第三方面所述的载体,或其基因组中整合有如本发明第二方面所述的多核苷酸。

31、在另一优选例中,所述的细胞为原核细胞或真核细胞。

32、在另一优选例中,所述的宿主细胞为真核细胞,如酵母细胞或植物细胞。

33、在另一优选例中,所述的宿主细胞为酿酒酵母细胞。

34、在另一优选例中,所述的宿主细胞原核细胞,如大肠杆菌。

35、在另一优选例中,所述的宿主细胞为人参细胞。

36、在另一优选例中,所述宿主细胞不是天然生产人参皂苷f1的细胞。

37、本发明第五方面,提供了如本发明第一方面所述的多肽的用途,被用于催化以下反应,或倍用于制备催化以下反应的催化制剂:

38、

39、其中,所述式(i)化合物是原人参三醇(protopanaxatriol),式(ii)化合物为人参皂苷f1(20-o-β-d-glucopyranosyl-20(s)-protopanaxatriol)。

40、在另一优选例中,所述的糖基供体包括选自下组的核苷二磷酸糖:udp-葡萄糖,adp-葡萄糖,tdp-葡萄糖,cdp-葡萄糖,gdp-葡萄糖,udp-乙酰基葡萄糖,adp-乙酰基葡萄糖,tdp-乙酰基葡萄糖,cdp-乙酰基葡萄糖,gdp-乙酰基葡萄糖,udp-木糖,adp-木糖,tdp-木糖,cdp-木糖,gdp-木糖,udp-木糖,udp-半乳糖醛酸,adp-半乳糖醛酸,tdp-半乳糖醛酸,cdp-半乳糖醛酸,gdp-半乳糖醛酸,udp-半乳糖,adp-半乳糖,tdp-半乳糖,cdp-半乳糖,gdp-半乳糖,udp-阿拉伯糖,adp-阿拉伯糖,tdp-阿拉伯糖,cdp-阿拉伯糖,gdp-阿拉伯糖,udp-鼠李糖,adp-鼠李糖,tdp-鼠李糖,cdp-鼠李糖,gdp-鼠李糖,或其他核苷二磷酸己糖或核苷二磷酸戊糖,或其组合。

41、在另一优选例中,所述的糖基供体包括选自下组的尿苷二磷酸(udp)糖:udp-葡萄糖,udp-木糖,udp-半乳糖醛酸,udp-半乳糖,udp-阿拉伯糖,udp-鼠李糖,或其他尿苷二磷酸己糖或尿苷二磷酸戊糖,或其组合。

42、在另一优选例中,所述的糖基选自:葡萄糖基、半乳糖醛酸基、木糖糖基,半乳糖基、阿拉伯糖基、鼠李糖基,以及其他己糖基或戊糖基。

43、本发明第六方面,提供了如本发明第四方面所述的宿主细胞的用途,用作发酵生产人参皂苷f1的菌株。

44、本发明第七方面,提供了一种生产人参皂苷f1的方法,包括步骤:

45、在适合培养的条件下,培养如本发明第四方面所述的宿主细胞,从而获得含人参皂苷f1的发酵产物,从所述发酵产物中分离出人参皂苷f1。

46、在另一优选例中,所述培养包括试管培养、摇瓶培养、罐发酵培养。

47、在另一优选例中,所述试管培养使用ypd培养基。

48、在另一优选例中,所述摇瓶培养和/或罐发酵培养使用合成培养基。

49、在另一优选例中,培养所述工程化酵母菌的接种量为od600=0.001~10,较佳地od600=0.01~5,更佳地od600=0.01~1,例如od600=0.05。

50、在另一优选例中,所述工程化酵母菌在合成培养基中培养0.5~10天,较佳地1~8天,更佳地2~5天,例如,约4天。

51、在另一优选例中,所述ypd培养基包括1~20g/l酵母提取物、10~50g/l细菌源蛋白胨和10~50g/l d(+)-葡萄糖一水;较佳地,5~15g/l酵母提取物、15~40g/l细菌源蛋白胨和15~40g/l d(+)-葡萄糖一水;更佳地,8~12g/l酵母提取物、10~30g/l细菌源蛋白胨和10~30g/l d(+)-葡萄糖一水,例如,10g/l酵母提取物、20g/l细菌源蛋白胨和22g/l d(+)-葡萄糖一水。

52、在另一优选例中,在20~45℃下培养所述工程化酵母菌,较佳地25~40℃,更佳地25~35℃,例如,约30℃。

53、在另一优选例中,在培养为振荡培养,转速为100~500rpm,较佳地200~400rpm,更佳地200~300rpm,例如,约250rpm。

54、在另一优选例中,所述方法还包括步骤:检测所述发酵产物中的人参皂苷f1。

55、在另一优选例中,所述检测通过液相色谱分析。

56、在另一优选例中,所述方法的人参皂苷f1的产量≥120mg/l,较佳地150mg/ml,更佳地≥180mg/l,例如,约190mg/l、195mg/l或200mg/l。

57、在另一优选例中,所述方法的副产物人参皂苷rg1的含量≤5mg/l,较佳地≤3mg/l,更佳地≤1mg/l,最佳地≤0.5mg/l,例如,约0.4mg/l。

58、在另一优选例中,所述发酵产物中人参皂苷f1/rg1(w/w)≥300,较佳地≥350,更佳地≥400,最佳地≥450,例如,约470或480。

59、应理解,在本发明范围内中,本发明的上述各技术特征和在下文(如实施例)中具体描述的各技术特征之间都可以互相组合,从而构成新的或优选的技术方案。限于篇幅,在此不再一一累述。