一种小麦7B染色体SNP标记组合及其在高类黄酮小麦材料筛选中的应用
本发明属于作物分子遗传育种,具体涉及一种小麦7b染色体snp标记组合及其在高类黄酮小麦材料筛选中的应用。
背景技术:
1、小麦是重要的粮食作物和主食原料。随着小麦品质改良由加工品质向营养品质进一步拓展,籽粒类黄酮等功能性营养成分逐渐成为育种研究的重要目标。类黄酮属于植物多酚类次生代谢产物,小麦籽粒类黄酮含量受遗传背景影响,属于典型数量性状。
2、目前,小麦籽粒类黄酮含量通常在成熟收获后通过理化方法测定,表型鉴定周期较长,不利于在育种早代对大量材料进行快速筛选。qtl定位能够将数量性状与特定染色体区段建立联系;在稳定qtl区间内进一步筛选与表型显著相关的snp基因型或单倍型,可为候选材料的基因型辅助筛选提供依据。
3、因此,研究开发能够显著富集高类黄酮材料的snp标记组合和优势单倍型,对于高类黄酮小麦种质筛选及相关遗传改良具有实际意义。
技术实现思路
1、针对现有技术的不足,本发明提供了一种小麦7b染色体snp标记组合及其在高类黄酮小麦材料筛选中的应用。
2、本发明的技术方案如下:
3、一种与小麦籽粒高类黄酮含量相关的snp标记7b_716635145,所述7b_716635145位于小麦7b染色体第716635145 bp处,为c/t多态性位点。
4、优选的,所述7b_716635145位点的碱基类型为c的小麦籽粒类黄酮含量高。
5、一种与小麦籽粒高类黄酮含量相关的snp标记组合,包括7b_716635145和7b_723730836;
6、所述7b_716635145位于小麦7b染色体第716635145 bp处,为c/t多态性位点;
7、所述7b_723730836位于小麦7b染色体第723730836 bp处,为t/c多态性位点。
8、优选的,所述7b_716635145位点的碱基类型为c的小麦籽粒类黄酮含量高;
9、所述7b_723730836位点的碱基类型为t的小麦籽粒类黄酮含量高。
10、进一步优选的,所述7b_716635145位点的cc基因型与7b_723730836位点的tt基因型构成cc–tt优势单倍型。
11、上述snp标记7b_716635145或snp标记组合在选育具有小麦籽粒高类黄酮含量的小麦品种或小麦品系中的应用。
12、优选的,所述应用中,选育7b_716635145位点为cc基因型的小麦;
13、或选育7b_716635145位点为cc基因型且7b_723730836位点为tt基因型的小麦。
14、一种筛选具有小麦籽粒高类黄酮含量的小麦品种或小麦品系的方法,包括如下步骤:
15、利用上述snp标记7b_716635145或snp标记组合进行筛选。
16、优选的,筛选7b_716635145位点为cc基因型的小麦;
17、或筛选7b_716635145位点为cc基因型且7b_723730836位点为tt基因型的小麦。
18、本发明的有益效果
19、本发明在ham-2×中麦255构建的433份ril群体中定位到小麦7b染色体712.71—723.73 mb的稳定主效类黄酮qtl
qfla.sdau-7b,并基于既有snp分型数据和两个环境的类黄酮表型筛选出7b_716635145和7b_723730836两个核心snp标记。由7b_716635145-cc和7b_723730836-tt构成的cc–tt单倍型在两个环境中均表现出较高的类黄酮含量,且在高类黄酮材料中显著富集,可为小麦群体中的高类黄酮候选材料辅助筛选提供标记依据。
1.一种与小麦籽粒高类黄酮含量相关的snp标记7b_716635145,所述7b_716635145位于小麦7b染色体第716635145 bp处,为c/t多态性位点。
2.如权利要求1所述的snp标记7b_716635145,其特征在于,所述7b_716635145位点的碱基类型为c的小麦籽粒类黄酮含量高。
3.一种与小麦籽粒高类黄酮含量相关的snp标记组合,其特征在于,包括7b_716635145和7b_723730836;
4.如权利要求3所述的snp标记组合,其特征在于,所述7b_716635145位点的碱基类型为c的小麦籽粒类黄酮含量高;
5.如权利要求3所述的snp标记组合,其特征在于,所述7b_716635145位点的cc基因型与7b_723730836位点的tt基因型构成cc–tt优势单倍型。
6.权利要求1-2任一项所述snp标记7b_716635145或权利要求3-5任一项所述snp标记组合在选育具有小麦籽粒高类黄酮含量的小麦品种或小麦品系中的应用。
7.如权利要求6所述的应用,其特征在于,选育7b_716635145位点为cc基因型的小麦;
8.一种筛选具有小麦籽粒高类黄酮含量的小麦品种或小麦品系的方法,包括如下步骤:
9.如权利要求8所述的方法,其特征在于,筛选7b_716635145为cc基因型的小麦;
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