一种L-组氨酸生产菌株及其构建方法与应用
本发明涉及生物技术与发酵工程,尤其是一种l-组氨酸生产菌株及其构建方法与应用。
背景技术:
1、l-组氨酸(
l-histidine)是一种含有咪唑环的碱性氨基酸,在医药、食品、饲料及化妆品等领域具有广泛的应用价值。据统计,全球l-组氨酸市场需求呈稳步增长态势,对高效、低成本、可持续的生产技术提出了迫切需求。
2、目前,在代谢工程改造中所面临的主要问题包括:l-组氨酸会对关键酶
ncgl1504进行反馈抑制,使l-组氨酸不能高效地生成;atp和nadph的供应不足,也会限制l-组氨酸的产量。
技术实现思路
1、本发明所要解决的技术问题在于提供一种l-组氨酸生产菌株。
2、本发明所要解决的另一技术问题在于提供上述l-组氨酸生产菌株的构建方法。
3、本发明所要解决的另一技术问题在于提供上述l-组氨酸生产菌株的应用。
4、为解决上述技术问题,本发明的技术方案是:
5、一种l-组氨酸生产菌株,命名为his-13,是以野生型谷氨酸棒状杆菌
corynebacterium glutamicum作为出发菌株利用代谢工程手段进行基因编辑获得的:过表达
ncgl1505基因
、ncgl2093基因
、ncgl2096基因
、ncgl2094基因
、ncgl2097基因
、ncgl2100基因
、ncgl0218基因
、ncgl2101基因
、ncgl0799基因和
ncgl2102基因,过表达突变后的
ncgl1504
y56m,t235p基因;异源引入大肠杆菌
escherichia coli来源的
pntab基因;过表达外排蛋白
ncgl1262基因;敲除
ncgl0909基因、
ncgl2632基因和
ncgl0580基因;过表达
ncgl1610-1609-1608操纵子。
6、优选的,上述l-组氨酸生产菌株,在野生型谷氨酸棒状杆菌
corynebacterium
glutamicum基因组上用p
tuf启动子驱动
ncgl1505基因
、ncgl2093基因
、ncgl2096基因
、
ncgl2094基因
、ncgl2097基因
、ncgl2100基因
、ncgl0218基因
、ncgl2101基因
、ncgl0799基因和
ncgl2102基因过表达,用p
tuf启动子驱动突变后的
ncgl1504
y56m,t235p基因过表达;异源引入大肠杆菌来源的
pntab基因并用p
tuf启动子驱动过表达;用p
sod启动子驱动外排蛋白
ncgl1262基因过表达;敲除
ncgl0909基因、
ncgl2632基因和
ncgl0580基因;用p
tuf启动子驱动
ncgl1610-1609-1608操纵子过表达。
7、优选的,上述l-组氨酸生产菌株,所述
ncgl2102基因、
ncgl2101基因和
ncgl2100基因以
ncgl2102-2101-2100天然操纵子的形式过表达;
ncgl2097基因和
ncgl2096基因以
ncgl2097-2096天然操纵子的形式过表达;
ncgl2094基因和
ncgl2093基因以
ncgl2094-2093天然操纵子的形式过表达。
8、优选的,上述l-组氨酸生产菌株,所述野生型谷氨酸棒状杆菌
corynebacterium
glutamicum为野生型谷氨酸棒状杆菌
corynebacterium glutamicumatcc 13032。
9、优选的,上述l-组氨酸生产菌株,所述
ncgl0909基因的核苷酸序列如序列表seqid no.1所示;
ncgl2632基因的核苷酸序列如序列表seq id no.2所示;
ncgl0580基因的核苷酸序列如序列表seq id no.3所示。
10、优选的,上述l-组氨酸生产菌株,所述
ncgl1610-1609-1608操纵子的核苷酸序列如序列表seq id no.4所示;
ncgl1610基因的核苷酸序列如序列表seq id no.5所示;
ncgl1609基因的核苷酸序列如序列表seq id no.6所示;
ncgl1608基因的核苷酸序列如序列表seq id no.7所示。
11、优选的,上述l-组氨酸生产菌株,所述
ncgl2102-2101-2100天然操纵子的核苷酸序列如序列表seq id no.8;
ncgl2102基因的核苷酸序列如序列表seq id no.9所示;
ncgl2101基因的核苷酸序列如序列表seq id no.10所示;
ncgl2100基因的核苷酸序列如序列表seq id no.11所示;
ncgl2097-2096天然操纵子的核苷酸序列如序列表seq id no.12所示;
ncgl2097基因的核苷酸序列如序列表seq id no.13所示;
ncgl2096基因的核苷酸序列如序列表seq id no.14所示;
ncgl2094-2093天然操纵子的核苷酸序列如序列表seq idno.15所示;
ncgl2094基因的核苷酸序列如序列表seq id no.16所示;
ncgl2093基因的核苷酸序列如序列表seq id no.17所示;
ncgl0218基因的核苷酸序列如序列表seq id no.18所示;
ncgl0799基因的核苷酸序列如序列表seq id no.19所示;
ncgl1505基因的核苷酸序列如序列表seq id no.20所示;
ncgl1504
y56m,t235p基因的核苷酸序列如序列表seq id no.21所示; 大肠杆菌
escherichia coli来源的
pntab基因的核苷酸序列如序列表seq id no.22所示;大肠杆菌
escherichia coli来源的
pnta基因的核苷酸序列如序列表seq id no.23所示;大肠杆菌
escherichia coli来源的
pntb基因的核苷酸序列如序列表seq id no.24所示;外排蛋白
ncgl1262基因的核苷酸序列如序列表seq id no.25所示。
12、优选的,上述l-组氨酸生产菌株,所述p
tuf启动子的核苷酸序列如序列表seq idno.37所示,p
sod启动子的核苷酸序列如序列表seq id no.26所示。
13、上述l-组氨酸生产菌株的构建方法,在出发菌株野生型谷氨酸棒状杆菌
corynebacterium glutamicum基础上进行定向改造,具体步骤如下:
14、(1)基因组上过表达
ncgl1505基因
、ncgl2093基因
、ncgl2096基因
、ncgl2094基因
、
ncgl2097基因
、ncgl2100基因
、ncgl0218基因
、ncgl2101基因
、ncgl0799基因
、ncgl2102基因,以及过表达内源突变后的
ncgl1504
y56m,t235p基因;
15、(2)异源引入大肠杆菌来源的
pntab基因;
16、(3)过表达外排蛋白
ncgl1262基因;
17、(4)敲除
ncgl0909基因、
ncgl2632基因和
ncgl0580基因,并过表达
ncgl1610-1609-
1608操纵子。
18、优选的,上述l-组氨酸生产菌株的构建方法,具体步骤如下:
19、1)在
ncgl3068位点使用p
tuf启动子驱动n
cgl2102-2101-2100操纵子过表达;
20、2)在
ncgl1781位点使用p
tuf启动子驱动
ncgl2097-2096操纵子过表达;
21、3)在
ncgl1775位点使用p
tuf启动子驱动
ncgl2094-2093操纵子过表达;
22、4)在
ncgl1790位点使用p
tuf启动子驱动
ncgl0218基因过表达;
23、5)在
ncgl1774位点使用p
tuf启动子驱动
ncgl0799基因过表达;
24、6)在
ncgl1773位点使用p
tuf启动子驱动
ncgl1505基因过表达;
25、7)在
ncgl1817位点使用p
tuf启动子驱动
ncgl1504
y56m,t235p基因过表达;
26、8)在
ncgl2998位点使用p
tuf启动子驱动大肠杆菌来源的
pntab过表达;
27、9)在
ncgl2949位点使用p
sod启动子驱动
ncgl1262基因过表达;
28、10)敲除
ncgl0909基因;
29、11)敲除
ncgl2632基因;
30、12)敲除
ncgl0580基因;
31、13)在
ncgl2923位点使用p
tuf启动子驱动
ncgl1610-1609-1608操纵子过表达。
32、上述
ncgl3068的核苷酸序列如序列表seq id no.27所示;
ncgl1781的核苷酸序列如序列表seq id no.28所示;
ncgl1775的核苷酸序列如序列表seq id no.29所示;
ncgl1790的核苷酸序列如序列表seq id no.30所示;
ncgl1773的核苷酸序列如序列表seqid no.31所示;
ncgl1774的核苷酸序列如序列表seq id no.32所示;
ncgl1817的核苷酸序列如序列表seq id no.33所示;
ncgl2998的核苷酸序列如序列表seq id no.34所示;
ncgl2949的核苷酸序列如序列表seq id no.35所示;
ncgl2923的核苷酸序列如序列表seqid no.36所示。
33、上述l-组氨酸生产菌株在生产l-组氨酸中的应用。
34、优选的,上述应用,采用发酵方法生产l-组氨酸。
35、优选的,上述应用,使用发酵罐进行发酵:按20%接种量接种种子液到发酵培养基中,发酵过程中通过流加氨水维持ph在7.0。
36、优选的,上述应用,具体步骤如下:
37、(1)斜面种子培养:将菌株从-80℃的20%甘油保菌管接入固体斜面活化培养,培养条件为32℃、12h,共活化两代,使用第二代固体斜面上的菌作为种子罐的出发菌;
38、(2)发酵罐种子培养:使用无菌的生理盐水洗下二代固体斜面菌体,全部接入5 l发酵罐内培养,培养基定容至2 l,培养条件为32℃,ph 7.0,溶氧30-50%,培养至od600nm达到15;
39、(3)发酵罐发酵培养:按20%接种量接种种子液到发酵培养基中,培养基定容2l,培养条件为32℃,溶氧30-50%,发酵过程中通过流加氨水维持ph在7.0左右。
40、优选的,上述应用,使用的斜面培养基为:bhi培养基。
41、优选的,上述应用,使用的种子培养基为:mgso4·7h2o 1g/l,酵母粉4g/l,蛋白胨2g/l,k2hpo4·3h2o 4g/l,谷氨酸1.3g/l,feso4·7h2o 8mg/l,mnso46mg/l,vb1、vb3、vb5各2mg/l,硫酸铵8g/l。
42、优选的,上述应用,使用的发酵培养基为:mgso4·7h2o 2g/l,酵母粉4g/l,蛋白胨3g/l,k2hpo4·3h2o 6g/l,谷氨酸1.3g/l,feso4·7h2o 30mg/l,mnso410mg/l,vb1、vb3、vb5各2mg/l,硫酸铵8g/l。
43、上述培养基均可采用标准方法制备获得。
44、有益效果:
45、上述l-组氨酸生产菌株,构建过程采用atp优化策略,包括敲除
ncgl0909基因、
ncgl2632基因
、ncgl0580基因,从能量代谢的角度上,敲除非必需atp消耗基因,减少atp的损失,使更多的atp有效用于产物的合成;尤其
ncgl0580敲除后,糖酵解途径中多个关键基因的转录水平显著上调,有利于atp的生成;过表达突变后的
ncgl1504
y56m,t235p基因,通过改变酶的调控结构域,产物l-组氨酸不能与其结合使其蛋白构象发生改变,从而提升组氨酸的产量;过表达
ncgl1610-1609-1608操纵子,使氧化磷酸化水平提高,促进atp的生成;采用特定的启动子过表达特定基因,结合atp优化策略,使得到的菌株合成效率和生产强度显著提升。
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