一种L-组氨酸生产菌株及其构建方法与应用

摘要: 本发明涉及生物技术与发酵工程,尤其是一种l-组氨酸生产菌株及其构建方法与应用。背景技术:1、l-组氨酸(l-histidine)是一种含有咪唑环的碱性氨基酸,在...
一种L-组氨酸生产菌株及其构建方法与应用

本发明涉及生物技术与发酵工程,尤其是一种l-组氨酸生产菌株及其构建方法与应用。

背景技术:

1、l-组氨酸(

l-histidine)是一种含有咪唑环的碱性氨基酸,在医药、食品、饲料及化妆品等领域具有广泛的应用价值。据统计,全球l-组氨酸市场需求呈稳步增长态势,对高效、低成本、可持续的生产技术提出了迫切需求。

2、目前,在代谢工程改造中所面临的主要问题包括:l-组氨酸会对关键酶

ncgl1504进行反馈抑制,使l-组氨酸不能高效地生成;atp和nadph的供应不足,也会限制l-组氨酸的产量。

技术实现思路

1、本发明所要解决的技术问题在于提供一种l-组氨酸生产菌株。

2、本发明所要解决的另一技术问题在于提供上述l-组氨酸生产菌株的构建方法。

3、本发明所要解决的另一技术问题在于提供上述l-组氨酸生产菌株的应用。

4、为解决上述技术问题,本发明的技术方案是:

5、一种l-组氨酸生产菌株,命名为his-13,是以野生型谷氨酸棒状杆菌

corynebacterium glutamicum作为出发菌株利用代谢工程手段进行基因编辑获得的:过表达

ncgl1505基因

、ncgl2093基因

、ncgl2096基因

、ncgl2094基因

、ncgl2097基因

、ncgl2100基因

、ncgl0218基因

、ncgl2101基因

、ncgl0799基因和

ncgl2102基因,过表达突变后的

ncgl1504

y56m,t235p基因;异源引入大肠杆菌

escherichia coli来源的

pntab基因;过表达外排蛋白

ncgl1262基因;敲除

ncgl0909基因、

ncgl2632基因和

ncgl0580基因;过表达

ncgl1610-1609-1608操纵子。

6、优选的,上述l-组氨酸生产菌株,在野生型谷氨酸棒状杆菌

corynebacterium

glutamicum基因组上用p

tuf启动子驱动

ncgl1505基因

、ncgl2093基因

、ncgl2096基因

、

ncgl2094基因

、ncgl2097基因

、ncgl2100基因

、ncgl0218基因

、ncgl2101基因

、ncgl0799基因和

ncgl2102基因过表达,用p

tuf启动子驱动突变后的

ncgl1504

y56m,t235p基因过表达;异源引入大肠杆菌来源的

pntab基因并用p

tuf启动子驱动过表达;用p

sod启动子驱动外排蛋白

ncgl1262基因过表达;敲除

ncgl0909基因、

ncgl2632基因和

ncgl0580基因;用p

tuf启动子驱动

ncgl1610-1609-1608操纵子过表达。

7、优选的,上述l-组氨酸生产菌株,所述

ncgl2102基因、

ncgl2101基因和

ncgl2100基因以

ncgl2102-2101-2100天然操纵子的形式过表达;

ncgl2097基因和

ncgl2096基因以

ncgl2097-2096天然操纵子的形式过表达;

ncgl2094基因和

ncgl2093基因以

ncgl2094-2093天然操纵子的形式过表达。

8、优选的,上述l-组氨酸生产菌株,所述野生型谷氨酸棒状杆菌

corynebacterium

glutamicum为野生型谷氨酸棒状杆菌

corynebacterium glutamicumatcc 13032。

9、优选的,上述l-组氨酸生产菌株,所述

ncgl0909基因的核苷酸序列如序列表seqid no.1所示;

ncgl2632基因的核苷酸序列如序列表seq id no.2所示;

ncgl0580基因的核苷酸序列如序列表seq id no.3所示。

10、优选的,上述l-组氨酸生产菌株,所述

ncgl1610-1609-1608操纵子的核苷酸序列如序列表seq id no.4所示;

ncgl1610基因的核苷酸序列如序列表seq id no.5所示;

ncgl1609基因的核苷酸序列如序列表seq id no.6所示;

ncgl1608基因的核苷酸序列如序列表seq id no.7所示。

11、优选的,上述l-组氨酸生产菌株,所述

ncgl2102-2101-2100天然操纵子的核苷酸序列如序列表seq id no.8;

ncgl2102基因的核苷酸序列如序列表seq id no.9所示;

ncgl2101基因的核苷酸序列如序列表seq id no.10所示;

ncgl2100基因的核苷酸序列如序列表seq id no.11所示;

ncgl2097-2096天然操纵子的核苷酸序列如序列表seq id no.12所示;

ncgl2097基因的核苷酸序列如序列表seq id no.13所示;

ncgl2096基因的核苷酸序列如序列表seq id no.14所示;

ncgl2094-2093天然操纵子的核苷酸序列如序列表seq idno.15所示;

ncgl2094基因的核苷酸序列如序列表seq id no.16所示;

ncgl2093基因的核苷酸序列如序列表seq id no.17所示;

ncgl0218基因的核苷酸序列如序列表seq id no.18所示;

ncgl0799基因的核苷酸序列如序列表seq id no.19所示;

ncgl1505基因的核苷酸序列如序列表seq id no.20所示;

ncgl1504

y56m,t235p基因的核苷酸序列如序列表seq id no.21所示; 大肠杆菌

escherichia coli来源的

pntab基因的核苷酸序列如序列表seq id no.22所示;大肠杆菌

escherichia coli来源的

pnta基因的核苷酸序列如序列表seq id no.23所示;大肠杆菌

escherichia coli来源的

pntb基因的核苷酸序列如序列表seq id no.24所示;外排蛋白

ncgl1262基因的核苷酸序列如序列表seq id no.25所示。

12、优选的,上述l-组氨酸生产菌株,所述p

tuf启动子的核苷酸序列如序列表seq idno.37所示,p

sod启动子的核苷酸序列如序列表seq id no.26所示。

13、上述l-组氨酸生产菌株的构建方法,在出发菌株野生型谷氨酸棒状杆菌

corynebacterium glutamicum基础上进行定向改造,具体步骤如下:

14、(1)基因组上过表达

ncgl1505基因

、ncgl2093基因

、ncgl2096基因

、ncgl2094基因

、

ncgl2097基因

、ncgl2100基因

、ncgl0218基因

、ncgl2101基因

、ncgl0799基因

、ncgl2102基因,以及过表达内源突变后的

ncgl1504

y56m,t235p基因;

15、(2)异源引入大肠杆菌来源的

pntab基因;

16、(3)过表达外排蛋白

ncgl1262基因;

17、(4)敲除

ncgl0909基因、

ncgl2632基因和

ncgl0580基因,并过表达

ncgl1610-1609-

1608操纵子。

18、优选的,上述l-组氨酸生产菌株的构建方法,具体步骤如下:

19、1)在

ncgl3068位点使用p

tuf启动子驱动n

cgl2102-2101-2100操纵子过表达;

20、2)在

ncgl1781位点使用p

tuf启动子驱动

ncgl2097-2096操纵子过表达;

21、3)在

ncgl1775位点使用p

tuf启动子驱动

ncgl2094-2093操纵子过表达;

22、4)在

ncgl1790位点使用p

tuf启动子驱动

ncgl0218基因过表达;

23、5)在

ncgl1774位点使用p

tuf启动子驱动

ncgl0799基因过表达;

24、6)在

ncgl1773位点使用p

tuf启动子驱动

ncgl1505基因过表达;

25、7)在

ncgl1817位点使用p

tuf启动子驱动

ncgl1504

y56m,t235p基因过表达;

26、8)在

ncgl2998位点使用p

tuf启动子驱动大肠杆菌来源的

pntab过表达;

27、9)在

ncgl2949位点使用p

sod启动子驱动

ncgl1262基因过表达;

28、10)敲除

ncgl0909基因;

29、11)敲除

ncgl2632基因;

30、12)敲除

ncgl0580基因;

31、13)在

ncgl2923位点使用p

tuf启动子驱动

ncgl1610-1609-1608操纵子过表达。

32、上述

ncgl3068的核苷酸序列如序列表seq id no.27所示;

ncgl1781的核苷酸序列如序列表seq id no.28所示;

ncgl1775的核苷酸序列如序列表seq id no.29所示;

ncgl1790的核苷酸序列如序列表seq id no.30所示;

ncgl1773的核苷酸序列如序列表seqid no.31所示;

ncgl1774的核苷酸序列如序列表seq id no.32所示;

ncgl1817的核苷酸序列如序列表seq id no.33所示;

ncgl2998的核苷酸序列如序列表seq id no.34所示;

ncgl2949的核苷酸序列如序列表seq id no.35所示;

ncgl2923的核苷酸序列如序列表seqid no.36所示。

33、上述l-组氨酸生产菌株在生产l-组氨酸中的应用。

34、优选的,上述应用,采用发酵方法生产l-组氨酸。

35、优选的,上述应用,使用发酵罐进行发酵:按20%接种量接种种子液到发酵培养基中,发酵过程中通过流加氨水维持ph在7.0。

36、优选的,上述应用,具体步骤如下:

37、(1)斜面种子培养:将菌株从-80℃的20%甘油保菌管接入固体斜面活化培养,培养条件为32℃、12h,共活化两代,使用第二代固体斜面上的菌作为种子罐的出发菌;

38、(2)发酵罐种子培养:使用无菌的生理盐水洗下二代固体斜面菌体,全部接入5 l发酵罐内培养,培养基定容至2 l,培养条件为32℃,ph 7.0,溶氧30-50%,培养至od600nm达到15;

39、(3)发酵罐发酵培养:按20%接种量接种种子液到发酵培养基中,培养基定容2l,培养条件为32℃,溶氧30-50%,发酵过程中通过流加氨水维持ph在7.0左右。

40、优选的,上述应用,使用的斜面培养基为:bhi培养基。

41、优选的,上述应用,使用的种子培养基为:mgso4·7h2o 1g/l,酵母粉4g/l,蛋白胨2g/l,k2hpo4·3h2o 4g/l,谷氨酸1.3g/l,feso4·7h2o 8mg/l,mnso46mg/l,vb1、vb3、vb5各2mg/l,硫酸铵8g/l。

42、优选的,上述应用,使用的发酵培养基为:mgso4·7h2o 2g/l,酵母粉4g/l,蛋白胨3g/l,k2hpo4·3h2o 6g/l,谷氨酸1.3g/l,feso4·7h2o 30mg/l,mnso410mg/l,vb1、vb3、vb5各2mg/l,硫酸铵8g/l。

43、上述培养基均可采用标准方法制备获得。

44、有益效果:

45、上述l-组氨酸生产菌株,构建过程采用atp优化策略,包括敲除

ncgl0909基因、

ncgl2632基因

、ncgl0580基因,从能量代谢的角度上,敲除非必需atp消耗基因,减少atp的损失,使更多的atp有效用于产物的合成;尤其

ncgl0580敲除后,糖酵解途径中多个关键基因的转录水平显著上调,有利于atp的生成;过表达突变后的

ncgl1504

y56m,t235p基因,通过改变酶的调控结构域,产物l-组氨酸不能与其结合使其蛋白构象发生改变,从而提升组氨酸的产量;过表达

ncgl1610-1609-1608操纵子,使氧化磷酸化水平提高,促进atp的生成;采用特定的启动子过表达特定基因,结合atp优化策略,使得到的菌株合成效率和生产强度显著提升。