成年人抑郁伴随严重便秘的肠道微生物标志物、预测系统及其应用的制作方法

摘要: 本发明属于生物医药领域,具体地涉及一种成年人抑郁伴随严重便秘的肠道微生物标志物、预测系统及其应用。背景技术:1、抑郁症是全球致残率最高的精神障碍之一,成年抑郁症...
成年人抑郁伴随严重便秘的肠道微生物标志物、预测系统及其应用的制作方法

本发明属于生物医药领域,具体地涉及一种成年人抑郁伴随严重便秘的肠道微生物标志物、预测系统及其应用。

背景技术:

1、抑郁症是全球致残率最高的精神障碍之一,成年抑郁症群体社会负担较重,患病率较高。与青少年抑郁症不同,成年人抑郁症常伴随慢性躯体疾病、职业功能损害及高复发风险。

2、在成年抑郁症伴随严重便秘患者中,抑郁症伴随严重便秘的患者常存在慢性炎症、胰岛素抵抗等代谢异常,而严重便秘相关症状(疲劳、活动减少)与抑郁症重叠,易导致误诊或过度诊断。

3、因此,区分待测成年人是否为抑郁症伴随严重便秘患者是实现精准诊断与个体化治疗的关键前提,现有技术缺乏针对性的客观评估手段。

技术实现思路

1、针对上述技术问题,本发明提供一种成年人抑郁伴随严重便秘的肠道微生物标志物、预测系统及其应用,其可为抑郁症伴随严重便秘患者的精准诊断提供针对性的客观评估手段。

2、本发明提供的技术方案如下:

3、第一方面,一种抑郁症伴随严重便秘的微生物标志物,所述微生物标志物包括约氏副拟杆菌parabacteroides johnsonii和/或光泽副普雷沃氏菌paraprevotella clara。

4、第二方面,一种成年人抑郁症伴随肥胖的微生物标志物,所述微生物标志物为由约氏副拟杆菌parabacteroides johnsonii、光泽副普雷沃氏菌paraprevotella clara、龋齿沙尔氏菌schaalia odontolytica和普通拟杆菌bacteroides vulgatus组成的标志物组合。

5、第三方面,一种试剂盒,所述试剂盒内装有用于定量检测第二方面所述的微生物标志物的试剂。

6、第四方面,第三方面所述的试剂盒在制备诊断成年人抑郁症伴随严重便秘的产品中的应用,所述龋齿沙尔氏菌schaalia odontolytica、约氏副拟杆菌parabacteroidesjohnsonii和光泽副普雷沃氏菌paraprevotella clara在成年人抑郁症伴随严重便秘患者中明显增加,所述普通拟杆菌bacteroides vulgatus在成年人抑郁症伴随严重便秘患者中明显减少。

7、第五方面,一种用于诊断抑郁症伴随严重便秘的产品,所述产品包括试剂、试纸、适配体和芯片中的一种或多种,所述产品用于定量检测第二方面所述的微生物标志物,并对第二方面所述的微生物标志物具有特异性。

8、第六方面,一种评估待测成年人为抑郁症伴随严重便秘患者的风险的预测系统,包括:

9、检测模块,获得待测成年人的粪便样本中第二方面所述的微生物标志物的定量检测结果;

10、比对模块,将所述检测结果与预设阈值进行比较,根据比较结果判断待测成年人为抑郁症伴随严重便秘患者的风险。

11、第六方面,一种成年抑郁症伴随严重便秘患者的预测系统,包括:

12、检测模块,用于获取待测供体的粪便样本中预设的微生物标志物的定量检测结果,所述微生物标志物为由约氏副拟杆菌parabacteroides johnsonii、光泽副普雷沃氏菌paraprevotella clara、龋齿沙尔氏菌schaalia odontolytica和普通拟杆菌bacteroidesvulgatus组成的标志物组合;

13、计算模块,用于根据所述定量检测结果计算待测供体为抑郁症伴随严重便秘患者的概率,记为患病概率值;

14、比对模块,用于将所述患病概率值与预设阈值进行比较,根据比较结果判断待测成年人是否为抑郁症伴随严重便秘患者。

15、需要说明的是,本发明新发现并验证了上述多种肠道微生物与抑郁症伴随严重便秘具有强相关性,在此基础上,虽然本发明在实施例中仅列举了如何通过相对丰度值实现对待测样本进行定量检测,但其它可以对微生物实现定量检测的手段也是可行的(如绝对丰度或总微生物载量信息等手段),也可以用于辅助诊断待测样本是否患有抑郁症伴随严重便秘,人们可以根据自身的需要进行选择,在此不做赘述。

16、本发明的有益效果如下:

17、1、本发明新发现4种与抑郁症伴随严重便秘相关的肠道微生物,其包括龋齿沙尔氏菌schaalia odontolytica、普通拟杆菌bacteroides vulgatus、约氏副拟杆菌parabacteroides johnsonii和光泽副普雷沃氏菌paraprevotella clara;

18、经过研究、验证后发现,上述4种肠道微生物中的一种或几种可以作为与抑郁症伴随严重便秘相关的微生物标志物,可用于诊断待测样本是否患有抑郁症伴随严重便秘。

19、2、本发明还提供了一种试剂和试剂盒,能够以上述4个菌种中的某个或某几个作为检测标志物(也即微生物标志物)实现预测或诊断,待测成年人是否为抑郁症伴随严重便秘患者,完全无创,准确性高。本发明通过宏基因组学测序手段,提供更高的分辨率,使得对微生物群落的分析能够深入到菌种甚至是菌株的水平,从而提高诊断的准确性和可靠性。所述4个菌种还可作为开发这些系统的靶标微生物,填补了这一领域的空白。

20、3、本发明还提供了用于诊断抑郁症伴随严重便秘的产品和预测系统。该产品和预测系统能够实现基于各菌种的相对丰度即可计算获得患病概率,再与参考值对比预测或者诊断患者是否患抑郁症伴随严重便秘或者有患有抑郁症伴随严重便秘的风险。该产品和预测系统具有良好的可行性和准确性,可以有效地评估待测样本患抑郁症伴随严重便秘的风险,为临床诊断提供了新的工具。

1.一种定量检测微生物标志物的试剂在制备诊断成年人抑郁症伴随严重便秘的产品中的应用,其特征在于,所述微生物标志物包括约氏副拟杆菌parabacteroides johnsonii和光泽副普雷沃氏菌paraprevotella clara,所述约氏副拟杆菌parabacteroidesjohnsonii和光泽副普雷沃氏菌paraprevotella clara在成年人抑郁症伴随严重便秘患者中明显增加。

2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述微生物标志物还包括龋齿沙尔氏菌schaalia odontolytica和/或普通拟杆菌bacteroides vulgatus,所述龋齿沙尔氏菌schaalia odontolytica在成年人抑郁症伴随严重便秘患者中明显增加,所述普通拟杆菌bacteroides vulgatus在成年人抑郁症伴随严重便秘患者中明显减少。

3.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述微生物标志物为由约氏副拟杆菌parabacteroides johnsonii、光泽副普雷沃氏菌paraprevotella clara、龋齿沙尔氏菌schaalia odontolytica和普通拟杆菌bacteroides vulgatus组成的标志物组合,所述龋齿沙尔氏菌schaalia odontolytica、约氏副拟杆菌parabacteroides johnsonii和光泽副普雷沃氏菌paraprevotella clara在成年人抑郁症伴随严重便秘患者中明显增加,所述普通拟杆菌bacteroides vulgatus在成年人抑郁症伴随严重便秘患者中明显减少。

4.一种成年人抑郁症伴随严重便秘的微生物标志物,所述微生物标志物为由约氏副拟杆菌parabacteroides johnsonii、光泽副普雷沃氏菌paraprevotella clara、龋齿沙尔氏菌schaalia odontolytica和普通拟杆菌bacteroides vulgatus组成的标志物组合。

5.一种试剂盒,其特征在于:所述试剂盒内装有用于定量检测权利要求4所述的微生物标志物的试剂。

6.权利要求5所述的试剂盒在制备诊断成年人抑郁症伴随严重便秘的产品中的应用,其特征在于:所述龋齿沙尔氏菌schaalia odontolytica、约氏副拟杆菌parabacteroidesjohnsonii和光泽副普雷沃氏菌paraprevotella clara在成年人抑郁症伴随严重便秘患者中明显增加,所述普通拟杆菌bacteroides vulgatus在成年人抑郁症伴随严重便秘患者中明显减少。

7.一种用于诊断成年人抑郁症伴随严重便秘的产品,其特征在于:所述产品包括试剂、试纸、适配体和芯片中的一种或多种,所述产品对4所述的微生物标志物具有特异性,并用于定量检测权利要求4所述的微生物标志物。

8.一种评估待测成年人为抑郁症伴随严重便秘患者的风险的预测系统,其特征在于,包括:

9.一种成年抑郁症伴随严重便秘患者的预测系统,其特征在于:包括: