通过序列优化生产稳定性增加的生物治疗药物的方法与流程

技术特征：
1.一种用于优化包含可变重链(vh)和/或可变轻链(vl)的抗体的方法，所述方法包括：a)识别用于优化的抗体；b)识别所述抗体vh和/或vl中的一个或多个异常或低频残基；c)将所述抗体vh和/或vl序列与最接近的人或非人种系序列进行比对；d)识别所述抗体vh、vl或两者中的一个或多个体细胞超突变位点；e)识别通常在所述体细胞超突变位点中的位点处观察到的一个或多个种系残基；f)设计并工程化在所述体细胞超突变位点中的所述位点处含有所述种系残基的变体或变体库；g)评估所述变体或变体库的特性；以及h)选择一个或多个优化变体，其中所述一个或多个优化变体具有改善的生物物理特性、降低的免疫原性风险或两者。2.根据权利要求1所述的方法，其中异常或低频残基的所述识别由基于计算机的软件来完成。3.根据权利要求2所述的方法，其中所述基于计算机的软件是abysis。4.根据权利要求1所述的方法，其中所述异常或低频残基处于所述抗体vh中。5.根据权利要求1所述的方法，其中所述异常或低频残基处于所述抗体vl中。6.根据权利要求1所述的方法，其中所述异常或低频残基处于所述抗体vh和vl中。7.根据权利要求1所述的方法，其中所述先导抗体在框架区(fr)和/或互补决定区(cdr)中的一个或多个区中含有体细胞超突变。8.根据权利要求1所述的方法，其中工程化变体在所述抗体的人框架区、cdr1、cdr2或cdr3中产生。9.根据权利要求1所述的方法，其中将所述抗体vh和/或vl序列与所述最接近的人种系序列进行比对。10.根据权利要求1所述的方法，其中所述方法还包括克隆并生产所述变体或变体库。11.根据权利要求1所述的方法，其中所述变体或变体库的所述评估是生物物理评估。12.根据权利要求11所述的方法，其中所述生物物理评估是分析超速离心、热稳定性、解折叠自由能、分析尺寸排阻、储存稳定性和/或非特异性结合。13.根据权利要求12所述的方法，其中分析超速离心评估还包括将所述工程化变体的分析超速离心沉降速度(auc-sv)与所述先导抗体的auc-sv进行比较。14.根据权利要求12所述的方法，其中热稳定性评估还包括将每个所述工程化变体的热解折叠曲线的tm与所述先导抗体的热解折叠曲线的tm进行比较。15.根据权利要求12所述的方法，其中热稳定性评估还包括将每个所述工程化变体的tagg与所述先导抗体的tagg进行比较。16.根据权利要求12所述的方法，其中所述解折叠自由能还包括将每个所述工程化变体的δgu1、δgu2或c
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与所述先导抗体的δgu1、δgu2或c
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进行比较。17.根据权利要求12所述的方法，其中所述工程化变体的储存稳定性在4℃或40℃下在2周和4周时测量并与所述先导抗体的储存稳定性进行比较。18.根据权利要求1所述的方法，其中所述最佳变体具有增加的单体含量、增加的tm、增
加的tagg、增加的δgu1、增加的δgu2、增加的c
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值或减少的聚集。19.根据权利要求18所述的方法，其中当与所述先导抗体进行比较时，所述最佳变体的单体含量增加2％或更多。20.根据权利要求18所述的方法，其中当与所述先导抗体进行比较时，所述最佳变体的tm增加1℃或更多。21.根据权利要求18所述的方法，其中当与所述先导抗体进行比较时，所述最佳变体的tagg增加1℃或更多。22.根据权利要求18所述的方法，其中当与所述先导抗体进行比较时，所述最佳变体的解折叠自由能δgu1或δgu2增加4kj/mol或更多。23.根据权利要求18所述的方法，其中当与所述先导抗体进行比较时，所述最佳变体的c
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增加0.1m或更多。24.根据权利要求18所述的方法，其中当与所述先导抗体进行比较时，所述最佳变体的聚集含量减少1％或更多。25.根据权利要求1所述的方法，其中所述变体或变体库的所述评估是免疫原性风险评估。26.根据权利要求25所述的方法，其中所述免疫原性风险评估在计算机上测量。27.根据权利要求26所述的方法，其中在计算机上的所述免疫原性风险评估通过epivax评分来测量。28.根据权利要求27所述的方法，其中当与所述先导分子进行比较时，所述最佳变体具有相等或更低的epivax评分。29.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述抗体是抗体或抗体的抗原结合片段。30.一种产品，所述产品通过根据前述权利要求中任一项所述的方法来生产。

技术总结
本发明涉及以增强的稳定性优化抗体的方法，该方法包括用种系氨基酸残基使体细胞超突变发生突变，并因此提供增强的热稳定性、改善的生物物理特性和保质期，同时保持对抗原的亲和力。和力。和力。


技术研发人员：S
受保护的技术使用者：詹森生物科技公司
技术研发日：2020.10.02
技术公布日：2022/7/15