鉴定西瓜种皮裂纹性状的分子标记、方法、引物对、试剂盒及其应用

技术特征：
1.一种与西瓜种皮裂纹性状紧密连锁的indel分子标记，其特征在于，所述indel分子标记为核苷酸序列如seq id no.1所示的117bp核苷酸片段和核苷酸序列如seq id no.2所示的128bp核苷酸片段；所述seq id no.1与种皮无裂纹性状紧密连锁，所述seq id no.2与种皮裂纹性状紧密连锁。2.引物对在鉴定西瓜种皮裂纹性状中的应用，其特征在于，所述引物对包括核苷酸序列如seq id no.3所示的上游引物和核苷酸序列如seq id no.4所示的下游引物，所述应用为利用引物对扩增西瓜基因组dna获得扩增产物，再通过检测扩增产物来鉴定西瓜种皮是否有裂纹。3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述西瓜基因组dna取自幼苗期、抽蔓期或结果期的任一一个时期。4.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述应用中检测扩增产物是通过聚丙烯酰氨凝胶电泳进行检测，若扩增产物为117bp的一个片段，或者同时包含117bp和128bp两个片段，则判定具有种皮无裂纹性状；若扩增产物为128bp的一个片段，则判定具有种皮裂纹性状。5.一种鉴定西瓜种皮裂纹性状的方法，其特征在于，包括如下步骤：(1)提取待测西瓜的基因组dna；(2)以步骤(1)获得的基因组dna为模板，利用引物对进行pcr扩增，获得pcr产物；所述引物对包括核苷酸序列如seq id no.3所示的上游引物和核苷酸序列如seq id no.4所示的下游引物；(3)通过检测pcr产物，判断西瓜种皮是否有裂纹。6.根据权利要求5所述的方法，其特征在于，步骤(3)所述判断方法为利用聚丙烯酰氨凝胶电泳检测pcr产物，若pcr产物为117bp的一个片段，或者同时包含117bp和128bp两个片段，则判定具有种皮无裂纹性状；若pcr产物为128bp的一个片段，则判定具有种皮裂纹性状。7.权利要求5或6任意一项所述的方法在西瓜种皮裂纹性状辅助鉴定、辅助育种及西瓜种皮裂纹性状筛选中的应用。8.一种用于鉴定西瓜种皮裂纹性状的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒含有引物对；所述引物对包括核苷酸序列如seq id no.3所示的上游引物和核苷酸序列如seq id no.4所示的下游引物。9.一种权利要求8所述的试剂盒的使用方法，其特征在于，利用所述引物对对西瓜基因组dna进行扩增，获得pcr产物，再利用聚丙烯酰氨凝胶电泳对pcr产物进行检测。10.权利要求9所述的试剂盒在西瓜种皮裂纹性状辅助鉴定、辅助育种及西瓜种皮裂纹性状筛选中的应用。

技术总结
鉴定西瓜种皮裂纹性状的分子标记、方法、引物对、试剂盒及其应用，属于分子标记辅助育种技术领域。为了更好地鉴定西瓜种皮裂纹性状，获得与西瓜种皮裂纹性状紧密连锁的染色体区段及分子标记，本发明提供了一种与西瓜种皮裂纹性状紧密连锁的分子标记，该分子标记存在一处InDel位点的变化。通过引物对对西瓜幼苗基因组DNA进行PCR扩增，利用聚丙烯酰氨凝胶电泳检测PCR产物，即可对西瓜种皮是否具有裂纹性状进行区分。上述鉴定方法，操作简便，准确度高，为西瓜种皮形态分子鉴定提供了行之有效的分子育种工具。分子育种工具。分子育种工具。


技术研发人员：刘钊 栾非时 宋正峰 刘识 刘树森 高鹏 郎丰孝 王学征 冯翠艳 刘宏宇 杜黎黎
受保护的技术使用者：山东省西甜瓜育种工程技术研究中心有限公司 东北农业大学
技术研发日：2022.04.14
技术公布日：2022/8/1