密封蛋白-6双特异性抗体1.相关申请的交叉引用2.本技术要求2019年3月20日提交的美国临时申请第62/821,399号的权益，所述申请的全部内容以引用的方式整体并入本文。3.以引用的方式并入电子提交的材料4.以引用的方式整体并入本文的是与此同时提交并且如下标识的电脑可读核苷酸/氨基酸序列表：2019年3月20日创建的名为"54086p2_seqlisting.txt"的344,064ascii(文本)文件。
背景技术：
：：5.抗体构成了强大的治疗剂，其特征在于副作用有限，因为它们能够特异性地靶向细胞、细菌、病毒或毒素上的不同抗原。在1986年，第一种治疗性单克隆抗体orthocloneokt3被引入市场。从那时起，此类生物制药产品显著增长。在2014年底，美国或欧洲批准了47种单克隆抗体产品用于治疗多种疾病，包括癌症和炎症性疾病、心血管疾病、呼吸系统疾病和感染性疾病。6.目前，美国食品和药品管理局批准了十多种单克隆抗体来治疗癌症。这些剂之中有阿仑单抗其被指出用于慢性淋巴细胞性白血病(cll)；和曲妥珠单抗其用于治疗乳腺癌。将一些抗体用化学治疗药物标记，包括例如本妥昔单抗安适利(brentuximabvedotin)和ado-曲妥珠单抗恩美坦新(ado-trastuzumabemtansine)其他抗体产品，如博纳吐单抗(blinatumomab)(blincyto)被设计来识别并结合至两种不同的抗原。尽管此类抗体产品的商业可获得性，但目前的癌症发病率和癌症死亡率仍然高。据报告，每年每100,000名男性和女性的癌症发病率超过450人，并且每年每100,000名男性和女性的癌症死亡率刚超过170人。技术实现要素：7.本文提供了结合至密封蛋白-6(cldn6)的抗原结合蛋白及其双特异性型式。在各个方面，本公开的抗原结合蛋白结合至人cldn6并且任选地结合至小鼠cldn6。在各个方面，所述抗原结合蛋白结合至cldn6的细胞外结构域(ecd)。在各种情况下，所述抗原结合蛋白结合至cldn6的ecd的细胞外环2(el2)。在各个方面，所述抗原结合蛋白结合至el2，并且不结合至cldn6的ecd的细胞外环1(el1)。在各种情况下，所述抗原结合蛋白结合至人密封蛋白家族的另外成员，包括例如密封蛋白-3(cldn3)、密封蛋白-4(cldn4)和密封蛋白-9(cldn9)。在各种情况下，所述抗原结合蛋白结合至cldn6以及cldn4和cldn9中的至少一者。在各种情况下，所述抗原结合蛋白结合至cldn6，并且不结合至密封蛋白家族的任何其他成员。在各个方面，所述抗原结合蛋白结合至由人卵巢癌细胞(例如ovca429细胞)内源性表达的cldn6，并且在facs亲和力测定中表现出对ovca429细胞的小于约1200nm的ic50。在各种情况下，本公开的抗原结合蛋白在没有任何其他部分附接至所述抗原结合蛋白的情况下抑制受试者(例如人)中的肿瘤生长。8.本文进一步提供了与异源部分缀合(例如，与任何化学治疗剂、药物或毒性部分缀合)的抗原结合蛋白抑制受试者(例如人)中的肿瘤生长。在各种情况下，所述缀合的抗原结合蛋白是单克隆抗体。在各种情况下，所述抗体与改变微管动力学的剂(例如mmae)缀合。在各种情况下，缀合物包含可裂解的接头，例如，mc-vc-pab。在各个方面，所述缀合物是同质缀合物或异质缀合物。在各个方面，所述异源部分在所述抗原结合蛋白的特定位点处缀合。在各种情况下，所述缀合的抗原结合蛋白是双特异性抗原结合蛋白。9.在各个方面，所述双特异性抗原结合蛋白结合至由人癌细胞表达的cldn6。在各个方面，所述抗原结合蛋白抑制人cldn6与参考抗cldn6抗体之间的结合相互作用。不受特定理论的束缚，本文提供的抗原结合蛋白的抑制作用允许此类实体可用于减少肿瘤生长和治疗患有肿瘤或癌症的受试者的方法中。如本文进一步讨论的，在各个方面，所述抗原结合蛋白是抗体、其抗原结合抗体片段或抗体蛋白产物。10.本公开还提供了包含一组特定氨基酸序列的至少3、4、5个或所有氨基酸序列的双特异性抗原结合蛋白。在各个方面，所述抗原结合蛋白包含本文公开的cldn6抗体的至少3、4、5或6个互补决定区(cdr)氨基酸序列。11.本文进一步提供了相关的多肽、核酸、载体、宿主细胞和缀合物。此外还考虑了包含此类实体的药盒和药物组合物。12.还提供了制备双特异性抗原结合蛋白的方法。在各种实施方案中，所述方法包括培养包含编码如本文所述的双特异性抗原结合蛋白或多肽的核酸的宿主细胞以表达所述双特异性抗原结合蛋白或多肽。13.本文另外提供了治疗患有癌症的受试者的方法。在各种实施方案中，所述方法包括向所述受试者施用有效治疗所述受试者的癌症的量的本公开的药物组合物。14.还提供了治疗患有表达cldn6的癌症的受试者的方法，所述方法包括向所述受试者施用本文所述的药物组合物。进一步考虑了抑制受试者中的肿瘤生长的方法，所述方法包括向所述受试者施用本文所述的药物组合物。15.一种减小受试者中的肿瘤大小或预防受试者中的癌症复发的方法，所述方法包括向所述受试者施用本文所述的药物组合物。16.本文还提供了一种治疗被诊断为cldn6的低过表达者的受试者的癌症的方法，所述方法包括向所述受试者施用本文所述的药物组合物。17.在各种实施方案中，所述施用诱导肿瘤细胞，例如表达cldn6的细胞中的细胞凋亡。在各种实施方案中，所述施用诱导抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(adcc)或补体依赖性细胞毒性(cdc)、肿瘤坏死和细胞死亡或耗减，和/或肿瘤细胞粘附的破坏，其各自引起肿瘤消退或减缓肿瘤生长。附图说明18.图1表示正常(非癌性)组织中的cldn6表达的图。19.图2表示如通过agilent44k方法确定的癌细胞系中的cldn6表达的图。20.图3表示如通过rnaseq确定的癌细胞系中的cldn6表达的图。21.图4表示描绘不同细胞模型中的cldn6-gfp定位的一组荧光图像。22.图5表示人cldn6、人cldn3、人cldn4、人cldn9和小鼠cldn6的序列比对。显示了el1和el2的序列。23.图6a表示在用对照igg2抗体、ab3、参考ab1、参考ab2、参考ab3、ab2和ab3治疗后，携带子宫内膜肿瘤的小鼠中肿瘤随时间(天)变化的肿瘤体积(mm3)的图。图6b表示在用对照igg2抗体、ab3、参考ab1、参考ab2、参考ab3、ab2或ab3治疗的携带子宫内膜肿瘤的小鼠中的肿瘤在第14天的平均肿瘤体积(mm3)变化的图。24.图7a表示在用对照igg2抗体、ab3、参考ab1、参考ab2和ab3治疗后，携带膀胱肿瘤的小鼠中肿瘤随时间(天)变化的肿瘤体积(mm3)的图。图7b表示在用对照igg2抗体、ab3、参考ab1、参考ab2或ab3治疗的携带膀胱肿瘤的小鼠中的肿瘤在第35天的平均肿瘤体积(mm3)变化的图。25.图8a表示在用对照igg2抗体、ab3、参考ab1、ab2和ab3治疗后，携带卵巢肿瘤的小鼠中肿瘤随时间(天)变化的肿瘤体积(mm3)的图。图8b表示用对照igg2抗体、ab3、参考ab1、ab2或ab3治疗的携带卵巢肿瘤的小鼠中的肿瘤在第20天的平均肿瘤体积(mm3)变化的图。26.图9a表示在用对照igg2抗体、ab3、参考ab1、参考ab2、参考ab3和ab3治疗后，携带黑素瘤的小鼠中肿瘤随时间(天)变化的肿瘤体积(mm3)的图。图9b表示用对照igg2抗体、ab3、参考ab1、参考ab2、参考ab3或ab3治疗的携带黑素瘤的小鼠中的肿瘤在第21天的平均肿瘤体积(mm3)变化的图。27.图10a表示相对于用对照抗体治疗的小鼠，在用ab3治疗的携带肿瘤的小鼠中实现的肿瘤生长抑制％的图。图10b表示蛋白质印迹的图像，所述图像展示不同水平的cldn6id子宫内膜癌细胞系(ark2)、膀胱癌细胞系(umuc4)、卵巢癌细胞系(ov90)和黑素瘤细胞系(m202)和对照细胞。α-微管蛋白的水平大致相同，从而表明相等的蛋白质负载量。28.图11表示用媒介物对照、对照抗体、参考ab1、参考ab2、参考ab3和ab3治疗的携带肿瘤的小鼠的体重随时间(天)变化的变化％的图。29.图12a表示在用媒介物对照、对照igg2抗体、ab3、参考ab1或所指示抗cldn6抗体之一治疗后，携带卵巢肿瘤的小鼠中肿瘤随时间(天)变化的肿瘤体积(mm3)的图。图12b表示在用媒介物对照、对照igg2抗体、ab3、参考ab1或所指示抗cldn6抗体之一治疗的携带卵巢肿瘤的小鼠中的肿瘤在第28天的平均肿瘤体积(mm3)变化的图。30.图13表示用媒介物对照、对照抗体、参考ab1和所指示抗cldn6抗体治疗的携带肿瘤的小鼠的体重随时间(天)变化的变化％的图。31.图14表示本发明的几种抗cldn6抗体以及参考ab1和参考2的一系列剂量反应曲线。小鼠igg用作对照。32.图15a表示在用媒介物对照、对照igg抗体、ab3的小鼠形式、ab3的第一种人源化形式和ab3的第二人源化形式治疗的携带膀胱肿瘤的小鼠中的肿瘤在第35天的平均肿瘤体积(mm3)变化的图。图15b表示图15a中各组的肿瘤体积(mm3)的变化的图。33.图16a表示在用媒介物对照、对照igg抗体、ab3的小鼠形式、ab3的第一种人源化形式和ab3的第二人源化形式治疗的携带膀胱肿瘤的小鼠中的肿瘤在第35天的平均肿瘤体积(mm3)变化的图。在此实验中还测试了两种对照抗体(一种小鼠抗体和一种嵌合抗体)。图16b表示图16a中各组的肿瘤体积(mm3)的变化的图。34.图17a表示在用媒介物对照、对照igg抗体、ab1的小鼠形式和ab1的人源化形式治疗的携带膀胱肿瘤的小鼠中的肿瘤在第35天的平均肿瘤体积(mm3)变化的图。图17b表示图17a中各组的肿瘤体积(mm3)的变化的图。35.图18a表示在用媒介物对照、对照igg抗体、ab4的小鼠形式和ab4的人源化形式治疗的携带膀胱肿瘤的小鼠中的肿瘤在第35天的平均肿瘤体积(mm3)变化的图。图18b表示图18a中各组的肿瘤体积(mm3)的变化的图。36.图19a表示在用媒介物对照、对照igg抗体、ab3的小鼠形式、ab3的嵌合形式、ab3的第一人源化形式、ab3的第二人源化形式、ab1的小鼠形式、ab1的人源化形式、ab4的小鼠形式、ab4的人源化形式治疗的携带膀胱肿瘤的小鼠中的肿瘤在第35天的平均肿瘤体积(mm3)变化的图，并且也对四种对照抗体(具有小鼠形式或嵌合形式的一种抗体以及具有小鼠或人形式的一种抗体)在此实验中进行了测试。图19b表示图19a中各组的肿瘤体积(mm3)的变化的图。37.图20表示如图19a中所述治疗的携带膀胱肿瘤的小鼠中的肿瘤在第55天的平均肿瘤体积(mm3)变化的图。38.图21表示在第32天如图19a中所述治疗的携带肿瘤的小鼠体重的变化％的图。39.图22是制备和表征的12种cldn6抗体(命名为s1-s12)的重链可变区和轻链可变区的序列的列表。s1-s6是基于ab3的人源化型式(人源化ab3-7)，并且s7-s12是基于ab1的人源化型式(人源化ab1-11)。40.图23-图26是本公开的cldn6抗体的示例性下一代测序(ngs)鉴定的体细胞超突变(shm)的示意图。图23是基于ab-3的抗体和重链中的ngs鉴定的shm的图示。图24是基于ab-3的抗体和轻链中的ngs鉴定的shm的图示。图25是基于ab-1的抗体和重链中的ngs鉴定的shm的图示。图26是基于ab-1的抗体和轻链中的ngs鉴定的shm的图示。突变以chothia编号列出。41.图27是基于人源化ab3-7(abs1-s6)或人源化ab1-11(abs7-s12)的抗体s1-s12的facs结合测定结果的表。所测试的浓度在d列中示出。42.图28是不同细胞系中不同浓度的抗体s1-s12的facs结合测定结果的表。43.图29a是三种类型的n-聚糖(寡甘露糖、复合物和杂合体)以及此类糖的常用符号的图示。图29b是岩藻糖代谢的补救途径和从头途径的图解。在补救途径中，将游离l-岩藻糖转化为gdp-岩藻糖，而在从头途径中，gdp-岩藻糖通过由gmd和fx催化的三个反应合成。gdp-岩藻糖然后通过gdp-fuc转移酶从细胞溶质转运至高尔基体腔中并转移至受体寡糖和蛋白质。另一种反应产物gdp通过管腔核苷酸二磷酸酶转化为鸟苷5-单磷酸(gmp)和无机磷酸盐(pi)。前者输出到细胞溶质(通过与gdp岩藻糖转运相结合的反向转运系统)，而后者被假定通过高尔基阴离子通道golac离开高尔基体腔。参见例如，nordeen等人2000；hirschberg等人2001。44.图30是皮下注射人癌细胞、随后如本文所述治疗的小鼠中的肿瘤体积的图。45.图31是皮下注射人癌细胞、随后如本文所述治疗的小鼠中的肿瘤体积的图。46.图32是皮下注射人癌细胞、随后如本文所述治疗的小鼠中的肿瘤体积的图。47.图33是皮下注射人癌细胞、随后如本文所述治疗的小鼠中的肿瘤体积的图。48.图34a是如本文所述与仅二抗(黑线)或与全长抗体(红线、蓝线、绿线)一起孵育的ovca429细胞的信号的facs图。红线、蓝线和绿线的区别在于在二抗之前和/或之后的洗涤步骤不同。49.图34b是如本文所述与仅二抗(黑线)或与fab(红线、蓝线、绿线)一起孵育的ovca429细胞的信号的facs图。红线、蓝线和绿线的区别在于在二抗之前和/或之后的洗涤步骤不同。50.图34c是如本文所述与仅二抗(黑线)或与fab(红线、蓝线、绿线)一起孵育的ovca429细胞的信号的facs图。红线、蓝线和绿线的区别在于在二抗之前和/或之后的洗涤步骤不同。51.图34d是如本文所述与仅二抗(黑线)或与fab(红线、蓝线、绿线)一起孵育的ovca429细胞的信号的facs图。红线、蓝线和绿线的区别在于在二抗之前和/或之后的洗涤步骤不同。52.图34e是如本文所述与仅二抗(黑线)或与全长抗体和fab的混合物(红线、蓝线、绿线和紫线)一起孵育的ovca429细胞的信号的facs图。红线、蓝线、绿线和紫线的区别在于在二抗之前和/或之后的洗涤步骤不同。53.图35是列出facs图的定量信号的表。54.图36a是用仅二抗免疫染色的细胞的图像。图36b是用仅fab(充当一抗)免疫染色的细胞的图像。图36c是用fab和二抗免疫染色的细胞的图像。55.图37a是用于表达人源化ab3-7和ab1-11的scfv的表达载体的图示。图37b提供编码lc可变区和hc可变区(在其之间具有间隔区)的序列。56.图38a是来自与仅二抗(黑色)或与ab3-7scfv和二抗(红色)一起孵育的ark2细胞的信号的facs图。57.图38b是来自与仅二抗(黑色)或与ab3-7scfv和二抗(红色)一起孵育的m202细胞的信号的facs图。58.图39a是来自与(a)仅二抗(蓝色条形)、(b)ab3-7scfv、随后二抗(橙色条形)或(c)ab1-11scfv、随后二抗(灰色条形)一起孵育的过表达cldn6gfp的293t细胞、m202细胞或ark2细胞的信号的条形图。59.图39b是来自与(a)仅二抗(蓝色条形)、(b)ab3-7scfv、随后二抗(橙色条形)或(c)ab1-11scfv、随后二抗(灰色条形)一起孵育的过表达cldn6gfp的293t细胞、m202细胞或ark2细胞的gfp信号的条形图。60.图40a-图40c是由与仅二抗(黑线)或与ab3-7scfv、随后二抗(红线)或与ab1-11scfv、随后二抗(蓝线)一起孵育的过表达cldn6gfp的293t细胞(图40a)、m202细胞(图40b)或ark2细胞(图40c)产生的信号的facs图。61.图40d-图40f是展示图40a的每一组中的细胞数量的facs图。62.图41a-图41h示出包含ab3-7(也称为ab23)的cldn6抗体-药物缀合物(adc)的生物化学表征。图41a是总结cldn6adc的生物化学性质的表。图41b-图41h表示hic-hplc的色谱图，其示出与不同数量的药物缀合的抗体的相对丰度。63.图42示出通过天然page分析的包含ab3-7的cldn6adc的分子完整性。64.图43示出包含ab3-7的cldn6抗体-药物缀合物(adc)与天然cldn6阳性细胞或人工过表达cldn6的细胞的结合活性(流式细胞术)。65.图44示出包含ab3-7的cldn6adc与表达cldn6的细胞的结合亲和力。kd(解离常数)测量通过kinexa4000(sapidyneinstrument,boise,idaho)使用hek293tcldn6-mgfpa11细胞来进行。66.图45示出包含ab3-7的cldn6adc的体外表征。图展示cldn6adc的细胞内化。h23-7是指ab3-7。67.图46a-图46n示出cldn6adc的体外抗癌活性。图46a-图46g示出包含ab-3-7的不同cldn6adc对癌细胞的二维(2d)抗增殖作用：mc-vc-pab-mmae(常规)(图46a)；mc-vc-pab-mmae(d4技术)(图46b)；mc-ggfg-mmae(d4技术)(图46c)；cl2a-sn38(常规)(图46d)；cl2a-sn38(d4技术)(图46e)；mc-ggfg-dxd(图46f)；和mc-vc-pab-dxd(图46g)。图46h-图46n示出cldn6adc-11(与vc-pab-mmae缀合的ab1-11)对不同癌细胞系的2d抗增殖作用：ark2(图46h)；ovca429(图46i)；h841(图46j)；ov90(图46k)；h1693(图46l)；m202(图46m)；和mcf7(图46n)。68.图47示出cldn6adc-11针对cldn6阳性卵巢癌细胞系(ov90)异种移植物的体内抗癌功效。69.图48a-图48b示出cldn6adc-11针对cldn6阴性黑素瘤癌细胞系(m202)异种移植物没有抗癌活性。70.图49a-图49b示出cldn6adc-23(ab3-7-vc-pab-mmae)针对癌细胞系异种移植物的体内抗癌功效。图49a示出cldn6adc-23针对cldn6阳性膀胱细胞系(umuc4)异种移植物的抗癌活性。图49b示出在用对照抗体或5mg/kgadc-23治疗后的所指示时间点收集的异种移植物组织的苏木精和伊红(h&e)染色。71.图50a-图50e示出cldn6adc-23针对卵巢癌患者来源的异种移植物(pdx)的体内抗癌功效。图50a示出通过蛋白质印迹分析筛选cldn6表达的一组卵巢pdx样品。图50b是将用荧光素酶转染的pdx卵巢癌细胞注射到免疫功能低下小鼠(nsg)的腹腔中的示意图。图50c-图50e示出用如本文所述的cldn6adc-23治疗的小鼠的存活率。72.图51a-图51c示出cldn6adc-23针对cldn6阳性卵巢癌细胞系(ov90)异种移植物的剂量依赖性抗癌功效。图51a和图51b示出在所指示剂量和时间的肿瘤大小的消退。图51c示出用cldn6adc-23给药的小鼠的体重的变化百分比。73.图52a-图52c示出在cldn6阴性黑素瘤癌细胞系(m202)异种移植物中不存在cldn6adc-23的脱靶活性。图52a和图52b示出肿瘤体积的变化。图52b中所示的肿瘤体积是在第21天获得的。图52c示出用cldn6adc-23给药的小鼠的体重的变化百分比。74.图53a-图53c示出cldn6-cd3双特异性t细胞衔接剂(bite)的纯化和验证。图53a示出bite构建体的示意图。图53b和图53c分别示出bite-23(与cd3evh和vl融合的ab3-7vl和vh)和bite-11(与cd3evh和vl融合的ab1-11vl和vh)的纯化bite蛋白。75.图54a-图54e示出cldn6-cd3双特异性蛋白与天然cldn6阳性细胞(ark2)以及经工程改造以过表达cldn6的细胞(hek293tcldn6-mgfphis20细胞)的有效结合。示出由bite-11(11-1bite和11-2bite；独立产生的bite-11批次)或bite-23(23bite)结合的细胞的流式细胞术(图54a-图54c)。示出用bite-11(图54d)或bite-23(图54e)染色的ark2细胞。76.图55a-图55b示出cldn6-cd3双特异性蛋白诱导t细胞活化。bite-11(图55a)。bite-23(图55b)。77.图56示出cldn6-cd3双特异性蛋白在与cldn6阳性细胞一起孵育后诱导t细胞簇集。bite-11(中间图；p11bite)。bite-23(右图(p23bite)。78.图57示出cldn6-cd3双特异性蛋白诱导针对癌细胞的靶特异性和剂量依赖性细胞毒性。bite-11(上图；p11-11)。bite-23(下图；p23-7)。博纳吐单抗(对照)。79.图58示出示例性cldn6-cd16a双特异性串联双抗体(tandab)的示意图，所述双抗体包含与cd16a结合vh和vl结构域融合的cldn6结合vl和vh结构域。80.图59a-图59d示出cldn6-cd16atandab与cldn6阳性细胞(ark2)但不与cldn6阴性细胞(hupt4)的有效结合。tandab-11(图59a-图59c；标记为tandab-11-his或tandab11-cd16a-his)。tandab-23(图59a、图59b和图59d；标记为tandab-23-his或tandab23-cd16a-his)。81.图60示出cldn6-cd3bite的体内抗癌活性。样品包括blincyto(对照)、afm13(非靶向cd16tandab对照)；bite-23(标记为bite#23)；bite-11(标记为bite#11)；ab3-7(标记为mab#23)；tandab-11(标记为cd16-tandab#11)；和tandab-23(标记为cd16-tandab#23)。82.图61示出cldn6-cd3bite的体内抗癌活性。样品包括igg对照、bite-23(标记为bite#23)和tandab-23(标记为cd16-tandab#23)。83.图62a-图62d示出cldn6-cd3bite的氨基酸序列和核酸序列。图62a-图62b分别示出bite-11的氨基酸序列和核酸序列。图62c-图62d分别示出bite-23的氨基酸序列和核酸序列。84.图63a-图63d示出cldn6-cd16atandab的氨基酸序列和核酸序列。图63a-图63b分别示出tandab-11的氨基酸序列和核酸序列。图63c-图63d分别示出tandab-23的氨基酸序列和核酸序列。具体实施方式85.密封蛋白家族86.紧密连接(也称为封闭连接或闭锁小带)是位于两个相邻细胞之间的脊椎动物结构，所述结构调控细胞旁通透性并维持上皮和内皮细胞片层中的细胞极性。密封蛋白(cldn)基因家族编码膜蛋白，所述膜蛋白是87.紧密连接的重要组分。cldn蛋白包含四个跨膜(tm)螺旋(tm1、tm2、tm3和tm4)和两个细胞外环(el1和el2)。相邻细胞的cldn蛋白的细胞外环彼此相互作用以密封细胞片层并调控腔与基底外侧空间之间的细胞旁转运。88.cldn蛋白在各种人疾病和病理中发挥作用。例如，已证明cldn1基因中的突变导致皮肤进行性鳞剥以及胆管梗阻。cldn16基因的突变体导致镁消耗性病症。cldn19突变导致眼部疾患，如黄斑缺损和近视，而cldn14突变可导致非综合征性隐性耳聋。cldn3和cldn4已知是肠道中产气荚膜梭菌肠毒素的表面受体，并且cldn1、cldn6和cldn9是丙型肝炎病毒(hcv)进入的共受体。几种cldn蛋白已被证明在癌症中异常表达。例如，cldn1在乳腺癌和结肠癌中下调，而cldn3和cldn4在多种癌症中高度上调。89.密封蛋白-6(cldn6)是cldn家族的成员。编码人cldn6蛋白的基因位于人16号染色体p臂上的16p13.3处，并且在黑猩猩、恒河猴、狗、牛、小鼠、大鼠、斑马鱼和青蛙中是保守的。cldn6通常在人中表达为220个氨基酸的前体蛋白；其中前21个氨基酸构成信号肽。cldn6前体蛋白的氨基酸序列可在国家生物技术信息中心(ncbi)网站以ncbi参考序列np_067018.2公开获得，并在本文中提供为seqidno:1。seqidno:1的位置143处的氨基酸是ile。在一些情况下，由于编码cldn6的dna序列中的单核苷酸多态性(snp)，位置143处的氨基酸是val。具有在位置143处的val的人cldn6的氨基酸序列在本文中提供为seqidno:178。90.抗原结合蛋白91.本文提供了结合至密封蛋白-6(cldn6)的抗原结合蛋白。本公开的抗原结合蛋白可采用本领域中已知的多种形式的抗原结合蛋白中的任一种。在各种实施方案中，本公开的抗原结合蛋白采取抗体、或抗原结合抗体片段或抗体蛋白产物的形式。92.在本公开的各种实施方案中，抗原结合蛋白包含抗体、基本上由抗体组成或由抗体组成。如本文所用，术语“抗体”是指具有常规免疫球蛋白形式、包含重链和轻链并且包含可变区和恒定区的蛋白质。例如，抗体可以是igg，所述igg是两对相同的多肽链的“y形”结构，每一对具有一条“轻”链(通常具有约25kda的分子量)和一条“重”链(通常具有约50-70kda的分子量)。抗体具有可变区和恒定区。在igg形式中，可变区通常是约100-110个或更多个氨基酸，包含三个互补决定区(cdr)，主要负责抗原识别，并且在结合至不同抗原的其他抗体之间显著不同。恒定区允许抗体募集免疫系统的细胞和分子。可变区由每条轻链和重链的n端区域组成，而恒定区由每条重链和轻链的c端部分组成。(janeway等人,“structureoftheantibodymoleculeandtheimmunoglobulingenes”,immunobiology:theimmunesysteminhealthanddisease,第4版elsevierscienceltd./garlandpublishing,(1999))。93.本领域中已经描述了抗体的cdr的一般结构和性质。简言之，在抗体支架中，cdr包埋在重链和轻链可变区中的框架内，其中它们构成主要负责抗原结合和识别的区域。可变区通常包含在框架区(称为框架区1-4，即fr1、fr2、fr3和fr4，根据kabat等人,1991；还参见chothia和lesk,1987,同上)内的至少三个重链或轻链cdr(kabat等人,1991,sequencesofproteinsofimmunologicalinterest,publichealthservicen.i.h.,bethesda,md；还参见chothia和lesk,1987,j.mol.biol.196:901-917；chothia等人,1989,nature342:877-883)。94.抗体可包含本领域中已知的任何恒定区。人轻链被分类为κ轻链和λ轻链。重链被分类为μ、δ、γ、α或ε，并且将抗体的同种型分别定义为igm、igd、igg、iga和ige。igg具有若干亚类，包括但不限于igg1、igg2、igg3和igg4。igm具有亚类，包括但不限于igm1和igm2。本公开的实施方案包括抗体的所有此类类别或同种型。轻链恒定区可以是例如κ或λ型轻链恒定区，例如人κ或λ型轻链恒定区。重链恒定区可以是例如α、δ、ε、γ或μ型重链恒定区，例如人α、δ、ε、γ或μ型重链恒定区。因此，在各种实施方案中，抗体是同种型iga、igd、ige、igg或igm的抗体，包括igg1、igg2、igg3或igg4中的任一者。在各个方面，抗体包含相对于天然存在的对应物包含一个或多个氨基酸修饰的恒定区，以提高半衰期/稳定性或使抗体更适合于表达/制造。在各种情况下，抗体包含恒定区，其中天然存在的对应物中存在的c端lys残基被除去或修剪。95.抗体可以是单克隆抗体。在一些实施方案中，抗体包含与由哺乳动物例如小鼠、兔、山羊、马、鸡、仓鼠、人等产生的天然存在的抗体基本上相似的序列。在此方面，抗体可被认为是哺乳动物抗体，例如小鼠抗体、兔抗体、山羊抗体、马抗体、鸡抗体、仓鼠抗体、人抗体等。在某些方面，抗原结合蛋白是抗体，如人抗体。在某些方面，抗原结合蛋白是嵌合抗体或人源化抗体。术语“嵌合抗体”是指含有来自两种或更多种不同抗体的结构域的抗体。例如，嵌合抗体可含有来自一种物种的恒定结构域和来自第二物种的可变结构域，或者更一般地说，可含有来自至少两种物种的氨基酸序列链段。嵌合抗体还可含有同一物种内的两种或更多种不同抗体的结构域。当关于抗体使用时，术语“人源化”是指至少具有来自非人来源的cdr区的抗体，所述抗体被工程改造为具有与原始来源抗体相比更类似于真正人抗体的结构和免疫学功能。例如，人源化可涉及将来自非人抗体如小鼠抗体的cdr移植到人抗体中。人源化还可涉及选择氨基酸取代以使非人序列与人序列更相似。信息，包括人抗体重链和轻链恒定区的序列信息，可通过uniprot数据库以及抗体工程改造和生产领域中的技术人员众所周知的其他数据库公开获得。例如，igg2恒定区可从uniprot数据库以uniprot编号p01859获得，其以引用的方式并入本文。96.抗体可通过酶(例如木瓜蛋白酶和胃蛋白酶)裂解成片段。木瓜蛋白酶裂解抗体以产生两个fab片段和单个fc片段。胃蛋白酶裂解抗体以产生f(ab’)2片段和pfc’片段。在本公开的各个方面，本公开的抗原结合蛋白是抗体的抗原结合片段(也称为抗原结合抗体片段、抗原结合片段、抗原结合部分)。在各种情况下，抗原结合抗体片段是fab片段或f(ab’)2片段。97.抗体的结构已被用来创造越来越多的替代抗体形式，所述替代抗体形式跨越至少约12-150kda的分子量范围并且化合价(n)范围从单体(n＝1)至二聚体(n＝2)、三聚体(n＝3)、四聚体(n＝4)并且可能更高；此类替代抗体形式在本文中称为“抗体蛋白产物”。抗体蛋白产物包括基于完整抗体结构的那些和模拟保留完整抗原结合能力的抗体片段(例如scfv、fab和vhh/vh)(下文论述)的那些。保留其完整抗原结合位点的最小抗原结合片段是fv片段，其完全由可变(v)区组成。使用可溶性、柔性氨基酸肽接头将v区连接至scfv(单链可变片段)片段以稳定分子，或将恒定(c)结构域添加至v区以产生fab片段[抗原结合片段]。scfv和fab片段两者均可在宿主细胞(例如原核宿主细胞)中容易地产生。其他抗体蛋白产物包括二硫键稳定的scfv(ds-scfv)、单链fab(scfab)以及二聚体和多聚体抗体形式，如二、三和四抗体，或包含由连接至寡聚化结构域的scfv组成的不同形式的微型抗体(miniab)。最小的片段是骆驼重链抗体的vhh/vh以及单结构域抗体(sdab)。最常用于创建新型抗体形式的结构单元(buildingblock)是单链可变(v)结构域抗体片段(scfv)，其包含通过约15个氨基酸残基的肽接头连接的来自重链和轻链的v结构域(vh和vl结构域)。肽体或肽-fc融合物是另一种抗体蛋白产物。肽体的结构由移植到fc结构域上的生物活性肽组成。肽体在本领域中有详细描述。参见，例如，shimamoto等人,mabs4(5):586-591(2012)。[0098]其他抗体蛋白产物包括单链抗体(sca)；双抗体；三抗体；四抗体；双特异性或三特异性抗体等。双特异性抗体可分为五个主要类别：bsigg、附加igg、双特异性抗体(bsab)片段、双特异性融合蛋白和bsab缀合物。参见例如，spiess等人,molecularimmunology67(2)部分a:97-106(2015)。[0099]在各个方面，本公开的抗原结合蛋白包含这些抗体蛋白产物中的任一种、基本上由其组成或由其组成。在各个方面，本公开的抗原结合蛋白包含以下中的任一者、基本上由以下中的任一者组成或由以下中的任一者组成：scfv、fabvhh/vh、fv片段、ds-scfv、scfab、二聚抗体、多聚抗体(例如，双抗体、三抗体、四抗体)、miniab、骆驼科动物重链抗体的肽体vhh/vh、sdab、双抗体、三抗体、四抗体、双特异性或三特异性抗体、bsigg、附加的igg、bsab片段、双特异性融合蛋白和bsab缀合物。[0100]在各种情况下，本公开的抗原结合蛋白是单体形式、或聚合、寡聚体或多聚体形式的抗体蛋白产物。在抗体包含两个或更多个不同抗原结合区片段的某些实施方案中，所述抗体被认为是双特异性、三特异性或多特异性的，或二价、三价或多价的，这取决于由抗体识别和结合的不同表位的数目。[0101]在各种实施方案中，抗cldn6抗体或其抗体变体选自由以下组成的组：人抗体、人源化抗体、嵌合抗体、单克隆抗体、重组抗体、抗原结合抗体片段、单链抗体、单体抗体、双抗体、三抗体、四抗体、fab片段、igg1抗体、igg2抗体、igg3抗体和igg4抗体。[0102]在各个方面，本公开的抗原结合蛋白连接至治疗剂。如下文所述，治疗剂可以是本领域中已知的任何治疗剂，包括但不限于化学治疗剂、细胞因子和生长因子、细胞毒性剂等。参见下文的“缀合物”。[0103]双特异性形式[0104]在示例性方面，抗原结合蛋白是双特异性的，并且因此能够结合两种不同且独特的抗原。在示例性实施方案中，抗原结合蛋白是双特异性的并且结合至cldn6和第二抗原。[0105]在示例性情况下，第二抗原是由t细胞表达的细胞表面蛋白。在示例性方面，细胞表面蛋白是t细胞受体(tcr)的组分，例如cd3。在示例性情况下，第二抗原是辅助t细胞活化的共刺激分子，例如cd40或4-1bb(cd137)。在示例性方面，第二抗原是fc受体。在各个方面，fc受体是fcγ受体、fc-α受体、fc-ε受体。在示例性方面，fc受体是cd64(fc-γri)、cd32(fc-γriia)、cd16a(fc-γriiia)、cd16b(fc-γriiib)、fcεri、cd23(fc-εrii)、cd89(fc-εri)、fcα/μr或fcrn。在示例性方面，fc受体是cd16a。在示例性情况下，第二抗原是免疫检查点分子，例如参与免疫检查点途径的蛋白质。免疫检查点途径和在其中起作用的分子或蛋白质是本领域已知的。参见，例如pardoll,natrevgenet12(4):252-264(2012)。在示例性情况下，免疫检查点分子是a2ar、b7-h3、b7-h4、btla、ctla4、ido、kir、lag3、nox2、pd-1、tim3、vista或siglec7。任选地，免疫检查点分子是pd-1、lag3、tim3或ctla4。[0106]本领域中已知超过五十种形式的双特异性抗原结合蛋白，其中一些描述于kontermann和brinkmann,drugdiscoverytoday20(7):838-847(2015)；zhang等人,exphematoloncol6:12(2017)；spiess等人,molimmunol.；67(2pta):95-106(2015)中。在示例性方面，本公开的双特异性抗原结合蛋白是通过化学工程改造、遗传工程改造或四源杂交瘤(quadroma)技术制备的。[0107]在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白是用抗体的一些或全部恒定结构域构建的。在示例性方面，本公开的双特异性抗原结合蛋白包含fc多肽并保留fc介导的效应功能。在各种情况下，双特异性抗原结合蛋白是例如通过两个单克隆抗体(mab)的化学交联或通过杵和臼技术形成的双特异性单克隆抗体。在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白是通过“杵入臼(knobs-into-holes)”技术制备的，其中通过将不同的突变引入两个ch3结构域、从而产生不对称抗体来强制h链异二聚化。在一个hc中进行“杵”突变，并且在另一个hc中创建“臼”突变以促进异二聚化。在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白是通过四源杂交瘤技术产生的双特异性抗体，所述四源杂交瘤技术是基于两种不同杂交瘤细胞的体细胞融合，从而产生具有所需特异性的单克隆抗体。zhang等人,2017,同上。在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白是crossmab、邻-fabigg、dvd-ig、二合一igg、igg-scfv和scfv2-fc(kontermann和brinkmann，2015，同上。在各个方面，双特异性抗原结合蛋白是ig-scfv融合物，其中将新的抗原结合部分添加至全长igg中，从而产生对两种不同抗原具有四价的融合蛋白，例如，iggc端scfv融合物和iggn端scfv融合物。在示例性情况下，双特异性抗原结合蛋白是双重可变结构域-igg(dvd-igg)，其中对一种抗原具有特异性的igg的lc和hc可变区通过接头与对第二抗原具有特异性的igg的n端lc和hc可变区融合以形成dvd-igg。在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白是双抗体-fc融合物，其涉及用双特异性双抗体替代igg的fab片段。[0108]在替代情况下，本公开的双特异性抗原结合蛋白不包含fc多肽。在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白包含每种亲本单克隆抗体的可变结构域，并且接头被克隆和连接以形成单链双特异性抗体。在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白是串联scfv、双抗体形式、单链双抗体、串联双抗体(tandab)、双亲和力重靶向分子(dart)、对接锁定(dnl)和纳米抗体(fan等人,jhematoloncol.2015；8:130)。在各个方面，双特异性抗原结合蛋白是双特异性f(mab1)2、scfv、双特异性双抗体(bsdb)、单链双特异性双抗体(scbsdb)、单链双特异性串联可变结构域(scbstafv)、对接锁定三价fab(dnl-(fab)3)、单结构域抗体(sdab)或双特异性单结构域抗体(bssdab)。示例性方面，双特异性抗原结合蛋白是串联scfv，其包含通过额外的肽接头如甘氨酸-丝氨酸重复基序连接的两个scfv片段。任选地，串联scfv包含以下结构：vla-接头1–vha-接头2–vhb-接头3–vlb(vl和vh源自单链抗体片段；a和b代表亲本单克隆抗体a和b)。在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白是tandab，其包含连接在单个多肽链中的两对vl和vh结构域(reusch等人,mabs.2015；7(3):584-604)。两种多肽产物以头接尾的方式二聚化，从而在表达时形成具有大分子量(约105kda)的同二聚体。在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白是使用描述于pnas108(27):11187-92(2011)中的crossmab技术产生的双特异性抗原结合蛋白。crossmab没有任何化学接头或连接件，并且是通过在双特异性异二聚体igg抗体中强制执行正确轻链缔合的方法产生的。在示例性方面，crossmab是双(1 1)、三(2 1)和四(2 2)价双特异性crossmab，或者是基于非fc串联抗原结合片段(fab)的crossmab。在示例性情况下，crossmab是crossmabfab、crossmabvh-vl或crossmabch1-cl。[0109]在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白包括单结构域抗体或包含单一单体可变抗体结构域的纳米抗体。任选地，可变结构域是基于重链可变结构域。在替代方面，可变结构域是基于轻链可变结构域。[0110]在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白是双特异性t细胞衔接剂或bite是二价小分子，其仅包含通过柔性肽接头连接的scfv形式的抗体的可变区。在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白包含scfv，所述scfv包含当前公开的cldn6抗体的lc和hc可变区以及对第二抗原具有特异性的二抗的lc和hc可变区。在一些实施方案中，bite包含对cd3具有特异性的二抗的lc和hc可变区。在一些实施方案中，cd3是cd3e。[0111]在示例性情况下，双特异性抗原结合蛋白是双重亲和力重靶向(dart)，其与不同，dart的两条链之间的共价键联限制抗原结合位点的自由。因此，dart是结构紧凑的，并且可在靶细胞与效应细胞之间形成稳定的接触。dart包含两个工程改造的fv片段，所述fv片段自身的vh与另一个的vh交换。相互交换的fv结构域有利地通过短连接肽从构象约束中释放变体片段。[0112]在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白是包含与经修饰的hsa融合的两个scfv的hsabody。hsabody描述于mcdonagh等人,molcancerther.2012；11(3):582–93中。[0113]因此，在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白包含任何当前公开的cldn6抗体的抗原结合片段。在示例性方面，抗原结合片段是fab。在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白包含任何当前公开的cldn6抗体的f(ab)2’。在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白包含scfv，所述scfv包含任何当前公开的cldn6抗体的lc和hc可变区。在示例性方面，scfv包含seqidno:514或515的氨基酸序列。在各个方面，抗原结合片段基于重链可变区，并且在其他方面，抗原结合片段基于轻链可变区。在示例性方面，抗原结合片段包含hc可变区和lc可变区两者的至少一部分。在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白包含当前公开的cldn6抗体的lc或hc可变区中的至少一者(如果不是两者)和对第二抗原具有特异性的二抗的lc和hc可变区中的至少一者(如果不是两者)。在示例性情况下，双特异性抗原结合蛋白包含scfv，所述scfv包含当前公开的cldn6抗体的lc和hc可变区以及对第二抗原具有特异性的二抗的lc和hc可变区。[0114]cldn6和表位[0115]本公开的抗原结合蛋白结合至cldn6。在各个方面，cldn6是具有以下氨基酸序列的人cldn6：[0116]masagmqilgvvltllgwvnglvscalpmwkvtafignsivvaqvvweglwmscvvqstgqmqckvydsllalpqdlqaaralcviallvalfgllvylagakcttcveekdskarlvltsgivfvisgvltlipvcwtahaxirdfynplvaeaqkrelgaslylgwaasgllllgggllcctcpsggsqgpshymarystsapaisrgpseyptknyv，其中x是ile或val(seqidno:202)。[0117]在各个方面，人cldn6包含seqidno:1、178和200-202中任一个的氨基酸序列。[0118]在各个方面，本公开的抗原结合蛋白结合至cldn6的氨基酸序列内的表位。在各个方面，cldn6是人cldn6，并且本公开的抗原结合蛋白结合至人cldn6的氨基酸序列例如seqidno:1、178和200-202内的表位。“表位”是指由抗原结合蛋白结合的cldn6的区域或cldn6内的区域。在一些实施方案中，表位是线性表位。“线性表位”是指由抗原结合蛋白结合的cldn6的区域或cldn6内的区域，并且所述区域由cldn6的氨基酸序列的连续氨基酸组成。线性表位的氨基酸在cldn6的一级结构中彼此相邻。因此，线性表位是抗原(即cldn6)的氨基酸序列的片段或部分。在其他各种实施方案中，表位是构象或结构表位。“构象表位”或“结构表位”是指由仅当cldn6处于其正确折叠状态时彼此紧邻定位的氨基酸组成的表位。与线性表位不同，构象或结构表位的氨基酸在cldn6的一级结构(即氨基酸序列)中彼此不相邻。构象或结构表位不是由抗原(cldn6)的氨基酸序列的连续氨基酸组成。[0119]在各个方面，表位位于cldn6(例如人cldn6)的细胞外结构域(ecd)内。在各个方面，抗原结合蛋白结合至具有氨基酸序列wtahaiirdfynplvaeaqkrel(seqidno:2)的cldn6的ecd的细胞外环2(el2)。在各个方面，抗原结合蛋白所结合的表位位于seqidno:2内。在各个方面，本公开的抗原结合蛋白结合至seqidno:2的n端部分，例如tahaiirdfynpl(seqidno:3)。在各个方面，本公开的抗原结合蛋白结合至seqidno:2的c端部分，例如lvaeaqkrel(seqidno:4)。在各种情况下，本公开的抗原结合蛋白结合至el2，但不结合至cldn6的细胞外环1(el1)。在各个方面，本公开的抗原结合蛋白所结合的表位不同于包含含有seqidno:185的轻链可变区和含有seqidno:186的序列的重链可变区的抗cldn6抗体所结合的表位。在各个方面，本公开的抗原结合蛋白所结合的表位不同于包含含有seqidno:181的轻链可变区和含有seqidno:182的序列的重链可变区的抗cldn6抗体所结合的表位。[0120]在各个方面，抗原结合蛋白结合至人cldn6和非人cldn6。在各种情况下，非人cldn6是黑猩猩、恒河猴、狗、牛、小鼠、大鼠、斑马鱼或青蛙的cldn6。在各种情况下，抗原结合蛋白结合至人cldn6和小鼠cldn6。[0121]亲和力和亲合力[0122]本文提供的抗原结合蛋白以非共价和可逆方式结合至cldn6。在各种实施方案中，抗原结合蛋白与cldn6的结合强度可就其亲和力(抗原结合蛋白的结合位点与表位之间相互作用的强度的量度)而言进行描述。在各个方面，本文提供的抗原结合蛋白对cldn6具有高亲和力，并且因此与低亲和力抗原结合蛋白相比将在更短的时间段内结合更大量的cldn6。在各个方面，抗原结合蛋白具有平衡缔合常数ka，其为至少105mol-1、至少106mol-1、至少107mol-1、至少108mol-1、至少109mol-1或至少1010mol-1或至少1010mol-1、至少1010mol-1。正如普通技术人员所理解的，ka可受到包括ph、温度和缓冲液组成的因素的影响。[0123]在各种实施方案中，抗原结合蛋白与cldn6的结合强度可就其灵敏度而言进行描述。kd是平衡解离常数，即抗原结合蛋白与cldn6之间的koff/kon的比率。kd和ka呈负相关。kd值与抗原结合蛋白的浓度(特定实验所需的抗原结合蛋白的量)有关，并且因此kd值越低(浓度越低)，抗原结合蛋白的亲和力越高。在各个方面，抗原结合蛋白与cldn6的结合强度可就kd而言进行描述。在各个方面，本文提供的抗原结合蛋白的kd是约10-1、约10-2、约10-3、约10-4、约10-5、约10-6或更小。在各个方面，本文提供的抗原结合蛋白的kd是微摩尔、纳摩尔、皮摩尔或飞摩尔。在各个方面，本文提供的抗原结合蛋白的kd在约10-4至10-6、或10-7至10-9、或10-10至10-12或10-13至10-15的范围内。在各个方面，本文提供的抗原结合蛋白的kd在约1.0x10-12m至约1.0x10-8m的范围内。在各个方面，抗原结合蛋白的kd在约1.0x10-11m至约1.0x10-9m的范围内。[0124]在各个方面，使用基于流式细胞术或荧光活化细胞分选(facs)的测定来对抗原结合蛋白的亲和力进行测量或排名。基于流式细胞术的结合测定是本领域已知的。参见例如，cedeno-arias等人,scipharm79(3):569-581(2011)；rathanaswami等人,analyticalbiochem373:52-60(2008)；以及geuijen等人,jimmunolmethods302(1-2):68-77(2005)。在各个方面，使用trikha等人,intjcancer110:326-335(2004)和tam等人,circulation98(11):1085-1091(1998)以及下文中描述的竞争测定来对抗原结合蛋白的亲和力进行测量或排名。参见下文标题为“竞争测定”的章节。在trikh等人中，将表达抗原的细胞用于放射测定中。用悬浮液中的细胞测量125i标记的抗原结合蛋白(例如抗体)与细胞表面抗原的结合。在各个方面，将cldn6抗体的相对亲和力是通过基于facs的测定来测定，其中将不同浓度的与荧光团缀合的cldn6抗体与表达cldn6的细胞一起孵育，并且测定发出的荧光(其是抗体-抗原结合的直接量度)。绘制每个剂量或浓度的荧光的曲线。最大值是荧光稳定或达到最大值时的最低浓度，即发生结合饱和时。最大值的一半被认为是ec50或ic50，并且具有最低ec50/ic50的抗体被认为相对于以相同方式测试的其他抗体具有最高亲和力。这种测定在本文实施例5中描述。[0125]在各个方面，在竞争性结合抑制测定中确定的ic50值近似于抗原结合蛋白的kd。在各种情况下，如下文所论述，竞争测定是使用参考抗体、荧光团缀合的二抗和表达cldn6的细胞进行的基于facs的测定。在各个方面，将细胞进行遗传工程改造以过表达cldn6。在一些方面，细胞是用病毒载体转导以表达cldn6的hek293t细胞。在替代方面，细胞内源性地表达cldn6。在进行基于facs的测定之前，在一些方面，内源性地表达cldn6的细胞被预先确定为低cldn6表达细胞或高cldn6表达细胞。在一些方面，细胞是癌细胞或肿瘤细胞。在各个方面，细胞是来自细胞系，例如卵巢细胞系、子宫内膜细胞系、膀胱细胞系、肺细胞系、胃肠(gi)细胞系、肝细胞系、肺细胞系等的细胞。在各个方面，内源性地表达cldn6的细胞选自由以下组成的组：ovca429卵巢细胞、ark2子宫内膜细胞、oaw28卵巢细胞、umuc-4膀胱细胞、peo14卵巢细胞、ov177卵巢细胞、h1693肺细胞、mkn7上消化道细胞、ov-90卵巢细胞、huh-7肝细胞、jhos-4卵巢细胞、h1435肺细胞和nugc3上消化道细胞。在各个方面，抗原结合蛋白抑制由细胞表达的人cldn6与参考抗体之间的结合相互作用，所述参考抗体已知结合至cldn6，但不是本公开的抗原结合蛋白。在各种情况下，本公开的抗原结合蛋白与参考抗体竞争结合至人cldn6，并且由此降低结合至参考抗体的人cldn6的量，如通过体外竞争性结合测定所确定的。在各个方面，本公开的抗原结合蛋白抑制人cldn6与参考抗体之间的结合相互作用，并且所述抑制通过ic50来表征。在各个方面，对于抑制人cldn6与参考抗体之间的结合相互作用，抗原结合蛋白表现出小于约2500nm的ic50。在各个方面，抗原结合蛋白表现出小于约2000nm、小于约1500nm、小于约1000nm、小于约900nm、小于约800nm、小于约700nm、小于约600nm、小于约500nm、小于约400nm、小于约300nm、小于约200nm或小于约100nm的ic50。在各个方面，抗原结合蛋白表现出小于约90nm、小于约80nm、小于约70nm、小于约60nm、小于约50nm、小于约40nm、小于约30nm、小于约20nm或小于约10nm的ic50。在各种情况下，本公开的抗原结合蛋白与已知结合至cldn6的参考抗体(所述参考抗体不同于本公开的任何抗原结合蛋白)竞争结合至cldn6。参见竞争测定下的进一步说明。[0126]亲合力给出抗体-抗原复合物的总体强度的量度。它取决于三个主要参数：抗原结合蛋白对表位的亲和力、抗原结合蛋白和cldn6两者的效价以及相互作用的部分的结构排列。抗原结合蛋白的效价(抗原结合位点的数量)越大，它可结合的抗原(cldn6)的量就越大。在各个方面，抗原结合蛋白对cldn6具有强亲合力。在各个方面，抗原结合蛋白是多价的。在各个方面，抗原结合蛋白是二价的。在各种情况下，抗原抗原结合蛋白是单价的。[0127]交叉反应性[0128]在各种实施方案中，本公开的抗原结合蛋白结合至cldn6并且不结合至cldn家族的任何其他成员，例如不与cldn家族的任何其他成员交叉反应。在各种情况下，本公开的抗原结合蛋白是cldn-6特异性的。在各种实施方案中，本公开的抗原结合蛋白对cldn6的选择性是所述抗原结合蛋白对cldn3、cldn4、cldn9或其组合的选择性的至少10倍、5倍、4倍、3倍、2倍。在各种实施方案中，本公开的抗原结合蛋白对cldn6的选择性是所述抗原结合蛋白对cldn3、cldn4和cldn9中的每一者的选择性的至少10倍、5倍、4倍、3倍、2倍。选择性可以基于抗原结合蛋白对cldn6或cldn家族成员所表现出的kd，其中kd可通过本领域已知的技术(例如表面等离子体共振、基于facs的亲和力测定)确定。[0129]在各个方面，本公开的抗原结合蛋白结合至cldn6并且不结合至密封蛋白3(cldn3)、密封蛋白4(cldn4)和密封蛋白9(cldn9)中的任一者。在各个方面，抗原结合蛋白不结合至cldn3、cldn4和cldn9中的任一者，并且在使用内源性地表达cldn6的ovca429细胞的基于facs的测定中表现出小于约1200nm(例如，小于约1000nm、小于约750nm、小于约500nm、小于约250nm)的ic50。在各个方面，抗原结合蛋白不结合至cldn3、cldn4和cldn9中的任一者，并且使用内源性地表达cldn6的ovca429细胞达到50％结合饱和度时的浓度小于约1200nm(例如，小于约1000nm、小于约750nm、小于约500nm、小于约250nm)。在各个方面，抗原结合蛋白对cldn6的选择性是对cldn3、cldn4和cldn9的选择性的至少5倍，并且使用内源性地表达cldn6的ovca429细胞达到50％结合饱和度时的浓度小于约1200nm(例如，小于约1000nm、小于约750nm、小于约500nm、小于约250nm)。在各个方面，抗原结合蛋白对cldn6人工和内源性模型表现出小于约1200nm(例如，小于约1000nm、小于约750nm、小于约500nm、小于约250nm)的ic50，并且表现出cldn6ic50与cldn3、cldn4和/或cldn9分离的大于约5倍比率。在各种情况下，抗原结合蛋白对cldn6表现出小于约1200nm(例如，小于约1000nm、小于约750nm、小于约500nm、小于约250nm)的ic50并且对cldn3、cldn4和cldn9中的任一者表现出是所述ic50的至少5倍的ic50。[0130]在各种实施方案中，本公开的抗原结合蛋白结合至cldn6并且与cldn家族的至少一个其他成员交叉反应(例如结合)。在各个方面，本公开的抗原结合蛋白结合至cldn6以及cldn3、cldn4和cldn9中的一者或多者。在各个方面，本公开的抗原结合蛋白结合至cldn6和cldn4或cldn9，但不结合至cldn3。在各种情况下，本公开的抗原结合蛋白结合至cldn6和cldn4，但既不结合至cldn3也不结合至cldn9。在各种情况下，本公开的抗原结合蛋白结合至cldn6和cldn9，但不结合至cldn3或cldn4。[0131]竞争测定[0132]在各种实施方案中，抗原结合蛋白抑制人cldn6与参考抗体之间的结合相互作用，所述参考抗体已知结合至cldn6，但不是本公开的抗原结合蛋白。在各种情况下，本公开的抗原结合蛋白与参考抗体竞争结合至人cldn6，并且由此降低结合至参考抗体的人cldn6的量，如通过体外竞争性结合测定所确定的。在各种实施方案中，参考抗体结合至人cldn6的细胞外结构域的氨基酸序列内(任选地，el2或el1内)的表位。在各个方面，参考抗体包含由seqidno:179编码的轻链可变序列和由seqidno:180编码的重链可变序列。在各个方面，参考抗体包含seqidno:181的轻链可变序列和seqidno:182的重链可变序列。在各个方面，本公开的抗原结合蛋白抑制人cldn6与参考抗体之间的结合相互作用，并且所述抑制通过ic50来表征。在各个方面，对于抑制人cldn6与参考抗体之间的结合相互作用，抗原结合蛋白表现出小于约2500nm的ic50。在各个方面，抗原结合蛋白表现出小于约2000nm、小于约1500nm、小于约1000nm、小于约900nm、小于约800nm、小于约700nm、小于约600nm、小于约500nm、小于约400nm、小于约300nm、小于约200nm或小于约100nm的ic50。在各个方面，抗原结合蛋白表现出小于约90nm、小于约80nm、小于约70nm、小于约60nm、小于约50nm、小于约40nm、小于约30nm、小于约20nm或小于约10nm的ic50。[0133]在各种情况下，本公开的抗原结合蛋白与参考抗体竞争结合至人cldn6，并且由此降低结合至参考抗体的人cldn6的量，如通过体外竞争性结合测定所确定的。在各个方面，体外竞争性结合测定是基于facs的测定，其中在不存在或存在特定量的本公开的抗原结合蛋白的情况下测量结合至参考抗体的fc的荧光团缀合的二抗的荧光。这种基于facs的测定在本文的实施例中进行了描述。在各个方面，使用参考抗体、荧光团缀合的二抗和表达cldn6的细胞进行基于facs的测定。在各个方面，将细胞进行遗传工程改造以过表达cldn6。在一些方面，细胞是用病毒载体转导以表达cldn6的hek293t细胞。在替代方面，细胞内源性地表达cldn6。在进行基于facs的测定之前，在一些方面，内源性地表达cldn6的细胞被预先确定为低cldn6表达细胞或高cldn6表达细胞。在一些方面，细胞是癌细胞或肿瘤细胞。在各个方面，细胞是来自细胞系，例如卵巢细胞系、子宫内膜细胞系、膀胱细胞系、肺细胞系、胃肠(gi)细胞系、肝细胞系、肺细胞系等的细胞。在各个方面，内源性地表达cldn6的细胞选自由以下组成的组：ovca429卵巢细胞、ark2子宫内膜细胞、oaw28卵巢细胞、umuc-4膀胱细胞、peo14卵巢细胞、ov177卵巢细胞、h1693肺细胞、mkn7上消化道细胞、ov-90卵巢细胞、huh-7肝细胞、jhos-4卵巢细胞、h1435肺细胞和nugc3上消化道细胞。在各种情况下，本公开的抗原结合蛋白以高亲和力结合至由ark2细胞、ovca429细胞、ls513细胞或mcf7细胞中的一者或多者内源性地表达的cldn6。在各个方面，如使用ark2细胞、ovca429细胞、ls513细胞或mcf7细胞中的一者或多者在基于facs的竞争性结合抑制测定中所确定的，抗原结合蛋白表现出小于约3000nm的ic50。在各个方面，如使用ark2细胞、ovca429细胞、ls513细胞或mcf7细胞中的一者或多者在基于facs的竞争性结合抑制测定中所确定的，抗原结合蛋白表现出小于约2500nm、小于约2000nm、小于约1750nm、小于约1500nm、小于约1250nm、小于约1000nm、小于约750nm或小于约500nm的ic50。在各个方面，如使用ark2细胞、ovca429细胞、ls513细胞或mcf7细胞中的一者或多者在基于facs的竞争性结合抑制测定中所确定的，抗原结合蛋白表现出小于约400nm、小于约300nm、小于约200nm、小于约100nm、小于约75nm、小于约50nm、小于约25nm或小于约10nm的ic50。[0134]其他结合测定，例如竞争性结合测定或竞争测定是本领域中已知的，所述测定测试抗体与二抗竞争结合至抗原或其表位的能力。参见例如，trikha等人,intjcancer110:326-335(2004)；tam等人,circulation98(11):1085-1091(1998)。美国专利申请公布第us20140178905号；chand等人,biologicals46:168-171(2017)；liu等人,analbiochem525:89-91(2017)；和goolia等人,jvetdiagninvest29(2):250-253(2017)。此外，比较两种抗体的其他方法是本领域中已知的，并且包括例如表面等离子体共振(spr)。spr可用于确定抗体和二抗的结合常数，并且可比较两个结合常数。[0135]抗体产生方法及相关方法[0136]制备抗原结合蛋白(例如，抗体、抗原结合抗体片段和抗体蛋白产物)的合适方法是本领域中已知的。例如，用于产生抗体的标准杂交瘤方法描述于例如harlow和lane(编辑),antibodies:alaboratorymanual,cshpress(1988)；和ca.janeway等人(编辑),immunobiology,第5版,garlandpublishing,newyork,ny(2001))。本文在实施例中提供了制备cldn6单克隆抗体或本公开的各种方法。[0137]取决于宿主物种，可使用各种佐剂来增加免疫应答，从而引起宿主产生更多的抗体。此类佐剂包括但不限于弗氏佐剂(freund’s)、矿物胶如氢氧化铝和表面活性物质如溶血卵磷脂、普朗尼克多元醇(pluronicpolyol)、聚阴离子、肽、油乳剂、匙孔血蓝蛋白和二硝基酚。bcg(卡介苗)和棒状杆菌是潜在有用的人佐剂。[0138]其他抗体产生方法总结在表1中。[0139]表1[0140][0141]测试抗体结合至cldn6的表位的能力(不管抗体是如何产生的)的方法是本领域已知的，并且包括任何抗体-抗原结合测定，例如放射免疫测定(ria)、elisa、蛋白质印迹、免疫沉淀、spr和竞争性抑制测定(参见例如，janeway等人，下文和美国专利申请公布第2002/0197266号，以及以上关于竞争测定的部分)。[0142]序列/结构[0143]本文提供了抗原结合蛋白，所述抗原结合蛋白包含(a)表a中列出的重链(hc)互补决定区(cdr)1氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:11、17、23、29、35、41、47、53、59、65、71、77、83、89、95、101、107、113、119、125和131，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列；(b)表a中列出的hccdr2氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:12、18、24、30、36、42、48、54、60、66、72、78、84、90、86、102、108、114、120、126和132，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列；(c)表a中列出的hccdr3氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:13、19、25、31、37、43、49、55、61、67、73、79、85、91、97、103、109、115、121、127和133，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列；(d)表a中列出的轻链(lc)cdr1氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:8、14、20、32、38、44、50、56、62、68、74、80、86、92、98、104、110、116、122和128，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列；(e)表a中列出的lccdr2氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:9、15、21、27、33、39、45、51、57、63、69、75、81、87、93、99、105、111、117、123和129，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列；(f)表a中列出的lccdr3氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:10、16、22、28、34、40、46、52、58、64、70、76、82、88、94、100、106、112、118、124和130，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列；或(g)(a)-(f)中的任何两者或更多者的组合。[0144]表a[0145][0146][0147]在各个方面，抗原结合蛋白包含表a中列出的lccdr1氨基酸序列、lccdr2氨基酸序列和lccdr3氨基酸序列以及表a中列出的hccdr氨基酸序列中的至少1或2个。在各个方面，抗原结合蛋白包含表a中列出的hccdr1氨基酸序列、hccdr2氨基酸序列和hccdr3氨基酸序列和表a中列出的lccdr氨基酸序列中的至少1或2个。[0148]在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含由表a的单行中seqidno:指定的氨基酸序列中的至少3、4或5个。在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含由表a的单行的seqidno:指定的lccdr氨基酸序列中的每一个和由表a的单行中的seqidno:指定的hccdr氨基酸序列的至少1或2个。在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含由表a的单行的seqidno:指定的hccdr氨基酸序列中的每一个和由表a的单行的seqidno:指定的lccdr氨基酸序列中的至少1或2个。在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含由表a的单行的seqidno:指定的所有6个cdr氨基酸序列。在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含选自由以下组成的组的六个cdr氨基酸序列：(a)seqidno:74-79；(b)seqidno:50-55；(c)seqidno:122-127；(d)seqidno:26-31；(e)seqidno:128-133；(f)seqidno:38-43；(g)seqidno:62-67；(h)seqidno:80-85；(i)seqidno:44-49；(j)seqidno:86-91；(k)seqidno:104-109；(l)seqidno:56-61；(m)seqidno:32-37；(n)seqidno:110-115；(o)seqidno:98-103；(p)seqidno:92-97；(q)seqidno:116-121；(r)seqidno:8-13；(s)seqidno:68-73；(t)seqidno:14-19；以及(u)seqidno:20-25。[0149]在各种情况下，表a的氨基酸序列被至少一个或多个(例如，至少2、3、4、5、6、7、8、9、10个或更多个)间插氨基酸隔开。在各种情况下，lccdr1与lccdr2的序列之间存在约10至约20个氨基酸，并且lccdr2与lccdr3的序列之间存在约25至约40个氨基酸。在各种情况下，lccdr1与lccdr2的序列之间存在约14至约16个氨基酸，并且lccdr2与lccdr3的序列之间存在约30至约35个氨基酸。在各种情况下，hccdr1与hccdr2的序列之间存在约10至约20个氨基酸，并且hccdr2与hccdr3的序列之间存在约25至约40个氨基酸。在各种情况下，hccdr1与hccdr2的序列之间存在约14至约16个氨基酸，并且hccdr2与hccdr3的序列之间存在约30至约35个氨基酸。[0150]在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含(a)表b中列出的重链可变区氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:135、137、139、141、143、145、147、149、151、153、155、157、159、161、163、165、167、169、171、173和175,或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列；或(b)表b中列出的轻链可变区氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:134、136、138、140、142、144、146、148、150、152、154、156、158、160、162、164、166、168、170、172、174和176，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列；或(c)(a)和(b)两者。[0151]表b[0152][0153]在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含选自由以下组成的组的一对氨基酸序列：(a)seqidno:156和157；(b)seqidno:148和149；(c)seqidno:172和173；(d)seqidno:140和141；(e)seqidno:174和175；(f)seqidno:144和145；(g)seqidno:152和153；(h)seqidno:158和159；(i)seqidno:146和147；(j)seqidno:160和161；(k)seqidno:166和167；(l)seqidno:150和151；(m)seqidno:142和143；(n)seqidno:168和169；(o)seqidno:164和165；(p)seqidno:162和163；(q)seqidno:170和171；(r)seqidno:134和135；(s)seqidno:154和155；(t)seqidno:136和137；和(u)seqidno:138和139。[0154]在各个方面，抗原结合蛋白不包含由seqidno:179和180的序列编码的一对氨基酸序列。在各个方面，抗原结合蛋白不包含seqidno:181和182的一对氨基酸序列。在各个方面，抗原结合蛋白不包含由seqidno:183和184的序列编码的一对氨基酸序列。在各个方面，抗原结合蛋白不包含seqidno:185和186的一对氨基酸序列。[0155]在各个方面，抗原结合蛋白包含与上述氨基酸序列相似的氨基酸序列，但抗原结合蛋白基本上保留其生物学功能，例如其结合至人cldn6、减少肿瘤生长、治疗癌症的能力。[0156]在各个方面，抗原结合蛋白包含相对于以上提及的氨基酸序列仅相差1、2、3、4、5、6个或更多个氨基酸的氨基酸序列。在各个方面，抗原结合蛋白包含参考序列的变体序列，所述变体序列相对于参考序列仅相差一个或两个氨基酸。在各个方面，抗原结合蛋白包含发生在cdr之外的一个或多个氨基酸取代，例如，所述一个或多个氨基酸取代发生在重链或轻链的框架区内。在各个方面，抗原结合蛋白包含一个或多个氨基酸取代，但所述抗原结合蛋白保留六个cdr的氨基酸序列。在各个方面，抗原结合蛋白包含相对于以上提及的氨基酸序列仅具有1、2、3、4、5、6个或更多个保守氨基酸取代的氨基酸序列。如本文所用，术语“保守氨基酸取代”是指用具有相似性质(例如，大小、电荷、疏水性、亲水性和/或芳香性)的另一个氨基酸取代一个氨基酸，并且包括在以下五组中的一个内的交换：[0157]i.小的脂肪族、非极性或微极性残基：ala、ser、thr、pro、gly；ii.极性、带负电荷的残基及其酰胺和酯：asp、asn、glu、gln、半胱氨酸和同型半胱氨酸；iii.极性、带正电荷的残基：his、arg、lys；鸟氨酸(orn)iv.大的脂肪族非极性残基：met、leu、ile、val、cys、正亮氨酸(nle)、同型半胱氨酸v.大的芳香族残基：phe、tyr、trp、乙酰基苯丙氨酸[0158]在各个方面，保守氨基酸取代是以下氨基酸组中的一个内的交换：[0159]i.脂肪族氨基酸：gly、ala、val、leu、ile[0160]ii.包含侧链羟基的非芳香族氨基酸：sercthr[0161]iii.包含硫侧链的氨基酸：cys、met[0162]iv：包含侧链芳香环的氨基酸：phe、tyr、trp[0163]v：酸性氨基酸：glu；asp[0164]vi：碱性氨基酸：arg；lys[0165]vii：包含侧链酰胺的氨基酸：gln、asn[0166]viii：包含侧链咪唑的氨基酸：his，α-二甲基咪唑乙酸(dmia)[0167]ix：亚氨基酸：pro、4-羟基-pro、4-氨基-pro[0168]在各个方面，抗原结合蛋白包含与以上提及的氨基酸序列具有大于或约30％、大于或约50％、或大于或约70％序列同一性的氨基酸序列。在各个方面，抗原结合蛋白包含与以上提及的氨基酸序列具有至少30％、至少40％、至少50％、至少60％、至少70％、至少80％、至少85％、至少90％或具有大于90％序列同一性的氨基酸序列。在各个方面，抗原结合蛋白包含沿以上提及的氨基酸序列的全长具有至少70％、至少80％、至少85％、至少90％或具有大于90％序列同一性的氨基酸序列。在各个方面，抗原结合蛋白包含沿以上提及的氨基酸序列的全长具有至少95％、96％、97％、98％或99％序列同一性的氨基酸序列。[0169]在各个方面，抗原结合蛋白包含参考序列的变体序列，所述变体序列相对于以上提及的序列具有至少或约70％序列同一性。在各个方面，抗原结合蛋白包含参考序列的变体序列，所述变体序列相对于以上提及的序列具有至少或约80％序列同一性。在各个方面，抗原结合蛋白包含参考序列的变体序列，所述变体序列相对于以上提及的序列具有至少或约90％序列同一性。在各个方面，抗原结合蛋白包含参考序列的变体序列，所述变体序列相对于以上提及的序列具有至少或约95％序列同一性。[0170]在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含表a的单行中的seqidno中的一个、两个、三个、四个或五个序列以及与seqidno:8-133中的任一个具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的至少一个变体序列。在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含选自以下的一组序列中的一个、两个、三个、四个或五个序列：(a)seqidno:74-79；(b)seqidno:50-55；(c)seqidno:122-127；(d)seqidno:26-31；(e)seqidno:128-133；(f)seqidno:38-43；(g)seqidno:62-67；(h)seqidno:80-85；(i)seqidno:44-49；(j)seqidno:86-91；(k)seqidno:104-109；(l)seqidno:56-61；(m)seqidno:32-37；(n)seqidno:110-115；(o)seqidno:98-103；(p)seqidno:92-97；(q)seqidno:116-121；(r)seqidno:8-13；(s)seqidno:68-73；(t)seqidno:14-19；和(u)seqidno:20-25，其中所述抗原结合蛋白还包含与所述组的序列中的至少一个具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的至少一个变体序列。例如，在各个方面，抗原结合蛋白包含seqidno:74-79中的四个序列，即seqidno:74-77，其中所述抗原结合蛋白包含两个变体序列：与seqidno:78具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的一个变体序列和与seqidno:79具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的另一个变体序列。[0171]在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含与seqidno:134-175中的任一个具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的一对变体序列。在各种情况下，抗原结合蛋白包含与以下各项具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的一对变体序列：(a)seqidno:156和157；(b)seqidno:148和149；(c)seqidno:172和173；(d)seqidno:140和141；(e)seqidno:174和175；(f)seqidno:144和145；(g)seqidno:152和153；(h)seqidno:158和159；(i)seqidno:146和147；(j)seqidno:160和161；(k)seqidno:166和167；(l)seqidno:150和151；(m)seqidno:142和143；(n)seqidno:168和169；(o)seqidno:164和165；(p)seqidno:162和163；(q)seqidno:170和171；(r)seqidno:134和135；(s)seqidno:154和155；(t)seqidno:136和137；和(u)seqidno:138和139。在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含一对序列：表b的一个序列和另一个序列，所述另一个序列是与seqidno:134-175中的任一个具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列。在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含一对序列：选自以下的一个序列：(a)seqidno:156和157；(b)seqidno:148和149；(c)seqidno:172和173；(d)seqidno:140和141；(e)seqidno:174和175；(f)seqidno:144和145；(g)seqidno:152和153；(h)seqidno:158和159；(i)seqidno:146和147；(j)seqidno:160和161；(k)seqidno:166和167；(l)seqidno:150和151；(m)seqidno:142和143；(n)seqidno:168和169；(o)seqidno:164和165；(p)seqidno:162和163；(q)seqidno:170和171；(r)seqidno:134和135；(s)seqidno:154和155；(t)seqidno:136和137；以及(u)seqidno:138和139；以及另一个序列，所述另一个序列是与(a)–(u)的序列具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列。例如，在各个方面，抗原结合蛋白包含seqidno:134的序列，并且所述抗原结合蛋白还包含与seqidno135具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列。[0172]在各种情况下，抗原结合蛋白包含以上提及的氨基酸序列的氨基酸序列，所述氨基酸序列具有一个或多个氨基酸取代以减少或消除反应性氨基酸来减少或防止不想要的侧链反应。例如，抗原结合蛋白包含以上提及的氨基酸序列的氨基酸序列，所述氨基酸序列具有一个或多个(i)被his、tyr或phe取代的trp残基；(ii)被gln、ser、ala或asp取代的asn残基；(iii)紧接在被ala、ser或glu取代的pro残基之前出现的asp残基；(iv)被gln、ser或ala取代的asn残基；和/或(v)被tyr、ser或ala取代的cys残基。在各个方面，抗原结合蛋白包含以上提及的氨基酸序列的氨基酸序列，所述氨基酸序列具有基于shm事件或基于大量其他相似抗体序列的统计学分析被预测为具有更大结合亲和力、更大稳定性或其他积极属性的氨基酸取代。在一些方面，抗原结合蛋白包含(a)表a1中列出的hccdr1氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:452、455、461、465、71和472，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列；(b)表a1中列出的hccdr2氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:475、456、462、466、468和473，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列；(c)表a1中列出的hccdr3氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:453、457、463、467、469和474，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列；(d)表a1中列出的lccdr1氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:449、476、458、464、68和470，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列；(e)表a1中列出的lccdr2氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:450、477、459、57、69和471，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列；(f)表a1中列出的lccdr3氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:451、454、460、58、70和112，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列，或(g)(a)-(f)中的任何两者或更多者的组合。[0173]表a1[0174][0175]在一些方面，hccdrl包含紧接seqidno:452的n端的gly，并且任选地，在一些方面，hccdrl包含紧接seq452的c端的mx，其中x是h、n或s。在各个方面，hccdr3包含紧接seqidno:453的n端的ala。在各个方面，lccdr1还包含紧接seqidno:449的n端的tas，和任选地紧接seqidno:449的c端的xh，其中x是h、s、y或q。在一些方面，如下文所述，seqidno:449的第一个氨基酸是s或q。在一些方面，如下文所述，seqidno:451的第一个氨基酸是s或q。[0176]在各个方面，hccdr1包含紧接seqidno:455的n端的gly，并且任选地，在各个方面，hccdr1包含紧接seqidno:455的c端的mx，其中x是n、s或h。在一些方面，hccdr2包含紧接seqidno:seqidno:456的n端的gln，和任选地紧接seqidno:456的c端的h。在各个方面，lccdrl包含紧接seqidno:476的n端的ris，并且任选地包含紧接seqidno:476的c端的la。在各个方面，lccdr2包含紧接seqidno:477的c端的xlve，其中x是i或s。[0177]在各个方面，hccdr1包含紧接seqidno:461的c端的mh。在各个方面，hccdr2包含紧接seqidno:462的n端的tyr，和任选地紧接seqidno:462的c端的th。在示例性方面，hccdr3不包含seqidno:463的前两个氨基酸。在各个方面，lccdrl包含紧接seqidno:458的n端的rss，和任选地紧接seqidno:458的c端的ln。在各个方面，lccdr2包含紧接seqidno:459的c端的xrfs，其中x是q、s、a或d。[0178]在各个方面，hccdr1包含紧接seqidno:465的c端的mh。在各个方面，hccdr2包含紧接seqidno:466的n端的yi，和任选地紧接seqidno:466的c端的xaa，其中xaa是n、s、q或a。在各个方面，lccdrl包含紧接seqidno:464的n端的las，和任选地紧接seqidno:464的c端的la。在各个方面，lccdr2包含紧接seqidno:57的c端的slad。[0179]在各个方面，hccdr1包含紧接seqidno:71的c端的mh。在各个方面，hccdr2包含紧接seqidno:468的n端的tyr，和任选地紧接seqidno:468的c端的iy。在各个方面，lccdrl包含紧接seqidno:68的n端的ras，和任选地紧接seq68的c端的syih。在各个方面，lccdr2包含紧接seqidno:69的c端的xles，其中x是n、q、s、a或d。[0180]在各个方面，lccdrl包含紧接seqidno:470的n端的kss，和任选地紧接seqidno:470的c端的yla。在各个方面，lccdr2包含紧接seqidno:471的c端的tres。在各个方面，hccdrl包含紧接seqidno:472的c端的mn。在各个方面，hccdr2包含紧接seq473的n端的xaa，其中xaa是n、q、s或a，和任选地紧接seq473的c端的thr。[0181]在各个方面，抗原结合蛋白包含表a1中列出的lccdr1氨基酸序列、lccdr2氨基酸序列和lccdr3氨基酸序列以及表a1中列出的hccdr氨基酸序列中的至少1或2个。在各个方面，抗原结合蛋白包含表a1中列出的hccdr1氨基酸序列、hccdr2氨基酸序列和hccdr3氨基酸序列以及表a1中列出的lccdr氨基酸序列中的至少1或2个。[0182]在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含由表a1的单行中的seqidno:指定的氨基酸序列中的至少3、4或5个。在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含由表a1的单行的seqidno:指定的lccdr氨基酸序列中的每一个以及由表a1的单行中的seqidno:指定的hccdr氨基酸序列中的至少1或2个。在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含由表a1的单行的seqidno:指定的hccdr氨基酸序列中的每一个以及由表a1的单行的seqidno:指定的lccdr氨基酸序列中的至少1或2个。在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含由表a1的单行的seqidno:指定的所有6个cdr氨基酸序列。在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含选自由以下组成的组的六个cdr氨基酸序列：(a)seqidno:449-453和475；(b)seqidno:476-477、454-457；(c)seqidno:458-463；(d)seqidno:57、58、464-467；(e)seqidno:68-71和468-469；以及(f)seqidno:112和470-474。[0183]在各种情况下，表a1的氨基酸序列被至少一个或多个(例如，至少2、3、4、5、6、7、8、9、10个或更多个)间插氨基酸隔开。在各种情况下，lccdr1与lccdr2的序列之间存在约10至约20个氨基酸，并且lccdr2与lccdr3的序列之间存在约25至约40个氨基酸。在各种情况下，lccdr1与lccdr2的序列之间存在约14至约16个氨基酸，并且lccdr2与lccdr3的序列之间存在约30至约35个氨基酸。在各种情况下，hccdr1与hccdr2的序列之间存在约10至约20个氨基酸，并且hccdr2与hccdr3的序列之间存在约25至约40个氨基酸。在各种情况下，hccdr1与hccdr2的序列之间存在约14至约16个氨基酸，并且hccdr2与hccdr3的序列之间存在约30至约35个氨基酸。[0184]各种实施方案中，抗原结合蛋白包含(a)表b1中列出的重链可变区氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:478、480、482、484、486和488，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列；或(b)表b1中列出的轻链可变区氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:479、481、483、485、487和489，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列；或(c)(a)和(b)两者。[0185]表b1[0186]hc可变lc可变ab1*478479ab3*480481ab4*482483ab9*488489ab11*486487ab18*484485[0187]在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含选自由以下组成的组的一对氨基酸序列：(a)seqidno:478和479；(b)seqidno:480和481；(c)seqidno:482和483；(d)seqidno:484和485；(e)seqidno:486和487；以及(f)seqidno:488和489。在各个方面，抗原结合蛋白包含具有表b1中列出的seqidno:的序列的变体序列，所述变体序列仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性，其中不同的氨基酸出现在下文“人源化抗体”中描述的位置处。[0188]人源化抗体[0189]在各个方面，抗原结合蛋白是表a、表a1、表b或表b1中描述的抗原结合蛋白的人源化型式。[0190]人源化ab1[0191]在各个方面，抗原结合蛋白是在重链可变区中的一个或多个以下位置处具有一个或多个(例如，2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34或35个)氨基酸取代的如表b或b1中列出的ab1的人源化型式：5、8、11、12、13、20、31、33、35、38、40、48、50、55、57、59、61、65、66、67、68、70、72、74、76、79、80、82、87、90、91、98、101和116。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:428的氨基酸序列。在各个方面，抗原结合蛋白是在重链可变区中的一个或多个(例如，1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12个)以下位置处具有一个或多个氨基酸取代的如表b或b1中列出的ab1的人源化型式：20、31、35、48、50、59、67、70、74、79、98、101。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:429的氨基酸序列。在各个方面，上述位置处的氨基酸选自根据下表的氨基酸：[0192]位置氨基酸位置氨基酸位置氨基酸5q，v8a，g11l，v12a，k13r，k20m，v31s，t，v，d33y，t35h，n，s38k，r40r，a48i，m50f，v，t，y，i55g，s57s，y59d，e，n，s61n，a65k，q66d，g67r，q，n，k68t，v70l，m72r，a74k，tꢀꢀ79v，d，s，a82q，e87t，r91s，t98n，q，h，d，r101y76st116a，s[0193]在各个方面，抗原结合蛋白是在轻链可变区中的一个或多个(例如2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40或41个)以下位置处具有一个或多个氨基酸取代的如表b或b1中列出的ab1的人源化型式：1、3、4、9、10、11、15、17、21、24、27、29、32、34、35、43、44、48、51、52、53、54、55、56、61、67、71、72、73、79、80、81、84、90、92、93、94、95、96、101、107。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:430的氨基酸序列。在各个方面，抗原结合蛋白是在轻链可变区中的一个或多个(例如，1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12或13个)以下位置处具有一个或多个氨基酸取代的如表b或b1中列出的ab1的人源化型式：4、21、32、34、48、51、53、61、67、79、84、91和93。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:431的氨基酸序列。在各个方面，上述位置处的氨基酸选自根据下表的氨基酸：[0194][0195][0196]人源化ab3[0197]在各个方面，抗原结合蛋白是在重链可变区中的一个或多个(例如，1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32或33个)以下位置处具有一个或多个氨基酸取代的如表b或b1中列出的ab3的人源化型式：3、5、18、19、23、31、33、35、40、42、49、50、52、53、54、55、56、57、58、59、61、64、76、79、80、81、87、94、95、99、106、112、114。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:432的氨基酸序列。在各个方面，抗原结合蛋白是在重链可变区中的一个或多个(例如，1、2、3、4、5、6或7个)以下位置处具有一个或多个氨基酸取代的如表b或b1中列出的ab3的人源化型式：31、35、50、55、79、99、106。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:433的氨基酸序列。在各个方面，上述位置处的氨基酸选自根据下表的氨基酸：[0198]位置氨基酸位置氨基酸位置氨基酸3k，q5e，l18m，l19k，r23v，a31n，s，r33w，a35n，s，h40s，a42e，g49a，s50q，s，n，h，aꢀꢀ52r，s53l，g54k，s55s，n，t，a，g56d，gꢀꢀꢀꢀ59a，s61h，y64e，d76d，n79r，n，q，d，s80s，t81v，l87n，s94g，a95t，v，i99n，d，t，k，a106c，y，a，s，t112t，l114i，tꢀꢀꢀꢀ[0199]在各个方面，抗原结合蛋白是在轻链可变区中的一个或多个(例如，1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28或29个)以下位置处具有一个或多个氨基酸取代的如表b或b1中列出的ab3的人源化型式：9、17、18、25、27、28、30、34、40、43、45、48、50、52、53、55、56、70、72、74、76、84、85、90、91、93、94、97和100。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:434的氨基酸序列。在各个方面，抗原结合蛋白是在轻链可变区中的一个或多个(例如，1、2、3、4、5、6、7、8或9个)以下位置处具有一个或多个氨基酸取代的如表b或b1中列出的ab3的人源化型式：25、34、48、53、55、84、85、90和93。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:435的氨基酸序列。在各个方面，上述位置处的氨基酸选自根据下表的氨基酸：[0200]位置氨基酸位置氨基酸位置氨基酸9a，s17e，d18t，r25i，v，l，t，a34a，s，n40q，p43s，a45q，k48v，i53i，v，l，t，s55v，t，l，a，q70q，d72s，t74k，t76n，s84g，a85n，q，s，t90h，q，s，t93t，s，n，g100g，q27e，q28n，s30y，s50n，a52k，s56e，s91h，s94v，t97t，pꢀꢀ[0201]人源化ab4[0202]在各个方面，抗原结合蛋白是在重链可变区中的一个或多个(例如，1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35或36个)以下位置处具有一个或多个氨基酸取代的如表b或b1中列出的ab4的人源化型式：5、11、12、13、20、29、31、33、37、38、40、45、48、50、55、56、57、59、61、62、65、66、67、68、70、72、74、76、79、82、84、87、91、97、101、117。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:436的氨基酸序列。在各个方面，抗原结合蛋白是在轻链可变区中的一个或多个(例如，1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18或19个)以下位置处具有一个或多个氨基酸取代的如表b或b1中列出的ab4的人源化型式：20、29、31、37、45、48、56、59、61、62、65、66、68、70、74、79、84、97和101。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:437的氨基酸序列。在各个方面，上述位置处的氨基酸选自根据下表的氨基酸：[0203][0204][0205]在各个方面，抗原结合蛋白是在轻链可变区中的一个或多个(例如，1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23或24个)以下位置处具有一个或多个氨基酸取代的如表b或b1中列出的ab4的人源化型式：7、14、17、18、31、33、39、41、42、44、50、51、55、57、60、81、88、92、94、95、96、99、100、105。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:438的氨基酸序列。在各个方面，抗原结合蛋白是在轻链可变区中的一个或多个(例如，1、2、3、4、5、6或7个)以下位置处具有一个或多个氨基酸取代的如表b或b1中列出的ab4的人源化型式：33、39、55、57、81、95、96。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:439的氨基酸序列。在各个方面，上述位置处的氨基酸选自根据下表的氨基酸：[0206]位置氨基酸位置氨基酸位置氨基酸7t，s14s，t17d，q18q，p31y，h33d，n，e，q39h，n，q，d41f，y42l，q44k，r50k，r51r，l55k，r，q57s，t，v60d，f81r，s，n，d88l，v92f，y94m，s95q，h，t96s，t，g，d99w，v105g，qꢀꢀ[0207]人源化ab18[0208]在各个方面，抗原结合蛋白是在重链可变区中的一个或多个(例如，1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25个)以下位置处具有一个或多个氨基酸取代的如表b或b1中列出的ab18的人源化型式：5、9、11、12、20、38、40、41、43、44、48、61、65、67、68、70、72、74、76、79、82、84、87、91和116，任选地一个或多个(例如，1、2、3、4或5个)以下位置：20、48、68、70、79。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:440或441的氨基酸序列。在各个方面，上述位置处的氨基酸选自根据下表的氨基酸：[0209][0210][0211]在各个方面，抗原结合蛋白是在轻链可变区中的一个或多个(例如，1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15或16个)以下位置处具有一个或多个氨基酸取代的如表b或b1中列出的ab18的人源化型式：1、3、9、15、18、19、21、22、49、51、69、93、84、78、105和111，任选地一个或多个(例如，1、2或3个)以下位置：19、21或84。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:442或443的氨基酸序列。在各个方面，上述位置处的氨基酸选自根据下表的氨基酸：[0212]位置氨基酸位置氨基酸位置氨基酸1n，d3m，v9s，d15a，l18k，r19v，a21m，i22s，n49s，p51r，k69t，s83n，s84v，l89l，v105a，q111l，iꢀꢀꢀꢀ[0213]人源化ab9[0214]在各个方面，抗原结合蛋白是在重链可变区中的一个或多个(例如，1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28或29个)以下位置处具有一个或多个氨基酸取代的如表b或b1中列出的ab9的人源化型式：1、5、9、11、12、20、38、40、41、43、44、48、61、63、65、67、69、70、72、73、74、76、79、84、87、91、93、112和113。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:444的氨基酸序列。在各个方面，上述位置处的氨基酸选自根据下表的氨基酸：[0215][0216][0217]在各个方面，抗原结合蛋白是在轻链可变区中的一个或多个(例如，1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14或15个)以下位置处具有一个或多个氨基酸取代的如表b或b1中列出的ab9的人源化型式：9、11、15、17、18、43、45、70、72、73、74、80、84、85和100。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:445的氨基酸序列。在各个方面，上述位置处的氨基酸选自根据下表的氨基酸：[0218]位置氨基酸位置氨基酸位置氨基酸9a，s11q，l15l，v17e，d18s，r43s，a45q，k70r，d72s，t73f，l74k，r80a，p84v，a85s，t100g，q[0219]人源化ab11[0220]在各个方面，抗原结合蛋白是在重链可变区中的一个或多个(例如，1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14或15个)以下位置处具有一个或多个氨基酸取代的如表b或b1中列出的ab11的人源化型式：1、15、18、19、42、49、63、75、76、78、80、84、88和93。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:446的氨基酸序列。在各个方面，上述位置处的氨基酸选自根据下表的氨基酸：[0221]位置氨基酸位置氨基酸位置氨基酸1d，e15r，g18r，l19k，r42e，g49a，s63t，s75p，a76t，k78t，s80f，y84t，n88s，a93m，vꢀꢀ[0222]在各个方面，抗原结合蛋白是在轻链可变区中的一个或多个(例如，1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14或15个)以下位置处具有一个或多个氨基酸取代的如表b或b1中列出的ab11的人源化型式：4、9、17、22、64、78、80、81、82、83、84、87、89、104和110，任选地一个或多个以下位置：4、82、110。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:447或448的氨基酸序列。在各个方面，上述位置处的氨基酸选自根据下表的氨基酸：[0223][0224][0225]在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含(a)表c中列出的重链可变区氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：376-379、384-387、391-396、403-408、412、413、416-419和422-427，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％、或约80％、或约85％、或约90％、或约95％序列同一性的变体序列；或(b)表c中列出的轻链可变区氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：380-383、388-390、397-402、409-411、414、415、420和421，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％、或约80％、或约85％、或约90％、或约95％序列同一性的变体序列；或(c)(a)和(b)两者。[0226]表c[0227][0228]在各种实施方案中，人源化抗原结合蛋白包含如表d中所示的一对氨基酸序列。[0229]表d[0230][0231][0232]在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含一对变体序列，所述变体序列各自与表c中列出的seqidno具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性。在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含一对序列：选自表c中列出的seqidno:的一个序列，和另一个序列，所述另一个序列是与具有表d中列出的seqidno:序列具有表c中列出的seqidno:的序列具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列。[0233]在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含一对序列：选自表d中列出的seqidno:的一个序列，和另一个序列，所述另一个序列是与具有表d中列出的seqidno:的序列具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列。例如，在各个方面，抗原结合蛋白包含seqidno:419的序列，并且所述抗原结合蛋白还包含与seqidno421具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列。[0234]在各种情况下，抗原结合蛋白是在重链(hc)可变区中或在轻链(lc)可变区中或在两者中具有一个或多个(例如，2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34或35个)氨基酸取代的如表d中列出的人源化抗原结合蛋白。在示例性方面，抗原结合蛋白是在hc可变区、lc可变区或两者中具有一个或多个氨基酸取代的ab1-11的人源化抗原结合蛋白。在示例性方面，抗原结合蛋白包含seqidno:379的具有1、2、3、4或5个氨基酸取代的hc。在示例性方面，抗原结合蛋白包含seqidno:504的hccdr1、seqidno:505的hccdr2、seqidno:506的hccdr3或其组合。在示例性情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:503的hc。在一些方面，抗原结合蛋白包含seqidno:496-501中的任一个的hc。在一些方面，抗原结合蛋白包含在图22中标记为s7-s12的hc序列。在各种情况下，轻链可变区包含seqidno:449的lccdr1、seqidno:450的lccdr2、seqidno:451的lccdr3或其组合。在一些方面，抗原结合蛋白包含seqidno:380-383和479中的任一个的lc。在示例性情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:383的lc。在一些方面，抗原结合蛋白包含在图22中标记为s7-s12的lc序列。在示例性方面，抗原结合蛋白是在hc可变区、lc可变区或两者中具有一个或多个氨基酸取代的ab3-7的人源化抗原结合蛋白。在示例性方面，抗原结合蛋白包含seqidno:387的具有1、2、3、4、5或6个氨基酸取代的hc。在示例性方面，抗原结合蛋白包含seqidno:507的hccdr1、seqidno:508的hccdr2、seqidno:509的hccdr3或其组合。在示例性情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:502的hc。在一些方面，抗原结合蛋白包含seqidno:490-495中的任一个的hc。在一些方面，抗原结合蛋白包含在图22中标记为s1-s6的hc序列。在各种情况下，轻链可变区包含seqidno:476的lccdr1、seqidno:477的lccdr2、seqidno:454的lccdr3或其组合。在一些方面，抗原结合蛋白包含seqidno:388-390和481中的任一个的lc。在示例性情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:389的lc。在一些方面，抗原结合蛋白包含在图22中标记为s1-s6的lc序列。在示例性方面，抗原结合蛋白是在hc可变区、lc可变区或两者中具有一个或多个氨基酸取代的ab3的人源化抗原结合蛋白。在示例性方面，抗原结合蛋白包含seqidno:139的具有1、2、3、4或5个(或更多个)氨基酸取代的hc。在一些方面，抗原结合蛋白包含seqidno:510中的任一个的hc。在一些方面，抗原结合蛋白包含seqidno:510的具有如图23所示的1、2、3、4或5个(或更多个)氨基酸取代的hc序列。在示例性方面，抗原结合蛋白包含seqidno:138的具有1、2、3、4或5个(或更多个)氨基酸取代的hc。在一些方面，抗原结合蛋白包含seqidno:511中的任一个的hc。在一些方面，抗原结合蛋白包含seqidno:511的具有如图24所示的1、2、3、4或5个(或更多个)氨基酸取代的hc序列。在示例性方面，抗原结合蛋白是在hc可变区、lc可变区或两者中具有一个或多个氨基酸取代的ab1的人源化抗原结合蛋白。在示例性方面，抗原结合蛋白包含seqidno:135的具有1、2、3、4或5个(或更多个)氨基酸取代的hc。在一些方面，抗原结合蛋白包含seqidno:513中的任一个的hc。在一些方面，抗原结合蛋白包含seqidno:513的具有如图25所示的1、2、3、4或5个(或更多个)氨基酸取代的hc序列。在示例性方面，抗原结合蛋白包含seqidno:134的具有1、2、3、4或5个(或更多个)氨基酸取代的hc。在一些方面，抗原结合蛋白包含seqidno:512中的任一个的hc。在一些方面，抗原结合蛋白包含seqidno:512的具有如图26所示的1、2、3、4或5个(或更多个)氨基酸取代的hc序列。[0235]无岩藻糖基化抗体[0236]许多分泌的蛋白质经历翻译后糖基化，这是糖部分(例如聚糖、糖类)与蛋白质的特定氨基酸共价附接的过程。在真核细胞中，发生两种类型的糖基化反应：(1)n-连接糖基化，其中聚糖附接至识别序列asn-x-thr/ser的天冬酰胺，其中“x”是除脯氨酸之外的任何氨基酸，和(2)o-连接糖基化，其中聚糖附接至丝氨酸或苏氨酸。无论糖基化类型(n连接或o连接)如何，由于与每个位点(o或n)缔合的大量聚糖结构，存在蛋白质糖型的微异质性。[0237]所有n-聚糖都具有共同的核心糖序列：manα1–6(manα1–3)manβ1–4glcnacβ1–4glcnacβ1-asn-x-ser/thr(man3glcnac2asn)，并分类为以下三种类型之一：(a)高甘露糖(hm)或低聚甘露糖(om)型，其由两个n-乙酰葡萄糖胺(galnac)部分和大量(例如，5、6、7、8或9个)甘露糖(man)残基组成；(b)复合型，其包含超过两个glcnac部分和任何数量的其他糖类型；或(c)杂合型，其包含在分支的一侧的man残基和在复合物分支的底部的glcnac。图1a(摘自stanley等人，第8章：n-glycans,essentialsofglycobiology,第2版,coldspringharborlaboratorypress；2009)显示三种类型的n-聚糖。[0238]n-连接聚糖通常包含半乳糖(gal)、n-乙酰半乳糖胺(galnac)、半乳糖胺(galn)、葡萄糖(glc)、n-乙酰葡萄糖胺(clcnac)、葡萄糖胺(glcn)、甘露糖(man)、n-乙酰甘露糖胺(mannac)、甘露糖胺(mann)、木糖(xyl)、n0乙酰基神经氨酸(neu5ac)、n-羟乙酰基神经氨酸(neu5gc)、2-酮基-3-脱氧壬酸(2-keto-3-doxynononicacid)(kdn)、岩藻糖(fuc)、葡萄糖醛酸(glca)、艾杜糖醛酸(idoa)、半乳糖醛酸(gala)、甘露糖醛酸(mana)的一个或多个单糖。这种糖类的常用符号示于图29a中。[0239]n-连接糖基化在内质网(er)中开始，其中一系列复杂的反应导致核心聚糖结构的附接，所述核心聚糖结构主要由两个glcnac残基和三个man残基组成。er中形成的聚糖复合物通过高尔基体中酶的作用进行修饰。如果酶相对难以接近糖类，则糖类通常保持原始hm形式。如果酶可接近糖类，则许多man残基被裂解，并且糖类被进一步修饰，从而形成复合型n-聚糖结构。例如，位于顺式高尔基体中的甘露糖苷酶-1可裂解或水解hm聚糖，而位于内侧高尔基体中的岩藻糖基转移酶fut-8使聚糖岩藻糖基化(hanrueimai-nishiya(2007),bmcbiotechnology,7:84)。[0240]因此，糖组成和聚糖结构的结构的构型发生变化，这取决于er和高尔基体中的糖基化机器、机器酶对聚糖结构的可及性、每种酶的作用顺序和蛋白质从糖基化机器中释放出来的阶段以及其他因素。[0241]在本公开的示例性实施方案中，抗原结合蛋白包含fc多肽。如本文所用的术语“fc多肽”包括源自抗体的fc区的多肽的天然和突变蛋白形式。在示例性方面，当前公开的抗原结合蛋白的fc多肽包含聚糖。在各种情况下，聚糖缺乏岩藻糖或无岩藻糖基化。在示例性方面，抗原结合蛋白包含无岩藻糖基化聚糖。如本文所用，术语“无岩藻糖基化聚糖”或“afuco聚糖”或“无岩藻糖基化糖型”或“afuc”是指缺乏核心岩藻糖的糖型，例如，参与与n-糖基化位点的asn酰胺键合的glcnac残基上的α1,6-连接的岩藻糖。无岩藻糖基化糖型包括但不限于a1g0、a2g0、a2g1a、a2g1b、a2g2和a1g1m5。另外的无岩藻糖基化聚糖包括例如a1g1a、g0[h3n4]、g0[h4n4]、g0[h5n4]、fo-n[h3n3]。参见例如，reusch和tejada,glycobiology25(12):1325-1334(2015)。[0242]本公开还提供了组合物，例如药物组合物，所述组合物包含抗原结合蛋白，所述抗原结合蛋白包含含有无岩藻糖基化聚糖的fc多肽。在示例性方面，组合物中存在的至少或约25％的抗原结合蛋白是包含fc多肽的抗原结合蛋白，所述fc多肽包含无岩藻糖基化聚糖。在示例性方面，组合物中存在的至少或约25％的抗原结合蛋白无岩藻糖基化。任选地，组合物中存在的至少30％、40％、50％、60％、70％、80％或90％或更多的抗原结合蛋白无岩藻糖基化。产生包含特定糖谱的抗原结合蛋白的组合物的方法是本领域已知的。在示例性实施方案中，抗原结合蛋白是在细胞中重组产生的，所述细胞经遗传修饰以改变从头途径或补救途径的酶的活性。这两种岩藻糖代谢途径示于图29b中。在示例性实施方案中，细胞经遗传修饰以改变以下中的任何一者或多者的活性：岩藻糖基转移酶(fut，例如，fut1、fut2、fut3、fut4、fut5、fut6、fut7、fut8、fut9)、岩藻糖激酶、gdp-岩藻糖焦磷酸化酶、gdp-d-甘露糖-4,6-脱水酶(gmd)和gdp-酮基-6-脱氧甘露糖-3,5-差向异构酶、4-还原酶(fx)。在示例性实施方案中，细胞经遗传修饰以敲除编码fx的基因。参见例如，国际专利公布第wo2017/079165a1号；kanda等人,jbiotechnol130,2007,300-310；yamane-ohunuki等人,biotechnolbioeng87,2004,614-622；malphettes等人,biotechnolbioeng106,2010,774-783。[0243]核酸[0244]本公开还提供了核酸，所述核酸包含编码本公开的抗原结合蛋白的核苷酸序列。如本文所用的“核酸”包括“多核苷酸”、“寡核苷酸”和“核酸分子”，并且通常是指dna或rna的聚合物或其经修饰形式，其可以是单链或双链的、从天然来源合成或获得(例如，分离和/或纯化)，其可含有天然、非天然或改变的核苷酸，并且其可含有天然、非天然或改变的核苷酸间键联，如氨基磷酸酯键或硫代磷酸酯键联，而不是在未修饰的寡核苷酸的核苷酸之间发现的磷酸二酯键。核酸可包含编码本公开的任何抗原结合蛋白的任何核苷酸序列。在各个方面，所述核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含(a)表a或a1中列出的重链(hc)互补决定区(cdr)1氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:11、17、23、29、35、41、47、53、59、65、71、77、83、89、95、101、107、113、119、125、131、452、455、461、465和472，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少或约80％、至少或约85％、至少或约90％、至少或约95％)序列同一性的变体序列；(b)表a或a1中列出的hccdr2氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:12、18、24、30、36、42、48、54、60、66、72、78、84、90、86、102、108、114、120、126、132、475、456、462、466、468和473，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少或约80％、至少或约85％、至少或约90％、至少或约95％)序列同一性的变体序列；(c)表a或a1中列出的hccdr3氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:13、19、25、31、37、43、49、55、61、67、73、79、85、91、97、103、109、115、121、127、133、453、457、463、467、469和474，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少或约80％、至少或约85％、至少或约90％、至少或约95％)序列同一性的变体序列；(d)表a或a1中列出的轻链(lc)cdr1氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:8、14、20、32、38、44、50、56、62、68、74、80、86、92、98、104、110、116、122、128、449、476、458、464和470，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少或约80％、至少或约85％、至少或约90％、至少或约95％)序列同一性的变体序列；(e)表a或a1中列出的lccdr2氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:9、15、21、27、33、39、45、51、57、63、69、75、81、87、93、99、105、111、117、123、129、450、477、459和471，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少或约80％、至少或约85％、至少或约90％、至少或约95％)序列同一性的变体序列；(f)表a中列出的lccdr3氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:10、16、22、28、34、40、46、52、58、64、70、76、82、88、94、100、106、112、118、124、130、451、454和460，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少或约80％、至少或约85％、至少或约90％、至少或约95％)序列同一性的变体序列；或(g)(a)-(f)中的任何两者或更多者的组合。在各个方面，所述核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含表a或a1中列出的lccdr1氨基酸序列、lccdr2氨基酸序列和lccdr3氨基酸序列和表a或a1中列出的hccdr氨基酸序列中的至少1或2个。在各个方面，所述核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含表a或a1中列出的hccdr1氨基酸序列、hccdr2氨基酸序列和hccdr3氨基酸序列和表a或a1中列出的lccdr氨基酸序列中的至少1或2个。在各种实施方案中，所述核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含(a)由表a或a1的单行中的seqidno:指定的氨基酸序列中的至少3、4或5个，(b)由表a或a1的单行的seqidno:指定的lccdr氨基酸序列中的每一个和由表a或a1的单行的seqidno:指定的hccdr氨基酸序列中的至少1或2个，(c)由表a或a1的单行的seqidno:指定的hccdr氨基酸序列中的每一个和由表a或a1的单行的seqidno:指定的lccdr氨基酸序列中的至少1或2个，(d)由表a的单行的seqidno:指定的所有6个cdr氨基酸序列，和/或(e)选自由以下组成的组的六个cdr氨基酸序列：(a)seqidno:74-79；(b)seqidno:50-55；(c)seqidno:122-127；(d)seqidno:26-31；(e)seqidno:128-133；(f)seqidno:38-43；(g)seqidno:62-67；(h)seqidno:80-85；(i)seqidno:44-49；(j)seqidno:86-91；(k)seqidno:104-109；(l)seqidno:56-61；(m)seqidno:32-37；(n)seqidno:110-115；(o)seqidno:98-103；(p)seqidno:92-97；(q)seqidno:116-121；(r)seqidno:8-13；(s)seqidno:68-73；(t)seqidno:14-19；(u)seqidno:20-25；(v)seqidno:449-453和475；(w)seqidno:476-477、454-457；(x)seqidno:458-463；(y)seqidno:57、58、464-467；(z)seqidno:68-71和468-469；和(aa)seqidno:112和470-474。在各种实施方案中，所述核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含(a)表b或b1中列出的重链可变区氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：135、137、139、141、143、145、147、149、151、153、155、157、159、161、163、165、167、169、171、173、175、478、480、482、484、486和488，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少或约80％、至少或约85％、至少或约90％、至少或约95％)序列同一性的变体序列；或(b)表b或b1中列出的轻链可变区氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：134、136、138、140、142、144、146、148、150、152、154、156、158、160、162、164、166、168、170、172、174、176、479、481、483、485、487和489，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少或约80％、至少或约85％、至少或约90％、至少或约95％)序列同一性的变体序列；或(c)(a)和(b)两者。在各种实施方案中，所述核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含选自由以下组成的组的一对氨基酸序列：(a)seqidno:156和157；(b)seqidno:148和149；(c)seqidno:172和173；(d)seqidno:140和141；(e)seqidno:174和175；(f)seqidno:144和145；(g)seqidno:152和153；(h)seqidno:158和159；(i)seqidno:146和147；(j)seqidno:160和161；(k)seqidno:166和167；(l)seqidno:150和151；(m)seqidno:142和143；(n)seqidno:168和169；(o)seqidno:164和165；(p)seqidno:162和163；(q)seqidno:170和171；(r)seqidno:134和135；(s)seqidno:154和155；(t)seqidno:136和137；和(u)seqidno:138和139。在各种实施方案中，所述核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含选自由表d中列出的对组成的组的一对氨基酸序列。在各个方面，所述核酸包含如下核苷酸序列，所述核苷酸序列包含seqidno:208-375中的任何一个或多个的序列。在一些实施方案中，核酸不包含任何插入、缺失、倒位和/或取代。在其他实施方案中，核酸包含一个或多个插入、缺失、倒位和/或取代。[0245]在各个方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白是在重链(hc)可变区中或在轻链(lc)可变区中或在两者中具有一个或多个(例如，2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34或35个)氨基酸取代的如表d中列出的人源化抗原结合蛋白。在示例性方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白是在hc可变区、lc可变区或两者中具有一个或多个氨基酸取代的ab1-11的人源化抗原结合蛋白。在示例性方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:379的具有1、2、3、4或5个氨基酸取代的hc。在示例性方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:504的hccdr1、seqidno:505的hccdr2、seqidno:506的hccdr3或其组合。在示例性情况下，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:503的hc。在一些方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:496-501中的任一个的hc。在一些方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含在图22中标记为s7-s12的hc序列。在各种情况下，核酸包含编码轻链可变区的核苷酸序列，所述轻链可变区包含seqidno:449的lccdr1、seqidno:450的lccdr2、seqidno:451的lccdr3或其组合。在一些方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:380-383和479中的任一个的lc。在示例性情况下，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:383的lc。在一些方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含在图22中标记为s7-s12的lc序列。在示例性方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白是在hc可变区、lc可变区或两者中具有一个或多个氨基酸取代的ab3-7的人源化抗原结合蛋白。在示例性方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:387的具有1、2、3、4、5或6个氨基酸取代的hc。在示例性方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:507的hccdr1、seqidno:508的hccdr2、seqidno:509的hccdr3或其组合。在示例性情况下，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:502的hc。在一些方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:490-495中的任一个的hc。在一些方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含在图22中标记为s1-s6的hc序列。在各种情况下，核酸包含编码轻链可变区的核苷酸序列，所述轻链可变区包含seqidno:476的lccdr1、seqidno:477的lccdr2、seqidno:454的lccdr3或其组合。在一些方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:388-390和481中的任一个的lc。在示例性情况下，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:389的lc。在一些方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含在图22中标记为s1-s6的lc序列。[0246]在示例性方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白是在hc可变区、lc可变区或两者中具有一个或多个氨基酸取代的ab3的人源化抗原结合蛋白。在示例性方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:139的具有1、2、3、4或5个(或更多个)氨基酸取代的hc。在一些方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:510中的任一个的hc。在一些方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:510的具有如图23所示的1、2、3、4或5个(或更多个)氨基酸取代的hc序列。在示例性方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:138的具有1、2、3、4或5个(或更多个)氨基酸取代的hc。在一些方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:511中的任一个的hc。在一些方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:511的具有如图24所示的1、2、3、4或5个(或更多个)氨基酸取代的hc序列。在示例性方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白是在hc可变区、lc可变区或两者中具有一个或多个氨基酸取代的ab1的人源化抗原结合蛋白。在示例性方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:135的具有1、2、3、4或5个(或更多个)氨基酸取代的hc。在一些方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:513中的任一个的hc。在一些方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:513的具有如图25所示的1、2、3、4或5个(或更多个)氨基酸取代的hc序列。在示例性方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:134的具有1、2、3、4或5个(或更多个)氨基酸取代的hc。在一些方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:512中的任一个的hc。在一些方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:512的具有如图26所示的1、2、3、4或5个(或更多个)氨基酸取代的hc序列。在一些实施方案中，核酸不包含任何插入、缺失、倒位和/或取代。在其他实施方案中，核酸包含一个或多个插入、缺失、倒位和/或取代。[0247]在一些方面，本公开的核酸是重组的。如本文所用，术语“重组”是指(i)通过将天然或合成核酸区段连接至可在活细胞中复制的核酸分子而在活细胞外构建的分子，或(ii)由以上(i)中描述的那些的复制产生的分子。出于本文的目的，复制可以是体外复制或体内复制。[0248]在一些方面，使用本领域中已知的程序基于化学合成和/或酶促连接反应构建核酸。参见例如，sambrook等人,同上；和ausubel等人,同上。例如，可使用天然存在的核苷酸或经设计以增加分子的生物稳定性或增加杂交后形成的双链体的物理稳定性的各种经修饰的核苷酸(例如硫代磷酸酯衍生物和吖啶取代的核苷酸)化学合成核酸。可用于产生核酸的经修饰核苷酸的实例包括但不限于5-氟尿嘧啶、5-溴尿嘧啶、5-氯尿嘧啶、5-碘尿嘧啶、次黄嘌呤、黄嘌呤、4-乙酰胞嘧啶、5-(羧基羟甲基)尿嘧啶、5-羧甲基氨基甲基-2-硫尿苷、5-羧甲基氨基甲基尿嘧啶、二氢尿嘧啶、β-d-半乳糖基辫苷、肌苷、n6-异戊烯基腺嘌呤、1-甲基鸟嘌呤、1-甲基肌苷、2,2-二甲基鸟嘌呤、2-甲基腺嘌呤、2-甲基鸟嘌呤、3-甲基胞嘧啶、5-甲基胞嘧啶、n-取代的腺嘌呤、7-甲基鸟嘌呤、5-甲基氨甲基尿嘧啶、5-甲氧基氨基甲基-2-硫尿嘧啶、β-d-甘露糖基辫苷、5'-甲氧基羧甲基尿嘧啶、5-甲氧基尿嘧啶、2-甲硫基-n6-异戊烯基腺嘌呤、尿嘧啶-5-氧乙酸(v)、怀丁氧苷、假尿嘧啶(pseudouratil)、辫苷(queosine)、2-硫胞嘧啶、5-甲基-2-硫尿嘧啶、2-硫尿嘧啶、4-硫尿嘧啶、5-甲基尿嘧啶、尿嘧啶-5-氧乙酸甲酯、3-(3-氨基-3-n-2-羧丙基)尿嘧啶和2,6-二氨基嘌呤。可替代地，本公开的一种或多种核酸可从公司购买，如macromolecularresources(fortcollins,co)和synthegen(houston,tx)。[0249]载体[0250]在一些方面，本公开的核酸被并入载体中。在此方面，本公开提供了包含当前公开的核酸中的任一者的载体。在各个方面，载体是重组表达载体。出于本文的目的，术语“重组表达载体”是指经遗传修饰的寡核苷酸或多核苷酸构建体，当所述构建体包含编码mrna、蛋白质、多肽或肽的核苷酸序列并且使载体在足以在宿主细胞内表达所述mrna、蛋白质、多肽或肽的条件下与所述细胞接触时，所述构建体允许宿主细胞表达mrna、蛋白质、多肽或肽。本公开的载体整体上不是天然存在的。然而，载体的部分可以是天然存在的。当前公开的载体可包含任何类型的核苷酸，包括但不限于dna和rna，所述核苷酸可以是单链或双链的，合成的或部分从天然来源获得的，并且可含有天然的、非天然的或改变的核苷酸。载体可包含天然存在的或非天然存在的核苷酸间键联或两种类型的键联。在一些方面，改变的核苷酸或非天然存在的核苷酸间键联不阻碍载体的转录或复制。[0251]本公开的载体可以是任何合适的载体，并且可用于转导、转化或转染任何合适的宿主。合适的载体包括被设计用于繁殖和扩增或用于表达或用于两者的那些载体，诸如质粒和病毒。载体可以是基于质粒的表达载体。在各个方面，载体选自由以下组成的组：puc系列(fermentaslifesciences)、pbluescript系列(stratagene,lajoiia,ca)、pet系列(novagen,madison,wi)、pgex系列(pharmaciabiotech,uppsala,sweden)和pex系列(clontech,paloalto,ca)。也可使用噬菌体载体，如λgtio、λgtl1、λzapii(stratagene)、λembl4和λnml149。植物表达载体的实例包括pbiol、pbi101.2、pbi101.3、pbi121和pbin19(clontech)。动物表达载体的实例包括peuk-cl、pmam和pmamneo(clontech)。在一些方面，载体是病毒载体，例如逆转录病毒载体。在各个方面，载体是腺病毒载体、腺相关病毒(aav)7、成视网膜细胞瘤细胞y79、人成视网膜细胞瘤细胞so-rb50、人肝癌细胞hepg2、小鼠b骨髓瘤细胞j558l或幼仓鼠肾(bhk)细胞(gaillet等人2007；khan,advpharmbull3(2):257-263(2013))。[0259]对于扩增或复制载体的目的，宿主细胞在一些方面是原核细胞，例如细菌细胞。[0260]本公开还提供了包含至少一种本文所述宿主细胞的细胞群体。在一些方面，细胞群体是异质群体，所述异质群体包含含有所描述的载体的宿主细胞，以及不包含任何载体的至少一种其他细胞。可替代地，在一些方面，细胞群体是基本上同质的群体，其中所述群体主要包含含有载体的宿主细胞(例如，基本上由其组成)。在一些方面，所述群体是细胞的克隆群体，其中所述群体的所有细胞是包含载体的单个宿主细胞的克隆，使得所述群体的所有细胞都包含载体。在本公开的各种实施方案中，细胞群体是包含宿主细胞的克隆群体，所述宿主细胞包含如本文所述的载体。[0261]制造方法[0262]本文还提供了产生结合至cldn6的抗原结合蛋白的方法。在各种实施方案中，所述方法包括在细胞培养基中培养包含核酸的宿主细胞，所述核酸包含编码如本文所述的抗原结合蛋白的核苷酸序列；以及从所述细胞培养基中收获所述抗原结合蛋白。宿主细胞可以是本文所述的任何宿主细胞。在各个方面，宿主细胞选自由以下组成的组：cho细胞、ns0细胞、cos细胞、vero细胞和bhk细胞。在各个方面，培养宿主细胞的步骤包括在生长培养基中培养所述宿主细胞以支持宿主细胞的生长和扩增。在各个方面，生长培养基以即时方式增加细胞密度、培养活力和生产力。在各个方面，生长培养基包含氨基酸、维生素、无机盐、葡萄糖和血清作为生长因子、激素和附着因子的来源。在各个方面，生长培养基是由氨基酸、维生素、微量元素、无机盐、脂质和胰岛素或胰岛素样生长因子组成的完全化学成分确定的培养基。除了营养之外，生长培养基还有助于维持ph值和渗透压。几种生长培养基是可商购的并且在本领域中有描述。参见例如，arora,“cellculturemedia:areview”matermethods3:175(2013)。[0263]在各个方面，所述方法包括在补料培养基中培养宿主细胞。在各个方面，所述方法包括以补料分批模式在补料培养基中培养。重组蛋白生产方法是本领域中已知的。参见例如，li等人,“cellcultureprocessesformonoclonalantibodyproduction”mabs2(5):466–477(2010)。[0264]制备抗原结合蛋白的方法可包括用于从细胞培养物或其上清液中纯化蛋白质以及优选地回收纯化的蛋白质的一个或多个步骤。在各个方面，所述方法包括一个或多个色谱步骤，例如亲和色谱(例如蛋白a亲和色谱)、离子交换色谱、疏水相互作用色谱。在各个方面，所述方法包括使用蛋白a亲和色谱树脂纯化蛋白质。[0265]在各种实施方案中，所述方法还包括用于配制纯化的蛋白质等的步骤，从而获得包含所述纯化的蛋白质的制剂。此类步骤描述于formulationandprocessdevelopmentstrategiesformanufacturing,jameel和hershenson编辑,johnwiley&sons,inc.(hoboken,nj),2010中。[0266]在各个方面，连接至多肽和抗原结合蛋白的抗原结合蛋白是融合蛋白的一部分。因此，本公开进一步提供了产生包含结合至cldn6的抗原结合蛋白的融合蛋白的方法。在各种实施方案中，所述方法包括在细胞培养基中培养包含核酸的宿主细胞，所述核酸包含编码如本文所述的融合蛋白的核苷酸序列；以及从所述细胞培养基中收获所述融合蛋白。[0267]缀合物[0268]本公开还提供附接、连接或缀合至第二部分(例如，异源部分、缀合物部分)的抗原结合蛋白。因此，本公开提供了包含抗原结合蛋白和异源部分的缀合物。如本文所用，术语“异源部分”与“缀合物部分”同义并且是指与本公开的抗原结合蛋白不同的任何分子(化学的或生物化学的、天然存在的或非编码的)。各种异源部分包括但不限于聚合物、碳水化合物、脂质、核酸、寡核苷酸、dna或rna、氨基酸、肽、多肽、蛋白质、治疗剂(例如，细胞毒性剂、细胞因子)或诊断剂。[0269]在一些实施方案中，异源部分是聚合物。聚合物可以是支化的或无支化的。聚合物可具有任何分子量。在一些实施方案中，聚合物具有介于约2kda至约100kda之间的平均分子量(术语“约”指示在水溶性聚合物的制剂中，一些分子将重于、一些分子将轻于所陈述的分子量)。在一些方面，聚合物的平均分子量介于约5kda与约50kda之间、介于约12kda至约40kda之间或介于约20kda至约35kda之间。[0270]在一些实施方案中，聚合物被改性为具有单个反应性基团，诸如用于酰化的活性酯或用于烷基化的醛，从而可控制聚合度。在一些实施方案中，聚合物是水溶性的，使得其所附接的蛋白质不会在诸如生理环境的水性环境中沉淀。在一些实施方案中，例如，当组合物用于治疗用途时，聚合物是药学上可接受的。另外，在一些方面，聚合物是聚合物的混合物，例如共聚物、嵌段共聚物。[0271]在一些实施方案中，聚合物选自由以下组成的组：聚酰胺；聚碳酸酯；聚烯烃及其衍生物，包括聚亚烷基二醇、聚环氧烷、聚对苯二甲酸亚烷基酯；丙烯酸和甲基丙烯酸酯的聚合物，包括聚(甲基丙烯酸甲酯)、聚(甲基丙烯酸乙酯)、聚(甲基丙烯酸丁酯)、聚(甲基丙烯酸异丁酯)、聚(甲基丙烯酸己酯)、聚(甲基丙烯酸异癸酯)、聚(甲基丙烯酸月桂酯)、聚(甲基丙烯酸苯酯)、聚(丙烯酸甲酯)、聚(丙烯酸异丙酯)、聚(丙烯酸异丁酯)和聚(丙烯酸十八酯)；聚乙烯聚合物，包括聚乙烯醇、聚乙烯醚、聚乙烯酯、聚卤乙烯、聚(乙酸乙烯酯)和聚乙烯吡咯烷酮；聚乙交酯；聚硅氧烷；聚氨酯及其共聚物；纤维素，包括烷基纤维素、羟烷基纤维素、纤维素醚、纤维素酯、硝基纤维素、甲基纤维素、乙基纤维素、羟丙基纤维素、羟基-丙基甲基纤维素、羟丁基甲基纤维素、乙酸纤维素、丙酸纤维素、乙酸丁酸纤维素、邻苯二甲酸乙酸纤维素、羧乙基纤维素、三乙酸纤维素和硫酸纤维素钠盐；聚丙烯；聚乙烯，包括聚(乙二醇)、聚(环氧乙烷)和聚(对苯二甲酸乙二醇酯)；以及聚苯乙烯。[0272]用于在本文中使用的特别优选的水溶性聚合物是聚乙二醇(peg)。如本文所用，聚乙二醇是意图涵盖可用于衍生其它蛋白质的任何peg形式，诸如单(c1-c10)烷氧基或芳氧基-聚乙二醇。peg是线性或支化的中性聚醚，可以广泛范围的分子量获得，并且可溶于水和大多数有机溶剂中。[0273]在一些实施方案中，异源部分是碳水化合物。在一些实施方案中，碳水化合物是单糖(例如，葡萄糖、半乳糖、果糖)、二糖(例如，蔗糖、乳糖、麦芽糖)、寡糖(例如，棉子糖、水苏糖)、多糖(淀粉、淀粉酶、支链淀粉)、纤维素、几丁质、愈创葡聚糖(callose)、昆布多糖、木聚糖、甘露聚糖、岩藻依聚糖、半乳甘露聚糖。[0274]在一些实施方案中，异源部分是脂质。在一些实施方案中，脂质是脂肪酸、类花生酸、前列腺素、白三烯、血栓烷、n-酰基乙醇胺)、甘油脂质(例如，单、二、三取代的甘油)、甘油磷脂(例如，磷脂酰胆碱、磷脂酰肌醇、磷脂酰乙醇胺、磷脂酰丝氨酸)、鞘脂(例如鞘氨醇、神经酰胺)、固醇脂质(例如，类固醇、胆固醇)、异戊烯醇脂质、糖脂或聚酮化合物、油、蜡、胆固醇、固醇、脂溶性维生素、甘油单酯、甘油二酯、甘油三酯、磷脂。[0275]在一些实施方案中，异源部分是治疗剂。治疗剂可以是本领域中已知的任一种。本文考虑的治疗剂的实例包括但不限于天然酶、源自天然来源的蛋白质、重组蛋白质、天然肽、合成肽、环肽、抗体、受体激动剂、细胞毒性剂、免疫球蛋白、β-肾上腺素能阻滞剂、钙通道阻滞剂、冠状血管扩张剂、强心苷、抗心律失常药、心脏拟交感神经药、血管紧张素转化酶(ace)抑制剂、利尿剂、强心药、胆固醇和甘油三酯降低剂、胆汁酸螯合剂、贝特类、3-羟基-3-甲基戊二酰基(hmg)-coa还原酶抑制剂、烟酸衍生物、抗肾上腺素能药、α-肾上腺素能阻滞剂、中枢作用的抗肾上腺素能药、血管扩张剂、保钾剂、噻嗪类药物和相关剂、血管紧张素ii受体拮抗剂、外周血管扩张剂、抗雄激素、雌激素、抗生素、类视黄醇、胰岛素和类似物、α-葡糖苷酶抑制剂、双胍类药物、格列奈类药物、磺酰脲类药物、噻唑烷二酮类、雄激素、孕激素、骨代谢调控剂、垂体前叶激素、下丘脑激素、垂体后叶激素、促性腺激素、促性腺激素释放激素拮抗剂、排卵刺激剂、选择性雌激素受体调节剂、抗甲状腺剂、甲状腺激素、膨胀性泻剂(bulkformingagent)、泻药、逆蠕动剂、菌群调节剂、肠道吸附剂、肠道抗感染剂、抗厌食剂、抗恶病质剂、抗贪食症剂、食欲抑制剂、抗肥胖剂、抗酸剂、上消化道药物、抗胆碱能药、氨基水杨酸衍生物、生物应答调节剂、皮质类固醇、解痉剂、5-ht4部分激动剂、抗组胺药、大麻素、多巴胺拮抗剂、血清素拮抗剂、细胞保护剂、组胺h2受体拮抗剂、粘膜保护剂、质子泵抑制剂、幽门螺杆菌根除疗法、红细胞生成刺激剂、造血剂、贫血剂、肝素、抗纤维蛋白溶解剂、止血剂、凝血因子、二磷酸腺苷抑制剂、糖蛋白受体抑制剂、纤维蛋白原-血小板结合抑制剂、血栓烷-a2抑制剂、纤溶酶原活化剂、抗血栓形成剂、糖皮质激素、盐皮质激素、皮质类固醇、选择性抗免疫抑制剂、抗真菌剂、参与预防性治疗的药物、aids相关感染、巨细胞病毒、非核苷逆转录酶抑制剂、核苷类似物逆转录酶抑制剂、蛋白酶抑制剂、贫血、卡波济氏肉瘤、氨基糖苷类、碳青霉烯类、头孢菌素类、糖肽类、林可酰胺类、大环内酯类、噁唑烷酮类、青霉素类、链阳菌素类、磺胺类药物、甲氧苄啶及其衍生物、四环素类、驱虫药、抗阿米巴药、双胍类、金鸡纳属生物碱、叶酸拮抗剂、喹啉衍生物、卡氏肺孢子虫疗法、酰肼类、咪唑类、三唑类、硝基咪唑类、环胺类、神经酰胺酶抑制剂、核苷、磷酸盐结合剂、胆碱酯酶抑制剂、辅助治疗、巴比妥类药物和衍生物、苯二氮卓类药物、γ氨基丁酸衍生物、乙内酰脲衍生物、亚氨基芪衍生物、琥珀酰亚胺衍生物、抗惊厥药、麦角生物碱、抗偏头痛制剂、生物应答调节剂、氨基甲酸酯、三环衍生物、去极化剂、非去极化剂、神经肌肉麻痹剂、cns刺激剂、多巴胺能试剂、单胺氧化酶抑制剂、comt抑制剂、烷基磺酸盐、乙烯亚胺、咪唑四嗪、氮芥类似物、亚硝基脲、含铂化合物、抗代谢药、嘌呤类似物、嘧啶类似物、尿素衍生物、蒽环类药物、放线菌素d、喜树碱衍生物、表鬼臼毒素、紫杉烷、长春花生物碱和类似物、抗雄激素、抗雌激素、非类固醇芳香酶抑制剂、蛋白激酶抑制剂、抗肿瘤药、氮杂螺癸二酮衍生物、抗焦虑药、兴奋剂、单胺再摄取抑制剂、选择性血清素再摄取抑制剂、抗抑郁剂、苯并异噁唑衍生物、丁酰苯衍生物、二苯并二氮杂衍生物、二苯并硫氮杂衍生物、二苯基丁基哌啶衍生物、吩噻嗪、噻吩并苯并二氮杂衍生物、噻吨衍生物、过敏原提取物、非类固醇药物、白三烯受体拮抗剂、黄嘌呤、内皮素受体拮抗剂、前列腺素、肺表面活性剂、粘液溶解剂、抗有丝分裂剂、排尿酸药、黄嘌呤氧化酶抑制剂、磷酸二酯酶抑制剂、乌洛托品(metheamine)盐、硝基呋喃衍生物、喹诺酮类、平滑肌松弛剂、拟副交感神经药、卤代烃、氨基苯甲酸酯、酰胺类(例如利多卡因、盐酸阿替卡因、盐酸布比卡因)、退热剂、催眠药和镇静剂、环吡咯酮类、吡唑并嘧啶类、非类固醇抗炎药、阿片类药物、对氨基苯酚衍生物、乙醇脱氢酶抑制剂、肝素拮抗剂、吸附剂、催吐剂、阿片类拮抗剂、胆碱酯酶再活化剂、尼古丁替代疗法、维生素a类似物和拮抗剂、维生素b类似物和拮抗剂、维生素c类似物和拮抗剂、维生素d类似物和拮抗剂、维生素e类似物和拮抗剂、维生素k类似物和拮抗剂。[0276]本公开的抗原结合蛋白可与一种或多种有效抑制肿瘤转移的细胞因子和生长因子缀合，并且其中所述细胞因子或生长因子已显示对至少一种细胞群体具有抗增殖作用。此类细胞因子、淋巴因子、生长因子或其他造血因子包括但不限于：m-csf、gm-csf、tnf、il-1、il-2、il-3、il-4、il-5、il-6、il-7、il-8、il-9、il-10、il-11、il-12、il-13、il-14、il-15、il-16、il-17、il-18、ifn、tnfα、tnf1、tnf2、g-csf、meg-csf、gm-csf、血小板生成素、干细胞因子和红细胞生成素。用于在本文中使用的另外生长因子包括血管生成素、骨形态发生蛋白-1、骨形态发生蛋白-2、骨形态发生蛋白-3、骨形态发生蛋白-4、骨形态发生蛋白-5、骨形态发生蛋白-6、骨形态发生蛋白-7、骨形态发生蛋白-8、骨形态发生蛋白-9、骨形态发生蛋白-10、骨形态发生蛋白-11、骨形态发生蛋白-12、骨形态发生蛋白-13、骨形态发生蛋白-14、骨形态发生蛋白-15、骨形态发生蛋白受体ia、骨形态发生蛋白受体ib、脑源性神经营养因子、睫状神经营养因子、睫状神经营养因子受体α、细胞因子诱导的嗜中性粒细胞趋化因子1、细胞因子诱导的嗜中性粒细胞趋化因子2α、细胞因子诱导的嗜中性粒细胞趋化因子2β、β内皮细胞生长因子、内皮素1、上皮细胞来源的嗜中性粒细胞引诱剂、神经胶质细胞系来源的嗜中性粒细胞受体α1、神经胶质细胞系来源的嗜中性粒细胞受体α2、生长相关蛋白、生长相关蛋白α、生长相关蛋白β、生长相关蛋白γ、肝素结合表皮生长因子、肝细胞生长因子、肝细胞生长因子受体、胰岛素样生长因子i、胰岛素样生长因子受体、胰岛素样生长因子ii、胰岛素样生长因子结合蛋白、角质形成细胞生长因子、白血病抑制因子、白血病抑制因子受体α、神经生长因子、神经生长因子受体、神经营养因子-3、神经营养因子-4、前b细胞生长刺激因子、干细胞因子、干细胞因子受体、转化生长因子α、转化生长因子β、转化生长因子β1、转化生长因子β1.2、转化生长因子β2、转化生长因子β3、转化生长因子β5、潜在转化生长因子β1、转化生长因子β结合蛋白i、转化生长因子β结合蛋白ii、转化生长因子受体β结合蛋白iii、肿瘤坏死因子受体i型、肿瘤坏死因子受体ii型、尿激酶型纤溶酶原活化剂受体、嵌合蛋白及其生物学或免疫学活性片段。[0277]在一些实施方案中，缀合物包含如本文所述的化合物和细胞毒性剂。细胞毒性剂是对细胞有毒性的任何分子(化学或生物化学)。在一些方面，当细胞毒性剂与本发明的化合物缀合时，获得的结果是协同的。也就是说，化合物和细胞毒性剂的组合疗法的有效性是协同的，即，有效性大于由各自的相加个体效应所预期的有效性。因此，可减少细胞毒性剂的剂量，并且因此同时降低毒性问题和其他副作用的风险。在一些实施方案中，细胞毒性剂是化学治疗剂。化学治疗剂是本领域中已知的并且包括但不限于铂配位化合物、拓扑异构酶抑制剂、抗生素、抗有丝分裂生物碱和二氟核苷，如美国专利第6,630,124号中所描述。[0278]在一些实施方案中，化学治疗剂是铂配位化合物。术语“铂配位化合物”是指以离子形式提供铂的任何抑制肿瘤细胞生长的铂配位化合物。在一些实施方案中，铂配位化合物是顺式二胺二水合铂(ii)-离子；氯(二亚乙基三胺)-氯化铂(ii)；二氯(乙二胺)-铂(ii)；二氨(1,1-环丁烷二羧基)铂(ii)(卡铂)；螺铂；异丙铂；二氨(2-乙基丙二酸)-铂(ii)；乙二胺丙二酸铂(ii)；水合(1,2-二氨基二环己烷)-硫酸根铂(ii)；(1,2-二氨基环己烷)丙二酸铂(ii)；(4-羧基邻苯二甲酸)(1,2-二氨基环己烷)铂(ii)；(1,2-二氨基环己烷)-(异柠檬酸)铂(ii)；(1,2-二氨基环己烷)顺式(丙酮酸)铂(ii)；(1,2-二氨基环己烷)草酸铂(ii)；奥马铂；和四铂。[0279]在一些实施方案中，顺铂是用于本发明的组合物和方法中的铂配位化合物。顺铂可从bristolmyers-squibbcorporation以名称platinoltm商购，并且可作为用于用水、无菌盐水或其他合适的媒介物复原的粉末获得。适用于本发明的其他铂配位化合物是已知的并且可商购和/或可通过常规技术制备。顺铂或顺式-二氯二氨铂ii已成功用作治疗各种人实体恶性肿瘤的化学治疗剂许多年。最近，其他二氨基铂复合物也显示出作为治疗各种人实体恶性肿瘤的化学治疗剂的功效。这种二氨基-铂复合物包括但不限于螺铂和卡铂。尽管顺铂和其他二氨基-铂复合物已广泛用作人的化学治疗剂，但它们必须以高剂量水平递送，这可能导致毒性问题，如肾损伤。[0280]在一些实施方案中，化学治疗剂是拓扑异构酶抑制剂。拓扑异构酶是能够改变真核细胞中的dna拓扑结构的酶。它们对细胞功能和细胞增殖至关重要。一般而言，真核细胞中存在两类拓扑异构酶，i型和ii型。拓扑异构酶i是大约100,000分子量的单体酶。所述酶结合至dna并引入瞬时单链断裂，使双螺旋展开(或允许其展开)，且随后在与dna链解离之前使所述断裂重新密封。各种拓扑异构酶抑制剂最近在治疗患有卵巢癌、癌症、食道癌或非小细胞肺癌的人中显示出临床功效。[0281]在一些方面，拓扑异构酶抑制剂是喜树碱或喜树碱类似物。喜树碱是由中国本土的喜树(camptothecaaccuminata)和印度本土的青翠枝(nothapodytesfoetida)树产生的不溶于水的细胞毒性生物碱。喜树碱对多种肿瘤细胞表现出肿瘤细胞生长抑制活性。喜树碱类似物类化合物通常是dna拓扑异构酶i的特异性抑制剂。术语“拓扑异构酶抑制剂”是指在结构上与喜树碱有关的任何肿瘤细胞生长抑制化合物。喜树碱类似物类化合物包括但不限于：拓扑替康、伊立替康和9-氨基喜树碱。[0282]在另外的实施方案中，细胞毒性剂是以下中要求保护或描述的任何肿瘤细胞生长抑制喜树碱类似物：1991年4月2日发布的美国专利第5,004,758号和在1989年6月21日公布为20'公布号ep0321122的欧洲专利申请第88311366.4号；1986年8月5日发布的美国专利第4,604,463号和1985年4月17日公布的欧洲专利申请公布第ep0137145号；1984年9月25日发布的美国专利第4,473,692号和1983年3月16日公布的欧洲专利申请公布第ep0074256号；1985年10月8日发布的美国专利第4,545,880号和1983年3月16日公布的欧洲专利申请公布第ep0074256号；1983年9月14日公布的欧洲专利申请公布第ep0088642号；wani等人,j.med.chem.,29,2358-2363(1986)；nitta等人,proc.14thinternationalcongr.chemotherapy,kyoto,1985,tokyopress,anticancersection1,第28-30页，特别是称为cpt-11的化合物。cpt-11是喜树碱类似物，其具有通过10-羟基-7-乙基喜树碱的c-10处的氨基甲酸酯键联连接的4-(哌啶基)-哌啶侧链。cpt-11目前正在进行人临床试验，并且也被称为伊立替康；wani等人,j.med.chem.,23,554(1980)；wani等人,j.med.chem.,30,1774(1987)；1982年8月3日发布的美国专利第4,342,776号；1990年9月13日提交的美国专利申请序列第581,916号和1991年3月20日公布的欧洲专利申请公布第ep418099号；1985年4月23日发布的美国专利第4,513,138号和1983年3月23日公布的欧洲专利申请公布第ep0074770号；1983年8月16日发布的美国专利第4,399,276号和1982年7月28日公布的欧洲专利申请公布第0056692号；其各自的全部公开内容特此以引用的方式并入。喜树碱类似物类的所有上文列出的化合物均可商购和/或可通过包括上文列出的参考文献中描述的那些技术的常规技术制备。拓扑异构酶抑制剂可选自由以下组成的组：拓扑替康、伊立替康和9-氨基喜树碱。[0283]在一些实施方案中，喜树碱类似物是伊立替康(cpt-11)的活性代谢物。在一些此类实施方案中，喜树碱类似物是7-乙基-10-羟基喜树碱(sn-38)。作为代谢物，sn-38是通过羧酸酯酶水解伊立替康而形成的。在一些实施方案中，sn-38具有以下结构中的一种：[0284][0285]sn-38已描述于美国专利申请序列第7,999,083号；美国专利申请序列第8,080,250号；美国专利申请序列第8,759,496号；美国专利申请序列第8,999,344号；美国专利申请序列第10,195,288号；和美国专利申请序列第9,808,537号中。[0286]在一些实施方案中，喜树碱类似物是甲磺酸依沙替康。甲磺酸依沙替康是水溶性喜树碱(cpt)，与其他cpt类似物相比表现出更强的拓扑异构酶i抑制活性和抗肿瘤活性。此外，依沙替康对p-糖蛋白(p-gp)介导的多重耐药性细胞有效。[0287]在一些实施方案中，喜树碱类似物是德卢替康(dxd)，它是依沙替康的有效衍生物，其拓扑异构酶i抑制效力是sn-38的10倍。在一些实施方案中，dxd具有以下结构：[0288][0289]dxd已描述于美国专利申请序列第6,407,115号；美国专利申请序列第10,195,288号；美国专利申请序列第9,808,537号；和美国专利申请序列第6,407,115号中。[0290]大量喜树碱类似物类化合物(包括其药学上可接受的盐、水合物和溶剂合物)的制备以及包含这种喜树碱类似物类化合物和惰性、药学上可接受的载剂或稀释剂的口服和胃肠外药物组合物的制备在1991年4月2日发布的美国专利第5,004,758号和1989年6月21日作为公布号ep0321122公布的欧洲专利申请第88311366.4号中进行了广泛描述，所述专利的教义以引用的方式并入本文。[0291]在本发明的其他实施方案中，化学治疗剂是抗生素化合物。合适的抗生素包括但不限于阿霉素、丝裂霉素、博来霉素、柔红霉素和链脲菌素。[0292]在一些实施方案中，化学治疗剂是抗有丝分裂生物碱。一般来说，抗有丝分裂生物碱可从长春花(cantharanthusroseus)中提取，并且已被证明是有效的抗癌化学治疗剂。已经在化学和药理学上研究了大量半合成衍生物(参见，o.vantellingen等人,anticancerresearch,12,1699-1716(1992))。本发明的抗有丝分裂生物碱包括但不限于长春碱、长春新碱、长春地辛、紫杉酚和长春瑞滨。后两种抗有丝分裂生物碱可分别从elilillyandcompany和pierrefabrelaboratories商购获得(参见美国专利第5,620,985号)。在一个实施方案中，抗有丝分裂生物碱是长春瑞滨。[0293]在本发明的其他实施方案中，化学治疗剂是二氟核苷。2'-脱氧-2',2'-二氟核苷在本领域中已知具有抗病毒活性。此类化合物在美国专利第4,526,988号和第4,808614号中公开和教导。欧洲专利申请公布184,365公开了这些相同的二氟核苷具有溶瘤活性。在某些方面，本发明的组合物和方法中使用的2'-脱氧-2',2'-二氟核苷是2'-脱氧-2',2'-二氟胞苷盐酸盐，也称为吉西他滨盐酸盐。吉西他滨是可商购的，或者可如美国专利第4,526,988号、第4,808,614号和第5,223,608号中公开和教导以多步法合成，所述专利的教义以引用的方式并入本文。[0294]在各个方面，化学治疗剂是通过阻断微管蛋白聚合而抑制细胞分裂的抗有丝分裂剂。使微管不稳定或改变微管动力学，例如美登木素生物碱或其衍生物(例如dm1或dm4)、奥瑞他汀或其衍生物。在各种情况下，化学治疗剂是奥瑞他汀。例如，在某些方面，奥瑞他汀是尾海兔素、单甲基奥瑞他汀e(mmae)、单甲基奥瑞他汀e(mmae)或pf-06380101。奥瑞他汀在本领域中有描述。参见例如maderna,a.；等人.,molpharmaceutics12(6):1798-1812(2015)。在各个方面，缀合物包含与mmae组合的本公开的抗体。任选地，缀合物包含接头。在一些方面，接头包含可裂解的连接部分。在各种情况下，缀合物包含连接至附接基团的本公开的抗体，所述附接基团连接至组织蛋白酶可裂解接头，所述接头进而连接至与mmae连接的间隔区。在一些方面，附接基团通过抗体fc区的cys残基附接至抗体。在示例性方面，附接基团包含式i的结构：[0295][0296]在示例性方面，组织蛋白酶可裂解接头包含式ii的结构：[0297][0298]在示例性方面，间隔区包含式iii的结构：[0299][0300]在一些实施方案中，mmae具有以下结构：[0301][0302]本公开还提供了包含与多肽连接的本公开的抗原结合蛋白的缀合物，使得所述缀合物是融合蛋白。因此，本公开提供了包含与多肽连接的本公开的抗原结合蛋白的融合蛋白。在各种实施方案中，多肽是诊断标记，例如荧光蛋白，如绿色荧光蛋白；或其他标签，例如myc标签。在各个方面，多肽是上文列出的细胞因子、淋巴因子、生长因子或其他造血因子中的一者。[0303]接头[0304]在一些实施方案中，缀合物直接连接至异源部分。在替代实施方案中，缀合物包含将本公开的化合物连接至异源部分的接头。在一些方面，接头包含1至约60、或1至30个原子或更长、2至5个原子、2至10个原子、5至10个原子或10至20个原子长的原子链。在一些实施方案中，链原子都是碳原子。在一些实施方案中，接头的主链中的链原子选自由c、o、n和s组成的组。链原子和接头可根据它们的预期溶解度(亲水性)进行选择，以提供可溶性更高的缀合物。在一些实施方案中，接头提供了如下官能团，所述官能团经受酶或其他催化剂或在靶组织或器官或细胞中发现的水解条件的裂解。在一些实施方案中，接头的长度足够长以降低空间位阻的可能性。在一些实施方案中，接头是氨基酸或肽基接头。此类肽基接头可以是任何长度。各种接头的长度是约1至50个氨基酸，长度是5至50、3至5、5至10、5至15或10至30个氨基酸。[0305]多种合适的接头是本领域中已知的。接头可以是可裂解的(可裂解接头)，例如在生理条件下，例如在细胞内条件下，使得接头的裂解在细胞内环境中释放药物。可替代地，接头可在细胞外条件下裂解，例如在肿瘤细胞外或在肿瘤块附近，使得接头的裂解释放优先渗透到肿瘤细胞内部的药物。在其他实施方案中，接头是不可裂解的(不可裂解的接头)，并且例如通过抗体降解释放药物。[0306]接头可与抗体部分上的化学反应性基团键合，例如与游离氨基、亚氨基、羟基、硫醇或羧基键合(例如，与n或c端键合，与一个或多个赖氨酸残基的ε氨基键合，与一个或多个谷氨酸或天冬氨酸残基的游离羧酸基团键合，与一个或多个半胱氨酸残基的巯基键合，或与一个或多个丝氨酸或苏氨酸残基的羟基键合)。接头结合的位点可以是抗体部分的氨基酸序列中的天然残基，或者可将所述位点引入抗体部分中，例如通过dna重组技术(例如，通过在氨基酸序列中引入半胱氨酸或蛋白酶裂解位点)或通过蛋白质生物化学(例如，还原、ph调节或蛋白水解)。接头键合的位点也可以是非天然氨基酸。接头键合的位点也可以是抗体上的聚糖。[0307]通常，接头在其连接的两个基团连接的条件下基本上是惰性的。术语“双功能交联剂”、“双功能接头”或“交联剂”是指在接头的每一端具有两个反应性基团的修饰剂，使得一个反应性基团可首先与细胞毒性化合物反应以提供带有接头部分和第二反应性基团的化合物，所述化合物然后可与抗体反应。可替代地，双功能交联剂的一端可首先与抗体反应以提供带有接头部分和第二反应性基团的抗体，所述抗体然后可与细胞毒性化合物反应。连接部分可含有允许在特定位点释放细胞毒性部分的化学键。合适的化学键是本领域众所周知的，并且包括二硫键、硫醚键、酸不稳定键、光不稳定键、蛋白酶/肽酶不稳定键和酯酶不稳定键。参见例如，美国专利第5,208,020号；第5,475,092号；第6,441,163号；第6,716,821号；第6,913,748号；第7,276,497号；第7,276,499号；第7,368,565号；第7,388,026号和第7,414,073号。在一些实施方案中，键是二硫键、硫醚和/或蛋白酶/肽酶不稳定键。可用于本发明的其他接头包括不可裂解的接头，如在us20050169933中详细描述的那些；带电接头或亲水性接头，如在us2009/0274713、us2010/0129314和wo2009/134976中描述的那些，所述专利各自以引用的方式明确并入本文。[0308]在一些实施方案中，接头是赋予缀合物亲水性的亲水性接头。在一些实施方案中，亲水性接头包括聚乙二醇(peg)。在一些实施方案中，亲水性接头是cla2。在一些实施方案中，cla2接头具有以下结构：[0309][0310]cla2已在美国专利第8,080,250号；第8,759,496号；和第10,195,288号中进行了描述。[0311]在一些实施方案中，亲水性接头是cl2e。在一些实施方案中，cl2e具有以下结构：[0312][0313]cl2e已在美国专利第8,080,250号；第8,759,496号；和第10,195,288号中进行了描述。[0314]在一些实施方案中，通过在细胞内环境中(例如，溶酶体或核内体或质膜微囊(caveolea)内)存在的裂解剂，接头是可裂解的。接头可以是例如通过细胞内或细胞外肽酶或蛋白酶而裂解的肽接头，所述酶包括但不限于溶酶体或核内体蛋白酶。在一些实施方案中，肽接头包含至少两个、至少三个、至少四个或至少五个氨基酸长。[0315]在一些实施方案中，肽接头是mc-vc-pab，包含缬氨酸和瓜氨酸残基。在一些实施方案中，mc-vc-pab接头具有以下结构：[0316][0317]mc-vc-pab已在美国专利第7,659,241号；第7,829,531号；第6,884,869号；第6,214,345号；和第6,214,345号中进行了描述。[0318]在一些实施方案中，肽接头是马来酰亚胺基己酰基甘氨酸-甘氨酸-苯丙氨酸-甘氨酸(mc-ggfg)。在一些实施方案中，mc-ggfg接头具有以下结构：[0319][0320]mc-ggfg已在美国专利第9,808,537号和第10,195,288号中进行了描述。[0321]在其它的实施方案中，可裂解接头是ph敏感性的，即对某些ph值下的水解敏感。在一些实施方案中，ph敏感性接头在酸性条件下是可水解的。例如，可使用在溶酶体中可水解的酸不稳定接头(例如，腙、缩氨基脲、缩氨基硫脲、顺式-乌头酰胺、原酸酯、缩醛、缩酮等)(参见例如，美国专利第5,122,368号；第5,824,805号；第5,622,929号；dubowchik和walker,1999,pharm.therapeutics83:67-123；neville等人,1989,biol.chem.264:14653-14661)。此类接头在中性ph条件(如在血液中的那些)下是相对稳定的，但是在低于ph5.5或5.0、接近溶酶体的ph下是不稳定的。在某些实施方案中，可水解的接头是硫醚接头(例如，经由酰基腙键附接至治疗剂的硫醚(参见，例如，美国专利第5,622,929号)。[0322]在其它实施方案中，在还原条件下，接头是可裂解的(例如，二硫化物接头)。能够通过二硫键将抗体与细胞毒性化合物连接的双功能交联剂包括但不限于n-琥珀酰亚胺基-4-(4-硝基吡啶基-2-二硫代)丁酸酯、n-琥珀酰亚胺基-3-(2-吡啶基二硫代)丙酸酯(spdp)、n-琥珀酰亚胺基-4-(2-吡啶基二硫代)戊酸酯(spp)、n-琥珀酰亚胺基-4-(2-吡啶基二硫代)丁酸酯(spdb)、n-琥珀酰亚胺基-4-(2-吡啶基二硫代)-2-磺基丁酸酯(磺基-spdb)。磺基-spdb描述于例如美国专利8,236,319中，所述专利以引用的方式并入本文。可替代地，可使用引入硫醇基团的交联剂，如2-亚氨基硫杂环戊烷、同型半胱氨酸硫内酯或s-乙酰基琥珀酸酐。在其他实施方案中，接头可含有先前描述的肽、ph敏感性接头或二硫化物接头中的一者或多者的组合。[0323]“异双官能交联剂”是具有两个不同反应性基团的双官能交联剂。含有胺反应性n-羟基琥珀酰亚胺基团(nhs基团)和羰基反应性肼基团的异双功能交联剂也可用于将细胞毒性化合物与抗体连接。这种可商购获得的异双官能交联剂的实例包括琥珀酰亚胺基6-肼基烟酰胺酰胺丙酮腙(sanh)、琥珀酰亚胺基4-肼基对苯二酸酯盐酸盐(shth)和琥珀酰亚胺基肼烟酸酯盐酸盐(shnh)。带有酸不稳定键联的缀合物也可使用本发明的带有肼的苯并二氮杂衍生物来制备。可使用的双官能交联剂的实例包括琥珀酰亚胺基-对-甲酰基苯甲酸酯(sfb)和琥珀酰亚胺基-对-甲酰基苯氧基乙酸酯(sfpa)。[0324]本文所述的接头可与本文所述的异源部分以任何组合使用。本文所述的所有上文列出的接头和异源部分均可商购和/或可通过包括上文列出的参考文献中描述的那些技术的常规技术制备。[0325]缀合[0326]异源部分与抗原结合蛋白的比率(har)表示每个抗原结合分子连接的异源部分的数量。在一些实施方案中，har在1至15、1至10、1至9、1至8、1至7、1至6、1至5、1至4、1至3或1至2的范围内。在一些实施方案中，har在2至10、2至9、2至8、2至7、2至6、2至5、2至4或2至3的范围内。在其他实施方案中，har是约2、约2.5、约3、约4、约5或约6。在一些实施方案中，har在约2至约4的范围内。har可通过常规手段表征，如质谱、uv/vis光谱、elisa测定和/或hplc。[0327]在一些实施方案中，缀合物是异质缀合物(也称为“常规的”)，其中抗原结合蛋白缀合至不同数量的异源部分。在一些实施方案中，异质缀合物遵循缀合物的高斯分布或准高斯分布，其中分布集中在平均异源部分负载值上，其中一些抗原结合蛋白以高于平均值缀合，而一些抗原结合蛋白以低于平均值缀合。[0328]在一些实施方案中，缀合物是均质缀合物，其中相当大百分比的抗原结合蛋白缀合至确定数量的异源部分。在一些实施方案中，均质缀合物包含1、2、3、4、5、6、7、8、9或10的har。在一些实施方案中，均质缀合物包含2、4、6或8的har。在优选实施方案中，均质缀合物包含4的har。在其他优选实施方案中，均质缀合物包含2的har。在一些实施方案中，均质缀合物包含大于或等于70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77％、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％的具有限定har的缀合物。在一些实施方案中，均质缀合物包含约70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77％、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％的具有限定har的缀合物。在一些实施方案中，均质缀合物包含至少70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77％、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％的具有限定har的缀合物。在一些实施方案中，同质缀合物包含非高斯或准高斯分布的har分布。在一些实施方案中，均质缀合物的同质性通过色谱图确定，例如hplc或任何合适的色谱。在一些实施方案中，色谱图是hic色谱图。均质缀合物可通过位点特异性缀合产生。[0329]在一些实施方案中，异源部分以位点特异性方式与抗原结合蛋白(例如，抗体)缀合。各种位点特异性缀合方法是本领域已知的，例如，thiomab或tdc或在未配对的半胱氨酸残基处缀合(junutula等人(2008)nat.biotechnol.26:925-932；dimasi等人(2017)mol.pharm.14:1501-1516；shen等人(2012)nat.biotechnol.30:184-9)；硫醇桥接头(behrens等人(2015)mol.pharm.12:3986-98)；使用转谷氨酰胺酶在谷氨酰胺处缀合(dennler等人(2013)methodsmol.bio.1045:205-15；dennler等人(2014)bioconjugchem.25:569-78)；在工程改造的非天然氨基酸残基处缀合(axup等人(2012)procnatlacadsciu.s.a.104-16101-6；tian等人(2014)procnatlacadsciu.s.a.111:1766-71；vanbrunt等人(2015)bioconjugchem26:2249-60；zimmerman等人(2014)bioconjugchem25:351-61)；硒代半胱氨酸结合(li等人(2017)cellchembiol24:433-442)；聚糖介导的缀合(okeley等人(2013)bioconjugchem24:1650-5)；半乳糖或galnac类似物处的缀合(ramakrishnan和qasba(2002)jbiolchem277:20833-9；vangeel等人(2015)bioconjugchem26:2233-42)；通过聚糖工程改造(zhou等人(2014)bioconjugchem25:510-20；tang等人(2017)natprotoc12:1702-1721)；通过短肽标签，如工程改造谷氨酰胺标签或分选酶a介导的转肽作用(strop等人(2013)chembiol20:161-7；beerli等人(2015)plosone10:e0131177)；以及通过醛标签(wu等人(2009)procnatlacadsciu.s.a.106:3000-5)。[0330]缀合物(例如，adc)的不可预测性[0331]仅基于抗体谱或药物有效负载谱，不可能提前预测哪些抗体-药物缀合物对于临床应用将是足够安全和有效的。例如，特定的药物有效负载当与针对一个靶标的抗体缀合时可发挥很好的作用，但当与针对不同靶标的抗体缀合或甚至与针对同一靶标的不同抗体缀合时，它的作用可能几乎没有。不同的抗体-药物缀合物在体内展现出不同的抗肿瘤活性的原因还没有得到充分的理解，以至于无法在新的抗体-药物缀合物的设计中进行准确预测。据推测，许多因素的不可预测的相互作用在起作用。这些因素可包括，例如，抗体-药物缀合物对靶抗原的结合亲和力、缀合物渗透实体瘤的能力以及在循环中适当暴露于肿瘤而不引起毒性的半衰期。[0332]仅抗体亲和力就很好地证明了复杂性和不可预测性。具有高亲和力的抗体或抗体-药物缀合物追踪具有更好的细胞摄取，从而导致细胞内释放出更高水平的细胞毒性有效负载。还已知较高的亲和力可增强抗体依赖性细胞毒性(adcc)。所有这些属性都有利于抗体-药物缀合物的细胞杀伤性质。然而，众所周知，抗体或抗体-药物缀合物的高亲和力可通过“抗原屏障效应”阻止有效的肿瘤渗透，从而表明为了在体内实现强大的抗肿瘤活性，抗体-药物缀合物的亲和力必须恰到好处：不要太高或太低。迄今为止，尚不清楚如何预测抗体-药物缀合物的最高效或最有效的亲和力水平。[0333]此外，仅通过接头和有效负载的机制无法预测体内抗肿瘤活性。例如，o.ab等人,mol.cancerther.14(&):1605-1613(2015)证明，当在临床前癌症模型中进行测试时，通过不同接头与相同抗微管蛋白毒素缀合的相同抗体表现出截然不同的抗肿瘤活性。这一实例是特别出人意料的，因为两个接头的化学结构非常相似。此外，存在于高级缀合物中的接头含有亲水性部分。亲水性代谢物的膜渗透性通常较低，并且被认为从溶酶体(缀合物降解的位点)流出的速度较慢，从而导致释放的有效负载的抗微管蛋白活性延迟。这一发现支持有效负载递送的“理想”动力学，但迄今为止，还没有深入了解此类动力学的构成。增加这种复杂性的是悬而未决的问题，即有效负载递送的理想动力学(即使是针对特定细胞类型定义的)是否将适用于所有细胞类型。因此，仅从接头或有效负载的化学组成不可能预测最有效的体内抗肿瘤活性。[0334]组合物、药物组合物和制剂[0335]本文提供了包含如当前公开的抗原结合蛋白、核酸、载体、宿主细胞或缀合物的组合物。在一些方面，所述组合物包含分离和/或纯化形式的抗原结合蛋白。在一些方面，所述组合物包含本公开的单一类型(例如，结构)的抗原结合蛋白或包含本公开的两种或更多种抗原结合蛋白的组合，其中所述组合包含两种或更多种不同类型(例如，结构)的抗原结合蛋白。[0336]在一些方面，所述组合物包含增强抗原结合蛋白的化学-物理特征的剂，例如通过在某些温度(例如室温)下稳定抗原结合蛋白、延长保质期、减少降解(例如氧化蛋白酶介导的降解)、增加抗原结合蛋白的半衰期等。在一些方面，所述组合物包含作为异源部分或缀合物部分的本文公开的任何剂，任选地与本公开的抗原结合蛋白混合或缀合至抗原结合蛋白。[0337]在本公开的各个方面，所述组合物另外包含药学上可接受的载剂、稀释剂或赋形剂。在一些实施方案中，将如当前公开的抗原结合蛋白、核酸、载体、宿主细胞或缀合物(下文称为“活性剂”)配制成包含活性剂以及药学上可接受的载剂、稀释剂或赋形剂的药物组合物。在此方面，本公开进一步提供了包含活性剂的药物组合物，所述药物组合物旨在施用于受试者，例如哺乳动物。[0338]在一些实施方案中，活性剂以适合施用于患者的纯度水平存在于药物组合物中。在一些实施方案中，活性剂具有至少约90％、约91％、约92％、约93％、约94％、约95％、约96％、约97％、约98％或约99％的纯度水平，以及药学上可接受的稀释剂、载剂或赋形剂。在一些实施方案中，所述组合物含有浓度为约0.001至约30.0mg/ml的活性剂。[0339]在各个方面，所述药物组合物包含药学上可接受的载剂。如本文所用，术语“药学上可接受的载剂”包括任何标准药物载剂，如磷酸盐缓冲盐水溶液、水、乳液(如油/水或水油型乳液)以及各种类型的润湿剂。所述术语还包括美国联邦政府监管机构批准的或美国药典中列出的用于动物(包括人)的任何剂。[0340]药物组合物可包含任何药学上可接受的成分，包括例如酸化剂、添加剂、吸附剂、气溶胶推进剂、空气置换剂、碱化剂、抗结块剂、抗凝剂、抗微生物防腐剂、抗氧化剂、防腐剂、碱、粘合剂、缓冲剂、螯合剂、包衣剂、着色剂、干燥剂、洗涤剂、稀释剂、消毒剂、崩解剂、分散剂、溶解增强剂、染料、润肤剂、乳化剂、乳化稳定剂、填充剂、成膜剂、增味剂、调味剂、流动增强剂、胶凝剂、造粒剂、保湿剂、润滑剂、粘膜粘附剂、软膏基质、软膏、油质媒介物、有机基质、锭剂基质、颜料、增塑剂、抛光剂、防腐剂、螯合剂、皮肤渗透剂、增溶剂、溶剂、稳定剂、栓剂基质、表面活性剂(surfaceactiveagent)、表面活性剂(surfactant)、悬浮剂、甜味剂、治疗剂、增稠剂、张力剂、毒性剂、增粘剂、吸水剂、水混溶性助溶剂、水软化剂或润湿剂。参见例如，thehandbookofpharmaceuticalexcipients,第三版,a.h.kibbe(pharmaceuticalpress,london,uk,2000)，其以引用的方式整体并入。remington’spharmaceuticalsciences,第十六版,e.w.martin(mackpublishingco.,easton,pa.,1980)，其以引用的方式整体并入。[0341]在各个方面，药物组合物包含在所采用的剂量和浓度下对接受者无毒的配制材料。在具体实施方案中，药物组合物包含活性剂和一种或多种药学上可接受的盐；多元醇；表面活性剂；渗透平衡剂；张力剂；抗氧化剂；抗生素；抗真菌剂；填充剂；冻干保护剂；消泡剂；螯合剂；防腐剂；着色剂；镇痛剂；或另外的药剂。在各个方面，药物组合物包含一种或多种多元醇和/或一种或多种表面活性剂，任选地，除了一种或多种赋形剂外，包括但不限于药学上可接受的盐；渗透平衡剂(张力剂)；抗氧化剂；抗生素；抗真菌剂；填充剂；冻干保护剂；消泡剂；螯合剂；防腐剂；着色剂；和镇痛剂。[0342]在某些实施方案中，药物组合物可含有用于调节、维持或保持例如组合物的ph、摩尔渗透压浓度、粘度、澄清度、颜色、等张性、气味、无菌性、稳定性、溶解或释放速率、吸收或渗透的配制材料。在此类实施方案中，合适的配制材料包括但不限于氨基酸(如甘氨酸、谷氨酰胺、天冬酰胺、精氨酸或赖氨酸)；抗微生物剂；抗氧化剂(如抗坏血酸、亚硫酸钠或亚硫酸氢钠)；缓冲剂(如硼酸盐、碳酸氢盐、tris-hcl、柠檬酸盐、磷酸盐或其它有机酸)；增积剂(如甘露糖醇或甘氨酸)；螯合剂(如乙二胺四乙酸(edta))；络合剂(如咖啡碱(caffeine)、聚乙烯吡咯烷酮、β-环糊精或羟丙基-β-环糊精)；填充剂；单糖；双糖；和其它碳水化合物(如葡萄糖、甘露糖或糊精)；蛋白质(如血清白蛋白、明胶或免疫球蛋白)；着色剂、调味剂和稀释剂；乳化剂；亲水性聚合物(如聚乙烯吡咯烷酮)；低分子量多肽；成盐相对离子(如钠)；防腐剂(如氯化苯甲烃铵、苯甲酸、水杨酸、硫柳汞(thimerosal)、苯乙醇、对羟基苯甲酸甲酯、对羟基苯甲酸丙酯、氯己定(chlorhexidine)、山梨酸(sorbicacid)或过氧化氢)；溶剂(如甘油、丙二醇或聚乙二醇)；糖醇(如甘露糖醇或山梨糖醇)；混悬剂；界面活性剂或湿润剂(如普洛尼克(pluronic)、peg、脱水山梨醇酯、聚山梨醇酯(如聚山梨醇酯20、聚山梨醇酯)、曲通(triton)、缓血酸胺(tromethamine)、卵磷脂(lecithin)、胆固醇、泰洛沙泊(tyloxapal))；稳定性增强剂(如蔗糖或山梨糖醇)；张力增强剂(如碱金属卤化物(优选氯化钠或氯化钾)、甘露糖醇山梨糖醇)；递送媒介物；稀释剂；赋形剂和/或药物佐剂。参见remington'spharmaceuticalsciences,第18版,(a.r.genrmo编),1990,mackpublishingcompany。[0343]可配制药物组合物以达到生理相容的ph值。在一些实施方案中，药物组合物的ph可以是例如介于约4或约5与约8.0或约4.5和约7.5或约5.0至约7.5之间。在各种实施方案中，药物组合物的ph介于5.5与7.5之间。[0344]本公开提供了生产药物组合物的方法。在各个方面，所述方法包括将抗原结合蛋白、缀合物、融合蛋白、核酸、载体、宿主细胞或其组合与药学上可接受的载剂、稀释剂或赋形剂组合。[0345]施用途径[0346]关于本公开，活性剂或包含活性剂的药物组合物可通过任何合适的施用途径施用于受试者。例如，活性剂可通过胃肠外、经鼻、经口、肺部、局部、阴道或直肠施用而施用于受试者。提供以下关于施用途径的论述仅用于说明各种实施方案并且不应被解释为以任何方式限制范围。[0347]用于胃肠外施用的制剂包括水性和非水性等张无菌注射溶液，其可含有抗氧化剂、缓冲剂、抑菌剂和致使制剂与预定接受者的血液等张的溶质；以及水性和非水性无菌悬浮液，其可包含悬浮剂、增溶剂、增稠剂、稳定剂以及防腐剂。术语“胃肠外”是指不是通过消化道而是通过一些其他途径，如皮下、肌肉内、脊柱内或静脉内。本公开的活性剂可在药物载剂(诸如无菌液体或液体混合物)中与生理学上可接受的稀释剂一起施用，所述无菌液体或液体混合物包括水、盐水、水性右旋糖以及相关糖溶液、醇(诸如乙醇或十六烷醇)、二醇(诸如丙二醇或聚乙二醇)、二甲亚砜、甘油、缩酮如2,2-二甲基-l53-二氧戊环-4-甲醇、醚、聚(乙二醇)400、油、脂肪酸、脂肪酸酯或甘油酯或乙酰化脂肪酸甘油酯，其中添加或不添加药学上可接受的表面活性剂，诸如皂或洗涤剂、悬浮剂诸如果胶、卡波姆、甲基纤维素、羟丙基甲基纤维素或羧甲基纤维素或乳化剂和其他药物佐剂。[0348]可用于胃肠外制剂的油包括石油、动物油、植物油或合成油。油的具体实例包括花生、大豆、芝麻、棉籽、玉米、橄榄、凡士林和矿物。适用于胃肠外制剂的脂肪酸包括油酸、硬脂酸和异硬脂酸。油酸乙酯和肉豆蔻酸异丙酯是合适的脂肪酸酯的实例。[0349]用于胃肠外制剂的合适的皂包括脂肪碱金属、铵和三乙醇胺盐，并且合适的洗涤剂包括(a)阳离子洗涤剂，诸如二甲基二烷基卤化铵和烷基吡啶鎓卤化物，(b)阴离子洗涤剂，例如像烷基、芳基和烯烃磺酸酯、烷基、烯烃、醚以及单酸甘油酯硫酸酯和磺基琥珀酸盐，(c)非离子洗涤剂，例如像脂肪胺氧化物、脂肪酸链烷醇酰胺和聚氧乙烯-聚丙烯共聚物，(d)两性洗涤剂，例如像烷基-β-氨基丙酸盐和2-烷基-咪唑啉季铵盐以及(e)它们的混合物。[0350]在一些实施方案中，胃肠外制剂在溶液中含有约0.5重量％至约25重量％的本公开的活性剂。可使用防腐剂和缓冲剂。为了最小化或消除注射部位的刺激，此类组合物可含有具有约12至约17的亲水-亲油平衡(hlb)的一种或多种非离子表面活性剂。此类制剂中的表面活性剂的量通常将在约5重量％至约15重量％的范围内。合适的表面活性剂包括聚乙二醇脱水山梨糖醇脂肪酸酯，诸如脱水山梨醇单油酸酯和环氧乙烷与疏水基质的高分子量加合物，通过环氧丙烷与丙二醇的缩合形成的。在一些方面，胃肠外制剂可以单位剂量或多剂量密封容器，如安瓿和小瓶形式呈现，并且可储存于冷冻干燥(冻干)条件下，仅需在使用前即刻添加无菌液体赋形剂(例如水)以供注射。在一些方面，临时注射溶液和悬浮液是由前述种类的无菌粉末、颗粒剂和片剂制备的。[0351]可注射制剂根据本公开。可注射组合物对有效药物载剂的要求是本领域普通技术人员众所周知的(参见例如，pharmaceuticsandpharmacypractice,j.b.lippincottcompany,philadelphia,pa,banker和chalmers,编,第238-250页(1982)；以及ashphandbookoninjectabledrugs,toissel,第4版,第622-630页(1986)。[0352]剂量[0353]据信本公开的活性剂可用于抑制肿瘤生长的方法以及如本文进一步描述的其他方法(包括治疗或预防癌症的方法)中。出于本公开的目的，所施用的活性剂的量或剂量应足以在合理的时间范围内在受试者或动物中实现例如治疗性或预防性应答。例如，本公开的活性剂的剂量应足以从施用时起约1至4分钟、1至4小时或1至4周或更长时间，例如5至20周或更多周的时间段内治疗如本文所述的癌症。在某些实施方案中，所述时间段甚至可更长。剂量将由特定活性剂的功效和动物(例如人)的状况以及待治疗的动物(例如人)的体重决定。[0354]用于确定施用剂量的许多测定是本领域已知的。出于本文的目的，包括以下方面的测定可用于确定待施用于哺乳动物的起始剂量：比较在向一组哺乳动物中的哺乳动物施用给定剂量的本公开的活性剂后癌症治疗的程度，其中每组被给予不同剂量的活性剂。施用特定剂量后治疗癌症的程度可由例如在小鼠异种移植物模型中使用活性剂实现的肿瘤消退程度来表示。测定肿瘤消退的方法是本领域已知的并且在本文的实施例中进行了描述。[0355]本公开的活性剂的剂量也将由可能伴随本公开的特定活性剂的施用的任何不利副作用的存在、性质和程度来确定。通常，主治医师将决定用于治疗每个个体患者的本公开的活性剂的剂量，考虑多种因素，如年龄、体重、一般健康、饮食、性别、所施用的本公开的活性剂、施用途径和所治疗疾患的严重程度。举例来说且不旨在限制本公开，本公开的活性剂的剂量可以是约0.0001至约1g/kg所治疗受试者的体重/天、约0.0001至约0.001g/kg体重/天或约0.01mg至约1g/kg体重/天。[0356]控制释放制剂[0357]在一些实施方案中，本文所述的活性剂可被修饰成贮库形式，使得本公开的活性剂释放到其被施用的身体中的方式关于时间和体内的位置进行控制(参见例如，美国专利第4,450,150号)。本公开的活性剂的贮库形式可以是例如包含活性剂和多孔或无孔材料(例如聚合物)的可植入组合物，其中活性剂被材料包封或扩散到材料中和/或无孔材料的降解。然后将贮库植入受治疗者体内的所需位置，并且活性剂以预定速率从植入物释放。[0358]在某些方面，包含活性剂的药物组合物被修饰以具有任何类型的体内释放特征。在一些方面，药物组合物是立即释放、受控释放、持续释放、延长释放、延迟释放或双相释放制剂。配制用于受控释放的肽的方法是本领域已知的。参见例如，qian等人,jpharm374:46-52(2009)和国际专利申请公布号wo2008/130158；wo2004/033036；wo2000/032218；和wo1999/040942。[0359]本发明组合物还可包含例如微胶粒或脂质体或一些其它包封形式，或者可以延迟释放的方式施用以提供持久储存和/或递送效果。[0360]用途[0361]本公开的抗原结合蛋白可用于抑制肿瘤生长。不受特定理论的束缚，本文提供的抗原结合蛋白的抑制作用允许此类实体可用于治疗癌症的方法中。[0362]因此，本文提供了抑制受试者的肿瘤生长的方法和减小受试者的肿瘤大小的方法。在各种实施方案中，所述方法包括向所述受试者施用有效抑制受试者的肿瘤生长或减小肿瘤大小的量的本公开的药物组合物。在各个方面，卵巢肿瘤、黑素瘤肿瘤、膀胱肿瘤或子宫内膜肿瘤的生长受到抑制。在各个方面，卵巢肿瘤、黑素瘤肿瘤、膀胱肿瘤或子宫内膜肿瘤的大小减小。[0363]如本文所用，术语“抑制”或“减少”以及源自其的词可能不是100％或完全抑制或减小。而是，存在不同程度的抑制或减小，本领域的普通技术人员认为其具有潜在的益处或治疗效果。在此方面，本公开的抗原结合蛋白可抑制肿瘤生长或将肿瘤大小减小至任何量或水平。在各种实施方案中，本公开的方法所提供的抑制是至少或约10％抑制(例如，至少或约20％抑制、至少或约30％抑制、至少或约40％抑制、至少或约50％抑制、至少或约60％抑制、至少或约70％抑制、至少或约80％抑制、至少或约90％抑制、至少或约95％抑制、至少或约98％抑制)。在各种实施方案中，本公开的方法所提供的减小是至少或约10％减小(例如，至少或约20％减小、至少或约30％减小、至少或约40％减小、至少或约50％减小、至少或约60％减小、至少或约70％减小、至少或约80％减小、至少或约90％减小、至少或约95％减小、至少或约98％减小)。[0364]本文另外提供了治疗患有癌症(例如表达cldn6的癌症)的受试者的方法。在各种实施方案中，所述方法包括向所述受试者施用有效治疗所述受试者的癌症的量的本公开的药物组合物。[0365]出于本文的目的，本文公开的方法的癌症可以是任何癌症，例如由异常和不受控制的细胞分裂引起的任何恶性生长或肿瘤，所述恶性生长或肿瘤可通过淋巴系统或血流扩散至身体的其他部位。在一些方面，癌症是选自由以下组成的组的癌症：急性淋巴细胞癌、急性骨髓性白血病、肺泡横纹肌肉瘤、骨癌、脑癌、乳腺癌、肛门癌、肛管癌或肛门直肠癌、眼癌、肝内胆管癌、关节癌、颈癌、胆囊癌或胸膜癌、鼻癌、鼻腔癌或中耳癌、口腔癌、外阴癌、慢性淋巴细胞性白血病、慢性骨髓性癌症、结肠癌、食道癌、宫颈癌、胃肠类癌、霍奇金淋巴瘤、下咽癌、肾癌、喉癌、肝癌、肺癌、恶性间皮瘤、黑素瘤、多发性骨髓瘤、鼻咽癌、非霍奇金淋巴瘤、卵巢癌、胰腺癌、腹膜癌、网膜癌和肠系膜癌、咽癌、前列腺癌、直肠癌、肾癌(例如，肾细胞癌(rcc))、小肠癌、软组织癌、胃癌、睾丸癌、甲状腺癌、输尿管癌和膀胱癌。在特定方面，癌症选自由以下组成的组：头颈癌、卵巢癌、宫颈癌、膀胱癌和食道癌、胰腺癌、胃肠癌、胃癌、乳腺癌、子宫内膜癌和结肠直肠癌、肝细胞癌、成胶质细胞瘤、膀胱癌、肺癌(例如，非小细胞肺癌(nsclc))、细支气管肺泡癌。在各个方面，癌症是卵巢癌、黑素瘤、膀胱癌、肺癌、肝癌、子宫内膜癌。在各个方面，癌症是以cldn6的中度至高度表达为特征的任何癌症。参见例如，图1-图3。在各个方面，癌症是急性骨髓性白血病、大b细胞淋巴瘤、胃癌、前列腺癌、黑素瘤、结肠癌、直肠癌、膀胱癌、宫颈癌、肝癌、乳腺癌、肾透明细胞癌、头颈癌、肉瘤、肾嫌色细胞癌、低级别胶质瘤、肾上腺皮质癌、成胶质细胞瘤、肾乳头状细胞癌、肺鳞状细胞癌、甲状腺癌、肺腺癌、胰腺癌、子宫内膜癌、子宫癌肉瘤或卵巢癌。在各个方面，癌症选自卵巢癌、子宫内膜样癌、子宫癌、肺癌、胃癌、乳腺癌、头颈部鳞状细胞癌(hnscc)、宫颈癌和膀胱癌。[0366]如本文所用，术语“治疗”以及与其有关的词语不一定意味着100％或完全治疗。而是，存在不同程度的治疗，本领域普通技术人员认为所述治疗具有潜在益处或治疗效果。在此方面，本公开的治疗癌症的方法可提供任何量或任何水平的治疗。此外，由本公开的方法提供的治疗可包括治疗一种或多种正在治疗的癌症的疾患或症状或体征。此外，由本公开的方法提供的治疗可包括减缓癌症的进展。例如，所述方法可通过增强t细胞活性或针对癌症的免疫应答、减少肿瘤或癌症生长、减少肿瘤细胞的转移、增加肿瘤或癌细胞的细胞死亡等来治疗癌症。在各个方面，所述方法通过将癌症的发作或复发延迟至少1天、2天、4天、6天、8天、10天、15天、30天、两个月、3个月、4个月、6个月、1年、2年、3年、4年或更长时间来治疗。在各个方面，所述方法通过增加受试者的存活来治疗。[0367]本公开的抗原结合蛋白还可用于检测样品中的cldn6或诊断cldn6阳性癌症。因此，本公开提供了检测样品中的密封蛋白6(cldn6)的方法。在各种实施方案中，所述方法包括使样品与如本文所述的抗原结合蛋白、缀合物或融合蛋白接触，以及测定包含与cldn6结合的抗原结合蛋白、缀合物或融合蛋白的免疫复合物。本公开还提供了诊断受试者中的密封蛋白6(cldn6)阳性癌症的方法。在各种实施方案中，所述方法包括使包含从受试者获得的细胞或组织的生物样品与如本文所述的抗原结合蛋白、缀合物或融合蛋白接触，以及测定包含与cldn6结合的抗原结合蛋白、缀合物或融合蛋白的免疫复合物。[0368]受试者[0369]在本公开的一些实施方案中，受试者是哺乳动物，包括但不限于啮齿目哺乳动物，如小鼠和仓鼠；和兔形目哺乳动物，如兔；食肉目哺乳动物，包括猫科动物(猫)和犬科动物(狗)；偶蹄目哺乳动物，包括牛科动物(牛)和猪科动物(猪)；或奇蹄目哺乳动物，包括马科动物(马)。在一些方面，哺乳动物是灵长目、直翅目(ceboid)或类猴目(猴)或类人猿目(人和猿)。在一些方面，哺乳动物是人。[0370]药盒[0371]在一些实施方案中，将本公开的抗原结合蛋白提供在药盒中。在各个方面，药盒包含作为单位剂量的抗原结合蛋白。出于本文的目的，“单位剂量”是指分散在合适载剂中的离散量。在各个方面，单位剂量是足以向受试者提供所需效果(例如抑制肿瘤生长、减小肿瘤大小、治疗癌症)的量。因此，本文提供了包含任选地以单位剂量提供的本公开的抗原结合蛋白的药盒。在各个方面，药盒包含若干单位剂量，例如一周或一个月供应的单位剂量，任选地，每个单位剂量单独包装或以其他方式与其他单位剂量分开。在一些实施方案中，药盒/单位剂量的组分与施用于患者的说明书一起包装。在一些实施方案中，药盒包含一个或多个用于向患者施用的装置，例如针头和注射器等。在一些方面，将本公开的抗原结合蛋白、其药学上可接受的盐、包含抗原结合蛋白的缀合物、或包含抗原结合蛋白的多聚体或二聚体预先包装在即用型形式(例如注射器、静脉内袋等)中。在一些方面，药盒还包含其他治疗剂或诊断剂或药学上可接受的载剂(例如溶剂、缓冲剂、稀释剂等)，包括本文所述的那些中的任一种。在特定方面，药盒包含本公开的抗原结合蛋白以及用于化学疗法或放射疗法的剂(例如治疗剂)。[0372]各种实施方案[0373]在本公开的各种实施方案中，双特异性抗原结合蛋白结合至人密封蛋白6(cldn6)蛋白(seqidno:200)和第二抗原，其中(a)所述抗原结合蛋白结合至cldn6的细胞外结构域(ecd)的细胞外环2(el2)，并且不结合至cldn6的ecd的细胞外环1(el1)；或(b)不结合至密封蛋白3(cldn3)、密封蛋白4(cldn4)和密封蛋白9(cldn9)中的任一者，并且以小于约1200nm抑制参考抗体与由ovca429细胞内源性表达的cldn6的结合；或(c)它们的组合。在各种情况下，双特异性抗原结合蛋白结合至氨基酸序列wtahaiirdfynplvaeaqkrel(seqidno:2)内的表位，或结合至cldn6的氨基酸序列tahaiirdfynpl(seqidno:3)或lvaeaqkrel(seqidno:4)。在各个方面，双特异性抗原结合蛋白不结合至密封蛋白3(cldn3)、密封蛋白4(cldn4)和密封蛋白9(cldn9)中的任何一者或多者。在各种情况下，双特异性抗原结合蛋白不结合至cldn3。在各种情况下，双特异性抗原结合蛋白结合至cldn6、cldn4和cldn9，但不结合至cldn3。在各种情况下，双特异性抗原结合蛋白结合至cldn6和cldn4，但不结合至cldn3或cldn9。在各个方面，双特异性抗原结合蛋白结合至cldn6和no:10)。[0379]提供了一种双特异性抗原结合蛋白，其中所述双特异性抗原结合蛋白包含：(a)hccdr1，所述hccdr1包含氨基酸序列ftfsxyx，其中位置5的x是n、s、r、q或a，并且位置7的x是w、h、y、f(seqidno:455)，任选地，包含氨基酸序列ftfsnyw(seqidno:23)；(b)hccdr2，所述hccdr2包含氨基酸序列irlkxdxyat，其中位置5的x是s、n、a或t，并且位置7的x是q、s、a、n(seqidno:456)，任选地，包含氨基酸序列irlksdnyat(seqidno:24)；(c)hccdr3，所述hccdr3包含氨基酸序列xdgppsgx，其中位置1的x是n、d或t，并且位置8的x是s、t、a、c或y(seqidno:457)，任选地，包含氨基酸序列ndgppsgc(seqidno:25)；(d)lccdr1，所述lccdr1包含氨基酸序列exiysy，其中x是q、s、a、d或n(seqidno:476)，任选地，包含氨基酸序列eniysy(seqidno:20)；(e)lccdr2，所述lccdr2包含氨基酸序列xak，其中位置1的x是q、s、a、d或n(seqidno:477)，任选地包含氨基酸序列nak(seqidno:21)；以及(f)lccdr3，所述lccdr3包含氨基酸序列qxhyxvpwt，其中位置2的x是h、q、s或t，并且位置5的x是t、s、n或g(seqidno:454)，任选地，包含氨基酸序列qhhytvpwt(seqidno:22)。[0380]提供了一种双特异性抗原结合蛋白，所述双特异性抗原结合蛋白包含(a)hccdr1，所述hccdr1包含氨基酸序列ytxtxyt，其中位置3的x是f、y、s或t，并且位置5的x是s、t、y或d(seqidno:461)，任选地，包含氨基酸序列ytftsyt(seqidno:29)；(b)hccdr2，所述hccdr2包含氨基酸序列ixpssxyt，其中位置2的x是q、s、a或n，并且位置6的x是t、s、v、d或g(seqidno:462)，任选地，包含氨基酸序列inpsstyt(seqidno:30)；(c)hccdr3，所述hccdr3包含氨基酸序列xrgexggfay，其中位置1的x是s、a、t或v，并且位置5的x是l、v或f(seqidno:463)，任选地，包含氨基酸序列srgelggfay(seqidno:31)；(d)lccdr1，所述lccdr1包含氨基酸序列qslvhsxgxty，其中位置7的x是d、n、e、q、s或a，并且位置9的x是q、s、a、d或n(seqidno:458)，任选地，包含氨基酸序列qslvhsdgnty(seqidno:26)；(e)lccdr2，所述lccdr2包含氨基酸序列xvx，其中位置1的x是k、q或r，并且位置3的x是s、t或v(seqidno:459)，任选地，包含氨基酸序列kvs(seqidno:27)；以及(f)lccdr3，所述lccdr3包含氨基酸序列sxxthvpyt，其中位置2的x是q、h或t，并且位置3的x是s、g、t或d(seqidno:460)，任选地，包含氨基酸序列sqsthvpyt(seqidno:28)。[0381]在各种实施方案中，双特异性抗原结合蛋白包含：[0382](a)seqidno:504或seqidno:507的重链cdr1氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；[0383](b)seqidno:505或seqidno:508的重链cdr2氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；[0384](c)seqidno:506或seqidno:509的重链cdr3氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；[0385](d)seqidno:449或seqidno:476的轻链cdr1氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；[0386](e)seqidno:450或seqidno:477的轻链cdr2氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；[0387](f)seqidno:451或seqidno:454的轻链cdr3氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；[0388](g)(a)-(f)中的任何两者或更多者的组合。[0389]任选地，变体序列具有至少约80％、至少或约85％、至少或约90％或至少或约95％序列同一性。[0390]在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白包含seqidno:449的轻链cdr1氨基酸序列、seqidno:450的轻链cdr2氨基酸序列和seqidno:451的轻链cdr3氨基酸序列，以及seqidno:504的重链cdr1氨基酸序列、seqidno:505的重链cdr2氨基酸序列和seqidno:506的重链cdr3氨基酸序列中的一个或两个。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:476的轻链cdr1氨基酸序列、seqidno:477的轻链cdr2氨基酸序列和seqidno:454的轻链cdr3氨基酸序列，以及seqidno:507的重链cdr1氨基酸序列、seqidno:508的重链cdr2氨基酸序列和seqidno:509的重链cdr3氨基酸序列中的一个或两个。任选地，抗原结合蛋白包含选自由以下组成的组的六个cdr氨基酸序列：seqidno:449-451和504-506；以及seqidno:476、477、454和507-509。[0391]在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白包含：(a)seqidno:490-503中的任一个的重链可变区氨基酸序列，或在图22中标记为s1-s12的重链可变区氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；(b)seqidno:380-383、388-390、479和481中的任一个的轻链可变区氨基酸序列，或在图22中标记为s1-s12的轻链可变区氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；或(c)(a)和(b)两者。在一些方面，变体序列具有至少约80％或至少约85％序列同一性，或者变体序列具有至少约90％或至少约95％序列同一性。[0392]在示例性情况下，双特异性抗原结合蛋白包含一对氨基酸序列：[0393]seqidno:389和490；[0394]seqidno:389和491；[0395]seqidno:389和492；[0396]seqidno:389和493；[0397]seqidno:389和494；[0398]seqidno:389和495；[0399]seqidno:383和496；[0400]seqidno:383和497；[0401]seqidno:383和498；[0402]seqidno:383和499；[0403]seqidno:383和500；[0404]seqidno:383和501；[0405]seqidno:383和503；[0406]seqidno:389和502；[0407]在图22中标记为s1的重链可变区序列和在图22中标记为s1的轻链可变区序列；[0408]在图22中标记为s2的重链可变区序列和在图22中标记为s2的轻链可变区序列；[0409]在图22中标记为s3的重链可变区序列和在图22中标记为s3的轻链可变区序列；[0410]在图22中标记为s4的重链可变区序列和在图22中标记为s4的轻链可变区序列；[0411]在图22中标记为s5的重链可变区序列和在图22中标记为s5的轻链可变区序列；[0412]在图22中标记为s6的重链可变区序列和在图22中标记为s6的轻链可变区序列；[0413]在图22中标记为s7的重链可变区序列和在图22中标记为s7的轻链可变区序列；[0414]在图22中标记为s78的重链可变区序列和在图22中标记为s8的轻链可变区序列；[0415]在图22中标记为s89的重链可变区序列和在图22中标记为s9的轻链可变区序列；[0416]在图22中标记为s910的重链可变区序列和在图22中标记为s10的轻链可变区序列；[0417]在图22中标记为s11的重链可变区序列和在图22中标记为s11的轻链可变区序列；或[0418]在图22中标记为s12的重链可变区序列和在图22中标记为s12的轻链可变区序列。[0419]在一些方面，双特异性抗原结合蛋白是抗体，例如单克隆抗体。在各个方面，抗体是igg。任选地，抗原结合蛋白在软琼脂3d增殖测定中抑制至少约50％的集落生长，抑制注射有人癌细胞的异种移植小鼠中的肿瘤生长，抑制注射有卵巢癌细胞、黑素瘤癌细胞、膀胱癌细胞或子宫内膜癌细胞的异种移植小鼠中的肿瘤生长，或抑制注射有卵巢癌细胞、膀胱癌细胞或子宫内膜癌细胞的异种移植小鼠中的至少50％的肿瘤生长。[0420]因此，在各种实施方案中，本公开提供了一种双特异性抗原结合蛋白，所述双特异性抗原结合蛋白包含[0421](a)seqidno:504或seqidno:507的重链cdr1氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；[0422](b)seqidno:505或seqidno:508的重链cdr2氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；[0423](c)seqidno:506或seqidno:509的重链cdr3氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；[0424](d)seqidno:449或seqidno:476的轻链cdr1氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；[0425](e)seqidno:450或seqidno:477的轻链cdr2氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；[0426](f)seqidno:451或seqidno:454的轻链cdr3氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；或[0427](g)(a)-(f)中的任何两者或更多者的组合。[0428]还提供了一种双特异性抗原结合蛋白，所述双特异性抗原结合蛋白包含选自由以下组成的组的六个cdr氨基酸序列：seqidno:449-451和504-506；以及seqidno:476、477、454和507-509。[0429]本公开提供了一种双特异性抗原结合蛋白，所述双特异性抗原结合蛋白包含：[0430](a)seqidno:490-503中的任一个的重链可变区氨基酸序列，或在图22中标记为s1-s12的重链可变区氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；或[0431](b)seqidno:380-383、388-390、479和481中的任一个的轻链可变区氨基酸序列，或在图22中标记为s1-s12的轻链可变区氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；或[0432](c)(a)和(b)两者。[0433]在各个方面，变体序列具有至少约85％序列同一性或约90％或约95％序列同一性。[0434]本公开还提供了一种双特异性抗原结合蛋白，所述双特异性抗原结合蛋白包含选自由以下组成的组的一对氨基酸序列：[0435]seqidno:389和490；[0436]seqidno:389和491；[0437]seqidno:389和492；[0438]seqidno:389和493；[0439]seqidno:389和494；[0440]seqidno:389和495；[0441]seqidno:383和496；[0442]seqidno:383和497；[0443]seqidno:383和498；[0444]seqidno:383和499；[0445]seqidno:383和500；[0446]seqidno:383和501；[0447]seqidno:383和503；[0448]seqidno:389和502；[0449]在图22中标记为s1的重链可变区序列和在图22中标记为s1的轻链可变区序列；[0450]在图22中标记为s2的重链可变区序列和在图22中标记为s2的轻链可变区序列；[0451]在图22中标记为s3的重链可变区序列和在图22中标记为s3的轻链可变区序列；[0452]在图22中标记为s4的重链可变区序列和在图22中标记为s4的轻链可变区序列；[0453]在图22中标记为s5的重链可变区序列和在图22中标记为s5的轻链可变区序列；[0454]在图22中标记为s6的重链可变区序列和在图22中标记为s6的轻链可变区序列；[0455]在图22中标记为s7的重链可变区序列和在图22中标记为s7的轻链可变区序列；[0456]在图22中标记为s78的重链可变区序列和在图22中标记为s8的轻链可变区序列；[0457]在图22中标记为s89的重链可变区序列和在图22中标记为s9的轻链可变区序列；[0458]在图22中标记为s910的重链可变区序列和在图22中标记为s10的轻链可变区序列；[0459]在图22中标记为s11的重链可变区序列和在图22中标记为s11的轻链可变区序列；或[0460]在图22中标记为s12的重链可变区序列和在图22中标记为s12的轻链可变区序列。[0461]本文提供了一种双特异性抗原结合蛋白，所述双特异性抗原结合蛋白包含：[0462](a)如seqidno:510或513或图23或25中所列的重链可变区氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；或[0463](b)如seqidno:511或512或图24或26中所列的轻链可变区氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；或[0464](c)(a)和(b)两者。[0465]本公开还提供了一种抗原结合蛋白，所述抗原结合蛋白包含一对氨基酸序列，其中所述对包含[0466](a)如seqidno:510所列的重链可变区氨基酸序列和如seqidno:511所列的轻链可变区氨基酸序列，或其仅相差1-5个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；任选地，其中所述不同的1-5个氨基酸对于重链如图23中所示或对于轻链如图24中所示，或[0467](b)如seqidno:513所列的重链可变区氨基酸序列和如seqidno:512所列的轻链可变区氨基酸序列，或其仅相差1-5个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；或任选地，其中所述不同的1-5个氨基酸对于重链如图25中所示或对于轻链如图26中所示。[0468]在各个方面，当前公开的抗原结合蛋白包含fc多肽，所述fc多肽包含无岩藻糖基化聚糖。[0469]在各个方面，本公开的双特异性抗原结合蛋白基于抗体，例如单克隆抗体，例如igg。在各个方面，双特异性抗原结合蛋白在软琼脂3d增殖测定中抑制至少约50％的集落生长，或抑制注射有人癌细胞的异种移植小鼠中的肿瘤生长。在各个方面，双特异性抗原结合蛋白抑制注射有卵巢癌细胞、黑素瘤癌细胞、膀胱癌细胞或子宫内膜癌细胞的异种移植小鼠中的肿瘤生长。在各种情况下，双特异性抗原结合蛋白抑制注射有卵巢癌细胞、膀胱癌细胞或子宫内膜癌细胞的异种移植小鼠中的至少50％的肿瘤生长。[0470]本公开提供了包含本文所述的双特异性抗原结合蛋白和异源部分的缀合物。在示例性方面，所述缀合物包含细胞毒性剂或化学治疗剂，例如本文所述的那些中的任一种。在各个方面，化学治疗剂是通过阻断微管蛋白聚合而抑制细胞分裂的抗有丝分裂剂。在一些情况下，抗有丝分裂剂是奥瑞他汀，任选地，mmae。[0471]本公开还提供了包含本文所述的双特异性抗原结合蛋白的融合蛋白。本公开进一步提供了核酸，所述核酸包含编码本公开的抗原结合蛋白、缀合物或融合蛋白的核苷酸序列。本公开提供了包含核酸的载体，所述核酸包含编码本公开的抗原结合蛋白、缀合物或融合蛋白的核苷酸序列。本公开另外提供了包含本公开的核酸或载体的宿主细胞。[0472]本公开提供了一种产生结合至密封蛋白6(cldn6)蛋白的双特异性抗原结合蛋白的方法，所述方法包括(i)在细胞培养基中培养本公开的宿主细胞，其中所述宿主细胞包含核酸，所述核酸包含编码前述权利要求中任一项所述的抗原结合蛋白的核苷酸序列，和(ii)从所述细胞培养基中收获所述抗原结合蛋白。此外，提供了一种产生融合蛋白的方法，所述融合蛋白包含结合至密封蛋白6(cldn6)蛋白的双特异性抗原结合蛋白，所述方法包括(i)在细胞培养基中培养本公开的宿主细胞，其中所述宿主细胞包含核酸，所述核酸包含编码本公开的融合蛋白的核苷酸序列，和(ii)从所述细胞培养基中收获所述融合蛋白。[0473]本公开还提供了一种产生药物组合物的方法，所述方法包括将本公开的双特异性抗原结合蛋白、缀合物、融合蛋白、核酸、载体、宿主细胞或其组合组合与药学上可接受的载剂、稀释剂或赋形剂组合。还提供了药物组合物，所述药物组合物包含本公开的双特异性抗原结合蛋白、缀合物、融合蛋白、核酸、载体、宿主细胞或其组合，以及药学上可接受的载剂、稀释剂或赋形剂。[0474]本文提供了一种治疗患有表达cldn6的癌症的受试者的方法，所述方法包括向所述受试者施用有效治疗所述癌症的量的本文所述的药物组合物。还提供了一种抑制受试者中的肿瘤生长的方法，所述方法包括向所述受试者施用有效抑制肿瘤生长的量的本文所述的药物组合物。本公开提供了一种减小受试者中的肿瘤大小的方法，所述方法包括向所述受试者施用有效减小肿瘤大小的量的本文所述的药物组合物。进一步提供了一种预防受试者的癌症复发的方法，所述方法包括向所述受试者施用有效预防癌症复发的量的本文所述的药物组合物。[0475]本公开提供了一种检测样品中的密封蛋白6(cldn6)的方法，所述方法包括使所述样品与本公开的抗原结合蛋白、缀合物或融合蛋白接触，以及测定包含与cldn6结合的抗原结合蛋白、缀合物或融合蛋白的免疫复合物。本文还提供了一种诊断受试者的密封蛋白6(cldn6)阳性癌症的方法，所述方法包括使包含从所述受试者获得的细胞或组织的生物样品与本公开的抗原结合蛋白、缀合物或融合蛋白接触，以及测定包含与cldn6结合的抗原结合蛋白、缀合物或融合蛋白的免疫复合物。[0476]本公开还提供了一种治疗被诊断为cldn6的低过表达者的受试者的癌症的方法。在各种实施方案中，所述方法包括向所述受试者施用有效预防癌症复发的量的当前公开的药物组合物。在一些方面，施用诱导肿瘤细胞的细胞凋亡，任选地，施用诱导表达cldn6的细胞的细胞凋亡。在各个方面，受试者患有肿瘤并且所述肿瘤被半定量地分类为四个组中的一个：高表达者、中度表达者、低表达者和非表达者。在各种情况下，高表达者被定义为cldn6rna大于12log片段/千碱基百万(fpkm)，其中所述cldn6rna通过rnaseq测量，或者如通过免疫组织化学(ihc)所测量cldn6蛋白水平大于3 。在各种情况下，中度表达者被定义为cldn6rna大于10logfpkm，其中所述cldn6rna通过rnaseq测量，或者如通过ihc所测量cldn6蛋白水平大于2 。在各种情况下，低表达者被定义为cldn6rna大于6logfpkm，其中所述cldn6rna通过rnaseq测量，或者如通过ihc所测量cldn6蛋白水平大于1 。在各种情况下，非表达者被定义为cldn6rna小于6logfpkm，其中所述cldn6rna通过rnaseq测量，或者cldn6蛋白水平低于ihc检测限。在各个方面，患有所述肿瘤的受试者类似地被描述为cldn6的高表达者、中度表达者、低表达者或非表达者。[0477]给出以下实施例仅用于说明本公开，并且不以任何方式限制其范围。[0478]实施例[0479]实施例1[0480]此实施例展示对不同细胞和组织来源中的cldn6rna水平的分析。[0481]为了建立不同来源材料中cldn6表达的基线，测定了由转化肿瘤学研究实验室(torl)创建的患者样品、正常组织和细胞系中的cldn6表达的表达水平。[0482]使用国家癌症研究所(nci)管理的癌症基因组图谱(tcga)数据库中包含的信息测量患者样品中的cldn6rna的水平。使用共同基金维护的基因型-组织表达(gtex)数据库中的信息测量正常组织中的cldn6水平。对来自gtex数据库的组织的分析表明，cldn6可在不同部位检测到，包括脑、垂体、胰腺、肾、肺、甲状腺和子宫颈以及其他组织(图1)。[0483]使用agilent44k微阵列(4x44k阵列芯片，agilenttechnologies,santaclara,ca)和rna测序(rna-seq)测定来测量torl癌细胞系中的cldn6表达水平。rnaseq由bgiamericas(cambridge,ma)使用他们的“rnaseqforquantification”服务进行。如图2和图3所示，卵巢癌、头颈癌、肺癌和膀胱癌细胞表达最高水平的cldn6，但是在乳腺癌、肾癌、结肠癌、肉瘤和肝癌细胞中可检测到cldn6表达水平。[0484]实施例2[0485]此实施例展示经工程改造以过表达cldn6的细胞的产生。[0486]生成了经工程改造以过表达cldn6的模型。这些模型用于确定实施例5中描述的cldn6抗体的功效。简言之，将编码cldn6的核苷酸序列工程改造到具有cmv启动子和脑心肌炎病毒(emcv)的减毒内部核糖体进入位点(ires)的双顺反子载体中。ires位于目标基因(goi)cdna(cldn6)与嘌呤霉素cdna之间。土拨鼠转录后调控元件(wpre)位于嘌呤霉素cdna的下游。所述载体还表达了gfp标记物序列或mycddk标签。含有gfp的表达载体的序列在本文中提供为seqidno:189。[0487]将表达载体病毒转导到hek293t细胞(用于筛选目的)和nih3t3细胞(用于免疫)中。基于在含有嘌呤霉素(1μg/ml)的培养基中的存活选择阳性转导细胞。将阳性细胞亚克隆以获得稳定、均一的cldn6过表达细胞的克隆群体。[0488]使用参考cldn6单克隆抗体(mab)在bdbiosciencesaccuritm流式细胞仪(sanjose,ca)上通过流式细胞术确认亚克隆cldn6表达。二抗和缀合物：alexa647山羊抗小鼠igg(最小x反应性)抗体(biolegend,sandiego,ca；目录号405322)用于检测参考cldn6mab与由亚克隆表达的cldn6之间的结合活性。[0489]cldn6的细胞定位通过荧光显微术使用成像系统(synentec(mountainview,ca)和表达cldn6-绿色荧光蛋白(gfp)融合蛋白的细胞进行测定。如图4所示，在细胞膜中检测到gfp的荧光，从而证明cldn6定位于细胞膜。[0490]实施例3[0491]此实施例展示参考抗体和对照抗体的产生。[0492]基准(参考)cldn6特异性抗体和对照抗体是通过将抗体重链和轻链可变区克隆到expichotm表达系统(thermofisherscientific,waltham,ma)中以产生重组小鼠igg2a嵌合抗体而制备。将这些抗体与实施例5中描述的新产生的cldn6特异性抗体一起进行测试。[0493]简言之，根据制造商的方案，使用expichotm表达系统(目录号：a29133，thermofisherscientific,usa)转染含有对照和基准抗体序列的质粒。将细胞在第1天在37℃和8％co2下培养，然后在转染后在试剂盒中提供的培养基中在32℃和5％co2下培养。通过以1,000g离心10分钟，然后以5,000g离心30分钟澄清expichotm培养基来纯化抗体。然后使用0.45μm过滤器、随后0.22μm过滤器过滤上清液。随后，根据制造商的方案，使用蛋白a/g树脂(lifetechnologies,carlsbad,ca；目录号20424)对上清液进行亲和纯化。在elisa纯化之前，粗略确定培养基中的抗体滴度，以确保负载的培养基的量占据树脂结合能力的小于80％。孵育后，将树脂用pbs洗涤并用洗脱缓冲液(lifetechnologies，目录号21004)洗脱。通过添加tris缓冲液(ph8.0)将洗脱级分立即调节至生理ph。随后使用amiconultra-15离心过滤单元(lifetechnologies，目录号ufc900324)在pbs缓冲液中对纯化的抗体进行缓冲液交换和蛋白质浓缩。抗体浓度通过bca蛋白测定确定。进行sds-page和考马斯染色以测试抗体纯度。将纯化的蛋白质等分并在-80℃下长期储存或在4℃下保存以供立即使用。[0494]抗体的完整性通过sds-page，然后在非还原对比还原条件下进行考马斯染色来验证；在非还原条件下，150kda左右有一条主要带，而在还原条件下，观察到两条带，50kda和25kda。[0495]对具有序列相似性的其他cldn家族成员(图5)，即cldn3、cldn4和cldn9具有特异性的抗体以基本相同的方式产生，例外是质粒中包含的抗体序列是对cldn3、cldn4或cldn9具有特异性的抗体序列。[0496]实施例4[0497]此实施例展示具有高内源性cldn6表达的细胞系的表征。[0498]通过facs和蛋白质印迹分析一组癌细胞系的cldn6内源性表达。简言之，使用过表达cldn6的细胞(例如，过表达cldn6的hek293t细胞，如实施例2中所述)和以高或低水平内源性表达cldn6的细胞系(如实施例1中所确定的)通过facs验证抗体与靶标的结合。将表达cldn6的细胞与参考或对照抗体(如实施例3中所描述)一起在冰上孵育30分钟，并且在洗涤后，与alexa647缀合的山羊抗小鼠igg(最小x反应性)抗体biolegend目录号405322一起在冰上孵育30分钟。荧光由bdbiosciencesaccuritm流式细胞仪(sanjose,ca)读取。[0499]使用参考和对照抗体对硝酸纤维素进行蛋白质印迹。简言之，将来自细胞裂解物的样品煮沸以使蛋白质内容物变性。sds-page(sds-聚丙烯酰胺凝胶电泳)用于根据多肽的长度分离变性的蛋白质。然后将分离的蛋白质从丙烯酰胺凝胶转移至硝酸纤维素膜上。使用2％牛血清白蛋白(bsa)溶液来封闭膜，从而使非特异性抗体结合最小化。将膜与参考或对照抗体一起孵育。将膜用辣根过氧化物酶(hrp)缀合的二抗染色，所述二抗识别参考或对照抗体，并且二抗的检测是通过化学发光进行的。[0500]过表达的细胞系用于验证对照和参考抗体，并且一旦验证，就将对照和参考抗体用于表征内源性细胞系。在这些测定中，过表达cldn6的细胞被包括作为阳性对照。[0501]facs测定显示，除了子宫内膜癌细胞系、膀胱癌细胞系、肺癌细胞系和上消化道癌细胞系外，四种卵巢癌细胞系也在表面以高水平表达cldn6。蛋白质印迹也检测到高水平的cldn6表达。另外两种卵巢癌细胞系、另一种肝癌细胞系、另外的肺癌细胞系和另外的上消化道癌细胞系显示在表面上表达中等水平的cldn6，如通过蛋白质印迹所检测。子宫内膜肿瘤细胞和膀胱肿瘤细胞也在体内表达高水平的cldn6作为异种移植物。表2总结了测试癌细胞系的cldn6的内源性表达水平。[0502]表2[0503][0504][0505]实施例5[0506]此实施例展示为产生cldn6特异性抗体而对小鼠进行免疫。[0507]cldn6特异性抗体通过遵循fredhutchinson癌症研究中心的技术，用三种不同肽免疫原的混合物对balb/c和cd1小鼠进行免疫而产生。所述三种肽跨越cldn6细胞外结构域中的第二个环(即el2)。这些肽包括全长的el2、跨越el2的第一(n端)一半的肽和跨越el2的第二(c端)一半的肽。表3提供了三种肽的序列。[0508]表3[0509][0510][0511]还使用包含人cldn6-myc-ddk表达载体的质粒，用过表达全长cldn6的3t3细胞对小鼠进行了免疫。[0512]从经免疫的小鼠收获脾细胞，并通过btx电融合(btx,holliston,ma)与骨髓瘤系融合以产生杂交瘤。在384孔板中产生并培养了7680个原代杂交瘤培养物。使用表达三种不同肽靶标的珠粒，通过珠粒阵列评估抗体结合肽的能力。1920种潜在阳性抗体被重新排列到96孔板中，通过流式细胞术针对内源性和人工细胞系模型进一步筛选。[0513]然后通过流式细胞术针对与目标区域具有序列相似性的蛋白质(例如，其他cldn蛋白质)的内源性和人工模型对阳性杂交瘤上清液进行反筛选。从二次筛选和反筛选中，选择了约20种cldn6特异性抗体进行额外研究。对这些抗体进行亚克隆并确定可变重链和轻链序列。参见表b和序列表。[0514]cldn6抗体被格式化为使用expichotm表达的全长igg抗体。将抗体的重链和轻链可变区克隆到抗体表达载体中，将所述载体在实验室中基于pcdnatm载体(目录号：a14697，thermofisherscientific,usa)进行工程改造并转染到cho细胞中(根据试剂盒中提供的方案(expichotm表达系统，目录号：a29133，thermofisherscientific,usa))。将抗体纯化，并通过facs测定抗体与cldn6的细胞表面结合和抗体ic50，其中按照制造商的方案将cldn6抗体直接与alexa647nhs酯(琥珀酰亚胺酯)，目录号a20106(thermofisherscientific)缀合。将cldn6抗体在50μl体积中使用150,000个细胞系统从0.32nm至1000nm(连续稀释1:5，6个点)进行测试。[0515]cldn6表达细胞用于facs测定以确定cldn6抗体结合至细胞表面上的cldn6以及与其他cldn家族成员交叉反应的能力。将经工程改造以表达与gfp融合的人cldn6、与gfp融合的小鼠cldn6、cldn9-gfp、cldn4-gfp或cldn3-gfp或单独gfp(无cldn6)的hek293t细胞用作cldn6表达的人工模型。ark2、ovca429、ls513和mcf7细胞用作cldn6表达的内源模型，以及cldn3/4表达的模型。[0516]对于测试的每种类型的细胞和每种mab，通过edta(而不是胰蛋白酶)将细胞从培养瓶表面脱离以保护细胞表面蛋白质。然后将脱离的细胞与alexa标记的cldn6mab一起在冰上在黑暗中以预定浓度孵育30分钟。将cldn6mab直接用alexa647nhs酯(琥珀酰亚胺酯)标记。洗涤后，通过bdaccuritm流式细胞仪c6读取细胞以检测通道fl4h中的抗体-抗原蛋白结合。以不同浓度测试每种抗体以建立剂量-荧光曲线。使用在线提供的非常简单的ic50工具包，抗体的ec50/ic50(基于fl4h的值(在活的单细胞群中设门)计算最大值的一半时的抗体浓度)，所述工具包允许绘制生物剂量反应数据并拟合至曲线类型以给出ec50/ic50。最大值是荧光最大时的最低抗体浓度。还筛选了抗体与其他cldn蛋白(例如cldn9、cldn3和cldn4)交叉反应的能力。这些值用于确定所测试的抗体组中每种抗体的相对亲和力。使用类似方法，但使用具有cldn6、cldn3、cldn4和cldn9的不同表达谱的细胞获得交叉反应性数据。[0517]将以这种方式确定的相对亲和力数据和交叉反应性数据列于表4和5中。[0518]表4[0519][0520]ab#对应于表a和b中所列的ab#。[0521]表5[0522][0523][0524]ab#对应于表a和b中所列的ab#。[0525]实施例6[0526]此实施例展示嵌合小鼠iggmab的表征。[0527]进行软琼脂3d增殖测定和异种移植物结合测定以进一步表征实施例5中描述的mab。简言之，对于48孔板的每个孔，将1xrpmi培养基中的0.6％seaplaque琼脂糖中含有10,000个细胞的250μl顶层混合物涂铺在1xrpmi培养基中的0.6％seaplaque琼脂糖的固化的250ul底部层的顶部上。将含有1xrpmi培养基的250ul液体进料层置于固化的顶层上方。软琼脂测定的所有三个层均使用或不使用曲妥珠单抗、cldn6mab或小鼠igg2a对照制备，以150ng/ml(1um)开始且以1.5ng/ml结束，1:10稀释。每个测试条件一式两份进行。在用0.05％中性红染色之前，使细胞形成集落3周，并在evosxl倒置光学显微镜上成像。与对照相比，经处理中的集落数量减少≥20％的细胞系被认为是敏感的。[0528]如表6所示，当用所指示的抗体处理时，许多细胞系表现出集落数量的减少。[0529]表6[0530][0531][0532]在注射有人癌细胞系的异种移植小鼠中进行了体内结合研究。简言之，在六周龄的cd-1无胸腺裸鼠(charlesriverlaboratories)中建立了人癌细胞系的异种移植物模型。每个细胞系的皮下注射遵循以下条件：ark20.75×107、umuc41.0×107、ov901.0×107和m2020.5×107个细胞，全部含有50％基质胶(bdbiosciences)。注射足够数量的小鼠以达到每个治疗组8只小鼠。当肿瘤达到150至300mm3的平均大小时，将小鼠随机分到治疗组中。对于治疗，将每种治疗性抗体(ab3、ab2、参考ab1、参考ab2、参考ab3(曲妥珠单抗)和非靶向igg2对照在无菌盐水中稀释至1mg/ml的工作浓度，用于静脉内尾静脉(iv)注射。对于m202研究，曲美替尼(dmso溶剂合物，medchemexpress)在第一个每周周期的5天服用，2天停用计划中以1.0mg/kg(10％cremaphor，10％peg400)通过po给药，然后对于剩余的两周给药减至0.5mg/kg。将肿瘤异种移植物每周用卡尺测量三次，并且肿瘤体积(mm3)由高度×宽度×长度相乘确定。对小鼠治疗2-7周。在研究结束时，对动物实施安乐死，并切除肿瘤组织并分开保存为速冻或福尔马林固定石蜡包埋(ffpe)组织以用于生物标志物分析。所有动物工作均根据iacuc和加州大学洛杉矶分校动物研究委员会批准的方案进行。使用来自studydirector(sanfrancisco,ca)的studylog软件分析数据。结果呈现为每组的平均值体积。误差条表示平均值的标准误差(se)。[0533]异种移植物测定的结果显示于图6-图10中。如图6a和图6b所示，在第14天，相对于对照igg2抗体，在携带子宫内膜肿瘤的小鼠中，ab2和ab3中的每一者都引起了肿瘤体积的显著平均变化。如图7a和图7b所示，相对于对照igg2抗体，在携带膀胱肿瘤的小鼠中，ab3在第35天引起肿瘤体积的显著平均变化。图8a和图8b示出相对于对照igg2抗体，在携带卵巢肿瘤的小鼠中，ab2和ab3中的每一者在第20天引起了肿瘤体积的显著平均变化。图9a和图9b展示ab3以cldn特异性方式起作用，因为图9a和图9b中使用的模型不表达cldn6、cldn3、cldn4和cldn9中的任一者，并且因此用作阴性对照。图9a和图9b的数据还表明ab3的脱靶活性低于参考ab1和参考ab2。图10a总结图6-图9的结果。如图10a所示，ab3显著降低了携带子宫内膜肿瘤、膀胱肿瘤和卵巢肿瘤的小鼠中的肿瘤生长，所述肿瘤中的每一种都表达cldn6，但不减少携带不表达cldn6的黑素瘤小鼠的肿瘤生长(图10b)。如图11所示，治疗期间小鼠体重的平均链没有实质性变化，从而表明治疗的安全性。[0534]第二组实验在人卵巢癌细胞系ov90的异种移植模型中进行。向小鼠注射实施例5中描述的10种mab中的一种或对照抗体(小鼠igg2a抗体，参考cldn6ab)或pbs媒介物对照。每组8只小鼠，并且每4天向每只动物静脉内注射10mg/kg抗体。如图12a和图12b所示，实施例5中描述的几种抗体减小了携带卵巢肿瘤的小鼠的肿瘤体积。表现最好的是ab3、ab4、ab7和ab10，尽管相对于媒介物对照，所有测试的抗体都减小了肿瘤体积。如图13所示，用ab3、ab4、ab7或ab10治疗的动物的体重没有显著变化，从而表明它们的安全性。[0535]实施例7[0536]此实施例展示嵌合小鼠iggmab的进一步表征。[0537]进行了内化定量测定。简言之，由参考ab1、ab3或ab4结合触发的cldn6蛋白内化的研究是用阳性对照普遍表达的转铁蛋白受体(tfr)进行的，所述受体是在抗体结合后内化的已知细胞表面受体。[0538]将tfr和cldn6抗体用texasredtm-x、琥珀酰亚胺酯、混合异构体、目录号t6134(thermofisherscientific)标记。在抗体治疗前一天，将细胞接种在μ-载玻片8孔室(目录号80826，ibidicellsinfocusinc.)中，以允许细胞附着和生长。将细胞与标记的抗体一起在黑暗中在冰上孵育30分钟。然后通过echo实验室荧光显微镜读取含有cldn6或tfr标记细胞的腔室，以采集内化之前的图像。然后将腔室在37℃下孵育40分钟以进行内化过程，并通过echo实验室荧光显微镜再次采集图像。与参考ab1所引起的cldn6内化相比，ab3和ab4引起了更大程度的cldn6内化(数据未示出)。[0539]实施例8[0540]此实施例展示嵌合小鼠iggmab的进一步表征。[0541]二维(2d)增殖测定用实施例5中描述的选择抗体如下进行：将细胞以每孔5,000至20,000个细胞一式两份接种在24孔板中。第二天，将细胞用六种1-5稀释的mab(以100nm的曲妥珠单抗、cldn6mab或小鼠igg2a对照开始)和固定浓度的1ng/μl单甲基奥瑞他汀e(mmae)缀合的抗小鼠二抗(moradec,llc)进行处理以生成剂量反应曲线。在第1天、抗体处理当天和稍后在第6天对未处理的细胞孔进行定量以确定细胞生长的范围。在第6天对用mab处理的孔进行定量，并将每种处理条件下的生长确定为相对于未处理的细胞的生长的归一化百分比。在z1粒子计数器(beckmancoulter,inc)上进行定量。[0542]结果在图14中示出。ab2、ab3、ab4和ab5在抑制增殖方面展示最大的功效。这些抗体中的每一种的ic50介于0.1nm与1nm之间。ab7、ab10、ab11和ab15中的每一个也展示在此测定中抑制增殖的能力，但程度低于ab2、ab3、ab4和ab5。[0543]实施例9[0544]此实施例展示本公开的抗体的人源化。[0545]选择表a中列出的抗体的子集进行人源化分析。将ab1、ab3、ab4、ab9、ab11和ab18抗体的重链可变(vh)和轻链可变(vl)序列与来自人vh基因和人vlκ基因的已知人种系序列的文库(theinternationalimmunogeneticsinformationwww.imgt.org；创始人和董事:marie-paulelefranc,montpellier,france)进行比较；所使用的数据库是imgt人vh基因(f orf，273个种系序列)和imgt人vlκ基因(f orf，74个种系序列)。受体人种系选自序列与亲本抗体最接近的那些。[0546]对于每种抗体的每个vh和vl，表7提供了关于选择作为受体序列的人种系序列和选择的人重链连接区(j基因)的信息。连接区(j基因)选自theinternationalimmunogeneticsinformationwww.imgt.org(创始人和董事:marie-paulelefranc,montpellier,france)编译的人连接区序列。[0547]表7[0548][0549]cdr根据abm定义而定义(关于比较cdr定义的表，参见dr.andrewc.r.martin的网站www.bioinf.org.uk/abs/)。[0550]可能需要将人种系框架(即vh和vl中的非cdr残基)位置改变为相应的亲本鼠类序列以优化人源化抗体的结合。人源化抗体的型式的序列提供为seqidno:376-421。[0551]对于ab1，基于序列和构象，hc的cdr2的asn52(顺序编号)和lc中cdr2的asn54中的每一个被确定为具有低脱酰胺潜力。[0552]对于ab3，基于序列和构象，hc的cdr1的asn31(顺序编号)、hc的cdr2的asn57、lc的cdr1的asn28和lc的cdr2的asn50中的每一个被确定为具有低脱酰胺潜力。hc的cdr1的trp33被确定为可能暴露于溶剂并具有氧化潜力，尤其是在应力条件下。在hc的cdr3中，确定在cdr内存在游离cys106，其在制造抗体时可能出现问题，因为它可能暴露于溶剂。建议将此cys残基改变为tyr、ser或ala。对这些改变的抗体的结合的维持进行测试。lc的cdr2的ile53被确定为暴露于溶剂并可能导致非特异性结合。建议将此ile残基改变为ser。对这种改变的抗体的结合的维持进行测试。[0553]对于ab4，基于序列和构象，hc的cdr2的asn52(顺序编号)和lc的cdr2的asn58中的每一个被确定为具有低脱酰胺潜力。lc的cdr1中的序列dgnt被确定为有问题，因为它被确定为具有高异天冬氨酸形成潜力(在序列dg处)以及脱酰胺潜力(在序列nt处)。此序列被建议改变。[0554]对于ab9，基于序列和构象，hc的cdr1中的asn33(顺序编号)以及hc的cdr2中的asn52和asn59被确定为具有低脱酰胺潜力。基于序列和构象，asn54被确定为具有中等脱酰胺潜力。hc的cdr2中的ngg序列被确定为具有高/中等脱酰胺潜力，随后是异天冬氨酸形成。因此，建议改变此氨基酸序列。在制造抗体时，hc的cdr3中的游离cys106可能是有问题的，因为它被确定为可能暴露于溶剂。建议将此cys残基改变为tyr、ser或ala。对这些改变的抗体的结合的维持进行测试。hc的cdr1中的arg28在人抗体中并不常见。此残基被改变为thr，并测试了结合的维持。对于ab9，lc的cdr1中的trp32(顺序编号)被确定为可能暴露于溶剂并且可能发生氧化，尤其是在应力条件下。相同cdr的leu24在人抗体中并不常见。此残基被改变为arg并测试结合的维持。[0555]对于ab11，hc的cdr2中的asp54-ser55(顺序编号)被确定为具有低异天冬氨酸形成潜力。基于序列和构象，lc的cdr2中的asn57被确定为具有低脱酰胺潜力。[0556]对于ab18，基于序列和构象，hc的cdr1中的asn33和cdr-h2asn50(顺序编号)被确定为具有低脱酰胺潜力。在hc的cdr2中，asp-pro(dp)序列被确定为具有在酸性条件下发生片段化的潜力。在vl结构域中，基于序列和构象，lc的cdr1中的asn34和asn37被确定为具有低脱酰胺潜力。在lc的cdr3中，trp56被确定为可能暴露于溶剂并且可能发生氧化，尤其是在应力条件下。[0557]表8显示组合人源化vh和vl的方案。如果没有人源化型式与嵌合mab等效。优选对以粗体下划线文本显示。[0558]表8[0559][0560][0561]表8中描述的人源化抗体的构建和表达基本上如实施例5中所述。facs测定基本上如实施例5中所述进行以确定人源化抗体的相对抗原结合强度。测试了两种剂量(1.5μg或0.3μg)的人源化抗体与人cldn6或鼠cldn6的结合，所述蛋白质由工程改造的293t克隆表达。测定的结果提供于表9中。[0562]表9[0563][0564][0565]还进行了facs测定以确定人源化抗体(1.5μg或0.3μg)与如所指示癌细胞系表达的cldn6结合的相对抗原结合强度。测定的结果提供于表10中。仅将二抗用作阴性对照。64a-chim、h64a和sc27-108-chim用作参考抗体。相应的亲本抗体(人源化之前的抗体)用作对照并指定为“chim”。[0566]表10[0567][0568][0569]“chim”是抗体的前人源化形式。[0570]基于体外抗原结合数据，选择了三种人源化抗体进行进一步的测试和开发。抗体来源于ab1、ab3和ab4。[0571]在注射有膀胱癌细胞系umuc4的异种移植小鼠中进行了ab1、ab3和ab4的人源化型式的体内结合研究，基本上如实施例6中所述。简言之，在6周龄cd-1无胸腺裸鼠中建立umuc4的异种移植物模型(charlesriverlaboratories)。在肿瘤达到150至300mm3的平均大小时，将小鼠随机分为治疗组。将人源化抗体在无菌盐水中稀释至1mg/ml的工作浓度以用于静脉内尾静脉(iv)注射。将肿瘤异种移植物每周用卡尺测量三次，并且肿瘤体积(mm3)由高度×宽度×长度相乘确定。对小鼠治疗2-7周。在研究结束时，对动物实施安乐死，并切除肿瘤组织并分开保存为速冻或福尔马林固定石蜡包埋(ffpe)组织以用于生物标志物分析。[0572]异种移植物测定的结果显示于图15-图21中。图15示出两种人源化ab3型式(ab3-2和ab3-4)的异种移植物测定结果，其中治疗涉及q4d施用的10mg/kg。对照包括媒介物对照(pbs)、人igg(10mg/kgq4d)和鼠ab3型式(10mg/kgq4d)。如此图所示，人源化ab3-4在35天治疗期间显示出肿瘤体积的减小。图16示出与图15中所示的实验相同的治疗的异种移植物测定结果，例外是进行了两种额外的对照(64amse及其嵌合型式(64a-chim))。与图15中一样，图16示出用人源化ab3-4治疗后肿瘤体积的显著减小。[0573]图17示出人源化ab1-5的异种移植物测定结果。对照包括媒介物对照(pbs)、人igg(10mg/kgq4d)和鼠ab1型式(10mg/kgq4d)。如图17所示，用人源化ab1-5治疗的小鼠展示肿瘤体积的显著减小。[0574]图18示出人源化ab4-3的异种移植物测定结果。对照包括媒介物对照(pbs)、人igg(10mg/kgq4d)和鼠ab4型式(10mg/kgq4d)。用人源化ab4-3治疗的小鼠没有展示肿瘤体积的显著减小。[0575]图19-图21展示异种移植物测定的结果，其中对图15-图18的所有4种人源化抗体进行了测试。参考cldn6抗体的小鼠和嵌合型式用作对照。如图19所示，用人源化ab3-4和ab1-5治疗的小鼠展示肿瘤体积减小。图20展示到第55天的时间过程中的肿瘤体积。测定中小鼠的体重显示在图21中。[0576]实施例10[0577]用不同的ab1、ab3和ab4序列进行了计算机分析。特别地，对每种抗体的(a)原始亲本克隆、(b)最接近的小鼠种系序列、(c)最接近的人种系序列和(d)人源化序列的序列进行了比对。将被认为已经经历亲和力成熟的氨基酸用星号标记，而根据抗体数据库信息与所述位置处的氨基酸不同的氨基酸用主题标签标记。将每个序列的cdr加框。基于此分析，将制备具有表10中所列的序列的几种人源化抗体。[0578]表10[0579]亲本克隆共有序列hc共有序列lcab1422423ab3424425ab4426427[0580]具有由这些共有序列定义的序列的多种抗体基本上如实施例5中所述制备并在体外通过facs测试抗原结合(基本上如实施例5中描述)和在体内测试减小小鼠的肿瘤体积的能力(基本上如实施例6中描述)。[0581]实施例11[0582]此实施例描述本公开的cldn6抗体的下一代测序(ngs)分析。[0583]对ab1和ab3的序列进行ngs分析，以鉴定每种抗体的重链和轻链的体细胞超突变(shm)相关变体。ngs分析鉴定了每种抗体的重链和轻链序列中的shm的点。分析揭示对于ab3有1452个不同的重链序列和326个不同的轻链序列，并且对于ab1有372个不同的重链序列和3081个不同的轻链序列。示例性结果显示在图23-图26中。图23和图24分别示出变体ab3的重链和轻链的鉴定的变化，而图25和图26分别示出变体ab1的重链和轻链的鉴定的变化。每个图的底部提供了以chothia编号的突变。[0584]基于结合参与的可能性选择了在重链中具有ngs鉴定的shm的抗体。基于人源化ab3-7(abs1-s6)制造了六种抗体，并且基于人源化ab1-11(abs7-s12)制造了六种抗体，并且随后针对表型进行评估。图22是亲本和与轻链序列配对的12个变体重链序列的列表。12种抗体(abs1-s12)的facs结合研究基本上如本文所述进行，并且结果示于图27中[0585]还用不同量的abs1-s12进行了facs结合测定。在此有限稀释测定中测试的抗体浓度是0.32nm、1.6nm、8nm、40nm、200nm和1000nm，并且使用了表达cldn6的不同细胞系。结果在图28中示出。[0586]这些数据支持新鉴定的抗体(s1-s12)展示相对于相应的亲本人源化抗体增加的结合。[0587]实施例12[0588]此实施例展示本文所述的人源化抗体的体内分析。[0589]体内研究在注射有人癌细胞系的异种移植小鼠中进行，基本上如实施例6所述。在此研究中，使用了umuc4细胞系、强烈表达cldn6的膀胱癌细胞系和ov-90细胞系(一种表达cldn6的卵巢癌细胞系)的细胞。当向小鼠皮下施用时，两种细胞系都具有致瘤性。简言之，在六周龄的cd-1无胸腺裸鼠(charlesriverlaboratories)中建立了人癌细胞系的异种移植物模型。对于每个细胞系的皮下注射遵循以下条件：umuc41.0×107和ov901.0×107，全部含有50％基质胶(bdbiosciences)。将cd-1裸鼠(每组8只小鼠)在右侧腹皮下注射umuc4或ov-90细胞系。当肿瘤达到150至300mm3的平均大小时，将小鼠随机分到治疗组中。对于治疗，将每种治疗性抗体(人源化ab1-11、人源化ab3-7)和人igg对照抗体在无菌盐水中稀释，并通过静脉内尾静脉(iv)注射以10mg/kg每4天一次每天(q4d-图30)或每周一次(qw-图31)施用。将肿瘤异种移植物每周用卡尺测量三次，并且肿瘤体积(mm3)由高度×宽度×长度相乘确定。将小鼠进行治疗21-36天。在研究结束时，对动物实施安乐死，并切除肿瘤组织并分开保存为速冻或福尔马林固定石蜡包埋(ffpe)组织以用于生物标志物分析。所有动物工作均根据iacuc和加州大学洛杉矶分校动物研究委员会批准的方案进行。使用来自studydirector(sanfrancisco,ca)的studylog软件分析数据。结果呈现为每组的平均值体积。误差条表示平均值的标准误差(se)。[0590]异种移植物测定的结果显示于图30和图31中。如图30所示，相对于对照治疗的小鼠，用ab1-11或ab3-7进行的q4d治疗导致肿瘤体积或umuc4肿瘤显著减小。到研究期结束时，两种人源化抗体都实现了肿瘤体积相对于对照小鼠的60％减小。[0591]如图31所示，用任一人源化抗体治疗的小鼠的ov-90肿瘤体积小于对照治疗小鼠的肿瘤体积。到研究结束时，ab1-11实现了肿瘤体积相对于对照小鼠的33％减小，而ab3-7实现了16％减小。[0592]这些数据支持人源化抗体维持首先在相应的小鼠抗体情况下观察到的治疗功效。[0593]实施例13[0594]此实施例展示体内测试的抗体药物缀合物。[0595]制备了包含mmae和人源化ab1-11的缀合物并使用注射有表达cldn6的ov-90卵巢癌细胞系的异种移植小鼠进行了体内测试，基本上如实施例6中所述。在此实验中，将ov-90细胞皮下注射cd-1裸鼠(每组8只小鼠)右侧腹中。当肿瘤达到150至300mm3的平均大小时，将小鼠随机分到治疗组中。对于治疗，对小鼠每周一次通过尾静脉注射施用(1)10mg/kg人源化ab1-11抗体，(2)10mg/kg人igg对照抗体，(3)5mg/kg包含mmae的非靶向缀合物(不含ab1-11)，和(4)10mg/kg包含mmae和ab1-11的靶向抗体药物缀合物(adc)。非靶向缀合物包含缀合至非靶向人igg对照抗体的mmae。将肿瘤异种移植物每周用卡尺测量三次，并且肿瘤体积(mm3)由高度×宽度×长度相乘确定。将小鼠进行治疗20-36天。在研究结束时，对动物实施安乐死，并切除肿瘤组织并分开保存为速冻或福尔马林固定石蜡包埋(ffpe)组织以用于生物标志物分析。所有动物工作均根据iacuc和加州大学洛杉矶分校动物研究委员会批准的方案进行。使用来自studydirector(sanfrancisco,ca)的studylog软件分析数据。结果呈现为每组的平均值体积。误差条表示平均值的标准误差(se)。[0596]如图32所示，靶向adc的施用导致肿瘤体积显著减小。到研究结束时，相对于对照治疗的小鼠，用靶向adc治疗的小鼠的肿瘤体积表现出大于70％减小。[0597]用皮下注射umuc4膀胱癌细胞而不是ov-90细胞的小鼠进行了相同的体内分析，并通过尾静脉注射每周一次施用治疗：(1)10mg/kg人源化ab1-11抗体，(2)10mg/kg人igg对照抗体，(3)5mg/kg包含mmae的非靶向缀合物(不含ab1-11)，和(4)10mg/kg包含mmae和ab1-11的靶向抗体药物缀合物(adc)。非靶向缀合物包含缀合至非靶向人igg对照抗体的mmae。靶向缀合物总共给予3次，而其他治疗每周施用一次，总共5次。如上所述进行肿瘤体积测量，但对靶向adc治疗的小鼠的测量持续长达80天。[0598]如图33所示，靶向adc的施用展示肿瘤体积从几乎200mm3减小至几乎0mm3。效果持续到研究的80天或最后一次adc治疗后超过约60天。[0599]这些数据支持包含本公开的抗体的抗体药物缀合物有效减小肿瘤大小和治疗癌症。[0600]实施例14[0601]此实施例展示cldn-6fab片段的产生和表征。[0602]人源化cldn6抗体ab1-11的fab抗体片段是使用piercefab制备试剂盒(目录号44985)按照制造商的说明生成的。简言之，将人源化ab1-11的等分试样添加至包含固定化木瓜蛋白酶的柱中。洗脱的级分含有两个fab片段和fc多肽。通过将混合物负载到包含蛋白a树脂的柱上，将fab片段与包含fc的级分分离。从蛋白a柱洗脱的级分仅含有fab片段，而结合的级分含有fc。[0603]然后基本上如本文所述，通过facs测试ab1-11的fab片段的抗原结合。在此facs测定中，将ovca429细胞与全长ab1-11(图34a)、ab1-11fab(图34b-图34d)或全长ab1-11和ab1-11fab的混合物(图34e)一起孵育。由于fab片段的较高解离速率，所以对facs结合测定的方案略加修改(相对于上述描述)。与一抗(全长ab1-11或其fab片段)孵育后和/或与二抗(山羊f(ab)2抗人igg(h l)二抗[dylight649](novusbiologicals；目录号nbp1-51902)孵育后的洗涤步骤是多种多样的。dylight649信号的示例性facs图显示在图34a-图34e中，并且结果在图35中进行了定量。[0604]在图34a中，黑线表示细胞仅与二抗(没有一抗)一起孵育，然后洗涤2次；红线表示细胞与全长ab1-11一起孵育，洗涤一次，与二抗一起孵育，然后在二抗孵育后没有洗涤步骤；蓝线表示细胞与全长ab1-11一起孵育，洗涤一次，与二抗一起孵育，然后洗涤一次；并且绿线表示细胞与全长ab1-11一起孵育，洗涤一次，与二抗一起孵育，然后洗涤两次。[0605]在图34b中，黑线表示细胞仅与二抗(没有ab1-11fab)一起孵育，然后洗涤2次；红线表示细胞与ab1-11fab一起孵育，在孵育之间没有洗涤步骤的情况下与二抗一起孵育，然后二抗孵育后没有洗涤步骤；蓝线表示细胞与ab1-11fab一起孵育，在孵育之间没有洗涤步骤的情况下与二抗一起孵育，然后洗涤一次；并且绿线表示细胞与ab1-11fab一起孵育，在孵育之间没有洗涤步骤的情况下与二抗一起孵育，然后洗涤两次。[0606]在图34c中，黑线表示细胞仅与二抗(没有ab1-11fab)一起孵育，然后洗涤2次；红线表示细胞与ab1-11fab一起孵育，洗涤一次，与二抗一起孵育，然后二抗孵育后没有洗涤步骤；蓝线表示细胞与ab1-11fab一起孵育，洗涤一次，与二抗一起孵育，然后洗涤一次；并且绿线表示细胞与ab1-11fab一起孵育，洗涤一次，与二抗一起孵育，然后洗涤两次。[0607]在图34d中，黑线表示细胞仅与二抗(没有ab1-11fab)一起孵育，然后洗涤2次；红线表示细胞与ab1-11fab一起孵育，洗涤两次，与二抗一起孵育，然后二抗孵育后没有洗涤步骤；蓝线表示细胞与ab1-11fab一起孵育，洗涤两次，与二抗一起孵育，然后洗涤一次；并且绿线表示细胞与ab1-11fab一起孵育，洗涤两次，与二抗一起孵育，然后洗涤两次。[0608]在图34e中，黑线表示细胞仅与二抗(没有ab1-11fab)一起孵育，然后洗涤2次；红线表示细胞与全长ab1-11和ab1-11fab的混合物一起孵育，洗涤一次，与二抗一起孵育，然后洗涤两次；蓝线表示细胞与全长ab1-11和ab1-11fab的混合物一起孵育，在孵育之间没有洗涤步骤的情况下与二抗一起孵育，然后洗涤两次；并且绿线表示细胞与全长ab1-11和ab1-11fab的混合物一起孵育，洗涤一次，与二抗一起孵育，然后洗涤两次；并且紫线表示细胞与全长ab1-11和ab1-11fab的混合物一起孵育，洗涤两次，与二抗一起孵育，然后洗涤两次。[0609]如这些图中所示，ab1-11的fab片段展示与抗原的强结合。[0610]然后将ab1-11fab片段用作一抗以对表达cldn6的ovca429细胞进行免疫染色。此研究中的二抗是山羊f(ab)2抗人igg(h l)二抗[dylight649](novusbiologicals；目录号nbp1-51902)。结果在图36a-图36c中示出。在图36a中，ovca429细胞在没有任何ab1-11fab(仅与二抗)的情况下孵育。在图36b中，将细胞仅用ab1-11fab(没有二抗)染色。在图36c中，将细胞与ab1-11fab片段一起孵育，洗涤两次，然后与二抗一起孵育。与二抗孵育后，将细胞洗涤两次，然后暴露于c6持续9秒。[0611]这些研究中的数据表明，ab1-11的单价型式展示良好的抗原结合。[0612]实施例15[0613]此实施例展示cldn-6scfv的产生和表征。[0614]使用包含cmv启动子和土拨鼠肝炎病毒转录后调控元件(wpre)的病毒表达载体制备人源化ab3-7和ab1-11的单链fv片段，所述元件位于轻链可变区和重链可变序列的侧翼(图37a)。编码(g4s)3间隔区的序列位于lc与hc可变序列之间。lc可变区、间隔区和hc可变区的序列提供于图37b中。病毒载体在细胞中表达，并且收获所产生的scfv，随后通过facs测试抗原结合。每个facs反应使用ark2或m202细胞(0.25x106)。一抗是scfv并且以5μg/反应使用。二抗是biolegend目录号652513，并且每次反应使用2μl的0.5μg/μl储备液。每次孵育(与一抗和二抗一起)在4℃下进行30分钟。孵育后，在facs分析之前进行单一洗涤步骤。任何未使用的细胞都用于成像研究。[0615]示例性facs图在图38a和图38b中示出。在图38a中，黑线表示仅与二抗一起孵育的ark2细胞的信号，并且红线表示与ab3-7的scfv一起孵育的ark2细胞的信号。在图38b中，黑线表示仅与二抗一起孵育的m202细胞的信号，并且红线表示与ab3-7的scfv一起孵育的m202细胞的信号。[0616]用ab1-11scfv进行上述相同的facs实验。一抗是scfv并且以2μg/反应使用。二抗是biolegend目录号652513，并且每次反应使用1μl的0.5μg/μl储备液。每次孵育(与一抗和二抗一起)在4℃下进行30分钟。孵育后，在facs分析之前进行单一洗涤步骤。结果显示在图39a和图39b中。如图39a所示，过表达cldn6和绿色荧光蛋白(gfp)的293t细胞仅在细胞与scfv一起孵育、随后二抗孵育时，而不是在细胞仅与二抗(无scfv)孵育时产生通过facs检测到的信号。ark2细胞展示通过facs检测到的类似模式。如图39b所示，只有表达gfp的293t细胞产生gfp特异性信号，而m202和ark2细胞(不表达gfp)不产生。图40a-图40c提供来自此实验的示例性facs图。在图40a中，黑线是仅与二抗孵育后表达cldn6和gfp的293t细胞的信号，红线是这些细胞与ab3-7scfv、随后二抗孵育后的信号，并且蓝线是这些细胞在与ab1-11scfv、随后二抗孵育后的信号。图40b和图40c遵循采用带有彩色线的此相同方案，例外是图40b是来自m202细胞的信号，并且图40c是来自ark2细胞的信号。图40d-图40f展示图40a中测试的每组293t细胞的数量大致相同。[0617]这些数据证明人源化cldn6抗体的scfv与抗原强烈结合。[0618]实施例16[0619]此实施例展示cldn6adc的体外表征。[0620]包含各种接头-药物组合的adc是用人源化ab3-7抗体(也称为ab23，参见例如表8)制备的：(a)vc-pab-mmae，(b)ggfg-mmae，(c)cl2a-sn38，(d)ggfg-dxd和(e)vc-pab-dxd。adc在wuxibiologics(上海，中国)制备。[0621]图41a-图41h示出包含ab3-7的cldn6adc的生物化学表征。图41a是总结包含ab3-7的七种cldn6adc的生物化学性质的表。标记为d4的adc是指基本均质的缀合物，所述缀合物包含大量抗体，所述抗体为每种抗体缀合至4种药物(d4技术，wuxibiologics的一项技术)。标记为ctrl的adc是指包含每种抗体的药物数量的高斯分布的常规异质缀合物(常规)。所述adc包含低百分比的未缀合抗体、高分子量(hmw)种类和未缀合游离药物。所述adc还包含低水平的内毒素，从而使其适用于体内研究。图41b-图41h表示hic-hplc色谱图，其示出对于每种adc，与不同数量的药物缀合的抗体的相对丰度。例如，d0下的峰面积表示未缀合的ab3-7的相对丰度。类似地，d1、d2、d3……d8下的峰面积表示每种抗体缀合至1、2、3……8种药物的ab3-7抗体的相对丰度。[0622]图42示出包含ab3-7的cldn6adc的分子完整性未因缀合而改变。cldn6adc和未缀合的ab3-7抗体的分子完整性通过nativepage(nativepage4-16％bis-tris蛋白凝胶(目录号bn1002box，thermofisher)评估。天然page根据蛋白质天然结构的净电荷、大小和形状来分离蛋白质。在天然条件下，与未缀合的ab3-7抗体相比，所有7种cldn6adc在结构上都保持完整，并且确实表现出任何降解迹象。因此，缀合不会改变ab3-7抗体的分子完整性。[0623]图43示出缀合不影响ab3-7抗体的结合亲和力。流式细胞术显示包含ab3-7的cldn6adc保留了对cldn6的特异性和高结合亲和力。通过流式细胞术分析三种细胞系的adc结合活性：(a)umuc4膀胱癌细胞系(天然表达cldn6)，(b)hek293tcldn6-mgfpa11(经工程改造以人工过表达(oe)cldn6)，和(c)m202黑素瘤细胞系(cldn6阴性细胞)。具体而言，将adc与约150,000个细胞在50μl2％fbs/pbs中在4℃下孵育30分钟，然后用2％fbs/pbs洗涤。然后将adc与来自biolegend(409320)的alexa647抗人iggfc抗体在4℃下孵育30分钟。通过bdaccuritmc6流式细胞仪测量结合。与它们的未缀合的抗体ab3-7相比，七种不同的cldn6adc通过流式细胞术显示出与cldn6阳性细胞系(umuc4细胞和hek293tcldn6-mgfpa11)相似的结合亲和力，而显示对cldn6阴性细胞系(m202)没有结合。[0624]图44进一步示出缀合不影响ab3-7抗体的结合亲和力。解离常数(kd)的测量表明，包含ab3-7的cldn6adc保留了对cldn6的特异性和高结合亲和力。cldn6adc的基于细胞的抗体亲和力(kd)通过kinexa4000(sapidyneinstrument,boise,idaho)进行测量。简言之，使用versene使hek293tcldn6-mgfpa11细胞脱离，并在4℃下在2％fbs/dmem中与500pm或10nm抗体一起平衡过夜。细胞浓度从5x106个细胞开始，并进行2倍系列稀释直至10个点。第二天，将细胞以1500rpm离心10分钟，并保存上清液。将pmma珠粒(sapidyeinstrument，目录号440176)用山羊抗人igg(jacksonimmunoresearchlabs(目录号109-005-003)以30μg/ml进行预包被。将荧光二抗alexa647affinipure山羊抗人igg(jacksonimmunoresearchlabs，目录号109-605-088)以0.5μg/ml在1％bsa/pbs中稀释。测量中还包括仅抗体溶液(信号100％)和非特异性结合(nsb，仅缓冲剂)对照。使用通过n曲线分析而分析的两条抗体曲线计算kd。如图44所示，所有adc和未缀合的ab3-7的结合亲和力(kd)相似。因此，与各种接头-药物组合的缀合不会改变对hek293tcldn6-mgfpa11细胞上表达的cldn6的抗体结合亲和力。[0625]图45示出包含ab3-7的cldn6adc被癌细胞有效内化，这是adc活化的重要步骤。具体地，ark2细胞(表达cldn6的子宫癌肉瘤)被细胞核(蓝色)、溶酶体(绿色)和cldn6adc(红色)染色。上图上的图像在早期阶段(adc/抗体染色后30分钟内)拍摄，并且下图上的那些图像在稍后阶段(adc/抗体染色后5-6小时内)拍摄，以显示与adc复合的cldn6或未缀合的抗体的内化。如图45所示，与其未缀合的抗体ab3-7相比，缀合没有改变抗体内化率。[0626]实施例17[0627]此实施例展示cldn6adc针对癌细胞的体外抗癌活性。[0628]图46a-图46g示出包含ab3-7的不同cldn6adc对癌细胞的2d抗增殖作用。针对四种癌细胞系测试了cldn6adc的抗增殖活性：cldn6阳性细胞系(umuc4、ov90)和cldn6阴性细胞系(mcf7、m202)。将每种细胞系均匀地接种到48孔板的孔中，每孔300-1000个细胞。48小时后，测量每种细胞系每孔的细胞数量的基线测量值。将剩余的细胞孔用6种药物浓度的1:5连续稀释液处理，最终处理浓度在200nm(30ng/ml)至0.064nm(0.0096ng/ml)的范围内。7天后，通过比较经处理的对比未处理的对照中的细胞计数来评估抗增殖活性。[0629]如图46a-图46g所示，包含mc-vc-pab-mmae(常规)和mc-vc-pab-mmae(d4技术)的cldn6adc在针对cldn6阳性细胞(umuc4)表现出最大抗增殖效力和特异性方面是可比的。包含cl2a-sn38(常规)和cl2a-sn38(d4技术)的cldn6adc表现出同样相似的抗增殖效力，但是非特异性的，在cldn6阳性细胞和cldn6阴性细胞之间不加区分地杀伤。包含mc-ggfg-mmae的cldn6adc针对cldn6阳性细胞(umuc4)显示具有特异性的低抗增殖效力。包含mc-ggfg-dxd和mc-vc-pab-dxd的cldn6adc针对任何细胞系均不显示抗增殖作用。[0630]图46h-图46n示出包含与vc-pab-mmae(adc-11)缀合的ab1-11的cldn6针对各种细胞系的2d抗增殖作用。具体地，测试了四种细胞系：cldn6阳性细胞系(ark2、ovca429、h841、ov90、h1693)和cldn6阴性细胞系(mcf7、m202)。将每种细胞系均匀地接种到48孔板的孔中，每孔300-1000个细胞。48小时后，测量每种细胞系每孔的细胞数量的基线测量值。将剩余的细胞孔用以下各项的1:5连续稀释液处理：(a)cldn6靶向adc-11，(b)对照adc(与vc-pab-mmae缀合的非靶向igg)，(c)未缀合的非靶向igg，和(d)未缀合的ab1-11，最终处理浓度在1000nm(150ng/ml)至0.32nm(0.0048ng/ml)的范围内。7天后，通过比较经处理的对比未处理的对照中的细胞计数来评估抗增殖活性。[0631]如图46h-图46n中所示，adc-11针对cldn6阳性细胞系(ark2、ovca429、h841、ov90、h1693)表现出稳健的抗增殖活性，而对cldn6阴性细胞系(m202和mcf7)没有活性。[0632]实施例18[0633]此实施例显示cldn6adc针对癌细胞系异种移植物的体内抗癌功效。[0634]对于所有体内实验，将肿瘤异种移植物用卡尺测量3次/周，并且肿瘤体积(mm3)由高度x宽度x长度相乘确定。所有动物工作均根据iacuc和ucla动物研究委员会批准的方案进行。使用来自studydirector(sanfrancisco,ca)的studylog软件分析数据。[0635]图47示出cldn6adc针对cldn6阳性卵巢癌细胞系(ov90)异种移植物的抗癌功效。本文测试的cldn6adc包含与vc-pab-mmae(adc-11；常规)缀合的人源化ab1-11。ov90卵巢癌细胞系异种移植物是在6周龄cd-1无胸腺裸鼠(charlesriverlaboratories)中通过将1.0×107个细胞与50％基质胶(bdbiosciences)皮下注射到动物的右后侧腹中而建立的。当肿瘤达到100-200mm3的平均大小时，将小鼠(n＝8)随机分到以下任一治疗组：1)非靶向人igg1对照抗体，10mg/kgqwiv4周；2)人源化cldn6-ab1-11(hu-11)，10mg/kgqwiv(静脉内注射)，持续4周；3)adc-11，5mg/kgqwiv，持续3周；以及4)非靶向对照adc，5mg/kgqwiv，持续3周。给药后跟踪异种移植物直至肿瘤进展。用cldn6adc治疗导致异种移植物肿瘤消退。cldn6adc的活性优于使用未缀合的cldn6mab或非靶向对照adc观察到的活性。[0636]图48a-图48b示出cldn6adc-11(常规)针对cldn6阴性黑素瘤癌细胞系(m202)异种移植物没有抗癌活性。adc-11在不表达cldn6的m202细胞系异种移植物中没有显示任何抗癌活性。m202黑素瘤癌细胞系异种移植物是在6周龄cd-1无胸腺裸鼠(charlesriverlaboratories)中通过将1.0×107个细胞与50％基质胶(bdbiosciences)皮下注射到动物的右后侧腹中而建立的。当肿瘤达到100-300mm3的平均大小时，将小鼠(n＝8)随机分到以下任一治疗组：1)非靶向人igg1对照抗体，10mg/kgqwiv4周；或2)adc-11，5mg/kgqwiv，持续3周。cldn6adc针对cldn6阴性异种移植物的抗癌活性缺乏证明了cldn6adc活性的特异性。[0637]图49a-图49b示出cldn6adc-23针对癌细胞系异种移植物的体内抗癌功效。本文测试的cldn6adc包含与vc-pab-mmae(adc-23；常规)缀合的人源化ab3-7。图49a示出cldn6adc-23针对cldn6阳性膀胱细胞系(umuc4)异种移植物有效。具体地，umuc4膀胱癌细胞系异种移植物是在6周龄cd-1无胸腺裸鼠(charlesriverlaboratories)中通过将1.0×107个细胞与50％基质胶(bdbiosciences)皮下注射到动物的右后侧腹中而建立的。当肿瘤达到100-200mm3的平均大小时，将小鼠(n＝8)随机分到以下任一治疗组：1)非靶向人igg1(hu-igg1)对照抗体，10mg/kg每周一次(qwiv)，持续4周；2)人源化cldn6ab3-7抗体(hu23)，10mg/kgqwiv，持续4周；3)adc-23，5mg/kgqwiv，持续3周。在给药后追踪异种移植物直至肿瘤进展或治疗开始后60天。图49b示出在用hu-igg1对照抗体或5mg/kgadc-23治疗后的所指示时间点收集的异种移植物组织的苏木精和曙红(h&e)染色。对研究期间收集的异种移植物组织的组织病理学分析表明，adc-23治疗的小鼠中上皮-肿瘤细胞含量损失(图49b)。[0638]用cldn6adc-23治疗导致umuc4cldn6阳性细胞系异种移植物中的异种移植物肿瘤消退。图49a-图49b中呈现的数据和上文呈现的那些数据证明cldn6adc(adc-11和adc-23)在靶向cldn6阳性细胞系异种移植物方面是有效的。[0639]实施例19[0640]此实施例显示了cldn6adc-23针对患者来源的异种移植物(pdx)的体内抗癌活性。[0641]图50a-图50e示出cldn6adc-23(常规)针对卵巢癌pdx模型的体内抗癌功效。具体地，通过蛋白质印迹分析筛选一组卵巢pdx样品的cldn6蛋白表达(图50a)。为所述研究选择了两个cldn6阳性(df189和df181)和一个cldn6阴性(df20)样品。将来自每个pdx的卵巢癌细胞在注射到免疫功能低下小鼠(nsg)的腹腔内之前用荧光素酶转染(图50b)。图50c-图50e示出在用以下各项治疗的小鼠中每周测量一次的荧光素酶活性输出：(1)非靶向hu-igg1对照抗体，10mg/kgqwiv4周；(2)人源化cldn6ab3-7，10mg/kgqwiv持续4周；或(3)adc-23，5mg/kgqwiv，持续3周。用hu-igg1对照或cldn6ab3-7mab治疗的小鼠显示腹腔内肿瘤负荷持续增加，直到对于每个测试的pdx模型，在植入癌细胞后大约50天小鼠不得不进行安乐死。然而，用adc-23治疗的小鼠显示肿瘤负荷的显著降低以及总体存活率的显著提高。这些反应仅限于注射有cldn6阳性卵巢癌细胞的小鼠(图50c和图50d)。df20cldn6阴性模型仅显示治疗的有限益处，而对总体存活没有影响(图50e)。[0642]实施例20[0643]此实施例显示cldn6adc-23的剂量依赖性活性。[0644]图51a-图51c显示cldn6adc-23(d4技术)针对cldn6阳性卵巢癌细胞系(ov90)异种移植物的剂量依赖性抗癌活性。ov90卵巢癌细胞系异种移植物是在6周龄cd-1无胸腺裸鼠(charlesriverlaboratories)中通过将1.0×107个细胞与50％基质胶(bdbiosciences)皮下注射到动物的右后侧腹中而建立的。当肿瘤达到约200mm3的平均大小时，将小鼠(n＝6)随机分到治疗组。将具有ov90异种移植物的小鼠以0.1mg/kg至2.5mg/kgivqw范围内的不同剂量治疗3周。随着给药浓度降低，观察到抗肿瘤活性降低。用2.5mg/kg的cldn6adc-23治疗诱导均匀的异种移植物消退(图51a和图51b)。没有观察到响应于用任何给予剂量的cldn6adc-23治疗的对小鼠体重的影响(图51c)。因此，在cldn6阳性卵巢癌细胞系异种移植物中证实了新型cldn6adc-23的选择性和剂量依赖性活性。[0645]图52a-图52c示出在cldn6阴性黑素瘤癌细胞系(m202)异种移植物中没有cldn6adc-23(d4技术)的脱靶活性。m202黑素瘤癌细胞系异种移植物是在6周龄cd-1无胸腺裸鼠(charlesriverlaboratories)中通过将1.0×107个细胞与50％基质胶(bdbiosciences)皮下注射到动物的右后侧腹中而建立的。当肿瘤达到约200mm3的平均大小时，将小鼠(n＝6)随机分到治疗组。将携带m202黑素瘤异种移植物的小鼠以0.1mg/kg至2.5mg/kgivqw范围内的不同剂量治疗3周。在任何给予的剂量下均未观察到cldn6adc针对cldn6阴性m202异种移植物的抗癌活性(图52a-图52b)。没有观察到响应于用任何给予剂量的cldn6adc治疗的对小鼠体重的影响(图52c)。[0646]实施例21[0647]此实施例显示cldn6-cd3双特异性蛋白的产生。[0648]在本文中制备并表征了两种cldn6-cd3双特异性t细胞衔接剂(bite)：(a)ab1-11的cldn6结合部分与cd3结合部分融合(bite-11)，和(b)ab3-7的cldn6结合部分与cd3结合部分融合(bite-23)。[0649]图53a示出示例性双特异性蛋白的示意图，所述双特异性蛋白包含与cd3e结合vh和vl结构域融合的cldn6结合vl和vh结构域。将融合蛋白用包含6个组氨酸残基的his标签进行标记，以便于纯化和检测。[0650]图53b-图53c分别示出bite-23和bite-11的纯化和验证。cldn6-cd3双特异性蛋白在expicho表达系统(thermofisherscientific)中表达，并使用talon金属亲和树脂(clontechlaboratories,inc.,目录号635503)或蛋白l琼脂糖珠粒(thermofisherscientific,目录号20512)进行纯化。[0651]实施例22[0652]此实施例显示cldn6-cd3双特异性蛋白的体外表征。[0653]图54a-图54e示出cldn6-cd3双特异性蛋白与天然cldn6阳性细胞(ark2)以及经工程改造以过表达cldn6的细胞(hek293tcldn6-mgfphis20细胞)的有效结合。具体地，将cldn6阳性细胞(ark2和hek293tcldn6-mgfphis20细胞)和cldn6阴性细胞(hupt4)各自与cldn6-cd3双特异性蛋白和抗his二抗孵育以进行检测。进行流式细胞术测定(图54a-图54c)并拍摄细胞的图像(图54d和图54e)。cldn6-cd3双特异性蛋白结合至cldn6阳性细胞系，但不结合至cldn6阴性细胞系，从而证明双特异性蛋白与cldn6的特异性和有效结合。[0654]图55a-图55b示出cldn6-cd3双特异性蛋白诱导t细胞活化。使用jurkat细胞与nfat-re报告分子和cldn6-cd3双特异性蛋白进行t细胞活化测定。具体地，使用t细胞活化生物测定试剂盒(promega,目录号nfat-rej1621)测量t细胞活化。将多种细胞系(hek293t-cldn6阳性、hek293t-cldn6阴性、ark2、umuc4和okt3)以40,000个细胞/孔的密度接种在白色96孔板孔中，并在37℃下孵育过夜，然后将测定试剂盒中包含的解冻使用jurkatt细胞添加至接种的细胞中(1:1细胞比例)并用cldn6-cd3双特异性蛋白处理。将经处理的板在37℃下孵育6-24小时时间段，然后添加bio-glo试剂(包含在试剂盒中)并立即在victor3v光度计上以每秒计数(cps)为单位进行读取。当用bite-11和bite-23处理时，过表达cldn6(内源性和工程改造)的细胞系诱导t细胞的活化，而cldn6阴性细胞系诱导显著降低的活化水平。[0655]图56示出cldn6-cd3双特异性蛋白在与cldn6阳性细胞一起孵育后诱导t细胞簇集。具体地，图56示出处理后3天的cldn6-cd3细胞毒性测定的代表性图像。将pancd3 人pbmc与ark2(一种cldn6阳性细胞系)以不同的效应物:靶标比率共培养，并用cldn6-cd3双特异性蛋白或博纳吐单抗(阴性对照)处理。将用125ng/mlcldn6-cd3双特异性蛋白处理3天后显示t细胞簇集的代表性图像与博纳吐单抗对照进行比较(图56)。[0656]图57示出cldn6-cd3双特异性蛋白诱导针对癌细胞的靶特异性和剂量依赖性细胞毒性。具体地，图57示出cldn6-cd3双特异性蛋白在处理后3天诱导的ldh活性。ldh活性在与图55a-图55b相同的测定概述中被评估为细胞损伤的标志物。收集培养基并以14,500rpm离心10分钟。保存上清液并将6μl用于ldh活性测定(sigma，目录号mak066)。将具有10％fbs的rpmi用作阴性对照。测定在37℃下进行，并使用酶标仪(moleculardevice)以30秒间隔每15分钟测量od450nm。[0657]如图57所示，cldn6-cd3双特异性蛋白以剂量依赖性方式诱导靶标特异性细胞毒性。与用博纳吐单抗处理的细胞相比，与cd3阳性人pbmc共培养并用bite-11(p11-11)或bite-23(p23-7)处理的ark2细胞释放了显著更高水平的ldh。还观察到效应细胞与靶细胞比率依赖性反应，从而表明细胞毒性作用需要cd3阳性细胞。[0658]实施例23[0659]此实施例显示靶向cldn6的串联双抗体(tandab)的产生和体外表征。[0660]本文制备并测试了两种cldn6-cd16双特异性tandab：(a)ab1-11的cldn6结合部分与cd16a结合部分融合(tandab11)，和(b)ab3-7的cldn6结合部分与cd16a结合部分融合(tandab23)。[0661]图58示出示例性双特异性蛋白的示意图，所述双特异性蛋白包含与cd16a结合vh和vl结构域融合的cldn6结合vl和vh结构域。将融合蛋白用包含6个组氨酸残基的his标签进行标记，以便于纯化和检测。[0662]图59a-图59d示出cldn6-cd16a双特异性蛋白与天然cldn6阳性细胞(ark2)但不与cldn6阴性细胞(hupt4)的有效结合。具体地，将cldn6阳性细胞(ark2)和cldn6阴性细胞(hupt4)各自与cldn6-cd16atandab和抗his二抗孵育以进行检测。进行流式细胞术测定(图59a-图59b)并拍摄细胞的图像(图59c和图59d)。cldn6-cd16atandab结合cldn6阳性细胞，但不结合至cldn6阴性细胞，从而证明tandab与cldn6的特异性和有效结合。[0663]实施例24[0664]此实施例展示调节免疫应答的cldn6双特异性蛋白的体内抗癌活性。[0665]图60证明cldn6-cd3bite在注射有人pbmc的小鼠中的cldn6阳性癌细胞系异种移植物(umuc4)中的稳健体内抗癌活性。具体地，在腹膜内注射(a)1.0×107个人供体外周血单核细胞(pbmc)、(b)用il-2刺激的供体pbmc或(c)从人供体pbmc分离的nk细胞之前12天，向免疫功能低下(nsg)小鼠注射1.0×107个umuc4膀胱细胞。注射pbmc/nk细胞后的第二天，将小鼠用(a)1mg/kgblincytomab(非靶向对照)、(b)2mg/kgafm13(非靶向cd16tandab)、(c)1mg/kgbite-11、(d)1mg/kgbite-23、(e)20mg/kgtandab-11或(f)20mg/kgtandab-23连续治疗7天。作为对照，将另一组小鼠用10mg/kgab3-7ivqw治疗。在用bite-11或bite-23治疗的小鼠中观察到显著肿瘤消退。因此，cldn6-cd3bite具有稳健抗肿瘤活性。[0666]图61证明cldn6-cd3bite在blt小鼠中针对cldn6阳性癌细胞系异种移植物(umuc4)的体内抗癌活性。具体地，向免疫功能低下(nsg)小鼠植入胎儿供体cd38 干细胞和供体肝脏和胸腺的片段，以产生完全人源化的免疫系统。在注射1.0×107个umuc4膀胱癌细胞之前，在这些blt(骨髓肝脏胸腺)小鼠中证实了人免疫细胞的重建。一旦肿瘤达到200-300mm3的平均体积，就将小鼠就用(a)1mg/kg非靶向hu-igg1对照、(b)1mg/kgbite-23或(c)2mg/kgtandab-23通过静脉注射治疗连续5天。在用bite-23治疗的小鼠中观察到显著肿瘤消退。这些数据表明cldn6指导的bite非常有效，并且赋予抗肿瘤活性。[0667]本文所引用的所有参考文献(包括出版物、专利申请和专利)据此以引用的方式并入，其程度等同于每个参考文献单独地且具体地被表示为以引用的方式并入本文并且整体在本文得以陈述。[0668]在描述本公开的上下文中(尤其在随附权利要求书的上下文中)使用术语“一个/种(a/an)”和“所述”以及类似的提及物应解释为涵盖单数和复数，除非本文中另外指明或与上下文明显相矛盾。除非另外指出，否则术语“包含”、“具有”、“包括”和“含有”应解释为开放式术语(即意指“包括但不限于”)。[0669]除非在本文中另外指示，否则对本文中值范围的叙述仅意图充当个别提及属于所述范围和每个端点内的每一单独值的速记方法，并且每一单独值和端点并入本说明书中，如同在本文中个别地叙述一般。[0670]除非在本文另外指示或以其他方式与上下文明显相矛盾，否则本文所描述的所有方法可按任何合适的顺序进行。除非另外要求，否则使用的任何和所有实例，或本文所提供的各种语言(例如，“如”)仅意图更好地说明本发明并且并不对本发明的范围造成限制。本说明书中的任何语言都不应被解释为指示实践本公开所必需的任何未要求的要素。[0671]本文描述了本公开的某些实施方案，包括为本发明人所知用于实施本发明的最佳方式。阅读上述说明书后那些优选实施方案的变型对于本领域普通技术人员可变得明显。本发明人希望技术人员适当地采用此类变化，并且本发明人意图以本文具体描述的方式之外的方式来实践本公开。因此，本公开包括在随附的适用法律允许的权利要求中叙述的主题的所有修改和等效物。此外，除非本文另有指示或与上下文明显矛盾，否则在其所有可能变化形式的上述要素的任何组合都涵盖在本公开内。当前第1页12当前第1页12
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：：5.抗体构成了强大的治疗剂，其特征在于副作用有限，因为它们能够特异性地靶向细胞、细菌、病毒或毒素上的不同抗原。在1986年，第一种治疗性单克隆抗体orthocloneokt3被引入市场。从那时起，此类生物制药产品显著增长。在2014年底，美国或欧洲批准了47种单克隆抗体产品用于治疗多种疾病，包括癌症和炎症性疾病、心血管疾病、呼吸系统疾病和感染性疾病。6.目前，美国食品和药品管理局批准了十多种单克隆抗体来治疗癌症。这些剂之中有阿仑单抗其被指出用于慢性淋巴细胞性白血病(cll)；和曲妥珠单抗其用于治疗乳腺癌。将一些抗体用化学治疗药物标记，包括例如本妥昔单抗安适利(brentuximabvedotin)和ado-曲妥珠单抗恩美坦新(ado-trastuzumabemtansine)其他抗体产品，如博纳吐单抗(blinatumomab)(blincyto)被设计来识别并结合至两种不同的抗原。尽管此类抗体产品的商业可获得性，但目前的癌症发病率和癌症死亡率仍然高。据报告，每年每100,000名男性和女性的癌症发病率超过450人，并且每年每100,000名男性和女性的癌症死亡率刚超过170人。技术实现要素：7.本文提供了结合至密封蛋白-6(cldn6)的抗原结合蛋白及其双特异性型式。在各个方面，本公开的抗原结合蛋白结合至人cldn6并且任选地结合至小鼠cldn6。在各个方面，所述抗原结合蛋白结合至cldn6的细胞外结构域(ecd)。在各种情况下，所述抗原结合蛋白结合至cldn6的ecd的细胞外环2(el2)。在各个方面，所述抗原结合蛋白结合至el2，并且不结合至cldn6的ecd的细胞外环1(el1)。在各种情况下，所述抗原结合蛋白结合至人密封蛋白家族的另外成员，包括例如密封蛋白-3(cldn3)、密封蛋白-4(cldn4)和密封蛋白-9(cldn9)。在各种情况下，所述抗原结合蛋白结合至cldn6以及cldn4和cldn9中的至少一者。在各种情况下，所述抗原结合蛋白结合至cldn6，并且不结合至密封蛋白家族的任何其他成员。在各个方面，所述抗原结合蛋白结合至由人卵巢癌细胞(例如ovca429细胞)内源性表达的cldn6，并且在facs亲和力测定中表现出对ovca429细胞的小于约1200nm的ic50。在各种情况下，本公开的抗原结合蛋白在没有任何其他部分附接至所述抗原结合蛋白的情况下抑制受试者(例如人)中的肿瘤生长。8.本文进一步提供了与异源部分缀合(例如，与任何化学治疗剂、药物或毒性部分缀合)的抗原结合蛋白抑制受试者(例如人)中的肿瘤生长。在各种情况下，所述缀合的抗原结合蛋白是单克隆抗体。在各种情况下，所述抗体与改变微管动力学的剂(例如mmae)缀合。在各种情况下，缀合物包含可裂解的接头，例如，mc-vc-pab。在各个方面，所述缀合物是同质缀合物或异质缀合物。在各个方面，所述异源部分在所述抗原结合蛋白的特定位点处缀合。在各种情况下，所述缀合的抗原结合蛋白是双特异性抗原结合蛋白。9.在各个方面，所述双特异性抗原结合蛋白结合至由人癌细胞表达的cldn6。在各个方面，所述抗原结合蛋白抑制人cldn6与参考抗cldn6抗体之间的结合相互作用。不受特定理论的束缚，本文提供的抗原结合蛋白的抑制作用允许此类实体可用于减少肿瘤生长和治疗患有肿瘤或癌症的受试者的方法中。如本文进一步讨论的，在各个方面，所述抗原结合蛋白是抗体、其抗原结合抗体片段或抗体蛋白产物。10.本公开还提供了包含一组特定氨基酸序列的至少3、4、5个或所有氨基酸序列的双特异性抗原结合蛋白。在各个方面，所述抗原结合蛋白包含本文公开的cldn6抗体的至少3、4、5或6个互补决定区(cdr)氨基酸序列。11.本文进一步提供了相关的多肽、核酸、载体、宿主细胞和缀合物。此外还考虑了包含此类实体的药盒和药物组合物。12.还提供了制备双特异性抗原结合蛋白的方法。在各种实施方案中，所述方法包括培养包含编码如本文所述的双特异性抗原结合蛋白或多肽的核酸的宿主细胞以表达所述双特异性抗原结合蛋白或多肽。13.本文另外提供了治疗患有癌症的受试者的方法。在各种实施方案中，所述方法包括向所述受试者施用有效治疗所述受试者的癌症的量的本公开的药物组合物。14.还提供了治疗患有表达cldn6的癌症的受试者的方法，所述方法包括向所述受试者施用本文所述的药物组合物。进一步考虑了抑制受试者中的肿瘤生长的方法，所述方法包括向所述受试者施用本文所述的药物组合物。15.一种减小受试者中的肿瘤大小或预防受试者中的癌症复发的方法，所述方法包括向所述受试者施用本文所述的药物组合物。16.本文还提供了一种治疗被诊断为cldn6的低过表达者的受试者的癌症的方法，所述方法包括向所述受试者施用本文所述的药物组合物。17.在各种实施方案中，所述施用诱导肿瘤细胞，例如表达cldn6的细胞中的细胞凋亡。在各种实施方案中，所述施用诱导抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(adcc)或补体依赖性细胞毒性(cdc)、肿瘤坏死和细胞死亡或耗减，和/或肿瘤细胞粘附的破坏，其各自引起肿瘤消退或减缓肿瘤生长。附图说明18.图1表示正常(非癌性)组织中的cldn6表达的图。19.图2表示如通过agilent44k方法确定的癌细胞系中的cldn6表达的图。20.图3表示如通过rnaseq确定的癌细胞系中的cldn6表达的图。21.图4表示描绘不同细胞模型中的cldn6-gfp定位的一组荧光图像。22.图5表示人cldn6、人cldn3、人cldn4、人cldn9和小鼠cldn6的序列比对。显示了el1和el2的序列。23.图6a表示在用对照igg2抗体、ab3、参考ab1、参考ab2、参考ab3、ab2和ab3治疗后，携带子宫内膜肿瘤的小鼠中肿瘤随时间(天)变化的肿瘤体积(mm3)的图。图6b表示在用对照igg2抗体、ab3、参考ab1、参考ab2、参考ab3、ab2或ab3治疗的携带子宫内膜肿瘤的小鼠中的肿瘤在第14天的平均肿瘤体积(mm3)变化的图。24.图7a表示在用对照igg2抗体、ab3、参考ab1、参考ab2和ab3治疗后，携带膀胱肿瘤的小鼠中肿瘤随时间(天)变化的肿瘤体积(mm3)的图。图7b表示在用对照igg2抗体、ab3、参考ab1、参考ab2或ab3治疗的携带膀胱肿瘤的小鼠中的肿瘤在第35天的平均肿瘤体积(mm3)变化的图。25.图8a表示在用对照igg2抗体、ab3、参考ab1、ab2和ab3治疗后，携带卵巢肿瘤的小鼠中肿瘤随时间(天)变化的肿瘤体积(mm3)的图。图8b表示用对照igg2抗体、ab3、参考ab1、ab2或ab3治疗的携带卵巢肿瘤的小鼠中的肿瘤在第20天的平均肿瘤体积(mm3)变化的图。26.图9a表示在用对照igg2抗体、ab3、参考ab1、参考ab2、参考ab3和ab3治疗后，携带黑素瘤的小鼠中肿瘤随时间(天)变化的肿瘤体积(mm3)的图。图9b表示用对照igg2抗体、ab3、参考ab1、参考ab2、参考ab3或ab3治疗的携带黑素瘤的小鼠中的肿瘤在第21天的平均肿瘤体积(mm3)变化的图。27.图10a表示相对于用对照抗体治疗的小鼠，在用ab3治疗的携带肿瘤的小鼠中实现的肿瘤生长抑制％的图。图10b表示蛋白质印迹的图像，所述图像展示不同水平的cldn6id子宫内膜癌细胞系(ark2)、膀胱癌细胞系(umuc4)、卵巢癌细胞系(ov90)和黑素瘤细胞系(m202)和对照细胞。α-微管蛋白的水平大致相同，从而表明相等的蛋白质负载量。28.图11表示用媒介物对照、对照抗体、参考ab1、参考ab2、参考ab3和ab3治疗的携带肿瘤的小鼠的体重随时间(天)变化的变化％的图。29.图12a表示在用媒介物对照、对照igg2抗体、ab3、参考ab1或所指示抗cldn6抗体之一治疗后，携带卵巢肿瘤的小鼠中肿瘤随时间(天)变化的肿瘤体积(mm3)的图。图12b表示在用媒介物对照、对照igg2抗体、ab3、参考ab1或所指示抗cldn6抗体之一治疗的携带卵巢肿瘤的小鼠中的肿瘤在第28天的平均肿瘤体积(mm3)变化的图。30.图13表示用媒介物对照、对照抗体、参考ab1和所指示抗cldn6抗体治疗的携带肿瘤的小鼠的体重随时间(天)变化的变化％的图。31.图14表示本发明的几种抗cldn6抗体以及参考ab1和参考2的一系列剂量反应曲线。小鼠igg用作对照。32.图15a表示在用媒介物对照、对照igg抗体、ab3的小鼠形式、ab3的第一种人源化形式和ab3的第二人源化形式治疗的携带膀胱肿瘤的小鼠中的肿瘤在第35天的平均肿瘤体积(mm3)变化的图。图15b表示图15a中各组的肿瘤体积(mm3)的变化的图。33.图16a表示在用媒介物对照、对照igg抗体、ab3的小鼠形式、ab3的第一种人源化形式和ab3的第二人源化形式治疗的携带膀胱肿瘤的小鼠中的肿瘤在第35天的平均肿瘤体积(mm3)变化的图。在此实验中还测试了两种对照抗体(一种小鼠抗体和一种嵌合抗体)。图16b表示图16a中各组的肿瘤体积(mm3)的变化的图。34.图17a表示在用媒介物对照、对照igg抗体、ab1的小鼠形式和ab1的人源化形式治疗的携带膀胱肿瘤的小鼠中的肿瘤在第35天的平均肿瘤体积(mm3)变化的图。图17b表示图17a中各组的肿瘤体积(mm3)的变化的图。35.图18a表示在用媒介物对照、对照igg抗体、ab4的小鼠形式和ab4的人源化形式治疗的携带膀胱肿瘤的小鼠中的肿瘤在第35天的平均肿瘤体积(mm3)变化的图。图18b表示图18a中各组的肿瘤体积(mm3)的变化的图。36.图19a表示在用媒介物对照、对照igg抗体、ab3的小鼠形式、ab3的嵌合形式、ab3的第一人源化形式、ab3的第二人源化形式、ab1的小鼠形式、ab1的人源化形式、ab4的小鼠形式、ab4的人源化形式治疗的携带膀胱肿瘤的小鼠中的肿瘤在第35天的平均肿瘤体积(mm3)变化的图，并且也对四种对照抗体(具有小鼠形式或嵌合形式的一种抗体以及具有小鼠或人形式的一种抗体)在此实验中进行了测试。图19b表示图19a中各组的肿瘤体积(mm3)的变化的图。37.图20表示如图19a中所述治疗的携带膀胱肿瘤的小鼠中的肿瘤在第55天的平均肿瘤体积(mm3)变化的图。38.图21表示在第32天如图19a中所述治疗的携带肿瘤的小鼠体重的变化％的图。39.图22是制备和表征的12种cldn6抗体(命名为s1-s12)的重链可变区和轻链可变区的序列的列表。s1-s6是基于ab3的人源化型式(人源化ab3-7)，并且s7-s12是基于ab1的人源化型式(人源化ab1-11)。40.图23-图26是本公开的cldn6抗体的示例性下一代测序(ngs)鉴定的体细胞超突变(shm)的示意图。图23是基于ab-3的抗体和重链中的ngs鉴定的shm的图示。图24是基于ab-3的抗体和轻链中的ngs鉴定的shm的图示。图25是基于ab-1的抗体和重链中的ngs鉴定的shm的图示。图26是基于ab-1的抗体和轻链中的ngs鉴定的shm的图示。突变以chothia编号列出。41.图27是基于人源化ab3-7(abs1-s6)或人源化ab1-11(abs7-s12)的抗体s1-s12的facs结合测定结果的表。所测试的浓度在d列中示出。42.图28是不同细胞系中不同浓度的抗体s1-s12的facs结合测定结果的表。43.图29a是三种类型的n-聚糖(寡甘露糖、复合物和杂合体)以及此类糖的常用符号的图示。图29b是岩藻糖代谢的补救途径和从头途径的图解。在补救途径中，将游离l-岩藻糖转化为gdp-岩藻糖，而在从头途径中，gdp-岩藻糖通过由gmd和fx催化的三个反应合成。gdp-岩藻糖然后通过gdp-fuc转移酶从细胞溶质转运至高尔基体腔中并转移至受体寡糖和蛋白质。另一种反应产物gdp通过管腔核苷酸二磷酸酶转化为鸟苷5-单磷酸(gmp)和无机磷酸盐(pi)。前者输出到细胞溶质(通过与gdp岩藻糖转运相结合的反向转运系统)，而后者被假定通过高尔基阴离子通道golac离开高尔基体腔。参见例如，nordeen等人2000；hirschberg等人2001。44.图30是皮下注射人癌细胞、随后如本文所述治疗的小鼠中的肿瘤体积的图。45.图31是皮下注射人癌细胞、随后如本文所述治疗的小鼠中的肿瘤体积的图。46.图32是皮下注射人癌细胞、随后如本文所述治疗的小鼠中的肿瘤体积的图。47.图33是皮下注射人癌细胞、随后如本文所述治疗的小鼠中的肿瘤体积的图。48.图34a是如本文所述与仅二抗(黑线)或与全长抗体(红线、蓝线、绿线)一起孵育的ovca429细胞的信号的facs图。红线、蓝线和绿线的区别在于在二抗之前和/或之后的洗涤步骤不同。49.图34b是如本文所述与仅二抗(黑线)或与fab(红线、蓝线、绿线)一起孵育的ovca429细胞的信号的facs图。红线、蓝线和绿线的区别在于在二抗之前和/或之后的洗涤步骤不同。50.图34c是如本文所述与仅二抗(黑线)或与fab(红线、蓝线、绿线)一起孵育的ovca429细胞的信号的facs图。红线、蓝线和绿线的区别在于在二抗之前和/或之后的洗涤步骤不同。51.图34d是如本文所述与仅二抗(黑线)或与fab(红线、蓝线、绿线)一起孵育的ovca429细胞的信号的facs图。红线、蓝线和绿线的区别在于在二抗之前和/或之后的洗涤步骤不同。52.图34e是如本文所述与仅二抗(黑线)或与全长抗体和fab的混合物(红线、蓝线、绿线和紫线)一起孵育的ovca429细胞的信号的facs图。红线、蓝线、绿线和紫线的区别在于在二抗之前和/或之后的洗涤步骤不同。53.图35是列出facs图的定量信号的表。54.图36a是用仅二抗免疫染色的细胞的图像。图36b是用仅fab(充当一抗)免疫染色的细胞的图像。图36c是用fab和二抗免疫染色的细胞的图像。55.图37a是用于表达人源化ab3-7和ab1-11的scfv的表达载体的图示。图37b提供编码lc可变区和hc可变区(在其之间具有间隔区)的序列。56.图38a是来自与仅二抗(黑色)或与ab3-7scfv和二抗(红色)一起孵育的ark2细胞的信号的facs图。57.图38b是来自与仅二抗(黑色)或与ab3-7scfv和二抗(红色)一起孵育的m202细胞的信号的facs图。58.图39a是来自与(a)仅二抗(蓝色条形)、(b)ab3-7scfv、随后二抗(橙色条形)或(c)ab1-11scfv、随后二抗(灰色条形)一起孵育的过表达cldn6gfp的293t细胞、m202细胞或ark2细胞的信号的条形图。59.图39b是来自与(a)仅二抗(蓝色条形)、(b)ab3-7scfv、随后二抗(橙色条形)或(c)ab1-11scfv、随后二抗(灰色条形)一起孵育的过表达cldn6gfp的293t细胞、m202细胞或ark2细胞的gfp信号的条形图。60.图40a-图40c是由与仅二抗(黑线)或与ab3-7scfv、随后二抗(红线)或与ab1-11scfv、随后二抗(蓝线)一起孵育的过表达cldn6gfp的293t细胞(图40a)、m202细胞(图40b)或ark2细胞(图40c)产生的信号的facs图。61.图40d-图40f是展示图40a的每一组中的细胞数量的facs图。62.图41a-图41h示出包含ab3-7(也称为ab23)的cldn6抗体-药物缀合物(adc)的生物化学表征。图41a是总结cldn6adc的生物化学性质的表。图41b-图41h表示hic-hplc的色谱图，其示出与不同数量的药物缀合的抗体的相对丰度。63.图42示出通过天然page分析的包含ab3-7的cldn6adc的分子完整性。64.图43示出包含ab3-7的cldn6抗体-药物缀合物(adc)与天然cldn6阳性细胞或人工过表达cldn6的细胞的结合活性(流式细胞术)。65.图44示出包含ab3-7的cldn6adc与表达cldn6的细胞的结合亲和力。kd(解离常数)测量通过kinexa4000(sapidyneinstrument,boise,idaho)使用hek293tcldn6-mgfpa11细胞来进行。66.图45示出包含ab3-7的cldn6adc的体外表征。图展示cldn6adc的细胞内化。h23-7是指ab3-7。67.图46a-图46n示出cldn6adc的体外抗癌活性。图46a-图46g示出包含ab-3-7的不同cldn6adc对癌细胞的二维(2d)抗增殖作用：mc-vc-pab-mmae(常规)(图46a)；mc-vc-pab-mmae(d4技术)(图46b)；mc-ggfg-mmae(d4技术)(图46c)；cl2a-sn38(常规)(图46d)；cl2a-sn38(d4技术)(图46e)；mc-ggfg-dxd(图46f)；和mc-vc-pab-dxd(图46g)。图46h-图46n示出cldn6adc-11(与vc-pab-mmae缀合的ab1-11)对不同癌细胞系的2d抗增殖作用：ark2(图46h)；ovca429(图46i)；h841(图46j)；ov90(图46k)；h1693(图46l)；m202(图46m)；和mcf7(图46n)。68.图47示出cldn6adc-11针对cldn6阳性卵巢癌细胞系(ov90)异种移植物的体内抗癌功效。69.图48a-图48b示出cldn6adc-11针对cldn6阴性黑素瘤癌细胞系(m202)异种移植物没有抗癌活性。70.图49a-图49b示出cldn6adc-23(ab3-7-vc-pab-mmae)针对癌细胞系异种移植物的体内抗癌功效。图49a示出cldn6adc-23针对cldn6阳性膀胱细胞系(umuc4)异种移植物的抗癌活性。图49b示出在用对照抗体或5mg/kgadc-23治疗后的所指示时间点收集的异种移植物组织的苏木精和伊红(h&e)染色。71.图50a-图50e示出cldn6adc-23针对卵巢癌患者来源的异种移植物(pdx)的体内抗癌功效。图50a示出通过蛋白质印迹分析筛选cldn6表达的一组卵巢pdx样品。图50b是将用荧光素酶转染的pdx卵巢癌细胞注射到免疫功能低下小鼠(nsg)的腹腔中的示意图。图50c-图50e示出用如本文所述的cldn6adc-23治疗的小鼠的存活率。72.图51a-图51c示出cldn6adc-23针对cldn6阳性卵巢癌细胞系(ov90)异种移植物的剂量依赖性抗癌功效。图51a和图51b示出在所指示剂量和时间的肿瘤大小的消退。图51c示出用cldn6adc-23给药的小鼠的体重的变化百分比。73.图52a-图52c示出在cldn6阴性黑素瘤癌细胞系(m202)异种移植物中不存在cldn6adc-23的脱靶活性。图52a和图52b示出肿瘤体积的变化。图52b中所示的肿瘤体积是在第21天获得的。图52c示出用cldn6adc-23给药的小鼠的体重的变化百分比。74.图53a-图53c示出cldn6-cd3双特异性t细胞衔接剂(bite)的纯化和验证。图53a示出bite构建体的示意图。图53b和图53c分别示出bite-23(与cd3evh和vl融合的ab3-7vl和vh)和bite-11(与cd3evh和vl融合的ab1-11vl和vh)的纯化bite蛋白。75.图54a-图54e示出cldn6-cd3双特异性蛋白与天然cldn6阳性细胞(ark2)以及经工程改造以过表达cldn6的细胞(hek293tcldn6-mgfphis20细胞)的有效结合。示出由bite-11(11-1bite和11-2bite；独立产生的bite-11批次)或bite-23(23bite)结合的细胞的流式细胞术(图54a-图54c)。示出用bite-11(图54d)或bite-23(图54e)染色的ark2细胞。76.图55a-图55b示出cldn6-cd3双特异性蛋白诱导t细胞活化。bite-11(图55a)。bite-23(图55b)。77.图56示出cldn6-cd3双特异性蛋白在与cldn6阳性细胞一起孵育后诱导t细胞簇集。bite-11(中间图；p11bite)。bite-23(右图(p23bite)。78.图57示出cldn6-cd3双特异性蛋白诱导针对癌细胞的靶特异性和剂量依赖性细胞毒性。bite-11(上图；p11-11)。bite-23(下图；p23-7)。博纳吐单抗(对照)。79.图58示出示例性cldn6-cd16a双特异性串联双抗体(tandab)的示意图，所述双抗体包含与cd16a结合vh和vl结构域融合的cldn6结合vl和vh结构域。80.图59a-图59d示出cldn6-cd16atandab与cldn6阳性细胞(ark2)但不与cldn6阴性细胞(hupt4)的有效结合。tandab-11(图59a-图59c；标记为tandab-11-his或tandab11-cd16a-his)。tandab-23(图59a、图59b和图59d；标记为tandab-23-his或tandab23-cd16a-his)。81.图60示出cldn6-cd3bite的体内抗癌活性。样品包括blincyto(对照)、afm13(非靶向cd16tandab对照)；bite-23(标记为bite#23)；bite-11(标记为bite#11)；ab3-7(标记为mab#23)；tandab-11(标记为cd16-tandab#11)；和tandab-23(标记为cd16-tandab#23)。82.图61示出cldn6-cd3bite的体内抗癌活性。样品包括igg对照、bite-23(标记为bite#23)和tandab-23(标记为cd16-tandab#23)。83.图62a-图62d示出cldn6-cd3bite的氨基酸序列和核酸序列。图62a-图62b分别示出bite-11的氨基酸序列和核酸序列。图62c-图62d分别示出bite-23的氨基酸序列和核酸序列。84.图63a-图63d示出cldn6-cd16atandab的氨基酸序列和核酸序列。图63a-图63b分别示出tandab-11的氨基酸序列和核酸序列。图63c-图63d分别示出tandab-23的氨基酸序列和核酸序列。具体实施方式85.密封蛋白家族86.紧密连接(也称为封闭连接或闭锁小带)是位于两个相邻细胞之间的脊椎动物结构，所述结构调控细胞旁通透性并维持上皮和内皮细胞片层中的细胞极性。密封蛋白(cldn)基因家族编码膜蛋白，所述膜蛋白是87.紧密连接的重要组分。cldn蛋白包含四个跨膜(tm)螺旋(tm1、tm2、tm3和tm4)和两个细胞外环(el1和el2)。相邻细胞的cldn蛋白的细胞外环彼此相互作用以密封细胞片层并调控腔与基底外侧空间之间的细胞旁转运。88.cldn蛋白在各种人疾病和病理中发挥作用。例如，已证明cldn1基因中的突变导致皮肤进行性鳞剥以及胆管梗阻。cldn16基因的突变体导致镁消耗性病症。cldn19突变导致眼部疾患，如黄斑缺损和近视，而cldn14突变可导致非综合征性隐性耳聋。cldn3和cldn4已知是肠道中产气荚膜梭菌肠毒素的表面受体，并且cldn1、cldn6和cldn9是丙型肝炎病毒(hcv)进入的共受体。几种cldn蛋白已被证明在癌症中异常表达。例如，cldn1在乳腺癌和结肠癌中下调，而cldn3和cldn4在多种癌症中高度上调。89.密封蛋白-6(cldn6)是cldn家族的成员。编码人cldn6蛋白的基因位于人16号染色体p臂上的16p13.3处，并且在黑猩猩、恒河猴、狗、牛、小鼠、大鼠、斑马鱼和青蛙中是保守的。cldn6通常在人中表达为220个氨基酸的前体蛋白；其中前21个氨基酸构成信号肽。cldn6前体蛋白的氨基酸序列可在国家生物技术信息中心(ncbi)网站以ncbi参考序列np_067018.2公开获得，并在本文中提供为seqidno:1。seqidno:1的位置143处的氨基酸是ile。在一些情况下，由于编码cldn6的dna序列中的单核苷酸多态性(snp)，位置143处的氨基酸是val。具有在位置143处的val的人cldn6的氨基酸序列在本文中提供为seqidno:178。90.抗原结合蛋白91.本文提供了结合至密封蛋白-6(cldn6)的抗原结合蛋白。本公开的抗原结合蛋白可采用本领域中已知的多种形式的抗原结合蛋白中的任一种。在各种实施方案中，本公开的抗原结合蛋白采取抗体、或抗原结合抗体片段或抗体蛋白产物的形式。92.在本公开的各种实施方案中，抗原结合蛋白包含抗体、基本上由抗体组成或由抗体组成。如本文所用，术语“抗体”是指具有常规免疫球蛋白形式、包含重链和轻链并且包含可变区和恒定区的蛋白质。例如，抗体可以是igg，所述igg是两对相同的多肽链的“y形”结构，每一对具有一条“轻”链(通常具有约25kda的分子量)和一条“重”链(通常具有约50-70kda的分子量)。抗体具有可变区和恒定区。在igg形式中，可变区通常是约100-110个或更多个氨基酸，包含三个互补决定区(cdr)，主要负责抗原识别，并且在结合至不同抗原的其他抗体之间显著不同。恒定区允许抗体募集免疫系统的细胞和分子。可变区由每条轻链和重链的n端区域组成，而恒定区由每条重链和轻链的c端部分组成。(janeway等人,“structureoftheantibodymoleculeandtheimmunoglobulingenes”,immunobiology:theimmunesysteminhealthanddisease,第4版elsevierscienceltd./garlandpublishing,(1999))。93.本领域中已经描述了抗体的cdr的一般结构和性质。简言之，在抗体支架中，cdr包埋在重链和轻链可变区中的框架内，其中它们构成主要负责抗原结合和识别的区域。可变区通常包含在框架区(称为框架区1-4，即fr1、fr2、fr3和fr4，根据kabat等人,1991；还参见chothia和lesk,1987,同上)内的至少三个重链或轻链cdr(kabat等人,1991,sequencesofproteinsofimmunologicalinterest,publichealthservicen.i.h.,bethesda,md；还参见chothia和lesk,1987,j.mol.biol.196:901-917；chothia等人,1989,nature342:877-883)。94.抗体可包含本领域中已知的任何恒定区。人轻链被分类为κ轻链和λ轻链。重链被分类为μ、δ、γ、α或ε，并且将抗体的同种型分别定义为igm、igd、igg、iga和ige。igg具有若干亚类，包括但不限于igg1、igg2、igg3和igg4。igm具有亚类，包括但不限于igm1和igm2。本公开的实施方案包括抗体的所有此类类别或同种型。轻链恒定区可以是例如κ或λ型轻链恒定区，例如人κ或λ型轻链恒定区。重链恒定区可以是例如α、δ、ε、γ或μ型重链恒定区，例如人α、δ、ε、γ或μ型重链恒定区。因此，在各种实施方案中，抗体是同种型iga、igd、ige、igg或igm的抗体，包括igg1、igg2、igg3或igg4中的任一者。在各个方面，抗体包含相对于天然存在的对应物包含一个或多个氨基酸修饰的恒定区，以提高半衰期/稳定性或使抗体更适合于表达/制造。在各种情况下，抗体包含恒定区，其中天然存在的对应物中存在的c端lys残基被除去或修剪。95.抗体可以是单克隆抗体。在一些实施方案中，抗体包含与由哺乳动物例如小鼠、兔、山羊、马、鸡、仓鼠、人等产生的天然存在的抗体基本上相似的序列。在此方面，抗体可被认为是哺乳动物抗体，例如小鼠抗体、兔抗体、山羊抗体、马抗体、鸡抗体、仓鼠抗体、人抗体等。在某些方面，抗原结合蛋白是抗体，如人抗体。在某些方面，抗原结合蛋白是嵌合抗体或人源化抗体。术语“嵌合抗体”是指含有来自两种或更多种不同抗体的结构域的抗体。例如，嵌合抗体可含有来自一种物种的恒定结构域和来自第二物种的可变结构域，或者更一般地说，可含有来自至少两种物种的氨基酸序列链段。嵌合抗体还可含有同一物种内的两种或更多种不同抗体的结构域。当关于抗体使用时，术语“人源化”是指至少具有来自非人来源的cdr区的抗体，所述抗体被工程改造为具有与原始来源抗体相比更类似于真正人抗体的结构和免疫学功能。例如，人源化可涉及将来自非人抗体如小鼠抗体的cdr移植到人抗体中。人源化还可涉及选择氨基酸取代以使非人序列与人序列更相似。信息，包括人抗体重链和轻链恒定区的序列信息，可通过uniprot数据库以及抗体工程改造和生产领域中的技术人员众所周知的其他数据库公开获得。例如，igg2恒定区可从uniprot数据库以uniprot编号p01859获得，其以引用的方式并入本文。96.抗体可通过酶(例如木瓜蛋白酶和胃蛋白酶)裂解成片段。木瓜蛋白酶裂解抗体以产生两个fab片段和单个fc片段。胃蛋白酶裂解抗体以产生f(ab’)2片段和pfc’片段。在本公开的各个方面，本公开的抗原结合蛋白是抗体的抗原结合片段(也称为抗原结合抗体片段、抗原结合片段、抗原结合部分)。在各种情况下，抗原结合抗体片段是fab片段或f(ab’)2片段。97.抗体的结构已被用来创造越来越多的替代抗体形式，所述替代抗体形式跨越至少约12-150kda的分子量范围并且化合价(n)范围从单体(n＝1)至二聚体(n＝2)、三聚体(n＝3)、四聚体(n＝4)并且可能更高；此类替代抗体形式在本文中称为“抗体蛋白产物”。抗体蛋白产物包括基于完整抗体结构的那些和模拟保留完整抗原结合能力的抗体片段(例如scfv、fab和vhh/vh)(下文论述)的那些。保留其完整抗原结合位点的最小抗原结合片段是fv片段，其完全由可变(v)区组成。使用可溶性、柔性氨基酸肽接头将v区连接至scfv(单链可变片段)片段以稳定分子，或将恒定(c)结构域添加至v区以产生fab片段[抗原结合片段]。scfv和fab片段两者均可在宿主细胞(例如原核宿主细胞)中容易地产生。其他抗体蛋白产物包括二硫键稳定的scfv(ds-scfv)、单链fab(scfab)以及二聚体和多聚体抗体形式，如二、三和四抗体，或包含由连接至寡聚化结构域的scfv组成的不同形式的微型抗体(miniab)。最小的片段是骆驼重链抗体的vhh/vh以及单结构域抗体(sdab)。最常用于创建新型抗体形式的结构单元(buildingblock)是单链可变(v)结构域抗体片段(scfv)，其包含通过约15个氨基酸残基的肽接头连接的来自重链和轻链的v结构域(vh和vl结构域)。肽体或肽-fc融合物是另一种抗体蛋白产物。肽体的结构由移植到fc结构域上的生物活性肽组成。肽体在本领域中有详细描述。参见，例如，shimamoto等人,mabs4(5):586-591(2012)。[0098]其他抗体蛋白产物包括单链抗体(sca)；双抗体；三抗体；四抗体；双特异性或三特异性抗体等。双特异性抗体可分为五个主要类别：bsigg、附加igg、双特异性抗体(bsab)片段、双特异性融合蛋白和bsab缀合物。参见例如，spiess等人,molecularimmunology67(2)部分a:97-106(2015)。[0099]在各个方面，本公开的抗原结合蛋白包含这些抗体蛋白产物中的任一种、基本上由其组成或由其组成。在各个方面，本公开的抗原结合蛋白包含以下中的任一者、基本上由以下中的任一者组成或由以下中的任一者组成：scfv、fabvhh/vh、fv片段、ds-scfv、scfab、二聚抗体、多聚抗体(例如，双抗体、三抗体、四抗体)、miniab、骆驼科动物重链抗体的肽体vhh/vh、sdab、双抗体、三抗体、四抗体、双特异性或三特异性抗体、bsigg、附加的igg、bsab片段、双特异性融合蛋白和bsab缀合物。[0100]在各种情况下，本公开的抗原结合蛋白是单体形式、或聚合、寡聚体或多聚体形式的抗体蛋白产物。在抗体包含两个或更多个不同抗原结合区片段的某些实施方案中，所述抗体被认为是双特异性、三特异性或多特异性的，或二价、三价或多价的，这取决于由抗体识别和结合的不同表位的数目。[0101]在各种实施方案中，抗cldn6抗体或其抗体变体选自由以下组成的组：人抗体、人源化抗体、嵌合抗体、单克隆抗体、重组抗体、抗原结合抗体片段、单链抗体、单体抗体、双抗体、三抗体、四抗体、fab片段、igg1抗体、igg2抗体、igg3抗体和igg4抗体。[0102]在各个方面，本公开的抗原结合蛋白连接至治疗剂。如下文所述，治疗剂可以是本领域中已知的任何治疗剂，包括但不限于化学治疗剂、细胞因子和生长因子、细胞毒性剂等。参见下文的“缀合物”。[0103]双特异性形式[0104]在示例性方面，抗原结合蛋白是双特异性的，并且因此能够结合两种不同且独特的抗原。在示例性实施方案中，抗原结合蛋白是双特异性的并且结合至cldn6和第二抗原。[0105]在示例性情况下，第二抗原是由t细胞表达的细胞表面蛋白。在示例性方面，细胞表面蛋白是t细胞受体(tcr)的组分，例如cd3。在示例性情况下，第二抗原是辅助t细胞活化的共刺激分子，例如cd40或4-1bb(cd137)。在示例性方面，第二抗原是fc受体。在各个方面，fc受体是fcγ受体、fc-α受体、fc-ε受体。在示例性方面，fc受体是cd64(fc-γri)、cd32(fc-γriia)、cd16a(fc-γriiia)、cd16b(fc-γriiib)、fcεri、cd23(fc-εrii)、cd89(fc-εri)、fcα/μr或fcrn。在示例性方面，fc受体是cd16a。在示例性情况下，第二抗原是免疫检查点分子，例如参与免疫检查点途径的蛋白质。免疫检查点途径和在其中起作用的分子或蛋白质是本领域已知的。参见，例如pardoll,natrevgenet12(4):252-264(2012)。在示例性情况下，免疫检查点分子是a2ar、b7-h3、b7-h4、btla、ctla4、ido、kir、lag3、nox2、pd-1、tim3、vista或siglec7。任选地，免疫检查点分子是pd-1、lag3、tim3或ctla4。[0106]本领域中已知超过五十种形式的双特异性抗原结合蛋白，其中一些描述于kontermann和brinkmann,drugdiscoverytoday20(7):838-847(2015)；zhang等人,exphematoloncol6:12(2017)；spiess等人,molimmunol.；67(2pta):95-106(2015)中。在示例性方面，本公开的双特异性抗原结合蛋白是通过化学工程改造、遗传工程改造或四源杂交瘤(quadroma)技术制备的。[0107]在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白是用抗体的一些或全部恒定结构域构建的。在示例性方面，本公开的双特异性抗原结合蛋白包含fc多肽并保留fc介导的效应功能。在各种情况下，双特异性抗原结合蛋白是例如通过两个单克隆抗体(mab)的化学交联或通过杵和臼技术形成的双特异性单克隆抗体。在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白是通过“杵入臼(knobs-into-holes)”技术制备的，其中通过将不同的突变引入两个ch3结构域、从而产生不对称抗体来强制h链异二聚化。在一个hc中进行“杵”突变，并且在另一个hc中创建“臼”突变以促进异二聚化。在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白是通过四源杂交瘤技术产生的双特异性抗体，所述四源杂交瘤技术是基于两种不同杂交瘤细胞的体细胞融合，从而产生具有所需特异性的单克隆抗体。zhang等人,2017,同上。在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白是crossmab、邻-fabigg、dvd-ig、二合一igg、igg-scfv和scfv2-fc(kontermann和brinkmann，2015，同上。在各个方面，双特异性抗原结合蛋白是ig-scfv融合物，其中将新的抗原结合部分添加至全长igg中，从而产生对两种不同抗原具有四价的融合蛋白，例如，iggc端scfv融合物和iggn端scfv融合物。在示例性情况下，双特异性抗原结合蛋白是双重可变结构域-igg(dvd-igg)，其中对一种抗原具有特异性的igg的lc和hc可变区通过接头与对第二抗原具有特异性的igg的n端lc和hc可变区融合以形成dvd-igg。在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白是双抗体-fc融合物，其涉及用双特异性双抗体替代igg的fab片段。[0108]在替代情况下，本公开的双特异性抗原结合蛋白不包含fc多肽。在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白包含每种亲本单克隆抗体的可变结构域，并且接头被克隆和连接以形成单链双特异性抗体。在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白是串联scfv、双抗体形式、单链双抗体、串联双抗体(tandab)、双亲和力重靶向分子(dart)、对接锁定(dnl)和纳米抗体(fan等人,jhematoloncol.2015；8:130)。在各个方面，双特异性抗原结合蛋白是双特异性f(mab1)2、scfv、双特异性双抗体(bsdb)、单链双特异性双抗体(scbsdb)、单链双特异性串联可变结构域(scbstafv)、对接锁定三价fab(dnl-(fab)3)、单结构域抗体(sdab)或双特异性单结构域抗体(bssdab)。示例性方面，双特异性抗原结合蛋白是串联scfv，其包含通过额外的肽接头如甘氨酸-丝氨酸重复基序连接的两个scfv片段。任选地，串联scfv包含以下结构：vla-接头1–vha-接头2–vhb-接头3–vlb(vl和vh源自单链抗体片段；a和b代表亲本单克隆抗体a和b)。在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白是tandab，其包含连接在单个多肽链中的两对vl和vh结构域(reusch等人,mabs.2015；7(3):584-604)。两种多肽产物以头接尾的方式二聚化，从而在表达时形成具有大分子量(约105kda)的同二聚体。在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白是使用描述于pnas108(27):11187-92(2011)中的crossmab技术产生的双特异性抗原结合蛋白。crossmab没有任何化学接头或连接件，并且是通过在双特异性异二聚体igg抗体中强制执行正确轻链缔合的方法产生的。在示例性方面，crossmab是双(1 1)、三(2 1)和四(2 2)价双特异性crossmab，或者是基于非fc串联抗原结合片段(fab)的crossmab。在示例性情况下，crossmab是crossmabfab、crossmabvh-vl或crossmabch1-cl。[0109]在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白包括单结构域抗体或包含单一单体可变抗体结构域的纳米抗体。任选地，可变结构域是基于重链可变结构域。在替代方面，可变结构域是基于轻链可变结构域。[0110]在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白是双特异性t细胞衔接剂或bite是二价小分子，其仅包含通过柔性肽接头连接的scfv形式的抗体的可变区。在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白包含scfv，所述scfv包含当前公开的cldn6抗体的lc和hc可变区以及对第二抗原具有特异性的二抗的lc和hc可变区。在一些实施方案中，bite包含对cd3具有特异性的二抗的lc和hc可变区。在一些实施方案中，cd3是cd3e。[0111]在示例性情况下，双特异性抗原结合蛋白是双重亲和力重靶向(dart)，其与不同，dart的两条链之间的共价键联限制抗原结合位点的自由。因此，dart是结构紧凑的，并且可在靶细胞与效应细胞之间形成稳定的接触。dart包含两个工程改造的fv片段，所述fv片段自身的vh与另一个的vh交换。相互交换的fv结构域有利地通过短连接肽从构象约束中释放变体片段。[0112]在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白是包含与经修饰的hsa融合的两个scfv的hsabody。hsabody描述于mcdonagh等人,molcancerther.2012；11(3):582–93中。[0113]因此，在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白包含任何当前公开的cldn6抗体的抗原结合片段。在示例性方面，抗原结合片段是fab。在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白包含任何当前公开的cldn6抗体的f(ab)2’。在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白包含scfv，所述scfv包含任何当前公开的cldn6抗体的lc和hc可变区。在示例性方面，scfv包含seqidno:514或515的氨基酸序列。在各个方面，抗原结合片段基于重链可变区，并且在其他方面，抗原结合片段基于轻链可变区。在示例性方面，抗原结合片段包含hc可变区和lc可变区两者的至少一部分。在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白包含当前公开的cldn6抗体的lc或hc可变区中的至少一者(如果不是两者)和对第二抗原具有特异性的二抗的lc和hc可变区中的至少一者(如果不是两者)。在示例性情况下，双特异性抗原结合蛋白包含scfv，所述scfv包含当前公开的cldn6抗体的lc和hc可变区以及对第二抗原具有特异性的二抗的lc和hc可变区。[0114]cldn6和表位[0115]本公开的抗原结合蛋白结合至cldn6。在各个方面，cldn6是具有以下氨基酸序列的人cldn6：[0116]masagmqilgvvltllgwvnglvscalpmwkvtafignsivvaqvvweglwmscvvqstgqmqckvydsllalpqdlqaaralcviallvalfgllvylagakcttcveekdskarlvltsgivfvisgvltlipvcwtahaxirdfynplvaeaqkrelgaslylgwaasgllllgggllcctcpsggsqgpshymarystsapaisrgpseyptknyv，其中x是ile或val(seqidno:202)。[0117]在各个方面，人cldn6包含seqidno:1、178和200-202中任一个的氨基酸序列。[0118]在各个方面，本公开的抗原结合蛋白结合至cldn6的氨基酸序列内的表位。在各个方面，cldn6是人cldn6，并且本公开的抗原结合蛋白结合至人cldn6的氨基酸序列例如seqidno:1、178和200-202内的表位。“表位”是指由抗原结合蛋白结合的cldn6的区域或cldn6内的区域。在一些实施方案中，表位是线性表位。“线性表位”是指由抗原结合蛋白结合的cldn6的区域或cldn6内的区域，并且所述区域由cldn6的氨基酸序列的连续氨基酸组成。线性表位的氨基酸在cldn6的一级结构中彼此相邻。因此，线性表位是抗原(即cldn6)的氨基酸序列的片段或部分。在其他各种实施方案中，表位是构象或结构表位。“构象表位”或“结构表位”是指由仅当cldn6处于其正确折叠状态时彼此紧邻定位的氨基酸组成的表位。与线性表位不同，构象或结构表位的氨基酸在cldn6的一级结构(即氨基酸序列)中彼此不相邻。构象或结构表位不是由抗原(cldn6)的氨基酸序列的连续氨基酸组成。[0119]在各个方面，表位位于cldn6(例如人cldn6)的细胞外结构域(ecd)内。在各个方面，抗原结合蛋白结合至具有氨基酸序列wtahaiirdfynplvaeaqkrel(seqidno:2)的cldn6的ecd的细胞外环2(el2)。在各个方面，抗原结合蛋白所结合的表位位于seqidno:2内。在各个方面，本公开的抗原结合蛋白结合至seqidno:2的n端部分，例如tahaiirdfynpl(seqidno:3)。在各个方面，本公开的抗原结合蛋白结合至seqidno:2的c端部分，例如lvaeaqkrel(seqidno:4)。在各种情况下，本公开的抗原结合蛋白结合至el2，但不结合至cldn6的细胞外环1(el1)。在各个方面，本公开的抗原结合蛋白所结合的表位不同于包含含有seqidno:185的轻链可变区和含有seqidno:186的序列的重链可变区的抗cldn6抗体所结合的表位。在各个方面，本公开的抗原结合蛋白所结合的表位不同于包含含有seqidno:181的轻链可变区和含有seqidno:182的序列的重链可变区的抗cldn6抗体所结合的表位。[0120]在各个方面，抗原结合蛋白结合至人cldn6和非人cldn6。在各种情况下，非人cldn6是黑猩猩、恒河猴、狗、牛、小鼠、大鼠、斑马鱼或青蛙的cldn6。在各种情况下，抗原结合蛋白结合至人cldn6和小鼠cldn6。[0121]亲和力和亲合力[0122]本文提供的抗原结合蛋白以非共价和可逆方式结合至cldn6。在各种实施方案中，抗原结合蛋白与cldn6的结合强度可就其亲和力(抗原结合蛋白的结合位点与表位之间相互作用的强度的量度)而言进行描述。在各个方面，本文提供的抗原结合蛋白对cldn6具有高亲和力，并且因此与低亲和力抗原结合蛋白相比将在更短的时间段内结合更大量的cldn6。在各个方面，抗原结合蛋白具有平衡缔合常数ka，其为至少105mol-1、至少106mol-1、至少107mol-1、至少108mol-1、至少109mol-1或至少1010mol-1或至少1010mol-1、至少1010mol-1。正如普通技术人员所理解的，ka可受到包括ph、温度和缓冲液组成的因素的影响。[0123]在各种实施方案中，抗原结合蛋白与cldn6的结合强度可就其灵敏度而言进行描述。kd是平衡解离常数，即抗原结合蛋白与cldn6之间的koff/kon的比率。kd和ka呈负相关。kd值与抗原结合蛋白的浓度(特定实验所需的抗原结合蛋白的量)有关，并且因此kd值越低(浓度越低)，抗原结合蛋白的亲和力越高。在各个方面，抗原结合蛋白与cldn6的结合强度可就kd而言进行描述。在各个方面，本文提供的抗原结合蛋白的kd是约10-1、约10-2、约10-3、约10-4、约10-5、约10-6或更小。在各个方面，本文提供的抗原结合蛋白的kd是微摩尔、纳摩尔、皮摩尔或飞摩尔。在各个方面，本文提供的抗原结合蛋白的kd在约10-4至10-6、或10-7至10-9、或10-10至10-12或10-13至10-15的范围内。在各个方面，本文提供的抗原结合蛋白的kd在约1.0x10-12m至约1.0x10-8m的范围内。在各个方面，抗原结合蛋白的kd在约1.0x10-11m至约1.0x10-9m的范围内。[0124]在各个方面，使用基于流式细胞术或荧光活化细胞分选(facs)的测定来对抗原结合蛋白的亲和力进行测量或排名。基于流式细胞术的结合测定是本领域已知的。参见例如，cedeno-arias等人,scipharm79(3):569-581(2011)；rathanaswami等人,analyticalbiochem373:52-60(2008)；以及geuijen等人,jimmunolmethods302(1-2):68-77(2005)。在各个方面，使用trikha等人,intjcancer110:326-335(2004)和tam等人,circulation98(11):1085-1091(1998)以及下文中描述的竞争测定来对抗原结合蛋白的亲和力进行测量或排名。参见下文标题为“竞争测定”的章节。在trikh等人中，将表达抗原的细胞用于放射测定中。用悬浮液中的细胞测量125i标记的抗原结合蛋白(例如抗体)与细胞表面抗原的结合。在各个方面，将cldn6抗体的相对亲和力是通过基于facs的测定来测定，其中将不同浓度的与荧光团缀合的cldn6抗体与表达cldn6的细胞一起孵育，并且测定发出的荧光(其是抗体-抗原结合的直接量度)。绘制每个剂量或浓度的荧光的曲线。最大值是荧光稳定或达到最大值时的最低浓度，即发生结合饱和时。最大值的一半被认为是ec50或ic50，并且具有最低ec50/ic50的抗体被认为相对于以相同方式测试的其他抗体具有最高亲和力。这种测定在本文实施例5中描述。[0125]在各个方面，在竞争性结合抑制测定中确定的ic50值近似于抗原结合蛋白的kd。在各种情况下，如下文所论述，竞争测定是使用参考抗体、荧光团缀合的二抗和表达cldn6的细胞进行的基于facs的测定。在各个方面，将细胞进行遗传工程改造以过表达cldn6。在一些方面，细胞是用病毒载体转导以表达cldn6的hek293t细胞。在替代方面，细胞内源性地表达cldn6。在进行基于facs的测定之前，在一些方面，内源性地表达cldn6的细胞被预先确定为低cldn6表达细胞或高cldn6表达细胞。在一些方面，细胞是癌细胞或肿瘤细胞。在各个方面，细胞是来自细胞系，例如卵巢细胞系、子宫内膜细胞系、膀胱细胞系、肺细胞系、胃肠(gi)细胞系、肝细胞系、肺细胞系等的细胞。在各个方面，内源性地表达cldn6的细胞选自由以下组成的组：ovca429卵巢细胞、ark2子宫内膜细胞、oaw28卵巢细胞、umuc-4膀胱细胞、peo14卵巢细胞、ov177卵巢细胞、h1693肺细胞、mkn7上消化道细胞、ov-90卵巢细胞、huh-7肝细胞、jhos-4卵巢细胞、h1435肺细胞和nugc3上消化道细胞。在各个方面，抗原结合蛋白抑制由细胞表达的人cldn6与参考抗体之间的结合相互作用，所述参考抗体已知结合至cldn6，但不是本公开的抗原结合蛋白。在各种情况下，本公开的抗原结合蛋白与参考抗体竞争结合至人cldn6，并且由此降低结合至参考抗体的人cldn6的量，如通过体外竞争性结合测定所确定的。在各个方面，本公开的抗原结合蛋白抑制人cldn6与参考抗体之间的结合相互作用，并且所述抑制通过ic50来表征。在各个方面，对于抑制人cldn6与参考抗体之间的结合相互作用，抗原结合蛋白表现出小于约2500nm的ic50。在各个方面，抗原结合蛋白表现出小于约2000nm、小于约1500nm、小于约1000nm、小于约900nm、小于约800nm、小于约700nm、小于约600nm、小于约500nm、小于约400nm、小于约300nm、小于约200nm或小于约100nm的ic50。在各个方面，抗原结合蛋白表现出小于约90nm、小于约80nm、小于约70nm、小于约60nm、小于约50nm、小于约40nm、小于约30nm、小于约20nm或小于约10nm的ic50。在各种情况下，本公开的抗原结合蛋白与已知结合至cldn6的参考抗体(所述参考抗体不同于本公开的任何抗原结合蛋白)竞争结合至cldn6。参见竞争测定下的进一步说明。[0126]亲合力给出抗体-抗原复合物的总体强度的量度。它取决于三个主要参数：抗原结合蛋白对表位的亲和力、抗原结合蛋白和cldn6两者的效价以及相互作用的部分的结构排列。抗原结合蛋白的效价(抗原结合位点的数量)越大，它可结合的抗原(cldn6)的量就越大。在各个方面，抗原结合蛋白对cldn6具有强亲合力。在各个方面，抗原结合蛋白是多价的。在各个方面，抗原结合蛋白是二价的。在各种情况下，抗原抗原结合蛋白是单价的。[0127]交叉反应性[0128]在各种实施方案中，本公开的抗原结合蛋白结合至cldn6并且不结合至cldn家族的任何其他成员，例如不与cldn家族的任何其他成员交叉反应。在各种情况下，本公开的抗原结合蛋白是cldn-6特异性的。在各种实施方案中，本公开的抗原结合蛋白对cldn6的选择性是所述抗原结合蛋白对cldn3、cldn4、cldn9或其组合的选择性的至少10倍、5倍、4倍、3倍、2倍。在各种实施方案中，本公开的抗原结合蛋白对cldn6的选择性是所述抗原结合蛋白对cldn3、cldn4和cldn9中的每一者的选择性的至少10倍、5倍、4倍、3倍、2倍。选择性可以基于抗原结合蛋白对cldn6或cldn家族成员所表现出的kd，其中kd可通过本领域已知的技术(例如表面等离子体共振、基于facs的亲和力测定)确定。[0129]在各个方面，本公开的抗原结合蛋白结合至cldn6并且不结合至密封蛋白3(cldn3)、密封蛋白4(cldn4)和密封蛋白9(cldn9)中的任一者。在各个方面，抗原结合蛋白不结合至cldn3、cldn4和cldn9中的任一者，并且在使用内源性地表达cldn6的ovca429细胞的基于facs的测定中表现出小于约1200nm(例如，小于约1000nm、小于约750nm、小于约500nm、小于约250nm)的ic50。在各个方面，抗原结合蛋白不结合至cldn3、cldn4和cldn9中的任一者，并且使用内源性地表达cldn6的ovca429细胞达到50％结合饱和度时的浓度小于约1200nm(例如，小于约1000nm、小于约750nm、小于约500nm、小于约250nm)。在各个方面，抗原结合蛋白对cldn6的选择性是对cldn3、cldn4和cldn9的选择性的至少5倍，并且使用内源性地表达cldn6的ovca429细胞达到50％结合饱和度时的浓度小于约1200nm(例如，小于约1000nm、小于约750nm、小于约500nm、小于约250nm)。在各个方面，抗原结合蛋白对cldn6人工和内源性模型表现出小于约1200nm(例如，小于约1000nm、小于约750nm、小于约500nm、小于约250nm)的ic50，并且表现出cldn6ic50与cldn3、cldn4和/或cldn9分离的大于约5倍比率。在各种情况下，抗原结合蛋白对cldn6表现出小于约1200nm(例如，小于约1000nm、小于约750nm、小于约500nm、小于约250nm)的ic50并且对cldn3、cldn4和cldn9中的任一者表现出是所述ic50的至少5倍的ic50。[0130]在各种实施方案中，本公开的抗原结合蛋白结合至cldn6并且与cldn家族的至少一个其他成员交叉反应(例如结合)。在各个方面，本公开的抗原结合蛋白结合至cldn6以及cldn3、cldn4和cldn9中的一者或多者。在各个方面，本公开的抗原结合蛋白结合至cldn6和cldn4或cldn9，但不结合至cldn3。在各种情况下，本公开的抗原结合蛋白结合至cldn6和cldn4，但既不结合至cldn3也不结合至cldn9。在各种情况下，本公开的抗原结合蛋白结合至cldn6和cldn9，但不结合至cldn3或cldn4。[0131]竞争测定[0132]在各种实施方案中，抗原结合蛋白抑制人cldn6与参考抗体之间的结合相互作用，所述参考抗体已知结合至cldn6，但不是本公开的抗原结合蛋白。在各种情况下，本公开的抗原结合蛋白与参考抗体竞争结合至人cldn6，并且由此降低结合至参考抗体的人cldn6的量，如通过体外竞争性结合测定所确定的。在各种实施方案中，参考抗体结合至人cldn6的细胞外结构域的氨基酸序列内(任选地，el2或el1内)的表位。在各个方面，参考抗体包含由seqidno:179编码的轻链可变序列和由seqidno:180编码的重链可变序列。在各个方面，参考抗体包含seqidno:181的轻链可变序列和seqidno:182的重链可变序列。在各个方面，本公开的抗原结合蛋白抑制人cldn6与参考抗体之间的结合相互作用，并且所述抑制通过ic50来表征。在各个方面，对于抑制人cldn6与参考抗体之间的结合相互作用，抗原结合蛋白表现出小于约2500nm的ic50。在各个方面，抗原结合蛋白表现出小于约2000nm、小于约1500nm、小于约1000nm、小于约900nm、小于约800nm、小于约700nm、小于约600nm、小于约500nm、小于约400nm、小于约300nm、小于约200nm或小于约100nm的ic50。在各个方面，抗原结合蛋白表现出小于约90nm、小于约80nm、小于约70nm、小于约60nm、小于约50nm、小于约40nm、小于约30nm、小于约20nm或小于约10nm的ic50。[0133]在各种情况下，本公开的抗原结合蛋白与参考抗体竞争结合至人cldn6，并且由此降低结合至参考抗体的人cldn6的量，如通过体外竞争性结合测定所确定的。在各个方面，体外竞争性结合测定是基于facs的测定，其中在不存在或存在特定量的本公开的抗原结合蛋白的情况下测量结合至参考抗体的fc的荧光团缀合的二抗的荧光。这种基于facs的测定在本文的实施例中进行了描述。在各个方面，使用参考抗体、荧光团缀合的二抗和表达cldn6的细胞进行基于facs的测定。在各个方面，将细胞进行遗传工程改造以过表达cldn6。在一些方面，细胞是用病毒载体转导以表达cldn6的hek293t细胞。在替代方面，细胞内源性地表达cldn6。在进行基于facs的测定之前，在一些方面，内源性地表达cldn6的细胞被预先确定为低cldn6表达细胞或高cldn6表达细胞。在一些方面，细胞是癌细胞或肿瘤细胞。在各个方面，细胞是来自细胞系，例如卵巢细胞系、子宫内膜细胞系、膀胱细胞系、肺细胞系、胃肠(gi)细胞系、肝细胞系、肺细胞系等的细胞。在各个方面，内源性地表达cldn6的细胞选自由以下组成的组：ovca429卵巢细胞、ark2子宫内膜细胞、oaw28卵巢细胞、umuc-4膀胱细胞、peo14卵巢细胞、ov177卵巢细胞、h1693肺细胞、mkn7上消化道细胞、ov-90卵巢细胞、huh-7肝细胞、jhos-4卵巢细胞、h1435肺细胞和nugc3上消化道细胞。在各种情况下，本公开的抗原结合蛋白以高亲和力结合至由ark2细胞、ovca429细胞、ls513细胞或mcf7细胞中的一者或多者内源性地表达的cldn6。在各个方面，如使用ark2细胞、ovca429细胞、ls513细胞或mcf7细胞中的一者或多者在基于facs的竞争性结合抑制测定中所确定的，抗原结合蛋白表现出小于约3000nm的ic50。在各个方面，如使用ark2细胞、ovca429细胞、ls513细胞或mcf7细胞中的一者或多者在基于facs的竞争性结合抑制测定中所确定的，抗原结合蛋白表现出小于约2500nm、小于约2000nm、小于约1750nm、小于约1500nm、小于约1250nm、小于约1000nm、小于约750nm或小于约500nm的ic50。在各个方面，如使用ark2细胞、ovca429细胞、ls513细胞或mcf7细胞中的一者或多者在基于facs的竞争性结合抑制测定中所确定的，抗原结合蛋白表现出小于约400nm、小于约300nm、小于约200nm、小于约100nm、小于约75nm、小于约50nm、小于约25nm或小于约10nm的ic50。[0134]其他结合测定，例如竞争性结合测定或竞争测定是本领域中已知的，所述测定测试抗体与二抗竞争结合至抗原或其表位的能力。参见例如，trikha等人,intjcancer110:326-335(2004)；tam等人,circulation98(11):1085-1091(1998)。美国专利申请公布第us20140178905号；chand等人,biologicals46:168-171(2017)；liu等人,analbiochem525:89-91(2017)；和goolia等人,jvetdiagninvest29(2):250-253(2017)。此外，比较两种抗体的其他方法是本领域中已知的，并且包括例如表面等离子体共振(spr)。spr可用于确定抗体和二抗的结合常数，并且可比较两个结合常数。[0135]抗体产生方法及相关方法[0136]制备抗原结合蛋白(例如，抗体、抗原结合抗体片段和抗体蛋白产物)的合适方法是本领域中已知的。例如，用于产生抗体的标准杂交瘤方法描述于例如harlow和lane(编辑),antibodies:alaboratorymanual,cshpress(1988)；和ca.janeway等人(编辑),immunobiology,第5版,garlandpublishing,newyork,ny(2001))。本文在实施例中提供了制备cldn6单克隆抗体或本公开的各种方法。[0137]取决于宿主物种，可使用各种佐剂来增加免疫应答，从而引起宿主产生更多的抗体。此类佐剂包括但不限于弗氏佐剂(freund’s)、矿物胶如氢氧化铝和表面活性物质如溶血卵磷脂、普朗尼克多元醇(pluronicpolyol)、聚阴离子、肽、油乳剂、匙孔血蓝蛋白和二硝基酚。bcg(卡介苗)和棒状杆菌是潜在有用的人佐剂。[0138]其他抗体产生方法总结在表1中。[0139]表1[0140][0141]测试抗体结合至cldn6的表位的能力(不管抗体是如何产生的)的方法是本领域已知的，并且包括任何抗体-抗原结合测定，例如放射免疫测定(ria)、elisa、蛋白质印迹、免疫沉淀、spr和竞争性抑制测定(参见例如，janeway等人，下文和美国专利申请公布第2002/0197266号，以及以上关于竞争测定的部分)。[0142]序列/结构[0143]本文提供了抗原结合蛋白，所述抗原结合蛋白包含(a)表a中列出的重链(hc)互补决定区(cdr)1氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:11、17、23、29、35、41、47、53、59、65、71、77、83、89、95、101、107、113、119、125和131，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列；(b)表a中列出的hccdr2氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:12、18、24、30、36、42、48、54、60、66、72、78、84、90、86、102、108、114、120、126和132，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列；(c)表a中列出的hccdr3氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:13、19、25、31、37、43、49、55、61、67、73、79、85、91、97、103、109、115、121、127和133，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列；(d)表a中列出的轻链(lc)cdr1氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:8、14、20、32、38、44、50、56、62、68、74、80、86、92、98、104、110、116、122和128，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列；(e)表a中列出的lccdr2氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:9、15、21、27、33、39、45、51、57、63、69、75、81、87、93、99、105、111、117、123和129，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列；(f)表a中列出的lccdr3氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:10、16、22、28、34、40、46、52、58、64、70、76、82、88、94、100、106、112、118、124和130，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列；或(g)(a)-(f)中的任何两者或更多者的组合。[0144]表a[0145][0146][0147]在各个方面，抗原结合蛋白包含表a中列出的lccdr1氨基酸序列、lccdr2氨基酸序列和lccdr3氨基酸序列以及表a中列出的hccdr氨基酸序列中的至少1或2个。在各个方面，抗原结合蛋白包含表a中列出的hccdr1氨基酸序列、hccdr2氨基酸序列和hccdr3氨基酸序列和表a中列出的lccdr氨基酸序列中的至少1或2个。[0148]在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含由表a的单行中seqidno:指定的氨基酸序列中的至少3、4或5个。在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含由表a的单行的seqidno:指定的lccdr氨基酸序列中的每一个和由表a的单行中的seqidno:指定的hccdr氨基酸序列的至少1或2个。在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含由表a的单行的seqidno:指定的hccdr氨基酸序列中的每一个和由表a的单行的seqidno:指定的lccdr氨基酸序列中的至少1或2个。在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含由表a的单行的seqidno:指定的所有6个cdr氨基酸序列。在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含选自由以下组成的组的六个cdr氨基酸序列：(a)seqidno:74-79；(b)seqidno:50-55；(c)seqidno:122-127；(d)seqidno:26-31；(e)seqidno:128-133；(f)seqidno:38-43；(g)seqidno:62-67；(h)seqidno:80-85；(i)seqidno:44-49；(j)seqidno:86-91；(k)seqidno:104-109；(l)seqidno:56-61；(m)seqidno:32-37；(n)seqidno:110-115；(o)seqidno:98-103；(p)seqidno:92-97；(q)seqidno:116-121；(r)seqidno:8-13；(s)seqidno:68-73；(t)seqidno:14-19；以及(u)seqidno:20-25。[0149]在各种情况下，表a的氨基酸序列被至少一个或多个(例如，至少2、3、4、5、6、7、8、9、10个或更多个)间插氨基酸隔开。在各种情况下，lccdr1与lccdr2的序列之间存在约10至约20个氨基酸，并且lccdr2与lccdr3的序列之间存在约25至约40个氨基酸。在各种情况下，lccdr1与lccdr2的序列之间存在约14至约16个氨基酸，并且lccdr2与lccdr3的序列之间存在约30至约35个氨基酸。在各种情况下，hccdr1与hccdr2的序列之间存在约10至约20个氨基酸，并且hccdr2与hccdr3的序列之间存在约25至约40个氨基酸。在各种情况下，hccdr1与hccdr2的序列之间存在约14至约16个氨基酸，并且hccdr2与hccdr3的序列之间存在约30至约35个氨基酸。[0150]在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含(a)表b中列出的重链可变区氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:135、137、139、141、143、145、147、149、151、153、155、157、159、161、163、165、167、169、171、173和175,或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列；或(b)表b中列出的轻链可变区氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:134、136、138、140、142、144、146、148、150、152、154、156、158、160、162、164、166、168、170、172、174和176，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列；或(c)(a)和(b)两者。[0151]表b[0152][0153]在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含选自由以下组成的组的一对氨基酸序列：(a)seqidno:156和157；(b)seqidno:148和149；(c)seqidno:172和173；(d)seqidno:140和141；(e)seqidno:174和175；(f)seqidno:144和145；(g)seqidno:152和153；(h)seqidno:158和159；(i)seqidno:146和147；(j)seqidno:160和161；(k)seqidno:166和167；(l)seqidno:150和151；(m)seqidno:142和143；(n)seqidno:168和169；(o)seqidno:164和165；(p)seqidno:162和163；(q)seqidno:170和171；(r)seqidno:134和135；(s)seqidno:154和155；(t)seqidno:136和137；和(u)seqidno:138和139。[0154]在各个方面，抗原结合蛋白不包含由seqidno:179和180的序列编码的一对氨基酸序列。在各个方面，抗原结合蛋白不包含seqidno:181和182的一对氨基酸序列。在各个方面，抗原结合蛋白不包含由seqidno:183和184的序列编码的一对氨基酸序列。在各个方面，抗原结合蛋白不包含seqidno:185和186的一对氨基酸序列。[0155]在各个方面，抗原结合蛋白包含与上述氨基酸序列相似的氨基酸序列，但抗原结合蛋白基本上保留其生物学功能，例如其结合至人cldn6、减少肿瘤生长、治疗癌症的能力。[0156]在各个方面，抗原结合蛋白包含相对于以上提及的氨基酸序列仅相差1、2、3、4、5、6个或更多个氨基酸的氨基酸序列。在各个方面，抗原结合蛋白包含参考序列的变体序列，所述变体序列相对于参考序列仅相差一个或两个氨基酸。在各个方面，抗原结合蛋白包含发生在cdr之外的一个或多个氨基酸取代，例如，所述一个或多个氨基酸取代发生在重链或轻链的框架区内。在各个方面，抗原结合蛋白包含一个或多个氨基酸取代，但所述抗原结合蛋白保留六个cdr的氨基酸序列。在各个方面，抗原结合蛋白包含相对于以上提及的氨基酸序列仅具有1、2、3、4、5、6个或更多个保守氨基酸取代的氨基酸序列。如本文所用，术语“保守氨基酸取代”是指用具有相似性质(例如，大小、电荷、疏水性、亲水性和/或芳香性)的另一个氨基酸取代一个氨基酸，并且包括在以下五组中的一个内的交换：[0157]i.小的脂肪族、非极性或微极性残基：ala、ser、thr、pro、gly；ii.极性、带负电荷的残基及其酰胺和酯：asp、asn、glu、gln、半胱氨酸和同型半胱氨酸；iii.极性、带正电荷的残基：his、arg、lys；鸟氨酸(orn)iv.大的脂肪族非极性残基：met、leu、ile、val、cys、正亮氨酸(nle)、同型半胱氨酸v.大的芳香族残基：phe、tyr、trp、乙酰基苯丙氨酸[0158]在各个方面，保守氨基酸取代是以下氨基酸组中的一个内的交换：[0159]i.脂肪族氨基酸：gly、ala、val、leu、ile[0160]ii.包含侧链羟基的非芳香族氨基酸：sercthr[0161]iii.包含硫侧链的氨基酸：cys、met[0162]iv：包含侧链芳香环的氨基酸：phe、tyr、trp[0163]v：酸性氨基酸：glu；asp[0164]vi：碱性氨基酸：arg；lys[0165]vii：包含侧链酰胺的氨基酸：gln、asn[0166]viii：包含侧链咪唑的氨基酸：his，α-二甲基咪唑乙酸(dmia)[0167]ix：亚氨基酸：pro、4-羟基-pro、4-氨基-pro[0168]在各个方面，抗原结合蛋白包含与以上提及的氨基酸序列具有大于或约30％、大于或约50％、或大于或约70％序列同一性的氨基酸序列。在各个方面，抗原结合蛋白包含与以上提及的氨基酸序列具有至少30％、至少40％、至少50％、至少60％、至少70％、至少80％、至少85％、至少90％或具有大于90％序列同一性的氨基酸序列。在各个方面，抗原结合蛋白包含沿以上提及的氨基酸序列的全长具有至少70％、至少80％、至少85％、至少90％或具有大于90％序列同一性的氨基酸序列。在各个方面，抗原结合蛋白包含沿以上提及的氨基酸序列的全长具有至少95％、96％、97％、98％或99％序列同一性的氨基酸序列。[0169]在各个方面，抗原结合蛋白包含参考序列的变体序列，所述变体序列相对于以上提及的序列具有至少或约70％序列同一性。在各个方面，抗原结合蛋白包含参考序列的变体序列，所述变体序列相对于以上提及的序列具有至少或约80％序列同一性。在各个方面，抗原结合蛋白包含参考序列的变体序列，所述变体序列相对于以上提及的序列具有至少或约90％序列同一性。在各个方面，抗原结合蛋白包含参考序列的变体序列，所述变体序列相对于以上提及的序列具有至少或约95％序列同一性。[0170]在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含表a的单行中的seqidno中的一个、两个、三个、四个或五个序列以及与seqidno:8-133中的任一个具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的至少一个变体序列。在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含选自以下的一组序列中的一个、两个、三个、四个或五个序列：(a)seqidno:74-79；(b)seqidno:50-55；(c)seqidno:122-127；(d)seqidno:26-31；(e)seqidno:128-133；(f)seqidno:38-43；(g)seqidno:62-67；(h)seqidno:80-85；(i)seqidno:44-49；(j)seqidno:86-91；(k)seqidno:104-109；(l)seqidno:56-61；(m)seqidno:32-37；(n)seqidno:110-115；(o)seqidno:98-103；(p)seqidno:92-97；(q)seqidno:116-121；(r)seqidno:8-13；(s)seqidno:68-73；(t)seqidno:14-19；和(u)seqidno:20-25，其中所述抗原结合蛋白还包含与所述组的序列中的至少一个具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的至少一个变体序列。例如，在各个方面，抗原结合蛋白包含seqidno:74-79中的四个序列，即seqidno:74-77，其中所述抗原结合蛋白包含两个变体序列：与seqidno:78具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的一个变体序列和与seqidno:79具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的另一个变体序列。[0171]在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含与seqidno:134-175中的任一个具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的一对变体序列。在各种情况下，抗原结合蛋白包含与以下各项具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的一对变体序列：(a)seqidno:156和157；(b)seqidno:148和149；(c)seqidno:172和173；(d)seqidno:140和141；(e)seqidno:174和175；(f)seqidno:144和145；(g)seqidno:152和153；(h)seqidno:158和159；(i)seqidno:146和147；(j)seqidno:160和161；(k)seqidno:166和167；(l)seqidno:150和151；(m)seqidno:142和143；(n)seqidno:168和169；(o)seqidno:164和165；(p)seqidno:162和163；(q)seqidno:170和171；(r)seqidno:134和135；(s)seqidno:154和155；(t)seqidno:136和137；和(u)seqidno:138和139。在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含一对序列：表b的一个序列和另一个序列，所述另一个序列是与seqidno:134-175中的任一个具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列。在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含一对序列：选自以下的一个序列：(a)seqidno:156和157；(b)seqidno:148和149；(c)seqidno:172和173；(d)seqidno:140和141；(e)seqidno:174和175；(f)seqidno:144和145；(g)seqidno:152和153；(h)seqidno:158和159；(i)seqidno:146和147；(j)seqidno:160和161；(k)seqidno:166和167；(l)seqidno:150和151；(m)seqidno:142和143；(n)seqidno:168和169；(o)seqidno:164和165；(p)seqidno:162和163；(q)seqidno:170和171；(r)seqidno:134和135；(s)seqidno:154和155；(t)seqidno:136和137；以及(u)seqidno:138和139；以及另一个序列，所述另一个序列是与(a)–(u)的序列具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列。例如，在各个方面，抗原结合蛋白包含seqidno:134的序列，并且所述抗原结合蛋白还包含与seqidno135具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列。[0172]在各种情况下，抗原结合蛋白包含以上提及的氨基酸序列的氨基酸序列，所述氨基酸序列具有一个或多个氨基酸取代以减少或消除反应性氨基酸来减少或防止不想要的侧链反应。例如，抗原结合蛋白包含以上提及的氨基酸序列的氨基酸序列，所述氨基酸序列具有一个或多个(i)被his、tyr或phe取代的trp残基；(ii)被gln、ser、ala或asp取代的asn残基；(iii)紧接在被ala、ser或glu取代的pro残基之前出现的asp残基；(iv)被gln、ser或ala取代的asn残基；和/或(v)被tyr、ser或ala取代的cys残基。在各个方面，抗原结合蛋白包含以上提及的氨基酸序列的氨基酸序列，所述氨基酸序列具有基于shm事件或基于大量其他相似抗体序列的统计学分析被预测为具有更大结合亲和力、更大稳定性或其他积极属性的氨基酸取代。在一些方面，抗原结合蛋白包含(a)表a1中列出的hccdr1氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:452、455、461、465、71和472，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列；(b)表a1中列出的hccdr2氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:475、456、462、466、468和473，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列；(c)表a1中列出的hccdr3氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:453、457、463、467、469和474，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列；(d)表a1中列出的lccdr1氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:449、476、458、464、68和470，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列；(e)表a1中列出的lccdr2氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:450、477、459、57、69和471，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列；(f)表a1中列出的lccdr3氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:451、454、460、58、70和112，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列，或(g)(a)-(f)中的任何两者或更多者的组合。[0173]表a1[0174][0175]在一些方面，hccdrl包含紧接seqidno:452的n端的gly，并且任选地，在一些方面，hccdrl包含紧接seq452的c端的mx，其中x是h、n或s。在各个方面，hccdr3包含紧接seqidno:453的n端的ala。在各个方面，lccdr1还包含紧接seqidno:449的n端的tas，和任选地紧接seqidno:449的c端的xh，其中x是h、s、y或q。在一些方面，如下文所述，seqidno:449的第一个氨基酸是s或q。在一些方面，如下文所述，seqidno:451的第一个氨基酸是s或q。[0176]在各个方面，hccdr1包含紧接seqidno:455的n端的gly，并且任选地，在各个方面，hccdr1包含紧接seqidno:455的c端的mx，其中x是n、s或h。在一些方面，hccdr2包含紧接seqidno:seqidno:456的n端的gln，和任选地紧接seqidno:456的c端的h。在各个方面，lccdrl包含紧接seqidno:476的n端的ris，并且任选地包含紧接seqidno:476的c端的la。在各个方面，lccdr2包含紧接seqidno:477的c端的xlve，其中x是i或s。[0177]在各个方面，hccdr1包含紧接seqidno:461的c端的mh。在各个方面，hccdr2包含紧接seqidno:462的n端的tyr，和任选地紧接seqidno:462的c端的th。在示例性方面，hccdr3不包含seqidno:463的前两个氨基酸。在各个方面，lccdrl包含紧接seqidno:458的n端的rss，和任选地紧接seqidno:458的c端的ln。在各个方面，lccdr2包含紧接seqidno:459的c端的xrfs，其中x是q、s、a或d。[0178]在各个方面，hccdr1包含紧接seqidno:465的c端的mh。在各个方面，hccdr2包含紧接seqidno:466的n端的yi，和任选地紧接seqidno:466的c端的xaa，其中xaa是n、s、q或a。在各个方面，lccdrl包含紧接seqidno:464的n端的las，和任选地紧接seqidno:464的c端的la。在各个方面，lccdr2包含紧接seqidno:57的c端的slad。[0179]在各个方面，hccdr1包含紧接seqidno:71的c端的mh。在各个方面，hccdr2包含紧接seqidno:468的n端的tyr，和任选地紧接seqidno:468的c端的iy。在各个方面，lccdrl包含紧接seqidno:68的n端的ras，和任选地紧接seq68的c端的syih。在各个方面，lccdr2包含紧接seqidno:69的c端的xles，其中x是n、q、s、a或d。[0180]在各个方面，lccdrl包含紧接seqidno:470的n端的kss，和任选地紧接seqidno:470的c端的yla。在各个方面，lccdr2包含紧接seqidno:471的c端的tres。在各个方面，hccdrl包含紧接seqidno:472的c端的mn。在各个方面，hccdr2包含紧接seq473的n端的xaa，其中xaa是n、q、s或a，和任选地紧接seq473的c端的thr。[0181]在各个方面，抗原结合蛋白包含表a1中列出的lccdr1氨基酸序列、lccdr2氨基酸序列和lccdr3氨基酸序列以及表a1中列出的hccdr氨基酸序列中的至少1或2个。在各个方面，抗原结合蛋白包含表a1中列出的hccdr1氨基酸序列、hccdr2氨基酸序列和hccdr3氨基酸序列以及表a1中列出的lccdr氨基酸序列中的至少1或2个。[0182]在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含由表a1的单行中的seqidno:指定的氨基酸序列中的至少3、4或5个。在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含由表a1的单行的seqidno:指定的lccdr氨基酸序列中的每一个以及由表a1的单行中的seqidno:指定的hccdr氨基酸序列中的至少1或2个。在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含由表a1的单行的seqidno:指定的hccdr氨基酸序列中的每一个以及由表a1的单行的seqidno:指定的lccdr氨基酸序列中的至少1或2个。在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含由表a1的单行的seqidno:指定的所有6个cdr氨基酸序列。在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含选自由以下组成的组的六个cdr氨基酸序列：(a)seqidno:449-453和475；(b)seqidno:476-477、454-457；(c)seqidno:458-463；(d)seqidno:57、58、464-467；(e)seqidno:68-71和468-469；以及(f)seqidno:112和470-474。[0183]在各种情况下，表a1的氨基酸序列被至少一个或多个(例如，至少2、3、4、5、6、7、8、9、10个或更多个)间插氨基酸隔开。在各种情况下，lccdr1与lccdr2的序列之间存在约10至约20个氨基酸，并且lccdr2与lccdr3的序列之间存在约25至约40个氨基酸。在各种情况下，lccdr1与lccdr2的序列之间存在约14至约16个氨基酸，并且lccdr2与lccdr3的序列之间存在约30至约35个氨基酸。在各种情况下，hccdr1与hccdr2的序列之间存在约10至约20个氨基酸，并且hccdr2与hccdr3的序列之间存在约25至约40个氨基酸。在各种情况下，hccdr1与hccdr2的序列之间存在约14至约16个氨基酸，并且hccdr2与hccdr3的序列之间存在约30至约35个氨基酸。[0184]各种实施方案中，抗原结合蛋白包含(a)表b1中列出的重链可变区氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:478、480、482、484、486和488，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列；或(b)表b1中列出的轻链可变区氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:479、481、483、485、487和489，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列；或(c)(a)和(b)两者。[0185]表b1[0186]hc可变lc可变ab1*478479ab3*480481ab4*482483ab9*488489ab11*486487ab18*484485[0187]在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含选自由以下组成的组的一对氨基酸序列：(a)seqidno:478和479；(b)seqidno:480和481；(c)seqidno:482和483；(d)seqidno:484和485；(e)seqidno:486和487；以及(f)seqidno:488和489。在各个方面，抗原结合蛋白包含具有表b1中列出的seqidno:的序列的变体序列，所述变体序列仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性，其中不同的氨基酸出现在下文“人源化抗体”中描述的位置处。[0188]人源化抗体[0189]在各个方面，抗原结合蛋白是表a、表a1、表b或表b1中描述的抗原结合蛋白的人源化型式。[0190]人源化ab1[0191]在各个方面，抗原结合蛋白是在重链可变区中的一个或多个以下位置处具有一个或多个(例如，2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34或35个)氨基酸取代的如表b或b1中列出的ab1的人源化型式：5、8、11、12、13、20、31、33、35、38、40、48、50、55、57、59、61、65、66、67、68、70、72、74、76、79、80、82、87、90、91、98、101和116。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:428的氨基酸序列。在各个方面，抗原结合蛋白是在重链可变区中的一个或多个(例如，1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12个)以下位置处具有一个或多个氨基酸取代的如表b或b1中列出的ab1的人源化型式：20、31、35、48、50、59、67、70、74、79、98、101。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:429的氨基酸序列。在各个方面，上述位置处的氨基酸选自根据下表的氨基酸：[0192]位置氨基酸位置氨基酸位置氨基酸5q，v8a，g11l，v12a，k13r，k20m，v31s，t，v，d33y，t35h，n，s38k，r40r，a48i，m50f，v，t，y，i55g，s57s，y59d，e，n，s61n，a65k，q66d，g67r，q，n，k68t，v70l，m72r，a74k，tꢀꢀ79v，d，s，a82q，e87t，r91s，t98n，q，h，d，r101y76st116a，s[0193]在各个方面，抗原结合蛋白是在轻链可变区中的一个或多个(例如2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40或41个)以下位置处具有一个或多个氨基酸取代的如表b或b1中列出的ab1的人源化型式：1、3、4、9、10、11、15、17、21、24、27、29、32、34、35、43、44、48、51、52、53、54、55、56、61、67、71、72、73、79、80、81、84、90、92、93、94、95、96、101、107。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:430的氨基酸序列。在各个方面，抗原结合蛋白是在轻链可变区中的一个或多个(例如，1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12或13个)以下位置处具有一个或多个氨基酸取代的如表b或b1中列出的ab1的人源化型式：4、21、32、34、48、51、53、61、67、79、84、91和93。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:431的氨基酸序列。在各个方面，上述位置处的氨基酸选自根据下表的氨基酸：[0194][0195][0196]人源化ab3[0197]在各个方面，抗原结合蛋白是在重链可变区中的一个或多个(例如，1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32或33个)以下位置处具有一个或多个氨基酸取代的如表b或b1中列出的ab3的人源化型式：3、5、18、19、23、31、33、35、40、42、49、50、52、53、54、55、56、57、58、59、61、64、76、79、80、81、87、94、95、99、106、112、114。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:432的氨基酸序列。在各个方面，抗原结合蛋白是在重链可变区中的一个或多个(例如，1、2、3、4、5、6或7个)以下位置处具有一个或多个氨基酸取代的如表b或b1中列出的ab3的人源化型式：31、35、50、55、79、99、106。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:433的氨基酸序列。在各个方面，上述位置处的氨基酸选自根据下表的氨基酸：[0198]位置氨基酸位置氨基酸位置氨基酸3k，q5e，l18m，l19k，r23v，a31n，s，r33w，a35n，s，h40s，a42e，g49a，s50q，s，n，h，aꢀꢀ52r，s53l，g54k，s55s，n，t，a，g56d，gꢀꢀꢀꢀ59a，s61h，y64e，d76d，n79r，n，q，d，s80s，t81v，l87n，s94g，a95t，v，i99n，d，t，k，a106c，y，a，s，t112t，l114i，tꢀꢀꢀꢀ[0199]在各个方面，抗原结合蛋白是在轻链可变区中的一个或多个(例如，1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28或29个)以下位置处具有一个或多个氨基酸取代的如表b或b1中列出的ab3的人源化型式：9、17、18、25、27、28、30、34、40、43、45、48、50、52、53、55、56、70、72、74、76、84、85、90、91、93、94、97和100。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:434的氨基酸序列。在各个方面，抗原结合蛋白是在轻链可变区中的一个或多个(例如，1、2、3、4、5、6、7、8或9个)以下位置处具有一个或多个氨基酸取代的如表b或b1中列出的ab3的人源化型式：25、34、48、53、55、84、85、90和93。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:435的氨基酸序列。在各个方面，上述位置处的氨基酸选自根据下表的氨基酸：[0200]位置氨基酸位置氨基酸位置氨基酸9a，s17e，d18t，r25i，v，l，t，a34a，s，n40q，p43s，a45q，k48v，i53i，v，l，t，s55v，t，l，a，q70q，d72s，t74k，t76n，s84g，a85n，q，s，t90h，q，s，t93t，s，n，g100g，q27e，q28n，s30y，s50n，a52k，s56e，s91h，s94v，t97t，pꢀꢀ[0201]人源化ab4[0202]在各个方面，抗原结合蛋白是在重链可变区中的一个或多个(例如，1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35或36个)以下位置处具有一个或多个氨基酸取代的如表b或b1中列出的ab4的人源化型式：5、11、12、13、20、29、31、33、37、38、40、45、48、50、55、56、57、59、61、62、65、66、67、68、70、72、74、76、79、82、84、87、91、97、101、117。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:436的氨基酸序列。在各个方面，抗原结合蛋白是在轻链可变区中的一个或多个(例如，1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18或19个)以下位置处具有一个或多个氨基酸取代的如表b或b1中列出的ab4的人源化型式：20、29、31、37、45、48、56、59、61、62、65、66、68、70、74、79、84、97和101。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:437的氨基酸序列。在各个方面，上述位置处的氨基酸选自根据下表的氨基酸：[0203][0204][0205]在各个方面，抗原结合蛋白是在轻链可变区中的一个或多个(例如，1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23或24个)以下位置处具有一个或多个氨基酸取代的如表b或b1中列出的ab4的人源化型式：7、14、17、18、31、33、39、41、42、44、50、51、55、57、60、81、88、92、94、95、96、99、100、105。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:438的氨基酸序列。在各个方面，抗原结合蛋白是在轻链可变区中的一个或多个(例如，1、2、3、4、5、6或7个)以下位置处具有一个或多个氨基酸取代的如表b或b1中列出的ab4的人源化型式：33、39、55、57、81、95、96。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:439的氨基酸序列。在各个方面，上述位置处的氨基酸选自根据下表的氨基酸：[0206]位置氨基酸位置氨基酸位置氨基酸7t，s14s，t17d，q18q，p31y，h33d，n，e，q39h，n，q，d41f，y42l，q44k，r50k，r51r，l55k，r，q57s，t，v60d，f81r，s，n，d88l，v92f，y94m，s95q，h，t96s，t，g，d99w，v105g，qꢀꢀ[0207]人源化ab18[0208]在各个方面，抗原结合蛋白是在重链可变区中的一个或多个(例如，1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25个)以下位置处具有一个或多个氨基酸取代的如表b或b1中列出的ab18的人源化型式：5、9、11、12、20、38、40、41、43、44、48、61、65、67、68、70、72、74、76、79、82、84、87、91和116，任选地一个或多个(例如，1、2、3、4或5个)以下位置：20、48、68、70、79。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:440或441的氨基酸序列。在各个方面，上述位置处的氨基酸选自根据下表的氨基酸：[0209][0210][0211]在各个方面，抗原结合蛋白是在轻链可变区中的一个或多个(例如，1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15或16个)以下位置处具有一个或多个氨基酸取代的如表b或b1中列出的ab18的人源化型式：1、3、9、15、18、19、21、22、49、51、69、93、84、78、105和111，任选地一个或多个(例如，1、2或3个)以下位置：19、21或84。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:442或443的氨基酸序列。在各个方面，上述位置处的氨基酸选自根据下表的氨基酸：[0212]位置氨基酸位置氨基酸位置氨基酸1n，d3m，v9s，d15a，l18k，r19v，a21m，i22s，n49s，p51r，k69t，s83n，s84v，l89l，v105a，q111l，iꢀꢀꢀꢀ[0213]人源化ab9[0214]在各个方面，抗原结合蛋白是在重链可变区中的一个或多个(例如，1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28或29个)以下位置处具有一个或多个氨基酸取代的如表b或b1中列出的ab9的人源化型式：1、5、9、11、12、20、38、40、41、43、44、48、61、63、65、67、69、70、72、73、74、76、79、84、87、91、93、112和113。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:444的氨基酸序列。在各个方面，上述位置处的氨基酸选自根据下表的氨基酸：[0215][0216][0217]在各个方面，抗原结合蛋白是在轻链可变区中的一个或多个(例如，1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14或15个)以下位置处具有一个或多个氨基酸取代的如表b或b1中列出的ab9的人源化型式：9、11、15、17、18、43、45、70、72、73、74、80、84、85和100。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:445的氨基酸序列。在各个方面，上述位置处的氨基酸选自根据下表的氨基酸：[0218]位置氨基酸位置氨基酸位置氨基酸9a，s11q，l15l，v17e，d18s，r43s，a45q，k70r，d72s，t73f，l74k，r80a，p84v，a85s，t100g，q[0219]人源化ab11[0220]在各个方面，抗原结合蛋白是在重链可变区中的一个或多个(例如，1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14或15个)以下位置处具有一个或多个氨基酸取代的如表b或b1中列出的ab11的人源化型式：1、15、18、19、42、49、63、75、76、78、80、84、88和93。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:446的氨基酸序列。在各个方面，上述位置处的氨基酸选自根据下表的氨基酸：[0221]位置氨基酸位置氨基酸位置氨基酸1d，e15r，g18r，l19k，r42e，g49a，s63t，s75p，a76t，k78t，s80f，y84t，n88s，a93m，vꢀꢀ[0222]在各个方面，抗原结合蛋白是在轻链可变区中的一个或多个(例如，1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14或15个)以下位置处具有一个或多个氨基酸取代的如表b或b1中列出的ab11的人源化型式：4、9、17、22、64、78、80、81、82、83、84、87、89、104和110，任选地一个或多个以下位置：4、82、110。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:447或448的氨基酸序列。在各个方面，上述位置处的氨基酸选自根据下表的氨基酸：[0223][0224][0225]在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含(a)表c中列出的重链可变区氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：376-379、384-387、391-396、403-408、412、413、416-419和422-427，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％、或约80％、或约85％、或约90％、或约95％序列同一性的变体序列；或(b)表c中列出的轻链可变区氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：380-383、388-390、397-402、409-411、414、415、420和421，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％、或约80％、或约85％、或约90％、或约95％序列同一性的变体序列；或(c)(a)和(b)两者。[0226]表c[0227][0228]在各种实施方案中，人源化抗原结合蛋白包含如表d中所示的一对氨基酸序列。[0229]表d[0230][0231][0232]在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含一对变体序列，所述变体序列各自与表c中列出的seqidno具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性。在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含一对序列：选自表c中列出的seqidno:的一个序列，和另一个序列，所述另一个序列是与具有表d中列出的seqidno:序列具有表c中列出的seqidno:的序列具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列。[0233]在各种实施方案中，抗原结合蛋白包含一对序列：选自表d中列出的seqidno:的一个序列，和另一个序列，所述另一个序列是与具有表d中列出的seqidno:的序列具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列。例如，在各个方面，抗原结合蛋白包含seqidno:419的序列，并且所述抗原结合蛋白还包含与seqidno421具有至少或约70％(例如，至少约80％、至少约85％、至少约90％、至少约95％)序列同一性的变体序列。[0234]在各种情况下，抗原结合蛋白是在重链(hc)可变区中或在轻链(lc)可变区中或在两者中具有一个或多个(例如，2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34或35个)氨基酸取代的如表d中列出的人源化抗原结合蛋白。在示例性方面，抗原结合蛋白是在hc可变区、lc可变区或两者中具有一个或多个氨基酸取代的ab1-11的人源化抗原结合蛋白。在示例性方面，抗原结合蛋白包含seqidno:379的具有1、2、3、4或5个氨基酸取代的hc。在示例性方面，抗原结合蛋白包含seqidno:504的hccdr1、seqidno:505的hccdr2、seqidno:506的hccdr3或其组合。在示例性情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:503的hc。在一些方面，抗原结合蛋白包含seqidno:496-501中的任一个的hc。在一些方面，抗原结合蛋白包含在图22中标记为s7-s12的hc序列。在各种情况下，轻链可变区包含seqidno:449的lccdr1、seqidno:450的lccdr2、seqidno:451的lccdr3或其组合。在一些方面，抗原结合蛋白包含seqidno:380-383和479中的任一个的lc。在示例性情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:383的lc。在一些方面，抗原结合蛋白包含在图22中标记为s7-s12的lc序列。在示例性方面，抗原结合蛋白是在hc可变区、lc可变区或两者中具有一个或多个氨基酸取代的ab3-7的人源化抗原结合蛋白。在示例性方面，抗原结合蛋白包含seqidno:387的具有1、2、3、4、5或6个氨基酸取代的hc。在示例性方面，抗原结合蛋白包含seqidno:507的hccdr1、seqidno:508的hccdr2、seqidno:509的hccdr3或其组合。在示例性情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:502的hc。在一些方面，抗原结合蛋白包含seqidno:490-495中的任一个的hc。在一些方面，抗原结合蛋白包含在图22中标记为s1-s6的hc序列。在各种情况下，轻链可变区包含seqidno:476的lccdr1、seqidno:477的lccdr2、seqidno:454的lccdr3或其组合。在一些方面，抗原结合蛋白包含seqidno:388-390和481中的任一个的lc。在示例性情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:389的lc。在一些方面，抗原结合蛋白包含在图22中标记为s1-s6的lc序列。在示例性方面，抗原结合蛋白是在hc可变区、lc可变区或两者中具有一个或多个氨基酸取代的ab3的人源化抗原结合蛋白。在示例性方面，抗原结合蛋白包含seqidno:139的具有1、2、3、4或5个(或更多个)氨基酸取代的hc。在一些方面，抗原结合蛋白包含seqidno:510中的任一个的hc。在一些方面，抗原结合蛋白包含seqidno:510的具有如图23所示的1、2、3、4或5个(或更多个)氨基酸取代的hc序列。在示例性方面，抗原结合蛋白包含seqidno:138的具有1、2、3、4或5个(或更多个)氨基酸取代的hc。在一些方面，抗原结合蛋白包含seqidno:511中的任一个的hc。在一些方面，抗原结合蛋白包含seqidno:511的具有如图24所示的1、2、3、4或5个(或更多个)氨基酸取代的hc序列。在示例性方面，抗原结合蛋白是在hc可变区、lc可变区或两者中具有一个或多个氨基酸取代的ab1的人源化抗原结合蛋白。在示例性方面，抗原结合蛋白包含seqidno:135的具有1、2、3、4或5个(或更多个)氨基酸取代的hc。在一些方面，抗原结合蛋白包含seqidno:513中的任一个的hc。在一些方面，抗原结合蛋白包含seqidno:513的具有如图25所示的1、2、3、4或5个(或更多个)氨基酸取代的hc序列。在示例性方面，抗原结合蛋白包含seqidno:134的具有1、2、3、4或5个(或更多个)氨基酸取代的hc。在一些方面，抗原结合蛋白包含seqidno:512中的任一个的hc。在一些方面，抗原结合蛋白包含seqidno:512的具有如图26所示的1、2、3、4或5个(或更多个)氨基酸取代的hc序列。[0235]无岩藻糖基化抗体[0236]许多分泌的蛋白质经历翻译后糖基化，这是糖部分(例如聚糖、糖类)与蛋白质的特定氨基酸共价附接的过程。在真核细胞中，发生两种类型的糖基化反应：(1)n-连接糖基化，其中聚糖附接至识别序列asn-x-thr/ser的天冬酰胺，其中“x”是除脯氨酸之外的任何氨基酸，和(2)o-连接糖基化，其中聚糖附接至丝氨酸或苏氨酸。无论糖基化类型(n连接或o连接)如何，由于与每个位点(o或n)缔合的大量聚糖结构，存在蛋白质糖型的微异质性。[0237]所有n-聚糖都具有共同的核心糖序列：manα1–6(manα1–3)manβ1–4glcnacβ1–4glcnacβ1-asn-x-ser/thr(man3glcnac2asn)，并分类为以下三种类型之一：(a)高甘露糖(hm)或低聚甘露糖(om)型，其由两个n-乙酰葡萄糖胺(galnac)部分和大量(例如，5、6、7、8或9个)甘露糖(man)残基组成；(b)复合型，其包含超过两个glcnac部分和任何数量的其他糖类型；或(c)杂合型，其包含在分支的一侧的man残基和在复合物分支的底部的glcnac。图1a(摘自stanley等人，第8章：n-glycans,essentialsofglycobiology,第2版,coldspringharborlaboratorypress；2009)显示三种类型的n-聚糖。[0238]n-连接聚糖通常包含半乳糖(gal)、n-乙酰半乳糖胺(galnac)、半乳糖胺(galn)、葡萄糖(glc)、n-乙酰葡萄糖胺(clcnac)、葡萄糖胺(glcn)、甘露糖(man)、n-乙酰甘露糖胺(mannac)、甘露糖胺(mann)、木糖(xyl)、n0乙酰基神经氨酸(neu5ac)、n-羟乙酰基神经氨酸(neu5gc)、2-酮基-3-脱氧壬酸(2-keto-3-doxynononicacid)(kdn)、岩藻糖(fuc)、葡萄糖醛酸(glca)、艾杜糖醛酸(idoa)、半乳糖醛酸(gala)、甘露糖醛酸(mana)的一个或多个单糖。这种糖类的常用符号示于图29a中。[0239]n-连接糖基化在内质网(er)中开始，其中一系列复杂的反应导致核心聚糖结构的附接，所述核心聚糖结构主要由两个glcnac残基和三个man残基组成。er中形成的聚糖复合物通过高尔基体中酶的作用进行修饰。如果酶相对难以接近糖类，则糖类通常保持原始hm形式。如果酶可接近糖类，则许多man残基被裂解，并且糖类被进一步修饰，从而形成复合型n-聚糖结构。例如，位于顺式高尔基体中的甘露糖苷酶-1可裂解或水解hm聚糖，而位于内侧高尔基体中的岩藻糖基转移酶fut-8使聚糖岩藻糖基化(hanrueimai-nishiya(2007),bmcbiotechnology,7:84)。[0240]因此，糖组成和聚糖结构的结构的构型发生变化，这取决于er和高尔基体中的糖基化机器、机器酶对聚糖结构的可及性、每种酶的作用顺序和蛋白质从糖基化机器中释放出来的阶段以及其他因素。[0241]在本公开的示例性实施方案中，抗原结合蛋白包含fc多肽。如本文所用的术语“fc多肽”包括源自抗体的fc区的多肽的天然和突变蛋白形式。在示例性方面，当前公开的抗原结合蛋白的fc多肽包含聚糖。在各种情况下，聚糖缺乏岩藻糖或无岩藻糖基化。在示例性方面，抗原结合蛋白包含无岩藻糖基化聚糖。如本文所用，术语“无岩藻糖基化聚糖”或“afuco聚糖”或“无岩藻糖基化糖型”或“afuc”是指缺乏核心岩藻糖的糖型，例如，参与与n-糖基化位点的asn酰胺键合的glcnac残基上的α1,6-连接的岩藻糖。无岩藻糖基化糖型包括但不限于a1g0、a2g0、a2g1a、a2g1b、a2g2和a1g1m5。另外的无岩藻糖基化聚糖包括例如a1g1a、g0[h3n4]、g0[h4n4]、g0[h5n4]、fo-n[h3n3]。参见例如，reusch和tejada,glycobiology25(12):1325-1334(2015)。[0242]本公开还提供了组合物，例如药物组合物，所述组合物包含抗原结合蛋白，所述抗原结合蛋白包含含有无岩藻糖基化聚糖的fc多肽。在示例性方面，组合物中存在的至少或约25％的抗原结合蛋白是包含fc多肽的抗原结合蛋白，所述fc多肽包含无岩藻糖基化聚糖。在示例性方面，组合物中存在的至少或约25％的抗原结合蛋白无岩藻糖基化。任选地，组合物中存在的至少30％、40％、50％、60％、70％、80％或90％或更多的抗原结合蛋白无岩藻糖基化。产生包含特定糖谱的抗原结合蛋白的组合物的方法是本领域已知的。在示例性实施方案中，抗原结合蛋白是在细胞中重组产生的，所述细胞经遗传修饰以改变从头途径或补救途径的酶的活性。这两种岩藻糖代谢途径示于图29b中。在示例性实施方案中，细胞经遗传修饰以改变以下中的任何一者或多者的活性：岩藻糖基转移酶(fut，例如，fut1、fut2、fut3、fut4、fut5、fut6、fut7、fut8、fut9)、岩藻糖激酶、gdp-岩藻糖焦磷酸化酶、gdp-d-甘露糖-4,6-脱水酶(gmd)和gdp-酮基-6-脱氧甘露糖-3,5-差向异构酶、4-还原酶(fx)。在示例性实施方案中，细胞经遗传修饰以敲除编码fx的基因。参见例如，国际专利公布第wo2017/079165a1号；kanda等人,jbiotechnol130,2007,300-310；yamane-ohunuki等人,biotechnolbioeng87,2004,614-622；malphettes等人,biotechnolbioeng106,2010,774-783。[0243]核酸[0244]本公开还提供了核酸，所述核酸包含编码本公开的抗原结合蛋白的核苷酸序列。如本文所用的“核酸”包括“多核苷酸”、“寡核苷酸”和“核酸分子”，并且通常是指dna或rna的聚合物或其经修饰形式，其可以是单链或双链的、从天然来源合成或获得(例如，分离和/或纯化)，其可含有天然、非天然或改变的核苷酸，并且其可含有天然、非天然或改变的核苷酸间键联，如氨基磷酸酯键或硫代磷酸酯键联，而不是在未修饰的寡核苷酸的核苷酸之间发现的磷酸二酯键。核酸可包含编码本公开的任何抗原结合蛋白的任何核苷酸序列。在各个方面，所述核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含(a)表a或a1中列出的重链(hc)互补决定区(cdr)1氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:11、17、23、29、35、41、47、53、59、65、71、77、83、89、95、101、107、113、119、125、131、452、455、461、465和472，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少或约80％、至少或约85％、至少或约90％、至少或约95％)序列同一性的变体序列；(b)表a或a1中列出的hccdr2氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:12、18、24、30、36、42、48、54、60、66、72、78、84、90、86、102、108、114、120、126、132、475、456、462、466、468和473，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少或约80％、至少或约85％、至少或约90％、至少或约95％)序列同一性的变体序列；(c)表a或a1中列出的hccdr3氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:13、19、25、31、37、43、49、55、61、67、73、79、85、91、97、103、109、115、121、127、133、453、457、463、467、469和474，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少或约80％、至少或约85％、至少或约90％、至少或约95％)序列同一性的变体序列；(d)表a或a1中列出的轻链(lc)cdr1氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:8、14、20、32、38、44、50、56、62、68、74、80、86、92、98、104、110、116、122、128、449、476、458、464和470，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少或约80％、至少或约85％、至少或约90％、至少或约95％)序列同一性的变体序列；(e)表a或a1中列出的lccdr2氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:9、15、21、27、33、39、45、51、57、63、69、75、81、87、93、99、105、111、117、123、129、450、477、459和471，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少或约80％、至少或约85％、至少或约90％、至少或约95％)序列同一性的变体序列；(f)表a中列出的lccdr3氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：seqidno:10、16、22、28、34、40、46、52、58、64、70、76、82、88、94、100、106、112、118、124、130、451、454和460，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少或约80％、至少或约85％、至少或约90％、至少或约95％)序列同一性的变体序列；或(g)(a)-(f)中的任何两者或更多者的组合。在各个方面，所述核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含表a或a1中列出的lccdr1氨基酸序列、lccdr2氨基酸序列和lccdr3氨基酸序列和表a或a1中列出的hccdr氨基酸序列中的至少1或2个。在各个方面，所述核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含表a或a1中列出的hccdr1氨基酸序列、hccdr2氨基酸序列和hccdr3氨基酸序列和表a或a1中列出的lccdr氨基酸序列中的至少1或2个。在各种实施方案中，所述核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含(a)由表a或a1的单行中的seqidno:指定的氨基酸序列中的至少3、4或5个，(b)由表a或a1的单行的seqidno:指定的lccdr氨基酸序列中的每一个和由表a或a1的单行的seqidno:指定的hccdr氨基酸序列中的至少1或2个，(c)由表a或a1的单行的seqidno:指定的hccdr氨基酸序列中的每一个和由表a或a1的单行的seqidno:指定的lccdr氨基酸序列中的至少1或2个，(d)由表a的单行的seqidno:指定的所有6个cdr氨基酸序列，和/或(e)选自由以下组成的组的六个cdr氨基酸序列：(a)seqidno:74-79；(b)seqidno:50-55；(c)seqidno:122-127；(d)seqidno:26-31；(e)seqidno:128-133；(f)seqidno:38-43；(g)seqidno:62-67；(h)seqidno:80-85；(i)seqidno:44-49；(j)seqidno:86-91；(k)seqidno:104-109；(l)seqidno:56-61；(m)seqidno:32-37；(n)seqidno:110-115；(o)seqidno:98-103；(p)seqidno:92-97；(q)seqidno:116-121；(r)seqidno:8-13；(s)seqidno:68-73；(t)seqidno:14-19；(u)seqidno:20-25；(v)seqidno:449-453和475；(w)seqidno:476-477、454-457；(x)seqidno:458-463；(y)seqidno:57、58、464-467；(z)seqidno:68-71和468-469；和(aa)seqidno:112和470-474。在各种实施方案中，所述核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含(a)表b或b1中列出的重链可变区氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：135、137、139、141、143、145、147、149、151、153、155、157、159、161、163、165、167、169、171、173、175、478、480、482、484、486和488，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少或约80％、至少或约85％、至少或约90％、至少或约95％)序列同一性的变体序列；或(b)表b或b1中列出的轻链可变区氨基酸序列或选自由以下组成的组的序列：134、136、138、140、142、144、146、148、150、152、154、156、158、160、162、164、166、168、170、172、174、176、479、481、483、485、487和489，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％(例如，至少或约80％、至少或约85％、至少或约90％、至少或约95％)序列同一性的变体序列；或(c)(a)和(b)两者。在各种实施方案中，所述核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含选自由以下组成的组的一对氨基酸序列：(a)seqidno:156和157；(b)seqidno:148和149；(c)seqidno:172和173；(d)seqidno:140和141；(e)seqidno:174和175；(f)seqidno:144和145；(g)seqidno:152和153；(h)seqidno:158和159；(i)seqidno:146和147；(j)seqidno:160和161；(k)seqidno:166和167；(l)seqidno:150和151；(m)seqidno:142和143；(n)seqidno:168和169；(o)seqidno:164和165；(p)seqidno:162和163；(q)seqidno:170和171；(r)seqidno:134和135；(s)seqidno:154和155；(t)seqidno:136和137；和(u)seqidno:138和139。在各种实施方案中，所述核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含选自由表d中列出的对组成的组的一对氨基酸序列。在各个方面，所述核酸包含如下核苷酸序列，所述核苷酸序列包含seqidno:208-375中的任何一个或多个的序列。在一些实施方案中，核酸不包含任何插入、缺失、倒位和/或取代。在其他实施方案中，核酸包含一个或多个插入、缺失、倒位和/或取代。[0245]在各个方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白是在重链(hc)可变区中或在轻链(lc)可变区中或在两者中具有一个或多个(例如，2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34或35个)氨基酸取代的如表d中列出的人源化抗原结合蛋白。在示例性方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白是在hc可变区、lc可变区或两者中具有一个或多个氨基酸取代的ab1-11的人源化抗原结合蛋白。在示例性方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:379的具有1、2、3、4或5个氨基酸取代的hc。在示例性方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:504的hccdr1、seqidno:505的hccdr2、seqidno:506的hccdr3或其组合。在示例性情况下，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:503的hc。在一些方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:496-501中的任一个的hc。在一些方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含在图22中标记为s7-s12的hc序列。在各种情况下，核酸包含编码轻链可变区的核苷酸序列，所述轻链可变区包含seqidno:449的lccdr1、seqidno:450的lccdr2、seqidno:451的lccdr3或其组合。在一些方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:380-383和479中的任一个的lc。在示例性情况下，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:383的lc。在一些方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含在图22中标记为s7-s12的lc序列。在示例性方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白是在hc可变区、lc可变区或两者中具有一个或多个氨基酸取代的ab3-7的人源化抗原结合蛋白。在示例性方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:387的具有1、2、3、4、5或6个氨基酸取代的hc。在示例性方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:507的hccdr1、seqidno:508的hccdr2、seqidno:509的hccdr3或其组合。在示例性情况下，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:502的hc。在一些方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:490-495中的任一个的hc。在一些方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含在图22中标记为s1-s6的hc序列。在各种情况下，核酸包含编码轻链可变区的核苷酸序列，所述轻链可变区包含seqidno:476的lccdr1、seqidno:477的lccdr2、seqidno:454的lccdr3或其组合。在一些方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:388-390和481中的任一个的lc。在示例性情况下，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:389的lc。在一些方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含在图22中标记为s1-s6的lc序列。[0246]在示例性方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白是在hc可变区、lc可变区或两者中具有一个或多个氨基酸取代的ab3的人源化抗原结合蛋白。在示例性方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:139的具有1、2、3、4或5个(或更多个)氨基酸取代的hc。在一些方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:510中的任一个的hc。在一些方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:510的具有如图23所示的1、2、3、4或5个(或更多个)氨基酸取代的hc序列。在示例性方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:138的具有1、2、3、4或5个(或更多个)氨基酸取代的hc。在一些方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:511中的任一个的hc。在一些方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:511的具有如图24所示的1、2、3、4或5个(或更多个)氨基酸取代的hc序列。在示例性方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白是在hc可变区、lc可变区或两者中具有一个或多个氨基酸取代的ab1的人源化抗原结合蛋白。在示例性方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:135的具有1、2、3、4或5个(或更多个)氨基酸取代的hc。在一些方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:513中的任一个的hc。在一些方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:513的具有如图25所示的1、2、3、4或5个(或更多个)氨基酸取代的hc序列。在示例性方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:134的具有1、2、3、4或5个(或更多个)氨基酸取代的hc。在一些方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:512中的任一个的hc。在一些方面，核酸包含编码如下抗原结合蛋白的核苷酸序列，所述抗原结合蛋白包含seqidno:512的具有如图26所示的1、2、3、4或5个(或更多个)氨基酸取代的hc序列。在一些实施方案中，核酸不包含任何插入、缺失、倒位和/或取代。在其他实施方案中，核酸包含一个或多个插入、缺失、倒位和/或取代。[0247]在一些方面，本公开的核酸是重组的。如本文所用，术语“重组”是指(i)通过将天然或合成核酸区段连接至可在活细胞中复制的核酸分子而在活细胞外构建的分子，或(ii)由以上(i)中描述的那些的复制产生的分子。出于本文的目的，复制可以是体外复制或体内复制。[0248]在一些方面，使用本领域中已知的程序基于化学合成和/或酶促连接反应构建核酸。参见例如，sambrook等人,同上；和ausubel等人,同上。例如，可使用天然存在的核苷酸或经设计以增加分子的生物稳定性或增加杂交后形成的双链体的物理稳定性的各种经修饰的核苷酸(例如硫代磷酸酯衍生物和吖啶取代的核苷酸)化学合成核酸。可用于产生核酸的经修饰核苷酸的实例包括但不限于5-氟尿嘧啶、5-溴尿嘧啶、5-氯尿嘧啶、5-碘尿嘧啶、次黄嘌呤、黄嘌呤、4-乙酰胞嘧啶、5-(羧基羟甲基)尿嘧啶、5-羧甲基氨基甲基-2-硫尿苷、5-羧甲基氨基甲基尿嘧啶、二氢尿嘧啶、β-d-半乳糖基辫苷、肌苷、n6-异戊烯基腺嘌呤、1-甲基鸟嘌呤、1-甲基肌苷、2,2-二甲基鸟嘌呤、2-甲基腺嘌呤、2-甲基鸟嘌呤、3-甲基胞嘧啶、5-甲基胞嘧啶、n-取代的腺嘌呤、7-甲基鸟嘌呤、5-甲基氨甲基尿嘧啶、5-甲氧基氨基甲基-2-硫尿嘧啶、β-d-甘露糖基辫苷、5'-甲氧基羧甲基尿嘧啶、5-甲氧基尿嘧啶、2-甲硫基-n6-异戊烯基腺嘌呤、尿嘧啶-5-氧乙酸(v)、怀丁氧苷、假尿嘧啶(pseudouratil)、辫苷(queosine)、2-硫胞嘧啶、5-甲基-2-硫尿嘧啶、2-硫尿嘧啶、4-硫尿嘧啶、5-甲基尿嘧啶、尿嘧啶-5-氧乙酸甲酯、3-(3-氨基-3-n-2-羧丙基)尿嘧啶和2,6-二氨基嘌呤。可替代地，本公开的一种或多种核酸可从公司购买，如macromolecularresources(fortcollins,co)和synthegen(houston,tx)。[0249]载体[0250]在一些方面，本公开的核酸被并入载体中。在此方面，本公开提供了包含当前公开的核酸中的任一者的载体。在各个方面，载体是重组表达载体。出于本文的目的，术语“重组表达载体”是指经遗传修饰的寡核苷酸或多核苷酸构建体，当所述构建体包含编码mrna、蛋白质、多肽或肽的核苷酸序列并且使载体在足以在宿主细胞内表达所述mrna、蛋白质、多肽或肽的条件下与所述细胞接触时，所述构建体允许宿主细胞表达mrna、蛋白质、多肽或肽。本公开的载体整体上不是天然存在的。然而，载体的部分可以是天然存在的。当前公开的载体可包含任何类型的核苷酸，包括但不限于dna和rna，所述核苷酸可以是单链或双链的，合成的或部分从天然来源获得的，并且可含有天然的、非天然的或改变的核苷酸。载体可包含天然存在的或非天然存在的核苷酸间键联或两种类型的键联。在一些方面，改变的核苷酸或非天然存在的核苷酸间键联不阻碍载体的转录或复制。[0251]本公开的载体可以是任何合适的载体，并且可用于转导、转化或转染任何合适的宿主。合适的载体包括被设计用于繁殖和扩增或用于表达或用于两者的那些载体，诸如质粒和病毒。载体可以是基于质粒的表达载体。在各个方面，载体选自由以下组成的组：puc系列(fermentaslifesciences)、pbluescript系列(stratagene,lajoiia,ca)、pet系列(novagen,madison,wi)、pgex系列(pharmaciabiotech,uppsala,sweden)和pex系列(clontech,paloalto,ca)。也可使用噬菌体载体，如λgtio、λgtl1、λzapii(stratagene)、λembl4和λnml149。植物表达载体的实例包括pbiol、pbi101.2、pbi101.3、pbi121和pbin19(clontech)。动物表达载体的实例包括peuk-cl、pmam和pmamneo(clontech)。在一些方面，载体是病毒载体，例如逆转录病毒载体。在各个方面，载体是腺病毒载体、腺相关病毒(aav)7、成视网膜细胞瘤细胞y79、人成视网膜细胞瘤细胞so-rb50、人肝癌细胞hepg2、小鼠b骨髓瘤细胞j558l或幼仓鼠肾(bhk)细胞(gaillet等人2007；khan,advpharmbull3(2):257-263(2013))。[0259]对于扩增或复制载体的目的，宿主细胞在一些方面是原核细胞，例如细菌细胞。[0260]本公开还提供了包含至少一种本文所述宿主细胞的细胞群体。在一些方面，细胞群体是异质群体，所述异质群体包含含有所描述的载体的宿主细胞，以及不包含任何载体的至少一种其他细胞。可替代地，在一些方面，细胞群体是基本上同质的群体，其中所述群体主要包含含有载体的宿主细胞(例如，基本上由其组成)。在一些方面，所述群体是细胞的克隆群体，其中所述群体的所有细胞是包含载体的单个宿主细胞的克隆，使得所述群体的所有细胞都包含载体。在本公开的各种实施方案中，细胞群体是包含宿主细胞的克隆群体，所述宿主细胞包含如本文所述的载体。[0261]制造方法[0262]本文还提供了产生结合至cldn6的抗原结合蛋白的方法。在各种实施方案中，所述方法包括在细胞培养基中培养包含核酸的宿主细胞，所述核酸包含编码如本文所述的抗原结合蛋白的核苷酸序列；以及从所述细胞培养基中收获所述抗原结合蛋白。宿主细胞可以是本文所述的任何宿主细胞。在各个方面，宿主细胞选自由以下组成的组：cho细胞、ns0细胞、cos细胞、vero细胞和bhk细胞。在各个方面，培养宿主细胞的步骤包括在生长培养基中培养所述宿主细胞以支持宿主细胞的生长和扩增。在各个方面，生长培养基以即时方式增加细胞密度、培养活力和生产力。在各个方面，生长培养基包含氨基酸、维生素、无机盐、葡萄糖和血清作为生长因子、激素和附着因子的来源。在各个方面，生长培养基是由氨基酸、维生素、微量元素、无机盐、脂质和胰岛素或胰岛素样生长因子组成的完全化学成分确定的培养基。除了营养之外，生长培养基还有助于维持ph值和渗透压。几种生长培养基是可商购的并且在本领域中有描述。参见例如，arora,“cellculturemedia:areview”matermethods3:175(2013)。[0263]在各个方面，所述方法包括在补料培养基中培养宿主细胞。在各个方面，所述方法包括以补料分批模式在补料培养基中培养。重组蛋白生产方法是本领域中已知的。参见例如，li等人,“cellcultureprocessesformonoclonalantibodyproduction”mabs2(5):466–477(2010)。[0264]制备抗原结合蛋白的方法可包括用于从细胞培养物或其上清液中纯化蛋白质以及优选地回收纯化的蛋白质的一个或多个步骤。在各个方面，所述方法包括一个或多个色谱步骤，例如亲和色谱(例如蛋白a亲和色谱)、离子交换色谱、疏水相互作用色谱。在各个方面，所述方法包括使用蛋白a亲和色谱树脂纯化蛋白质。[0265]在各种实施方案中，所述方法还包括用于配制纯化的蛋白质等的步骤，从而获得包含所述纯化的蛋白质的制剂。此类步骤描述于formulationandprocessdevelopmentstrategiesformanufacturing,jameel和hershenson编辑,johnwiley&sons,inc.(hoboken,nj),2010中。[0266]在各个方面，连接至多肽和抗原结合蛋白的抗原结合蛋白是融合蛋白的一部分。因此，本公开进一步提供了产生包含结合至cldn6的抗原结合蛋白的融合蛋白的方法。在各种实施方案中，所述方法包括在细胞培养基中培养包含核酸的宿主细胞，所述核酸包含编码如本文所述的融合蛋白的核苷酸序列；以及从所述细胞培养基中收获所述融合蛋白。[0267]缀合物[0268]本公开还提供附接、连接或缀合至第二部分(例如，异源部分、缀合物部分)的抗原结合蛋白。因此，本公开提供了包含抗原结合蛋白和异源部分的缀合物。如本文所用，术语“异源部分”与“缀合物部分”同义并且是指与本公开的抗原结合蛋白不同的任何分子(化学的或生物化学的、天然存在的或非编码的)。各种异源部分包括但不限于聚合物、碳水化合物、脂质、核酸、寡核苷酸、dna或rna、氨基酸、肽、多肽、蛋白质、治疗剂(例如，细胞毒性剂、细胞因子)或诊断剂。[0269]在一些实施方案中，异源部分是聚合物。聚合物可以是支化的或无支化的。聚合物可具有任何分子量。在一些实施方案中，聚合物具有介于约2kda至约100kda之间的平均分子量(术语“约”指示在水溶性聚合物的制剂中，一些分子将重于、一些分子将轻于所陈述的分子量)。在一些方面，聚合物的平均分子量介于约5kda与约50kda之间、介于约12kda至约40kda之间或介于约20kda至约35kda之间。[0270]在一些实施方案中，聚合物被改性为具有单个反应性基团，诸如用于酰化的活性酯或用于烷基化的醛，从而可控制聚合度。在一些实施方案中，聚合物是水溶性的，使得其所附接的蛋白质不会在诸如生理环境的水性环境中沉淀。在一些实施方案中，例如，当组合物用于治疗用途时，聚合物是药学上可接受的。另外，在一些方面，聚合物是聚合物的混合物，例如共聚物、嵌段共聚物。[0271]在一些实施方案中，聚合物选自由以下组成的组：聚酰胺；聚碳酸酯；聚烯烃及其衍生物，包括聚亚烷基二醇、聚环氧烷、聚对苯二甲酸亚烷基酯；丙烯酸和甲基丙烯酸酯的聚合物，包括聚(甲基丙烯酸甲酯)、聚(甲基丙烯酸乙酯)、聚(甲基丙烯酸丁酯)、聚(甲基丙烯酸异丁酯)、聚(甲基丙烯酸己酯)、聚(甲基丙烯酸异癸酯)、聚(甲基丙烯酸月桂酯)、聚(甲基丙烯酸苯酯)、聚(丙烯酸甲酯)、聚(丙烯酸异丙酯)、聚(丙烯酸异丁酯)和聚(丙烯酸十八酯)；聚乙烯聚合物，包括聚乙烯醇、聚乙烯醚、聚乙烯酯、聚卤乙烯、聚(乙酸乙烯酯)和聚乙烯吡咯烷酮；聚乙交酯；聚硅氧烷；聚氨酯及其共聚物；纤维素，包括烷基纤维素、羟烷基纤维素、纤维素醚、纤维素酯、硝基纤维素、甲基纤维素、乙基纤维素、羟丙基纤维素、羟基-丙基甲基纤维素、羟丁基甲基纤维素、乙酸纤维素、丙酸纤维素、乙酸丁酸纤维素、邻苯二甲酸乙酸纤维素、羧乙基纤维素、三乙酸纤维素和硫酸纤维素钠盐；聚丙烯；聚乙烯，包括聚(乙二醇)、聚(环氧乙烷)和聚(对苯二甲酸乙二醇酯)；以及聚苯乙烯。[0272]用于在本文中使用的特别优选的水溶性聚合物是聚乙二醇(peg)。如本文所用，聚乙二醇是意图涵盖可用于衍生其它蛋白质的任何peg形式，诸如单(c1-c10)烷氧基或芳氧基-聚乙二醇。peg是线性或支化的中性聚醚，可以广泛范围的分子量获得，并且可溶于水和大多数有机溶剂中。[0273]在一些实施方案中，异源部分是碳水化合物。在一些实施方案中，碳水化合物是单糖(例如，葡萄糖、半乳糖、果糖)、二糖(例如，蔗糖、乳糖、麦芽糖)、寡糖(例如，棉子糖、水苏糖)、多糖(淀粉、淀粉酶、支链淀粉)、纤维素、几丁质、愈创葡聚糖(callose)、昆布多糖、木聚糖、甘露聚糖、岩藻依聚糖、半乳甘露聚糖。[0274]在一些实施方案中，异源部分是脂质。在一些实施方案中，脂质是脂肪酸、类花生酸、前列腺素、白三烯、血栓烷、n-酰基乙醇胺)、甘油脂质(例如，单、二、三取代的甘油)、甘油磷脂(例如，磷脂酰胆碱、磷脂酰肌醇、磷脂酰乙醇胺、磷脂酰丝氨酸)、鞘脂(例如鞘氨醇、神经酰胺)、固醇脂质(例如，类固醇、胆固醇)、异戊烯醇脂质、糖脂或聚酮化合物、油、蜡、胆固醇、固醇、脂溶性维生素、甘油单酯、甘油二酯、甘油三酯、磷脂。[0275]在一些实施方案中，异源部分是治疗剂。治疗剂可以是本领域中已知的任一种。本文考虑的治疗剂的实例包括但不限于天然酶、源自天然来源的蛋白质、重组蛋白质、天然肽、合成肽、环肽、抗体、受体激动剂、细胞毒性剂、免疫球蛋白、β-肾上腺素能阻滞剂、钙通道阻滞剂、冠状血管扩张剂、强心苷、抗心律失常药、心脏拟交感神经药、血管紧张素转化酶(ace)抑制剂、利尿剂、强心药、胆固醇和甘油三酯降低剂、胆汁酸螯合剂、贝特类、3-羟基-3-甲基戊二酰基(hmg)-coa还原酶抑制剂、烟酸衍生物、抗肾上腺素能药、α-肾上腺素能阻滞剂、中枢作用的抗肾上腺素能药、血管扩张剂、保钾剂、噻嗪类药物和相关剂、血管紧张素ii受体拮抗剂、外周血管扩张剂、抗雄激素、雌激素、抗生素、类视黄醇、胰岛素和类似物、α-葡糖苷酶抑制剂、双胍类药物、格列奈类药物、磺酰脲类药物、噻唑烷二酮类、雄激素、孕激素、骨代谢调控剂、垂体前叶激素、下丘脑激素、垂体后叶激素、促性腺激素、促性腺激素释放激素拮抗剂、排卵刺激剂、选择性雌激素受体调节剂、抗甲状腺剂、甲状腺激素、膨胀性泻剂(bulkformingagent)、泻药、逆蠕动剂、菌群调节剂、肠道吸附剂、肠道抗感染剂、抗厌食剂、抗恶病质剂、抗贪食症剂、食欲抑制剂、抗肥胖剂、抗酸剂、上消化道药物、抗胆碱能药、氨基水杨酸衍生物、生物应答调节剂、皮质类固醇、解痉剂、5-ht4部分激动剂、抗组胺药、大麻素、多巴胺拮抗剂、血清素拮抗剂、细胞保护剂、组胺h2受体拮抗剂、粘膜保护剂、质子泵抑制剂、幽门螺杆菌根除疗法、红细胞生成刺激剂、造血剂、贫血剂、肝素、抗纤维蛋白溶解剂、止血剂、凝血因子、二磷酸腺苷抑制剂、糖蛋白受体抑制剂、纤维蛋白原-血小板结合抑制剂、血栓烷-a2抑制剂、纤溶酶原活化剂、抗血栓形成剂、糖皮质激素、盐皮质激素、皮质类固醇、选择性抗免疫抑制剂、抗真菌剂、参与预防性治疗的药物、aids相关感染、巨细胞病毒、非核苷逆转录酶抑制剂、核苷类似物逆转录酶抑制剂、蛋白酶抑制剂、贫血、卡波济氏肉瘤、氨基糖苷类、碳青霉烯类、头孢菌素类、糖肽类、林可酰胺类、大环内酯类、噁唑烷酮类、青霉素类、链阳菌素类、磺胺类药物、甲氧苄啶及其衍生物、四环素类、驱虫药、抗阿米巴药、双胍类、金鸡纳属生物碱、叶酸拮抗剂、喹啉衍生物、卡氏肺孢子虫疗法、酰肼类、咪唑类、三唑类、硝基咪唑类、环胺类、神经酰胺酶抑制剂、核苷、磷酸盐结合剂、胆碱酯酶抑制剂、辅助治疗、巴比妥类药物和衍生物、苯二氮卓类药物、γ氨基丁酸衍生物、乙内酰脲衍生物、亚氨基芪衍生物、琥珀酰亚胺衍生物、抗惊厥药、麦角生物碱、抗偏头痛制剂、生物应答调节剂、氨基甲酸酯、三环衍生物、去极化剂、非去极化剂、神经肌肉麻痹剂、cns刺激剂、多巴胺能试剂、单胺氧化酶抑制剂、comt抑制剂、烷基磺酸盐、乙烯亚胺、咪唑四嗪、氮芥类似物、亚硝基脲、含铂化合物、抗代谢药、嘌呤类似物、嘧啶类似物、尿素衍生物、蒽环类药物、放线菌素d、喜树碱衍生物、表鬼臼毒素、紫杉烷、长春花生物碱和类似物、抗雄激素、抗雌激素、非类固醇芳香酶抑制剂、蛋白激酶抑制剂、抗肿瘤药、氮杂螺癸二酮衍生物、抗焦虑药、兴奋剂、单胺再摄取抑制剂、选择性血清素再摄取抑制剂、抗抑郁剂、苯并异噁唑衍生物、丁酰苯衍生物、二苯并二氮杂衍生物、二苯并硫氮杂衍生物、二苯基丁基哌啶衍生物、吩噻嗪、噻吩并苯并二氮杂衍生物、噻吨衍生物、过敏原提取物、非类固醇药物、白三烯受体拮抗剂、黄嘌呤、内皮素受体拮抗剂、前列腺素、肺表面活性剂、粘液溶解剂、抗有丝分裂剂、排尿酸药、黄嘌呤氧化酶抑制剂、磷酸二酯酶抑制剂、乌洛托品(metheamine)盐、硝基呋喃衍生物、喹诺酮类、平滑肌松弛剂、拟副交感神经药、卤代烃、氨基苯甲酸酯、酰胺类(例如利多卡因、盐酸阿替卡因、盐酸布比卡因)、退热剂、催眠药和镇静剂、环吡咯酮类、吡唑并嘧啶类、非类固醇抗炎药、阿片类药物、对氨基苯酚衍生物、乙醇脱氢酶抑制剂、肝素拮抗剂、吸附剂、催吐剂、阿片类拮抗剂、胆碱酯酶再活化剂、尼古丁替代疗法、维生素a类似物和拮抗剂、维生素b类似物和拮抗剂、维生素c类似物和拮抗剂、维生素d类似物和拮抗剂、维生素e类似物和拮抗剂、维生素k类似物和拮抗剂。[0276]本公开的抗原结合蛋白可与一种或多种有效抑制肿瘤转移的细胞因子和生长因子缀合，并且其中所述细胞因子或生长因子已显示对至少一种细胞群体具有抗增殖作用。此类细胞因子、淋巴因子、生长因子或其他造血因子包括但不限于：m-csf、gm-csf、tnf、il-1、il-2、il-3、il-4、il-5、il-6、il-7、il-8、il-9、il-10、il-11、il-12、il-13、il-14、il-15、il-16、il-17、il-18、ifn、tnfα、tnf1、tnf2、g-csf、meg-csf、gm-csf、血小板生成素、干细胞因子和红细胞生成素。用于在本文中使用的另外生长因子包括血管生成素、骨形态发生蛋白-1、骨形态发生蛋白-2、骨形态发生蛋白-3、骨形态发生蛋白-4、骨形态发生蛋白-5、骨形态发生蛋白-6、骨形态发生蛋白-7、骨形态发生蛋白-8、骨形态发生蛋白-9、骨形态发生蛋白-10、骨形态发生蛋白-11、骨形态发生蛋白-12、骨形态发生蛋白-13、骨形态发生蛋白-14、骨形态发生蛋白-15、骨形态发生蛋白受体ia、骨形态发生蛋白受体ib、脑源性神经营养因子、睫状神经营养因子、睫状神经营养因子受体α、细胞因子诱导的嗜中性粒细胞趋化因子1、细胞因子诱导的嗜中性粒细胞趋化因子2α、细胞因子诱导的嗜中性粒细胞趋化因子2β、β内皮细胞生长因子、内皮素1、上皮细胞来源的嗜中性粒细胞引诱剂、神经胶质细胞系来源的嗜中性粒细胞受体α1、神经胶质细胞系来源的嗜中性粒细胞受体α2、生长相关蛋白、生长相关蛋白α、生长相关蛋白β、生长相关蛋白γ、肝素结合表皮生长因子、肝细胞生长因子、肝细胞生长因子受体、胰岛素样生长因子i、胰岛素样生长因子受体、胰岛素样生长因子ii、胰岛素样生长因子结合蛋白、角质形成细胞生长因子、白血病抑制因子、白血病抑制因子受体α、神经生长因子、神经生长因子受体、神经营养因子-3、神经营养因子-4、前b细胞生长刺激因子、干细胞因子、干细胞因子受体、转化生长因子α、转化生长因子β、转化生长因子β1、转化生长因子β1.2、转化生长因子β2、转化生长因子β3、转化生长因子β5、潜在转化生长因子β1、转化生长因子β结合蛋白i、转化生长因子β结合蛋白ii、转化生长因子受体β结合蛋白iii、肿瘤坏死因子受体i型、肿瘤坏死因子受体ii型、尿激酶型纤溶酶原活化剂受体、嵌合蛋白及其生物学或免疫学活性片段。[0277]在一些实施方案中，缀合物包含如本文所述的化合物和细胞毒性剂。细胞毒性剂是对细胞有毒性的任何分子(化学或生物化学)。在一些方面，当细胞毒性剂与本发明的化合物缀合时，获得的结果是协同的。也就是说，化合物和细胞毒性剂的组合疗法的有效性是协同的，即，有效性大于由各自的相加个体效应所预期的有效性。因此，可减少细胞毒性剂的剂量，并且因此同时降低毒性问题和其他副作用的风险。在一些实施方案中，细胞毒性剂是化学治疗剂。化学治疗剂是本领域中已知的并且包括但不限于铂配位化合物、拓扑异构酶抑制剂、抗生素、抗有丝分裂生物碱和二氟核苷，如美国专利第6,630,124号中所描述。[0278]在一些实施方案中，化学治疗剂是铂配位化合物。术语“铂配位化合物”是指以离子形式提供铂的任何抑制肿瘤细胞生长的铂配位化合物。在一些实施方案中，铂配位化合物是顺式二胺二水合铂(ii)-离子；氯(二亚乙基三胺)-氯化铂(ii)；二氯(乙二胺)-铂(ii)；二氨(1,1-环丁烷二羧基)铂(ii)(卡铂)；螺铂；异丙铂；二氨(2-乙基丙二酸)-铂(ii)；乙二胺丙二酸铂(ii)；水合(1,2-二氨基二环己烷)-硫酸根铂(ii)；(1,2-二氨基环己烷)丙二酸铂(ii)；(4-羧基邻苯二甲酸)(1,2-二氨基环己烷)铂(ii)；(1,2-二氨基环己烷)-(异柠檬酸)铂(ii)；(1,2-二氨基环己烷)顺式(丙酮酸)铂(ii)；(1,2-二氨基环己烷)草酸铂(ii)；奥马铂；和四铂。[0279]在一些实施方案中，顺铂是用于本发明的组合物和方法中的铂配位化合物。顺铂可从bristolmyers-squibbcorporation以名称platinoltm商购，并且可作为用于用水、无菌盐水或其他合适的媒介物复原的粉末获得。适用于本发明的其他铂配位化合物是已知的并且可商购和/或可通过常规技术制备。顺铂或顺式-二氯二氨铂ii已成功用作治疗各种人实体恶性肿瘤的化学治疗剂许多年。最近，其他二氨基铂复合物也显示出作为治疗各种人实体恶性肿瘤的化学治疗剂的功效。这种二氨基-铂复合物包括但不限于螺铂和卡铂。尽管顺铂和其他二氨基-铂复合物已广泛用作人的化学治疗剂，但它们必须以高剂量水平递送，这可能导致毒性问题，如肾损伤。[0280]在一些实施方案中，化学治疗剂是拓扑异构酶抑制剂。拓扑异构酶是能够改变真核细胞中的dna拓扑结构的酶。它们对细胞功能和细胞增殖至关重要。一般而言，真核细胞中存在两类拓扑异构酶，i型和ii型。拓扑异构酶i是大约100,000分子量的单体酶。所述酶结合至dna并引入瞬时单链断裂，使双螺旋展开(或允许其展开)，且随后在与dna链解离之前使所述断裂重新密封。各种拓扑异构酶抑制剂最近在治疗患有卵巢癌、癌症、食道癌或非小细胞肺癌的人中显示出临床功效。[0281]在一些方面，拓扑异构酶抑制剂是喜树碱或喜树碱类似物。喜树碱是由中国本土的喜树(camptothecaaccuminata)和印度本土的青翠枝(nothapodytesfoetida)树产生的不溶于水的细胞毒性生物碱。喜树碱对多种肿瘤细胞表现出肿瘤细胞生长抑制活性。喜树碱类似物类化合物通常是dna拓扑异构酶i的特异性抑制剂。术语“拓扑异构酶抑制剂”是指在结构上与喜树碱有关的任何肿瘤细胞生长抑制化合物。喜树碱类似物类化合物包括但不限于：拓扑替康、伊立替康和9-氨基喜树碱。[0282]在另外的实施方案中，细胞毒性剂是以下中要求保护或描述的任何肿瘤细胞生长抑制喜树碱类似物：1991年4月2日发布的美国专利第5,004,758号和在1989年6月21日公布为20'公布号ep0321122的欧洲专利申请第88311366.4号；1986年8月5日发布的美国专利第4,604,463号和1985年4月17日公布的欧洲专利申请公布第ep0137145号；1984年9月25日发布的美国专利第4,473,692号和1983年3月16日公布的欧洲专利申请公布第ep0074256号；1985年10月8日发布的美国专利第4,545,880号和1983年3月16日公布的欧洲专利申请公布第ep0074256号；1983年9月14日公布的欧洲专利申请公布第ep0088642号；wani等人,j.med.chem.,29,2358-2363(1986)；nitta等人,proc.14thinternationalcongr.chemotherapy,kyoto,1985,tokyopress,anticancersection1,第28-30页，特别是称为cpt-11的化合物。cpt-11是喜树碱类似物，其具有通过10-羟基-7-乙基喜树碱的c-10处的氨基甲酸酯键联连接的4-(哌啶基)-哌啶侧链。cpt-11目前正在进行人临床试验，并且也被称为伊立替康；wani等人,j.med.chem.,23,554(1980)；wani等人,j.med.chem.,30,1774(1987)；1982年8月3日发布的美国专利第4,342,776号；1990年9月13日提交的美国专利申请序列第581,916号和1991年3月20日公布的欧洲专利申请公布第ep418099号；1985年4月23日发布的美国专利第4,513,138号和1983年3月23日公布的欧洲专利申请公布第ep0074770号；1983年8月16日发布的美国专利第4,399,276号和1982年7月28日公布的欧洲专利申请公布第0056692号；其各自的全部公开内容特此以引用的方式并入。喜树碱类似物类的所有上文列出的化合物均可商购和/或可通过包括上文列出的参考文献中描述的那些技术的常规技术制备。拓扑异构酶抑制剂可选自由以下组成的组：拓扑替康、伊立替康和9-氨基喜树碱。[0283]在一些实施方案中，喜树碱类似物是伊立替康(cpt-11)的活性代谢物。在一些此类实施方案中，喜树碱类似物是7-乙基-10-羟基喜树碱(sn-38)。作为代谢物，sn-38是通过羧酸酯酶水解伊立替康而形成的。在一些实施方案中，sn-38具有以下结构中的一种：[0284][0285]sn-38已描述于美国专利申请序列第7,999,083号；美国专利申请序列第8,080,250号；美国专利申请序列第8,759,496号；美国专利申请序列第8,999,344号；美国专利申请序列第10,195,288号；和美国专利申请序列第9,808,537号中。[0286]在一些实施方案中，喜树碱类似物是甲磺酸依沙替康。甲磺酸依沙替康是水溶性喜树碱(cpt)，与其他cpt类似物相比表现出更强的拓扑异构酶i抑制活性和抗肿瘤活性。此外，依沙替康对p-糖蛋白(p-gp)介导的多重耐药性细胞有效。[0287]在一些实施方案中，喜树碱类似物是德卢替康(dxd)，它是依沙替康的有效衍生物，其拓扑异构酶i抑制效力是sn-38的10倍。在一些实施方案中，dxd具有以下结构：[0288][0289]dxd已描述于美国专利申请序列第6,407,115号；美国专利申请序列第10,195,288号；美国专利申请序列第9,808,537号；和美国专利申请序列第6,407,115号中。[0290]大量喜树碱类似物类化合物(包括其药学上可接受的盐、水合物和溶剂合物)的制备以及包含这种喜树碱类似物类化合物和惰性、药学上可接受的载剂或稀释剂的口服和胃肠外药物组合物的制备在1991年4月2日发布的美国专利第5,004,758号和1989年6月21日作为公布号ep0321122公布的欧洲专利申请第88311366.4号中进行了广泛描述，所述专利的教义以引用的方式并入本文。[0291]在本发明的其他实施方案中，化学治疗剂是抗生素化合物。合适的抗生素包括但不限于阿霉素、丝裂霉素、博来霉素、柔红霉素和链脲菌素。[0292]在一些实施方案中，化学治疗剂是抗有丝分裂生物碱。一般来说，抗有丝分裂生物碱可从长春花(cantharanthusroseus)中提取，并且已被证明是有效的抗癌化学治疗剂。已经在化学和药理学上研究了大量半合成衍生物(参见，o.vantellingen等人,anticancerresearch,12,1699-1716(1992))。本发明的抗有丝分裂生物碱包括但不限于长春碱、长春新碱、长春地辛、紫杉酚和长春瑞滨。后两种抗有丝分裂生物碱可分别从elilillyandcompany和pierrefabrelaboratories商购获得(参见美国专利第5,620,985号)。在一个实施方案中，抗有丝分裂生物碱是长春瑞滨。[0293]在本发明的其他实施方案中，化学治疗剂是二氟核苷。2'-脱氧-2',2'-二氟核苷在本领域中已知具有抗病毒活性。此类化合物在美国专利第4,526,988号和第4,808614号中公开和教导。欧洲专利申请公布184,365公开了这些相同的二氟核苷具有溶瘤活性。在某些方面，本发明的组合物和方法中使用的2'-脱氧-2',2'-二氟核苷是2'-脱氧-2',2'-二氟胞苷盐酸盐，也称为吉西他滨盐酸盐。吉西他滨是可商购的，或者可如美国专利第4,526,988号、第4,808,614号和第5,223,608号中公开和教导以多步法合成，所述专利的教义以引用的方式并入本文。[0294]在各个方面，化学治疗剂是通过阻断微管蛋白聚合而抑制细胞分裂的抗有丝分裂剂。使微管不稳定或改变微管动力学，例如美登木素生物碱或其衍生物(例如dm1或dm4)、奥瑞他汀或其衍生物。在各种情况下，化学治疗剂是奥瑞他汀。例如，在某些方面，奥瑞他汀是尾海兔素、单甲基奥瑞他汀e(mmae)、单甲基奥瑞他汀e(mmae)或pf-06380101。奥瑞他汀在本领域中有描述。参见例如maderna,a.；等人.,molpharmaceutics12(6):1798-1812(2015)。在各个方面，缀合物包含与mmae组合的本公开的抗体。任选地，缀合物包含接头。在一些方面，接头包含可裂解的连接部分。在各种情况下，缀合物包含连接至附接基团的本公开的抗体，所述附接基团连接至组织蛋白酶可裂解接头，所述接头进而连接至与mmae连接的间隔区。在一些方面，附接基团通过抗体fc区的cys残基附接至抗体。在示例性方面，附接基团包含式i的结构：[0295][0296]在示例性方面，组织蛋白酶可裂解接头包含式ii的结构：[0297][0298]在示例性方面，间隔区包含式iii的结构：[0299][0300]在一些实施方案中，mmae具有以下结构：[0301][0302]本公开还提供了包含与多肽连接的本公开的抗原结合蛋白的缀合物，使得所述缀合物是融合蛋白。因此，本公开提供了包含与多肽连接的本公开的抗原结合蛋白的融合蛋白。在各种实施方案中，多肽是诊断标记，例如荧光蛋白，如绿色荧光蛋白；或其他标签，例如myc标签。在各个方面，多肽是上文列出的细胞因子、淋巴因子、生长因子或其他造血因子中的一者。[0303]接头[0304]在一些实施方案中，缀合物直接连接至异源部分。在替代实施方案中，缀合物包含将本公开的化合物连接至异源部分的接头。在一些方面，接头包含1至约60、或1至30个原子或更长、2至5个原子、2至10个原子、5至10个原子或10至20个原子长的原子链。在一些实施方案中，链原子都是碳原子。在一些实施方案中，接头的主链中的链原子选自由c、o、n和s组成的组。链原子和接头可根据它们的预期溶解度(亲水性)进行选择，以提供可溶性更高的缀合物。在一些实施方案中，接头提供了如下官能团，所述官能团经受酶或其他催化剂或在靶组织或器官或细胞中发现的水解条件的裂解。在一些实施方案中，接头的长度足够长以降低空间位阻的可能性。在一些实施方案中，接头是氨基酸或肽基接头。此类肽基接头可以是任何长度。各种接头的长度是约1至50个氨基酸，长度是5至50、3至5、5至10、5至15或10至30个氨基酸。[0305]多种合适的接头是本领域中已知的。接头可以是可裂解的(可裂解接头)，例如在生理条件下，例如在细胞内条件下，使得接头的裂解在细胞内环境中释放药物。可替代地，接头可在细胞外条件下裂解，例如在肿瘤细胞外或在肿瘤块附近，使得接头的裂解释放优先渗透到肿瘤细胞内部的药物。在其他实施方案中，接头是不可裂解的(不可裂解的接头)，并且例如通过抗体降解释放药物。[0306]接头可与抗体部分上的化学反应性基团键合，例如与游离氨基、亚氨基、羟基、硫醇或羧基键合(例如，与n或c端键合，与一个或多个赖氨酸残基的ε氨基键合，与一个或多个谷氨酸或天冬氨酸残基的游离羧酸基团键合，与一个或多个半胱氨酸残基的巯基键合，或与一个或多个丝氨酸或苏氨酸残基的羟基键合)。接头结合的位点可以是抗体部分的氨基酸序列中的天然残基，或者可将所述位点引入抗体部分中，例如通过dna重组技术(例如，通过在氨基酸序列中引入半胱氨酸或蛋白酶裂解位点)或通过蛋白质生物化学(例如，还原、ph调节或蛋白水解)。接头键合的位点也可以是非天然氨基酸。接头键合的位点也可以是抗体上的聚糖。[0307]通常，接头在其连接的两个基团连接的条件下基本上是惰性的。术语“双功能交联剂”、“双功能接头”或“交联剂”是指在接头的每一端具有两个反应性基团的修饰剂，使得一个反应性基团可首先与细胞毒性化合物反应以提供带有接头部分和第二反应性基团的化合物，所述化合物然后可与抗体反应。可替代地，双功能交联剂的一端可首先与抗体反应以提供带有接头部分和第二反应性基团的抗体，所述抗体然后可与细胞毒性化合物反应。连接部分可含有允许在特定位点释放细胞毒性部分的化学键。合适的化学键是本领域众所周知的，并且包括二硫键、硫醚键、酸不稳定键、光不稳定键、蛋白酶/肽酶不稳定键和酯酶不稳定键。参见例如，美国专利第5,208,020号；第5,475,092号；第6,441,163号；第6,716,821号；第6,913,748号；第7,276,497号；第7,276,499号；第7,368,565号；第7,388,026号和第7,414,073号。在一些实施方案中，键是二硫键、硫醚和/或蛋白酶/肽酶不稳定键。可用于本发明的其他接头包括不可裂解的接头，如在us20050169933中详细描述的那些；带电接头或亲水性接头，如在us2009/0274713、us2010/0129314和wo2009/134976中描述的那些，所述专利各自以引用的方式明确并入本文。[0308]在一些实施方案中，接头是赋予缀合物亲水性的亲水性接头。在一些实施方案中，亲水性接头包括聚乙二醇(peg)。在一些实施方案中，亲水性接头是cla2。在一些实施方案中，cla2接头具有以下结构：[0309][0310]cla2已在美国专利第8,080,250号；第8,759,496号；和第10,195,288号中进行了描述。[0311]在一些实施方案中，亲水性接头是cl2e。在一些实施方案中，cl2e具有以下结构：[0312][0313]cl2e已在美国专利第8,080,250号；第8,759,496号；和第10,195,288号中进行了描述。[0314]在一些实施方案中，通过在细胞内环境中(例如，溶酶体或核内体或质膜微囊(caveolea)内)存在的裂解剂，接头是可裂解的。接头可以是例如通过细胞内或细胞外肽酶或蛋白酶而裂解的肽接头，所述酶包括但不限于溶酶体或核内体蛋白酶。在一些实施方案中，肽接头包含至少两个、至少三个、至少四个或至少五个氨基酸长。[0315]在一些实施方案中，肽接头是mc-vc-pab，包含缬氨酸和瓜氨酸残基。在一些实施方案中，mc-vc-pab接头具有以下结构：[0316][0317]mc-vc-pab已在美国专利第7,659,241号；第7,829,531号；第6,884,869号；第6,214,345号；和第6,214,345号中进行了描述。[0318]在一些实施方案中，肽接头是马来酰亚胺基己酰基甘氨酸-甘氨酸-苯丙氨酸-甘氨酸(mc-ggfg)。在一些实施方案中，mc-ggfg接头具有以下结构：[0319][0320]mc-ggfg已在美国专利第9,808,537号和第10,195,288号中进行了描述。[0321]在其它的实施方案中，可裂解接头是ph敏感性的，即对某些ph值下的水解敏感。在一些实施方案中，ph敏感性接头在酸性条件下是可水解的。例如，可使用在溶酶体中可水解的酸不稳定接头(例如，腙、缩氨基脲、缩氨基硫脲、顺式-乌头酰胺、原酸酯、缩醛、缩酮等)(参见例如，美国专利第5,122,368号；第5,824,805号；第5,622,929号；dubowchik和walker,1999,pharm.therapeutics83:67-123；neville等人,1989,biol.chem.264:14653-14661)。此类接头在中性ph条件(如在血液中的那些)下是相对稳定的，但是在低于ph5.5或5.0、接近溶酶体的ph下是不稳定的。在某些实施方案中，可水解的接头是硫醚接头(例如，经由酰基腙键附接至治疗剂的硫醚(参见，例如，美国专利第5,622,929号)。[0322]在其它实施方案中，在还原条件下，接头是可裂解的(例如，二硫化物接头)。能够通过二硫键将抗体与细胞毒性化合物连接的双功能交联剂包括但不限于n-琥珀酰亚胺基-4-(4-硝基吡啶基-2-二硫代)丁酸酯、n-琥珀酰亚胺基-3-(2-吡啶基二硫代)丙酸酯(spdp)、n-琥珀酰亚胺基-4-(2-吡啶基二硫代)戊酸酯(spp)、n-琥珀酰亚胺基-4-(2-吡啶基二硫代)丁酸酯(spdb)、n-琥珀酰亚胺基-4-(2-吡啶基二硫代)-2-磺基丁酸酯(磺基-spdb)。磺基-spdb描述于例如美国专利8,236,319中，所述专利以引用的方式并入本文。可替代地，可使用引入硫醇基团的交联剂，如2-亚氨基硫杂环戊烷、同型半胱氨酸硫内酯或s-乙酰基琥珀酸酐。在其他实施方案中，接头可含有先前描述的肽、ph敏感性接头或二硫化物接头中的一者或多者的组合。[0323]“异双官能交联剂”是具有两个不同反应性基团的双官能交联剂。含有胺反应性n-羟基琥珀酰亚胺基团(nhs基团)和羰基反应性肼基团的异双功能交联剂也可用于将细胞毒性化合物与抗体连接。这种可商购获得的异双官能交联剂的实例包括琥珀酰亚胺基6-肼基烟酰胺酰胺丙酮腙(sanh)、琥珀酰亚胺基4-肼基对苯二酸酯盐酸盐(shth)和琥珀酰亚胺基肼烟酸酯盐酸盐(shnh)。带有酸不稳定键联的缀合物也可使用本发明的带有肼的苯并二氮杂衍生物来制备。可使用的双官能交联剂的实例包括琥珀酰亚胺基-对-甲酰基苯甲酸酯(sfb)和琥珀酰亚胺基-对-甲酰基苯氧基乙酸酯(sfpa)。[0324]本文所述的接头可与本文所述的异源部分以任何组合使用。本文所述的所有上文列出的接头和异源部分均可商购和/或可通过包括上文列出的参考文献中描述的那些技术的常规技术制备。[0325]缀合[0326]异源部分与抗原结合蛋白的比率(har)表示每个抗原结合分子连接的异源部分的数量。在一些实施方案中，har在1至15、1至10、1至9、1至8、1至7、1至6、1至5、1至4、1至3或1至2的范围内。在一些实施方案中，har在2至10、2至9、2至8、2至7、2至6、2至5、2至4或2至3的范围内。在其他实施方案中，har是约2、约2.5、约3、约4、约5或约6。在一些实施方案中，har在约2至约4的范围内。har可通过常规手段表征，如质谱、uv/vis光谱、elisa测定和/或hplc。[0327]在一些实施方案中，缀合物是异质缀合物(也称为“常规的”)，其中抗原结合蛋白缀合至不同数量的异源部分。在一些实施方案中，异质缀合物遵循缀合物的高斯分布或准高斯分布，其中分布集中在平均异源部分负载值上，其中一些抗原结合蛋白以高于平均值缀合，而一些抗原结合蛋白以低于平均值缀合。[0328]在一些实施方案中，缀合物是均质缀合物，其中相当大百分比的抗原结合蛋白缀合至确定数量的异源部分。在一些实施方案中，均质缀合物包含1、2、3、4、5、6、7、8、9或10的har。在一些实施方案中，均质缀合物包含2、4、6或8的har。在优选实施方案中，均质缀合物包含4的har。在其他优选实施方案中，均质缀合物包含2的har。在一些实施方案中，均质缀合物包含大于或等于70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77％、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％的具有限定har的缀合物。在一些实施方案中，均质缀合物包含约70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77％、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％的具有限定har的缀合物。在一些实施方案中，均质缀合物包含至少70％、71％、72％、73％、74％、75％、76％、77％、78％、79％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％的具有限定har的缀合物。在一些实施方案中，同质缀合物包含非高斯或准高斯分布的har分布。在一些实施方案中，均质缀合物的同质性通过色谱图确定，例如hplc或任何合适的色谱。在一些实施方案中，色谱图是hic色谱图。均质缀合物可通过位点特异性缀合产生。[0329]在一些实施方案中，异源部分以位点特异性方式与抗原结合蛋白(例如，抗体)缀合。各种位点特异性缀合方法是本领域已知的，例如，thiomab或tdc或在未配对的半胱氨酸残基处缀合(junutula等人(2008)nat.biotechnol.26:925-932；dimasi等人(2017)mol.pharm.14:1501-1516；shen等人(2012)nat.biotechnol.30:184-9)；硫醇桥接头(behrens等人(2015)mol.pharm.12:3986-98)；使用转谷氨酰胺酶在谷氨酰胺处缀合(dennler等人(2013)methodsmol.bio.1045:205-15；dennler等人(2014)bioconjugchem.25:569-78)；在工程改造的非天然氨基酸残基处缀合(axup等人(2012)procnatlacadsciu.s.a.104-16101-6；tian等人(2014)procnatlacadsciu.s.a.111:1766-71；vanbrunt等人(2015)bioconjugchem26:2249-60；zimmerman等人(2014)bioconjugchem25:351-61)；硒代半胱氨酸结合(li等人(2017)cellchembiol24:433-442)；聚糖介导的缀合(okeley等人(2013)bioconjugchem24:1650-5)；半乳糖或galnac类似物处的缀合(ramakrishnan和qasba(2002)jbiolchem277:20833-9；vangeel等人(2015)bioconjugchem26:2233-42)；通过聚糖工程改造(zhou等人(2014)bioconjugchem25:510-20；tang等人(2017)natprotoc12:1702-1721)；通过短肽标签，如工程改造谷氨酰胺标签或分选酶a介导的转肽作用(strop等人(2013)chembiol20:161-7；beerli等人(2015)plosone10:e0131177)；以及通过醛标签(wu等人(2009)procnatlacadsciu.s.a.106:3000-5)。[0330]缀合物(例如，adc)的不可预测性[0331]仅基于抗体谱或药物有效负载谱，不可能提前预测哪些抗体-药物缀合物对于临床应用将是足够安全和有效的。例如，特定的药物有效负载当与针对一个靶标的抗体缀合时可发挥很好的作用，但当与针对不同靶标的抗体缀合或甚至与针对同一靶标的不同抗体缀合时，它的作用可能几乎没有。不同的抗体-药物缀合物在体内展现出不同的抗肿瘤活性的原因还没有得到充分的理解，以至于无法在新的抗体-药物缀合物的设计中进行准确预测。据推测，许多因素的不可预测的相互作用在起作用。这些因素可包括，例如，抗体-药物缀合物对靶抗原的结合亲和力、缀合物渗透实体瘤的能力以及在循环中适当暴露于肿瘤而不引起毒性的半衰期。[0332]仅抗体亲和力就很好地证明了复杂性和不可预测性。具有高亲和力的抗体或抗体-药物缀合物追踪具有更好的细胞摄取，从而导致细胞内释放出更高水平的细胞毒性有效负载。还已知较高的亲和力可增强抗体依赖性细胞毒性(adcc)。所有这些属性都有利于抗体-药物缀合物的细胞杀伤性质。然而，众所周知，抗体或抗体-药物缀合物的高亲和力可通过“抗原屏障效应”阻止有效的肿瘤渗透，从而表明为了在体内实现强大的抗肿瘤活性，抗体-药物缀合物的亲和力必须恰到好处：不要太高或太低。迄今为止，尚不清楚如何预测抗体-药物缀合物的最高效或最有效的亲和力水平。[0333]此外，仅通过接头和有效负载的机制无法预测体内抗肿瘤活性。例如，o.ab等人,mol.cancerther.14(&):1605-1613(2015)证明，当在临床前癌症模型中进行测试时，通过不同接头与相同抗微管蛋白毒素缀合的相同抗体表现出截然不同的抗肿瘤活性。这一实例是特别出人意料的，因为两个接头的化学结构非常相似。此外，存在于高级缀合物中的接头含有亲水性部分。亲水性代谢物的膜渗透性通常较低，并且被认为从溶酶体(缀合物降解的位点)流出的速度较慢，从而导致释放的有效负载的抗微管蛋白活性延迟。这一发现支持有效负载递送的“理想”动力学，但迄今为止，还没有深入了解此类动力学的构成。增加这种复杂性的是悬而未决的问题，即有效负载递送的理想动力学(即使是针对特定细胞类型定义的)是否将适用于所有细胞类型。因此，仅从接头或有效负载的化学组成不可能预测最有效的体内抗肿瘤活性。[0334]组合物、药物组合物和制剂[0335]本文提供了包含如当前公开的抗原结合蛋白、核酸、载体、宿主细胞或缀合物的组合物。在一些方面，所述组合物包含分离和/或纯化形式的抗原结合蛋白。在一些方面，所述组合物包含本公开的单一类型(例如，结构)的抗原结合蛋白或包含本公开的两种或更多种抗原结合蛋白的组合，其中所述组合包含两种或更多种不同类型(例如，结构)的抗原结合蛋白。[0336]在一些方面，所述组合物包含增强抗原结合蛋白的化学-物理特征的剂，例如通过在某些温度(例如室温)下稳定抗原结合蛋白、延长保质期、减少降解(例如氧化蛋白酶介导的降解)、增加抗原结合蛋白的半衰期等。在一些方面，所述组合物包含作为异源部分或缀合物部分的本文公开的任何剂，任选地与本公开的抗原结合蛋白混合或缀合至抗原结合蛋白。[0337]在本公开的各个方面，所述组合物另外包含药学上可接受的载剂、稀释剂或赋形剂。在一些实施方案中，将如当前公开的抗原结合蛋白、核酸、载体、宿主细胞或缀合物(下文称为“活性剂”)配制成包含活性剂以及药学上可接受的载剂、稀释剂或赋形剂的药物组合物。在此方面，本公开进一步提供了包含活性剂的药物组合物，所述药物组合物旨在施用于受试者，例如哺乳动物。[0338]在一些实施方案中，活性剂以适合施用于患者的纯度水平存在于药物组合物中。在一些实施方案中，活性剂具有至少约90％、约91％、约92％、约93％、约94％、约95％、约96％、约97％、约98％或约99％的纯度水平，以及药学上可接受的稀释剂、载剂或赋形剂。在一些实施方案中，所述组合物含有浓度为约0.001至约30.0mg/ml的活性剂。[0339]在各个方面，所述药物组合物包含药学上可接受的载剂。如本文所用，术语“药学上可接受的载剂”包括任何标准药物载剂，如磷酸盐缓冲盐水溶液、水、乳液(如油/水或水油型乳液)以及各种类型的润湿剂。所述术语还包括美国联邦政府监管机构批准的或美国药典中列出的用于动物(包括人)的任何剂。[0340]药物组合物可包含任何药学上可接受的成分，包括例如酸化剂、添加剂、吸附剂、气溶胶推进剂、空气置换剂、碱化剂、抗结块剂、抗凝剂、抗微生物防腐剂、抗氧化剂、防腐剂、碱、粘合剂、缓冲剂、螯合剂、包衣剂、着色剂、干燥剂、洗涤剂、稀释剂、消毒剂、崩解剂、分散剂、溶解增强剂、染料、润肤剂、乳化剂、乳化稳定剂、填充剂、成膜剂、增味剂、调味剂、流动增强剂、胶凝剂、造粒剂、保湿剂、润滑剂、粘膜粘附剂、软膏基质、软膏、油质媒介物、有机基质、锭剂基质、颜料、增塑剂、抛光剂、防腐剂、螯合剂、皮肤渗透剂、增溶剂、溶剂、稳定剂、栓剂基质、表面活性剂(surfaceactiveagent)、表面活性剂(surfactant)、悬浮剂、甜味剂、治疗剂、增稠剂、张力剂、毒性剂、增粘剂、吸水剂、水混溶性助溶剂、水软化剂或润湿剂。参见例如，thehandbookofpharmaceuticalexcipients,第三版,a.h.kibbe(pharmaceuticalpress,london,uk,2000)，其以引用的方式整体并入。remington’spharmaceuticalsciences,第十六版,e.w.martin(mackpublishingco.,easton,pa.,1980)，其以引用的方式整体并入。[0341]在各个方面，药物组合物包含在所采用的剂量和浓度下对接受者无毒的配制材料。在具体实施方案中，药物组合物包含活性剂和一种或多种药学上可接受的盐；多元醇；表面活性剂；渗透平衡剂；张力剂；抗氧化剂；抗生素；抗真菌剂；填充剂；冻干保护剂；消泡剂；螯合剂；防腐剂；着色剂；镇痛剂；或另外的药剂。在各个方面，药物组合物包含一种或多种多元醇和/或一种或多种表面活性剂，任选地，除了一种或多种赋形剂外，包括但不限于药学上可接受的盐；渗透平衡剂(张力剂)；抗氧化剂；抗生素；抗真菌剂；填充剂；冻干保护剂；消泡剂；螯合剂；防腐剂；着色剂；和镇痛剂。[0342]在某些实施方案中，药物组合物可含有用于调节、维持或保持例如组合物的ph、摩尔渗透压浓度、粘度、澄清度、颜色、等张性、气味、无菌性、稳定性、溶解或释放速率、吸收或渗透的配制材料。在此类实施方案中，合适的配制材料包括但不限于氨基酸(如甘氨酸、谷氨酰胺、天冬酰胺、精氨酸或赖氨酸)；抗微生物剂；抗氧化剂(如抗坏血酸、亚硫酸钠或亚硫酸氢钠)；缓冲剂(如硼酸盐、碳酸氢盐、tris-hcl、柠檬酸盐、磷酸盐或其它有机酸)；增积剂(如甘露糖醇或甘氨酸)；螯合剂(如乙二胺四乙酸(edta))；络合剂(如咖啡碱(caffeine)、聚乙烯吡咯烷酮、β-环糊精或羟丙基-β-环糊精)；填充剂；单糖；双糖；和其它碳水化合物(如葡萄糖、甘露糖或糊精)；蛋白质(如血清白蛋白、明胶或免疫球蛋白)；着色剂、调味剂和稀释剂；乳化剂；亲水性聚合物(如聚乙烯吡咯烷酮)；低分子量多肽；成盐相对离子(如钠)；防腐剂(如氯化苯甲烃铵、苯甲酸、水杨酸、硫柳汞(thimerosal)、苯乙醇、对羟基苯甲酸甲酯、对羟基苯甲酸丙酯、氯己定(chlorhexidine)、山梨酸(sorbicacid)或过氧化氢)；溶剂(如甘油、丙二醇或聚乙二醇)；糖醇(如甘露糖醇或山梨糖醇)；混悬剂；界面活性剂或湿润剂(如普洛尼克(pluronic)、peg、脱水山梨醇酯、聚山梨醇酯(如聚山梨醇酯20、聚山梨醇酯)、曲通(triton)、缓血酸胺(tromethamine)、卵磷脂(lecithin)、胆固醇、泰洛沙泊(tyloxapal))；稳定性增强剂(如蔗糖或山梨糖醇)；张力增强剂(如碱金属卤化物(优选氯化钠或氯化钾)、甘露糖醇山梨糖醇)；递送媒介物；稀释剂；赋形剂和/或药物佐剂。参见remington'spharmaceuticalsciences,第18版,(a.r.genrmo编),1990,mackpublishingcompany。[0343]可配制药物组合物以达到生理相容的ph值。在一些实施方案中，药物组合物的ph可以是例如介于约4或约5与约8.0或约4.5和约7.5或约5.0至约7.5之间。在各种实施方案中，药物组合物的ph介于5.5与7.5之间。[0344]本公开提供了生产药物组合物的方法。在各个方面，所述方法包括将抗原结合蛋白、缀合物、融合蛋白、核酸、载体、宿主细胞或其组合与药学上可接受的载剂、稀释剂或赋形剂组合。[0345]施用途径[0346]关于本公开，活性剂或包含活性剂的药物组合物可通过任何合适的施用途径施用于受试者。例如，活性剂可通过胃肠外、经鼻、经口、肺部、局部、阴道或直肠施用而施用于受试者。提供以下关于施用途径的论述仅用于说明各种实施方案并且不应被解释为以任何方式限制范围。[0347]用于胃肠外施用的制剂包括水性和非水性等张无菌注射溶液，其可含有抗氧化剂、缓冲剂、抑菌剂和致使制剂与预定接受者的血液等张的溶质；以及水性和非水性无菌悬浮液，其可包含悬浮剂、增溶剂、增稠剂、稳定剂以及防腐剂。术语“胃肠外”是指不是通过消化道而是通过一些其他途径，如皮下、肌肉内、脊柱内或静脉内。本公开的活性剂可在药物载剂(诸如无菌液体或液体混合物)中与生理学上可接受的稀释剂一起施用，所述无菌液体或液体混合物包括水、盐水、水性右旋糖以及相关糖溶液、醇(诸如乙醇或十六烷醇)、二醇(诸如丙二醇或聚乙二醇)、二甲亚砜、甘油、缩酮如2,2-二甲基-l53-二氧戊环-4-甲醇、醚、聚(乙二醇)400、油、脂肪酸、脂肪酸酯或甘油酯或乙酰化脂肪酸甘油酯，其中添加或不添加药学上可接受的表面活性剂，诸如皂或洗涤剂、悬浮剂诸如果胶、卡波姆、甲基纤维素、羟丙基甲基纤维素或羧甲基纤维素或乳化剂和其他药物佐剂。[0348]可用于胃肠外制剂的油包括石油、动物油、植物油或合成油。油的具体实例包括花生、大豆、芝麻、棉籽、玉米、橄榄、凡士林和矿物。适用于胃肠外制剂的脂肪酸包括油酸、硬脂酸和异硬脂酸。油酸乙酯和肉豆蔻酸异丙酯是合适的脂肪酸酯的实例。[0349]用于胃肠外制剂的合适的皂包括脂肪碱金属、铵和三乙醇胺盐，并且合适的洗涤剂包括(a)阳离子洗涤剂，诸如二甲基二烷基卤化铵和烷基吡啶鎓卤化物，(b)阴离子洗涤剂，例如像烷基、芳基和烯烃磺酸酯、烷基、烯烃、醚以及单酸甘油酯硫酸酯和磺基琥珀酸盐，(c)非离子洗涤剂，例如像脂肪胺氧化物、脂肪酸链烷醇酰胺和聚氧乙烯-聚丙烯共聚物，(d)两性洗涤剂，例如像烷基-β-氨基丙酸盐和2-烷基-咪唑啉季铵盐以及(e)它们的混合物。[0350]在一些实施方案中，胃肠外制剂在溶液中含有约0.5重量％至约25重量％的本公开的活性剂。可使用防腐剂和缓冲剂。为了最小化或消除注射部位的刺激，此类组合物可含有具有约12至约17的亲水-亲油平衡(hlb)的一种或多种非离子表面活性剂。此类制剂中的表面活性剂的量通常将在约5重量％至约15重量％的范围内。合适的表面活性剂包括聚乙二醇脱水山梨糖醇脂肪酸酯，诸如脱水山梨醇单油酸酯和环氧乙烷与疏水基质的高分子量加合物，通过环氧丙烷与丙二醇的缩合形成的。在一些方面，胃肠外制剂可以单位剂量或多剂量密封容器，如安瓿和小瓶形式呈现，并且可储存于冷冻干燥(冻干)条件下，仅需在使用前即刻添加无菌液体赋形剂(例如水)以供注射。在一些方面，临时注射溶液和悬浮液是由前述种类的无菌粉末、颗粒剂和片剂制备的。[0351]可注射制剂根据本公开。可注射组合物对有效药物载剂的要求是本领域普通技术人员众所周知的(参见例如，pharmaceuticsandpharmacypractice,j.b.lippincottcompany,philadelphia,pa,banker和chalmers,编,第238-250页(1982)；以及ashphandbookoninjectabledrugs,toissel,第4版,第622-630页(1986)。[0352]剂量[0353]据信本公开的活性剂可用于抑制肿瘤生长的方法以及如本文进一步描述的其他方法(包括治疗或预防癌症的方法)中。出于本公开的目的，所施用的活性剂的量或剂量应足以在合理的时间范围内在受试者或动物中实现例如治疗性或预防性应答。例如，本公开的活性剂的剂量应足以从施用时起约1至4分钟、1至4小时或1至4周或更长时间，例如5至20周或更多周的时间段内治疗如本文所述的癌症。在某些实施方案中，所述时间段甚至可更长。剂量将由特定活性剂的功效和动物(例如人)的状况以及待治疗的动物(例如人)的体重决定。[0354]用于确定施用剂量的许多测定是本领域已知的。出于本文的目的，包括以下方面的测定可用于确定待施用于哺乳动物的起始剂量：比较在向一组哺乳动物中的哺乳动物施用给定剂量的本公开的活性剂后癌症治疗的程度，其中每组被给予不同剂量的活性剂。施用特定剂量后治疗癌症的程度可由例如在小鼠异种移植物模型中使用活性剂实现的肿瘤消退程度来表示。测定肿瘤消退的方法是本领域已知的并且在本文的实施例中进行了描述。[0355]本公开的活性剂的剂量也将由可能伴随本公开的特定活性剂的施用的任何不利副作用的存在、性质和程度来确定。通常，主治医师将决定用于治疗每个个体患者的本公开的活性剂的剂量，考虑多种因素，如年龄、体重、一般健康、饮食、性别、所施用的本公开的活性剂、施用途径和所治疗疾患的严重程度。举例来说且不旨在限制本公开，本公开的活性剂的剂量可以是约0.0001至约1g/kg所治疗受试者的体重/天、约0.0001至约0.001g/kg体重/天或约0.01mg至约1g/kg体重/天。[0356]控制释放制剂[0357]在一些实施方案中，本文所述的活性剂可被修饰成贮库形式，使得本公开的活性剂释放到其被施用的身体中的方式关于时间和体内的位置进行控制(参见例如，美国专利第4,450,150号)。本公开的活性剂的贮库形式可以是例如包含活性剂和多孔或无孔材料(例如聚合物)的可植入组合物，其中活性剂被材料包封或扩散到材料中和/或无孔材料的降解。然后将贮库植入受治疗者体内的所需位置，并且活性剂以预定速率从植入物释放。[0358]在某些方面，包含活性剂的药物组合物被修饰以具有任何类型的体内释放特征。在一些方面，药物组合物是立即释放、受控释放、持续释放、延长释放、延迟释放或双相释放制剂。配制用于受控释放的肽的方法是本领域已知的。参见例如，qian等人,jpharm374:46-52(2009)和国际专利申请公布号wo2008/130158；wo2004/033036；wo2000/032218；和wo1999/040942。[0359]本发明组合物还可包含例如微胶粒或脂质体或一些其它包封形式，或者可以延迟释放的方式施用以提供持久储存和/或递送效果。[0360]用途[0361]本公开的抗原结合蛋白可用于抑制肿瘤生长。不受特定理论的束缚，本文提供的抗原结合蛋白的抑制作用允许此类实体可用于治疗癌症的方法中。[0362]因此，本文提供了抑制受试者的肿瘤生长的方法和减小受试者的肿瘤大小的方法。在各种实施方案中，所述方法包括向所述受试者施用有效抑制受试者的肿瘤生长或减小肿瘤大小的量的本公开的药物组合物。在各个方面，卵巢肿瘤、黑素瘤肿瘤、膀胱肿瘤或子宫内膜肿瘤的生长受到抑制。在各个方面，卵巢肿瘤、黑素瘤肿瘤、膀胱肿瘤或子宫内膜肿瘤的大小减小。[0363]如本文所用，术语“抑制”或“减少”以及源自其的词可能不是100％或完全抑制或减小。而是，存在不同程度的抑制或减小，本领域的普通技术人员认为其具有潜在的益处或治疗效果。在此方面，本公开的抗原结合蛋白可抑制肿瘤生长或将肿瘤大小减小至任何量或水平。在各种实施方案中，本公开的方法所提供的抑制是至少或约10％抑制(例如，至少或约20％抑制、至少或约30％抑制、至少或约40％抑制、至少或约50％抑制、至少或约60％抑制、至少或约70％抑制、至少或约80％抑制、至少或约90％抑制、至少或约95％抑制、至少或约98％抑制)。在各种实施方案中，本公开的方法所提供的减小是至少或约10％减小(例如，至少或约20％减小、至少或约30％减小、至少或约40％减小、至少或约50％减小、至少或约60％减小、至少或约70％减小、至少或约80％减小、至少或约90％减小、至少或约95％减小、至少或约98％减小)。[0364]本文另外提供了治疗患有癌症(例如表达cldn6的癌症)的受试者的方法。在各种实施方案中，所述方法包括向所述受试者施用有效治疗所述受试者的癌症的量的本公开的药物组合物。[0365]出于本文的目的，本文公开的方法的癌症可以是任何癌症，例如由异常和不受控制的细胞分裂引起的任何恶性生长或肿瘤，所述恶性生长或肿瘤可通过淋巴系统或血流扩散至身体的其他部位。在一些方面，癌症是选自由以下组成的组的癌症：急性淋巴细胞癌、急性骨髓性白血病、肺泡横纹肌肉瘤、骨癌、脑癌、乳腺癌、肛门癌、肛管癌或肛门直肠癌、眼癌、肝内胆管癌、关节癌、颈癌、胆囊癌或胸膜癌、鼻癌、鼻腔癌或中耳癌、口腔癌、外阴癌、慢性淋巴细胞性白血病、慢性骨髓性癌症、结肠癌、食道癌、宫颈癌、胃肠类癌、霍奇金淋巴瘤、下咽癌、肾癌、喉癌、肝癌、肺癌、恶性间皮瘤、黑素瘤、多发性骨髓瘤、鼻咽癌、非霍奇金淋巴瘤、卵巢癌、胰腺癌、腹膜癌、网膜癌和肠系膜癌、咽癌、前列腺癌、直肠癌、肾癌(例如，肾细胞癌(rcc))、小肠癌、软组织癌、胃癌、睾丸癌、甲状腺癌、输尿管癌和膀胱癌。在特定方面，癌症选自由以下组成的组：头颈癌、卵巢癌、宫颈癌、膀胱癌和食道癌、胰腺癌、胃肠癌、胃癌、乳腺癌、子宫内膜癌和结肠直肠癌、肝细胞癌、成胶质细胞瘤、膀胱癌、肺癌(例如，非小细胞肺癌(nsclc))、细支气管肺泡癌。在各个方面，癌症是卵巢癌、黑素瘤、膀胱癌、肺癌、肝癌、子宫内膜癌。在各个方面，癌症是以cldn6的中度至高度表达为特征的任何癌症。参见例如，图1-图3。在各个方面，癌症是急性骨髓性白血病、大b细胞淋巴瘤、胃癌、前列腺癌、黑素瘤、结肠癌、直肠癌、膀胱癌、宫颈癌、肝癌、乳腺癌、肾透明细胞癌、头颈癌、肉瘤、肾嫌色细胞癌、低级别胶质瘤、肾上腺皮质癌、成胶质细胞瘤、肾乳头状细胞癌、肺鳞状细胞癌、甲状腺癌、肺腺癌、胰腺癌、子宫内膜癌、子宫癌肉瘤或卵巢癌。在各个方面，癌症选自卵巢癌、子宫内膜样癌、子宫癌、肺癌、胃癌、乳腺癌、头颈部鳞状细胞癌(hnscc)、宫颈癌和膀胱癌。[0366]如本文所用，术语“治疗”以及与其有关的词语不一定意味着100％或完全治疗。而是，存在不同程度的治疗，本领域普通技术人员认为所述治疗具有潜在益处或治疗效果。在此方面，本公开的治疗癌症的方法可提供任何量或任何水平的治疗。此外，由本公开的方法提供的治疗可包括治疗一种或多种正在治疗的癌症的疾患或症状或体征。此外，由本公开的方法提供的治疗可包括减缓癌症的进展。例如，所述方法可通过增强t细胞活性或针对癌症的免疫应答、减少肿瘤或癌症生长、减少肿瘤细胞的转移、增加肿瘤或癌细胞的细胞死亡等来治疗癌症。在各个方面，所述方法通过将癌症的发作或复发延迟至少1天、2天、4天、6天、8天、10天、15天、30天、两个月、3个月、4个月、6个月、1年、2年、3年、4年或更长时间来治疗。在各个方面，所述方法通过增加受试者的存活来治疗。[0367]本公开的抗原结合蛋白还可用于检测样品中的cldn6或诊断cldn6阳性癌症。因此，本公开提供了检测样品中的密封蛋白6(cldn6)的方法。在各种实施方案中，所述方法包括使样品与如本文所述的抗原结合蛋白、缀合物或融合蛋白接触，以及测定包含与cldn6结合的抗原结合蛋白、缀合物或融合蛋白的免疫复合物。本公开还提供了诊断受试者中的密封蛋白6(cldn6)阳性癌症的方法。在各种实施方案中，所述方法包括使包含从受试者获得的细胞或组织的生物样品与如本文所述的抗原结合蛋白、缀合物或融合蛋白接触，以及测定包含与cldn6结合的抗原结合蛋白、缀合物或融合蛋白的免疫复合物。[0368]受试者[0369]在本公开的一些实施方案中，受试者是哺乳动物，包括但不限于啮齿目哺乳动物，如小鼠和仓鼠；和兔形目哺乳动物，如兔；食肉目哺乳动物，包括猫科动物(猫)和犬科动物(狗)；偶蹄目哺乳动物，包括牛科动物(牛)和猪科动物(猪)；或奇蹄目哺乳动物，包括马科动物(马)。在一些方面，哺乳动物是灵长目、直翅目(ceboid)或类猴目(猴)或类人猿目(人和猿)。在一些方面，哺乳动物是人。[0370]药盒[0371]在一些实施方案中，将本公开的抗原结合蛋白提供在药盒中。在各个方面，药盒包含作为单位剂量的抗原结合蛋白。出于本文的目的，“单位剂量”是指分散在合适载剂中的离散量。在各个方面，单位剂量是足以向受试者提供所需效果(例如抑制肿瘤生长、减小肿瘤大小、治疗癌症)的量。因此，本文提供了包含任选地以单位剂量提供的本公开的抗原结合蛋白的药盒。在各个方面，药盒包含若干单位剂量，例如一周或一个月供应的单位剂量，任选地，每个单位剂量单独包装或以其他方式与其他单位剂量分开。在一些实施方案中，药盒/单位剂量的组分与施用于患者的说明书一起包装。在一些实施方案中，药盒包含一个或多个用于向患者施用的装置，例如针头和注射器等。在一些方面，将本公开的抗原结合蛋白、其药学上可接受的盐、包含抗原结合蛋白的缀合物、或包含抗原结合蛋白的多聚体或二聚体预先包装在即用型形式(例如注射器、静脉内袋等)中。在一些方面，药盒还包含其他治疗剂或诊断剂或药学上可接受的载剂(例如溶剂、缓冲剂、稀释剂等)，包括本文所述的那些中的任一种。在特定方面，药盒包含本公开的抗原结合蛋白以及用于化学疗法或放射疗法的剂(例如治疗剂)。[0372]各种实施方案[0373]在本公开的各种实施方案中，双特异性抗原结合蛋白结合至人密封蛋白6(cldn6)蛋白(seqidno:200)和第二抗原，其中(a)所述抗原结合蛋白结合至cldn6的细胞外结构域(ecd)的细胞外环2(el2)，并且不结合至cldn6的ecd的细胞外环1(el1)；或(b)不结合至密封蛋白3(cldn3)、密封蛋白4(cldn4)和密封蛋白9(cldn9)中的任一者，并且以小于约1200nm抑制参考抗体与由ovca429细胞内源性表达的cldn6的结合；或(c)它们的组合。在各种情况下，双特异性抗原结合蛋白结合至氨基酸序列wtahaiirdfynplvaeaqkrel(seqidno:2)内的表位，或结合至cldn6的氨基酸序列tahaiirdfynpl(seqidno:3)或lvaeaqkrel(seqidno:4)。在各个方面，双特异性抗原结合蛋白不结合至密封蛋白3(cldn3)、密封蛋白4(cldn4)和密封蛋白9(cldn9)中的任何一者或多者。在各种情况下，双特异性抗原结合蛋白不结合至cldn3。在各种情况下，双特异性抗原结合蛋白结合至cldn6、cldn4和cldn9，但不结合至cldn3。在各种情况下，双特异性抗原结合蛋白结合至cldn6和cldn4，但不结合至cldn3或cldn9。在各个方面，双特异性抗原结合蛋白结合至cldn6和no:10)。[0379]提供了一种双特异性抗原结合蛋白，其中所述双特异性抗原结合蛋白包含：(a)hccdr1，所述hccdr1包含氨基酸序列ftfsxyx，其中位置5的x是n、s、r、q或a，并且位置7的x是w、h、y、f(seqidno:455)，任选地，包含氨基酸序列ftfsnyw(seqidno:23)；(b)hccdr2，所述hccdr2包含氨基酸序列irlkxdxyat，其中位置5的x是s、n、a或t，并且位置7的x是q、s、a、n(seqidno:456)，任选地，包含氨基酸序列irlksdnyat(seqidno:24)；(c)hccdr3，所述hccdr3包含氨基酸序列xdgppsgx，其中位置1的x是n、d或t，并且位置8的x是s、t、a、c或y(seqidno:457)，任选地，包含氨基酸序列ndgppsgc(seqidno:25)；(d)lccdr1，所述lccdr1包含氨基酸序列exiysy，其中x是q、s、a、d或n(seqidno:476)，任选地，包含氨基酸序列eniysy(seqidno:20)；(e)lccdr2，所述lccdr2包含氨基酸序列xak，其中位置1的x是q、s、a、d或n(seqidno:477)，任选地包含氨基酸序列nak(seqidno:21)；以及(f)lccdr3，所述lccdr3包含氨基酸序列qxhyxvpwt，其中位置2的x是h、q、s或t，并且位置5的x是t、s、n或g(seqidno:454)，任选地，包含氨基酸序列qhhytvpwt(seqidno:22)。[0380]提供了一种双特异性抗原结合蛋白，所述双特异性抗原结合蛋白包含(a)hccdr1，所述hccdr1包含氨基酸序列ytxtxyt，其中位置3的x是f、y、s或t，并且位置5的x是s、t、y或d(seqidno:461)，任选地，包含氨基酸序列ytftsyt(seqidno:29)；(b)hccdr2，所述hccdr2包含氨基酸序列ixpssxyt，其中位置2的x是q、s、a或n，并且位置6的x是t、s、v、d或g(seqidno:462)，任选地，包含氨基酸序列inpsstyt(seqidno:30)；(c)hccdr3，所述hccdr3包含氨基酸序列xrgexggfay，其中位置1的x是s、a、t或v，并且位置5的x是l、v或f(seqidno:463)，任选地，包含氨基酸序列srgelggfay(seqidno:31)；(d)lccdr1，所述lccdr1包含氨基酸序列qslvhsxgxty，其中位置7的x是d、n、e、q、s或a，并且位置9的x是q、s、a、d或n(seqidno:458)，任选地，包含氨基酸序列qslvhsdgnty(seqidno:26)；(e)lccdr2，所述lccdr2包含氨基酸序列xvx，其中位置1的x是k、q或r，并且位置3的x是s、t或v(seqidno:459)，任选地，包含氨基酸序列kvs(seqidno:27)；以及(f)lccdr3，所述lccdr3包含氨基酸序列sxxthvpyt，其中位置2的x是q、h或t，并且位置3的x是s、g、t或d(seqidno:460)，任选地，包含氨基酸序列sqsthvpyt(seqidno:28)。[0381]在各种实施方案中，双特异性抗原结合蛋白包含：[0382](a)seqidno:504或seqidno:507的重链cdr1氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；[0383](b)seqidno:505或seqidno:508的重链cdr2氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；[0384](c)seqidno:506或seqidno:509的重链cdr3氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；[0385](d)seqidno:449或seqidno:476的轻链cdr1氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；[0386](e)seqidno:450或seqidno:477的轻链cdr2氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；[0387](f)seqidno:451或seqidno:454的轻链cdr3氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；[0388](g)(a)-(f)中的任何两者或更多者的组合。[0389]任选地，变体序列具有至少约80％、至少或约85％、至少或约90％或至少或约95％序列同一性。[0390]在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白包含seqidno:449的轻链cdr1氨基酸序列、seqidno:450的轻链cdr2氨基酸序列和seqidno:451的轻链cdr3氨基酸序列，以及seqidno:504的重链cdr1氨基酸序列、seqidno:505的重链cdr2氨基酸序列和seqidno:506的重链cdr3氨基酸序列中的一个或两个。在各种情况下，抗原结合蛋白包含seqidno:476的轻链cdr1氨基酸序列、seqidno:477的轻链cdr2氨基酸序列和seqidno:454的轻链cdr3氨基酸序列，以及seqidno:507的重链cdr1氨基酸序列、seqidno:508的重链cdr2氨基酸序列和seqidno:509的重链cdr3氨基酸序列中的一个或两个。任选地，抗原结合蛋白包含选自由以下组成的组的六个cdr氨基酸序列：seqidno:449-451和504-506；以及seqidno:476、477、454和507-509。[0391]在示例性方面，双特异性抗原结合蛋白包含：(a)seqidno:490-503中的任一个的重链可变区氨基酸序列，或在图22中标记为s1-s12的重链可变区氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；(b)seqidno:380-383、388-390、479和481中的任一个的轻链可变区氨基酸序列，或在图22中标记为s1-s12的轻链可变区氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；或(c)(a)和(b)两者。在一些方面，变体序列具有至少约80％或至少约85％序列同一性，或者变体序列具有至少约90％或至少约95％序列同一性。[0392]在示例性情况下，双特异性抗原结合蛋白包含一对氨基酸序列：[0393]seqidno:389和490；[0394]seqidno:389和491；[0395]seqidno:389和492；[0396]seqidno:389和493；[0397]seqidno:389和494；[0398]seqidno:389和495；[0399]seqidno:383和496；[0400]seqidno:383和497；[0401]seqidno:383和498；[0402]seqidno:383和499；[0403]seqidno:383和500；[0404]seqidno:383和501；[0405]seqidno:383和503；[0406]seqidno:389和502；[0407]在图22中标记为s1的重链可变区序列和在图22中标记为s1的轻链可变区序列；[0408]在图22中标记为s2的重链可变区序列和在图22中标记为s2的轻链可变区序列；[0409]在图22中标记为s3的重链可变区序列和在图22中标记为s3的轻链可变区序列；[0410]在图22中标记为s4的重链可变区序列和在图22中标记为s4的轻链可变区序列；[0411]在图22中标记为s5的重链可变区序列和在图22中标记为s5的轻链可变区序列；[0412]在图22中标记为s6的重链可变区序列和在图22中标记为s6的轻链可变区序列；[0413]在图22中标记为s7的重链可变区序列和在图22中标记为s7的轻链可变区序列；[0414]在图22中标记为s78的重链可变区序列和在图22中标记为s8的轻链可变区序列；[0415]在图22中标记为s89的重链可变区序列和在图22中标记为s9的轻链可变区序列；[0416]在图22中标记为s910的重链可变区序列和在图22中标记为s10的轻链可变区序列；[0417]在图22中标记为s11的重链可变区序列和在图22中标记为s11的轻链可变区序列；或[0418]在图22中标记为s12的重链可变区序列和在图22中标记为s12的轻链可变区序列。[0419]在一些方面，双特异性抗原结合蛋白是抗体，例如单克隆抗体。在各个方面，抗体是igg。任选地，抗原结合蛋白在软琼脂3d增殖测定中抑制至少约50％的集落生长，抑制注射有人癌细胞的异种移植小鼠中的肿瘤生长，抑制注射有卵巢癌细胞、黑素瘤癌细胞、膀胱癌细胞或子宫内膜癌细胞的异种移植小鼠中的肿瘤生长，或抑制注射有卵巢癌细胞、膀胱癌细胞或子宫内膜癌细胞的异种移植小鼠中的至少50％的肿瘤生长。[0420]因此，在各种实施方案中，本公开提供了一种双特异性抗原结合蛋白，所述双特异性抗原结合蛋白包含[0421](a)seqidno:504或seqidno:507的重链cdr1氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；[0422](b)seqidno:505或seqidno:508的重链cdr2氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；[0423](c)seqidno:506或seqidno:509的重链cdr3氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；[0424](d)seqidno:449或seqidno:476的轻链cdr1氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；[0425](e)seqidno:450或seqidno:477的轻链cdr2氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；[0426](f)seqidno:451或seqidno:454的轻链cdr3氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；或[0427](g)(a)-(f)中的任何两者或更多者的组合。[0428]还提供了一种双特异性抗原结合蛋白，所述双特异性抗原结合蛋白包含选自由以下组成的组的六个cdr氨基酸序列：seqidno:449-451和504-506；以及seqidno:476、477、454和507-509。[0429]本公开提供了一种双特异性抗原结合蛋白，所述双特异性抗原结合蛋白包含：[0430](a)seqidno:490-503中的任一个的重链可变区氨基酸序列，或在图22中标记为s1-s12的重链可变区氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；或[0431](b)seqidno:380-383、388-390、479和481中的任一个的轻链可变区氨基酸序列，或在图22中标记为s1-s12的轻链可变区氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；或[0432](c)(a)和(b)两者。[0433]在各个方面，变体序列具有至少约85％序列同一性或约90％或约95％序列同一性。[0434]本公开还提供了一种双特异性抗原结合蛋白，所述双特异性抗原结合蛋白包含选自由以下组成的组的一对氨基酸序列：[0435]seqidno:389和490；[0436]seqidno:389和491；[0437]seqidno:389和492；[0438]seqidno:389和493；[0439]seqidno:389和494；[0440]seqidno:389和495；[0441]seqidno:383和496；[0442]seqidno:383和497；[0443]seqidno:383和498；[0444]seqidno:383和499；[0445]seqidno:383和500；[0446]seqidno:383和501；[0447]seqidno:383和503；[0448]seqidno:389和502；[0449]在图22中标记为s1的重链可变区序列和在图22中标记为s1的轻链可变区序列；[0450]在图22中标记为s2的重链可变区序列和在图22中标记为s2的轻链可变区序列；[0451]在图22中标记为s3的重链可变区序列和在图22中标记为s3的轻链可变区序列；[0452]在图22中标记为s4的重链可变区序列和在图22中标记为s4的轻链可变区序列；[0453]在图22中标记为s5的重链可变区序列和在图22中标记为s5的轻链可变区序列；[0454]在图22中标记为s6的重链可变区序列和在图22中标记为s6的轻链可变区序列；[0455]在图22中标记为s7的重链可变区序列和在图22中标记为s7的轻链可变区序列；[0456]在图22中标记为s78的重链可变区序列和在图22中标记为s8的轻链可变区序列；[0457]在图22中标记为s89的重链可变区序列和在图22中标记为s9的轻链可变区序列；[0458]在图22中标记为s910的重链可变区序列和在图22中标记为s10的轻链可变区序列；[0459]在图22中标记为s11的重链可变区序列和在图22中标记为s11的轻链可变区序列；或[0460]在图22中标记为s12的重链可变区序列和在图22中标记为s12的轻链可变区序列。[0461]本文提供了一种双特异性抗原结合蛋白，所述双特异性抗原结合蛋白包含：[0462](a)如seqidno:510或513或图23或25中所列的重链可变区氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；或[0463](b)如seqidno:511或512或图24或26中所列的轻链可变区氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；或[0464](c)(a)和(b)两者。[0465]本公开还提供了一种抗原结合蛋白，所述抗原结合蛋白包含一对氨基酸序列，其中所述对包含[0466](a)如seqidno:510所列的重链可变区氨基酸序列和如seqidno:511所列的轻链可变区氨基酸序列，或其仅相差1-5个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；任选地，其中所述不同的1-5个氨基酸对于重链如图23中所示或对于轻链如图24中所示，或[0467](b)如seqidno:513所列的重链可变区氨基酸序列和如seqidno:512所列的轻链可变区氨基酸序列，或其仅相差1-5个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；或任选地，其中所述不同的1-5个氨基酸对于重链如图25中所示或对于轻链如图26中所示。[0468]在各个方面，当前公开的抗原结合蛋白包含fc多肽，所述fc多肽包含无岩藻糖基化聚糖。[0469]在各个方面，本公开的双特异性抗原结合蛋白基于抗体，例如单克隆抗体，例如igg。在各个方面，双特异性抗原结合蛋白在软琼脂3d增殖测定中抑制至少约50％的集落生长，或抑制注射有人癌细胞的异种移植小鼠中的肿瘤生长。在各个方面，双特异性抗原结合蛋白抑制注射有卵巢癌细胞、黑素瘤癌细胞、膀胱癌细胞或子宫内膜癌细胞的异种移植小鼠中的肿瘤生长。在各种情况下，双特异性抗原结合蛋白抑制注射有卵巢癌细胞、膀胱癌细胞或子宫内膜癌细胞的异种移植小鼠中的至少50％的肿瘤生长。[0470]本公开提供了包含本文所述的双特异性抗原结合蛋白和异源部分的缀合物。在示例性方面，所述缀合物包含细胞毒性剂或化学治疗剂，例如本文所述的那些中的任一种。在各个方面，化学治疗剂是通过阻断微管蛋白聚合而抑制细胞分裂的抗有丝分裂剂。在一些情况下，抗有丝分裂剂是奥瑞他汀，任选地，mmae。[0471]本公开还提供了包含本文所述的双特异性抗原结合蛋白的融合蛋白。本公开进一步提供了核酸，所述核酸包含编码本公开的抗原结合蛋白、缀合物或融合蛋白的核苷酸序列。本公开提供了包含核酸的载体，所述核酸包含编码本公开的抗原结合蛋白、缀合物或融合蛋白的核苷酸序列。本公开另外提供了包含本公开的核酸或载体的宿主细胞。[0472]本公开提供了一种产生结合至密封蛋白6(cldn6)蛋白的双特异性抗原结合蛋白的方法，所述方法包括(i)在细胞培养基中培养本公开的宿主细胞，其中所述宿主细胞包含核酸，所述核酸包含编码前述权利要求中任一项所述的抗原结合蛋白的核苷酸序列，和(ii)从所述细胞培养基中收获所述抗原结合蛋白。此外，提供了一种产生融合蛋白的方法，所述融合蛋白包含结合至密封蛋白6(cldn6)蛋白的双特异性抗原结合蛋白，所述方法包括(i)在细胞培养基中培养本公开的宿主细胞，其中所述宿主细胞包含核酸，所述核酸包含编码本公开的融合蛋白的核苷酸序列，和(ii)从所述细胞培养基中收获所述融合蛋白。[0473]本公开还提供了一种产生药物组合物的方法，所述方法包括将本公开的双特异性抗原结合蛋白、缀合物、融合蛋白、核酸、载体、宿主细胞或其组合组合与药学上可接受的载剂、稀释剂或赋形剂组合。还提供了药物组合物，所述药物组合物包含本公开的双特异性抗原结合蛋白、缀合物、融合蛋白、核酸、载体、宿主细胞或其组合，以及药学上可接受的载剂、稀释剂或赋形剂。[0474]本文提供了一种治疗患有表达cldn6的癌症的受试者的方法，所述方法包括向所述受试者施用有效治疗所述癌症的量的本文所述的药物组合物。还提供了一种抑制受试者中的肿瘤生长的方法，所述方法包括向所述受试者施用有效抑制肿瘤生长的量的本文所述的药物组合物。本公开提供了一种减小受试者中的肿瘤大小的方法，所述方法包括向所述受试者施用有效减小肿瘤大小的量的本文所述的药物组合物。进一步提供了一种预防受试者的癌症复发的方法，所述方法包括向所述受试者施用有效预防癌症复发的量的本文所述的药物组合物。[0475]本公开提供了一种检测样品中的密封蛋白6(cldn6)的方法，所述方法包括使所述样品与本公开的抗原结合蛋白、缀合物或融合蛋白接触，以及测定包含与cldn6结合的抗原结合蛋白、缀合物或融合蛋白的免疫复合物。本文还提供了一种诊断受试者的密封蛋白6(cldn6)阳性癌症的方法，所述方法包括使包含从所述受试者获得的细胞或组织的生物样品与本公开的抗原结合蛋白、缀合物或融合蛋白接触，以及测定包含与cldn6结合的抗原结合蛋白、缀合物或融合蛋白的免疫复合物。[0476]本公开还提供了一种治疗被诊断为cldn6的低过表达者的受试者的癌症的方法。在各种实施方案中，所述方法包括向所述受试者施用有效预防癌症复发的量的当前公开的药物组合物。在一些方面，施用诱导肿瘤细胞的细胞凋亡，任选地，施用诱导表达cldn6的细胞的细胞凋亡。在各个方面，受试者患有肿瘤并且所述肿瘤被半定量地分类为四个组中的一个：高表达者、中度表达者、低表达者和非表达者。在各种情况下，高表达者被定义为cldn6rna大于12log片段/千碱基百万(fpkm)，其中所述cldn6rna通过rnaseq测量，或者如通过免疫组织化学(ihc)所测量cldn6蛋白水平大于3 。在各种情况下，中度表达者被定义为cldn6rna大于10logfpkm，其中所述cldn6rna通过rnaseq测量，或者如通过ihc所测量cldn6蛋白水平大于2 。在各种情况下，低表达者被定义为cldn6rna大于6logfpkm，其中所述cldn6rna通过rnaseq测量，或者如通过ihc所测量cldn6蛋白水平大于1 。在各种情况下，非表达者被定义为cldn6rna小于6logfpkm，其中所述cldn6rna通过rnaseq测量，或者cldn6蛋白水平低于ihc检测限。在各个方面，患有所述肿瘤的受试者类似地被描述为cldn6的高表达者、中度表达者、低表达者或非表达者。[0477]给出以下实施例仅用于说明本公开，并且不以任何方式限制其范围。[0478]实施例[0479]实施例1[0480]此实施例展示对不同细胞和组织来源中的cldn6rna水平的分析。[0481]为了建立不同来源材料中cldn6表达的基线，测定了由转化肿瘤学研究实验室(torl)创建的患者样品、正常组织和细胞系中的cldn6表达的表达水平。[0482]使用国家癌症研究所(nci)管理的癌症基因组图谱(tcga)数据库中包含的信息测量患者样品中的cldn6rna的水平。使用共同基金维护的基因型-组织表达(gtex)数据库中的信息测量正常组织中的cldn6水平。对来自gtex数据库的组织的分析表明，cldn6可在不同部位检测到，包括脑、垂体、胰腺、肾、肺、甲状腺和子宫颈以及其他组织(图1)。[0483]使用agilent44k微阵列(4x44k阵列芯片，agilenttechnologies,santaclara,ca)和rna测序(rna-seq)测定来测量torl癌细胞系中的cldn6表达水平。rnaseq由bgiamericas(cambridge,ma)使用他们的“rnaseqforquantification”服务进行。如图2和图3所示，卵巢癌、头颈癌、肺癌和膀胱癌细胞表达最高水平的cldn6，但是在乳腺癌、肾癌、结肠癌、肉瘤和肝癌细胞中可检测到cldn6表达水平。[0484]实施例2[0485]此实施例展示经工程改造以过表达cldn6的细胞的产生。[0486]生成了经工程改造以过表达cldn6的模型。这些模型用于确定实施例5中描述的cldn6抗体的功效。简言之，将编码cldn6的核苷酸序列工程改造到具有cmv启动子和脑心肌炎病毒(emcv)的减毒内部核糖体进入位点(ires)的双顺反子载体中。ires位于目标基因(goi)cdna(cldn6)与嘌呤霉素cdna之间。土拨鼠转录后调控元件(wpre)位于嘌呤霉素cdna的下游。所述载体还表达了gfp标记物序列或mycddk标签。含有gfp的表达载体的序列在本文中提供为seqidno:189。[0487]将表达载体病毒转导到hek293t细胞(用于筛选目的)和nih3t3细胞(用于免疫)中。基于在含有嘌呤霉素(1μg/ml)的培养基中的存活选择阳性转导细胞。将阳性细胞亚克隆以获得稳定、均一的cldn6过表达细胞的克隆群体。[0488]使用参考cldn6单克隆抗体(mab)在bdbiosciencesaccuritm流式细胞仪(sanjose,ca)上通过流式细胞术确认亚克隆cldn6表达。二抗和缀合物：alexa647山羊抗小鼠igg(最小x反应性)抗体(biolegend,sandiego,ca；目录号405322)用于检测参考cldn6mab与由亚克隆表达的cldn6之间的结合活性。[0489]cldn6的细胞定位通过荧光显微术使用成像系统(synentec(mountainview,ca)和表达cldn6-绿色荧光蛋白(gfp)融合蛋白的细胞进行测定。如图4所示，在细胞膜中检测到gfp的荧光，从而证明cldn6定位于细胞膜。[0490]实施例3[0491]此实施例展示参考抗体和对照抗体的产生。[0492]基准(参考)cldn6特异性抗体和对照抗体是通过将抗体重链和轻链可变区克隆到expichotm表达系统(thermofisherscientific,waltham,ma)中以产生重组小鼠igg2a嵌合抗体而制备。将这些抗体与实施例5中描述的新产生的cldn6特异性抗体一起进行测试。[0493]简言之，根据制造商的方案，使用expichotm表达系统(目录号：a29133，thermofisherscientific,usa)转染含有对照和基准抗体序列的质粒。将细胞在第1天在37℃和8％co2下培养，然后在转染后在试剂盒中提供的培养基中在32℃和5％co2下培养。通过以1,000g离心10分钟，然后以5,000g离心30分钟澄清expichotm培养基来纯化抗体。然后使用0.45μm过滤器、随后0.22μm过滤器过滤上清液。随后，根据制造商的方案，使用蛋白a/g树脂(lifetechnologies,carlsbad,ca；目录号20424)对上清液进行亲和纯化。在elisa纯化之前，粗略确定培养基中的抗体滴度，以确保负载的培养基的量占据树脂结合能力的小于80％。孵育后，将树脂用pbs洗涤并用洗脱缓冲液(lifetechnologies，目录号21004)洗脱。通过添加tris缓冲液(ph8.0)将洗脱级分立即调节至生理ph。随后使用amiconultra-15离心过滤单元(lifetechnologies，目录号ufc900324)在pbs缓冲液中对纯化的抗体进行缓冲液交换和蛋白质浓缩。抗体浓度通过bca蛋白测定确定。进行sds-page和考马斯染色以测试抗体纯度。将纯化的蛋白质等分并在-80℃下长期储存或在4℃下保存以供立即使用。[0494]抗体的完整性通过sds-page，然后在非还原对比还原条件下进行考马斯染色来验证；在非还原条件下，150kda左右有一条主要带，而在还原条件下，观察到两条带，50kda和25kda。[0495]对具有序列相似性的其他cldn家族成员(图5)，即cldn3、cldn4和cldn9具有特异性的抗体以基本相同的方式产生，例外是质粒中包含的抗体序列是对cldn3、cldn4或cldn9具有特异性的抗体序列。[0496]实施例4[0497]此实施例展示具有高内源性cldn6表达的细胞系的表征。[0498]通过facs和蛋白质印迹分析一组癌细胞系的cldn6内源性表达。简言之，使用过表达cldn6的细胞(例如，过表达cldn6的hek293t细胞，如实施例2中所述)和以高或低水平内源性表达cldn6的细胞系(如实施例1中所确定的)通过facs验证抗体与靶标的结合。将表达cldn6的细胞与参考或对照抗体(如实施例3中所描述)一起在冰上孵育30分钟，并且在洗涤后，与alexa647缀合的山羊抗小鼠igg(最小x反应性)抗体biolegend目录号405322一起在冰上孵育30分钟。荧光由bdbiosciencesaccuritm流式细胞仪(sanjose,ca)读取。[0499]使用参考和对照抗体对硝酸纤维素进行蛋白质印迹。简言之，将来自细胞裂解物的样品煮沸以使蛋白质内容物变性。sds-page(sds-聚丙烯酰胺凝胶电泳)用于根据多肽的长度分离变性的蛋白质。然后将分离的蛋白质从丙烯酰胺凝胶转移至硝酸纤维素膜上。使用2％牛血清白蛋白(bsa)溶液来封闭膜，从而使非特异性抗体结合最小化。将膜与参考或对照抗体一起孵育。将膜用辣根过氧化物酶(hrp)缀合的二抗染色，所述二抗识别参考或对照抗体，并且二抗的检测是通过化学发光进行的。[0500]过表达的细胞系用于验证对照和参考抗体，并且一旦验证，就将对照和参考抗体用于表征内源性细胞系。在这些测定中，过表达cldn6的细胞被包括作为阳性对照。[0501]facs测定显示，除了子宫内膜癌细胞系、膀胱癌细胞系、肺癌细胞系和上消化道癌细胞系外，四种卵巢癌细胞系也在表面以高水平表达cldn6。蛋白质印迹也检测到高水平的cldn6表达。另外两种卵巢癌细胞系、另一种肝癌细胞系、另外的肺癌细胞系和另外的上消化道癌细胞系显示在表面上表达中等水平的cldn6，如通过蛋白质印迹所检测。子宫内膜肿瘤细胞和膀胱肿瘤细胞也在体内表达高水平的cldn6作为异种移植物。表2总结了测试癌细胞系的cldn6的内源性表达水平。[0502]表2[0503][0504][0505]实施例5[0506]此实施例展示为产生cldn6特异性抗体而对小鼠进行免疫。[0507]cldn6特异性抗体通过遵循fredhutchinson癌症研究中心的技术，用三种不同肽免疫原的混合物对balb/c和cd1小鼠进行免疫而产生。所述三种肽跨越cldn6细胞外结构域中的第二个环(即el2)。这些肽包括全长的el2、跨越el2的第一(n端)一半的肽和跨越el2的第二(c端)一半的肽。表3提供了三种肽的序列。[0508]表3[0509][0510][0511]还使用包含人cldn6-myc-ddk表达载体的质粒，用过表达全长cldn6的3t3细胞对小鼠进行了免疫。[0512]从经免疫的小鼠收获脾细胞，并通过btx电融合(btx,holliston,ma)与骨髓瘤系融合以产生杂交瘤。在384孔板中产生并培养了7680个原代杂交瘤培养物。使用表达三种不同肽靶标的珠粒，通过珠粒阵列评估抗体结合肽的能力。1920种潜在阳性抗体被重新排列到96孔板中，通过流式细胞术针对内源性和人工细胞系模型进一步筛选。[0513]然后通过流式细胞术针对与目标区域具有序列相似性的蛋白质(例如，其他cldn蛋白质)的内源性和人工模型对阳性杂交瘤上清液进行反筛选。从二次筛选和反筛选中，选择了约20种cldn6特异性抗体进行额外研究。对这些抗体进行亚克隆并确定可变重链和轻链序列。参见表b和序列表。[0514]cldn6抗体被格式化为使用expichotm表达的全长igg抗体。将抗体的重链和轻链可变区克隆到抗体表达载体中，将所述载体在实验室中基于pcdnatm载体(目录号：a14697，thermofisherscientific,usa)进行工程改造并转染到cho细胞中(根据试剂盒中提供的方案(expichotm表达系统，目录号：a29133，thermofisherscientific,usa))。将抗体纯化，并通过facs测定抗体与cldn6的细胞表面结合和抗体ic50，其中按照制造商的方案将cldn6抗体直接与alexa647nhs酯(琥珀酰亚胺酯)，目录号a20106(thermofisherscientific)缀合。将cldn6抗体在50μl体积中使用150,000个细胞系统从0.32nm至1000nm(连续稀释1:5，6个点)进行测试。[0515]cldn6表达细胞用于facs测定以确定cldn6抗体结合至细胞表面上的cldn6以及与其他cldn家族成员交叉反应的能力。将经工程改造以表达与gfp融合的人cldn6、与gfp融合的小鼠cldn6、cldn9-gfp、cldn4-gfp或cldn3-gfp或单独gfp(无cldn6)的hek293t细胞用作cldn6表达的人工模型。ark2、ovca429、ls513和mcf7细胞用作cldn6表达的内源模型，以及cldn3/4表达的模型。[0516]对于测试的每种类型的细胞和每种mab，通过edta(而不是胰蛋白酶)将细胞从培养瓶表面脱离以保护细胞表面蛋白质。然后将脱离的细胞与alexa标记的cldn6mab一起在冰上在黑暗中以预定浓度孵育30分钟。将cldn6mab直接用alexa647nhs酯(琥珀酰亚胺酯)标记。洗涤后，通过bdaccuritm流式细胞仪c6读取细胞以检测通道fl4h中的抗体-抗原蛋白结合。以不同浓度测试每种抗体以建立剂量-荧光曲线。使用在线提供的非常简单的ic50工具包，抗体的ec50/ic50(基于fl4h的值(在活的单细胞群中设门)计算最大值的一半时的抗体浓度)，所述工具包允许绘制生物剂量反应数据并拟合至曲线类型以给出ec50/ic50。最大值是荧光最大时的最低抗体浓度。还筛选了抗体与其他cldn蛋白(例如cldn9、cldn3和cldn4)交叉反应的能力。这些值用于确定所测试的抗体组中每种抗体的相对亲和力。使用类似方法，但使用具有cldn6、cldn3、cldn4和cldn9的不同表达谱的细胞获得交叉反应性数据。[0517]将以这种方式确定的相对亲和力数据和交叉反应性数据列于表4和5中。[0518]表4[0519][0520]ab#对应于表a和b中所列的ab#。[0521]表5[0522][0523][0524]ab#对应于表a和b中所列的ab#。[0525]实施例6[0526]此实施例展示嵌合小鼠iggmab的表征。[0527]进行软琼脂3d增殖测定和异种移植物结合测定以进一步表征实施例5中描述的mab。简言之，对于48孔板的每个孔，将1xrpmi培养基中的0.6％seaplaque琼脂糖中含有10,000个细胞的250μl顶层混合物涂铺在1xrpmi培养基中的0.6％seaplaque琼脂糖的固化的250ul底部层的顶部上。将含有1xrpmi培养基的250ul液体进料层置于固化的顶层上方。软琼脂测定的所有三个层均使用或不使用曲妥珠单抗、cldn6mab或小鼠igg2a对照制备，以150ng/ml(1um)开始且以1.5ng/ml结束，1:10稀释。每个测试条件一式两份进行。在用0.05％中性红染色之前，使细胞形成集落3周，并在evosxl倒置光学显微镜上成像。与对照相比，经处理中的集落数量减少≥20％的细胞系被认为是敏感的。[0528]如表6所示，当用所指示的抗体处理时，许多细胞系表现出集落数量的减少。[0529]表6[0530][0531][0532]在注射有人癌细胞系的异种移植小鼠中进行了体内结合研究。简言之，在六周龄的cd-1无胸腺裸鼠(charlesriverlaboratories)中建立了人癌细胞系的异种移植物模型。每个细胞系的皮下注射遵循以下条件：ark20.75×107、umuc41.0×107、ov901.0×107和m2020.5×107个细胞，全部含有50％基质胶(bdbiosciences)。注射足够数量的小鼠以达到每个治疗组8只小鼠。当肿瘤达到150至300mm3的平均大小时，将小鼠随机分到治疗组中。对于治疗，将每种治疗性抗体(ab3、ab2、参考ab1、参考ab2、参考ab3(曲妥珠单抗)和非靶向igg2对照在无菌盐水中稀释至1mg/ml的工作浓度，用于静脉内尾静脉(iv)注射。对于m202研究，曲美替尼(dmso溶剂合物，medchemexpress)在第一个每周周期的5天服用，2天停用计划中以1.0mg/kg(10％cremaphor，10％peg400)通过po给药，然后对于剩余的两周给药减至0.5mg/kg。将肿瘤异种移植物每周用卡尺测量三次，并且肿瘤体积(mm3)由高度×宽度×长度相乘确定。对小鼠治疗2-7周。在研究结束时，对动物实施安乐死，并切除肿瘤组织并分开保存为速冻或福尔马林固定石蜡包埋(ffpe)组织以用于生物标志物分析。所有动物工作均根据iacuc和加州大学洛杉矶分校动物研究委员会批准的方案进行。使用来自studydirector(sanfrancisco,ca)的studylog软件分析数据。结果呈现为每组的平均值体积。误差条表示平均值的标准误差(se)。[0533]异种移植物测定的结果显示于图6-图10中。如图6a和图6b所示，在第14天，相对于对照igg2抗体，在携带子宫内膜肿瘤的小鼠中，ab2和ab3中的每一者都引起了肿瘤体积的显著平均变化。如图7a和图7b所示，相对于对照igg2抗体，在携带膀胱肿瘤的小鼠中，ab3在第35天引起肿瘤体积的显著平均变化。图8a和图8b示出相对于对照igg2抗体，在携带卵巢肿瘤的小鼠中，ab2和ab3中的每一者在第20天引起了肿瘤体积的显著平均变化。图9a和图9b展示ab3以cldn特异性方式起作用，因为图9a和图9b中使用的模型不表达cldn6、cldn3、cldn4和cldn9中的任一者，并且因此用作阴性对照。图9a和图9b的数据还表明ab3的脱靶活性低于参考ab1和参考ab2。图10a总结图6-图9的结果。如图10a所示，ab3显著降低了携带子宫内膜肿瘤、膀胱肿瘤和卵巢肿瘤的小鼠中的肿瘤生长，所述肿瘤中的每一种都表达cldn6，但不减少携带不表达cldn6的黑素瘤小鼠的肿瘤生长(图10b)。如图11所示，治疗期间小鼠体重的平均链没有实质性变化，从而表明治疗的安全性。[0534]第二组实验在人卵巢癌细胞系ov90的异种移植模型中进行。向小鼠注射实施例5中描述的10种mab中的一种或对照抗体(小鼠igg2a抗体，参考cldn6ab)或pbs媒介物对照。每组8只小鼠，并且每4天向每只动物静脉内注射10mg/kg抗体。如图12a和图12b所示，实施例5中描述的几种抗体减小了携带卵巢肿瘤的小鼠的肿瘤体积。表现最好的是ab3、ab4、ab7和ab10，尽管相对于媒介物对照，所有测试的抗体都减小了肿瘤体积。如图13所示，用ab3、ab4、ab7或ab10治疗的动物的体重没有显著变化，从而表明它们的安全性。[0535]实施例7[0536]此实施例展示嵌合小鼠iggmab的进一步表征。[0537]进行了内化定量测定。简言之，由参考ab1、ab3或ab4结合触发的cldn6蛋白内化的研究是用阳性对照普遍表达的转铁蛋白受体(tfr)进行的，所述受体是在抗体结合后内化的已知细胞表面受体。[0538]将tfr和cldn6抗体用texasredtm-x、琥珀酰亚胺酯、混合异构体、目录号t6134(thermofisherscientific)标记。在抗体治疗前一天，将细胞接种在μ-载玻片8孔室(目录号80826，ibidicellsinfocusinc.)中，以允许细胞附着和生长。将细胞与标记的抗体一起在黑暗中在冰上孵育30分钟。然后通过echo实验室荧光显微镜读取含有cldn6或tfr标记细胞的腔室，以采集内化之前的图像。然后将腔室在37℃下孵育40分钟以进行内化过程，并通过echo实验室荧光显微镜再次采集图像。与参考ab1所引起的cldn6内化相比，ab3和ab4引起了更大程度的cldn6内化(数据未示出)。[0539]实施例8[0540]此实施例展示嵌合小鼠iggmab的进一步表征。[0541]二维(2d)增殖测定用实施例5中描述的选择抗体如下进行：将细胞以每孔5,000至20,000个细胞一式两份接种在24孔板中。第二天，将细胞用六种1-5稀释的mab(以100nm的曲妥珠单抗、cldn6mab或小鼠igg2a对照开始)和固定浓度的1ng/μl单甲基奥瑞他汀e(mmae)缀合的抗小鼠二抗(moradec,llc)进行处理以生成剂量反应曲线。在第1天、抗体处理当天和稍后在第6天对未处理的细胞孔进行定量以确定细胞生长的范围。在第6天对用mab处理的孔进行定量，并将每种处理条件下的生长确定为相对于未处理的细胞的生长的归一化百分比。在z1粒子计数器(beckmancoulter,inc)上进行定量。[0542]结果在图14中示出。ab2、ab3、ab4和ab5在抑制增殖方面展示最大的功效。这些抗体中的每一种的ic50介于0.1nm与1nm之间。ab7、ab10、ab11和ab15中的每一个也展示在此测定中抑制增殖的能力，但程度低于ab2、ab3、ab4和ab5。[0543]实施例9[0544]此实施例展示本公开的抗体的人源化。[0545]选择表a中列出的抗体的子集进行人源化分析。将ab1、ab3、ab4、ab9、ab11和ab18抗体的重链可变(vh)和轻链可变(vl)序列与来自人vh基因和人vlκ基因的已知人种系序列的文库(theinternationalimmunogeneticsinformationwww.imgt.org；创始人和董事:marie-paulelefranc,montpellier,france)进行比较；所使用的数据库是imgt人vh基因(f orf，273个种系序列)和imgt人vlκ基因(f orf，74个种系序列)。受体人种系选自序列与亲本抗体最接近的那些。[0546]对于每种抗体的每个vh和vl，表7提供了关于选择作为受体序列的人种系序列和选择的人重链连接区(j基因)的信息。连接区(j基因)选自theinternationalimmunogeneticsinformationwww.imgt.org(创始人和董事:marie-paulelefranc,montpellier,france)编译的人连接区序列。[0547]表7[0548][0549]cdr根据abm定义而定义(关于比较cdr定义的表，参见dr.andrewc.r.martin的网站www.bioinf.org.uk/abs/)。[0550]可能需要将人种系框架(即vh和vl中的非cdr残基)位置改变为相应的亲本鼠类序列以优化人源化抗体的结合。人源化抗体的型式的序列提供为seqidno:376-421。[0551]对于ab1，基于序列和构象，hc的cdr2的asn52(顺序编号)和lc中cdr2的asn54中的每一个被确定为具有低脱酰胺潜力。[0552]对于ab3，基于序列和构象，hc的cdr1的asn31(顺序编号)、hc的cdr2的asn57、lc的cdr1的asn28和lc的cdr2的asn50中的每一个被确定为具有低脱酰胺潜力。hc的cdr1的trp33被确定为可能暴露于溶剂并具有氧化潜力，尤其是在应力条件下。在hc的cdr3中，确定在cdr内存在游离cys106，其在制造抗体时可能出现问题，因为它可能暴露于溶剂。建议将此cys残基改变为tyr、ser或ala。对这些改变的抗体的结合的维持进行测试。lc的cdr2的ile53被确定为暴露于溶剂并可能导致非特异性结合。建议将此ile残基改变为ser。对这种改变的抗体的结合的维持进行测试。[0553]对于ab4，基于序列和构象，hc的cdr2的asn52(顺序编号)和lc的cdr2的asn58中的每一个被确定为具有低脱酰胺潜力。lc的cdr1中的序列dgnt被确定为有问题，因为它被确定为具有高异天冬氨酸形成潜力(在序列dg处)以及脱酰胺潜力(在序列nt处)。此序列被建议改变。[0554]对于ab9，基于序列和构象，hc的cdr1中的asn33(顺序编号)以及hc的cdr2中的asn52和asn59被确定为具有低脱酰胺潜力。基于序列和构象，asn54被确定为具有中等脱酰胺潜力。hc的cdr2中的ngg序列被确定为具有高/中等脱酰胺潜力，随后是异天冬氨酸形成。因此，建议改变此氨基酸序列。在制造抗体时，hc的cdr3中的游离cys106可能是有问题的，因为它被确定为可能暴露于溶剂。建议将此cys残基改变为tyr、ser或ala。对这些改变的抗体的结合的维持进行测试。hc的cdr1中的arg28在人抗体中并不常见。此残基被改变为thr，并测试了结合的维持。对于ab9，lc的cdr1中的trp32(顺序编号)被确定为可能暴露于溶剂并且可能发生氧化，尤其是在应力条件下。相同cdr的leu24在人抗体中并不常见。此残基被改变为arg并测试结合的维持。[0555]对于ab11，hc的cdr2中的asp54-ser55(顺序编号)被确定为具有低异天冬氨酸形成潜力。基于序列和构象，lc的cdr2中的asn57被确定为具有低脱酰胺潜力。[0556]对于ab18，基于序列和构象，hc的cdr1中的asn33和cdr-h2asn50(顺序编号)被确定为具有低脱酰胺潜力。在hc的cdr2中，asp-pro(dp)序列被确定为具有在酸性条件下发生片段化的潜力。在vl结构域中，基于序列和构象，lc的cdr1中的asn34和asn37被确定为具有低脱酰胺潜力。在lc的cdr3中，trp56被确定为可能暴露于溶剂并且可能发生氧化，尤其是在应力条件下。[0557]表8显示组合人源化vh和vl的方案。如果没有人源化型式与嵌合mab等效。优选对以粗体下划线文本显示。[0558]表8[0559][0560][0561]表8中描述的人源化抗体的构建和表达基本上如实施例5中所述。facs测定基本上如实施例5中所述进行以确定人源化抗体的相对抗原结合强度。测试了两种剂量(1.5μg或0.3μg)的人源化抗体与人cldn6或鼠cldn6的结合，所述蛋白质由工程改造的293t克隆表达。测定的结果提供于表9中。[0562]表9[0563][0564][0565]还进行了facs测定以确定人源化抗体(1.5μg或0.3μg)与如所指示癌细胞系表达的cldn6结合的相对抗原结合强度。测定的结果提供于表10中。仅将二抗用作阴性对照。64a-chim、h64a和sc27-108-chim用作参考抗体。相应的亲本抗体(人源化之前的抗体)用作对照并指定为“chim”。[0566]表10[0567][0568][0569]“chim”是抗体的前人源化形式。[0570]基于体外抗原结合数据，选择了三种人源化抗体进行进一步的测试和开发。抗体来源于ab1、ab3和ab4。[0571]在注射有膀胱癌细胞系umuc4的异种移植小鼠中进行了ab1、ab3和ab4的人源化型式的体内结合研究，基本上如实施例6中所述。简言之，在6周龄cd-1无胸腺裸鼠中建立umuc4的异种移植物模型(charlesriverlaboratories)。在肿瘤达到150至300mm3的平均大小时，将小鼠随机分为治疗组。将人源化抗体在无菌盐水中稀释至1mg/ml的工作浓度以用于静脉内尾静脉(iv)注射。将肿瘤异种移植物每周用卡尺测量三次，并且肿瘤体积(mm3)由高度×宽度×长度相乘确定。对小鼠治疗2-7周。在研究结束时，对动物实施安乐死，并切除肿瘤组织并分开保存为速冻或福尔马林固定石蜡包埋(ffpe)组织以用于生物标志物分析。[0572]异种移植物测定的结果显示于图15-图21中。图15示出两种人源化ab3型式(ab3-2和ab3-4)的异种移植物测定结果，其中治疗涉及q4d施用的10mg/kg。对照包括媒介物对照(pbs)、人igg(10mg/kgq4d)和鼠ab3型式(10mg/kgq4d)。如此图所示，人源化ab3-4在35天治疗期间显示出肿瘤体积的减小。图16示出与图15中所示的实验相同的治疗的异种移植物测定结果，例外是进行了两种额外的对照(64amse及其嵌合型式(64a-chim))。与图15中一样，图16示出用人源化ab3-4治疗后肿瘤体积的显著减小。[0573]图17示出人源化ab1-5的异种移植物测定结果。对照包括媒介物对照(pbs)、人igg(10mg/kgq4d)和鼠ab1型式(10mg/kgq4d)。如图17所示，用人源化ab1-5治疗的小鼠展示肿瘤体积的显著减小。[0574]图18示出人源化ab4-3的异种移植物测定结果。对照包括媒介物对照(pbs)、人igg(10mg/kgq4d)和鼠ab4型式(10mg/kgq4d)。用人源化ab4-3治疗的小鼠没有展示肿瘤体积的显著减小。[0575]图19-图21展示异种移植物测定的结果，其中对图15-图18的所有4种人源化抗体进行了测试。参考cldn6抗体的小鼠和嵌合型式用作对照。如图19所示，用人源化ab3-4和ab1-5治疗的小鼠展示肿瘤体积减小。图20展示到第55天的时间过程中的肿瘤体积。测定中小鼠的体重显示在图21中。[0576]实施例10[0577]用不同的ab1、ab3和ab4序列进行了计算机分析。特别地，对每种抗体的(a)原始亲本克隆、(b)最接近的小鼠种系序列、(c)最接近的人种系序列和(d)人源化序列的序列进行了比对。将被认为已经经历亲和力成熟的氨基酸用星号标记，而根据抗体数据库信息与所述位置处的氨基酸不同的氨基酸用主题标签标记。将每个序列的cdr加框。基于此分析，将制备具有表10中所列的序列的几种人源化抗体。[0578]表10[0579]亲本克隆共有序列hc共有序列lcab1422423ab3424425ab4426427[0580]具有由这些共有序列定义的序列的多种抗体基本上如实施例5中所述制备并在体外通过facs测试抗原结合(基本上如实施例5中描述)和在体内测试减小小鼠的肿瘤体积的能力(基本上如实施例6中描述)。[0581]实施例11[0582]此实施例描述本公开的cldn6抗体的下一代测序(ngs)分析。[0583]对ab1和ab3的序列进行ngs分析，以鉴定每种抗体的重链和轻链的体细胞超突变(shm)相关变体。ngs分析鉴定了每种抗体的重链和轻链序列中的shm的点。分析揭示对于ab3有1452个不同的重链序列和326个不同的轻链序列，并且对于ab1有372个不同的重链序列和3081个不同的轻链序列。示例性结果显示在图23-图26中。图23和图24分别示出变体ab3的重链和轻链的鉴定的变化，而图25和图26分别示出变体ab1的重链和轻链的鉴定的变化。每个图的底部提供了以chothia编号的突变。[0584]基于结合参与的可能性选择了在重链中具有ngs鉴定的shm的抗体。基于人源化ab3-7(abs1-s6)制造了六种抗体，并且基于人源化ab1-11(abs7-s12)制造了六种抗体，并且随后针对表型进行评估。图22是亲本和与轻链序列配对的12个变体重链序列的列表。12种抗体(abs1-s12)的facs结合研究基本上如本文所述进行，并且结果示于图27中[0585]还用不同量的abs1-s12进行了facs结合测定。在此有限稀释测定中测试的抗体浓度是0.32nm、1.6nm、8nm、40nm、200nm和1000nm，并且使用了表达cldn6的不同细胞系。结果在图28中示出。[0586]这些数据支持新鉴定的抗体(s1-s12)展示相对于相应的亲本人源化抗体增加的结合。[0587]实施例12[0588]此实施例展示本文所述的人源化抗体的体内分析。[0589]体内研究在注射有人癌细胞系的异种移植小鼠中进行，基本上如实施例6所述。在此研究中，使用了umuc4细胞系、强烈表达cldn6的膀胱癌细胞系和ov-90细胞系(一种表达cldn6的卵巢癌细胞系)的细胞。当向小鼠皮下施用时，两种细胞系都具有致瘤性。简言之，在六周龄的cd-1无胸腺裸鼠(charlesriverlaboratories)中建立了人癌细胞系的异种移植物模型。对于每个细胞系的皮下注射遵循以下条件：umuc41.0×107和ov901.0×107，全部含有50％基质胶(bdbiosciences)。将cd-1裸鼠(每组8只小鼠)在右侧腹皮下注射umuc4或ov-90细胞系。当肿瘤达到150至300mm3的平均大小时，将小鼠随机分到治疗组中。对于治疗，将每种治疗性抗体(人源化ab1-11、人源化ab3-7)和人igg对照抗体在无菌盐水中稀释，并通过静脉内尾静脉(iv)注射以10mg/kg每4天一次每天(q4d-图30)或每周一次(qw-图31)施用。将肿瘤异种移植物每周用卡尺测量三次，并且肿瘤体积(mm3)由高度×宽度×长度相乘确定。将小鼠进行治疗21-36天。在研究结束时，对动物实施安乐死，并切除肿瘤组织并分开保存为速冻或福尔马林固定石蜡包埋(ffpe)组织以用于生物标志物分析。所有动物工作均根据iacuc和加州大学洛杉矶分校动物研究委员会批准的方案进行。使用来自studydirector(sanfrancisco,ca)的studylog软件分析数据。结果呈现为每组的平均值体积。误差条表示平均值的标准误差(se)。[0590]异种移植物测定的结果显示于图30和图31中。如图30所示，相对于对照治疗的小鼠，用ab1-11或ab3-7进行的q4d治疗导致肿瘤体积或umuc4肿瘤显著减小。到研究期结束时，两种人源化抗体都实现了肿瘤体积相对于对照小鼠的60％减小。[0591]如图31所示，用任一人源化抗体治疗的小鼠的ov-90肿瘤体积小于对照治疗小鼠的肿瘤体积。到研究结束时，ab1-11实现了肿瘤体积相对于对照小鼠的33％减小，而ab3-7实现了16％减小。[0592]这些数据支持人源化抗体维持首先在相应的小鼠抗体情况下观察到的治疗功效。[0593]实施例13[0594]此实施例展示体内测试的抗体药物缀合物。[0595]制备了包含mmae和人源化ab1-11的缀合物并使用注射有表达cldn6的ov-90卵巢癌细胞系的异种移植小鼠进行了体内测试，基本上如实施例6中所述。在此实验中，将ov-90细胞皮下注射cd-1裸鼠(每组8只小鼠)右侧腹中。当肿瘤达到150至300mm3的平均大小时，将小鼠随机分到治疗组中。对于治疗，对小鼠每周一次通过尾静脉注射施用(1)10mg/kg人源化ab1-11抗体，(2)10mg/kg人igg对照抗体，(3)5mg/kg包含mmae的非靶向缀合物(不含ab1-11)，和(4)10mg/kg包含mmae和ab1-11的靶向抗体药物缀合物(adc)。非靶向缀合物包含缀合至非靶向人igg对照抗体的mmae。将肿瘤异种移植物每周用卡尺测量三次，并且肿瘤体积(mm3)由高度×宽度×长度相乘确定。将小鼠进行治疗20-36天。在研究结束时，对动物实施安乐死，并切除肿瘤组织并分开保存为速冻或福尔马林固定石蜡包埋(ffpe)组织以用于生物标志物分析。所有动物工作均根据iacuc和加州大学洛杉矶分校动物研究委员会批准的方案进行。使用来自studydirector(sanfrancisco,ca)的studylog软件分析数据。结果呈现为每组的平均值体积。误差条表示平均值的标准误差(se)。[0596]如图32所示，靶向adc的施用导致肿瘤体积显著减小。到研究结束时，相对于对照治疗的小鼠，用靶向adc治疗的小鼠的肿瘤体积表现出大于70％减小。[0597]用皮下注射umuc4膀胱癌细胞而不是ov-90细胞的小鼠进行了相同的体内分析，并通过尾静脉注射每周一次施用治疗：(1)10mg/kg人源化ab1-11抗体，(2)10mg/kg人igg对照抗体，(3)5mg/kg包含mmae的非靶向缀合物(不含ab1-11)，和(4)10mg/kg包含mmae和ab1-11的靶向抗体药物缀合物(adc)。非靶向缀合物包含缀合至非靶向人igg对照抗体的mmae。靶向缀合物总共给予3次，而其他治疗每周施用一次，总共5次。如上所述进行肿瘤体积测量，但对靶向adc治疗的小鼠的测量持续长达80天。[0598]如图33所示，靶向adc的施用展示肿瘤体积从几乎200mm3减小至几乎0mm3。效果持续到研究的80天或最后一次adc治疗后超过约60天。[0599]这些数据支持包含本公开的抗体的抗体药物缀合物有效减小肿瘤大小和治疗癌症。[0600]实施例14[0601]此实施例展示cldn-6fab片段的产生和表征。[0602]人源化cldn6抗体ab1-11的fab抗体片段是使用piercefab制备试剂盒(目录号44985)按照制造商的说明生成的。简言之，将人源化ab1-11的等分试样添加至包含固定化木瓜蛋白酶的柱中。洗脱的级分含有两个fab片段和fc多肽。通过将混合物负载到包含蛋白a树脂的柱上，将fab片段与包含fc的级分分离。从蛋白a柱洗脱的级分仅含有fab片段，而结合的级分含有fc。[0603]然后基本上如本文所述，通过facs测试ab1-11的fab片段的抗原结合。在此facs测定中，将ovca429细胞与全长ab1-11(图34a)、ab1-11fab(图34b-图34d)或全长ab1-11和ab1-11fab的混合物(图34e)一起孵育。由于fab片段的较高解离速率，所以对facs结合测定的方案略加修改(相对于上述描述)。与一抗(全长ab1-11或其fab片段)孵育后和/或与二抗(山羊f(ab)2抗人igg(h l)二抗[dylight649](novusbiologicals；目录号nbp1-51902)孵育后的洗涤步骤是多种多样的。dylight649信号的示例性facs图显示在图34a-图34e中，并且结果在图35中进行了定量。[0604]在图34a中，黑线表示细胞仅与二抗(没有一抗)一起孵育，然后洗涤2次；红线表示细胞与全长ab1-11一起孵育，洗涤一次，与二抗一起孵育，然后在二抗孵育后没有洗涤步骤；蓝线表示细胞与全长ab1-11一起孵育，洗涤一次，与二抗一起孵育，然后洗涤一次；并且绿线表示细胞与全长ab1-11一起孵育，洗涤一次，与二抗一起孵育，然后洗涤两次。[0605]在图34b中，黑线表示细胞仅与二抗(没有ab1-11fab)一起孵育，然后洗涤2次；红线表示细胞与ab1-11fab一起孵育，在孵育之间没有洗涤步骤的情况下与二抗一起孵育，然后二抗孵育后没有洗涤步骤；蓝线表示细胞与ab1-11fab一起孵育，在孵育之间没有洗涤步骤的情况下与二抗一起孵育，然后洗涤一次；并且绿线表示细胞与ab1-11fab一起孵育，在孵育之间没有洗涤步骤的情况下与二抗一起孵育，然后洗涤两次。[0606]在图34c中，黑线表示细胞仅与二抗(没有ab1-11fab)一起孵育，然后洗涤2次；红线表示细胞与ab1-11fab一起孵育，洗涤一次，与二抗一起孵育，然后二抗孵育后没有洗涤步骤；蓝线表示细胞与ab1-11fab一起孵育，洗涤一次，与二抗一起孵育，然后洗涤一次；并且绿线表示细胞与ab1-11fab一起孵育，洗涤一次，与二抗一起孵育，然后洗涤两次。[0607]在图34d中，黑线表示细胞仅与二抗(没有ab1-11fab)一起孵育，然后洗涤2次；红线表示细胞与ab1-11fab一起孵育，洗涤两次，与二抗一起孵育，然后二抗孵育后没有洗涤步骤；蓝线表示细胞与ab1-11fab一起孵育，洗涤两次，与二抗一起孵育，然后洗涤一次；并且绿线表示细胞与ab1-11fab一起孵育，洗涤两次，与二抗一起孵育，然后洗涤两次。[0608]在图34e中，黑线表示细胞仅与二抗(没有ab1-11fab)一起孵育，然后洗涤2次；红线表示细胞与全长ab1-11和ab1-11fab的混合物一起孵育，洗涤一次，与二抗一起孵育，然后洗涤两次；蓝线表示细胞与全长ab1-11和ab1-11fab的混合物一起孵育，在孵育之间没有洗涤步骤的情况下与二抗一起孵育，然后洗涤两次；并且绿线表示细胞与全长ab1-11和ab1-11fab的混合物一起孵育，洗涤一次，与二抗一起孵育，然后洗涤两次；并且紫线表示细胞与全长ab1-11和ab1-11fab的混合物一起孵育，洗涤两次，与二抗一起孵育，然后洗涤两次。[0609]如这些图中所示，ab1-11的fab片段展示与抗原的强结合。[0610]然后将ab1-11fab片段用作一抗以对表达cldn6的ovca429细胞进行免疫染色。此研究中的二抗是山羊f(ab)2抗人igg(h l)二抗[dylight649](novusbiologicals；目录号nbp1-51902)。结果在图36a-图36c中示出。在图36a中，ovca429细胞在没有任何ab1-11fab(仅与二抗)的情况下孵育。在图36b中，将细胞仅用ab1-11fab(没有二抗)染色。在图36c中，将细胞与ab1-11fab片段一起孵育，洗涤两次，然后与二抗一起孵育。与二抗孵育后，将细胞洗涤两次，然后暴露于c6持续9秒。[0611]这些研究中的数据表明，ab1-11的单价型式展示良好的抗原结合。[0612]实施例15[0613]此实施例展示cldn-6scfv的产生和表征。[0614]使用包含cmv启动子和土拨鼠肝炎病毒转录后调控元件(wpre)的病毒表达载体制备人源化ab3-7和ab1-11的单链fv片段，所述元件位于轻链可变区和重链可变序列的侧翼(图37a)。编码(g4s)3间隔区的序列位于lc与hc可变序列之间。lc可变区、间隔区和hc可变区的序列提供于图37b中。病毒载体在细胞中表达，并且收获所产生的scfv，随后通过facs测试抗原结合。每个facs反应使用ark2或m202细胞(0.25x106)。一抗是scfv并且以5μg/反应使用。二抗是biolegend目录号652513，并且每次反应使用2μl的0.5μg/μl储备液。每次孵育(与一抗和二抗一起)在4℃下进行30分钟。孵育后，在facs分析之前进行单一洗涤步骤。任何未使用的细胞都用于成像研究。[0615]示例性facs图在图38a和图38b中示出。在图38a中，黑线表示仅与二抗一起孵育的ark2细胞的信号，并且红线表示与ab3-7的scfv一起孵育的ark2细胞的信号。在图38b中，黑线表示仅与二抗一起孵育的m202细胞的信号，并且红线表示与ab3-7的scfv一起孵育的m202细胞的信号。[0616]用ab1-11scfv进行上述相同的facs实验。一抗是scfv并且以2μg/反应使用。二抗是biolegend目录号652513，并且每次反应使用1μl的0.5μg/μl储备液。每次孵育(与一抗和二抗一起)在4℃下进行30分钟。孵育后，在facs分析之前进行单一洗涤步骤。结果显示在图39a和图39b中。如图39a所示，过表达cldn6和绿色荧光蛋白(gfp)的293t细胞仅在细胞与scfv一起孵育、随后二抗孵育时，而不是在细胞仅与二抗(无scfv)孵育时产生通过facs检测到的信号。ark2细胞展示通过facs检测到的类似模式。如图39b所示，只有表达gfp的293t细胞产生gfp特异性信号，而m202和ark2细胞(不表达gfp)不产生。图40a-图40c提供来自此实验的示例性facs图。在图40a中，黑线是仅与二抗孵育后表达cldn6和gfp的293t细胞的信号，红线是这些细胞与ab3-7scfv、随后二抗孵育后的信号，并且蓝线是这些细胞在与ab1-11scfv、随后二抗孵育后的信号。图40b和图40c遵循采用带有彩色线的此相同方案，例外是图40b是来自m202细胞的信号，并且图40c是来自ark2细胞的信号。图40d-图40f展示图40a中测试的每组293t细胞的数量大致相同。[0617]这些数据证明人源化cldn6抗体的scfv与抗原强烈结合。[0618]实施例16[0619]此实施例展示cldn6adc的体外表征。[0620]包含各种接头-药物组合的adc是用人源化ab3-7抗体(也称为ab23，参见例如表8)制备的：(a)vc-pab-mmae，(b)ggfg-mmae，(c)cl2a-sn38，(d)ggfg-dxd和(e)vc-pab-dxd。adc在wuxibiologics(上海，中国)制备。[0621]图41a-图41h示出包含ab3-7的cldn6adc的生物化学表征。图41a是总结包含ab3-7的七种cldn6adc的生物化学性质的表。标记为d4的adc是指基本均质的缀合物，所述缀合物包含大量抗体，所述抗体为每种抗体缀合至4种药物(d4技术，wuxibiologics的一项技术)。标记为ctrl的adc是指包含每种抗体的药物数量的高斯分布的常规异质缀合物(常规)。所述adc包含低百分比的未缀合抗体、高分子量(hmw)种类和未缀合游离药物。所述adc还包含低水平的内毒素，从而使其适用于体内研究。图41b-图41h表示hic-hplc色谱图，其示出对于每种adc，与不同数量的药物缀合的抗体的相对丰度。例如，d0下的峰面积表示未缀合的ab3-7的相对丰度。类似地，d1、d2、d3……d8下的峰面积表示每种抗体缀合至1、2、3……8种药物的ab3-7抗体的相对丰度。[0622]图42示出包含ab3-7的cldn6adc的分子完整性未因缀合而改变。cldn6adc和未缀合的ab3-7抗体的分子完整性通过nativepage(nativepage4-16％bis-tris蛋白凝胶(目录号bn1002box，thermofisher)评估。天然page根据蛋白质天然结构的净电荷、大小和形状来分离蛋白质。在天然条件下，与未缀合的ab3-7抗体相比，所有7种cldn6adc在结构上都保持完整，并且确实表现出任何降解迹象。因此，缀合不会改变ab3-7抗体的分子完整性。[0623]图43示出缀合不影响ab3-7抗体的结合亲和力。流式细胞术显示包含ab3-7的cldn6adc保留了对cldn6的特异性和高结合亲和力。通过流式细胞术分析三种细胞系的adc结合活性：(a)umuc4膀胱癌细胞系(天然表达cldn6)，(b)hek293tcldn6-mgfpa11(经工程改造以人工过表达(oe)cldn6)，和(c)m202黑素瘤细胞系(cldn6阴性细胞)。具体而言，将adc与约150,000个细胞在50μl2％fbs/pbs中在4℃下孵育30分钟，然后用2％fbs/pbs洗涤。然后将adc与来自biolegend(409320)的alexa647抗人iggfc抗体在4℃下孵育30分钟。通过bdaccuritmc6流式细胞仪测量结合。与它们的未缀合的抗体ab3-7相比，七种不同的cldn6adc通过流式细胞术显示出与cldn6阳性细胞系(umuc4细胞和hek293tcldn6-mgfpa11)相似的结合亲和力，而显示对cldn6阴性细胞系(m202)没有结合。[0624]图44进一步示出缀合不影响ab3-7抗体的结合亲和力。解离常数(kd)的测量表明，包含ab3-7的cldn6adc保留了对cldn6的特异性和高结合亲和力。cldn6adc的基于细胞的抗体亲和力(kd)通过kinexa4000(sapidyneinstrument,boise,idaho)进行测量。简言之，使用versene使hek293tcldn6-mgfpa11细胞脱离，并在4℃下在2％fbs/dmem中与500pm或10nm抗体一起平衡过夜。细胞浓度从5x106个细胞开始，并进行2倍系列稀释直至10个点。第二天，将细胞以1500rpm离心10分钟，并保存上清液。将pmma珠粒(sapidyeinstrument，目录号440176)用山羊抗人igg(jacksonimmunoresearchlabs(目录号109-005-003)以30μg/ml进行预包被。将荧光二抗alexa647affinipure山羊抗人igg(jacksonimmunoresearchlabs，目录号109-605-088)以0.5μg/ml在1％bsa/pbs中稀释。测量中还包括仅抗体溶液(信号100％)和非特异性结合(nsb，仅缓冲剂)对照。使用通过n曲线分析而分析的两条抗体曲线计算kd。如图44所示，所有adc和未缀合的ab3-7的结合亲和力(kd)相似。因此，与各种接头-药物组合的缀合不会改变对hek293tcldn6-mgfpa11细胞上表达的cldn6的抗体结合亲和力。[0625]图45示出包含ab3-7的cldn6adc被癌细胞有效内化，这是adc活化的重要步骤。具体地，ark2细胞(表达cldn6的子宫癌肉瘤)被细胞核(蓝色)、溶酶体(绿色)和cldn6adc(红色)染色。上图上的图像在早期阶段(adc/抗体染色后30分钟内)拍摄，并且下图上的那些图像在稍后阶段(adc/抗体染色后5-6小时内)拍摄，以显示与adc复合的cldn6或未缀合的抗体的内化。如图45所示，与其未缀合的抗体ab3-7相比，缀合没有改变抗体内化率。[0626]实施例17[0627]此实施例展示cldn6adc针对癌细胞的体外抗癌活性。[0628]图46a-图46g示出包含ab3-7的不同cldn6adc对癌细胞的2d抗增殖作用。针对四种癌细胞系测试了cldn6adc的抗增殖活性：cldn6阳性细胞系(umuc4、ov90)和cldn6阴性细胞系(mcf7、m202)。将每种细胞系均匀地接种到48孔板的孔中，每孔300-1000个细胞。48小时后，测量每种细胞系每孔的细胞数量的基线测量值。将剩余的细胞孔用6种药物浓度的1:5连续稀释液处理，最终处理浓度在200nm(30ng/ml)至0.064nm(0.0096ng/ml)的范围内。7天后，通过比较经处理的对比未处理的对照中的细胞计数来评估抗增殖活性。[0629]如图46a-图46g所示，包含mc-vc-pab-mmae(常规)和mc-vc-pab-mmae(d4技术)的cldn6adc在针对cldn6阳性细胞(umuc4)表现出最大抗增殖效力和特异性方面是可比的。包含cl2a-sn38(常规)和cl2a-sn38(d4技术)的cldn6adc表现出同样相似的抗增殖效力，但是非特异性的，在cldn6阳性细胞和cldn6阴性细胞之间不加区分地杀伤。包含mc-ggfg-mmae的cldn6adc针对cldn6阳性细胞(umuc4)显示具有特异性的低抗增殖效力。包含mc-ggfg-dxd和mc-vc-pab-dxd的cldn6adc针对任何细胞系均不显示抗增殖作用。[0630]图46h-图46n示出包含与vc-pab-mmae(adc-11)缀合的ab1-11的cldn6针对各种细胞系的2d抗增殖作用。具体地，测试了四种细胞系：cldn6阳性细胞系(ark2、ovca429、h841、ov90、h1693)和cldn6阴性细胞系(mcf7、m202)。将每种细胞系均匀地接种到48孔板的孔中，每孔300-1000个细胞。48小时后，测量每种细胞系每孔的细胞数量的基线测量值。将剩余的细胞孔用以下各项的1:5连续稀释液处理：(a)cldn6靶向adc-11，(b)对照adc(与vc-pab-mmae缀合的非靶向igg)，(c)未缀合的非靶向igg，和(d)未缀合的ab1-11，最终处理浓度在1000nm(150ng/ml)至0.32nm(0.0048ng/ml)的范围内。7天后，通过比较经处理的对比未处理的对照中的细胞计数来评估抗增殖活性。[0631]如图46h-图46n中所示，adc-11针对cldn6阳性细胞系(ark2、ovca429、h841、ov90、h1693)表现出稳健的抗增殖活性，而对cldn6阴性细胞系(m202和mcf7)没有活性。[0632]实施例18[0633]此实施例显示cldn6adc针对癌细胞系异种移植物的体内抗癌功效。[0634]对于所有体内实验，将肿瘤异种移植物用卡尺测量3次/周，并且肿瘤体积(mm3)由高度x宽度x长度相乘确定。所有动物工作均根据iacuc和ucla动物研究委员会批准的方案进行。使用来自studydirector(sanfrancisco,ca)的studylog软件分析数据。[0635]图47示出cldn6adc针对cldn6阳性卵巢癌细胞系(ov90)异种移植物的抗癌功效。本文测试的cldn6adc包含与vc-pab-mmae(adc-11；常规)缀合的人源化ab1-11。ov90卵巢癌细胞系异种移植物是在6周龄cd-1无胸腺裸鼠(charlesriverlaboratories)中通过将1.0×107个细胞与50％基质胶(bdbiosciences)皮下注射到动物的右后侧腹中而建立的。当肿瘤达到100-200mm3的平均大小时，将小鼠(n＝8)随机分到以下任一治疗组：1)非靶向人igg1对照抗体，10mg/kgqwiv4周；2)人源化cldn6-ab1-11(hu-11)，10mg/kgqwiv(静脉内注射)，持续4周；3)adc-11，5mg/kgqwiv，持续3周；以及4)非靶向对照adc，5mg/kgqwiv，持续3周。给药后跟踪异种移植物直至肿瘤进展。用cldn6adc治疗导致异种移植物肿瘤消退。cldn6adc的活性优于使用未缀合的cldn6mab或非靶向对照adc观察到的活性。[0636]图48a-图48b示出cldn6adc-11(常规)针对cldn6阴性黑素瘤癌细胞系(m202)异种移植物没有抗癌活性。adc-11在不表达cldn6的m202细胞系异种移植物中没有显示任何抗癌活性。m202黑素瘤癌细胞系异种移植物是在6周龄cd-1无胸腺裸鼠(charlesriverlaboratories)中通过将1.0×107个细胞与50％基质胶(bdbiosciences)皮下注射到动物的右后侧腹中而建立的。当肿瘤达到100-300mm3的平均大小时，将小鼠(n＝8)随机分到以下任一治疗组：1)非靶向人igg1对照抗体，10mg/kgqwiv4周；或2)adc-11，5mg/kgqwiv，持续3周。cldn6adc针对cldn6阴性异种移植物的抗癌活性缺乏证明了cldn6adc活性的特异性。[0637]图49a-图49b示出cldn6adc-23针对癌细胞系异种移植物的体内抗癌功效。本文测试的cldn6adc包含与vc-pab-mmae(adc-23；常规)缀合的人源化ab3-7。图49a示出cldn6adc-23针对cldn6阳性膀胱细胞系(umuc4)异种移植物有效。具体地，umuc4膀胱癌细胞系异种移植物是在6周龄cd-1无胸腺裸鼠(charlesriverlaboratories)中通过将1.0×107个细胞与50％基质胶(bdbiosciences)皮下注射到动物的右后侧腹中而建立的。当肿瘤达到100-200mm3的平均大小时，将小鼠(n＝8)随机分到以下任一治疗组：1)非靶向人igg1(hu-igg1)对照抗体，10mg/kg每周一次(qwiv)，持续4周；2)人源化cldn6ab3-7抗体(hu23)，10mg/kgqwiv，持续4周；3)adc-23，5mg/kgqwiv，持续3周。在给药后追踪异种移植物直至肿瘤进展或治疗开始后60天。图49b示出在用hu-igg1对照抗体或5mg/kgadc-23治疗后的所指示时间点收集的异种移植物组织的苏木精和曙红(h&e)染色。对研究期间收集的异种移植物组织的组织病理学分析表明，adc-23治疗的小鼠中上皮-肿瘤细胞含量损失(图49b)。[0638]用cldn6adc-23治疗导致umuc4cldn6阳性细胞系异种移植物中的异种移植物肿瘤消退。图49a-图49b中呈现的数据和上文呈现的那些数据证明cldn6adc(adc-11和adc-23)在靶向cldn6阳性细胞系异种移植物方面是有效的。[0639]实施例19[0640]此实施例显示了cldn6adc-23针对患者来源的异种移植物(pdx)的体内抗癌活性。[0641]图50a-图50e示出cldn6adc-23(常规)针对卵巢癌pdx模型的体内抗癌功效。具体地，通过蛋白质印迹分析筛选一组卵巢pdx样品的cldn6蛋白表达(图50a)。为所述研究选择了两个cldn6阳性(df189和df181)和一个cldn6阴性(df20)样品。将来自每个pdx的卵巢癌细胞在注射到免疫功能低下小鼠(nsg)的腹腔内之前用荧光素酶转染(图50b)。图50c-图50e示出在用以下各项治疗的小鼠中每周测量一次的荧光素酶活性输出：(1)非靶向hu-igg1对照抗体，10mg/kgqwiv4周；(2)人源化cldn6ab3-7，10mg/kgqwiv持续4周；或(3)adc-23，5mg/kgqwiv，持续3周。用hu-igg1对照或cldn6ab3-7mab治疗的小鼠显示腹腔内肿瘤负荷持续增加，直到对于每个测试的pdx模型，在植入癌细胞后大约50天小鼠不得不进行安乐死。然而，用adc-23治疗的小鼠显示肿瘤负荷的显著降低以及总体存活率的显著提高。这些反应仅限于注射有cldn6阳性卵巢癌细胞的小鼠(图50c和图50d)。df20cldn6阴性模型仅显示治疗的有限益处，而对总体存活没有影响(图50e)。[0642]实施例20[0643]此实施例显示cldn6adc-23的剂量依赖性活性。[0644]图51a-图51c显示cldn6adc-23(d4技术)针对cldn6阳性卵巢癌细胞系(ov90)异种移植物的剂量依赖性抗癌活性。ov90卵巢癌细胞系异种移植物是在6周龄cd-1无胸腺裸鼠(charlesriverlaboratories)中通过将1.0×107个细胞与50％基质胶(bdbiosciences)皮下注射到动物的右后侧腹中而建立的。当肿瘤达到约200mm3的平均大小时，将小鼠(n＝6)随机分到治疗组。将具有ov90异种移植物的小鼠以0.1mg/kg至2.5mg/kgivqw范围内的不同剂量治疗3周。随着给药浓度降低，观察到抗肿瘤活性降低。用2.5mg/kg的cldn6adc-23治疗诱导均匀的异种移植物消退(图51a和图51b)。没有观察到响应于用任何给予剂量的cldn6adc-23治疗的对小鼠体重的影响(图51c)。因此，在cldn6阳性卵巢癌细胞系异种移植物中证实了新型cldn6adc-23的选择性和剂量依赖性活性。[0645]图52a-图52c示出在cldn6阴性黑素瘤癌细胞系(m202)异种移植物中没有cldn6adc-23(d4技术)的脱靶活性。m202黑素瘤癌细胞系异种移植物是在6周龄cd-1无胸腺裸鼠(charlesriverlaboratories)中通过将1.0×107个细胞与50％基质胶(bdbiosciences)皮下注射到动物的右后侧腹中而建立的。当肿瘤达到约200mm3的平均大小时，将小鼠(n＝6)随机分到治疗组。将携带m202黑素瘤异种移植物的小鼠以0.1mg/kg至2.5mg/kgivqw范围内的不同剂量治疗3周。在任何给予的剂量下均未观察到cldn6adc针对cldn6阴性m202异种移植物的抗癌活性(图52a-图52b)。没有观察到响应于用任何给予剂量的cldn6adc治疗的对小鼠体重的影响(图52c)。[0646]实施例21[0647]此实施例显示cldn6-cd3双特异性蛋白的产生。[0648]在本文中制备并表征了两种cldn6-cd3双特异性t细胞衔接剂(bite)：(a)ab1-11的cldn6结合部分与cd3结合部分融合(bite-11)，和(b)ab3-7的cldn6结合部分与cd3结合部分融合(bite-23)。[0649]图53a示出示例性双特异性蛋白的示意图，所述双特异性蛋白包含与cd3e结合vh和vl结构域融合的cldn6结合vl和vh结构域。将融合蛋白用包含6个组氨酸残基的his标签进行标记，以便于纯化和检测。[0650]图53b-图53c分别示出bite-23和bite-11的纯化和验证。cldn6-cd3双特异性蛋白在expicho表达系统(thermofisherscientific)中表达，并使用talon金属亲和树脂(clontechlaboratories,inc.,目录号635503)或蛋白l琼脂糖珠粒(thermofisherscientific,目录号20512)进行纯化。[0651]实施例22[0652]此实施例显示cldn6-cd3双特异性蛋白的体外表征。[0653]图54a-图54e示出cldn6-cd3双特异性蛋白与天然cldn6阳性细胞(ark2)以及经工程改造以过表达cldn6的细胞(hek293tcldn6-mgfphis20细胞)的有效结合。具体地，将cldn6阳性细胞(ark2和hek293tcldn6-mgfphis20细胞)和cldn6阴性细胞(hupt4)各自与cldn6-cd3双特异性蛋白和抗his二抗孵育以进行检测。进行流式细胞术测定(图54a-图54c)并拍摄细胞的图像(图54d和图54e)。cldn6-cd3双特异性蛋白结合至cldn6阳性细胞系，但不结合至cldn6阴性细胞系，从而证明双特异性蛋白与cldn6的特异性和有效结合。[0654]图55a-图55b示出cldn6-cd3双特异性蛋白诱导t细胞活化。使用jurkat细胞与nfat-re报告分子和cldn6-cd3双特异性蛋白进行t细胞活化测定。具体地，使用t细胞活化生物测定试剂盒(promega,目录号nfat-rej1621)测量t细胞活化。将多种细胞系(hek293t-cldn6阳性、hek293t-cldn6阴性、ark2、umuc4和okt3)以40,000个细胞/孔的密度接种在白色96孔板孔中，并在37℃下孵育过夜，然后将测定试剂盒中包含的解冻使用jurkatt细胞添加至接种的细胞中(1:1细胞比例)并用cldn6-cd3双特异性蛋白处理。将经处理的板在37℃下孵育6-24小时时间段，然后添加bio-glo试剂(包含在试剂盒中)并立即在victor3v光度计上以每秒计数(cps)为单位进行读取。当用bite-11和bite-23处理时，过表达cldn6(内源性和工程改造)的细胞系诱导t细胞的活化，而cldn6阴性细胞系诱导显著降低的活化水平。[0655]图56示出cldn6-cd3双特异性蛋白在与cldn6阳性细胞一起孵育后诱导t细胞簇集。具体地，图56示出处理后3天的cldn6-cd3细胞毒性测定的代表性图像。将pancd3 人pbmc与ark2(一种cldn6阳性细胞系)以不同的效应物:靶标比率共培养，并用cldn6-cd3双特异性蛋白或博纳吐单抗(阴性对照)处理。将用125ng/mlcldn6-cd3双特异性蛋白处理3天后显示t细胞簇集的代表性图像与博纳吐单抗对照进行比较(图56)。[0656]图57示出cldn6-cd3双特异性蛋白诱导针对癌细胞的靶特异性和剂量依赖性细胞毒性。具体地，图57示出cldn6-cd3双特异性蛋白在处理后3天诱导的ldh活性。ldh活性在与图55a-图55b相同的测定概述中被评估为细胞损伤的标志物。收集培养基并以14,500rpm离心10分钟。保存上清液并将6μl用于ldh活性测定(sigma，目录号mak066)。将具有10％fbs的rpmi用作阴性对照。测定在37℃下进行，并使用酶标仪(moleculardevice)以30秒间隔每15分钟测量od450nm。[0657]如图57所示，cldn6-cd3双特异性蛋白以剂量依赖性方式诱导靶标特异性细胞毒性。与用博纳吐单抗处理的细胞相比，与cd3阳性人pbmc共培养并用bite-11(p11-11)或bite-23(p23-7)处理的ark2细胞释放了显著更高水平的ldh。还观察到效应细胞与靶细胞比率依赖性反应，从而表明细胞毒性作用需要cd3阳性细胞。[0658]实施例23[0659]此实施例显示靶向cldn6的串联双抗体(tandab)的产生和体外表征。[0660]本文制备并测试了两种cldn6-cd16双特异性tandab：(a)ab1-11的cldn6结合部分与cd16a结合部分融合(tandab11)，和(b)ab3-7的cldn6结合部分与cd16a结合部分融合(tandab23)。[0661]图58示出示例性双特异性蛋白的示意图，所述双特异性蛋白包含与cd16a结合vh和vl结构域融合的cldn6结合vl和vh结构域。将融合蛋白用包含6个组氨酸残基的his标签进行标记，以便于纯化和检测。[0662]图59a-图59d示出cldn6-cd16a双特异性蛋白与天然cldn6阳性细胞(ark2)但不与cldn6阴性细胞(hupt4)的有效结合。具体地，将cldn6阳性细胞(ark2)和cldn6阴性细胞(hupt4)各自与cldn6-cd16atandab和抗his二抗孵育以进行检测。进行流式细胞术测定(图59a-图59b)并拍摄细胞的图像(图59c和图59d)。cldn6-cd16atandab结合cldn6阳性细胞，但不结合至cldn6阴性细胞，从而证明tandab与cldn6的特异性和有效结合。[0663]实施例24[0664]此实施例展示调节免疫应答的cldn6双特异性蛋白的体内抗癌活性。[0665]图60证明cldn6-cd3bite在注射有人pbmc的小鼠中的cldn6阳性癌细胞系异种移植物(umuc4)中的稳健体内抗癌活性。具体地，在腹膜内注射(a)1.0×107个人供体外周血单核细胞(pbmc)、(b)用il-2刺激的供体pbmc或(c)从人供体pbmc分离的nk细胞之前12天，向免疫功能低下(nsg)小鼠注射1.0×107个umuc4膀胱细胞。注射pbmc/nk细胞后的第二天，将小鼠用(a)1mg/kgblincytomab(非靶向对照)、(b)2mg/kgafm13(非靶向cd16tandab)、(c)1mg/kgbite-11、(d)1mg/kgbite-23、(e)20mg/kgtandab-11或(f)20mg/kgtandab-23连续治疗7天。作为对照，将另一组小鼠用10mg/kgab3-7ivqw治疗。在用bite-11或bite-23治疗的小鼠中观察到显著肿瘤消退。因此，cldn6-cd3bite具有稳健抗肿瘤活性。[0666]图61证明cldn6-cd3bite在blt小鼠中针对cldn6阳性癌细胞系异种移植物(umuc4)的体内抗癌活性。具体地，向免疫功能低下(nsg)小鼠植入胎儿供体cd38 干细胞和供体肝脏和胸腺的片段，以产生完全人源化的免疫系统。在注射1.0×107个umuc4膀胱癌细胞之前，在这些blt(骨髓肝脏胸腺)小鼠中证实了人免疫细胞的重建。一旦肿瘤达到200-300mm3的平均体积，就将小鼠就用(a)1mg/kg非靶向hu-igg1对照、(b)1mg/kgbite-23或(c)2mg/kgtandab-23通过静脉注射治疗连续5天。在用bite-23治疗的小鼠中观察到显著肿瘤消退。这些数据表明cldn6指导的bite非常有效，并且赋予抗肿瘤活性。[0667]本文所引用的所有参考文献(包括出版物、专利申请和专利)据此以引用的方式并入，其程度等同于每个参考文献单独地且具体地被表示为以引用的方式并入本文并且整体在本文得以陈述。[0668]在描述本公开的上下文中(尤其在随附权利要求书的上下文中)使用术语“一个/种(a/an)”和“所述”以及类似的提及物应解释为涵盖单数和复数，除非本文中另外指明或与上下文明显相矛盾。除非另外指出，否则术语“包含”、“具有”、“包括”和“含有”应解释为开放式术语(即意指“包括但不限于”)。[0669]除非在本文中另外指示，否则对本文中值范围的叙述仅意图充当个别提及属于所述范围和每个端点内的每一单独值的速记方法，并且每一单独值和端点并入本说明书中，如同在本文中个别地叙述一般。[0670]除非在本文另外指示或以其他方式与上下文明显相矛盾，否则本文所描述的所有方法可按任何合适的顺序进行。除非另外要求，否则使用的任何和所有实例，或本文所提供的各种语言(例如，“如”)仅意图更好地说明本发明并且并不对本发明的范围造成限制。本说明书中的任何语言都不应被解释为指示实践本公开所必需的任何未要求的要素。[0671]本文描述了本公开的某些实施方案，包括为本发明人所知用于实施本发明的最佳方式。阅读上述说明书后那些优选实施方案的变型对于本领域普通技术人员可变得明显。本发明人希望技术人员适当地采用此类变化，并且本发明人意图以本文具体描述的方式之外的方式来实践本公开。因此，本公开包括在随附的适用法律允许的权利要求中叙述的主题的所有修改和等效物。此外，除非本文另有指示或与上下文明显矛盾，否则在其所有可能变化形式的上述要素的任何组合都涵盖在本公开内。当前第1页12当前第1页12
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