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通用逆转录引物及miRNA的cDNA合成方法、合成试剂盒和miRNA检测方法与流程

2021-11-05 21:36:00 来源:中国专利 TAG:

技术特征:
1.一种通用逆转录引物,其核苷酸序列由以下通式(i)表示:r

(dt)
n

vn
ꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀꢀ
(i)其中,r为所述通用逆转录引物的5’端序列,其核苷酸序列如seq id no:1所示;vn为所述通用逆转录引物的3’端序列,其中v表示腺嘌呤残基、鸟嘌呤残基或胞嘧啶残基,n表示腺嘌呤残基、鸟嘌呤残基、胞嘧啶残基或胸腺嘧啶残基;(dt)
n
为所述通用逆转录引物的中间部分,表示n个连续的胸腺嘧啶残基,其中n为8

20内的任意整数。2.根据权利要求1所述的通用逆转录引物,其核苷酸序列如seq id no:2所示。3.一种mirna的cdna合成方法,其包括在同一反应体系和同一反应条件下进行的以下反应步骤:s1:mirna加poly(a)尾反应:以mirna为靶标,以atp为反应原料,在poly(a)聚合酶的催化下,进行加poly(a)尾反应;s2:逆转录合成cdna反应:以步骤s1获得的已加poly(a)尾的mirna为靶标,利用权利要求1或2提及的通用逆转录引物,在逆转录酶的催化下,合成cdna。4.根据权利要求3所述的cdna合成方法,其中所述反应体系包含:10

100mm tris

hcl ph 8.3、20

100mm nacl、10

100mm kcl、1

20mm mgcl2、5

50mm dtt、1

20nm权利要求1或2提及的通用逆转录引物、0.1

1mm atp、0.1

5u/μl poly(a)聚合酶、5

50u/μl逆转录酶、0.1

1.0mm dntp;所述反应条件为:37℃

42℃保温20

60min,随后65℃

90℃保温5

20min。5.一种mirna的cdna合成试剂盒,其包含权利要求1或2所述的通用逆转录引物;优选地,所述cdna合成试剂盒还包含用于进行mirna合成cdna反应的成分:atp、poly(a)聚合酶、逆转录酶、dntp和反应缓冲液,其中所述反应缓冲液包含tris

hcl ph 8.3、nacl、kcl、mgcl2和dtt;进一步优选地,所述cdna合成试剂盒在使用时各成分在cdna合成反应体系中的浓度分别为:10

100mm tris

hcl ph 8.3、20

100mm nacl、10

100mm kcl、1

20mm mgcl2、5

50mm dtt、1

20nm权利要求1或2提及的通用逆转录引物、0.1

1mm atp、0.1

5u/μlpoly(a)聚合酶、5

50u/μl逆转录酶、0.1

1.0mm dntp。6.一种通用扩增反向引物,其核苷酸序列由以下通式(ii)表示:p

r
ꢀꢀꢀꢀ
(ii)其中,p为所述通用扩增反向引物的5’端序列,表示切刻内切酶的酶切位点及其保护性碱基,其中所述切刻内切酶的酶切位点选自seq id no:3、seq id no:4、seq id no:5和seq id no:6中的任一种;r为所述通用扩增反向引物的3’端序列,其核苷酸序列如seq id no:1所示;优选地,所述通用扩增反向引物的核苷酸序列如seq id no:7、seq id no:8、seq id no:9和seq id no:10中的任一种所示。7.一种多核苷酸,其核苷酸序列如seq id no:1所示。8.一种定量检测mirna的方法,其在权利要求3或4提及的cdna合成方法的基础上还包括:s3:以步骤s2逆转录合成的cdna为模板进行rt

sda和/或rt

pcr定量检测;其中用于扩增cdna模板的反向引物为权利要求6提及的通用扩增反向引物。
9.一种mirna检测试剂盒,其包含权利要求1或2所述的通用逆转录引物和权利要求6所述的通用扩增反向引物。10.根据权利要求1或2所述的通用逆转录引物、权利要求3或4所述的cdna合成方法、权利要求5所述的cdna合成试剂盒、权利要求6所述的通用扩增反向引物、权利要求8所述的定量检测mirna的方法或权利要求9所述的mirna检测试剂盒,其中所述mirna选自以下中的一种或多种:真核生物的循环mirna、组织mirna、总rna和人工合成的mirna分子。

技术总结
本发明公开一种通用逆转录引物及miRNA的cDNA合成方法、合成试剂盒和miRNA检测方法。提供的通用逆转录引物的5’端为适用于SDA等温扩增和PCR变温扩增的通用扩增引物结合序列,因此利用该通用逆转录引物由miRNA合成的cDNA不仅适用于SDA等温检测miRNA的体系中,还可同时适用于PCR变温检测miRNA的体系中,因此可以实现SDA等温和PCR变温同时检测同一miRNA的目的,有效提高miRNA定量结果的准确性。提供的cDNA合成方法可在同一反应体系和同一反应条件下同步实现miRNA加poly(A)尾和逆转录反应,整个反应时间较短,可以实现快速合成cDNA的目的。的。的。


技术研发人员:赵俊 朱灵 杨柯 朱灿灿 汪磊 花昌义 邓国庆 刘勇
受保护的技术使用者:合肥中科易康达生物医学有限公司
技术研发日:2021.07.29
技术公布日:2021/11/4
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