与小麦抗白粉病基因相连锁的分子标记及其应用

摘要: 本发明涉及植物遗传学及作物分子育种,具体涉及与小麦抗白粉病基因相连锁的分子标记及其应用。背景技术:1、小麦(triticumaestivuml.)是全球种植范围...
与小麦抗白粉病基因相连锁的分子标记及其应用

本发明涉及植物遗传学及作物分子育种,具体涉及与小麦抗白粉病基因相连锁的分子标记及其应用。

背景技术:

1、小麦(

triticum aestivuml.)是全球种植范围最广、总产量最高的粮食作物之一,为人类日常膳食提供约20%的总热量和蛋白质来源。然而,小麦在生长过程中常受到多种病虫害的侵袭,对产量和品质造成严重威胁,进而影响全球粮食安全。其中,由小麦白粉病菌(

blumeria graminisf. sp.

tritici,简称bgt)引起的小麦白粉病,是过去几十年间全球范围内危害最严重的小麦病害之一,严重时可导致籽粒产量和品质大幅下降。

2、利用寄主自身携带的抗性资源,通过育种手段培育抗病品种,是防控小麦白粉病最为经济、有效且环境友好的策略。传统抗病育种主要依赖表型鉴定,通过人工接种或田间自然发病对育种材料进行抗性评价和筛选。然而,白粉病抗性表型鉴定受病原菌生理小种组成、环境条件、植株生育期等多种因素影响,鉴定周期长、工作量大,且在大规模育种群体中难以高效开展。此外,随着新毒性生理小种的出现和流行,部分已育成的抗病品种在推广种植数年后往往丧失抗性,亟需挖掘和利用新的抗性资源。

3、分子标记辅助选择通过检测与目标性状紧密连锁的dna多态性,可在苗期对育种材料进行基因型鉴定,有效规避环境干扰,显著缩短育种周期。在各类分子标记中,简单重复序列(simple sequence repeat,ssr)标记因具有基因组分布广泛、多态性丰富、共显性遗传、操作简便且重复性好等突出优势,已成为小麦遗传研究中应用最广的标记类型之一。ssr标记能够揭示亲本及后代群体在特定基因组区域的多态性差异,通过连锁分析可准确追踪目标性状相关染色体区段在分离群体中的传递规律,是构建遗传连锁图谱、定位数量性状位点(qtl)及实施分子标记辅助选择的核心工具。

4、然而,目前可用的小麦白粉病抗性相关ssr标记数量仍然有限,且部分已报道标记与抗性位点的遗传距离较大,多态性稳定性不足,在实际育种中难以实现高效、可靠的选择。因此,开发与白粉病抗性基因/位点紧密连锁、具有高多态性和稳定扩增特征的新型ssr分子标记,明确其在分离群体中的共分离关系和选择效率,对于构建高密度遗传图谱、精细定位抗性位点以及开展分子标记辅助育种具有重要的实践价值,是提升抗病品种选育精准度和加速育种进程的关键技术途径。

技术实现思路

1、本发明要解决的技术问题是提供一种与小麦抗白粉病基因相连锁的分子标记及其应用。

2、在一个方面,本发明提供一种与小麦抗白粉病基因相连锁的ssr分子标记,所述ssr分子标记位于小麦fileder 1a染色体上,其遗传位置为5187077bp~5187250bp,对应于小麦1a染色体的第5187077位碱基~第5187250位碱基之间。

3、进一步地,所述ssr分子标记的检测引物对的上游引物为seq id no.1所示序列,所述ssr分子标记的检测引物对的下游引物为seq id no.2所示序列。

4、在一个方面,本发明提供上述ssr分子标记在小麦白粉病抗性鉴定和/或小麦白粉病抗性育种中的应用。

5、在一个方面,本发明提供一种检测小麦白粉病抗性的方法,包括:以待测小麦基因组dna为模板,使用上述ssr分子标记的检测引物对进行pcr扩增,根据pcr扩增结果检测待测小麦的白粉病抗性。

6、进一步地,若待测小麦pcr扩增片段大小为187bp,则判定其为抗白粉病小麦;若待测小麦pcr扩增片段大小为174bp,则判定其为感白粉病小麦。

7、再一个方面,本发明提供一种检测试剂盒,包含上述ssr分子标记的检测引物对。

8、在一个方面,本发明提供上述试剂盒在小麦白粉病抗性鉴定和/或小麦白粉病抗性育种中的应用。

9、与现有技术相比,本发明具有以下有益效果:

10、本发明通过构建遗传分离群体,结合白粉病抗性表型鉴定与分子标记检测,筛选获得与白粉病抗性相关位点紧密连锁的ssr分子标记ncd7-ssr。本发明分子标记ncd7-ssr在抗病材料ncd7和感病材料fielder中分别扩增出如seq id no.9和seq id no.10所示的特征性序列,一次pcr扩增结合常规电泳即可根据条带差异直接判定待测材料是否携带抗性相关位点,检测结果与抗性表型高度吻合,避免了传统表型鉴定受环境影响导致的误判。

1.一种与小麦抗白粉病相连锁的ssr分子标记,其特征在于,所述ssr分子标记位于小麦fileder 1a染色体上,其遗传位置为5187077bp~5187250bp,对应于小麦1a染色体的第5187077位碱基~第5187250位碱基之间。

2.根据权利要求1所述的ssr分子标记,其特征在于,所述ssr分子标记的检测引物对的上游引物为seq id no.1所示序列,所述ssr分子标记的检测引物对的下游引物为seq idno.2所示序列。

3.如权利要求1或2所述ssr分子标记在小麦白粉病抗性鉴定和/或小麦白粉病抗性育种中的应用。

4.一种检测小麦白粉病抗性的方法,其特征在于,包括:以待测小麦基因组dna为模板,使用权利要求2所述ssr分子标记的检测引物对进行pcr扩增,根据pcr扩增结果检测待测小麦的白粉病抗性。

5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,若待测小麦pcr扩增片段大小为187bp,则判定其为抗白粉病小麦;若待测小麦pcr扩增片段大小为174bp,则判定其为感白粉病小麦。

6.一种检测试剂盒,其特征在于,包含权利要求2所述的ssr分子标记的检测引物对。

7.如权利要求6所述试剂盒在小麦白粉病抗性鉴定和/或小麦白粉病抗性育种中的应用。