CCR1基因与VASN基因相对表达水平在预测胶质瘤预后情况中的应用

摘要: 本发明涉及生物,特别是涉及ccr1基因与vasn基因相对表达水平在预测胶质瘤预后情况中的应用。背景技术:1、胶质瘤是中枢神经系统中最常见且最具侵袭性的原发性恶性...
CCR1基因与VASN基因相对表达水平在预测胶质瘤预后情况中的应用

本发明涉及生物,特别是涉及ccr1基因与vasn基因相对表达水平在预测胶质瘤预后情况中的应用。

背景技术:

1、胶质瘤是中枢神经系统中最常见且最具侵袭性的原发性恶性肿瘤,具有高度的异质性和复杂的分子病理特征。根据世界卫生组织(who)中枢神经系统肿瘤分类标准,胶质瘤可分为多个级别和分子亚型,其中胶质母细胞瘤(glioblastoma,gbm)为ⅳ级,恶性程度最高,患者中位生存期不足15个月。尽管近年来在手术切除、放疗、化疗(如替莫唑胺)及肿瘤电场治疗等方面取得了进展,但胶质瘤患者总体预后仍然较差,且个体间生存差异显著,反映出其复杂的分子机制和异质性。

2、随着高通量测序技术的发展,基于分子标志物的胶质瘤分型标志逐渐建立。目前临床广泛采用的分型体系包括idh突变状态、1p/19q共缺失状态以及mgmt启动子甲基化状态等,这些标志在一定程度上指导了预后判断和治疗决策。此外,基于基因表达谱的分子分型(如proneural、neural、classical、mesenchymal亚型)进一步揭示了胶质瘤内部的异质性。然而,现有分型方法多依赖于组织样本的批量检测,受实验批次、样本处理、数据分析流程等因素影响较大,导致分型结果在不同平台或队列间重复性差,难以稳定应用于单个临床样本。

3、由于胶质瘤的高度异质性,单一生物标志物难以全面反映患者的预后风险。尤其在缺乏有效靶向治疗手段的情况下,识别出稳健的预后标志并构建适用于个体水平的风险评估模型,对于实现精准分层、优化治疗策略、避免过度治疗具有重要意义。

技术实现思路

1、本发明的目的是提供ccr1基因与vasn基因相对表达水平在预测胶质瘤预后情况中的应用,以解决上述现有技术存在的问题。本发明筛选到了与胶质瘤预后有关的极化相关基因对ccr1-vasn。当ccr1基因的表达水平高于vasn基因的表达水平时,提示胶质瘤患者预后更优。本发明提供的极化相关预后生物标志物可应用于高异质性胶质瘤患者的预后评估,具有良好的稳健性和临床推广价值。

2、为实现上述目的,本发明提供了如下方案:

3、本发明提供一种预测胶质瘤患者预后情况的生物标志物,所述生物标志物为ccr1基因与vasn基因的相对表达水平。

4、进一步地,所述ccr1基因在ncbi中的编号为gene id:1230;所述vasn基因在ncbi中的编号为gene id:114990。

5、本发明还提供检测ccr1基因与vasn基因相对表达水平的试剂在制备预测胶质瘤患者预后情况的产品中的应用,ccr1基因表达量高于vasn基因表达量的胶质瘤患者的预后情况优于ccr1基因表达量低于vasn基因表达量的胶质瘤患者。

6、进一步地,所述预后情况是指总生存期或无进展生存期。

7、本发明还提供一种预测胶质瘤患者预后情况的产品,所述产品包含检测ccr1基因表达量和检测vasn基因表达量的试剂。

8、本发明还提供ccr1基因与vasn基因相对表达水平在制备预测胶质瘤患者预后情况的模型产品中的应用,ccr1基因表达量高于vasn基因表达量的胶质瘤患者的预后情况优于ccr1基因表达量低于vasn基因表达量的胶质瘤患者。

9、本发明公开了以下技术效果:

10、本发明通过获取胶质瘤样本的基因表达谱及临床生存信息、人类蛋白质互作网络、以及小胶质细胞m1型和m2型极化标志物,基于随机游走算法优化极化相关标志物,结合表达谱中标志物对的表达差异,并根据样本的生存信息识别与预后相关的基因对;通过将预后相关基因对进行交叠,筛选得到了与胶质瘤预后有关的极化相关基因对ccr1-vasn。当ccr1基因的表达水平高于vasn基因的表达水平时,提示胶质瘤患者预后更优。当ccr1基因表达水平高于vasn基因表达水平,且二者表达水平差异越大,患者生存时间越长;当ccr1基因表达水平低于vasn基因表达水平,且二者表达水平差异越大,患者生存时间越短。本发明提供的极化相关预后标志物可应用于高异质性胶质瘤患者的预后评估,具有良好的稳健性和临床推广价值。

1.一种预测胶质瘤患者预后情况的生物标志物,其特征在于,所述生物标志物为ccr1基因与vasn基因的相对表达水平。

2.根据权利要求1所述的生物标志物,其特征在于,所述ccr1基因在ncbi中的编号为gene id:1230;所述vasn基因在ncbi中的编号为gene id:114990。

3.检测ccr1基因与vasn基因相对表达水平的试剂在制备预测胶质瘤患者预后情况的产品中的应用,其特征在于,ccr1基因表达量高于vasn基因表达量的胶质瘤患者的预后情况优于ccr1基因表达量低于vasn基因表达量的胶质瘤患者。

4.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述预后情况是指总生存期或无进展生存期。

5.一种预测胶质瘤患者预后情况的产品,其特征在于,所述产品包含检测ccr1基因表达量和检测vasn基因表达量的试剂。

6.ccr1基因与vasn基因相对表达水平在制备预测胶质瘤患者预后情况的模型产品中的应用,其特征在于,ccr1基因表达量高于vasn基因表达量的胶质瘤患者的预后情况优于ccr1基因表达量低于vasn基因表达量的胶质瘤患者。