腹泻肠道微生物标志物及其应用的制作方法
本发明属于生物医药领域,具体地涉及一种腹泻肠道微生物标志物及其应用。
背景技术:
1、腹泻可致脱水、营养不良。目前腹泻主要的诊断手段包括临床评估和结肠镜检查等:1)临床评估以病史采集和粪便性状分级(如布里斯托大便分型)为核心,在基层初筛及流行病学调查中应用便捷,但其结果高度依赖患者对排便频率和性状的主观回忆,难以区分功能性腹泻与器质性病变的病因学差异;2)结肠镜检查是诊断炎症性肠病及结直肠肿瘤的金标准,但具有侵入性、费用高昂、肠道准备繁琐等局限,不适用于轻症及基层大规模筛查。
2、因此,虽然当前已有多种腹泻相关的诊断方案,但这些方案仍存在一定局限性,故本领域存在新开发一种产品的需求,以辅助临床准确检测腹泻患者的肠道功能状态,满足不同场景下的诊疗需求。
技术实现思路
1、针对上述技术问题,本发明提供一种腹泻肠道微生物标志物及其应用,其可较准确地诊断待测人员是否患有腹泻。
2、本发明提供的技术方案如下:
3、第一方面,提供一种定量检测微生物标志物的试剂在制备与腹泻相关的产品中的应用,所述微生物标志物包括活泼瘤胃球菌ruminococcus gnavus、简明弯曲杆菌campylobacter concisus和死亡梭杆菌fusobacterium mortiferum,所述活泼瘤胃球菌ruminococcus gnavus、简明弯曲杆菌campylobacter concisus和死亡梭杆菌fusobacterium mortiferum在腹泻患者中明显增加。
4、第二方面,提供一种用于诊断或预测腹泻的肠道微生物标志物,所述微生物标志物包括明显粪球菌coprococcus catus、活泼瘤胃球菌ruminococcus gnavus、死亡梭杆菌fusobacterium mortiferum、黏液罗斯氏菌rothia mucilaginosa、唾液链球菌streptococcus salivarius和简明弯曲杆菌campylobacter concisus。
5、第三方面,提供一种用于诊断或预测腹泻的肠道微生物标志物,所述微生物标志物为以下组合中的任一种:
6、a)所述微生物标志物为由活泼瘤胃球菌ruminococcus gnavus、简明弯曲杆菌campylobacter concisus和死亡梭杆菌fusobacterium mortiferum组成的标志物组合;
7、b)所述微生物标志物为由活泼瘤胃球菌ruminococcus gnavus、黏液罗斯氏菌rothia mucilaginosa、简明弯曲杆菌campylobacter concisus和死亡梭杆菌fusobacterium mortiferum组成的标志物组合;
8、c)所述微生物标志物为由简明弯曲杆菌campylobacter concisus、黏液罗斯氏菌rothia mucilaginosa、明显粪球菌coprococcus catus、唾液链球菌streptococcussalivarius、活泼瘤胃球菌ruminococcus gnavus、死亡梭杆菌fusobacterium mortiferum组成的标志物组合。
9、第三方面,提供一种诊断或预测腹泻的产品,所述产品包括试剂、试纸、适配体和芯片中的一种或多种,所述产品所述的微生物标志物具有特异性,并用于定量检测所述的微生物标志物。
10、第四方面,提供一种诊断或预测腹泻的试剂盒,所述试剂盒内装有用于定量检测所述的微生物标志物的试剂。
11、第五方面,提供一种试剂盒在制备诊断腹泻的产品中的应用,所述明显粪球菌coprococcus catus和唾液链球菌streptococcus salivarius在腹泻患者中呈现明显减少;所述活泼瘤胃球菌(ruminococcus gnavus)、黏液罗斯氏菌rothia mucilaginosa、简明弯曲杆菌campylobacter concisus和死亡梭杆菌fusobacterium mortiferum在腹泻患者中呈现明显增加。
12、需要说明的是,本发明新发现并验证了上述多种肠道微生物与腹泻具有强相关性,可以用于诊断待测人员是否患有腹泻。在此基础上,虽然本发明在实施例中仅列举了如何通过相对丰度值实现对待测样本进行定量检测,但其它可以对微生物实现定量检测的手段也是可行的(如绝对丰度或总微生物载量信息等手段),也可以用于辅助诊断待测人员是否患有腹泻,人们可以根据自身的需要进行选择,在此不做赘述。
13、本发明的有益效果如下:
14、1、本发明新发现6种与腹泻相关的肠道微生物,包括:唾液链球菌streptococcussalivarius、活泼瘤胃球菌ruminococcus gnavus、死亡梭杆菌fusobacteriummortiferum、黏液罗斯氏菌rothia mucilaginosa、简明弯曲杆菌campylobacter concisus和明显粪球菌coprococcus catus。
15、经过研究、验证后发现,对腹泻患者而言,上述6种肠道微生物中的一种或几种,可以用于诊断待测人员是否患有腹泻。
16、2、本发明还提供了一种试剂和/或试剂盒,能够以上述6种菌种中的某个或某几个作为检测标志物(也即微生物标志物),以诊断待测人员是否患有腹泻,完全无创,准确性高。
17、通过宏基因组学测序手段,提供更高的分辨率,使得对微生物群落的分析能够深入到菌种甚至是菌株的水平,从而提高诊断的准确性和可靠性。所述6种菌种还可作为开发这些系统的靶标微生物,填补了这一领域的空白。
18、3、本发明还提供了用于诊断腹泻的产品。该产品能够实现基于各菌种的相对丰度值诊断待测人员患有腹泻的风险,整个诊断过程安全、无创且高效,其具有良好的可行性和准确性,可以有效地评估待测人员(的粪便样本)患腹泻的风险,评估结果较准确。
1.一种定量检测微生物标志物的试剂在制备诊断腹泻的产品中的应用,其特征在于,所述微生物标志物包括活泼瘤胃球菌ruminococcus gnavus、简明弯曲杆菌campylobacterconcisus和死亡梭杆菌fusobacterium mortiferum,所述活泼瘤胃球菌ruminococcusgnavus、简明弯曲杆菌campylobacter concisus和死亡梭杆菌fusobacterium mortiferum在腹泻患者中明显增加。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述微生物标志物还包括黏液罗斯氏菌rothia mucilaginosa和/或明显粪球菌coprococcus catus,所述明显粪球菌coprococcuscatus在腹泻患者中明显减少,所述黏液罗斯氏菌rothia mucilaginosa在腹泻患者中明显增加。
3.根据权利要求1或2所述的应用,其特征在于,所述微生物标志物还包括唾液链球菌streptococcus salivarius,所述唾液链球菌streptococcus salivarius在腹泻患者中明显减少。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,所述微生物标志物为由简明弯曲杆菌campylobacter concisus、黏液罗斯氏菌rothia mucilaginosa、明显粪球菌coprococcuscatus、唾液链球菌streptococcus salivarius、活泼瘤胃球菌ruminococcus gnavus、死亡梭杆菌fusobacterium mortiferum组成的标志物组合,所述明显粪球菌coprococcuscatus和唾液链球菌streptococcus salivarius在腹泻患者中呈现明显减少;所述活泼瘤胃球菌(ruminococcus gnavus)、黏液罗斯氏菌rothia mucilaginosa、简明弯曲杆菌campylobacter concisus和死亡梭杆菌fusobacterium mortiferum在腹泻患者中呈现明显增加。
5.一种用于诊断或预测腹泻的肠道微生物标志物,其特征在于,所述微生物标志物包括明显粪球菌coprococcus catus、活泼瘤胃球菌ruminococcus gnavus、死亡梭杆菌fusobacterium mortiferum、黏液罗斯氏菌rothia mucilaginosa、唾液链球菌streptococcus salivarius和简明弯曲杆菌campylobacter concisus。
6.一种用于诊断或预测腹泻的肠道微生物标志物,其特征在于,所述微生物标志物为以下组合中的任一种:
7.一种诊断或预测腹泻的产品,其特征在于:所述产品包括试剂、试纸、适配体和芯片中的一种或多种,所述产品对权利要求5或6所述的微生物标志物具有特异性,并用于定量检测权利要求5或6所述的微生物标志物。
8.一种诊断或预测腹泻的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒内装有用于定量检测权利要求5或6所述的微生物标志物的试剂。
9.权利要求8所述的试剂盒在制备诊断腹泻的产品中的应用,所述明显粪球菌coprococcus catus和唾液链球菌streptococcus salivarius在腹泻患者中呈现明显减少;所述活泼瘤胃球菌(ruminococcus gnavus)、黏液罗斯氏菌rothia mucilaginosa、简明弯曲杆菌campylobacter concisus和死亡梭杆菌fusobacterium mortiferum在腹泻患者中呈现明显增加。