肠易激综合征肠道微生物标志物及其应用的制作方法
本发明属于生物医药领域,具体地涉及一种肠易激综合征肠道微生物标志物及其应用。
背景技术:
1、目前,肠易激综合征(ibs)的诊断主要依靠基于症状的罗马标准进行阳性诊断,并辅以粪便钙卫蛋白等检查以排除器质性疾病,其主要存在以下缺陷:1)症状标准本身不完善:罗马iv标准为追求特异性(85.1%)而牺牲了敏感性(82.1%),易漏诊症状较轻的患者。同时,其以“腹痛”为核心的定义可能不适用于中国以“腹胀”为主要诉求的患者;2)缺乏客观生物标志物:诊断完全依赖患者主观描述,易受回忆偏倚影响,且ibs的高度异质性也使得单一标志物难以实现精准诊断。
2、因此,虽然当前已有肠易激综合征(ibs)的诊断方案,但该诊断仍存在一定局限性,故本领域存在新开发一种产品的需求,以辅助临床准确检测肠易激综合征(ibs)患者的肠道功能状态,以满足不同场景下的诊疗需求。
技术实现思路
1、针对上述技术问题,本发明提供一种肠易激综合征肠道微生物标志物及其应用,其可较准确地诊断待测人员是否患有肠易激综合征。
2、本发明提供的技术方案如下:
3、第一方面,提供一种定量检测微生物标志物的试剂在制备诊断肠易激综合征的产品中的应用,所述微生物标志物包括活泼瘤胃球菌(ruminococcus gnavus)、丹毒丝科菌细菌(erysipelotrichaceae bacterium)和沃氏嗜胆菌(bilophila wadsworthia),所述活泼瘤胃球菌(ruminococcus gnavus)、沃氏嗜胆菌(bilophila wadsworthia)和丹毒丝科菌细菌(erysipelotrichaceae bacterium)在肠易激综合征人群组中显著增加。
4、第二方面,提供一种与肠易激综合征相关的微生物标志物,所述微生物标志物包括活泼瘤胃球菌(ruminococcus gnavus)、丹毒丝科菌细菌(erysipelotrichaceaebacterium)、沃氏嗜胆菌(bilophila wadsworthia)和丹毒丝科菌细菌(erysipelotrichaceae bacterium)。
5、第三方面,提供一种诊断或预测肠易激综合征的产品,所述产品包括试剂、试纸、适配体和芯片中的一种或多种,所述产品所述的微生物标志物具有特异性,并用于定量检测所述的微生物标志物。
6、第四方面,提供一种试剂盒,所述试剂盒内装有用于定量检测所述的微生物标志物的试剂。
7、第五方面,提供一种试剂盒在制备诊断肠易激综合征的产品中的应用,所述长双歧杆菌(bifidobacterium longum)、多形拟杆菌(bacteroides thetaiotaomicron)和食物魏斯氏菌(weissella cibaria)在肠易激综合征人群组中显著减少;所述活泼瘤胃球菌(ruminococcus gnavus)、沃氏嗜胆菌(bilophila wadsworthia)和丹毒丝科菌细菌(erysipelotrichaceae bacterium)在肠易激综合征人群组中显著增加。
8、需要说明的是,本发明新发现并验证了上述多种肠道微生物与肠易激综合征具有强相关性,可以用于诊断待测人员是否患有肠易激综合征。在此基础上,虽然本发明在实施例中仅列举了如何通过相对丰度值实现对待测样本进行定量检测,但其它可以对微生物实现定量检测的手段也是可行的(如绝对丰度或总微生物载量信息等手段),也可以用于辅助诊断待测人员是否患有肠易激综合征,人们可以根据自身的需要进行选择,在此不做赘述。
9、本发明的有益效果如下:
10、1、本发明新发现6种与肠易激综合征相关的肠道微生物,包括:食物魏斯氏菌(weissella cibaria)、沃氏嗜胆菌(bilophila wadsworthia)、丹毒丝科菌细菌(erysipelotrichaceae bacterium)、长双歧杆菌(bifidobacterium longum)、多形拟杆菌(bacteroides thetaiotaomicron)和活泼瘤胃球菌(ruminococcus gnavus)。
11、经过研究、验证后发现,对肠易激综合征患者而言,上述6种肠道微生物中的一种或几种,可以用于诊断待测人员是否患有肠易激综合征。
12、2、本发明还提供了一种试剂和/或试剂盒,能够以上述6种菌种中的某个或某几个作为检测标志物(也即微生物标志物),以诊断待测人员是否患有肠易激综合征,完全无创,准确性高。
13、通过宏基因组学测序手段,提供更高的分辨率,使得对微生物群落的分析能够深入到菌种甚至是菌株的水平,从而提高诊断的准确性和可靠性。所述6种菌种还可作为开发这些系统的靶标微生物,填补了这一领域的空白。
14、3、本发明还提供了用于诊断肠易激综合征的产品和/或预测系统。该产品和/或预测系统能够实现基于各菌种的相对丰度值诊断待测人员患有肠易激综合征的风险,整个诊断过程安全、无创且高效,其具有良好的可行性和准确性,可以有效地评估待测人员(的粪便样本)患肠易激综合征的风险,评估结果较准确。
1.一种定量检测微生物标志物的试剂在制备诊断肠易激综合征的产品中的应用,其特征在于,所述微生物标志物包括活泼瘤胃球菌(ruminococcus gnavus)、丹毒丝科菌细菌(erysipelotrichaceae bacterium)和沃氏嗜胆菌(bilophila wadsworthia),所述活泼瘤胃球菌(ruminococcus gnavus)、沃氏嗜胆菌(bilophila wadsworthia)和丹毒丝科菌细菌(erysipelotrichaceae bacterium)在肠易激综合征人群组中显著增加。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述微生物标志物还包括食物魏斯氏菌(weissella cibaria),所述食物魏斯氏菌(weissella cibaria)在肠易激综合征人群组中呈现明显减少。
3.根据权利要求1或2所述的应用,其特征在于,所述微生物标志物还包括长双歧杆菌(bifidobacterium longum)和/或多形拟杆菌(bacteroides thetaiotaomicron),所述长双歧杆菌(bifidobacterium longum)和多形拟杆菌(bacteroides thetaiotaomicron)在肠易激综合征人群组中呈现明显减少。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,所述微生物标志物为由食物魏斯氏菌(weissella cibaria)、沃氏嗜胆菌(bilophila wadsworthia)、丹毒丝科菌细菌(erysipelotrichaceae bacterium)、长双歧杆菌(bifidobacterium longum)、多形拟杆菌(bacteroides thetaiotaomicron)和活泼瘤胃球菌(ruminococcus gnavus)组成的标志物组合;
5.一种与肠易激综合征相关的微生物标志物,其特征在于,所述微生物标志物包括活泼瘤胃球菌(ruminococcus gnavus)、丹毒丝科菌细菌(erysipelotrichaceae bacterium)和沃氏嗜胆菌(bilophila wadsworthia)。
6.根据权利要求5所述的微生物标志物,其特征在于,所述微生物标志物还包括长双歧杆菌(bifidobacterium longum)、多形拟杆菌(bacteroides thetaiotaomicron)和食物魏斯氏菌(weissella cibaria)中的一种或多种。
7.根据权利要求6所述的微生物标志物,其特征在于,所述微生物标志物为由食物魏斯氏菌(weissella cibaria)、沃氏嗜胆菌(bilophila wadsworthia)、丹毒丝科菌细菌(erysipelotrichaceae bacterium)、长双歧杆菌(bifidobacterium longum)、多形拟杆菌(bacteroides thetaiotaomicron)和活泼瘤胃球菌(ruminococcus gnavus)组成的标志物组合。
8.一种诊断或预测肠易激综合征的产品,其特征在于:所述产品包括试剂、试纸、适配体和芯片中的一种或多种,所述产品对权利要求5至7中任一项所述的微生物标志物具有特异性,并用于定量检测权利要求5至7中任一项所述的微生物标志物。
9.一种试剂盒,其特征在于:所述试剂盒内装有用于定量检测权利要求5至7中任一项所述的微生物标志物的试剂。
10.权利要求9所述的试剂盒在制备诊断肠易激综合征的产品中的应用,所述长双歧杆菌(bifidobacterium longum)、多形拟杆菌(bacteroides thetaiotaomicron)和食物魏斯氏菌(weissella cibaria)在肠易激综合征人群组中显著减少;所述活泼瘤胃球菌(ruminococcus gnavus)、沃氏嗜胆菌(bilophila wadsworthia)和丹毒丝科菌细菌(erysipelotrichaceae bacterium)在肠易激综合征人群组中显著增加。
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