用于梅花鹿亲子鉴定和个体识别的分子标记、引物及应用

技术特征：
1.用于梅花鹿亲子鉴定和个体识别的ssr标记，其特征是，所述ssr标记位点信息如下：2.用于梅花鹿亲子鉴定和个体识别的引物组，其特征在于，包括16对引物对，所述引物对序列分别如seq id no.1-32所示；所述引物组用于扩增权利要求1所述ssr标记。3.如权利要求2所述用于梅花鹿亲子鉴定和个体识别的引物组，其特征在于，所述引物5’端带有荧光标记。4.一种梅花鹿亲子鉴定方法，其特征在于，利用权利要求2或3所述的引物组中的部分或全部作为引物，以梅花鹿基因组dna作为模板分别进行荧光引物pcr反应，获得带荧光的pcr产物，然后再进行毛细管电泳、基因分型，判断样本之间是否为亲子关系。5.一种梅花鹿个体识别方法，其特征在于，利用权利要求2或3所述的引物组中的部分或全部作为引物，以梅花鹿基因组dna作为模板分别进行荧光引物pcr反应，获得带荧光的pcr产物，然后再进行毛细管电泳、基因分型，即可判断样本是否来源于同一个体。6.一种用于梅花鹿亲子鉴定和/或个体识别的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括权利要求2或3所述引物组。7.权利要求6所述试剂盒的使用方法，其特征在于，当待鉴定的两个亲本基因型均已知的情况下，可以用5-16对引物进行鉴定；所述5对引物为扩增mhl06、mhl25、mhl44、mhl30、
mhl58位点的引物；所述方法，当待鉴定的两个亲本基因型均已知的情况下，cpe-p>99.99％。8.权利要求6所述试剂盒的使用方法，其特征在于，当待鉴定的两个亲本其中一方基因型已知的情况下，可以用9-16对引物进行鉴定：所述9对引物为扩增mhl06、mhl25、mhl44、mhl30、mhl58、mhl02、mhl03、mhl84、mhl34位点的引物；所述方法，当待鉴定的两个亲本其中一方基因型已知的情况下，cpe-2>99.99％。9.权利要求6所述试剂盒的使用方法，其特征在于，当两个亲本基因型均未知的情况下，用全部16对引物进行亲子鉴定，cpe-1>99.98％。10.权利要求6所述试剂盒的使用方法，其特征在于，当用于梅花鹿个体识别时，可以采用5-8对引物对；所述5对引物为扩增mhl06、mhl25、mhl44、mhl30和mhl58这5个位点的引物对；当采用5对引物对时，pid<0.000001，pid(sib)为0.004446，可达到梅花鹿个体识别所需最少位点数；所述8对引物为扩增mhl02、mhl03、mhl06、mhl25、mhl30、mhl44、mhl58、mhl84这8个位点的引物对；当采用8对引物对时，累计个体识别率大于99.99％，累计全同胞识别率大于99.97％。

技术总结
本发明提供用于梅花鹿亲子鉴定和个体识别的分子标记、引物及应用，旨在解决现有梅花鹿亲子鉴定中存在的实际应用的问题。本发明提供16个高多态性位点，包括15个四碱基重复位点和1个六碱基重复位点，16个高多态性位点的多态信息含量在0.645～0.892之间，平均为0.7428。当16个位点用于梅花鹿亲子鉴定时，三种结合排除概率分别为；0.999824、0.999999、大于0.999999，均大于国际亲子鉴定的通用值0.9973。将其中8个位点用于个体识别时，累计个体识别率大于99.99％，累计全同胞识别率大于99.97％。本发明克服了现有方法存在的不能精准鉴定的问题，用于梅花鹿亲子鉴定及个体识别精准高效，具有实际应用价值，且可以在多个梅花鹿品种中使用，极具应用前景。极具应用前景。极具应用前景。


技术研发人员：邢秀梅 卢凯妹 王天骄 董依萌
受保护的技术使用者：中国农业科学院特产研究所
技术研发日：2022.06.20
技术公布日：2022/9/13