一种与多鳞鱚性别性状相关的QTL位点的构建方法

技术特征：
1.一种与多鳞鱚性别性状相关的qtl位点的构建方法，其特征是包括以下步骤：(s1)选取性成熟多鳞鱚雌雄个体为亲本，父母本个体杂交产生f1代全同胞家系，提取各样品的基因组dna；(s2)利用gbs技术对父母本以及161份f1代个体进行基因分型，并对snp标记过滤，共获得107406个多态性snp位点，接着以已知染色体水平的参考基因组为参考，根据标记的物理位置信息将其归并成对应的连锁群，去除非染色体上的标记，在每个遗传位置的标记中取完整度最高(缺失率最低)的标记作为作图标记，最终获得4735个snp标记用于构建整合图谱；(s3)利用步骤(s2)中的4735个筛选出来的snp标记构建遗传图谱；(s4)对步骤(s1)中的父母本及f1代全同胞家系群体进行性别性状表型鉴定；(s5)分析步骤(s3)构建的遗传图谱和步骤(s4)的性别性状表型鉴定结果，使用r/qtl对性别性状进行区间作图，得到与性别性状相关的qtl位点，共得出3个与性别性状相关的qtl位点，三个qtl位点均位于第18号染色体上，分别命名为qsex-18-1、qsex-18-2和qsex-18-3。2.根据权利要求1所述的与多鳞鱚性别性状相关的qtl位点的构建方法，其特征是：步骤(s2)中对snp标记过滤时，去除分型比例低于30％的位点，去除杂合比例大于75％的位点，按理论比对标记位点的基因型比例进行卡方检验，p值小于0.001的位点视为严重偏分离位点并去除，保留分离类型为lmxll、nnxnp和hkxhk的标记，共获得107406个多态性snp位点。3.根据权利要求1所述的与多鳞鱚性别性状相关的qtl位点的构建方法，其特征是：步骤(s2)中4735个snp标记具有如下所示的多态性标签及连锁群上的分布：
。4.根据权利要求1所述的与多鳞鱚性别性状相关的qtl位点的构建方法，其特征是：步骤(s3)中使用perl-svg模型构建遗传图谱。5.根据权利要求1所述的与多鳞鱚性别性状相关的qtl位点的构建方法，其特征是：步骤(s4)中通过解剖性腺对步骤(1)中的父母本及f1代全同胞家系群体进行性别性状表型鉴定。6.根据权利要求1所述的与多鳞鱚性别性状相关的qtl位点的构建方法，其特征是：步骤(s5)中使用r/qt1对性别性状进行区间作图，扫描步长为1cm，使用lod＝4.0做为阈值筛选qtl。7.根据权利要求1所述的与多鳞鱚性别性状相关的qtl位点的构建方法，其特征是：步骤(s5)中各qtl位点的区间如下：qtl连锁群markerpeak position区间(cm)qsex-18-1lg18lg175959092.761080-12.886qsex-18-2lg18lg17532224926.3837318.714-28.224qsex-18-3lg18lg17806990138.6570728.531-48.475。

技术总结
本发明公开了一种与多鳞鱚性别性状相关的QTL位点的构建方法，该方法利用GBS技术对161份多鳞鱚全同胞F1代及父母本个体进行测序并开发SNP标记，构建了多鳞鱚高密度遗传连锁图谱，所述分子标记共计4735个，分布于24个连锁群上。结合性别表型数据进行连锁定位分析，共筛选出3个与性别性状关联的稳定QTL位点。这些QTL位点在多鳞鱚性别性状分子标记辅助育种中具有良好的应用前景。这些多鳞鱚SNP分子标记可以在遗传图谱构建、性别性状定位中的应用。用。用。


技术研发人员：田昌绪 朱奕安 黄洋 林星桦 李广丽 朱春华 陈华谱 邓思平 江东能
受保护的技术使用者：广东海洋大学
技术研发日：2022.04.18
技术公布日：2022/7/15