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预测BRCA突变患者对侧乳腺癌发病风险的模型及应用

2022-06-08 13:42:09 来源:中国专利 TAG:

技术特征:
1.一种预测brca突变患者对侧乳腺癌发病风险的模型,其特征在于,所述模型为:lp=β1×
x1 β2×
x2 β3×
x3 β4×
x4;其中,lp为风险分值;x1为突变位点靠近brca1/2基因的3' cdna编码区的风险因素,x2为一级亲属乳腺癌和卵巢癌家族史的风险因素,x3为乳腺癌首诊年龄的风险因素,x4为激素受体状态的风险因素,β1、β2、β3、β4为各项风险因素的偏回归系数。2.根据权利要求1所述的预测brca突变患者对侧乳腺癌发病风险的模型,其特征在于,所述风险因素x1的偏回归系数β1取值范围为0.72-0.75,所述风险因素x2的偏回归系数β2取值范围为0.73-0.76,所述风险因素x3的偏回归系数β3取值范围为0.79-0.82,所述风险因素x4的偏回归系数β4取值范围为0.62-0.64。3.根据权利要求1所述的预测brca突变患者对侧乳腺癌发病风险的模型,其特征在于,所述突变位点靠近brca1/2基因的3' cdna编码区具体包括:突变位点位于brca1 c.4072 to 3'或brca2 c.6402 to 3'区域。4.根据权利要求1所述的预测brca突变患者对侧乳腺癌发病风险的模型,其特征在于,所述突变位点为brca突变乳腺癌患者的brca1/2突变位点,若患者的突变位点位于brca1 c.4072-3'或brca2 c.6402-3'则x1为1,患者的突变位点位于brca1 5'-c.4071或brca2 5'-c.6401则x1为0;所述一级亲属乳腺癌和卵巢癌家族史为brca突变乳腺癌患者的一级亲属乳腺癌和卵巢癌家族史,当一级亲属乳腺癌和卵巢癌家族史≥1例时,x2为1,无一级亲属乳腺癌和卵巢癌家族史时,x2为0;所述乳腺癌首诊年龄为brca突变乳腺癌患者的乳腺癌首诊年龄,当乳腺癌首诊年龄≤45岁时,x3为1,当乳腺癌首诊年龄>45岁时,x3为0;所述激素受体状态为brca突变乳腺癌患者的激素受体状态,当激素受体阳性时,x4为1,当激素受体阴性时,x4为0。5.根据权利要求1所述的预测brca突变患者对侧乳腺癌发病风险的模型,其特征在于,基于所述模型生成列线图。6.根据权利要求5所述的预测brca突变患者对侧乳腺癌发病风险的模型,其特征在于,所述列线图第一行为分值标尺;第二行为brca1/2突变位点,突变位点为brca1 c.4072-3'或brca2 c.6402-3'则选择“within 3'_cluster_region”,患者的突变位点为brca1 5'-c.4071或brca2 5'-c.6401则选“outside 3'_cluster_region”, 所述brca1/2突变位点分别对应第一行的一个相应分值;第三行为患者一级亲属乳腺癌和卵巢癌家族史,分别为一级亲属乳腺癌和卵巢癌家族史≥1例一级患病亲属,以及无一级患病亲属,并分别对应第一行一个相应分值;第四行为患者乳腺癌首诊年龄,分别为乳腺癌首诊年龄≤45,以及乳腺癌首诊年龄>45,并分别对应第一行一个相应分值;第五行为患者激素受体状态,分别为激素受体状态呈阳性,以及激素受体状态呈阴性,并分别对应第一行的相应分值;第六行为患者总分值,将第二至第五行的4个指标在第一行对应的分值进行相加,得出总分值,在第六行选择总分分值,对应投射至第七、八行上,分别得出患者5年及10年的对侧乳腺癌发病风险预测值。7.一种构建如上述权利要求1-6任意一项所述模型的方法,其特征在于,选取诊断为单侧乳腺癌、检测有brca1/2致病胚系突变的乳腺癌患者的样本数据;通过cox比例风险模型筛选所述样本数据中的突变位点靠近brca1/2基因的3' cdna编码区、一级亲属乳腺癌和卵巢癌家族史、乳腺癌首诊年龄、激素受体状态进行多因素分析;
得到所述模型为:lp=β1×
x1 β2×
x2 β3×
x3 β4×
x4;其中,lp为风险分值;x1为突变位点靠近brca1/2基因的3' cdna编码区的风险因素,x2为一级亲属乳腺癌和卵巢癌家族史的风险因素,x3为乳腺癌首诊年龄的风险因素,x4为激素受体状态的风险因素,β1、β2、β3、β4为各项风险因素的偏回归系数。8.一种利用上述权利要求1-6任意一项所述模型的预测方法,其特征在于,获取待测用户的数据;将所述待测用户的数据输入到所述模型中,计算该待测用户针对不同累积时间的brca突变患者对侧乳腺癌发病风险的评估值。9.一种构建如上述权利要求1-6任意一项所述模型的装置,其特征在于,训练样本数据获取单元,用于选取诊断为单侧乳腺癌、检测有brca1/2致病胚系突变的乳腺癌患者的样本数据;数据分析单元,用于通过cox比例风险模型筛选所述样本数据中的突变位点靠近brca1/2基因的3' cdna编码区、乳腺癌首诊年龄、一级亲属乳腺癌和卵巢癌家族史、激素受体状态进行多因素分析;模型输出单元,用于得到所述模型:lp=β1×
x1 β2×
x2 β3×
x3 β4×
x4;其中,lp为风险分值;x1为突变位点靠近brca1/2基因的3' cdna编码区的风险因素,x2为一级亲属乳腺癌和卵巢癌家族史的风险因素,x3为乳腺癌首诊年龄的风险因素,x4为激素受体状态的风险因素,β1、β2、β3、β4为各项风险因素的偏回归系数。10.一种计算机设备,其特征在于,包括存储器、处理器及存储在存储器上并可在处理器上运行的计算机程序,所述处理器执行所述计算机程序时实现上述权利要求7或8任意一项的方法。

技术总结
本申请涉及医疗技术领域,尤其涉及预测BRCA突变患者对侧乳腺癌发病风险的模型及应用。本发明基于BRCA突变乳腺癌患者的BRCA突变数据及临床特征数据基础,通过COX比例风险模型建立BRCA突变乳腺癌患者对侧乳腺癌发病风险的模型。所述模型具有个体化、简便等优点,能够对BRCA突变乳腺癌患者的对侧乳腺癌发病风险进行有效评估,对个体化风险监测、优化临床治疗决策及加强临床风险干预具有重要的指导意义。意义。意义。


技术研发人员:解云涛 孙洁 姚璐 张娟 徐晔 胡丽
受保护的技术使用者:北京肿瘤医院(北京大学肿瘤医院)
技术研发日:2022.05.09
技术公布日:2022/6/7
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