急性腹泻标志基因及其应用的制作方法

技术特征：
1.一种试剂盒，其特征在于，包括适于检测第一基因集中的至少一个基因的试剂，所述第一基因集由以下基因组成：gi_0066549、gi_0066550、gi_0066551、gi_0066552、gi_0066553和gi_0062833，其中，所述第一基因集中的基因与seq id no：1-6所示的核酸序列一一对应，所述第一基因集中的基因与其对应的seq id no：1-6中的序列具有不小于90％的同一性。2.根据权利要求1所述的试剂盒，其特征在于，进一步包括适于检测第二基因集中的至少一个基因的试剂，所述第二基因集由以下基因组成：gi_0003561、gi_0004803、gi_0006046、gi_0007244和gi_0010144，其中，所述第二基因集中的基因与seq id no：7-11所示的核酸序列一一对应，所述第二基因集中的基因与其对应的seq id no：7-11所示的核酸序列具有不小于90％的同一性。3.根据权利要求1所述的试剂盒，其特征在于，包括适于检测所述第一基因集中全部所述基因的试剂。4.根据权利要求2所述的试剂盒，其特征在于，包括适于检测所述第二基因集中全部所述基因的试剂。5.试剂在制备试剂盒中的用途，所述试剂适于检测第一基因集中的至少一种基因，所述试剂盒用于诊断急性腹泻或者检测急性腹泻的治疗效果，所述第一基因集由以下基因组成：gi_0066549、gi_0066550、gi_0066551、gi_0066552、gi_0066553和gi_0062833，其中，所述第一基因集中的基因与seq id no：1-6所示的核酸序列一一对应，所述第一基因集中的基因与其对应的seq id no：1-6中的序列具有不小于90％的同一性。6.根据权利要求5所述的用途，其特征在于，所述试剂进一步适于检测第二基因集中的至少一种基因，所述第二基因集由以下基因组成：gi_0003561、gi_0004803、gi_0006046、gi_0007244和gi_0010144，其中，所述第二基因集中的基因与seq id no：7-11所示的核酸序列一一对应，所述第二基因集中的基因与其对应的seq id no：7-11所示的核酸序列具有不小于90％的同一性。7.一种用于预防或者治疗急性腹泻的药物组合物或者食品组合物，其特征在于，含有提高第二基因集中的至少一种基因丰度的物质，所述第二基因集由以下基因组成：gi_0003561、gi_0004803、gi_0006046、gi_0007244和gi_0010144，其中，所述第二基因集中的基因与seq id no：7-11所示的核酸序列一一对应，所述第二基因集中的基因与其对应的seq id no：7-11所示的核酸序列具有不小于90％的同一性。8.一种确定个体是否患有急性腹泻的方法，其特征在于，包括：(1)确定所述个体的粪便样本中标志基因的丰度，所述标志基因包括第一基因集和第二基因集中的至少一种基因；(2)将步骤(1)中得到的所述丰度与预定的阈值进行比较，以便确定所述个体是否患有急性腹泻；其中，所述第一基因集由以下基因组成：gi_0066549、gi_0066550、gi_0066551、gi_0066552、gi_0066553和gi_0062833，其中，所述第一基因集中的基因与seq id no：1-6所示的核酸序列一一对应，所述第一基因集中的基因与其对应的seq id no：1-6中的序列具有不小于90％的同一性；所述第二基因集由以下基因组成：gi_0003561、gi_0004803、gi_0006046、gi_0007244
和gi_0010144，其中，所述第二基因集中的基因与seq id no：7-11所示的核酸序列一一对应，所述第二基因集中的基因与其对应的seq id no：7-11所示的核酸序列具有不小于90％的同一性。9.根据权利要求8所述的方法，其特征在于，步骤(1)进一步包括：获得所述个体的粪便样本中的核酸测序数据；将所述测序数据与参考基因组进行比对；基于所述比对的结果，确定所述标志基因的丰度。10.一种确定个体是否患有急性腹泻的装置，其特征在于，包括：丰度确定单元，用于确定所述个体的粪便样本中标志基因的丰度，所述标志基因包括第一基因集和第二基因集中的至少一种基因；比较单元，用于将所得到的所述丰度与预定的阈值进行比较，以便确定所述个体是否患有急性腹泻；其中，所述第一基因集由以下基因组成：gi_0066549、gi_0066550、gi_0066551、gi_0066552、gi_0066553和gi_0062833，其中，所述第一基因集中的基因与seq id no：1-6所示的核酸序列一一对应，所述第一基因集中的基因与其对应的seq id no：1-6中的序列具有不小于90％的同一性；所述第二基因集由以下基因组成：gi_0003561、gi_0004803、gi_0006046、gi_0007244和gi_0010144，其中，所述第二基因集中的基因与seq id no：7-11所示的核酸序列一一对应，所述第二基因集中的基因与其对应的seq id no：7-11所示的核酸序列具有不小于90％的同一性。11.根据权利要求10所述的装置，其特征在于，所述丰度确定单元适于通过下列步骤确定所述丰度：获得所述个体的粪便样本中的核酸测序数据；将所述测序数据与参考基因组进行比对；基于所述比对的结果，确定所述标志基因的丰度。12.一种装置，其特征在于，包括：计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序，所述程序用于执行权利要求8或9所述的方法；以及一个或者多个处理器，用于执行所述计算机可读存储介质中的程序。13.一种筛选药物的方法，其特征在于，所述药物用于治疗或者预防急性腹泻，所述方法包括：将候选药物施用于受试者，检测施用前后，所述受试者粪便中标志基因的丰度，所述标志基因包括第一基因集和第二基因集中的至少一种基因，其中，满足下列条件至少之一的候选药物适于用于治疗或者预防急性腹泻：(1)进行所述施用后，所述第一基因集中的至少一种基因的所述丰度降低；和(2)进行所述施用后，所述第二基因集中的至少一种基因的所述丰度升高；其中，所述第一基因集由以下基因组成：gi_0066549、gi_0066550、gi_0066551、gi_0066552、gi_0066553和gi_0062833，其中，所述第一基因集中的基因与seq id no：1-6所示
的核酸序列一一对应，所述第一基因集中的基因与其对应的seq id no：1-6中的序列具有不小于90％的同一性；所述第二基因集由以下基因组成：gi_0003561、gi_0004803、gi_0006046、gi_0007244和gi_0010144，其中，所述第二基因集中的基因与seq id no：7-11所示的核酸序列一一对应，所述第二基因集中的基因与其对应的seq id no：7-11所示的核酸序列具有不小于90％的同一性。

技术总结
本发明提出了一种急性腹泻基因标志物及其应用，该急性腹泻基因标志物包括第一基因集，因此，进一步提出了一种试剂盒，包括适于检测第一基因集中的至少一种基因的试剂，所述第一基因集中的基因与SEQ ID NO：1-6所示的核酸序列一一对应，所述第一基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO：1-6中的序列具有不小于90％的同一性。本发明提出的基因相较于健康个体，在急性腹泻患者群体中显著富集，能够准确区分健康群体和急性腹泻患者群体，可以作为检测和/或治疗急性腹泻的标志物。或治疗急性腹泻的标志物。


技术研发人员：王广冬 谢秋瑾 马玮
受保护的技术使用者：上海锐翌生物科技有限公司
技术研发日：2021.12.31
技术公布日：2022/5/20