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一种调控原癌基因MYB的长链非编码RNA及其应用的制作方法

2022-03-13 23:40:48 来源:中国专利 TAG:

一种调控原癌基因myb的长链非编码rna及其应用
技术领域
1.发明涉及分子生物学和医药领域,具体为一种调控原癌基因myb的长链非编码rna。


背景技术:

2.myb是一种广泛存在于真核生物中,并在进化上高度保守的原癌基因,其主要的生物学效应为调节细胞增殖分化。已有较多的研究表明,myb在白血病中高度表达,能够作为转录因子,调控癌细胞的增殖、分化、侵袭等过程,是白血病发生的驱动因素。因此,myb在白血病的检测和治疗中发挥着重要作用。
3.目前白血病的治疗主要以化疗和骨髓移植为主,化疗副作用大,临床易复发,而骨髓移植费用较高,骨髓来源少,导致白血病的总生存率仍然较低。因此,临床上需要寻找早期而敏感的治疗靶点并探索有效的治疗方法,以更好地降低白血病的死亡率。长链非编码rna(long non-coding rna,lncrna)是指转录本长度大于200个核苷酸,且不具备蛋白质编码功能的一类rna。研究表明,lncrna 可以在表观遗传、转录以及转录后水平调控基因的表达。此外,lncrna还参与多种重要的生命调控过程,包括基因组印记、染色质修饰、rna代谢、蛋白质功能活性以及染色质重塑等。且已被证实,lncrna与人类疾病的发生发展密切相关,参与多种肿瘤的发生发展过程,但lncrna在白血病中的研究仍处于起步阶段。
4.已有研究发现,远端调控元件在myb表达调控中具有非常重要的作用,myb 上游区域的dna序列可以与myb启动子形成dna-loop,并募集转录因子 hoxa9、pu.1和结构蛋白ctcf和cohesin等远端调控myb基因的转录。而lncrna 在白血病的发生和发展过程中可通过多种机制调控细胞增殖、凋亡等过程,发挥促癌或抑癌作用。近年来,虽然关于lncrna的研究进展迅猛,但是绝大部分的 lncrna的功能仍然是不清楚的,本发明在myb上游96k区域的位置发现了转录生成的lncrna,这种lncrna对myb基因的作用以及对白血病的影响未有人研究。


技术实现要素:

5.本发明旨在针对目前白血病检测和治疗的缺陷和不足,提供一种调控原癌基因myb的长链非编码rnamyb-96ks并将其用于调控myb的表达和肿瘤细胞尤其是白血病细胞的增殖。
6.所述的长链非编码rna全长序列可通过race技术获取,步骤包括:
7.(1)获取总rna作为模板合成race第一链cdna;优选的,从k562 细胞中获取总rna;
8.(2)以race第一链cdna为模板,进行第一轮race-pcr;所采用的引物为通用引物upm和5
′‑
末端或3
′‑
末端基因特异性引物;
9.第一轮race-pcr的5
′‑
末端基因特异性引物(5

race-gsp)序列为:5
′‑ꢀ
gtgcctttaaggcaccctgcatacatgat-3


10.第一轮race-pcr的3
′‑
末端基因特异性引物(3

race-gsp)序列为:5
′‑ꢀ
gtattgcagacttgggaactcacctcatg-3


11.(3)以第一轮race-pcr产物为模板,进行第二轮race-pcr,得到cd na序列;所采用的引物为通用引物upm和5
′‑
末端或3
′‑
末端基因特异性引物;
12.第二轮race-pcr的5
′‑
末端基因特异性引物5

race-ngsp序列为:5
′‑
g cctgttttccccattacatgaggtgagt-3


13.第二轮race-pcr的3
′‑
末端基因特异性引物3

race-ngsp序列为:5
′‑
c gcctcagtctctcaaagtaatccttcag-3


14.经过测序鉴定,上述序列位于人的第六号染色体上。
15.步骤(1)中,从白血病细胞中获得总rna,优选为白血病细胞系k562。通过上述方法可以获得长链非编码rna的序列。
16.本发明的技术方案如下:
17.一种调控原癌基因myb的长链非编码rna(myb-96ks),其cdna序列包含如seq id no.1所示的序列;优选的,其cdna序列如seq id no.1所示。
18.一种调控原癌基因myb的长链非编码rna的cdna,其序列包含如seq idno.1所示的序列;优选的,其序列如seq id no.1所示。
19.该长链非编码rna由myb上游96kb区域转录生成,能够调控原癌基因 myb的表达,尤其是调控白血病细胞中myb基因的表达;同时还能够调控白血病细胞的增殖,可以作为肿瘤尤其是白血病的检测和治疗靶点,作为肿瘤尤其是白血病的生物标志物。
20.可用于扩增所述长链非编码rna或者其cdna序列的引物,其上游引物序列包括如seq id no.2所示的序列,其下游引物包括seq id no.3所示的序列;优选的,其上游引物的核苷酸序列如seq id no.2所示,其下游引物的核苷酸序列如seq id no.3所示。
21.seq id no.2:5
′‑
gaagcatcagatgaagagggaagg-3

22.seq id no.3:5
′‑
ttcttttttctttttttttctttttttttttgccatggtctagtc-3

23.一种用于检测上述长链非编码rna、或者其表达丰度、或者其cdna的试剂或者试剂盒,含有前述的引物。
24.一种重组载体,为含有上述非编码长链rna的cdna序列的重组表达载体,能够过表达或者敲降上述长链非编码rna或者其cdna。
25.一种转染载体,含有上述重组载体,且转染载体为病毒或重组菌;优选的,所述的病毒为慢病毒。
26.所述重组载体通过以下方法构建:将上述非编码长链rna的cdna序列连接到表达载体上。
27.重组表达载体为过表达重组载体或敲降重组载体。
28.构建过表达重组载体时,优选的,过表达载体为plvx-ires-neo,构建方法为:将所述非编码长链rna的cdna序列连接到t载体上,经过测序验证后,进行酶切位点pcr反应将非编码长链rna的cdna全长序列从t载体上转移到过表达载体plvx-ires-neo上。优选的,以ecori和agei为限制性内切酶位点;用于构建重组过表达载体的引物,其序列如下:
29.myb-96ks-ecori-f:5
′‑
ggaattcgaagcatcagatgaagagggaagg-3

30.myb-96ks-xbai-r:5
′‑
gactagtttcttttttctttttttttctttttttttttgccatggtctagtc-3

blot分析;
45.图5为实施例5中lncrnamyb-96ks过表达/敲降对白血病细胞系增殖的影响。
具体实施方式
46.实施例1 race技术克隆长链非编码rna全长序列
47.(1)总rna提取
48.使用trizol法提取k562细胞总rna,加入rnase-free h2o,55℃下水浴10 min使rna完全溶解,-80℃冷冻保存。
49.(2)race第一链cdna合成
50.采用takara公司提供的race 5’/3’kit试剂盒进行合成。
51.将合成的3
’‑
race-ready cdna和5
’‑
race-ready cdna产物用一倍体积蒸馏水稀释,-20℃保存。
52.(3)race-pcr反应
53.race-pcr第一轮反应,利用通用引物upm分别和5
′‑
末端或3
′‑
末端基因特异性引物(gene-specific primer,gsp)进行pcr扩增。
54.所述长链非编码rna(以下简称lncrnamyb-96ks)的pcr引物序列:
[0055]5′
race-myb-96ks-gsp:5
′‑
gtgcctttaaggcaccctgcatacatgat-3


[0056]3′
race-myb-96ks-gsp:5
′‑
gtattgcagacttgggaactcacctcatg-3


[0057]
反应体系:15.5μlpcr-grade h2o,25.0μl 2
×
seqamp buffer,1.0μlseqamp dna polymerase,2.5μl 5
’‑
or 3
’‑
race-ready cdna,5.0μl 10
×
u pm,1.0μl 5'gsp或3'gsp(10μm),总体积50μl,充分混匀后,短暂离心。
[0058]
race-pcr第一轮反应程序:94℃30s,72℃2min,5个循环;94℃3 0s,72℃30s,72℃2min,5个循环;94℃30s,65℃30s,72℃2mi n,30个循环。
[0059]
第二轮反应,以第一轮的pcr产物稀释50倍为模板,以universal primershort(upm short)为通用引物进行扩增。
[0060]
所用引物的核苷酸序列如下:
[0061]5′
race-myb-96ks-ngsp:5
′‑
gcctgttttccccattacatgaggtgagt-3


[0062]3′
race-myb-96ks-ngsp:5
′‑
cgcctcagtctctcaaagtaatccttcag-3


[0063]
反应体系:15.5μl pcr-grade h2o,25.0μl 2x seqamp buffer,1.0μlseqamp dna polymerase,5.0μl一轮pcr产物,1.0μl upm short,1.0μl 5'or3'ngsp,总体积50μl,充分混匀后,短暂离心。
[0064]
反应程序:94℃30s,60℃30s,72℃2min,40个循环。
[0065]
pcr产物用1%的琼脂糖凝胶电泳检测,结果如图1所示。
[0066]
(4)目的片段凝胶回收及纯化
[0067]
使用qiagen公司的凝胶回收试剂盒qiaquick gel extraction kit进行目的片段的回收。
[0068]
用刀片小心切下含有目的片段的凝胶,放到ep管中回收。回收得到的目的片段用nanodrop 2000测定其浓度和纯度,并将回收的目的片段于-20℃保存。
[0069]
(5)目的片段与载体连接
[0070]
使用全式金公司的peasy-blunt zero cloning kit试剂盒进行t载体连接。
[0071]
克隆反应体系:
[0072][0073][0074]
反应条件:25℃15min。
[0075]
(6)转化
[0076]
trans1-t1感受态细胞冰上解冻,将步骤(5)的连接产物加入到50μl的感受态细胞中,冰浴30min。
[0077]
42℃水浴热激30s,立即置于冰上2min,加250μl lb液体培养基,200rpm、 37℃培养1h。
[0078]
1500g离心1min,弃掉部分上清,均匀涂抹到含抗生素的lb固体培养基上。
[0079]
37℃恒温培养箱,培养过夜12-14h。
[0080]
(7)鉴定
[0081]
取出培养基,挑取单克隆进行pcr验证,并选取阳性菌扩大培养后进行测序。
[0082]
反应体系:菌液1μl,2
×
taq plus master mix 10μl,m13f 0.5μl,m13r 0.5 μl,ddh2o 8μl,总体积20μl。
[0083]
反应程序:94℃5min;94℃30s,55℃30s,72℃2min,30个循环;72℃ 10min。
[0084]
(8)lncrna的全长克隆
[0085]
通过前述步骤的race方法得到lncrna的5’端和3’端片段信息后,在两端设计引物,特异性引物的上下游序列为:
[0086]
seq id no.2(lncrna myb-96ks-f):5
′‑
gaagcatcagatgaagagggaagg-3

[0087]
seq id no.3(lncrna myb-96ks-r):5
’‑
ttcttttttctttttttttctttttttttttgccatggtct agtc-3’[0088]
用上述引物对拼接好的lncrna全长cdna序列进行pcr扩增,并测序验证。pcr反应程序为:95℃,30s预变性。95℃,5s变性,60℃,30s扩增,共35个循环。克隆获得的调控原癌基因myb的长链非编码rna全长cdna序列,该序列全长2142个核苷酸,位于人6号染色体,myb基因正义链上游96k 区域,用myb-96ks表示。
[0089]
测序结果,其核苷酸序列如seq id no.1。
[0090]
lncrna myb-96ks在人6号染色体上的位置如图2所示。
[0091]
seq id no.1:
[0092]
gaagcatcagatgaagagggaaggcagagcagtgagaagtctttgaatgagacctttgagcttgtattgcagacttgggaa ctcacctcatgtaatggggaaaacaggctgattatttagttcttttttattaaaaaaactctataattataataaaaccctttttaattt atttacctaatatccccttgcctgaaatgtcttttttttttttgtttttgttttttgagacagggtctggctctgttgcccaggctggag cttggctcactgcaacctccacctcccggcctcaaattatcctcccacctcagtctcctgagtagctgggactacaggcatga ggcaccacacccaggtaatttttgtatttttggtagaaacaaggtttcaccatgttggccagctggtctcaaactcctggcctca agcaatcctcccgc
ctcagtctctcaaagtaatccttcagtctaatcaccaaaagtaatagcttgtttctgctgtgaaggaaatc tacaataataattatattgagtgttttcatacatttgattagtataaccaaataatttcaataagtataaagatttaaaatgaacatttc cttaatgttgtttaacctgcattataggttttatttacaactcaacccttatccataaataatagtctcaaatatttactaaaagtcaat atattttgtgtatgatatcacagccataaaaacaatcaaattagaagtagcatttacagtattagtcacagataggaaaccataa tttagtgaagaataacaaaaataaataaatatagattgacagatacatagttagattctgaaatttaactttggctttacccaacct tgttgagaatgaaatcatgtatgcagggtgccttaaaggcacttttttcctaaaaattgtatatattggaaataattcaccaagaa aatcctaagaaagaaaaagagtttatgtgattgactttgggttatcaaagcaaagactatccagggtaaataacaggcagag gatagtgattacagctcatttattaaaatagcaacattggtacatatctgagtcaagcctggaactccccctccctctcaactag acaagttaggctttaaaattactgtaaaaattaagtcaaattgcctgtgaaggtaagctcttagaagaattttttaggtagatgat ctacataacaagacatgcaccaaccaaatctgcagtcaaatattgggggaaaaaagcaacaacagtaggtttgtgtttattgc gatgtctggaatattttaaaaattaagctcctggcctcagcctagggatttctaatcaattccaggaaatgtactgtatctttcctt gaggccagcaggaaagccccttggcaagggtgtctggaatggccacttgacatccccagcacacctcttgccaaagttac ccatggctgctgacagagagactgatgtgctgccacagattgactttagggatgaacagatcaagatcaactaatctgggc agatgcattaaagtgtttctgtgtatttaagcataccatagaaagacaaattcaacagctttcactttgctttcatacaacgttgtt ctcttacgtgttttctatttttgtttatatactaatttcctctagattgactgggttctaaatttattatgaatttggtaaagcctctgaac tttgtgtttctatattacacaccttgtgtctgtgactactgttgtggttatacactcgggattttgaagtctcaacgataatcaccata agtcatttttagcagctctgtttaaaagattccatcagtagaaattcagcacgggtaactttcacttaaacattccagaccctcag aatcctttacatttaagtgatgtgttaaaaacaatggcacctctttttacttaatttcagtcacatttggaagaagataagaaagttt attctgaactccatcactcactattactgagtttgcttcattgttgaaactagggaaaattagtccgaggtttcaaaaaagcagct aaacaattttttttccaaattcttatccaccatgactagaccatggcaaaaaaaaaaagaaaaaaaaagaaaaaagaa
[0093]
(8)质粒提取
[0094]
提取t载质粒,使用omega公司的ezna endo-free plasmid dna mini kit 试剂盒。
[0095]
实施例2 lncrna myb-96ks在白血病细胞系中的表达水平检测
[0096]
(1)细胞培养
[0097]
人红白血病k562细胞、人急性髓系白血病u937细胞、人早幼粒急性白血病hl60细胞、hela细胞以及293t细胞均购买自atcc(american type culturecollection)。k562、u937、hl60细胞用rpmi 1640basic(gibco,#c11875500bt) 培养基培养,添加终浓度10%的胎牛血清(gibco,#10099-141c)和终浓度1%的链霉素和青霉素(hyclone,#sv30010)。hela和293t细胞用dmem(gibco, #c11965500bt)培养基加10%胎牛血清和1%链霉素和青霉素进行培养。接种好的细胞置于温度为37℃、co2体积分数为5%的细胞培养箱中培养。
[0098]
(2)总rna提取
[0099]
细胞培养于10cm细胞培养皿中,k562、u937、hl60细胞为悬浮细胞,长满后,取对数生长期的细胞,800rpm离心5min,弃上清,加入1ml的trizol 试剂,裂解5min。hela和293t细胞为贴壁细胞,长满后,倒掉培养基,加入1 ml的trizol试剂,裂解5min。把裂解液转移到rnase-free的ep管中,液体澄清且无团块,颠倒混匀。
[0100]
加入总体积1/5的氯仿,将溶液充分混合,室温放置3min;
[0101]
预冷离心机,4℃,12,000rpm,离心15min;
[0102]
转上层水相于另一1.5mlep管中,加0.5ml异丙醇,孵育10min;
[0103]
4℃,12,000rpm,离心10min。弃上清;
[0104]
加入75%乙醇(depc水配制)1ml,漩涡混悬样品。4℃,7500g,离心5min。
[0105]
重复洗涤2次;
[0106]
弃乙醇,收集rna(白色物质),ep管内rna空气晾干10min;
[0107]
加于rnase-freeh2o50μl,55℃,10min水浴使rna完全溶解,冻存到-80℃。
[0108]
(3)逆转录反应
[0109]
使用takara公司的反转录试剂盒primescript
tm
rtreagentkitwithgdnaeraser(#rr047a)进行反转录反应。
[0110]
a.去除基因组dna反应:按下表于冰上配制反应混合液,将装有反应液的pcr管放置于pcr仪中,42℃、2min,反应产物于4℃保存;
[0111][0112]
b.反转录反应:将下表中的成分按照相应的使用量加到pcr管中配制反应液,于冰上进行实验操作,反应体系配好后混匀,短暂离心,使管壁上的溶液收集到管底。
[0113][0114]
cdna合成反应条件:37℃、15min,85℃、5s,4℃保存。
[0115]
(4)rt-qpcr反应
[0116]
实时荧光定量pcr使用itaquniversalsybrgreensupermix试剂在bio-radcfx96平台上进行。反应体系如下所示:
[0117][0118]
lncrna特异性引物序列为:
[0119]
seqidno.2(lncrnamyb-96ks-f):5
′‑
gaagcatcagatgaagagggaagg-3

[0120]
seqidno.3(lncrnamyb-96ks-r):5
′‑
ttcttttttctttttttttctttttttttttgccatggtctagtc-3

[0121]
pcr反应程序为:95℃,30s预变性。95℃,5s变性,60℃,30s扩增,共35个循环。采用2-δδct
方法计算目的片段的相对表达量,每个样品3个生物学重复。结果显示,这种长链非编码rna(用myb-96ks表示)在白血病相关细胞如k562、u937和hl-60中有特异性表达,如图3所示。
[0122]
实施例3lncrnamyb-96ks过表达和敲降载体构建
[0123]
使用从实施例1中所获得的lncrnamyb-96ks全长序列,构建过表达和敲降载体。将实施例1中t载体质粒稀释至1ng/μl,以此为模板进行亚克隆pcr。
[0124]
1、plvx-myb-96ks过表达载体的构建
[0125]
(1)使用plvx-ires-neo质粒构建plvx-myb-96ks过表达载体。首先根据plvx-ires-neo质粒和myb-96ks的序列选取两个限制性内切酶位点,分别为ecori和xbai。然后设计加酶切位点的亚克隆引物,序列如下:
[0126]
myb-96ks-ecori-f:
[0127]5′‑
ggaattcgaagcatcagatgaagagggaagg-3

[0128]
myb-96ks-xbai-r:
[0129]5′‑
gactagtttcttttttctttttttttctttttttttttgccatggtctagtc-3

[0130]
(2)加酶切位点pcr
[0131]
反应体系:
[0132][0133]
反应条件:98℃变性10s,55℃5s、72℃1min,循环30次。
[0134]
待反应完毕后,1%琼脂糖凝胶电泳鉴定pcr产物并回收。
[0135]
(3)目的片段与plvx-ires-neo质粒双酶切
[0136]
双酶切体系(50μl):
[0137][0138]
反应条件为37℃、4h,65℃、20min。双酶切完成以后将双酶切产物切胶回收。
[0139]
(4)连接
[0140]
连接体系(20μl):
[0141][0142]
反应条件为16℃、20h,65℃、10min。
[0143]
连接完成后,转化、鉴定、质粒提取参照实施例1的相应方法进行,最终得到plvx-myb-96ks质粒。
[0144]
2、sh-myb-96ks敲降质粒的构建
[0145]
(1)使用plko.1-trc cloning质粒构建sh-myb-96ks敲降载体。分别以 ecori和agei为限制性内切酶位点。
[0146]
(2)特异性shrna设计,构建载体的shrna序列如下所示:
[0147]
myb-96ks-shrna-f:5
′‑
ccggctagacaagttaggctttaaactcgagtttaaagcctaacttgtctagtt tttg-3

[0148]
myb-96ks-shrna-r:5
′‑
aattcaaaaactagacaagttaggctttaaactcgagtttaaagcctaacttgt ctag-3

[0149]
(3)引物退火
[0150]
如下配置退火体系(50μl):
[0151][0152]
95℃、5min,随后70℃、10min,让其温度缓慢降至室温。
[0153]
(4)plko.1-trc cloning vector双酶切
[0154]
双酶切反应体系:
[0155][0156][0157]
设置酶切条件为:37℃、4h;65℃、20min。双酶切完成以后将双酶切产物切胶回收。
[0158]
(5)连接
[0159]
连接体系(20μl):
[0160][0161]
反应条件为16℃、20h,65℃、10min。
[0162]
连接完成后,转化、鉴定、质粒提取参照实施例1的相应方法进行,最终得到sh-myb-96ks质粒。
[0163]
实施例4 lncrna myb-96ks过表达/敲降对myb表达的影响
[0164]
(1)慢病毒包装
[0165]
293t细胞种植到10cm细胞培养皿中,传2-3代后,待细胞汇合度达70-80%时,转染质粒。
[0166]
使用病毒包装质粒(pcmv-dr8.91)、包膜蛋白质粒(pcmv-vsvg)和plvx-myb-96ks或sh-myb-96ks共18.9μg进行转染,质粒比例为 pcmv-dr8.91:pcmv-vsvg:plvx-myb-96ks/sh-myb-96ks=10:1:10。
[0167]
将上述质粒加入到720μl无血清无双抗的dmem培养基中,并加入40μl 转染试剂turbofect transfection reagent,涡旋混匀后,短暂离心,室温孵育15-20 min。
[0168]
将孵育好的混合物轻轻滴加到293t细胞中。轻轻混匀后置于37℃、5%co2条件的培养箱中培养12h。之后更换8ml新鲜培养基。
[0169]
转染48h和72h后,分别收集细胞培养液,1500g离心10min去除细胞碎片,将得到的病毒上清分装存于-80℃或4℃临时保存。
[0170]
(2)慢病毒感染k562细胞
[0171]
将k562细胞接种于6cm细胞培养皿中,当细胞汇合度达到70-80%后用病毒上清进行感染,加入终浓度8μg/ml的polybrene来增强病毒的感染效率。混匀后37℃、5%co2培养箱中培养12h,连续感多次后,吸掉病毒上清,加入新鲜培养液继续培养36h。
[0172]
(3)蛋白质提取
[0173]
k562细胞800rpm离心5min,弃上清。加入2ml dpbs洗2次细胞,并弃掉dpbs,加入200μl细胞裂解液(ripa:50xpi:100mm pmsf=97:2:1),冰上裂解20-30min后超声,超声条件为超声5s,间隔10s后再次超声5s,重复进行4次。超声完成后,4℃12000g,离心10min,取最上层上清2μl用于测浓度,剩余上清转移至新的1.5ml离心管中。
[0174]
(4)蛋白浓度测定(bradford法测蛋白浓度)
[0175]
使用1
×
pbs稀释bsa蛋白标准液(5mg/ml)至200μg/ml,按下表配制一定浓度梯度的标准蛋白。
[0176][0177]
将步骤(3)获得的蛋白样品用1*pbs 40倍稀释。在96孔板上分别加入上表中1-8号管中各浓度的蛋白质溶液和样品稀释液各20μl,每个样3个重复。再在各孔中加入200μl的bradford试剂,迅速震荡均匀。室温静置5min。以1 号管为空白对照,在酶标仪上测各孔的a595吸光值,再根据标准曲线计算稀释浓度。
[0178]
(5)western blot实验
[0179]
配制sds-page凝胶:配制8%分离胶,先在15ml管中加入灭菌的ddh2o,再依次加入30%丙烯酰胺、1.5m tris-hcl(ph 8.8)和10%sds,混匀后加入10%过硫酸铵和temed,轻轻摇匀。将分离胶加到玻璃板中,加入ddh2o补齐液面,使胶平整。室温静置约30min后凝固,将水倒掉,用吸水纸吸干多余的水分。接下来开始配制5%浓缩胶,依次加入灭菌的ddh2o、30%丙烯酰胺、0.5m tris-hcl (ph 6.8)和10%sds,混匀后再加入10%过硫酸铵和temed。浓缩胶加入后,垂直缓慢地将孔梳插入到夹层中,待胶凝固后拔出。
[0180]
sds-page电泳:把电泳装置放到电泳槽中,在两个玻璃板之间倒满电泳缓冲液,在电泳槽中倒指定高度的电泳缓冲液。上样前将蛋白样品加封口膜,沸水煮5min,12000g离心1min,每个泳道加30μg蛋白。电泳条件:第一阶段80 v,30min;第二阶段150v,40min。
[0181]
转膜:大小合适的nc膜,放入ddh2o中活化。用4℃预冷的转膜液充分浸润滤纸和海绵,将转膜夹黑色面置于最下方,依次放入海绵和三张叠加的滤纸。切除浓缩胶后,将下层胶轻轻放在滤纸上,再继续覆盖nc膜,叠加三层滤纸和海绵垫,赶出滤纸中的气泡后,关上夹子。将转膜夹放入转膜槽中,整个转膜装置置于冰中,100v转膜1h。转膜结束后用1
×
丽春红染液染5min。
[0182]
封闭:将nc膜用5%脱脂牛奶在摇床上封闭2h。
[0183]
免疫反应:5%的脱脂牛奶稀释抗体,myb一抗(1:2000),β-actin抗体 (1:4000),将抗体与nc膜在摇床上4℃孵育过夜。tbst漂洗滤膜3次,每次 10min。将带有辣根过氧化酶的二抗,用5%脱脂牛奶稀释(1:2000),将二抗加到nc膜上后,室温孵育1~2h。孵育结束后,tbst清洗3次,每次10min。
[0184]
化学显影:按peroside solution:luminol/enhancer=1:1在棕色管中配制显影
液,将nc膜正面向上,均匀滴加显影液后孵育5min,曝光拍照进行检测。
[0185]
结果如图4所示。
[0186]
实施例5 lncrna myb-96ks过表达/敲降对白血病细胞系k562增殖和迁移的影响
[0187]
(1)细胞培养和转染
[0188]
k562细胞分别转染plvx-myb-96ks和sh-myb-96ks质粒。参照实施例4 的方法进行k562细胞培养与转染。
[0189]
(2)cck-8实验
[0190]
转染的k562细胞计数后,向96孔板中每孔加入100μl细胞悬液(2000个细胞)。分别在转染0、24、48、72、96h后,每孔加入cck-8 10μl,不含细胞的孔作为空白对照。继续孵育2h。酶标仪测定450nm处的吸光度。
[0191]
结果如图5所示,其中图5左图是转染了过表达质粒(plvx-myb-96ks) 及空白plvx质粒(vector)的结果;图5右图是转染了敲降质粒(用 sh-myb-96ks)及空白sh质粒(sh nc)的结果。
再多了解一些

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