水稻耐高温基因TT1的KASP标记开发及其应用的制作方法

技术特征：
1.水稻耐高温基因tt1的kasp标记开发，其特征在于：所述分子标记是与水稻耐高温基因tt1紧密连锁的kasp标记kasp_tt1，所述kasp_tt1是水稻基因组中的一个snp位点，其核苷酸种类为a或g，为序列表中seq id no.4的第101位核苷酸。2.根据权利要求1所述的水稻耐高温基因tt1的kasp标记开发的应用，其特征在于：在c1、c2、c3或c4中的应用：所述c1为检测水稻基因组中kasp_tt1位点的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴定水稻高温耐性中的应用；所述c2为检测水稻基因组中kasp_tt1位点的多态性或基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定耐高温水稻产品中的应用；所述c3为检测水稻基因组中kasp_tt1位点的多态性或基因型的物质在水稻辅助育种或制备水稻辅助育种产品中的应用；所述c4为检测水稻基因组中kasp_tt1位点的多态性或基因型的物质在选育耐高温的水稻资源中的应用。3.水稻耐高温基因tt1的kasp标记开发的应用，其特征在于：提供一种鉴定或辅助鉴定水稻高温耐性的方法，包括检测待测水稻的基因型，根据待测水稻的基因型鉴定或辅助鉴定水稻高温耐性；所述基因型为水稻基因组中kasp_tt1位点的基因型；所述记kasp_tt1位点是水稻基因组中的一个snp位点，其核苷酸种类为a或g，为序列表中seq id no.4的第101位核苷酸。4.根据权利要求3所述的水稻耐高温基因tt1的kasp标记开发的应用，其特征在于：所述kasp_tt1位点的基因型为aa基因型时，水稻为耐高温或者候选为耐高温；所述kasp_tt1位点的基因型为ag基因型或者gg基因型时，水稻为不耐高温或者候选为不耐高温；其中，所述aa基因型表示水稻基因组中所述kasp_tt1位点的核苷酸种类为a的纯合型；所述gg基因型表示水稻基因组中所述kasp_tt1位点的核苷酸种类为g的纯合型；所述ag基因型表示水稻基因组中所述kasp_tt1位点的核苷酸种类为a和g的杂合型。5.根据权利要求3所述的水稻耐高温基因tt1的kasp标记开发的应用，其特征在于：提供一种检测水稻基因组中kasp_tt1位点的多态性或基因型的物质在a1、a2、a3或a4中的应用；所述kasp_tt1位点是水稻基因组中的一个snp位点，其核苷酸种类为a或g，为序列表中seq id no.4的第101位核苷酸：所述a1为检测水稻基因组中kasp_tt1位点的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴定水稻高温耐性中的应用；所述a2为检测水稻基因组中kasp_tt1位点的多态性或基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定耐高温水稻产品中的应用；所述a3为检测水稻基因组中kasp_tt1位点的多态性或基因型的物质在水稻辅助育种或制备水稻辅助育种产品中的应用；所述a4为检测水稻基因组中kasp_tt1位点的多态性或基因型的物质在选育耐高温的水稻资源中的应用。6.根据权利要求3所述的水稻耐高温基因tt1的kasp标记开发的应用，其特征在于：提供一种选育耐高温的水稻资源的方法，包括选择kasp_tt1位点的基因型为aa的水稻进行育种，其中，所述kasp_tt1位点是水稻基因组中的一个snp位点，其核苷酸种类为a或g，为序列
表中seq id no.4的第101位核苷酸；所述aa基因型表示水稻基因组中所述kasp_tt1位点的核苷酸种类为a的纯合型。7.根据权利要求3所述的水稻耐高温基因tt1的kasp标记开发的应用，其特征在于：提供含有检测水稻基因组中kasp_tt1位点的多态性或基因型的物质的产品，为e1-e4中任一种产品：所述e1为检测与水稻高温耐性相关的单核苷酸多态性或基因型的产品；所述e2为鉴定或辅助鉴定耐高温水稻的产品；所述e3为用于水稻辅助育种的产品；所述e4为用于选育耐高温水稻资源的产品。8.根据权利要求7所述的水稻耐高温基因tt1的kasp标记开发的应用，其特征在于：所述含有检测水稻基因组中kasp_tt1位点的多态性或基因型的物质的产品在b1、b2、b3或b4中的应用；所述b1为检测水稻基因组中kasp_tt1位点的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴定水稻高温耐性中的应用；所述b2为检测水稻基因组中kasp_tt1位点的多态性或基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定耐高温水稻产品中的应用；所述b3为检测水稻基因组中kasp_tt1位点的多态性或基因型的物质在水稻辅助育种或制备水稻辅助育种产品中的应用；所述b4为检测水稻基因组中kasp_tt1位点的多态性或基因型的物质在选育耐高温的水稻资源中的应用。9.根据权利要求3、4、5、6、7或8中任一所述的水稻耐高温基因tt1的kasp标记开发的应用，其特征在于：所述检测检测水稻基因组中kasp_tt1位点的多态性或基因型的物质为如下d1、d2或d3：所述d1为所述检测检测水稻基因组中kasp_tt1位点的多态性或基因型的物质含有扩增包括所述kasp_tt1位点在内的水稻基因组dna片段的pcr引物；所述d2为所述检测水稻基因组中kasp_tt1位点的多态性或基因型的物质为含有所述pcr引物的pcr试剂；所述d3为含有d1所述pcr引物或d2所述pcr试剂的试剂盒。10.根据权利要求9所述的水稻耐高温基因tt1的kasp标记开发的应用，其特征在于：所述pcr引物为p1或p2：p1、所述pcr引物为由核苷酸序列是序列表中seq id no.1的第22-45位的单链dna、核苷酸序列是序列表中seq id no.2的第22-45位的单链dna和核苷酸序列是序列表中seq id no.3的单链dna组成的引物组；p2、所述pcr引物为由序列表中seq id no.1所示的单链dna、序列表中seq id no.2所示的单链dna和由序列表中seq id no.3所示的单链dna的引物组。

技术总结
本发明公开了水稻耐高温基因TT1的KASP标记开发及其应用，属于基因生物技术领域。其中所述分子标记是与水稻耐高温基因TT1紧密连锁的KASP标记KASP_TT1，所述KASP_TT1是水稻基因组中的一个SNP位点，其核苷酸种类为A或G，为序列表中SEQ ID No.4的第101位核苷酸。本发明应用KASP技术对水稻耐高温基因TT1进行基因型鉴定，具有操作简便、成本低廉、检测周期短、标记稳定、绿色环保等优点，可精准检测水稻耐高温基因TT1，对促进耐高温水稻育种具有重要意义。对促进耐高温水稻育种具有重要意义。对促进耐高温水稻育种具有重要意义。


技术研发人员：迟铭 邢运高 李景芳 孙志广 徐波 刘艳 刘晓敏 王宝祥
受保护的技术使用者：连云港市农业科学院
技术研发日：2021.11.09
技术公布日：2022/1/14