棉花GhPDAT基因在调控棉花蕾铃脱落中的应用
本发明涉及基因工程,尤其涉及棉花ghpdat基因在调控棉花蕾铃脱落中的应用。
背景技术:
1、棉花(
gossypium spp.)是全球重要的经济作物和天然纤维来源,其产量和品质直接影响纺织工业的经济效益。蕾铃脱落是棉花生产中的关键限制因素之一,据统计,棉花蕾铃脱落率高达40~70%,严重制约棉花单产的提高。蕾铃脱落受遗传因素、环境条件、激素水平等多重因素调控,属于典型的数量性状。
2、传统育种方法改良蕾铃脱落性状周期长、效率低,且易受环境影响。分子标记辅助选择(marker-assisted selection,mas)和基因工程技术为加速育种进程提供了有效途径。全基因组关联分析(genome-wide association study,gwas)是一种基于群体连锁不平衡原理,通过分析自然群体中遗传标记与目标性状间的关联,从而鉴定控制复杂数量性状基因和qtl的有效方法。近年来,gwas已广泛应用于棉花等重要作物复杂农艺性状的遗传解析。
3、然而,目前关于调控棉花蕾铃脱落的关键基因及其功能机制的研究尚不充分,缺乏可直接用于分子育种的基因资源和功能性分子标记。因此,发掘与棉花蕾铃脱落紧密关联的关键基因,对于解析其功能、开展分子标记辅助育种具有重要意义。
技术实现思路
1、本发明的目的在于提供棉花ghpdat基因在调控棉花蕾铃脱落中的应用。
2、为了实现上述发明目的,本发明提供以下技术方案:
3、本发明提供了棉花ghpdat基因在调控棉花蕾铃脱落中的应用,所述ghpdat基因负调控棉花蕾铃脱落;所述ghpdat基因的编码区的核苷酸序列如seq id no.2所示。
4、优选的,所述ghpdat基因组核苷酸序列如seq id no.1所示。
5、与现有技术相比,本发明具有如下有益效果:
6、本发明基于高质量陆地棉新陆早31(hc04)的参考基因组,利用群体基因组重测序和全基因组关联分析(gwas)技术,成功鉴定出一种与棉花蕾铃脱落相关的基因
ghpdat。
7、本发明通过vigs沉默技术验证了
ghpdat基因的功能,沉默该基因可显著提高棉花蕾铃脱落率。本发明为降低棉花蕾铃脱落率、提高棉花产量提供了新的基因资源和育种工具,具有重要的应用价值。
1.棉花ghpdat基因在调控棉花蕾铃脱落中的应用,其特征在于,所述ghpdat基因负调控棉花蕾铃脱落;所述ghpdat基因的编码区的核苷酸序列如seq id no.2所示。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述ghpdat基因的核苷酸序列如seq idno.1所示。
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