核酸内切酶Gs12-7AI1.1及其在核酸检测中的应用的制作方法
本发明属于核酸酶,具体涉及核酸内切酶gs12-7ai1.1及其在核酸检测中的应用。
背景技术:
1、核酸内切酶gs12-7是一种通过生物信息学和实验策略从宏基因组中发掘的,其在基因编辑、分子诊断和治疗等领域具有重要应用(cn116144631a)。然而,现有野生型gs12-7核酸内切酶在高温条件下容易失去活性,这限制了其在某些需要高温反应的场景(如lamp扩增或体外诊断)中的应用。此外,crispr系统介导的核酸检测技术的快速发展对高效、耐热稳定和单管法核酸检测技术提出了更高需求。
2、同时,传统的核酸检测方法,如定量pcr、微流控芯片等技术通常需要依赖于复杂的仪器设备,存在效率低、成本高等问题。因此,亟需开发一种耐热性强、功能稳定且易于工业化生产的gs12-7核酸内切酶突变体,以及结合lamp实现“单管法”核酸检测,这是当前crispr系统介导的核酸现场快速检测研究领域的重要方向。
技术实现思路
1、本发明旨在通过基于proteinmpnn深度学习算法对野生型gs12-7核酸内切酶进行工程化改造,获得一种耐热性强、功能稳定且特异性的核酸内切酶gs12-7ai1.1,并提供其在单管法核酸检测中的应用。
2、为了实现上述目的,本发明采用以下技术方案:
3、gs12-7核酸内切酶突变体,包括以下蛋白:
4、ⅰ.seq id no.1所示氨基酸序列的gs12-7ai1.1蛋白;
5、ⅱ.与seq id no.1所示的氨基酸序列相比,具有80%以上序列同一性的蛋白,并且基本保留了其源自序列的生物学功能。
6、融合蛋白,包含上述蛋白和其他修饰部分。
7、编码gs12-7核酸内切酶突变体的多核苷酸。
8、上述gs12-7核酸内切酶突变体,或融合蛋白,或多核苷酸,或载体在核酸检测中的应用。
9、一种可视化核酸检测试剂盒,包括gs12-7核酸内切酶突变体,单链dna荧光-淬灭报告基因,与靶标核酸配对的向导rna。
10、可视化检测非洲猪瘟病毒核酸的试剂盒,包括lamp引物,gs12-7核酸内切酶突变体,单链dna荧光-淬灭报告基因以及与靶标核酸配对的向导rna,所述lamp引物如seq idno.5-10所示,所述向导rna序列如seq id no.11所示。优选地,所述单链dna荧光-淬灭报告基因的序列如seq id no.12所示。
11、与现有技术相比,本发明具有以下优点及有益效果:
12、1.gs12-7ai1.1突变体较gs12-7能在55℃高温条件下反应时间更持久,具有显著的耐热稳定性,适用于与lamp扩增结合进行单管检测靶标核酸分子。
13、2.gs12-7ai1.1识别的pam基序偏好胞嘧啶(c),能检测野生型gs12-7难以识别的靶标。
1.gs12-7核酸内切酶突变体,其特征在于,包括以下蛋白:
2.融合蛋白,其特征在于,包含权利要求1所述蛋白和其他修饰部分。
3.多核苷酸,其特征在于,所述多核苷酸为编码权利要求1所述核酸内切酶突变体的多核苷酸,或编码权利要求2所述融合蛋白的多核苷酸。
4.载体,其特征在于,所述载体包含权利要求3所述的多核苷酸。
5.权利要求1所述的核酸内切酶突变体,或权利要求2所述的融合蛋白,或权利要求3所述的多核苷酸,或权利要求4所述的载体在核酸检测中的应用。
6.一种可视化核酸检测试剂盒,其特征在于,包括权利要求1所述的核酸内切酶突变体,单链dna荧光-淬灭报告基因,与靶标核酸配对的向导rna。
7.可视化检测非洲猪瘟病毒核酸的试剂盒,其特征在于,包括lamp引物,权利要求1所述的核酸内切酶突变体,单链dna荧光-淬灭报告基因以及与靶标核酸配对的向导rna,所述lamp引物如seq id no.5-10所示,所述向导rna序列如seq id no.11所示。
8.根据权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,所述单链dna荧光-淬灭报告基因的序列如seq id no.12所示。
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