结直肠息肉肠道微生物标志物及其应用的制作方法
本发明属于生物医药领域,具体地涉及一种结直肠息肉肠道微生物标志物及其应用。
背景技术:
1、结直肠息肉是结直肠黏膜表面向肠腔内突出的隆起性病变,是消化内科最常见的疾病之一。结直肠息肉按病理类型可分为非肿瘤性息肉(增生性息肉、炎性息肉,通常无害)和肿瘤性息肉(腺瘤性息肉、锯齿状息肉),其中腺瘤性息肉是结直肠息肉最主要的息肉前病变,约占全部息肉的70%以上。
2、目前,结直肠息肉的常见检出手段包括结肠镜检查和粪便隐血试验(fit)等;结肠镜检查虽然是诊断的金标准,但其具有侵入性、需肠道准备、费用较高,且我国内镜资源有限,难以覆盖大规模无症状人群的筛查需求;粪便隐血试验(fit)虽简便无创,但对进展期腺瘤的灵敏度仅约25%~40%,漏诊率较高。
3、因此,亟需开发一种无创、便捷且灵敏度高的检测新方法。基于粪便样本的肠道微生物检测即可反映肠道微生态的早期改变,在结直肠息肉的早期预警中展现出应用前景,有望弥补现有筛查手段的不足。
技术实现思路
1、针对上述技术问题,本发明提供一种结直肠息肉肠道微生物标志物及其应用,其可为诊断结直肠息肉提供一种新的思路和途径。
2、本发明提供的技术方案如下:
3、第一方面,提供一种定量检测微生物标志物的试剂在制备与结直肠息肉相关的产品中的应用,所述微生物标志物包括鲍氏梭菌clostridium bolteae和灰色异普雷沃菌alloprevotella rava,所述鲍氏梭菌clostridium bolteae和灰色异普雷沃菌alloprevotella rava在结直肠息肉患者中明显增加。
4、第二方面,提供一种用于诊断或预测结直肠息肉的肠道微生物标志物,所述微生物标志物包括鲍氏梭菌clostridium bolteae、灰色异普雷沃菌alloprevotella rava、多枝梭菌clostridium ramosum和殊异韦荣氏球菌veillonella dispar。
5、第三方面,提供一种用于诊断或预测结直肠息肉的肠道微生物标志物,所述肠道微生物标志物为下述组合中的任一种:
6、a)所述微生物标志物为由多枝梭菌clostridium ramosum、鲍氏梭菌clostridiumbolteae和灰色异普雷沃菌alloprevotella rava组成的标志物组合;
7、b)所述微生物标志物为由灰色异普雷沃菌alloprevotella rava、鲍氏梭菌clostridium bolteae、多枝梭菌clostridium ramosum和殊异韦荣氏球菌veillonelladispar组成的标志物组合。
8、第四方面,提供一种诊断或预测结直肠息肉的产品,所述产品包括试剂、试纸、适配体和芯片中的一种或多种,所述产品所述的微生物标志物具有特异性,并用于定量检测所述的微生物标志物。
9、第五方面,提供一种诊断或预测结直肠息肉的试剂盒,所述试剂盒内装有用于定量检测所述的微生物标志物的试剂。
10、第六方面,提供一种第四方面所述的试剂盒在制备诊断结直肠息肉的产品中的应用,所述鲍氏梭菌clostridium bolteae、多枝梭菌clostridium ramosum和灰色异普雷沃菌alloprevotella rava在结直肠息肉组中呈现明显增加,殊异韦荣氏球菌veillonelladispar在结直肠息肉组中呈现明显减少。
11、需要说明的是,本发明新发现并验证了上述多种肠道微生物与结直肠息肉具有强相关性,可以用于诊断待测人员是否患有结直肠息肉。在此基础上,虽然本发明在实施例中仅列举了如何通过相对丰度值实现对待测样本进行定量检测,但其它可以对微生物实现定量检测的手段也是可行的(如绝对丰度或总微生物载量信息等手段),也可以用于辅助诊断待测人员是否患有结直肠息肉,人们可以根据自身的需要进行选择,在此不做赘述。
12、本发明的有益效果如下:
13、1、本发明新发现4种与结直肠息肉相关的肠道微生物,包括:鲍氏梭菌clostridium bolteae、灰色异普雷沃菌alloprevotella rava、多枝梭菌clostridiumramosum和殊异韦荣氏球菌veillonella dispar。
14、经过研究、验证后发现,对结直肠息肉患者而言,上述4种肠道微生物中的一种或几种,可以用于诊断待测人员是否患有结直肠息肉。
15、2、本发明还提供了一种试剂和/或试剂盒,能够以上述4种菌种中的某个或某几个作为检测标志物(也即微生物标志物),以诊断待测人员是否患有结直肠息肉,完全无创,准确性高。
16、通过宏基因组学测序手段,提供更高的分辨率,使得对微生物群落的分析能够深入到菌种甚至是菌株的水平,从而提高诊断的准确性和可靠性。所述4种菌种还可作为开发这些系统的靶标微生物,填补了这一领域的空白。
17、3、本发明还提供了用于诊断结直肠息肉的产品。该产品能够实现基于各菌种的相对丰度值诊断待测人员患有结直肠息肉的风险,整个诊断过程安全、无创且高效,其具有良好的可行性和准确性,可以有效地评估待测人员(的粪便样本)患结直肠息肉的风险,评估结果较准确。
1.一种定量检测微生物标志物的试剂在制备诊断结直肠息肉的产品中的应用,其特征在于,所述微生物标志物包括鲍氏梭菌clostridium bolteae和灰色异普雷沃菌alloprevotella rava,所述鲍氏梭菌clostridium bolteae和灰色异普雷沃菌alloprevotella rava在结直肠息肉患者中明显增加。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述微生物标志物还包括殊异韦荣氏球菌veillonella dispar或多枝梭菌clostridium ramosum,所述殊异韦荣氏球菌veillonelladispar在结直肠息肉患者中明显减少,所述多枝梭菌clostridium ramosum在结直肠息肉患者中明显增加。
3.根据权利要求1或2所述的应用,其特征在于,所述微生物标志物为由鲍氏梭菌clostridium bolteae、灰色异普雷沃菌alloprevotella rava、多枝梭菌clostridiumramosum和殊异韦荣氏球菌veillonella dispar组成的标志物组合,所述鲍氏梭菌clostridium bolteae、多枝梭菌clostridium ramosum和灰色异普雷沃菌alloprevotellarava在结直肠息肉组中呈现明显增加,殊异韦荣氏球菌veillonella dispar在结直肠息肉组中呈现明显减少。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,所述试剂包括引物和/或探针。
5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,所述产品包括试剂盒、芯片和诊断系统中的一种或多种。
6.一种用于诊断或预测结直肠息肉的肠道微生物标志物,其特征在于,所述微生物标志物包括鲍氏梭菌clostridium bolteae、灰色异普雷沃菌alloprevotella rava、多枝梭菌clostridium ramosum和殊异韦荣氏球菌veillonella dispar。
7.一种用于诊断或预测结直肠息肉的肠道微生物标志物,其特征在于,所述肠道微生物标志物为下述组合中的任一种:
8.一种诊断或预测结直肠息肉的产品,其特征在于:所述产品包括试剂、试纸、适配体和芯片中的一种或多种,所述产品对权利要求6或7所述的肠道微生物标志物具有特异性,并用于定量检测权利要求6或7所述的肠道微生物标志物。
9.一种诊断或预测结直肠息肉的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒内装有用于定量检测权利要求6或7所述的微生物标志物的试剂。
10.权利要求9所述的试剂盒在制备诊断结直肠息肉的产品中的应用,所述鲍氏梭菌clostridium bolteae、多枝梭菌clostridium ramosum和灰色异普雷沃菌alloprevotellarava在结直肠息肉组中呈现明显增加,殊异韦荣氏球菌veillonella dispar在结直肠息肉组中呈现明显减少。
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