一种检测黄瓜CsPsy1基因SNP位点的分子标记及其应用

技术特征：
1.一种检测黄瓜cspsy1基因snp位点的分子标记，命名为snp-cspsy1，由seq id no.1所示的核苷酸序列片段和seq id no.2所示的核苷酸序列片段组成；其中：seq id no.1所示的核苷酸序列片段为cspsy1基因类型1的部分核苷酸序列，seq id no.2所示的核苷酸序列片段为cspsy1基因类型2的部分核苷酸序列，两者之间存在一个t/c单碱基突变。2.根据权利要求1所述的检测黄瓜cspsy1基因snp位点的分子标记，其特征在于，所述snp-cspsy1由seq id no.3所示的上游引物和seq id no.4所示的下游引物扩增得到。3.根据权利要求1所述的检测黄瓜cspsy1基因snp位点的分子标记，其特征在于，所述cspsy1基因类型1为黄色果肉的西双版纳变种群黄瓜cspsy1基因类型，所述cspsy1基因类型2为白色果肉的栽培黄瓜变种群黄瓜cspsy1基因类型，且所述黄色果肉的西双版纳变种群黄瓜cspsy1基因起始密码子上游序列第27个核苷酸为t，所述白色果肉的栽培黄瓜变种群黄瓜cspsy1基因此处核苷酸为c。4.权利要求1至3任一项所述检测黄瓜cspsy1基因snp位点的分子标记在黄瓜分子标记辅助育种中的应用。5.一种检测黄瓜cspsy1基因snp位点的分子标记在黄瓜生长周期内鉴定cspsy1基因类型中的应用，所述检测黄瓜cspsy1基因snp位点的分子标记由seq id no.1所示的核苷酸序列片段和seq id no.2所示的核苷酸序列片段组成；其中：seq id no.1所示的核苷酸序列片段为黄色果肉的西双版纳变种群黄瓜cspsy1基因的部分核苷酸序列，seq id no.2所示的核苷酸序列片段为白色果肉的栽培黄瓜变种群黄瓜cspsy1基因的部分核苷酸序列，两者之间存在一个t/c单碱基突变。6.根据权利要求5所述的应用，其特征在于，所述t/c单碱基突变位于cspsy1基因起始密码子上游序列第27个核苷酸处，当cspsy1基因起始密码子上游序列第27个核苷酸为t时，黄瓜为黄色果肉的西双版纳变种群类型；当cspsy1基因起始密码子上游序列第27个核苷酸为c时，黄瓜为白色果肉的栽培变种群类型。7.根据权利要求5或6所述的应用，其特征在于，所述检测黄瓜cspsy1基因snp位点的分子标记由seq id no.3所示的上游引物和seq id no.4所示的下游引物扩增得到。

技术总结
本发明公开了一种检测黄瓜CsPsy1基因SNP位点的分子标记及其应用，属于植物生物技术和分子育种领域。通过比对不同黄瓜材料中CsPsy1基因序列发现CsPsy1基因起始密码子上游第27核苷酸处在不同材料间有一个单核苷酸差异，根据此处的核苷酸差异设计得到一个基于PCR和酶切技术的分子标记SNP-CsPsy1，其由SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列片段和SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列片段组成，两者之间有一个T/C的单核苷酸差异。本发明中检测黄瓜CsPsy1基因SNP位点的分子标记具有高稳定性，可以快速、高通量的在黄瓜候选材料的任何阶段对CsPsy1基因的SNP位点进行检测，应用于黄瓜分子标记辅助育种实践。助育种实践。助育种实践。


技术研发人员：王刚 何欢乐 潘俊松 蔡润 姚丹青 陈岳 张克岩 陈思雨 潘健 温海帆
受保护的技术使用者：上海交通大学
技术研发日：2021.12.28
技术公布日：2022/4/22