一种儿童过敏性相关的152个基因位点基因分型的检测方法与流程

技术特征：
1.一种儿童过敏性相关的152个基因位点基因分型的检测方法，其特征在于，包括如下步骤：(a)收集检测对象唾液或口腔拭子，并提取dna；(b)以得到的dna为模板对152个基因位点进行pcr扩增，并对扩增后的产物进行磁珠纯化，其中，所述152个基因位点分为两组分别进行pcr扩增，第一组为85个基因位点：rs7936434、rs1500963、rs511898、rs2054517、rs10062446、rs631208、rs7179742、rs267759、rs4271002、rs10494133、rs1125642、rs17513503、rs2503222、rs6069674、rs1946518、rs3818822、rs12135788、rs7551789、rs917650、rs6498482、rs16823014、rs528557、rs1042151、rs3856806、rs56151068、rs11740584、rs290992、rs1243064、rs4251481、rs4310804、rs4950928、rs1898671、rs6131034、rs9833094、rs2700521、rs3794262、rs17737064、rs7862221、rs10483907、rs12123821、rs16851030、rs17616434、rs5961136、rs1929992、rs139462954、rs1938821、rs7192、rs17565502、rs4251559、rs1353577、rs12143400、rs9323624、rs16950131、rs17388568、rs10492737、rs10018666、rs8011069、rs7717393、rs2065746、rs10492736、rs12437556、rs2280089、rs1715794、rs6733160、rs11652573、rs1042136、rs1461567、rs73118440、rs11717893、rs3024492、rs28359885、rs10889502、rs3860069、rs6673480、rs1800469、rs6554809、rs12774458、rs1544623、rs17330462、rs9273440、rs1800925、rs4516432、rs880633、rs12330531、rs12873765；第二组为67个基因位点：rs3097671、rs12028467、rs163550、rs11949166、rs11079339、rs334807、rs7572857、rs1853232、rs6474695、rs324015、rs4054760、rs73908987、rs1335464、rs499368、rs557881、rs2367563、rs11610328、rs2155219、rs7775228、rs7475217、rs2076530、rs12746200、rs730012、rs12158991、rs1391351、rs7017801、rs9275596、rs1131882、rs3130100、rs114892859、rs1325195、rs7851969、rs10492734、rs10809464、rs4928089、rs74995702、rs11819745、rs2243250、rs10507385、rs890448、rs9406426、rs72827854、rs2070874、rs761142、rs250585、rs17156347、rs12584136、rs144897250、rs2069772、rs6665683、rs10956253、rs1059288、rs7617456、rs1800896、rs2280090、rs3024496、rs3129294、rs2280091、rs1116931、rs7789045、rs10492735、rs2071888、rs4662366、rs1335467、rs1059513、rs4291、rs4292；所述第一组基因位点依次对应的上游扩增引物序列如seq id no：1～85所示，下游扩增引物序列如seq id no：86～170所示；所述第二组基因位点依次对应的上游扩增引物序列如seq id no：171～237所示，下游扩增引物序列如seq id no：238～304所示；(c)对纯化产物进行索引序列的连接，再次磁珠纯化，得到pcr文库；(d)对pcr文库进行基因测序，根据测序结果得到儿童过敏性相关的152个基因位点的基因分型结果。2.根据权利要求1所述的检测方法，其特征在于，所述pcr扩增的体系中152个基因位点对应的扩增引物的工作浓度分别为0.05-0.40μm。3.根据权利要求1所述的检测方法，其特征在于，所述pcr扩增的体系中还包括dna聚合酶预混液和pcr增强剂。
4.根据权利要求1所述的检测方法，其特征在于，所述第一组基因位点的pcr扩增程序如下：heat lid 150℃，95℃for 3min 30s，(98℃for 20s，58℃for 4min)
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18cycles，72℃for 5min。5.根据权利要求1所述的检测方法，其特征在于，所述第二组基因位点的pcr扩增程序如下：heat lid 150℃，95℃for 3min 30s，(98℃for 20s，60℃for 4min)
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18cycles，72℃for 5min。6.根据权利要求1所述的检测方法，其特征在于，所述磁珠纯化采用的磁珠为ampure xp磁珠。7.根据权利要求1所述的检测方法，其特征在于，所述索引序列包括igt-15index和igt-17index。

技术总结
本发明公开了一种儿童过敏性相关的152个基因位点基因分型的检测方法，收集检测对象唾液或口腔拭子，并提取DNA；以得到的DNA为模板对152个基因位点进行PCR扩增，并对扩增后的产物进行磁珠纯化；对纯化产物进行索引序列的连接，再次磁珠纯化，得到PCR文库；对PCR文库进行基因测序，根据测序结果得到儿童过敏性相关的152个基因位点的基因分型结果；上述检测方法中的152个基因位点能够从生物学的角度综合评估儿童的过敏遗传情况，帮助家长了解孩子的过敏风险，指导科学、有效降低儿童的严重过敏发生，并为儿童过敏原的早发现、早干预、早治疗；此外，本发明检测方法操作简单，时间短，效率高。高。高。


技术研发人员：钟玙沄 谭鸣 林德玲 杜英文强
受保护的技术使用者：飞科易特（广州）基因科技有限公司
技术研发日：2021.09.18
技术公布日：2022/1/14