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分辨率板、分辨率评估方法及相关设备与流程

2021-11-20 01:17:00 来源:中国专利 TAG:


1.本发明涉及图像处理技术领域,尤其涉及一种分辨率板、分辨率评估方法、基因测序系统、基因测序仪及存储介质。


背景技术:

2.基因测序是指分析特定dna片段的碱基序列,即腺嘌呤(a)、胸腺嘧啶(t)、胞嘧啶(c)与鸟嘌呤(g)的排列方式。目前常用的测序方法之一是:上述四种碱基分别携带不同的荧光基团,不同的荧光基团受激发后发射出不同波长(颜色)的荧光,通过识别该荧光波长就能够识别出被合成碱基的类型,从而读取碱基序列。二代测序技术采用高分辨显微成像系统,拍照采集生物芯片(基因测序芯片)上的dna纳米球(即dnb,dnananoballs)的荧光分子图像,将荧光分子图像送入碱基识别软件解读图像信号得到碱基序列。基因测序仪显微成像环节的成像质量对碱基识别的准确率影响较大,而显微成像系统的分辨率好坏将直接影响成像质量。
3.现有技术中,分辨率评估方法主要包括直接观测法与esf/mtf法,其中,直接观测法通过观察线对的相邻线强度值能否分开,确定成像系统的分辨率;esf/mtf法通过计算斜边梯形的esf(edgespread function,边沿扩散函数)和mtf(modulation transfer function)来判断成像系统的分辨率。然而,上述两种方法均无法直接评估相邻dna纳米球是否可分辨,且两种方法受环境因素影响较大,导致分辨率评估效率低。


技术实现要素:

4.鉴于以上内容,有必要提出一种分辨率板、分辨率评估方法、基因测序系统、基因测序仪及存储介质,能够针对dna纳米球和/或生物大分子等分子尺寸小、间距小的情况,提高分辨率评估的效率与鲁棒性。
5.本发明实施例第一方面提供一种分辨率板,所述分辨率板包括:基板以及在所述基板上设置的分辨率测试图像,所述分辨率测试图像由呈中心对称的若干位点组成,同一方向上相邻所述位点的间距从中心点向外逐渐变大。
6.进一步地,在本发明实施例提供的上述分辨率板中,所述位点为中心对称图形,同一方向上相邻所述位点的间距从所述中心点向外呈等差数列变大。
7.本发明实施例第二方面还提供一种利用上述任意一项所述的分辨率板进行分辨率评估的方法,应用于光学成像系统中,所述分辨率评估方法包括:
8.采集所述分辨率板的待分析图像;
9.计算所述待分析图像的强度函数;
10.根据所述强度函数执行快速傅里叶变换,得到所述待分析图像的目标频谱;
11.确定所述目标频谱包含的目标频谱峰数量;
12.根据所述目标频谱峰数量遍历预设映射表,得到所述光学成像系统的分辨率值。
13.进一步地,在本发明实施例提供的上述分辨率评估方法中,所述根据所述强度函
数执行快速傅里叶变换,得到所述待分析图像的目标频谱包括:
14.获取所述待分析图像沿预设方向的第一图像;
15.计算所述第一图像的一维强度函数;
16.根据所述一维强度函数执行一维快速傅里叶变换,得到所述第一图像的第一目标频谱。
17.进一步地,在本发明实施例提供的上述分辨率评估方法中,所述方法还包括:
18.当所述预设方向的数目大于1个时,分别获取所述待分析图像沿预设方向的第一图像集;
19.计算所述第一图像集中每一个图像的一维强度函数,得到一维强度函数集;
20.根据所述一维强度函数集中每一个一维强度函数计算平均值,得到一维平均强度函数;
21.根据所述一维平均强度函数执行一维快速傅里叶变换,得到所述第一图像集的第一目标频谱。
22.进一步地,在本发明实施例提供的上述分辨率评估方法中,所述根据所述强度函数执行快速傅里叶变换,得到所述待分析图像的目标频谱还包括:
23.计算所述待分析图像的二维强度函数;
24.根据所述二维强度函数执行二维快速傅里叶变换,得到所述待分析图像的第二目标频谱。
25.进一步地,在本发明实施例提供的上述分辨率评估方法中,所述确定所述目标频谱包含的目标频谱峰数量包括:
26.获取所述目标频谱对应的可分辨区域;
27.计算所述可分辨区域包含频谱峰数量的最大值;
28.确定所述最大值为目标频谱峰数量。
29.本发明实施例第三方面还提供一种基因测序系统,所述基因测序系统包括:
30.图像采集模块,用于采集所述分辨率板的待分析图像;
31.函数计算模块,用于计算所述待分析图像的强度函数;
32.频谱获取模块,用于根据所述强度函数执行快速傅里叶变换,得到所述待分析图像的目标频谱;
33.数量确定模块,用于确定所述目标频谱包含的目标频谱峰数量;
34.分辨率确定模块,用于根据所述目标频谱峰数量遍历预设映射表,得到所述光学成像系统的分辨率值。
35.本发明实施例第四方面还提供一种基因测序仪,所述基于测序仪包括处理器,所述处理器用于执行存储器中存储的计算机程序时实现如上述任意一项所述的分辨率评估方法的步骤。
36.本发明实施例第五方面还提供一种计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序,所述计算机程序被处理器执行时实现上述任意一项所述的分辨率评估方法的步骤。
37.本发明实施例提供一种分辨率板、分辨率评估方法、基因测序系统、基因测序仪及计算机可读存储介质,针对dna纳米球和/或生物大分子等分子尺寸小、间距小的情况,设计一种相邻位点的间距从中心点向外逐渐变大的分辨率板,通过评估光学成像系统能够分辨
的最小间距来确定分辨率,能够提高分辨率评估的效率与鲁棒性。此外,本发明通过对空间域作快速傅里叶变换的方法,统计在频域中的频谱峰的数量,能够提高分辨率评估能力。
附图说明
38.图1是本发明实施例提供的分辨率板的示意图。
39.图2是本发明实施例提供的分辨率评估方法的流程图。
40.图3a是本发明一实施例提供的分辨率板的设计图案示意图。
41.图3b为本发明一实施例提供的光学成像系统采集的分辨率板图像示意图。
42.图3c为本发明一实施例提供的空间域上强度函数的示意图。
43.图3d为图3c的强度函数在频域上的一维傅里叶频谱示意图。
44.图3e为图3b对应的二维傅里叶频谱示意图。
45.图3f为图3e中虚线框部分的一维频谱示意图。
46.图4是本发明一实施例提供的预设映射表的示意图。
47.图5是本发明一实施例提供的基因测序仪的结构示意图。
48.图6是图5所示的基因测序仪的一示例性的功能模块图。
49.如下具体实施方式将结合上述附图进一步说明本发明。
具体实施方式
50.为了能够更清楚地理解本发明的上述目的、特征和优点,下面结合附图和具体实施例对本发明进行详细描述。需要说明的是,在不冲突的情况下,本技术的实施例及实施例中的特征可以相互组合。
51.在下面的描述中阐述了很多具体细节以便于充分理解本发明,所描述的实施例是本发明一部分实施例,而不是全部的实施例。基于本发明中的实施例,本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例,都属于本发明保护的范围。
52.除非另有定义,本文所使用的所有的技术和科学术语与属于本发明的技术领域的技术人员通常理解的含义相同。本文中在本发明的说明书中所使用的术语只是为了描述具体的实施例的目的,不是旨在于限制本发明。
53.请参阅图1,图1中的(a)、(b)、(c)、(d)、(e)、(f)、(g)、(h)及(i)是本发明实施例提供的分辨率板的示意图。所述分辨率板可针对分子荧光检测中的生物大分子和/或基因测序仪中dna纳米球等分子尺寸较小,且呈一定规则排列的特点而设计,通过评估光学成像系统能够分辨的最小间距来确定分辨率。其中,所述分子荧光检测是一种超灵敏的检测技术,可以在溶液等介质中对单个或多个分子进行检测和成像,从而对化学反应的途径进行实时监测,特别是对生物大分子进行探测并提供分子结构与功能之间的信息,包括基因测序分析。
54.如图1所示,所述分辨率板包括:基板以及在所述基板上设置的分辨率测试图像,所述分辨率测试图像(图1中每个图的白色位点组成的图像即为分辨率测试图像)由呈中心对称的若干位点组成,同一方向上相邻所述位点的间距从中心点向外逐渐变大。其中,所述分辨率测试图像可以为点列图案。所述分辨率测试图像的边界没有限制(图1中每个图的外围边框仅为示例性的),可根据实际需求进行设置。可以理解的是,设计所述分辨率测试图
像由呈中心对称的若干位点组成,一方面是由于呈中心对称的图案可以在四个分支上容纳相同的点数,且总的点数最多,能够保证四个分支的点数用于后续分析,鲁棒性更好(若所述分辨率测试图像不是呈中心对称,那么图案只能在少数个方向上获得比较多的点,同时会造成有的分支上点数太少,该分支无法用于后续算法);另一方面,光学成像系统的视野中心成像质量最好,所以将分辨率测试图像的中心置于视野中心,利用视野中心对较密集的点进行成像。
55.在本发明的一实施例中,所述位点为中心对称图形,例如,所述位点可以为圆形、正方形、正三角形、正六边形及正八边形中的一种。所述位点沿着水平方向和/或垂直方向由中心点向外延伸。同一方向上相邻所述位点的间距从所述中心点向外呈等差数列变大。所述基板的材质可以包括:光学玻璃、熔融石英、光学陶瓷材料及硅片中的一种。
56.在本发明的至少一实施例中,分别获取所述分辨率测试图像的中心点(包括中心点)在水平方向和/或垂直方向上向外的最大点数目m与n。和分别为从所述分辨率测试图像的中心点沿水平方向和垂直方向的相邻位点间距,其中n
x
和n
y
均为整数,且n
x
∈[1,m-1],n
y
∈[1,n-1]。
[0057]
在本发明的至少一实施例中,在设计所述分辨率板方面,假设光学成像系统沿x,y方向上的分辨率分别为r
x
和r
y
,相邻所述位点的间距和呈等差数列排列。可以理解的是,当和/或时,这两个点通过光学成像系统无法分辨开。也即,通过判断哪两个相邻位点无法被光学成像系统分开,即可评估光学成像系统的分辨率。
[0058]
本发明实施例提供一种分辨率板,包括:基板以及在所述基板上设置的分辨率测试图像,所述分辨率测试图像由呈中心对称的若干位点组成,同一方向上相邻所述位点的间距从中心点向外逐渐变大。本发明针对分子荧光检测中的生物大分子和/或基因测序仪中dna纳米球等分子尺寸较小,且呈一定规则排列的特点设计一种分辨率板,很好地仿真了基于生物大分子或dna纳米球的光学成像系统的理想环境,从而能有效评估分辨率。
[0059]
图2是本发明实施例提供的分辨率评估方法的流程图。所述分辨率评估方法可以利用上述分辨率板进行分辨率评估,所述分辨率评估方法可以用于光学成像系统中。如图2所示,所述分辨率评估方法可以包括如下步骤:
[0060]
s21、采集所述分辨率板的待分析图像。
[0061]
在本发明的至少一实施例中,请参阅图3a,以所述位点的形状为圆形,位点直径d=500nm,m=n=28,=500nm,m=n=28,呈等差数列,所述基板的材质为硅材质,所述分辨率测试图像为图1中(g)图的“ ”型图案的分辨率板为例,调用光学成像系统采集所述分辨率板,得到所述分辨率板的待分析图像,如图3b所示,图3b为本发明一实施例提供的光学成像系统采集的分辨率板图像示意图。
[0062]
s22、计算所述待分析图像的强度函数。
[0063]
在本发明的至少一实施例中,所述强度函数为所述待分析图像中像素点的位置信息与所述像素点对应亮度值的关系函数。其中,所述像素点可以理解为光学成像系统可识别的最小图像单元,所述像素点的位置信息及所述像素点对应亮度值均可确定,所述像素
点的位置信息可以包括沿x与y方向上的位置信息。所述计算所述待分析图像的强度函数的步骤可以包括:获取所述像素点的位置信息(x,y);获取所述像素点对应亮度值;确定所述位置信息与所述亮度值的函数关系,所述函数关系也即为所述待分析图像的强度函数。
[0064]
在本发明的至少一实施例中,所述强度函数包括一维强度函数与二维强度函数。示例性地,所述一维强度函数记作f(x,y0),简记为f(x),其中,y0为一常数,可以根据实际需求设定;所述二维强度函数记作f(x,y)。
[0065]
s23、根据所述强度函数执行快速傅里叶变换,得到所述待分析图像的目标频谱。
[0066]
在本发明的至少一实施例中,对于空间域中水平方向与垂直方向上相邻位点的间距和是呈等差数列排列的点列,相邻位点的间距相当于信号的周期,间距值不同,那么在频域中对应的频率也不同,因而会形成频率不同且比较稀疏的多个频谱峰,所以空间域中比较致密的两个相邻位点,在频谱域中更容易分辨。且空间域中相邻位点的间距和的数量与频谱域中的频谱峰数量一致,因而通过统计频率峰数量,即可判断空间域中哪两个相邻位点是可以分辨的,从而评估光学成像系统的分辨率。
[0067]
在本发明的至少一实施例中,通过空间-频率转换(也即快速傅里叶变换),可以将频域中频谱峰的数量与空间域中相邻位点不同间距的数量一一对应。所述快速傅里叶变换包括一维快速傅里叶变换与二维快速傅里叶变换。
[0068]
具体地,当所述快速傅里叶变换包括一维快速傅里叶变换时,所述根据所述强度函数执行快速傅里叶变换,得到所述待分析图像的目标频谱包括:获取所述待分析图像沿预设方向的第一图像;计算所述第一图像的一维强度函数;根据所述一维强度函数执行一维快速傅里叶变换,得到所述第一图像的第一目标频谱。
[0069]
其中,所述预设方向为测试人员预先设置的,所述预设方向可以为1个方向,也可以为多个方向,在此不作限制。所述根据所述一维强度函数执行一维快速傅里叶变换包括:将所述一维强度函数输入公式(1):
[0070][0071]
其中,f
1d
(u)表示f(x)的一维傅里叶变换,f(x)为沿x方向的一维强度函数,下标1d表示一维,u为与x方向相对应的频率变量,p为所述待分析图像沿x方向的像素点的数量。在一实施例中,f(x)为f(x,y0)的简写,y0=q/2(表示选取y轴正中间的一行强度值),q为所述待分析图像沿y方向的像素点的数量。
[0072]
示例性地,对于所述分辨率测试图像为图1中(g)图的“ ”型图案的分辨率板,沿x或y方向的一条分支,该分支对应的图像为第一图像,如图3b中虚线框所示。计算所述第一图像的一维强度函数,如图3c所示,图3c为本发明一实施例提供的空间域上强度函数的示意图。根据所述一维强度函数执行一维快速傅里叶变换,得到所述第一强度图像的第一目标频谱,如图3d所示,图3d为图3c的强度函数在频域上的一维傅里叶频谱示意图。
[0073]
观察图3c可见,在空间域上,峰的排列(从左到右)逐步由稀疏变得致密,相邻峰会叠加形成幅值更高且宽度更窄的峰。当相邻峰致密到一定程度以后,叠加形成的峰变得不明显(但是仍然存在),从而导致分辨评估的不准确性。在图3c中,从左至右一共有22个峰(空间域上峰的数量均可用数字标记),对应的所以通过直接对空间域中
的峰计数,根据空间域上峰数量遍历预设映射表,得到所述光学成像系统x方向的分辨率值即为750。其中,所述预设映射表为出厂预设值,如图4所示,所述预设映射表中包含空间域点序号、空间域相邻位点间距、频谱峰数量以及光学成像系统分辨率的映射关系。
[0074]
观察图3d可见,在频域中从左至右(由低频到高频)共有24个显著的频谱峰。由于频谱峰对应着不同的频率,不同的频率对应着不同的周期,不同的周期对应着空间域中不同的相邻点间距,其中,低频频谱峰对应着较大的相邻点间距,高频频谱峰对应着较小的相邻点间距。由于存在24个由低到高的频谱峰(频域上峰的数量均可用数字标记),所以对应的相邻点间距为所以通过直接对频域中的峰计数,根据频域上峰数量遍历预设映射表,得到所述光学成像系统x方向的分辨率值即为650nm。
[0075]
由此可见,通过采用本发明实施例提供的分辨率评估方法,对空间域作快速傅里叶变换的方法,统计在频域中的频谱峰的数量,能够提高分辨率评估能力。
[0076]
在本发明的至少一实施例中,由于分辨率板的质量可能会导致待分析图像出现“缺点”现象,针对这类问题,可选择将多个分支的强度值先取加权平均值,再做一维傅里叶变换。具体地,所述方法还包括:当所述预设方向的数目大于1个时,分别获取所述待分析图像沿预设方向的第一图像集;计算所述第一图像集中每一个图像的一维强度函数,得到一维强度函数集;根据所述一维强度函数集中每一个一维强度函数计算平均值,得到一维平均强度函数;根据所述一维平均强度函数执行一维快速傅里叶变换,得到所述第一图像集的第一目标频谱。
[0077]
在本发明的至少一实施例中,当所述快速傅里叶变换包括二维快速傅里叶变换时,所述根据所述强度函数执行快速傅里叶变换,得到所述待分析图像的目标频谱包括:计算所述待分析图像的二维强度函数;根据所述二维强度函数执行二维快速傅里叶变换,得到所述待分析图像的第二目标频谱。
[0078]
与所述一维快速傅里叶变换不同,二维傅里叶变换法不需要选取分辨率板的不同分支,而是直接对分辨率板的二维强度函数执行二维快速傅里叶变换。具体地,所述根据所述二维强度函数执行二维快速傅里叶变换包括:将所述二维强度函数输入至公式(2):
[0079][0080]
其中,f
2d
(u,v)表示f(x,y)的二维傅里叶变换,f(x,y)为二维强度函数,下标2d表示二维,u为与x方向相对应的频率变量,v为与y方向相对应的频率变量,p为所述待分析图像沿x方向的像素点的数量,q为所述待分析图像沿y方向的像素点的数量。
[0081]
示例性地,对于所述分辨率测试图像为图1中(g)图的“ ”型图案的分辨率板,如图3e所示,图3e为图3b对应的二维傅里叶频谱示意图,二维傅里叶频谱图呈“ ”型。这里为了展示频谱细节,选取二维傅里叶频谱图沿x方向的一个分支(如图3e中的虚线框所示),并将频谱幅值呈现如图3f所示,图3f为图3e中虚线框部分的一维频谱示意图。如图3f所示,频谱中从左至右(从低频到高频)共有24个频谱峰,所以所以光学成像系统x方向的分辨率为650nm。同理,选择频谱图沿y方向的一个分支,也可以通过统计频谱峰的个数,确定光学成像系统y方向的分辨率。
[0082]
可以理解的是,直接针对分辨率板采用二维傅立叶变换的好处在于,不受分辨率
板“缺点”现象的影响,可以通过在频域统计频谱峰数量实现精度确定。
[0083]
s24、确定所述目标频谱包含的目标频谱峰数量。
[0084]
在本发明的至少一实施例中,所述目标频谱分为可分辨区域与不可分辨区域,所述可分辨区域的频谱峰称为目标频谱峰。如图3d所示,在第24个频谱峰右侧,存在更高频的频谱峰,但由于它们峰值较小,且有杂波干扰,说明在空间域有干扰信号和这一相邻位点的间距相同,因而判定为不可分辨区域。如图3c、图3d与图3f中,虚线左侧表示可分辨区域,虚线右侧表示不可分辨区域。
[0085]
所述确定所述目标频谱包含的目标频谱峰数量包括:获取所述目标频谱对应的可分辨区域;计算所述可分辨区域包含频谱峰数量的最大值;确定所述最大值为目标频谱峰数量。其中,所述计算所述可分辨区域包含频谱峰数量的最大值可采用直接观察频谱图,并对比较光滑(没有杂波干扰)的频谱峰计数;或者可采用机器学习等方法,统计频谱峰的数量。
[0086]
s25、根据所述目标频谱峰数量遍历预设映射表,得到所述光学成像系统的分辨率值。
[0087]
在本发明的至少一实施例中,根据所述目标频谱峰数量遍历预设映射表,得到所述光学成像系统的分辨率值。所述预设映射表中包含空间域点序号、空间域相邻位点间距、频谱峰数量以及光学成像系统分辨率的映射关系。其中,所述空间域点序号与所述空间域相邻位点间距为预先知道的,所述频谱峰数量与所述光学成像系统分辨率可通过多次计算获取。可以理解的是,通过遍历预设映射表的方式评估光学成像系统的分辨率,能够提高分辨率的评估效率。
[0088]
可以理解的是,现有方法在评估分辨率时,由于评估分辨率的待分析图像的区域较大,需要对待分析图像进行预处理,例如,去除不均匀背景等。而获取不均匀背景主要通过低通滤波实现,一方面低通滤波的参数需要根据照明条件反复调节,另一方面,由于不均匀背景很难通过调节低通滤波的参数完美得到,所以去除不均匀背景的操作会导致位点的失真,从而影响分辨率评估的准确性。
[0089]
而本发明实施例提供的分辨率评估方法,一方面,由于“ ”型图案的区域面积较小(~35
×
35μm2),在小区域内背景较为均匀,相比于传统方法,不存在不均匀背景的情况。另一方面,本发明直接对图像作快速傅里叶变换,得到对应频域信号,如图3d与图3f所示,第1个频谱峰左侧的接近于0的低频信号,即是不均匀背景的频谱。该低频信号与空间域的“ ”型图案对应的第1-24个频谱峰可以明显区分开,所以从频域角度,也没必要在分辨率评估之前先去除不均匀背景。本发明实施例提供的分辨率评估方法相对于传统方法,增加了分辨率评估的鲁棒性。
[0090]
本发明实施例提供一种分辨率评估方法,采集所述分辨率板的待分析图像;计算所述待分析图像的强度函数;根据所述强度函数执行快速傅里叶变换,得到所述待分析图像的目标频谱;确定所述目标频谱包含的目标频谱峰数量;根据所述目标频谱峰数量遍历预设映射表,得到所述光学成像系统的分辨率值。利用本发明实施例,通过对空间域作快速傅里叶变换的方法,统计在频域中的频谱峰的数量,能够提高分辨率评估能力。
[0091]
以上是对本发明实施例所提供的方法进行的详细描述。根据不同的需求,所示流程图中方块的执行顺序可以改变,某些方块可以省略。下面对本发明实施例所提供的基因
测序仪1进行描述。
[0092]
本发明实施例还提供一种基因测序仪,包括存储器、处理器及存储在存储器上并可在处理器上运行的计算机程序,所述处理器执行所述程序时实现上述任一实施方式中所述的分辨率评估方法的步骤。需要说明的是,所述基因测序仪可以包括芯片平台、光学系统、液路系统。其中,所述芯片平台可以用于装载生物芯片,所述光学系统可以用于获取荧光图像,所述液路系统可以用于利用预设的试剂进行生化反应。
[0093]
图5是本发明一实施例的基因测序仪的结构示意图。如图5所示,基因测序仪1包括存储器10,存储器10中存储有所述基因测序系统100。所述基因测序系统100可以采集所述分辨率板的待分析图像;计算所述待分析图像的强度函数;根据所述强度函数执行快速傅里叶变换,得到所述待分析图像的目标频谱;确定所述目标频谱包含的目标频谱峰数量;根据所述目标频谱峰数量遍历预设映射表,得到所述光学成像系统的分辨率值。利用本发明实施例,通过对空间域作快速傅里叶变换的方法,统计在频域中的频谱峰的数量,能够提高分辨率评估能力。
[0094]
本实施方式中,基因测序仪1还可以包括显示屏20及处理器30。存储器10、显示屏20可以分别与处理器30电连接。
[0095]
所述的存储器10可以是不同类型存储设备,用于存储各类数据。例如,可以是基因测序仪1的存储器、内存,还可以是可外接于该基因测序仪1的存储卡,如闪存、sm卡(smart media card,智能媒体卡)、sd卡(secure digital card,安全数字卡)等。此外,存储器10可以包括包括非易失性存储器,例如硬盘、内存、插接式硬盘,智能存储卡(smart media card,smc),安全数字(secure digital,sd)卡,闪存卡(flash card)、至少一个磁盘存储器件、闪存器件、或其他非易失性固态存储器件。存储器10用于存储各类数据,例如,所述基因测序仪1中安装的各类应用程序(applications)、应用上述分辨率评估方法而设置、获取的数据等信息。
[0096]
显示屏20安装于基因测序仪1,用于显示信息。
[0097]
处理器30用于执行所述分辨率评估方法以及所述基因测序仪1内安装的各类软件,例如操作系统及应用显示软件等。处理器30包含但不限于处理器(central processing unit,cpu)、微控制单元(micro controller unit,mcu)等用于解释计算机指令以及处理计算机软件中的数据的装置。
[0098]
所述基因测序系统100可以包括一个或多个的模块,所述一个或多个模块被存储在基因测序仪1的存储器10中并被配置成由一个或多个处理器(本实施方式为一个处理器30)执行,以完成本发明实施例。
[0099]
请参阅图6所示,当所述基因测序系统100用于对荧光图像进行图像清晰度分析时,所述基因测序系统100可以包括图像采集模块101、函数计算模块102、频谱获取模块103、数量确定模块104以及分辨率确定模块105。本发明实施例所称的模块可以是完成一特定功能的程序段,比程序更适合于描述软件在处理器30中的执行过程。
[0100]
可以理解的是,对应上述分辨率评估方法中的各实施方式,基因测序系统100可以包括图6中所示的各功能模块中的一部分或全部,各模块的功能将在以下具体介绍。需要说明的是,以上分辨率评估方法的各实施方式中相同的名词、相关名词及其具体的解释说明也可以适用于以下对各模块的功能介绍。为节省篇幅及避免重复起见,在此就不再赘述。
[0101]
图像采集模块101可以用于采集所述分辨率板的待分析图像。
[0102]
函数计算模块102可以用于计算所述待分析图像的强度函数。
[0103]
频谱获取模块103可以用于根据所述强度函数执行快速傅里叶变换,得到所述待分析图像的目标频谱。
[0104]
数量确定模块104可以用于确定所述目标频谱包含的目标频谱峰数量。
[0105]
分辨率确定模块105可以用于根据所述目标频谱峰数量遍历预设映射表,得到所述光学成像系统的分辨率值。
[0106]
本发明实施例还提供一种计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序,所述计算机程序被处理器30执行时实现上述任一实施方式中的分辨率评估方法的步骤。
[0107]
所述基因测序系统100/基因测序仪集成的模块/单元如果以软件功能单元的形式实现并作为独立的产品销售或使用时,可以存储在一个计算机可读取存储介质中。基于这样的理解,本发明实现上述实施方式方法中的全部或部分流程,也可以通过计算机程序来指令相关的硬件来完成,所述的计算机程序可存储于一计算机可读存储介质中,该计算机程序在被处理器30执行时,可实现上述各个方法实施例的步骤。其中,所述计算机程序包括计算机程序代码,所述计算机程序代码可以为源代码形式、对象代码形式、可执行文件或某些中间形式等。所述计算机可读存储介质可以包括:能够携带所述计算机程序代码的任何实体或装置、记录介质、u盘、移动硬盘、磁碟、光盘、计算机存储器、只读存储器(rom,read-only memory)等。
[0108]
所称处理器30可以是中央处理单元(central processing unit,cpu),还可以是其他通用处理器、数字信号处理器(digital signal processor,dsp)、专用集成电路(application specific integrated circuit,asic)、现场可编程门阵列(field-programmable gate array,fpga)或者其他可编程逻辑器件、分立门或者晶体管逻辑器件、分立硬件组件等。通用处理器可以是微处理器或者该处理器也可以是任何常规的处理器等,所述处理器30是所述基因测序系统100/基因测序仪1的控制中心,利用各种接口和线路连接整个基因测序系统100/基因测序仪1的各个部分。
[0109]
所述存储器10用于存储所述计算机程序和/或模块,所述处理器30通过运行或执行存储在所述存储器10内的计算机程序和/或模块,以及调用存储在存储器10内的数据,实现所述基因测序系统100/基因测序仪1的各种功能。所述存储器10可主要包括存储程序区和存储数据区,其中,存储程序区可存储操作系统、至少一个功能所需的应用程序(比如声音播放功能、图像播放功能等)等;存储数据区可存储根据基因测序仪1的使用所创建的数据等。
[0110]
在本发明所提供的几个具体实施方式中,应该理解到,所揭露的基因测序仪和方法,可以通过其它的方式实现。例如,以上所描述的系统实施方式仅仅是示意性的,例如,所述模块的划分,仅仅为一种逻辑功能划分,实际实现时可以有另外的划分方式。
[0111]
对于本领域技术人员而言,显然本发明实施例不限于上述示范性实施例的细节,而且在不背离本发明实施例的精神或基本特征的情况下,能够以其他的具体形式实现本发明实施例。因此,无论从哪一点来看,均应将实施例看作是示范性的,而且是非限制性的,本发明实施例的范围由所附权利要求而不是上述说明限定,因此旨在将落在权利要求的等同要件的含义和范围内的所有变化涵括在本发明实施例内。不应将权利要求中的任何附图标
记视为限制所涉及的权利要求。系统、装置或基因测序仪权利要求中陈述的多个单元、模块或装置也可以由同一个单元、模块或装置通过软件或者硬件来实现。
[0112]
以上实施方式仅用以说明本发明实施例的技术方案而非限制,尽管参照以上较佳实施方式对本发明实施例进行了详细说明,本领域的普通技术人员应当理解,可以对本发明实施例的技术方案进行修改或等同替换都不应脱离本发明实施例的技术方案的精神和范围。
再多了解一些

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