作为WRN抑制剂的化合物及其应用的制作方法
本发明属于医药化学领域,具体涉及作为wrn抑制剂的化合物或其药学上可接受的盐、异构体、溶剂化物、结晶或前药,它们的制备方法以及含有这些化合物的药物组合物和这些化合物或组合物用于治疗与wrn相关的疾病的用途。
背景技术:
1、微卫星(microsatellite)是基因组中的一类短串联重复dna序列,一般由1-6个核苷酸组成。由于其核心重复单元重复次数差异,微卫星通常具有群体多态性。与正常组织相比,肿瘤中某个微卫星位点由于重复单元的插入或缺失而出现新的微卫星等位基因的现象被称为微卫星不稳定性(microsatellite instability,msi)。msi的发生是由于肿瘤组织的dna错配修复 (dna mismatch repair, dmmr)出现功能性缺陷导致。随着临床前和临床研究的不断深入,伴随着dna错配修复缺陷的msi是临床上的一项重要的肿瘤标志物,在临床上,dmmr和msi-h通常具有相同的临床意义。发生msi的癌症包括:结直肠癌、胃癌、子宫内膜癌、卵巢癌、胆管癌、尿道癌、脑癌与皮肤癌。其中,以结直肠癌最为常见(msi-h ≈ 15%)。在多项临床实验中,以帕博利珠单抗为代表的pd-1单抗被发现对于msi-h的肿瘤具有良好的治疗效果,但研究中仍有不少比例的msi患者对免疫疗法不响应且一些msi-h的肿瘤患者对免疫治疗产生原发性耐药,这部分患者的临床需求目前仍未被满足。
2、近些年的一系列研究发现,rna/dna解螺旋酶recq家族中的wrn蛋白(wernerprotein)与msi-h肿瘤的发生发展具有很强的相关性。在msi-h的肿瘤细胞中敲除或敲低wrn可以显著的抑制肿瘤细胞的增殖、侵袭和迁移,促进肿瘤细胞的凋亡,这些研究结果表明wrn与msi-h在肿瘤之间可能具有合成致死的关系。目前,敲低wrn促进msi-h肿瘤凋亡的机理也得到了较为清晰的阐述:ta-二核苷酸重复在msi细胞中高度不稳定,并会发生大规模扩增。这些大量增加的ta rep乙酸乙酯t会形成non b的dna二级结构,使复制叉停止,并激活atr检查点激酶,在这个过程中需要wrn解旋酶的参与来重新激活dna复制叉来使dna复制继续进行。当没有wrn时,扩增的 ta-二核苷酸重复序列易被mus81核酸酶切割断裂,从而导致大量染色体破碎,诱导细胞凋亡。
3、因此,开发wrn小分子抑制剂有望为抗肿瘤治疗提供新的手段,使msi-h的肿瘤患者获得临床获益。
技术实现思路
1、本发明提供通式(i)所示的化合物或其药学上可接受的盐、异构体、溶剂化物、结晶或前药,
2、
3、其中,
4、x选自ch和n;
5、q选自=o、=nh和=nch3;
6、w选自卤素、氰基、氨基、烷基、环烷基、杂环基、卤代烷基、烷氧基、卤代烷氧基、羟基烷氧基、烷基氨基、芳基、杂芳基、芳基烷基、杂芳基烷基、环烷基烷基和杂环基烷基,其任选被一个或多个选自卤素、羟基、氨基、烷基、卤代烷基、羟基烷基、烷氧基、卤代烷氧基、羟基烷氧基、芳基、杂芳基、环烷基和杂环烷基的基团取代;
7、r1选自氢、卤素、氰基、氨基、烷基、氧代基团、环烷基、杂环基、杂环烯基、卤代烷基、烷氧基、卤代烷氧基、羟基烷氧基、单烷基氨基、双烷基氨基、烷基酰基氨基、烷基酰基、氨基酰基、烷基氨基酰基、双烷基氨基、芳基和杂芳基;和
8、r2选自烷基、卤代烷基、卤代烷氧基、羟基烷氧基、环烷基、杂环基、芳基和杂芳基,其任选被一个或多个选自卤素、羟基、烷基、卤代烷基、羟基烷基、烷氧基、卤代烷氧基、羟基烷氧基、氨基、单烷基氨基、烷基酰基氨基、烷基酰基、烷基磺酰基、氨基酰基、烷基氨基酰基、双烷基氨基、卤代烷基酰基、羟基烷基酰基、环烷基、杂环基、芳基、杂芳基的基团取代。
9、在一些实施方案中,本发明的化合物为通式(i)的化合物或其药学上可接受的盐、异构体、溶剂化物、结晶或前药,其中通式(i)为以下通式(ia)的结构:
10、
11、其中x、q、w、r1、r2如通式(i)中所定义。
12、在一些具体的实施方案中,本发明的化合物为通式(i)或(ia)的化合物或其药学上可接受的盐、异构体、溶剂化物、结晶或前药,其中w选自卤素、氰基、氨基、c1-6烷基、c3-10环烷基、c3-10杂环基、卤代c1-6烷基、c1-6烷氧基、卤代c1-6烷氧基、羟基c1-6烷氧基、c1-6烷基氨基、c6-10芳基、5-10元杂芳基、c6-10芳基c1-6烷基、5-10元杂芳基c1-6烷基、c3-10环烷基c1-6烷基和c3-10杂环基c1-6烷基,其任选被一个或多个选自卤素、羟基、氨基、c1-6烷基、卤代c1-6烷基、羟基c1-6烷基、c1-6烷氧基、卤代c1-6烷氧基、羟基c1-6烷氧基、c6-10芳基、5-10元杂芳基、c3-10环烷基和c3-10杂环烷基的基团取代,所述杂原子选自n、o、s和p。在一些具体的实施方案中,w选自甲基、乙基、、、、、和。
13、在一些实施方案中,根据本发明的通式(i)或(ia)的化合物或其药学上可接受的盐、异构体、溶剂化物、结晶或前药,其中r1选自氢、卤素、氰基、氨基、c1-6烷基、氧代基团、c3-10环烷基、3-10杂环基、3-10杂环烯基、卤代c1-6烷基、c1-6烷氧基、卤代c1-6烷氧基、羟基c1-6烷氧基、单c1-6烷基氨基、双c1-6烷基氨基、c1-6烷基酰基氨基、c1-6烷基酰基、氨基酰基、c1-6烷基氨基酰基、双c1-6烷基氨基、c6-10芳基和5-10元杂芳基,所述杂原子选自n、o、s和p。在一些具体的实施方案中,r1不存在。在另一些具体的实施方案中,r1选自氟、氯、溴、甲基、乙基、丙基、氧代集团、环丙基、环丁基、二氟甲基、三氟甲基、氨基。
14、在一些实施方案中,根据本发明的通式(i)或(ia)的化合物或其药学上可接受的盐、异构体、溶剂化物、结晶或前药,其中r2选自c1-6烷基、卤代c1-6烷基、卤代c1-6烷氧基、羟基c1-6烷氧基、c3-10环烷基、3-10元杂环基、c6-10芳基和5-10元杂芳基,其任选被一个或多个选自卤素、羟基、c1-6烷基、卤代c1-6烷基、羟基c1-6烷基、c1-6烷氧基、卤代c1-6烷氧基、羟基c1-6烷氧基、氨基、c1-6单烷基氨基、c1-6烷基酰基氨基、c1-6烷基酰基、c1-6烷基磺酰基、氨基酰基、c1-6烷基氨基酰基、双c1-6烷基氨基、卤代c1-6烷基酰基、羟基c1-6烷基酰基、c3-8环烷基、3-8元杂环基、c6-12芳基和5-12元杂芳基的基团取代,所述杂原子选自n、o、s和p;
15、进一步优选地,r2选自c1-3烷基、卤代c1-4烷基、卤代c1-3烷氧基、羟基c1-3烷氧基、c3-6环烷基、3-10元杂环基、c6-10芳基和5-10元杂芳基,其任选被一个或多个选自卤素、羟基、c1-3烷基、卤代c1-3烷基、羟基c1-3烷基、c1-3烷氧基、卤代c1-3烷氧基、羟基c1-3烷氧基、氨基、c1-3单烷基氨基、c1-3烷基酰基氨基、c1-3烷基酰基、c1-3烷基磺酰基、氨基酰基、c1-3烷基氨基酰基、双c1-3烷基氨基、卤代c1-3烷基酰基、羟基c1-3烷基酰基、c3-6环烷基、3-6元杂环基、c6-12芳基和5-8元杂芳基的基团取代,所述杂原子选自n、o、s和p。
16、在一些具体的实施方案中,根据本发明的通式(i)或(ia)的化合物或其药学上可接受的盐、异构体、溶剂化物、结晶或前药,其中r2选自甲基、乙基、丙基、异丙基、环丙基、环丁基、苯基、二氟甲基、三氟甲基、、、和。
17、本发明提供通式(ii)所示的化合物或其药学上可接受的盐、异构体、溶剂化物、结晶或前药,
18、
19、其中y选自o和nh,n选自0、1、2、3和4。
20、在一些实施方案中,本发明的化合物为通式(ii)的化合物或其药学上可接受的盐、异构体、溶剂化物、结晶或前药,其中通式(ii)为以下通式(iia)的结构:
21、
22、其中y和n如通式(ii)中所定义。
23、本发明提供以下具体化合物或其药学上可接受的盐、异构体、溶剂化物、结晶或前药:
24、,,,,,,,,,, ,,
25、,和 。
26、另一方面,本发明提供药物组合物,其包含本发明的化合物或其药学上可接受的盐、异构体、溶剂化物、结晶或前药。
27、在一些实施方案中,本发明提供本发明的化合物或其药学上可接受的盐、异构体、溶剂化物、结晶或前药及包含本发明的化合物或其药学上可接受的盐、异构体、溶剂化物、结晶或前药的药物组合物,所述化合物或药物组合物用于治疗与wrn相关的疾病。
28、在一些实施方案中,本发明提供药物组合物,其包含本发明的化合物或其药学上可接受的盐、异构体、溶剂化物、结晶或前药和可药用载体。
29、可以将本发明的化合物或其药学上可接受的盐、异构体、溶剂化物、结晶或前药与可药用载体、稀释剂或赋形剂混合制备成药物制剂,以适合于经口或胃肠外给药。给药方法包括,但不限于皮内、肌内、腹膜内、静脉内、皮下、鼻内和经口途径。所述制剂可以通过任何途径施用,例如通过输注或推注,通过经上皮或皮肤粘膜(例如口腔粘膜或直肠等)吸收的途径施用。给药可以是全身的或局部的。经口施用制剂的实例包括固体或液体剂型,具体而言,包括片剂、丸剂、粒剂、粉剂、胶囊剂、糖浆、乳剂、混悬剂等。所述制剂可通过本领域已知的方法制备,且包含药物制剂领域常规使用的载体、稀释剂或赋形剂。
30、第三方面,本发明提供本发明式(i)和(ii)所示的化合物或其药学上可接受的盐、异构体、溶剂化物、结晶或前药,或包含其的药物组合物用于治疗与wrn相关的疾病的方法以及在制备治疗与wrn相关的疾病的药物中的用途。
31、在一些优选的实施方案中,本发明提供本发明式(i)和(ii)所示的化合物或其药学上可接受的盐、异构体、溶剂化物、结晶或前药,或包含其的药物组合物用于治疗与wrn相关的疾病的方法以及在制备治疗与wrn相关的疾病的药物中的用途,其中所述的wrn相关的疾病包括但不限于:癌症、增殖性疾病、血液疾病或代谢疾病。在一些实施方案中,本发明所述的wrn相关的疾病为癌症。
32、在一些实施方案中,本发明所述的wrn相关的疾病,包括但不限于:胰腺癌、肺癌、结直肠癌、胆管癌、多发性骨髓瘤、黑素瘤、子宫癌、子宫内膜癌、甲状腺癌、急性髓性白血病、膀胱癌、尿路上皮癌、胃癌、宫颈癌、头颈部鳞状细胞癌、弥漫性大b细胞淋巴瘤、食道癌、慢性淋巴细胞白血病、肝细胞癌、乳腺癌、卵巢癌、前列腺癌、胶质母细胞瘤、肾癌和肉瘤。
33、在一些实施方案中,本发明提供本发明式(i)和(ii)所示的化合物或其药学上可接受的盐、异构体、溶剂化物、结晶或前药,或包含其的药物组合物在制备治疗和/或预防微卫星不稳定性(microsatellite instability,msi)或dna错配修复 (dna mismatchrepair, dmmr)癌症的药物中的用途。
34、在一些实施方案中,本发明所述的微卫星不稳定性(microsatelliteinstability,msi)或dna错配修复 (dna mismatch repair, dmmr)癌症,包括但不限于:结直肠癌、胃癌、前列腺癌、子宫内膜癌、肾上腺皮质癌、子宫癌、宫颈癌、食道癌、乳腺癌、肾脏癌和卵巢癌。
35、术语定义
36、除非有相反陈述,在说明书和权利要求书中使用的术语具有下述含义。
37、本发明化合物中的“氢”、“碳”、“氧”包括其所有同位素。同位素应理解为包括具有相同原子数但具有不同质量数的那些原子。举例来说,氢的同位素包括氕、氚和氘,碳的同位素包括12c、13c和14c,氧的同位素包括16o和18o等。
38、本发明的“异构体”是指原子组成及连接方式相同,而其三维空间排列不同的分子,包括但不限于非对映体,对映异构体,顺反异构体,和它们的混合物,如外消旋混合物。很多有机化合物都以光学活性形式存在,即它们有能力旋转平面偏振光的平面。在描述光学活性化合物时,前缀d、l或r、s用来表示分子手性中心的绝对构型。前缀d、l或(+)、(-)用来命名化合物平面偏振光旋转的符号,(-)或l是指化合物是左旋的,前缀(+)或d是指化合物是右旋的。这些立体异构体的化学结构是相同的,但其立体结构不一样。特定的立体异构体可以是对映体,异构体的混合物通常称为对映异构体混合物。50:50的对映体混合物被称为外消旋混合物或外消旋体,这可能导致化学反应过程中没有立体选择性或立体定向性。术语“外消旋混合物”和“外消旋体”是指等摩尔的两个对映异构体的混合物,缺乏光学活性。
39、依据起始物料和方法的选择,本发明化合物可以以可能的异构体中的一个或它们的混合物,例如外消旋体和非对应异构体混合物(这取决于不对称碳原子的数量)的形式存在。光学活性的(r)-或(s)-异构体可使用手性合成子或手性试剂制备,或使用常规技术拆分。
40、所得的任何立体异构体的混合物可以依据组分物理化学性质上的差异被分离成纯的或基本纯的几何异构体,对映异构体,非对映异构体,例如,通过色谱法和/或分步结晶法。
41、本发明的“卤素”是指氟、氯、溴、碘。本发明的“卤代”是指被氟、氯、溴或碘取代。
42、本发明的“烷基”指直链或支链的饱和脂肪烃基团,优选含1至6个碳原子的直链或支链基团,进一步优选含有1至3个碳原子的直链或支链基团,非限制性实例包括甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、叔丁基、仲丁基、正戊基、1,1-二甲基丙基、1,2-二甲基丙基、2,2-二甲基丙基、1-乙基丙基、2-甲基丁基、3-甲基丁基、正己基等。烷基可以是取代的或未取代的,当被取代时,取代基可以在任何可使用的连接点上。
43、本发明的“羰基”、“酰基”均指-c(o)-。
44、本发明的“磺酰基”是指-s(o)2-。
45、本发明的“磺酰胺基”是指-s(o)2nh-。
46、本发明的“卤代烷基”是指至少被一个卤素取代的烷基。
47、本发明的“羟基烷基”是指至少被一个羟基取代的烷基。
48、本发明的“烷氧基”是指-o-烷基。烷氧基的非限制性实例包括:甲氧基、乙氧基、丙氧基、正丙氧基、异丙氧基、异丁氧基、仲丁氧基等。烷氧基可以是任选取代的或未取代的,当被取代时,取代基可以在任何可使用的连接点上。
49、本发明的“环烷基”是指环状的饱和烃基。合适的环烷基可以为取代或未取代的具有3-12个碳原子的单环、二环或三环饱和烃基,例如环丙基、环丁基、环戊基、环己基。
50、本发明的“杂环基”是指具有1至4个环杂原子(其中每个杂原子独立地选自氮、氧、硫、硼、磷以及硅)的3-至15-元非芳香族环系统的基团(“3-15元杂环基”)。在包含一个或多个氮原子的杂环基基团中,连接点可以是碳或氮原子,只要化合价许可。杂环基基团或者可以是单环的(“单环杂环基”)或者是融合的、桥联的或螺的环系统(例如二环系统(又称“二环杂环基”))并且可以是饱和的或可以是部分不饱和的,其中,所述的二环杂环基包括但不限于苯并氮杂环基、苯并氧杂环基、苯并硫杂环基、苯并二氮杂环基、苯并二氧杂环基、苯并二硫杂环基、苯并氧氮杂环基、苯并硫氮杂环基。合适的杂环基包括但不限于哌啶基、氮杂环丁烷基、氮杂环丙烷基、四氢吡咯基、哌嗪基、二氢喹唑啉基、氧杂环丙基、氧杂环丁基、四氢呋喃基、四氢吡喃基、二氢苯并氧杂环己烯基、二氢喹啉基、四氢喹啉基、二氢异喹啉基和四氢异喹啉基等。杂环基的每个实例可以是任选取代的或未取代的,当被取代时,取代基可以在任何可使用的连接点上。
51、本发明的“芳基”是指可以包含单环或稠合多环的芳香体系,优选包含单环或稠合双环的芳香体系,其含有6个至12个碳原子,优选含有约6至约10个碳原子。合适的芳基包括但不限于苯基、萘基、蒽基、芴基、茚满基。芳基可以是任选取代的或未取代的,当被取代时,取代基可以在任何可使用的连接点上。
52、本发明的“杂芳基”是指至少有一个碳原子被杂原子替代的芳基,优选由5-12个原子构成(5-12元杂芳基),进一步优选由5-10个原子组成(5-10元杂芳基),所述的杂原子为o、s、n。所述杂芳基包括但不限于咪唑基、吡咯基、呋喃基、噻吩基、吡唑基、噁唑基、噻唑基、异噁唑基、异噻唑基、噁二唑基、三唑基、四唑基、吲哚基、吡啶基、嘧啶基、哒嗪基、吡嗪基、三嗪基、异吲哚基、苯并吡唑基、苯并咪唑基、苯并呋喃基、苯并吡喃基、苯并噻吩基、苯并噁唑基、苯并噻唑基、苯并异噁唑基、苯并异噻唑基、喹啉基、异喹啉基、喹唑啉基、噌啉基、喹喔啉基、苯并噁嗪基、苯并噻嗪基、咪唑并吡啶基、嘧啶并吡唑基、嘧啶并咪唑基、哒嗪并吡咯基、哒嗪并咪唑基、吡啶并吡咯基、吡啶并吡唑基等。杂芳基可以是任选取代的或未取代的,当被取代时,取代基可以在任何可使用的连接点上。
53、本发明的“环烷基烷氧基”是指一种烷氧基基团,其中该烷氧基基团的至少一个氢原子已被本文定义的环烷基基团取代。
54、本发明的“杂环基烷氧基”是指一种烷氧基基团,其中该烷氧基基团的至少一个氢原子已被本文定义的杂环基基团取代。
55、本发明的“药学上可接受的盐”是指本发明化合物的盐,这类盐用于哺乳动物体内时具有安全性和有效性,且具有应有的生物活性。
56、本发明的“溶剂化物”在常规意义上是指溶质(如活性化合物、活性化合物的盐)和溶剂(如水)组合形成的复合物。溶剂是指本领域的技术人员所知的或容易确定的溶剂。如果是水,则溶剂化物通常被称作水合物,例如半水合物、一水合物、二水合物、三水合物或其替代量等。
57、具有化学式(i)的化合物的体内作用可以部分地由在给予具有化学式(i)的化合物之后在人体或动物体内形成的一种或多种代谢物来发挥。如上所述,具有化学式(i)的化合物的体内作用也可以经由前体化合物(“前药”)代谢来发挥。本发明的“前药”是指在生物体中的生理条件下,由于与酶、胃酸等反应而转化成本发明化合物的化合物,即通过酶的氧化、还原、水解等转化成本发明化合物的化合物和/或通过胃酸等的水解反应等转化成本发明化合物的化合物等。
58、本发明的“结晶”是指其内部结构是在三维上规律地重复构成原子(或其集团)而形成的固体,有别于不具有这种规律的内部结构的无定形固体。
59、本发明的“药物组合物”是指包含任何一种本发明所述的化合物,包括对应的异构体、前药、溶剂化物、药学上可接受的盐或其化学的保护形式,和一种或多种可药用载体和/或另一种或多种药物的混合物。药用组合物的目的是促进化合物对生物体的给药。所述组合物通常用于制备治疗和/或预防由一种或多种激酶介导的疾病的药物。
60、本发明的“可药用载体”是指对有机体不引起明显刺激性和不干扰所给予化合物的生物活性和性质的载体,包含所有的溶剂、稀释剂或其它赋形剂、分散剂、表面活性剂等渗剂、增稠剂或乳化剂、防腐剂、固体粘合剂、润滑剂等。除非任何常规载体介质与本发明化合物不相容。可以作为药学上可接受的载体的一些实例包括,但不限于糖类,如乳糖、葡萄糖和蔗糖;淀粉,如玉米淀粉和马铃薯淀粉;纤维素及其衍生物,如羧甲基纤维素钠、以及纤维素和乙酸纤维素;麦芽、明胶等。
61、本发明的“赋形剂”指加入到药用组合物中以进一步促进给予化合物的惰性物质。赋形剂可以包括碳酸钙、磷酸钙、多种糖类和多种类型的淀粉、纤维素衍生物、明胶、植物油、聚乙二醇。
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