序列切割位置的预测方法、装置、设备、介质及产品与流程

摘要: 本申请实施例涉及生物信息,特别涉及一种序列切割位置的预测方法、装置、设备、介质及产品。背景技术:1、生物技术的快速发展为医学的进步提供了良好的帮助,准确分析细胞...
序列切割位置的预测方法、装置、设备、介质及产品与流程

本申请实施例涉及生物信息,特别涉及一种序列切割位置的预测方法、装置、设备、介质及产品。

背景技术:

1、生物技术的快速发展为医学的进步提供了良好的帮助,准确分析细胞生命周期的各个时期的变化,对疾病预防、早期诊断等方面存在重要意义。

2、研究发现游离脱氧核糖核酸(cell-free deoxyribonucleic acid,cfdna)是从细胞释放到血液中的dna片段,通常是细胞在死亡或损伤时释放的,如:细胞的dna在正常状态或病理状态下被切割酶切割时,形成的cfdna会进入血液循环。相关技术中,通常会确定释放cfdna时的dna切口,并在dna切口周侧通过分析碱基频率的方法揭示cfdna片段的状态,以分析细胞死亡的原因,如确定是否患病或者疾病类型。

3、然而上述过程仍然局限于对个体血液中cfdna的片段单独分析,分析的全面性较差,也导致无法较好地实现疾病预防、早期诊断的目的。

技术实现思路

1、本申请实施例提供了一种序列切割位置的预测方法、装置、设备、介质及产品,能够借助第一生物体相关的生物分子序列和额外提供的分子作用物质,分析分子作用物质在生物分子序列上最有可能切割的序列切割位置,有助于更准确地分析第一生物体的疾病患病风险。所述技术方案如下。

2、一方面,提供了一种序列切割位置的预测方法,所述方法包括:

3、获取第一生物体对应的生物分子序列,所述生物分子序列包括至少两个分子位点;

4、获取分子作用物质,所述分子作用物质用于切割所述生物分子序列;

5、基于所述细胞结构数据中所述分子作用物质与所述生物分子序列之间的相对位置关系,预测与所述生物分子序列对应的序列切割位置,所述序列切割位置用于表征所述分子作用物质在所述至少两个分子位点中的切割位置。

6、另一方面,提供了一种序列切割位置的预测装置,所述装置包括:

7、获取模块,用于获取第一生物体对应的生物分子序列,所述生物分子序列包括至少两个分子位点;

8、获取模块,还用于获取分子作用物质,所述分子作用物质用于切割所述生物分子序列;

9、预测模块,用于基于所述细胞结构数据中所述分子作用物质与所述生物分子序列之间的相对位置关系,预测与所述生物分子序列对应的序列切割位置,所述序列切割位置用于表征所述分子作用物质在所述至少两个分子位点中的切割位置。

10、另一方面,提供了一种计算机设备,所述计算机设备包括处理器和存储器,所述存储器中存储有至少一条指令、至少一段程序、代码集或指令集,所述至少一条指令、所述至少一段程序、所述代码集或指令集由所述处理器加载并执行以实现如上述本申请实施例中任一所述的序列切割位置的预测方法。

11、另一方面,提供了一种计算机可读存储介质,所述存储介质中存储有至少一条指令、至少一段程序、代码集或指令集,所述至少一条指令、所述至少一段程序、所述代码集或指令集由处理器加载并执行以实现如上述本申请实施例中任一所述的序列切割位置的预测方法。

12、另一方面,提供了一种计算机程序产品或计算机程序,该计算机程序产品或计算机程序包括计算机指令,该计算机指令存储在计算机可读存储介质中。计算机设备的处理器从计算机可读存储介质读取该计算机指令,处理器执行该计算机指令,使得该计算机设备执行上述实施例中任一所述的序列切割位置的预测方法。

13、本申请实施例提供的技术方案带来的有益效果至少包括:

14、基于分子作用物质与生物分子序列之间的相对位置关系,预测分子作用物质作用于生物分子序列时最可能的序列切割位置,以便通过序列切割位置预测第一生物体的生物异常状态。借助第一生物体相关的生物分子序列和额外提供的分子作用物质,分析分子作用物质在生物分子序列上最有可能切割的序列切割位置。由于疾病、遗传突变等生物学信息往往会通过序列切割位置体现,因此尽可能全面且完善地预测序列切割位置,有助于更准确地分析第一生物体的疾病患病风险,帮助作为疾病识别的早期检测依据,从而可以较好地辅助规避疾病,也有助于开发更加完善的诊断方式和治疗策略。

1.一种序列切割位置的预测方法,其特征在于,所述方法包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述基于所述分子作用物质与所述生物分子序列之间的相对位置关系,预测与所述生物分子序列对应的序列切割位置,包括:

3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述分子位点用于存储生物分子,所述生物分子包括至少一个生物原子;

4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述基于所述第一分子位点,预测与所述生物分子序列对应的所述序列切割位置,包括:

5.根据权利要求1至4任一所述的方法,其特征在于,所述获取第一生物体对应的生物分子序列,包括:

6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述基于所述游离分子序列确定所述第一生物体对应的所述生物分子序列,包括:

7.根据权利要求1至4任一所述的方法,其特征在于,所述基于所述分子作用物质与所述生物分子序列之间的相对位置关系,预测与所述生物分子序列对应的序列切割位置,包括:

8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,所述对所述生物分子序列和所述分子作用物质执行结构预测,生成与游离分子序列对应的至少两个细胞结构数据,包括:

9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,所述从所述至少两个预测结构数据中,筛选符合结构筛选条件的所述预测结构数据作为所述细胞结构数据,包括:

10.根据权利要求9所述的方法,其特征在于,所述从所述至少两个预测结构数据中,筛选所述分子作用物质未与核心组蛋白绑定的所述预测结构数据作为所述细胞结构数据,包括:

11.根据权利要求9所述的方法,其特征在于,所述从所述至少两个预测结构数据中,筛选连接组蛋白处于生物测序数据之内的所述预测结构数据作为所述细胞结构数据,包括:

12.根据权利要求9所述的方法,其特征在于,所述筛选所述游离分子序列包围所述核心组蛋白和所述连接组蛋白的所述预测结构数据作为所述细胞结构数据,包括:

13.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,所述得到与所述至少两个细胞结构数据分别对应的序列切割位置之后,还包括:

14.根据权利要求13所述的方法,其特征在于,所述基于所述至少一个序列切割位置分别对应的所述结构数据数量,预测所述第一生物体的生物异常状态,包括:

15.根据权利要求13所述的方法,其特征在于,所述方法还包括:

16.一种序列切割位置的预测装置,其特征在于,所述装置包括:

17.一种计算机设备,其特征在于,所述计算机设备包括处理器和存储器,所述存储器中存储有至少一段程序,所述至少一段程序由所述处理器加载并执行以实现如权利要求1至15任一所述的序列切割位置的预测方法。

18.一种计算机可读存储介质,其特征在于,所述存储介质中存储有至少一段程序,所述至少一段程序由处理器加载并执行以实现如权利要求1至15任一所述的序列切割位置的预测方法。

19.一种计算机程序产品,其特征在于,包括计算机指令,所述计算机指令被处理器执行时实现如权利要求1至15任一所述的序列切割位置的预测方法。