一种与苹果属植物根皮苷有无性状相关的分子标记及应用

技术特征：
1.一种与苹果属植物根皮苷有无性状相关的indel分子标记，其特征在于，所述indel分子标记序列为如下任一：1)如seq id no.4所示dna序列；2)包含seq id no.4所示dna序列；3)与seq id no.4具有至少80％，优选至少90％，更优选至少95％同源性的dna序列，且序列来源于苹果属植物。2.权利要求1所述分子标记的应用，其特征在于，为如下任一：1)鉴定苹果属植物根皮苷性状；2)预测苹果属植物根皮苷性状；3)在苹果属根皮苷分子标记辅助育种中的应用。3.检测权利要求1所述的indel分子标记的试剂在鉴定或预测苹果属植物根皮苷性状中的应用，或在苹果属根皮苷分子标记辅助育种中的应用。4.权利要求3所述的应用，其特征在于，所述试剂种类包括但不限于pcr类试剂、基因芯片类试剂或测序试剂。5.权利要求3所述的应用，其特征在于，所述试剂包含seq id no.5和6所示引物对。6.一种用于扩增检测权利要求1所述indel分子标记的引物对,其特征在于，所述分子标记的正向引物位于寒富苹果参考基因组(hfth1.genome)15号染色体上51836264(即pgt1基因起始密码子atg(51836106)上游158bp)的上游，反向引物位于参考基因组(hfth1.genome)15号染色体上51836264的下游；优选的，所述分子标记的正向引物位于参考基因组(hfth1.genome)15号染色体的51842406-51841914，位于基因pgt1起始密码子atg上游5808-6300bp；反向引物位于参考基因组15号染色体的51836264-51834654，位于基因pgt1起始密码子上游158bp-下游1452bp；所述引物对用于验证pgt1起始密码子atg上游158bp至上游基因lea之间的pgt1启动子区域3555bp的大片段缺失。7.权利要求6所述的与苹果属植物根皮苷有无性状相关的indel分子标记的引物对，其特征在于，所述引物对序列如seq id no.5和6所示。8.一种苹果属植物根皮苷性状检测试剂盒，其特征在于，包含权利要求6-7任一所述的引物对。9.一种预测苹果属植物根皮苷性状有无的方法，其特征在于，利用权利要求6-8任一所述引物对或试剂盒对苹果属植物进行检测。10.一种预测苹果属植物根皮苷性状有无的方法，其特征在于，以苹果属植物的基因组dna为模板，以权利要求6-7任一所述引物对为扩增引物，进行pcr扩增，对扩增产物进行电泳检测，若能够扩增出权利要求1所述indel分子标记，则待测苹果属植物含有根皮苷。

技术总结
本发明公开了一种与苹果属植物根皮苷有无性状相关的分子标记及应用。具体而言，本发明提供了一种与苹果属植物根皮苷有无性状相关的InDel分子标记，还提供与苹果属植物根皮苷有无性状相关的上述InDel分子标记在苹果属根皮苷分子标记辅助育种中的应用，本发明在苗期就可以判断苹果属植物根皮苷有无这一性状，大副节省育种时间和占地面积。大副节省育种时间和占地面积。大副节省育种时间和占地面积。


技术研发人员：李鹏民 王娱乐
受保护的技术使用者：西北农林科技大学
技术研发日：2021.11.01
技术公布日：2022/11/15