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一种肝癌多结节相关驱动基因的筛选方法及其应用

2022-09-15 01:05:10 来源:中国专利 TAG:

技术特征:
1.一种肝癌多结节相关驱动基因的筛选方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:(1)收集肝癌组织标本及对照癌旁标本;(2)提取样本dna进行全外显子组测序;(3)生物信息学分析。2.根据权利要求1所述的筛选方法,其特征在于,所述步骤(2)的具体操作为:采取covaris技术将检测合格的dna样品打断成180-220bp的片段,采用roche nimblegen seqcap ez exome v3/agilent sureselect humanall exon v6外显子捕获试剂盒构建文库,经illumina nova seq6000系列测序仪完成双端测序。3.根据权利要求2所述的筛选方法,其特征在于,所述步骤(3)的具体操作为:原始下机数据进行过滤后得到高质量数据,将之与参考基因组序列进行比对,后再完成生物信息学分析。4.根据权利要求3所述的筛选方法,其特征在于,还包括步骤(4)结合样本的病理学信息特征进行个性化分析,得到与肝癌多结节发生密切相关的驱动基因并进行功能富集。5.根据权利要求4所述的筛选方法,其特征在于,筛选得到的肝癌结节相关驱动基因包括mtor、cdkn1a、macf1、chd8和kdm6b。6.权利要求1-5中任一项所述的筛选方法在肝癌多结节相关驱动基因筛选中的应用。

技术总结
本发明公开了一种肝癌多结节相关驱动基因的筛选方法及其应用,属于医学技术领域。该方法包括以下步骤:(1)收集肝癌组织标本及对照癌旁标本;(2)提取样本DNA进行全外显子组测序;(3)生物信息学分析;(4)结合样本的病理学信息特征进行个性化分析,得到与肝癌多结节发生密切相关的驱动基因并进行功能富集。本发明筛选得到了多个与人类肝癌发生有关的驱动基因,如:MTOR、CDKN1A、MACF1、CHD8和KDM6B等。因此,本发明为多结节肝癌的精准医疗提供了科学依据。依据。依据。


技术研发人员:刘军杰 陈洁 罗涛
受保护的技术使用者:广西医科大学附属肿瘤医院
技术研发日:2022.06.23
技术公布日:2022/9/13
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