空间转录组数据的处理方法及装置、计算机可读存储介质与流程

1.本发明涉及数据处理技术领域，具体而言，涉及一种空间转录组数据的处理方法及装置、计算机可读存储介质。


背景技术：

2.在生物体中，细胞位置信息和功能的行使紧密相关，因此保留组织内细胞位置信息并同时检测组织切片转录组信息的“空间转录组技术”，在微环境，发育，细胞迁移，细胞命运决定等相关领域研究中均得到广泛的应用。目前，10x visium空间转录组解决方案通过组织形态学(h&e染色或者免疫荧光二选一)和组织原位基因活跃度信息的结合，实现了组织切片基因表达的无偏检测。但在生命科学领域的实际应用需求中，组织形态学信息需要多种形态鉴别数据的相互结合来支撑研究数据从而得出可靠的结论或判断。但是，这种二选一的空间转录组解决方案在组织形态学信息方面还有一定的限制，存在以下缺陷：结合h&e染色的空间转录组技术，形态学信息单一，不能提供蛋白表达信息和空间转录组测序数据的后续分析结合免疫荧光的空间转录组技术缺点：(1)建库切片厚度太厚(一般10um),蛋白形态学染色厚度一般为5-8um；(2)组织切片需要经过预冷的甲醇固定，该固定方法保存抗原效果不理想，尤其是细胞表面抗原，难以获得理想的荧光染色效果；(3)组织切片经过比较繁琐的荧光染色处理过程，对rna完整性有一定程度破坏，会降低基因检出h&e染色空间转录组测序，临片进行免疫荧光染色，根据荧光染色结果手动圈出目标区域，对应测序数据进行单独分析，该方法主观性偏强，准确性低，耗时间，效率低。
3.针对上述的问题，目前尚未提出有效的解决方案。


技术实现要素：

4.本发明实施例提供了一种空间转录组数据的处理方法及装置、计算机可读存储介质，以至少解决相关技术中仅采用结合单一形态学信息的空间转录组技术对样本进行分析，可靠性较低的技术问题。
5.根据本发明实施例的一个方面，提供了一种空间转录组数据的处理方法，包括：通过空间转录组技术获取目标样本切片的h&e染色图像和空间转录组测序分析结果；通过荧光染色法对所述目标样本切片进行靶蛋白的荧光标记抗体染色，得到所述靶蛋白的荧光染色图像；将所述h&e染色图像以及所述荧光染色图像进行叠加，得到叠加图像；提取所述叠加图像中荧光阳性信号对应的位点信息；根据所述空间转录组测序分析结果对所述位点信息对应的转录组数据进行分析处理，得到所述目标样本切片在所述位点信息处的空间转录组数据分析结果。
6.可选地，通过空间转录组技术获取目标样本切片的h&e染色图像，包括：对目标样本进行切片处理，得到所述目标样本切片；对所述目标样本切片进行h&e染色，得到所述h&e染色图像。
7.可选地，对所述目标样本切片进行h&e染色，得到所述h&e染色图像，包括：在利用
甲醇对所述目标样本切片进行固定后，对固定后的所述目标样本切片进行h&e染色，得到所述h&e染色图像。
8.可选地，通过荧光染色法对所述目标样本切片进行靶蛋白的荧光标记抗体染色，得到所述靶蛋白的荧光染色图像，包括：在利用多聚甲醛固定所述目标样本切片后，利用磷酸缓冲液pbs对所述目标样本切片进行第一预定次数的冲洗；对所述第一预定次数冲洗后的所述目标样本切片进行封闭处理，得到封闭处理后的目标样本切片；对所述封闭处理后的目标样本切片进行一抗孵育，得到一抗孵育后的所述目标样本切片；在利用所述pbs对所述一抗孵育后的所述目标样本切片进行第二预定次数的冲洗后，对所述第二预定次数冲洗后的所述一抗孵育后的目标样本切片进行染色，得到染色后的目标样本切片；对所述染色后的目标样本切片进行图像采集，得到所述荧光染色图像。
9.可选地，将所述h&e染色图像以及所述荧光染色图像进行叠加，得到叠加图像，包括：响应于对所述h&e染色图像以及所述荧光染色图像的叠加处理操作，得到所述叠加图像。
10.可选地，将所述h&e染色图像以及所述荧光染色图像进行叠加，得到叠加图像，包括：获取所述位点信息对应的所述转录组数据的第一预定文件；获取所述荧光染色图像中与所述h&e染色图像相邻的目标荧光染色图像；获取所述目标荧光染色图像的第二预定文件；获取图像缩放倍数对应的第三预定文件；将所述第一预定文件第二预定文件以及所述第三预定文件输入至预定分析软件，以利用所述预定分析软件对所述h&e染色图像以及所述荧光染色图像进行叠加，得到所述叠加图像。
11.可选地，根据所述空间转录组测序分析结果对所述位点信息对应的转录组数据进行分析处理，得到所述目标样本切片在所述位点信息处的空间转录组数据分析结果，包括：利用所述预定分析软件对以及所述空间转录组测序分析结果以及所述叠加图像进行分析，得到所述叠加图像中荧光阳性信号对应的位点信息；利用所述预定分析软件对所述位点信息对应的转录组数据进行分析处理，以得到所述目标样本切片在所述位点信息处的空间转录组数据分析结果。
12.根据本发明实施例的另外一个方面，还提供了一种空间转录组数据的处理装置，包括：第一获取单元，用于通过空间转录组技术获取目标样本切片的h&e染色图像和空间转录组测序分析结果；染色单元，用于通过荧光染色法对所述目标样本切片进行靶蛋白的荧光标记抗体染色，得到所述靶蛋白的荧光染色图像；叠加单元，用于将所述h&e染色图像以及所述荧光染色图像进行叠加，得到叠加图像；提取单元，用于提取所述叠加图像中荧光阳性信号对应的位点信息；第二获取单元，用于根据所述空间转录组测序分析结果对所述位点信息对应的转录组数据进行分析处理，得到所述目标样本切片在所述位点信息处的空间转录组数据分析结果。
13.可选地，所述第一获取单元，包括：切片子单元，用于对目标样本进行切片处理，得到所述目标样本切片；第一获取子单元，用于对所述目标样本切片进行h&e染色，得到所述h&e染色图像。
14.可选地，所述第一获取子单元，包括：第一获取模块，用于在利用甲醇对所述目标样本切片进行固定后，对固定后的所述目标样本切片进行h&e染色，得到所述h&e染色图像。
15.可选地，所述染色单元，包括：冲洗子单元，用于在利用多聚甲醛固定所述目标样
本切片后，利用磷酸缓冲液pbs对所述目标样本切片进行第一预定次数的冲洗；封闭处理子单元，用于对所述第一预定次数冲洗后的所述目标样本切片进行封闭处理，得到封闭处理后的目标样本切片；一抗孵育子单元，用于对所述封闭处理后的目标样本切片进行一抗孵育，得到一抗孵育后的所述目标样本切片；染色子单元，用于在利用所述pbs对所述一抗孵育后的所述目标样本切片进行第二预定次数的冲洗后，对所述第二预定次数冲洗后的所述一抗孵育后的目标样本切片进行染色，得到染色后的目标样本切片；图像采集子单元，用于对所述染色后的目标样本切片进行图像采集，得到所述荧光染色图像。
16.可选地，将所述h&e染色图像以及所述荧光染色图像进行叠加，得到叠加图像，包括：响应于对所述h&e染色图像以及所述荧光染色图像的叠加处理操作，得到所述叠加图像。
17.可选地，所述叠加单元，包括：第二获取子单元，用于获取所述位点信息对应的所述转录组数据的第一预定文件；第三获取子单元，用于获取所述荧光染色图像中与所述h&e染色图像相邻的目标荧光染色图像；第四获取子单元，用于获取所述目标荧光染色图像的第二预定文件；第五获取子单元，用于获取图像缩放倍数对应的第三预定文件；叠加子单元，用于将所述第一预定文件第二预定文件以及所述第三预定文件输入至预定分析软件，以利用所述预定分析软件对所述h&e染色图像以及所述荧光染色图像进行叠加，得到所述叠加图像。
18.可选地，所述第二获取单元，包括：分析子单元，用于利用所述预定分析软件对以及所述空间转录组测序分析结果以及所述叠加图像进行分析，得到所述叠加图像中荧光阳性信号对应的位点信息；第六获取子单元，用于利用所述预定分析软件对所述位点信息对应的转录组数据进行分析处理，以得到所述目标样本切片在所述位点信息处的空间转录组数据分析结果。
19.根据本发明实施例的另外一个方面，还提供了一种计算机可读存储介质，所述计算机可读存储介质包括存储的计算机程序，其中，在所述计算机程序被处理器运行时控制所述计算机可读存储介质所在设备执行上述中任一项所述的空间转录组数据的处理方法。
20.根据本发明实施例的另外一个方面，还提供了一种处理器，所述处理器用于运行计算机程序，其中，所述计算机程序运行时执行上述中任一项所述的空间转录组数据的处理方法。
21.在本发明实施例中，通过空间转录组技术获取目标样本切片的h&e染色图像和空间转录组测序分析结果；通过荧光染色法对目标样本切片进行靶蛋白的荧光标记抗体染色，得到靶蛋白的荧光染色图像；将h&e染色图像以及荧光染色图像进行叠加，得到叠加图像；提取叠加图像中荧光阳性信号对应的位点信息；根据空间转录组测序分析结果对位点信息对应的转录组数据进行分析处理，得到目标样本切片在位点信息处的空间转录组数据分析结果。通过本发明实施例提供的空间转录组数据的处理方法，实现了将h&e染色与荧光染色相结合，以得到样本的空间转录组分析结果的目的，达到了提高对样本进行空间转录组分析结果可靠性的技术效果，进而解决了相关技术中仅采用结合单一形态学信息的空间转录组技术对样本进行分析，可靠性较低的技术问题。
附图说明
22.此处所说明的附图用来提供对本发明的进一步理解，构成本技术的一部分，本发明的示意性实施例及其说明用于解释本发明，并不构成对本发明的不当限定。在附图中：
23.图1是根据本发明实施例的空间转录组数据的处理方法的流程图；
24.图2是根据本发明实施例的对目标样本切片进行荧光染色的流程图；
25.图3是根据本发明实施例的可选的空间转录组数据的处理方法的流程图；
26.图4是根据本发明实施例的空间转录组数据的处理装置的示意图。
具体实施方式
27.为了使本技术领域的人员更好地理解本发明方案，下面将结合本发明实施例中的附图，对本发明实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述，显然，所描述的实施例仅仅是本发明一部分的实施例，而不是全部的实施例。基于本发明中的实施例，本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例，都应当属于本发明保护的范围。
28.需要说明的是，本发明的说明书和权利要求书及上述附图中的术语“第一”、“第二”等是用于区别类似的对象，而不必用于描述特定的顺序或先后次序。应该理解这样使用的数据在适当情况下可以互换，以便这里描述的本发明的实施例能够以除了在这里图示或描述的那些以外的顺序实施。此外，术语“包括”和“具有”以及他们的任何变形，意图在于覆盖不排他的包含，例如，包含了一系列步骤或单元的过程、方法、系统、产品或设备不必限于清楚地列出的那些步骤或单元，而是可包括没有清楚地列出的或对于这些过程、方法、产品或设备固有的其它步骤或单元。
29.实施例1
30.根据本发明实施例，提供了一种空间转录组数据的处理方法的方法实施例，需要说明的是，在附图的流程图示出的步骤可以在诸如一组计算机可执行指令的计算机系统中执行，并且，虽然在流程图中示出了逻辑顺序，但是在某些情况下，可以以不同于此处的顺序执行所示出或描述的步骤。
31.图1是根据本发明实施例的空间转录组数据的处理方法的流程图，如图1所示，该空间转录组数据的处理方法包括如下步骤：
32.步骤s102，通过空间转录组技术获取目标样本切片的h&e染色图像和空间转录组测序分析结果。
33.步骤s104，通过荧光染色法对目标样本切片进行靶蛋白的荧光标记抗体染色，得到靶蛋白的荧光染色图像。
34.步骤s106，将h&e染色图像以及荧光染色图像进行叠加，得到叠加图像。
35.步骤s108，提取叠加图像中荧光阳性信号对应的位点信息。
36.步骤s110，根据空间转录组测序分析结果对位点信息对应的转录组数据进行分析处理，得到目标样本切片在位点信息处的空间转录组数据分析结果。
37.由上可知，在本发明实施例中，可以通过空间转录组技术获取目标样本切片的h&e染色图像和空间转录组测序分析结果；通过荧光染色法对目标样本切片进行靶蛋白的荧光标记抗体染色，得到靶蛋白的荧光染色图像；将h&e染色图像以及荧光染色图像进行叠加，
得到叠加图像；提取叠加图像中荧光阳性信号对应的位点信息；根据空间转录组测序分析结果对位点信息对应的转录组数据进行分析处理，得到目标样本切片在位点信息处的空间转录组数据分析结果。在本发明实施例中，实现了将h&e染色与荧光染色相结合，以得到样本的空间转录组分析结果的目的，达到了提高对样本进行空间转录组分析结果可靠性的技术效果。
38.因此，通过本发明实施例提供的空间转录组数据的处理方法，解决了相关技术中仅采用结合单一形态学信息的空间转录组技术对样本进行分析，可靠性较低的技术问题。
39.在上述步骤s102中，通过空间转录组技术获取目标样本切片的h&e染色图像，可以包括：对目标样本进行切片处理，得到目标样本切片；对目标样本切片进行h&e染色，得到h&e染色图像。
40.由于免疫荧光建库切片存在切片比较厚，可达10um，而蛋白形态学染色厚度一般为5-8um。因此，在本发明实施例中，通过空间转录组技术对目标样本进行切片处理，并对目标样本切片进行h&e染色，得到h&e染色图像。
41.作为一种可选的实施例，对目标样本切片进行h&e染色，得到h&e染色图像，可以包括：在利用甲醇对目标样本切片进行固定后，对固定后的目标样本切片进行h&e染色，得到h&e染色图像。
42.由于相关技术中对组织切片(即，目标样本切片)进行保存的效果不理想，尤其是细胞表面抗原，难以获得理想的荧光染色效果；因此，在上述实施例中，对组织切片进行预冷的甲醇固定，以获取比较理想的荧光染色效果；并且通过对组织切片进行固定后，有效降低了在组织切片经过比较繁琐的荧光染色处理过程中，对rna完整性在一定程度上的破坏，从而也提高了基因检出率。
43.作为一种可选的实施例，通过荧光染色法对目标样本切片进行靶蛋白的荧光标记抗体染色，得到靶蛋白的荧光染色图像，包括：在利用多聚甲醛固定目标样本切片后，利用磷酸缓冲液pbs对目标样本切片进行第一预定次数的冲洗；对第一预定次数冲洗后的目标样本切片进行封闭处理，得到封闭处理后的目标样本切片；对封闭处理后的目标样本切片进行一抗孵育，得到一抗孵育后的目标样本切片；在利用pbs对一抗孵育后的目标样本切片进行第二预定次数的冲洗后，对第二预定次数冲洗后的一抗孵育后的目标样本切片进行染色，得到染色后的目标样本切片；对染色后的目标样本切片进行图像采集，得到荧光染色图像。
44.图2是根据本发明实施例的对目标样本切片进行荧光染色的流程图，如图2所示，可以先利用多聚甲醛固定目标样本切片，接着对目标样本切片进行第一预定次数(例如，3次)的pbs冲洗以使得目标样本切片比较通透；然后对冲洗后的目标组织切片进行封闭处理以及一抗孵育处理；对一抗孵育处理后的目标样本切片进行第二预定次数(例如，3次)的冲洗；再对冲洗后的目标组织切片进行二抗孵育、冲洗处理；并对冲洗后的目标组织切片进行hochest核染；最后，对hochest核染后的目标样本切片进行冲洗后进行封片、拍照成像，以得到荧光染色图像。
45.作为一种可选的实施例，将h&e染色图像以及荧光染色图像进行叠加，得到叠加图像，可以包括：响应于对h&e染色图像以及荧光染色图像的叠加处理操作，得到叠加图像。
46.具体地，将h&e染色图像以及荧光染色图像进行叠加，得到叠加图像，包括：获取位
点信息对应的转录组数据的第一预定文件；获取荧光染色图像中与h&e染色图像相邻的目标荧光染色图像；获取目标荧光染色图像的第二预定文件；获取图像缩放倍数对应的第三预定文件；将第一预定文件第二预定文件以及第三预定文件输入至预定分析软件，以利用预定分析软件对h&e染色图像以及荧光染色图像进行叠加，得到叠加图像。
47.在本发明实施例中，可以通过人工对h&e染色图片和荧光图片进行叠加处理，生成带有文库边框的免疫荧光的图像，提供对应的输入文件。
48.可选地，根据空间转录组测序分析结果对位点信息对应的转录组数据进行分析处理，得到目标样本切片在位点信息处的空间转录组数据分析结果，包括：利用预定分析软件对以及空间转录组测序分析结果以及叠加图像进行分析，得到叠加图像中荧光阳性信号对应的位点信息；利用预定分析软件对位点信息对应的转录组数据进行分析处理，以得到目标样本切片在位点信息处的空间转录组数据分析结果。
49.图3是根据本发明实施例的可选的空间转录组数据的处理方法的流程图，如图3所示，可以将rds文件、免疫荧光图像gfp以及包含图像缩放倍数的json文件输入至临片荧光分析软件(即，预定分析软件)，基于rds文件得到spot坐标(即，位点信息)，基于免疫荧光图像分析得到像素水平的rgb值，同时基于json获取缩放倍数，基于上述spot坐标、像素水平的rgb值以及缩放倍数得到spot水平的rgb统计量，进而进行kmeans分类(即，得到目标样本切片中的阳性和阴性信息)，接着再进行空间展示以及输出。
50.其中，上述rds文件为空间转录组seurat分析的文件。
51.由上可知，在本发明实施例中，利用基于h&e染色的空间转录组技术平台获得高质量的h&e染色的空间转录组测序数据，同时获得针对临近切片高质量的免疫荧光成像数据。具体包括以下步骤：1)利用载玻片上固化的带有空间条形码标记的寡核苷酸序列捕获组织切片中细胞内带有polya的mrna(空间转录组测序数据)；2)h&e染色空间转录组实验流程：组织切片厚度10um(单层细胞)，预冷甲醇固定，常规h&e染色，20x全景扫描成像，组织透化，反转录合成一链cdna，0.08m koh变性，二链cdna合成，cdna扩增，纯化，二代建库测序，测序数据分析；3)免疫荧光染色方案，(可以是荧光标记的dna探针或者抗体)：邻近组织切片厚度3-5um，可在文库切片附近取样形态和文库贴片匹配度高的切片约10片左右；采用针对不同标本和不同抗体的最佳的荧光染色方案进行染色，20x全景扫描成像；4)人工对h&e染色图片和荧光图片进行叠加处理，生成带有文库边框的免疫荧光的图像，提供对应的输入文件，预定分析软件对荧光图片和空间转录组数据结合分析。其中，该预定分析软件是在linux环境下基于r脚本语言开发的软件包，以命令行的形式运行。
52.通过本发明实施例提供的空间转录组数据的处理方法，有效克服了以下缺陷：1)结合h&e染色的空间转录组技术，形态学信息单一，不能提供蛋白表达信息和空间转录组测序数据的后续分析；2)结合免疫荧光的空间转录组技术缺点：(a)建库切片厚度太厚(一般10um)，蛋白形态学染色厚度一般为5-8um；(b)组织切片需要经过预冷的甲醇固定，该固定方法保存抗原效果不理想，尤其是细胞表面抗原，难以获得理想的荧光染色效果；(c)组织切片经过比较繁琐的荧光染色处理过程，对rna完整性有一定程度破坏，会降低基因检出；3)h&e染色空间转录组测序，临片进行免疫荧光染色，根据荧光染色结果手动圈出目标区域，对应测序数据进行单独分析，主观性偏强，准确性低，耗时间，效率低。既结合h&e染色又结合荧光染色数据的空间转录组解决方案，同时获得了组织切片高质量的空间测序数据和
理想的荧光成像的数据，并且利用图像识别和机器学习的算法对荧光信号进行识别和分类，开发的预定分析软件，实现了荧光数据和空间测序数据的自动化分析和空间转录组数据的深度挖掘。
53.因此，通过本发明实施例提供的空间转录组数据的处理方法，实现了结合多种形态学信息的空间转录组测序数据的自动化分析，既保证了组织切片中稳定的基因检出效果，又获得了针对不同蛋白组合定制的免疫荧光数据。而且通过图像识别和机器学习的算法对荧光信号进行精准识别和分类，对组织样本进行蛋白维度和rna维度空间数据的分析。
54.实施例2
55.根据本发明实施例的另外一个方面，还提供了一种空间转录组数据的处理装置，图4是根据本发明实施例的空间转录组数据的处理装置的示意图，如图4所示，该空间转录组数据的处理装置可以包括：第一获取单元41、染色单元43、叠加单元45、提取单元47以及第二获取单元49。下面对该空间转录组数据的处理装置进行说明。
56.第一获取单元41，用于通过空间转录组技术获取目标样本切片的h&e染色图像和空间转录组测序分析结果。
57.染色单元43，用于通过荧光染色法对目标样本切片进行靶蛋白的荧光标记抗体染色，得到靶蛋白的荧光染色图像。
58.叠加单元45，用于将h&e染色图像以及荧光染色图像进行叠加，得到叠加图像。
59.提取单元47，用于提取叠加图像中荧光阳性信号对应的位点信息。
60.第二获取单元49，用于根据空间转录组测序分析结果对位点信息对应的转录组数据进行分析处理，得到目标样本切片在位点信息处的空间转录组数据分析结果。
61.此处需要说明的是，上述确定单元41，第一获取单元43，第二获取单元45以及确定单元47对应于实施例2中的步骤s302至s308，上述单元与对应的步骤所实现的示例和应用场景相同，但不限于上述实施例2所公开的内容。需要说明的是，上述单元作为装置的一部分可以在诸如一组计算机可执行指令的计算机系统中执行。
62.由上可知，在本技术上述实施例中，可以利用第一获取单元通过空间转录组技术获取目标样本切片的h&e染色图像和空间转录组测序分析结果；然后利用染色单元通过荧光染色法对目标样本切片进行靶蛋白的荧光标记抗体染色，得到靶蛋白的荧光染色图像；接着利用叠加单元将h&e染色图像以及荧光染色图像进行叠加，得到叠加图像；再利用提取单元提取叠加图像中荧光阳性信号对应的位点信息；并利用第二获取单元根据空间转录组测序分析结果对位点信息对应的转录组数据进行分析处理，得到目标样本切片在位点信息处的空间转录组数据分析结果。通过本发明实施例提供的空间转录组数据的处理装置，实现了将h&e染色与荧光染色相结合，以得到样本的空间转录组分析结果的目的，达到了提高对样本进行空间转录组分析结果可靠性的技术效果，解决了相关技术中仅采用结合单一形态学信息的空间转录组技术对样本进行分析，可靠性较低的技术问题。
63.作为一种可选的实施例，第一获取单元，包括：切片子单元，用于对目标样本进行切片处理，得到目标样本切片；第一获取子单元，用于对目标样本切片进行h&e染色，得到h&e染色图像。
64.作为一种可选的实施例，第一获取子单元，包括：第一获取模块，用于在利用甲醇对目标样本切片进行固定后，对固定后的目标样本切片进行h&e染色，得到h&e染色图像。
65.作为一种可选的实施例，染色单元，包括：冲洗子单元，用于在利用多聚甲醛固定目标样本切片后，利用磷酸缓冲液pbs对目标样本切片进行第一预定次数的冲洗；封闭处理子单元，用于对第一预定次数冲洗后的目标样本切片进行封闭处理，得到封闭处理后的目标样本切片；一抗孵育子单元，用于对封闭处理后的目标样本切片进行一抗孵育，得到一抗孵育后的目标样本切片；染色子单元，用于在利用pbs对一抗孵育后的目标样本切片进行第二预定次数的冲洗后，对第二预定次数冲洗后的一抗孵育后的目标样本切片进行染色，得到染色后的目标样本切片；图像采集子单元，用于对染色后的目标样本切片进行图像采集，得到荧光染色图像。
66.作为一种可选的实施例，将h&e染色图像以及荧光染色图像进行叠加，得到叠加图像，包括：响应于对h&e染色图像以及荧光染色图像的叠加处理操作，得到叠加图像。
67.作为一种可选的实施例，叠加单元，包括：第二获取子单元，用于获取位点信息对应的转录组数据的第一预定文件；第三获取子单元，用于获取荧光染色图像中与h&e染色图像相邻的目标荧光染色图像；第四获取子单元，用于获取目标荧光染色图像的第二预定文件；第五获取子单元，用于获取图像缩放倍数对应的第三预定文件；叠加子单元，用于将第一预定文件第二预定文件以及第三预定文件输入至预定分析软件，以利用预定分析软件对h&e染色图像以及荧光染色图像进行叠加，得到叠加图像。
68.作为一种可选的实施例，第二获取单元，包括：分析子单元，用于利用预定分析软件对以及空间转录组测序分析结果以及叠加图像进行分析，得到叠加图像中荧光阳性信号对应的位点信息；第六获取子单元，用于利用预定分析软件对位点信息对应的转录组数据进行分析处理，以得到目标样本切片在位点信息处的空间转录组数据分析结果。
69.实施例3
70.根据本发明实施例的另外一个方面，还提供了一种计算机可读存储介质，计算机可读存储介质包括存储的计算机程序，其中，在计算机程序被处理器运行时控制计算机可读存储介质所在设备执行上述中任一项的空间转录组数据的处理方法。
71.实施例4
72.根据本发明实施例的另外一个方面，还提供了一种处理器，处理器用于运行计算机程序，其中，计算机程序运行时执行上述中任一项的空间转录组数据的处理方法。
73.上述本发明实施例序号仅仅为了描述，不代表实施例的优劣。
74.在本发明的上述实施例中，对各个实施例的描述都各有侧重，某个实施例中没有详述的部分，可以参见其他实施例的相关描述。
75.在本技术所提供的几个实施例中，应该理解到，所揭露的技术内容，可通过其它的方式实现。其中，以上所描述的装置实施例仅仅是示意性的，例如所述单元的划分，可以为一种逻辑功能划分，实际实现时可以有另外的划分方式，例如多个单元或组件可以结合或者可以集成到另一个系统，或一些特征可以忽略，或不执行。另一点，所显示或讨论的相互之间的耦合或直接耦合或通信连接可以是通过一些接口，单元或模块的间接耦合或通信连接，可以是电性或其它的形式。
76.所述作为分离部件说明的单元可以是或者也可以不是物理上分开的，作为单元显示的部件可以是或者也可以不是物理单元，即可以位于一个地方，或者也可以分布到多个单元上。可以根据实际的需要选择其中的部分或者全部单元来实现本实施例方案的目的。
77.另外，在本发明各个实施例中的各功能单元可以集成在一个处理单元中，也可以是各个单元单独物理存在，也可以两个或两个以上单元集成在一个单元中。上述集成的单元既可以采用硬件的形式实现，也可以采用软件功能单元的形式实现。
78.所述集成的单元如果以软件功能单元的形式实现并作为独立的产品销售或使用时，可以存储在一个计算机可读取存储介质中。基于这样的理解，本发明的技术方案本质上或者说对现有技术做出贡献的部分或者该技术方案的全部或部分可以以软件产品的形式体现出来，该计算机软件产品存储在一个存储介质中，包括若干指令用以使得一台计算机设备(可为个人计算机、服务器或者网络设备等)执行本发明各个实施例所述方法的全部或部分步骤。而前述的存储介质包括：u盘、只读存储器(rom，read-only memory)、随机存取存储器(ram，random access memory)、移动硬盘、磁碟或者光盘等各种可以存储程序代码的介质。
79.以上所述仅是本发明的优选实施方式，应当指出，对于本技术领域的普通技术人员来说，在不脱离本发明原理的前提下，还可以做出若干改进和润饰，这些改进和润饰也应视为本发明的保护范围。