一种残膜回收机防缠绕挑膜装置的制 一种秧草收获机用电力驱动行走机构

空间转录组数据的处理方法及装置、计算机可读存储介质与流程

2022-04-02 07:48:53 来源:中国专利 TAG:

技术特征:
1.一种空间转录组数据的处理方法,其特征在于,包括:通过空间转录组技术获取目标样本切片的h&e染色图像和空间转录组测序分析结果;通过荧光染色法对所述目标样本切片进行靶蛋白的荧光标记抗体染色,得到所述靶蛋白的荧光染色图像;将所述h&e染色图像以及所述荧光染色图像进行叠加,得到叠加图像;提取所述叠加图像中荧光阳性信号对应的位点信息;根据所述空间转录组测序分析结果对所述位点信息对应的转录组数据进行分析处理,得到所述目标样本切片在所述位点信息处的空间转录组数据分析结果。2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,通过空间转录组技术获取目标样本切片的h&e染色图像,包括:对目标样本进行切片处理,得到所述目标样本切片;对所述目标样本切片进行h&e染色,得到所述h&e染色图像。3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,对所述目标样本切片进行h&e染色,得到所述h&e染色图像,包括:在利用甲醇对所述目标样本切片进行固定后,对固定后的所述目标样本切片进行h&e染色,得到所述h&e染色图像。4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,通过荧光染色法对所述目标样本切片进行靶蛋白的荧光标记抗体染色,得到所述靶蛋白的荧光染色图像,包括:在利用多聚甲醛固定所述目标样本切片后,利用磷酸缓冲液pbs对所述目标样本切片进行第一预定次数的冲洗;对所述第一预定次数冲洗后的所述目标样本切片进行封闭处理,得到封闭处理后的目标样本切片;对所述封闭处理后的目标样本切片进行一抗孵育,得到一抗孵育后的所述目标样本切片;在利用所述pbs对所述一抗孵育后的所述目标样本切片进行第二预定次数的冲洗后,对所述第二预定次数冲洗后的所述一抗孵育后的目标样本切片进行染色,得到染色后的目标样本切片;对所述染色后的目标样本切片进行图像采集,得到所述荧光染色图像。5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,将所述h&e染色图像以及所述荧光染色图像进行叠加,得到叠加图像,包括:响应于对所述h&e染色图像以及所述荧光染色图像的叠加处理操作,得到所述叠加图像。6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,将所述h&e染色图像以及所述荧光染色图像进行叠加,得到叠加图像,包括:获取所述位点信息对应的所述转录组数据的第一预定文件;获取所述荧光染色图像中与所述h&e染色图像相邻的目标荧光染色图像;获取所述目标荧光染色图像的第二预定文件;获取图像缩放倍数对应的第三预定文件;将所述第一预定文件第二预定文件以及所述第三预定文件输入至预定分析软件,以利
用所述预定分析软件对所述h&e染色图像以及所述荧光染色图像进行叠加,得到所述叠加图像。7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,根据所述空间转录组测序分析结果对所述位点信息对应的转录组数据进行分析处理,得到所述目标样本切片在所述位点信息处的空间转录组数据分析结果,包括:利用所述预定分析软件对以及所述空间转录组测序分析结果以及所述叠加图像进行分析,得到所述叠加图像中荧光阳性信号对应的位点信息;利用所述预定分析软件对所述位点信息对应的转录组数据进行分析处理,以得到所述目标样本切片在所述位点信息处的空间转录组数据分析结果。8.一种空间转录组数据的处理装置,其特征在于,包括:第一获取单元,用于通过空间转录组技术获取目标样本切片的h&e染色图像和空间转录组测序分析结果;染色单元,用于通过荧光染色法对所述目标样本切片进行靶蛋白的荧光标记抗体染色,得到所述靶蛋白的荧光染色图像;叠加单元,用于将所述h&e染色图像以及所述荧光染色图像进行叠加,得到叠加图像;提取单元,用于提取所述叠加图像中荧光阳性信号对应的位点信息;第二获取单元,用于根据所述空间转录组测序分析结果对所述位点信息对应的转录组数据进行分析处理,得到所述目标样本切片在所述位点信息处的空间转录组数据分析结果。9.一种计算机可读存储介质,其特征在于,所述计算机可读存储介质包括存储的计算机程序,其中,在所述计算机程序被处理器运行时控制所述计算机可读存储介质所在设备执行上述权利要求1至7中任一项所述的空间转录组数据的处理方法。10.一种处理器,其特征在于,所述处理器用于运行计算机程序,其中,所述计算机程序运行时执行上述权利要求1至7中任一项所述的空间转录组数据的处理方法。

技术总结
本发明公开了一种空间转录组数据的处理方法及装置、计算机可读存储介质。其中,该方法包括:通过空间转录组技术获取目标样本切片的H&E染色图像和空间转录组测序分析结果;通过荧光染色法对目标样本切片进行靶蛋白的荧光标记抗体染色,得到靶蛋白的荧光染色图像;将H&E染色图像以及荧光染色图像进行叠加,得到叠加图像;提取叠加图像中荧光阳性信号对应的位点信息;根据空间转录组测序分析结果对位点信息对应的转录组数据进行分析处理,得到目标样本切片在位点信息处的空间转录组数据分析结果。本发明解决了相关技术中仅采用结合单一形态学信息的空间转录组技术对样本进行分析,可靠性较低的技术问题。可靠性较低的技术问题。可靠性较低的技术问题。


技术研发人员:刘国静 张敏 王艳华 张莹 侯子健 赵云飞
受保护的技术使用者:天津诺禾致源生物信息科技有限公司
技术研发日:2021.12.29
技术公布日:2022/4/1
再多了解一些

本文用于企业家、创业者技术爱好者查询,结果仅供参考。

发表评论 共有条评论
用户名: 密码:
验证码: 匿名发表

相关文献