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一种长链脂肪酸甘油醇类化合物RubracinE、制备方法及其应用与流程

2022-02-22 20:27:40 来源:中国专利 TAG:

一种长链脂肪酸甘油醇类化合物rubracin e、制备方法及其应用
技术领域
1.本发明涉及微生物技术领域,具体涉及一种长链脂肪酸甘油醇类化合物rubracin e、制备方法及其应用。


背景技术:

2.癌症已经成为严重威胁人类健康及生命的疾病之一。肿瘤的治疗主要包括化疗、手术、放射治疗等,化疗是癌症治疗的主要手段之一。在化疗过程中,肿瘤细胞产生耐药性是导致化疗失败的最主要的原因。因此,寻找低度、活性良好的逆转剂是解决肿瘤耐药性最根本途径,具有主要的研究价值。
3.p-糖蛋白(p-gp)是abc转运蛋白家族最具有代表性的蛋白之一,分子量为170kd,由1280 个氨基酸残基组成。研究表明,p-gp能够转运化学性质和结构多样性的药物,包括部分抗癌药物,如阿霉素、紫杉烷类等,引起多药耐药(mdr)现象,导致癌症治疗的失败。因此,p-gp 抑制剂和底物的研究对于癌症治疗具有重要的意义,可将p-gp抑制剂与化疗药物共同给药作为克服mdr的有效策略。目前,已经开发了几代p-gp抑制剂,第一代逆转剂包括他莫昔芬、环孢素a等,其中以维拉帕米和环胞菌素为典型代表。但是此类药物通常缺乏p-糖蛋白的特异性,会产生严重的副作用,第一代逆转剂也在临床上受到很大程度的限制(sato w.etal.1991)。第二代逆转剂孢菌素类似物伐司朴达(valspodar,psc833)、右旋维拉帕米 (dexverapamil)等,其中以地塞米松为代表,然而,第二代逆转剂的开发由于高毒性和药物相互作用而产生一系列副作用而受到限制(rowinsky e.k.et al.1998;hyafil f.et al.1993;kellerr.p.et al.1992)。第三代p-糖蛋白抑制剂的主要代表药物有tariquidar(xr9576)、 zosuquidar(ly335979)、s9788等,其中以tariquidar(xr9576)和wk-x-34为代表(masseyp.r.et al.2014)。而从天然产物及其衍生物中开发p-gp抑制剂已成为第四代抑制剂研发的新方向和重点。
4.微生物来源天然产物一直都是创新药物研发重要来源,为新药研发提供物质基础。同时微生物具有生长周期短、代谢易于调控、菌种易于选育可以通过大规模的发酵实现工业化生产等优势,进一步奠定了其在新药研发中重要地位。目前有发现从微生物来源的天然产物中开发p-gp抑制剂的具体报道,但是并未明确具体是何种物质。


技术实现要素:

5.本发明针对现有技术的不足,提供一种微生物来源的长链脂肪酸甘油醇类新化合物及其制备方法以及它在制备逆转耐药肿瘤细胞活性药物中的应用。
6.本发明的目的之一是提供一种长链脂肪酸甘油醇新化合物rubracin e,结构如下式所示:
[0007][0008]
本发明的目的之二是提供一种长链脂肪酸甘油醇新化合物rubracin e的制备方法,所述化合物由红棕毛筒腔菌发酵提取后获得,所述红棕毛筒腔菌命名为红棕毛筒腔菌tubeufiarubra pf02-2,保藏单位:中国典型培养物保藏中心,保藏编号为cctcc no:m 2019957。
[0009]
本发明所述的红棕毛筒腔菌tubeufia rubra pf02-2,是由贵州大学生化工程中心分离获得,保藏单位:中国典型培养物保藏中心保藏,地址为:中国.武汉.武汉大学,保藏日: 2019.11.20,保藏登记号为cctcc no:m 2019957。
[0010]
红棕毛筒腔菌tubeufia rubra pf02-2的来源如下:
[0011]
采样时间:2016年5月14日;
[0012]
采样地点:广西壮族自治区防城港市屏峰雨林自然保护区;
[0013]
采样方式:采集位于广西壮族自治区防城港市屏峰雨林自然保护区的腐木,塑料密封袋带回实验室.
[0014]
本发明的红棕毛筒腔菌tubeufia rubra pf02-2菌株具有下述性质:
[0015]
菌落形态特征:在自然腐木基质上,菌落平展,呈网状、点状,量大时连接成片状,新鲜经分离得到的pf02-2纯菌落上呈无色透明到白色,经分离得到的pf02-2纯菌落自然干燥后呈红棕色。部分菌丝体埋生于基质之下,但多为表生,菌丝体由有隔膜带分枝的菌丝组成,无色至深棕色。分生孢子梗圆柱状,单生,弯曲生长,有隔膜,50-150微米长,4.5-6微米宽,顶端逐渐变细,底部深棕色,顶部透明到浅棕色,表面光滑。产孢细胞单生或多生,圆柱状,具柱状小齿突,合轴生长于分子孢子梗中部到顶部,10-19微米长,3-4微米宽,无色透明状到浅棕色,表面光滑。分子孢子卷旋型,单生,顶侧生,透明,顶端圆形,紧密卷旋时卷曲2-3.5次,直径35-50微米,分生孢子丝3-5微米厚(平均直径45微米,厚度4.5微米),在水中逐渐松散开,具不清晰的多隔膜,无色到浅棕色,表面光滑。分生孢子在水-琼脂培养基中12h后开始萌发生长。菌落在pda培养基中置于25-28℃生长2周可达16mm,棕色,呈圆形,表面粗糙,有明显的突出物,呈脉状皱褶,菌落边缘完整。
[0016]
具体的,制备方法包括以下步骤:将红棕毛筒腔菌tubeufia rubra pf02-2进行液体或固体发酵培养,得到发酵物;将发酵物萃取,所得萃取物经分离纯化,得到长链脂肪酸甘油醇类化合物rubracin e。
[0017]
制备方法具体包括以下步骤:
[0018]
s1、菌株活化:取出保存的菌种,接种在基础培养基平板上,静置培养传代至第三代后放大培养;
[0019]
s2、发酵培养:取步骤s1活化后的菌种接种在固体培养基中,在26~30℃下静置发酵培养一段时间;
[0020]
s3、萃取:取菌体连同培养基,加入乙酸乙酯萃取,将萃取液浓缩后得到发酵产物;
[0021]
s4、发酵产物预处理:用氯:甲=1:1溶剂溶解发酵产物,再与硅胶按质量比1:1~2混合均匀,待溶剂挥发后作为一次上柱样品,再与硅胶粉和石油醚上分离柱,分别采用石油醚、氯仿、乙酸乙酯和甲醇依次梯度洗脱,洗脱溶剂经旋转蒸发仪减压回收后,用氯仿、丙酮或甲醇溶解,再用薄层层析点板,使用展开剂展开,选择在紫外可见光分析仪下254nm或365 nm有荧光的液体,再用8%硫酸乙醇香草醛显色剂显色;合并乙酸乙酯层溶剂洗脱液,回收乙酸乙酯溶剂,得到乙酸乙酯层浸膏;
[0022]
s5、纯化分离:a、将乙酸乙酯层浸膏用甲醇溶剂溶解,与硅胶按质量比1:1~3混合均匀,待溶剂挥发作上柱样品上预柱,采用10%甲醇水进行平衡反相中压柱,加入含样品预柱,采用甲醇水依次10个梯度洗脱,洗脱液经旋转蒸发仪回收溶剂后,甲醇溶解后在用薄层层析点板,使用展开剂展开,选择在紫外可见光分析仪下254nm或365nm有荧光的液体,再合并8%硫酸乙醇香草醛显色剂显黑色的组分,得到fr.14组分;
[0023]
b、将组分fr.14用甲醇溶剂溶解后,与硅胶按质量比1:1~3混合均匀,待溶剂挥发后作上柱样品;称取硅胶粉与氯:甲=1:1溶剂混合均匀装入分离柱中,再加入上柱样品,采用氯甲系统梯度洗脱,洗脱液经旋转蒸发仪回收溶剂后,甲醇溶解后在用薄层层析点板,使用展开剂展开,选择在紫外可见光分析仪下254nm或365nm有荧光的液体,再合并8%硫酸乙醇香草醛显色剂显黑色的组分,得到fr.14-4组分;
[0024]
c、将fr.14-4用甲醇溶解,与硅胶按质量比1:1~3混合均匀,待溶剂挥发后作上柱样品,称取硅胶粉与氯:甲=10:1溶剂混合均匀装入分离柱中,再加入上柱样品,采用氯甲系统梯度洗脱,洗脱液用薄层层析点板,使用展开剂展开,选择在紫外可见光分析仪下254nm 或365nm有荧光的液体,再合并8%硫酸乙醇香草醛显色剂显灰黑色的组分,得到化合物rubracin e。
[0025]
其中,步骤s2的固体培养基为燕麦培养基,将200g燕麦以及150ml双蒸水混合后获得。
[0026]
本发明的目的之三是提供上述化合物及药用载体在制备肿瘤耐药逆转剂或肿瘤药物增敏剂中的应用。
[0027]
进一步的,耐药物或肿瘤药物为阿霉素。
[0028]
进一步的,所述的肿瘤包括乳腺癌、肺癌或者白血病。。
[0029]
进一步的,所述肿瘤耐药逆转剂为转运泵抑制剂,所述转运泵抑制剂对耐药蛋白p-糖蛋白和多药耐药蛋白中一种或几种具有抑制作用。
[0030]
本发明的目的之四是提供上述化合物及药用载体在制备抗肿瘤细胞药剂中的应用,所述的肿瘤细胞包括耐阿霉素乳腺癌细胞、耐阿霉素肺癌细胞或者耐阿霉素白血病。
附图说明
[0031]
图1为化合物rubracin e分离纯化流程图;
[0032]
图2为本发明中化合物rubracin e的旋光谱图;
[0033]
图3为本发明中化合物rubracin e的红外光谱图;
[0034]
图4为本发明中化合物rubracin e的紫外光谱图;
[0035]
图5为本发明中化合物rubracin e的高分辨质谱图;
[0036]
图6为本发明中化合物rubracin e的1h-nmr图;
[0037]
图7为本发明中化合物rubracin e的
13
c-nmr和dept图;
[0038]
图8为本发明中化合物rubracin e的hsqc谱图;
[0039]
图9为本发明中化合物rubracin e的1h-1
h cosy谱图;
[0040]
图10为本发明中化合物rubracin e的hmbc谱图;
[0041]
图11为rubracin e对耐药肿瘤细胞mcf-7/adm细胞毒活性示意图;
[0042]
图12为rubracin e对耐药肿瘤细胞k562/adm细胞毒活性示意图;
[0043]
图13为rubracin e对耐药肿瘤细胞a549/adm细胞毒活性示意图;
[0044]
图14为rubracin e联合阿霉素使用对mcf-7/adm ic
50
值影响图;
[0045]
图15为rubracin e联合阿霉素使用对k562/adm ic
50
值影响图;
[0046]
图16为rubracin e联合阿霉素使用对a549/adm ic
50
值影响图。
具体实施方式
[0047]
下面通过具体实施方式进一步详细说明:
[0048]
1、化合物rubracin e的制备方法
[0049]
如图1所示,
[0050]
s1、菌株活化
[0051]
从-80℃冰箱中取出甘油斜面保存的菌种,以无菌接种环挖取1环菌株tubeufia rubra的菌种,十字划线接种于直径11cm的基础培养基平板,28℃静置培养17d,传代至第三代可放大培养。
[0052]
s2、发酵培养
[0053]
燕麦固体发酵(1l三角烧瓶分装200g燕麦以及150ml双蒸水),每瓶接种量为培养平板上面积1
×
1cm2的活化菌种量,在28℃下静置培养至105天。
[0054]
s3、萃取
[0055]
菌体连同燕麦培养基,加入乙酸乙酯提取三次,每次在160rpm振荡萃取24h,合并萃取液,40℃减压浓缩,得到发酵产物,重复以上操作,合并发酵产物得2027.17g。
[0056]
s4、发酵产物预处理
[0057]
用氯:甲=1:1溶剂溶解2027.17g的发酵产物,与硅胶按质量比约1:1.5(即2027.17g发酵产物中加200-300目硅胶粉3041g)混合均匀,待溶剂挥发后得到河沙状样品,该样品作为一次上柱样品;称取200-300目硅胶粉6000g与石油醚溶剂混合均匀(在此过程中不能产生气泡)装入长为1.5m,内径为200mm分离柱中,让硅胶粉缓缓下沉直至不再下沉时加入一次上柱样品,分别采用石油醚、氯仿、乙酸乙酯、甲醇,依次4个梯度洗脱,每个梯度洗脱2~3个(大约每个柱体积洗脱36l~54l洗脱溶剂)柱体积,每1000ml洗脱溶剂为一份进行收集,每份洗脱样品经旋转蒸发仪减压回收后,用10或15ml氯仿、丙酮或甲醇溶解,移到规格为20ml西林瓶中,薄层层析(tlc)点板,用石油醚:氯仿=1:1、石油醚:丙酮=10:1、氯
仿:丙酮=5:1、氯仿:甲醇=10:1、乙酸乙酯:甲醇=5:1展开剂展开,在常规紫外可见光分析仪下观察是否在254nm或365nm有荧光,再用8%硫酸乙醇香草醛显色剂显色;合并乙酸乙酯层溶剂洗脱液,回收乙酸乙酯溶剂,得到乙酸乙酯层浸膏61.4g。
[0058]
s5、纯化分离
[0059]
a、乙酸乙酯层浸膏(61.4g)用甲醇溶剂溶解,与硅胶按质量比约1:1.5(即100g发酵产物中加中压rp-18反相硅胶)混合均匀,待溶剂挥发后得到河沙状样品,该样品作上柱样品;上柱样品加上长为10cm,直径为49mm的预柱;采用10%甲醇水进行平衡反相中压柱(柱长460mm,直径49mm),平衡大约5~6个柱体积(大约洗脱5~6l)后,加入含样品预柱,采用甲醇水梯度洗脱(10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、 100%),依次10个梯度洗脱,每个梯度洗脱4-5个柱体积,采用规格500ml的三角烧瓶接收洗脱液,每份洗脱液经旋转蒸发仪回收溶剂后,用10ml甲醇溶解转移到规格为20ml 西林瓶中后,经tlc点板,用石油醚:丙酮=2:1、氯仿:丙酮=5:1、氯仿:甲醇=10:1、乙酸乙酯:甲醇=2:1展开剂展开,在常规紫外可见光分析仪下观察是否在254nm或365nm有荧光,再用8%硫酸乙醇香草醛显色剂显色,合并8%硫酸乙醇香草醛显黑色的组分,(就是 80%甲醇水洗脱的组分),得到第14组分(fr.14 9.23g)。
[0060]
b、组分fr.14(9.23g)用甲醇溶剂溶解后,与200-300目硅胶按质量比约1:1.5(即9.23 g组分中加14g)混合均匀,待溶剂挥发后得到河沙状样品,该样品作上柱样品;称取200-300 目硅胶粉300g与氯:甲=1:1溶剂混合均匀(在此过程中不能产生气泡)装入长为460mm,内径为100mm分离柱中,让硅胶粉缓缓下沉直至不再下沉时加入一次上柱样品,采用氯甲系统梯度洗脱(50:1、30:1、15:1、10:1、5:1、2:1),每个梯度洗脱3-4个柱体积(大约1.8l-2.4 l),用规格150ml三角锥形瓶收集洗脱液,每份洗脱液经旋转蒸发仪回收溶剂后,用大约 10ml甲醇溶解转移到规格20ml西林瓶后,经tlc点板,用氯仿:甲醇:甲酸=5:1:1滴、乙酸乙酯:甲醇=3:1展开剂展开,在常规紫外可见光分析仪下观察是否在254nm或365nm有荧光,再用8%硫酸乙醇香草醛显色剂显色,合并8%硫酸乙醇香草醛显黑色的组分,得到第 4组分(fr.14-4 186mg)。
[0061]
c、fr.14-4(186mg)用甲醇溶解,与200-300目硅胶按质量比约1:1.5(即186mg组分中加270mg)混合均匀,待溶剂挥发后得到河沙状样品,该样品作上柱样品;称取200-300 目硅胶粉30g与氯:甲=10:1溶剂均匀混合(在此过程中不能产生气泡)装入长为240mm,内径为30mm分离柱中,让硅胶粉缓缓下沉直至不再下沉时加入一次上柱样品,采用乙甲系统等梯度洗脱,用规格20ml西林瓶收集洗脱液,经tlc点板,用氯仿:甲醇=5:1、乙酸乙酯:甲醇=5:1展开剂展开,在常规紫外可见光分析仪下观察是否在254nm或365nm有荧光,再用8%硫酸乙醇香草醛显色剂显色,合并8%硫酸乙醇香草醛显灰黑色的组分(即乙:甲=10:1)洗脱组分,得到化合物rubracin e 3.0mg。
[0062]
2、化合物rubracin e结构鉴定
12
″″
、h-13
″″
和h-14
″″
连接;h-18
″″
和h-17
″″
连接。
[0069][0070]
化合物rubracin e关键的hmbc相关
[0071]
在hmbc上(详见附图10),氢质子信号δh[4.44(1h,dd,j=12.0,2.9hz),4.22 (1h,overlap),h-1)]与δ
c 175.0(s,c-1
′″
),71.7(d,c-2),68.7(t,c-3)相关,证明c-1与酯基基团 c-1
′″
连接;氢质子信号δh[5.24(1h,m,h-2)]与δ
c 174.6(s,c-1
″″
),63.9(t,c-1),68.7(t,c-3) 相关,证明c-2与酯基基团c-1
″″
连接;氢质子信号δh[3.74(1h,overlap,h-3),3.91(1h,dd, j=11.1,5.4hz,h-3)]与δ
c 63.9(t,c-1),71.7(d,c-2),105.4(d,c-1

)相关,结合端基碳上氢原子的耦合常数(7.3),证明半乳糖通过β-d糖苷键连接在c-3位;氢质子δh[3.89(1h,overlap, h-6

),3.64(1h,dd,j=10.0,5.5hz),h-6

)]与100.5(d,c-1

),70.1(d,c-5

)相关,表明另一个半乳糖连接在c-6

上;氢质子[4.20(2h,overlap,h-6

)]与δ
c 172.7(s,c-1
′″″
),70.0(d,c-5

),71.2 (d,c-4

)相关,结合[2.06(3h,s,h-2
′″″
)]与172.7(s,c-1
′″″
)和65.0(t,c-6

)相关,证明最后的酯基基团连接在c-6

位上。仔细分析1d nmr、2d nmr结合hresi谱,最终确定rubracine的结构。
[0072]
表1化合物rubracin d nmr数据
[0073]
[0074][0075]
备注:标注a的化学位移可以相互转换,标注b化学位移可以相互转换
[0076]
3、化合物rubracin e细胞毒活性筛选
[0077]
3.1测试细胞株:mcf-7/adm、a549/adm、k562/adm
[0078]
3.2rpmi1640 10%胎牛血清
[0079]
3.3细胞培养
[0080]
3.3.1细胞复苏
[0081]
从液氮管中取出细胞,迅速将冻存管投入到已经预热到37度的水浴锅中迅速解
冻,并要不断的摇动,使管中的液体迅速融化。约1ml的冻存管内液体完全溶解后,无菌条件下取出细胞接种到细胞培养皿中(rpmi1640 10%胎牛血清),置37度co2培养箱中培养,次日更换培养液,继续培养,观察生长情况。
[0082]
3.3.2细胞传代
[0083]
待细胞长到80-90%后,无菌操作条件下采用规格为3ml塑料吸管吸出细胞培养液,加入1-2ml pbs冲洗1次(不含钙,镁离子),加1ml消化液(0.25%trypsin-0.53mm edta) 于培养瓶中,在倒置显微镜下观察细胞消化情况,若细胞大部分变圆,迅速拿回操作台,轻敲几下培养瓶后加2ml完全培养基终止消化。在新的培养瓶分别加新的完全培养基4ml,然后分别加入1ml含细胞的完全培养基。
[0084]
3.4cck-8测试细胞毒活性
[0085]
3.4.1分别设置浓度梯度:mcf-7/adm(0、6.25、12.5、25、50、100、200μg/ml), k562/adm和a549/adm(0、1.6、3.125、6.25、12.5、25、50、100),3个重复,阿霉素为阳性对照,dmso为阴性对照,所有数据采用spss软件计算。
[0086]
3.4.2实验步骤
[0087]
(1)细胞消化,细胞计数,调整细胞浓度为2
×
104个/ml。
[0088]
(2)在96孔板中接种100μl的细胞悬液。将培养板在5%co2培养箱、37℃的条件下培养24h。
[0089]
(3)根据分组,分别加入含不同浓度的化合物及阿霉素,继续置于培养箱于37℃条件下孵育48h。
[0090]
(4)培养结束后,pbs(不含钙,镁离子)冲洗1次,每孔加10μl cck-8试剂,置于培养箱孵育3h。
[0091]
(5)用酶标仪测定在490nm处的吸光度
[0092]
5.4实验结果
[0093]
结果表明化合物rubracin e对3株耐药肿瘤细胞在有效浓度范围(25μg/ml以下)没有细胞毒活性,可以继续进行逆转肿瘤细胞筛选,结果详见图11、图12和图13。
[0094]
四、化合物rubracin e在逆转耐药肿瘤细胞耐药的活性应用
[0095]
4.1测试细胞株:mcf-7/adm、k562/adm和a549/adm
[0096]
4.2rpmi1640 10%胎牛血清
[0097]
4.3细胞培养
[0098]
4.3.1细胞复苏
[0099]
从液氮管中取出细胞,迅速将冻存管投入到已经预热到37度的水浴锅中迅速解冻,并要不断的摇动,使管中的液体迅速融化。约1ml的冻存管内液体完全溶解后,无菌条件下取出细胞接种到细胞培养皿中(rpmi1640 10%胎牛血清),置37度co2培养箱中培养,次日更换培养液,继续培养,观察生长情况
[0100]
4.3.2细胞传代
[0101]
待细胞长到80-90%后,无菌操作条件下采用规格为3ml毫升塑料吸管吸出细胞培养液,加入1-2ml pbs冲洗1次(不含钙,镁离子),加1ml消化液(0.25%trypsin-0.53mmedta)于培养瓶中,在倒置显微镜下观察细胞消化情况,若细胞大部分变圆,迅速拿回操作台,轻敲几下培养瓶后加2ml完全培养基终止消化。在新的培养瓶分别加新的完全培养基
4ml,然后分别加入1ml含细胞的完全培养基。
[0102]
4.4cck-8测试逆转肿瘤细胞活性
[0103]
4.4.1分别设置浓度梯度:mcf-7/adm(0、6.25、12.5、25、50、100、200μg/ml), k562/adm和a549/adm(0、1.6、3.125、6.25、12.5、25、50、100),3个重复;rubracine浓度分别为5、10、20μg/ml。维拉帕米为阳性对照,dmso为阴性对照,所有数据采用 spss软件计算。
[0104]
4.4.2实验步骤
[0105]
(1)细胞消化,细胞计数,调整细胞浓度为2
×
104个/ml。
[0106]
(2)在96孔板中接种100ul的细胞悬液。将培养板在5%co2培养箱、37℃的条件下培养24h。
[0107]
(3)根据分组,分别加入含不同浓度的化合物和阿霉素,继续置于培养箱于37℃条件下孵育48h。
[0108]
(4)培养结束后,pbs(不含钙,镁离子)冲洗1次,每孔加10μl cck-8试剂,置于培养箱孵育3h。
[0109]
(5)用酶标仪测定在490nm处的吸光度
[0110]
4.4实验结果
[0111]
结果表明:化合物rubracin e浓度分别5μg/ml、10μg/ml、20μg/ml与阿霉素联合使用明显具有逆转耐药mcf-7/adm和k562/adm活性(详见图14、图15和表2);化合物 rubracin e浓度分别在5μg/ml、10μg/ml与阿霉素联合使用时逆转耐药肿瘤细胞 a549/adm效果不明显,但在20μg/ml浓度下具有明显逆转a549/adm的活性(详见结果图16),其ic50值详见表2。
[0112]
表2化合物rubracin e与adm联合使用时对三株细胞的ic
50

[0113][0114]
备注:a、b、c分别表示化合物浓度为5μg/ml、10μg/ml和20μg/ml
[0115]
以上所述的仅是本发明的实施例,方案中公知的具体结构及特性等常识在此未作过多描述。应当指出,对于本领域的技术人员来说,在不脱离本发明结构的前提下,还可以作出若干变形和改进,这些也应该视为本发明的保护范围,这些都不会影响本发明实施的效果和专利的实用性。本技术要求的保护范围应当以其权利要求的内容为准,说明书中的具体实施方式等记载可以用于解释权利要求的内容。
再多了解一些

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