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具有自体荧光光谱校正的粒子分析系统的制作方法

2022-02-22 10:18:54 来源:中国专利 TAG:


1.本公开涉及粒子分析系统、信息处理方法和程序。


背景技术:

2.为了分析微粒(诸如细胞、微生物或脂质体)的性质,使用利用测量从微粒发出的荧光或散射光的强度和光谱的设备(例如,流式细胞仪等)的分析方法。例如,流式细胞仪用激发光(诸如激光)照射在流动路径中流动的微粒,并且由微粒发出的荧光、散射光等由光检测器(诸如多个光电倍增管(pmt))检测。检测到的光通过转换为电信号而被量化。通过对该量化数据进行统计处理,分析上述微粒的特性。
3.对于流式细胞仪中的荧光检测,除了使用波长选择元件(诸如滤光器)选择不连续波长范围内的多个光束并测量每个波长范围的光强度的方法之外,还存在测量作为连续波长范围内的光谱的光强度的方法。例如,存在用于分析每个发光元件(诸如荧光染料)的荧光强度的技术,利用该荧光染料通过将通过用激光照射标记有多种荧光染料的微粒而获得的光谱与每个荧光染料的光谱(光谱参考)分离(解卷积)来标记微粒。根据该技术,测量光谱可以表示为通过将每个发光元件的参考光谱乘以预定系数而获得的值的线性和。由此,可以计算标记微粒的每种荧光染料的荧光强度。
4.可以在光谱图、直方图和二维图中显示光谱流式细胞仪的分析数据。光谱图以水平轴表示光接收元件的通道或检测波长,以垂直轴表示光强度,并且用阴影或色调表示关于微粒数量(事件数量或密度)的信息(群体信息)。光谱图使得可以直观地掌握微粒的荧光光谱和群体信息。
5.在光谱图中,当使用对数轴作为表示光强度的坐标轴时,低强度的微粒的光谱难以用过高的色散来表示,并且不能显示负数。此外,线性轴的使用使得难以确定低强度的微粒的光谱形状。因此,下面的专利文献1公开了对小于预定值的数据使用线性轴并且对大于预定值的数据使用对数轴的技术。
6.引用列表
7.专利文献
8.专利文献1:jp 5817369 b2。


技术实现要素:

9.技术问题
10.由于作为流式细胞仪要测量的对象的许多微小物质发出自体荧光,为了精确分析荧光强度,需要识别要测量的对象的自体荧光,并基于所识别的自体荧光执行校正。
11.此外,由于自体荧光根据微粒的类型、包含的物质等而变化,因此要测量的对象可以包括具有不同自体荧光的群体。因此,从测量数据中识别具有不同自体荧光的多个自体荧光群体(afp)将增加分析的准确性,但是从测量的自体荧光中分离多个自体荧光群体并不容易。
12.因此,本公开提出了促进识别多个自体荧光群体的粒子分析系统、信息处理方法和程序。
13.问题的解决方案
14.根据本公开,提供了一种粒子分析系统,包括:光检测器,获取通过用激发光照射粒子而生成的光;以及信息处理单元,输出光谱图,该光谱图包括在测量数据的二维图中指定的自体荧光群体的光谱信息和测量数据的光谱信息,每个测量数据对应于所获取的光,并且信息处理单元在荧光分离处理中记录自体荧光群体的光谱信息作为自体荧光参考光谱。
15.此外,根据本公开,提供了一种信息处理方法,包括:通过处理器输出光谱图,该光谱图包括在测量数据的二维图中指定的自体荧光群体的光谱信息和测量数据的光谱信息,每个测量数据对应于通过用激发光照射粒子而生成的光;并且在荧光分离处理中记录自体荧光群体的光谱信息作为自体荧光参考光谱。
16.如上所述,根据本公开,可以促进多个自体荧光群体的识别。
17.注意,上述效果不必是限制性的,并且与上述效果一起或代替上述效果,可以表现出本说明书中示出的任何效果或可以从本说明书中理解的其他效果。
附图说明
18.图1是示出根据本公开的实施例的粒子分析系统的示意性配置的示图。
19.图2是示出作为测量设备的示例的流式细胞仪的示意性配置的示图。
20.图3是示出流式细胞仪的配置的示例的示图。
21.图4是示出根据本公开的实施例的信息处理设备的功能配置的示例的功能框图。
22.图5是示出用于识别自体荧光群体的自体荧光屏幕的示例的示图。
23.图6a是示出自体荧光屏幕的初始状态的示图。
24.图6b是步骤#1部分的放大图。
25.图6c是示出选择目标数据的状态的示图。
26.图6d是示出一个激光光源的二维图、vf调整窗口和光谱图的示图。
27.图6e是用于说明带状图的显示和用户操作的示图。
28.图6f是示出自体荧光群体被分离的状态的示图。
29.图6g是图6f中步骤#2部分的一部分的放大图。
30.图6h是列表的放大图。
31.图7是示出仅使用五个激光光源时的自体荧光屏幕的示例的示图。
32.图8是示出识别自体荧光群体的处理流程的流程图。
33.图9是示出根据本公开的实施例的信息处理设备的硬件配置的示例的框图。
具体实施方式
34.在下文中,将参考附图详细描述本公开的优选实施例。将按以下顺序进行描述。
35.1.实施例
36.1.1粒子分析系统的配置
37.1.2测量设备的配置
38.1.3信息处理设备的功能配置
39.1.4用于识别自体荧光群体的屏幕的示例
40.1.5识别自体荧光群体的处理流程
41.1.6带状图显示和用户操作流程
42.1.7效果
43.1.8信息处理设备的硬件配置的示例
44.1.9总结
45.1.实施例
46.1.1信息处理系统的配置
47.图1是示出根据本公开的实施例的粒子分析系统1的示意性配置的示图。如图1所示,粒子分析系统1包括信息处理设备10和测量对应于样本s的光谱的测量设备20。信息处理设备10和测量设备20通过各种有线或无线网络连接。
48.在本实施例中作为样本s的微粒的示例包括细胞、微生物和生物相关微粒。生物相关微粒包括构成各种细胞的染色体、脂质体、线粒体、细胞器(organelles)(细胞器(cellular organelles))等。细胞包括动物细胞(诸如血细胞)和植物细胞。微生物包括细菌(诸如大肠杆菌)、病毒(诸如烟草花叶病毒)和真菌(诸如酵母)。此外,生物相关微粒可以包括生物相关聚合物(诸如核酸)、蛋白质(诸如酶)或其复合物。
49.信息处理设备10获取由测量设备20测量的样本s的测量数据,将作为所获取的测量数据的光谱分离成多个光谱,并分析分离的光谱的强度。例如,信息处理设备10将获取的样本s的荧光光谱分离成从标记样本s的多种荧光染料导出的荧光光谱,并分析分离的相应荧光光谱的荧光量。基于该荧光量,可以分析标记微粒的性质。
50.在图1所示的示例中,尽管示出了根据本实施例的信息处理设备10被设置为不同于测量设备20的设备的情况,但是根据本实施例的信息处理设备10的功能可以在控制测量设备20的操作的计算机中实现,或者可以在设置在测量设备20的壳体中的计算机中实现。稍后将详细描述信息处理设备10的详细配置。
51.测量设备20用激光照射样本s,检测来自样本s的荧光和散射光,并根据光的检测结果测量对应于样本s的光谱。即,测量设备20具有作为测量单元的功能。
52.在下文中,测量设备20是测量样本s的荧光光谱的流式细胞仪,并且将给出本技术的详细描述。
53.1.2测量设备的配置
54.接下来,将描述测量设备20的配置。图2是示出作为测量设备的示例的流式细胞仪的示意性配置的示图。此外,图3是示出流式细胞仪的结构的示例的示图。图2和图3所示的流式细胞仪包括激光光源21、微通道22和光检测器23。
55.参考图2,在流式细胞仪中,具有能够激发可以用于微粒(样本)s的染色的荧光染料的波长的激光从激光光源21发射到在微通道22中流动的简单染色的、多重染色的或未染色的微粒s。光检测器23检测从用激光照射的微粒s发射的荧光、散射光等。此外,尽管在图2和图3中未示出,但是在流式细胞仪中设置了光学系统,诸如用于将激光引导至微粒s的透镜以及用于将从微粒s发射的荧光、散射光等引导至光检测器23的光学系统。
56.激光光源21发射预定波长的激光(例如,波长λ=320nm(纳米)、355nm、405nm、
488nm、561nm、637nm和808nm)。在图2的示例中,示出了一个激光光源21,并且在图3的示例中,示出了由ld-1至ld-n表示的n个(n是正整数)激光光源21。n优选为3或更大,其中,每个激光光源具有405nm、488nm和637nm。最优选地,通过使用还包括320nm、355nm、561nm和808nm的七个激光光源21,可以覆盖40种或更多种颜色的荧光染料的激发波长范围。
57.n个激光光源21用不同轴上的激发光照射微粒s。当使用三个激光光源时,优选在微粒s流动的上游方向上布置405nm,并且在微粒s流动的下游方向上以488nm的激光光斑为中心布置808nm和637nm,并且当使用七个激光光源时,优选在微粒s流动的上游方向上布置561nm、405nm和320nm,并且在微粒s流动的下游方向上布置808nm、355nm和637nm。这种布置使得可以减少在检测每个激发波长的荧光光谱时的串扰。
58.微通道22被设置为使微粒s在流动方向上成排流动。已知的微通道芯片等用作微通道22。
59.此外,如图3所示,光检测器23包括检测器230和n个光接收元件单元231。
60.检测器230是用于检测从微粒s发射的前向散射光的装置。检测器230例如通过电荷耦合器件(ccd)、互补金属氧化物半导体(cmos)或光电二极管来实现。由检测器230检测的前向散射光的测量数据被输出到根据本实施例的信息处理设备10。
61.光接收元件单元231是用于检测从微粒s发射的荧光光谱的装置。每个光接收元件单元231通过对应激光光源21的激光辐射来检测从微粒s发射的荧光光谱。此外,一些光接收元件单元231也检测侧向散射光。
62.根据激光光源21的激发波长,每个光接收元件单元231具有比激发波长更长的检测波长范围。例如,当激发波长为320nm和355nm时,检测波长范围为360.5nm至843.8nm,并且当激发波长为405nm时,检测波长范围为413.6nm至843.8nm。当激发波长为488nm时,检测波长范围为492.9nm至843.4nm,当激发波长为561nm时,检测波长范围为555.3nm至843.8nm,当激发波长为638nm时,检测波长范围为643.3nm至843.8nm,并且当激发波长为808nm时,检测波长范围为823.5nm至920.0nm。如上所述,可以通过比激发波长长的宽检测波长范围生成光谱数据,并分离和检测对应于40种或更多种荧光染料的光谱。
63.从每个光接收元件单元231生成光谱数据,并且所生成的光谱数据被输出到根据本实施例的信息处理设备10。此外,从一些光接收元件单元231生成侧向散射光数据,并且所生成的侧向散射光数据被输出到根据本实施例的信息处理设备10。
64.此外,如图1所示,测量设备20包括设置保存单元20a、设置存储单元20b和搜索单元20c。设置保存单元20a将测量中设置的参数和标签作为设置信息存储在设置存储单元20b中。设置存储单元20b存储设置信息。搜索单元20c使用用户选择的参数和标签中的至少一个来搜索并显示设置信息。控制单元基于用户在显示屏中选择的设置信息来控制测量设备20中的激光光源21、光检测器23等。
65.参数包括每个激光光源21的接通/关断、微通道22的流速、检测器230和光接收元件单元231的灵敏度调整值、作为细胞检测的阈值、检测时间窗口等。
66.标签是关于测量的信息。标签的示例包括“tbnk面板”、“t细胞20c”、“pd-130c”、“yamauchi教授”、“omip-15”、“euroflow”、“44种颜色”等。“tbnk面板”是指示细胞类型的示例。“t细胞20c”是指示细胞类型和颜色数量的示例。“pd-130c”是指示细胞(受体)类型和颜色数量的示例。“yamauchi教授”是指示测量执行者或测量请求者的示例。“omip-15”是指示
标准测量协议的示例。“euroflow”是指示标准化组织名称的示例。“44种颜色”是指示颜色数量的示例。
67.通过重新使用存储在设置存储单元20b中的参数,用户可以有效地执行参数的设置。在此处,设置保存单元20a、设置存储单元20b和搜索单元20c中的任何一个或全部的配置可以包括在信息处理设备10中,而不是测量设备20中。
68.1.3信息处理设备的功能配置
69.接下来,将描述根据本公开的实施例的信息处理设备10的功能配置。图4是示出根据本公开的实施例的信息处理设备10的功能配置的示例的功能框图。如图4所示,根据本实施例的信息处理设备10包括测量数据获取单元101、afp识别单元102、存储单元110和ui控制单元120。
70.(测量数据获取单元)
71.测量数据获取单元101从测量设备20获取由测量设备20生成的测量数据。在此处,从测量设备20获取的微粒s的测量数据例如是表示通过用激光照射多个未染色微粒s而生成的前向散射光、侧向散射光和光谱的强度的自体荧光数据。对于多个微粒s的前向散射光、侧向散射光和光谱的测量,存在小但一定的时间宽度。因此,例如,超过微小时间宽度中的检测阈值的累积强度、最大强度或时间宽度(检测时间宽度)用作根据本实施例的测量数据。
72.测量数据获取单元101将所获取的测量数据存储在存储单元110中。此时,测量数据获取单元101可以将所获取的测量数据与诸如获取测量数据时的日期和时间的时间信息或者与测量设备20的测量条件相关的信息相关联,以将信息存储在存储单元110中。
73.afp识别单元102通过经由ui控制单元120与用户交互来识别自体荧光群体。具体地,afp识别单元102基于存储在存储单元110中的自体荧光数据创建用于识别自体荧光群体的二维图、光谱图等,并在ui控制单元120上显示。然后,afp识别单元102基于用户在ui控制单元120显示的屏幕上执行的操作来更新存储单元110和屏幕,并重复使ui控制单元120显示更新的屏幕以识别自体荧光群体的过程。
74.afp识别单元102包括目标选择单元106、afp分离单元107和afp选择单元108。目标选择单元106执行与用于识别自体荧光群体的目标数据的选择相关的处理。afp分离单元107执行与自体荧光群体的分离相关的处理。afp选择单元108执行与从分离的自体荧光群体中选择在荧光分离处理中使用的自体荧光群体相关的处理。在jp 5540952 b2、jp 5601098 b2、jp 5834584 b2和jp 5985140 b2中描述了荧光分离处理。
75.(存储单元)
76.存储单元110是包括在信息处理设备10中的存储装置(means),并且存储由信息处理设备10的每个功能单元获得的信息等。此外,存储单元110响应于来自信息处理设备10的每个功能单元的请求,适当地输出所存储的信息。存储单元110例如存储由测量数据获取单元101获取的自体荧光数据、与afp识别单元102的处理相关的数据等。存储单元110还存储执行数据,诸如对应于ui控制单元120用于在显示屏上显示各种信息的各种应用的程序。存储单元110适当地存储在信息处理设备10的处理期间可能出现的临时数据等。此外,存储单元110可以设置有各种数据库。各种数据库可以例如是存储上述自体荧光数据或与afp识别单元102的处理相关的数据的数据库。
77.(ui控制单元)
78.ui控制单元120执行诸如包括在信息处理设备10中的显示器的显示装置(未示出)或者诸如设置在信息处理设备10外部的显示器的显示装置的显示屏的显示控制。例如,ui控制单元120执行由afp识别单元102创建的屏幕的显示控制。
79.ui控制单元120还接受用户在显示屏幕上的操作,并将对应于所接受的操作的信息通知给afp识别单元102。例如,ui控制单元120接受用户的选通操作(gate operation),并将关于所创建的选通的信息通知给afp识别单元102。此外,ui控制单元120接受用户的选择操作,并将所选择的信息通知给afp识别单元102。
80.1.4用于识别自体荧光群体的屏幕的示例
81.接下来,将参考图5至图7描述用于识别自体荧光群体的自体荧光屏幕的示例。图5是示出用于识别自体荧光群体的自体荧光屏幕的示例的示图。如图5所示,自体荧光屏幕2包括用于选择事件数量的事件数量选择部分2a和用于选择用于创建选通的图形形状的图形形状选择部分2b。存在矩形、椭圆形和多边形作为用于创建选通的图形形状。
82.作为与用户的操作步骤相关联的部分,自体荧光屏幕2包括步骤#1(对应于屏幕上的步骤1)部分3、步骤#2(对应于屏幕的步骤2)部分4和步骤#3(对应于屏幕的步骤3)部分5。目标选择单元106处理步骤#1部分3,afp分离单元107处理步骤#2部分4,afp选择单元108处理步骤#3部分5。
83.图6a是示出自体荧光屏幕2的初始状态的示图。如图6a所示,在初始状态下不显示步骤#3部分5。在初始状态下,用户使用事件数量选择部分2a来选择事件数量。然后,afp识别单元102使用所选择的事件数量的自体荧光数据来显示步骤#1部分3和步骤#2部分4。注意,尽管afp识别单元102使ui控制单元120显示屏幕,但是在下文中,“使ui控制单元120显示”被简单地称为“显示”以简化描述。
84.在步骤#1中,afp识别单元102使用自体荧光数据创建并显示二维图31。用户使用目标选择按钮30来选择是选通用于搜索自体荧光群体的组还是使用显示的所有事件。当选通用于搜索自体荧光群体的组时(当没有选中目标选择按钮30时),用户从图形形状选择部分2b选择图形形状。
85.afp识别单元102接受用户的选择。注意,尽管afp识别单元102经由ui控制单元120接受用户的操作,但是在下文中,“经由ui控制单元120接受”被简单地称为“接受”以简化描述。
86.图6b是步骤#1部分3的放大图。如图6b所示,二维图31的x轴(fsc_a:前向散射区域)是前向散射光的强度,y轴(scc_a:侧向散射区域)是侧向散射光的强度。“_a”表示测量值为累积强度。此外,afp识别单元102显示提示创建用于识别自体荧光群体的目标数据的选通的消息(步骤1:在散射图上创建用于搜索自体荧光的目标群体选通)。
87.用户通过对所显示的二维图31执行选通来选择用于识别自体荧光群体的目标数据。当接受目标数据的选择时,afp识别单元102创建并显示所选择的目标数据的二维图32。
88.图6c是示出选择目标数据的状态的示图。在图6c中,选中目标选择按钮30,并且已经选择了所有事件来识别自体荧光群体。在步骤#2中,afp识别单元102针对在步骤#1中选择的目标数据创建并显示每个激光光源21的二维图41、虚拟滤光器(vf)调整窗口42和光谱图43。
89.在二维图41中,密度图或点图由图选择切换按钮40选择。在此处,密度图是以阴影或色调表示关于事件数量的信息,而点图是没有关于事件数量的信息的表示。vf是滤光器,可以调整要显示的荧光强度的波长范围,并且要显示的荧光强度的波长范围由vf调整窗口42调整。
90.图6d是示出一个激光光源21的二维图41、vf调整窗口42和光谱图43的示图。如图6d所示,二维图41的x轴(vf-320_a)是由vf过滤的光的强度,y轴(scc_a)是侧向散射光的强度。afp识别单元102结合通过vf调整窗口42对波长范围的调整来更新二维图41。通过通道或波长执行vf调整窗口42的调整。“320”是激光光源21的波长(nm)。在此处,仅需要显示二维图41,使得目标数据可以与测量数据分离,并且可以从侧向散射光或前向散射光的光强度或者由vf预先在波长范围内的光强度等中选择二维图41的两个轴。二维图41可以具有表示第一波长范围内的光强度的一个轴以及表示第二波长范围内的光强度的另一轴。
91.光谱图43的x轴是波长或通道,y轴(ld 320_a)是荧光强度。“320”是激光光源21的波长(nm)。颜色的阴影表示关于事件数量的信息。
92.返回图6c,作为步骤#2,afp识别单元102显示提示创建被估计为自体荧光群体的选通的消息(步骤2:在vf/ssc图上创建被猜测为自体荧光(af)群体的选通)。用户使用vf调整窗口42调整波长范围以使用目标数据被分成多个组的二维图41选通自体荧光群体。用户可以使用七个二维图41中的任意数量的二维图41来执行选通。
93.图6f是示出自体荧光群体被分离的状态的示图,并且图6g是图6f的步骤#2部分4的一部分的放大图。在图6g中,使用对应于波长为320nm和405nm的激光光源21的二维图41执行选通以创建四个选通45。
94.当接受选通45的创建时,afp识别单元102在二维图41中以不同的颜色显示选通45。例如,afp识别单元102以红色、蓝色、紫色和绿色显示相应的四个选通45。此外,afp识别单元102类似地着色并更新在步骤#1中显示的二维图32。
95.此外,在光谱图43中,afp识别单元102将指示属于每个选通的数据的光谱强度的平均值的平均光谱强度46以与二维图41的选通的颜色相同的颜色叠加在整个目标数据的光谱强度47上以显示。在光谱图43中,整个目标数据的光谱强度47例如以灰度显示。用户通过检查整个目标数据的平均光谱强度46与光谱强度47之间的关系来确定荧光分离处理中使用的自体荧光群体。
96.在步骤#3中,如图6f所示,afp识别单元102显示提示选择在荧光分离处理中使用的自体荧光群体以及在步骤#2中创建的选通的列表51的消息(步骤3:选择用作自体荧光的选通以进行进一步分析)。图6h是列表51的放大图。如图6h所示,列表51包括“用作自体荧光”、“用作基础”、“选通”、“事件”、“父代(parent)%”和“总共(total)%”。
[0097]“用作自体荧光”表示用户是否选择选通作为要在荧光分离处理中使用的自体荧光群体。标有复选标记的选通是荧光分离处理中使用的自体荧光群体。用户通过检查“用作自体荧光”来选择要在荧光分离处理中使用的自体荧光群体。
[0098]“用作基础”表示用户是否选择选通作为荧光分离处理中的基本自体荧光群体。蛇眼选通(snake eye gate)是被选择为基本自体荧光群体的选通。用户通过在“用作基础”中标记蛇眼来选择基本自体荧光群体。荧光分离处理包括:
[0099]
1)从每个染色细胞的光谱中减去基本自体荧光群体的光谱;
[0100]
2)使用光谱参考和除了基本自体荧光群体的光谱之外的自体荧光群体的光谱来执行荧光分离处理;以及
[0101]
3)作为荧光分离的结果,将基本自体荧光群体的荧光强度加回到每种染料的荧光强度上。用户通常选择荧光强度最低的自体荧光群体作为基本自体荧光群体。在此处,可以不选择基本自体荧光群体,在这种情况下,不执行步骤1)和步骤3),并且在步骤2)中使用参考光谱和所有自体荧光光谱执行荧光分离处理,从而可以获取每种染料的荧光强度。是否选择“用作基础”可以由用户决定。最小二乘法或加权最小二乘法用于荧光分离处理。
[0102]“选通”是识别选通的名称。“af-a”、“af-b”、“af-c”和“af-d”是由afp识别单元102创建的选通名称。选通名称左侧的方块表示选通的颜色。
[0103]“事件”是属于选通的数据数量。“父代%”表示选通的数据数量与父代选通的数据数量的比率,单位为%。“总公%”表示选通的数据数量与目标数据的数据总数的比率,单位为%。在图6h中,由于目标数据的总数为“10,000”,并且整个目标数据为父代选通,因此例如,当选通“afa”的数据数量为“766”时,“父代%”为“7.66%”,“总公%”为“7.66%”。
[0104]
图5示出了当使用所有七个激光光源21执行测量时的自体荧光屏幕2。当不使用一些激光光源21时,自体荧光屏幕2包括所使用的激光光源21的数量的二维图41、vf调整窗口42和光谱图43。图7是示出当仅使用五个激光光源21时的自体荧光屏幕2c的示例的示图。如图7所示,由于不使用波长为355nm和808nm的激光光源21,所以不显示基于使用波长为355nm和808nm的激光光源21的测量数据的二维图41、vf调整窗口42和光谱图43。
[0105]
1.5识别自体荧光群体的处理流程
[0106]
接下来,将描述用于识别自体荧光群体的处理流程。图8是示出识别自体荧光群体的处理流程的流程图。如图8所示,afp识别单元102使用自体荧光数据创建并显示以fsc_a为x轴、scc_a为y轴的二维图31(步骤s1)。然后,afp识别单元102通过由用户执行的选通来接受目标数据的指定(步骤s2)。当接受目标数据的指定时,afp识别单元102显示目标数据的二维图32。
[0107]
然后,afp识别单元102创建并显示目标数据的二维图41、vf调整窗口42和光谱图43(步骤s3)。注意,当使用vf调整窗口42接受用户的通道指定时,afp识别单元102更新二维图41。此外,当接受用户对光谱图43的操作时,afp识别单元102更新光谱图43。然后,afp识别单元102接受来自用户的自体荧光群体的选通(步骤s4)。当接受来自用户的自体荧光群体的选通时,afp识别单元102更新光谱图43、二维图32和二维图41。
[0108]
然后,当完成用户对自体荧光群体的选通的指定时,afp识别单元102显示选通的列表51(步骤s5),并且在选通的列表51中接受来自用户的自体荧光群体的选择(步骤s6)。然后,afp识别单元102将所选择的自体荧光群体的信息存储在存储单元110中(步骤s7)。
[0109]
如上所述,afp识别单元102可以通过显示包括二维图31、32和41、光谱图43、选通的列表51等的自体荧光屏幕2和2c,使用户容易选择自体荧光群体。
[0110]
1.6.带状图显示和用户操作流程
[0111]
afp分离单元107可以控制测量数据以及自体荧光数据的光谱图的显示。在此处,随着安装在测量设备20中的激光光源21的数量增加,需要宽屏幕区域来显示对应于每个激光光源21的光谱图。此外,因为需要对每个光谱图执行诸如轴切换处理的处理,所以需要共同显示和控制对应于多个激光光源的光谱图。因此,afp分离单元107可以控制带状图44的
显示,其中,并排显示对应于用于测量的激光光源21的光谱图。
[0112]
图6e是用于说明带状图44的显示和用户操作的示图。如图6e所示,在带状图44中,可以将通过照射每个激光光源21的激发光而获得的荧光强度并排显示为光谱。横轴表示光的强度,纵轴表示对应于每个激光光源设置的光接收元件单元231的通道。在此处,横轴不为所有激光光源21提供相同的通道存储宽度,而是根据对应于每个激光光源21的光接收元件单元231来设置通道的存储宽度,从而可以减小显示面积。
[0113]
此外,如图6e所示,用户可以选择用于显示带状图44的组,选择带状图44的y轴的显示参数,并调整带状图44中y轴的显示范围。在此处,在显示参数中,光谱的显示与面积(累积强度)、高度(最大强度)或宽度(检测时间宽度)中的任何一个相关。afp分离单元107根据显示参数的选择和显示范围的调整来更新带状图44。因此,用户不必为每个激光光源21选择参数、选择显示目标等,并且可以容易地掌握微粒的荧光光谱信息。
[0114]
此外,带状图44使得可以通过用户操作设置选通,并且可以根据所设置的选通显示二维图、光谱图43和带状图44。
[0115]
1.7效果
[0116]
如上所述,根据本实施例,目标选择单元106显示二维图31,并从用户接受用于识别自体荧光群体的自体荧光数据的选择。然后,afp分离单元107显示多个光轴的二维图41、vf调整窗口42和光谱图43,并接受用户在二维图41中分离的自体荧光群体。然后,afp分离单元107用要分离的自体荧光群体的颜色更新二维图41,并将要分离的自体荧光群体的平均光谱强度46叠加在光谱图43上,并以不同的颜色显示。在此处,不同的颜色表示色调、明度和饱和度中的一个是不同的。然后,afp选择单元108显示列表51,并促使用户选择用于荧光分离处理的自体荧光群体。因此,用户可以容易地识别用于荧光分离处理的自体荧光群体。
[0117]
在该实施例中,由于afp选择单元108接受在列表51中选择在荧光分离处理中用作基本自体荧光群体的自体荧光群体,所以用户可以选择基本自体荧光群体并且选择自体荧光群体。
[0118]
此外,在本实施例中,测量设备20包括用于用不同轴上的激发光照射微粒s的n个激光光源21和用于通过对应的激光光源21的激光辐射来检测从微粒s发射的荧光光谱的n个光接收元件单元231。因此,测量设备20可以有效地收集丰富的荧光光谱数据。
[0119]
此外,在本实施例中,由于测量设备20存储用于测量的参数和标签,所以用户可以通过重新使用过去使用的参数来有效地执行测量。
[0120]
1.8信息处理设备的硬件配置的示例
[0121]
接下来,将参考图9描述根据本公开的实施例的信息处理设备的硬件配置。图9是示出根据本公开的实施例的信息处理设备的硬件配置的示例的框图。图示的信息处理设备900可以实现例如上述实施例中的信息处理设备10。
[0122]
信息处理设备900包括中央处理单元(cpu)901、只读存储器(rom)903和随机存取存储器(ram)905。信息处理设备900还包括主机总线907、桥接器909、外部总线911、接口913、输入装置915、输出装置917、存储装置919、驱动器921、连接端口925和通信装置929。代替cpu 901或者与cpu 901一起,信息处理设备900可以包括被称为数字信号处理器(dsp)或专用集成电路(asic)的处理电路。
[0123]
cpu 901用作算术处理装置和控制装置,并且根据记录在rom 903、ram 905、存储装置919或可移动记录介质923中的各种程序来控制信息处理设备900的全部操作或部分操作。例如,在上述实施例中,cpu 901控制包括在信息处理设备10中的相应功能单元的整体操作。rom 903存储由cpu 901使用的程序、计算参数等。ram 905主要存储在cpu 901的执行中使用的程序、在执行中适当改变的参数等。cpu 901、rom 903和ram 905通过由内部总线(诸如cpu总线)构成的主机总线907相互连接。此外,主机总线907经由桥接器909连接到外部总线911,诸如外围组件互连/接口(pci)总线。
[0124]
输入装置915例如是由用户操作的装置,诸如鼠标、键盘、触摸面板、按钮、开关和操纵杆。输入装置915可以例如是使用红外线或其他无线电波的遥控装置,或者可以是外部连接装置927,诸如对应于信息处理设备900的操作的移动电话。输入装置915包括输入控制电路,该输入控制电路基于用户输入的信息生成输入信号,并将所生成的信号输出到cpu901。用户操作输入装置915以将各种数据输入到信息处理设备900并指示处理操作。
[0125]
输出装置917由能够视觉或听觉地向用户通知所获取的信息的装置来配置。输出装置917可以例如是诸如lcd、pdp或oeld的显示装置、诸如扬声器或耳机的声学输出装置、打印机装置等。输出装置917以文本或图像的形式将通过信息处理设备900的处理获得的结果作为视频输出,或者将其作为声学声音输出。
[0126]
存储装置919是被配置为信息处理设备900的存储单元的示例的用于数据存储的装置。存储装置919例如由诸如硬盘驱动器(hdd)、半导体存储装置、光存储装置或磁光存储装置的磁存储单元装置来配置。存储装置919存储由cpu 901执行的程序和各种数据、从外部获取的各种数据等。存储装置919可以实现根据上述实施例的存储单元110的功能。
[0127]
驱动器921是用于诸如磁盘、光盘、磁光盘或半导体存储器的可移动记录介质923的读取器/写入器,并且内置于信息处理设备900中或从外部附接到信息处理设备900。驱动器921读出记录在安装的可移动记录介质923中的信息,并将该信息输出到ram 905。驱动器921还在安装的可移动记录介质923上写入记录。
[0128]
连接端口925是用于将设备直接连接到信息处理设备900的端口。连接端口925可以例如是通用串行总线(usb)端口、ieee 1394端口、小型计算机系统接口(scsi)端口等。此外,连接端口925可以是rs-232c端口、光学音频终端、高清多媒体接口(hdmi)(注册商标)端口等。通过将外部连接装置927连接到连接端口925,可以在信息处理设备900与外部连接装置927之间交换各种数据。
[0129]
通信装置929例如是由通信装置等配置的用于连接到通信网络nw的通信接口。通信装置929可以例如是用于有线或无线局域网(lan)、蓝牙(注册商标)或无线usb(wusb)的通信卡。此外,通信装置929可以是用于光通信的路由器、用于非对称数字用户线路(adsl)的路由器、用于各种类型通信的调制解调器等。通信装置929使用诸如tcp/ip的预定协议向因特网或另一通信装置发送信号等,并且从因特网或另一通信装置接收信号等。连接到通信装置929的通信网络nw是通过有线或无线连接的网络,并且例如是因特网、家庭lan、红外通信、无线电波通信、卫星通信等。
[0130]
1.9总结
[0131]
已经参考附图详细描述了本公开的优选实施例,但是本公开的技术范围不限于这样的示例。显而易见的是,本公开领域的技术人员可以设想在权利要求中描述的技术思想
的范围内的各种变化或修改。应当理解,这些变化或修改也落入本公开的技术范围内。
[0132]
例如,尽管在上述实施例中,粒子分析系统1被配置为包括信息处理设备10和测量设备20,但是本技术不限于这样的示例。例如,信息处理设备10可以具有测量设备20的功能(测量功能)。在这种情况下,粒子分析系统1由信息处理设备10实现。此外,测量设备20可以具有信息处理设备10的功能(数据获取功能、自体荧光识别功能和ui控制功能)。在这种情况下,粒子分析系统1由测量设备20实现。此外,测量设备20可以具有信息处理设备10的部分功能,并且信息处理设备10可以具有测量设备20的部分功能。此外,信息处理设备10可以仅具有自体荧光识别功能。在这种情况下,可以通过另一信息处理设备等实现其他功能。
[0133]
还可以创建计算机程序,用于使包含在信息处理设备中的诸如cpu、rom和ram的硬件发挥等同于上述信息处理设备的相应配置的功能。还提供了存储计算机程序的存储介质。
[0134]
此外,本说明书中描述的效果仅是说明性的或示例性的,而不是限制性的。即,除了上述效果之外或代替上述效果,根据本公开的技术可以从本说明书的描述中表现出对本领域技术人员显而易见的其他效果。
[0135]
以下配置也在本公开的技术范围内。
[0136]
(1)
[0137]
一种信息处理设备,包括:
[0138]
afp分离单元,显示以自体荧光强度和侧向散射光强度为轴的二维图和用于自体荧光数据的光谱图,并显示在二维图中指定的自体荧光群体的光谱强度,其中,自体荧光群体的光谱强度叠加在光谱图上。
[0139]
(2)
[0140]
根据(1)的信息处理设备,其中,afp分离单元针对使用多个光轴测量的自体荧光数据显示相对于每个光轴的二维图和光谱图,并且显示在多个二维图中指定的自体荧光群体的光谱强度,其中,自体荧光群体的光谱强度叠加在光谱图上。
[0141]
(3)
[0142]
根据(1)或(2)的信息处理设备,其中,afp分离单元接受参数的改变操作并且更新光谱图,该参数指定相对于光谱图的光谱强度的测量时间宽度中的累积强度、最大强度和检测时间宽度中的任何一个。
[0143]
(4)
[0144]
根据(1)、(2)或(3)的信息处理设备,其中,afp分离单元以不同颜色叠加并显示自体荧光数据的光谱强度和自体荧光群体的平均光谱强度。
[0145]
(5)
[0146]
根据(1)至(4)中任一项的信息处理设备,还包括afp选择单元,该afp选择单元显示自体荧光群体的列表,并且接受用于荧光分离处理的自体荧光群体的选择和在荧光分离处理中用作基本自体荧光群体的自体荧光群体的选择。
[0147]
(6)
[0148]
一种信息处理方法,包括:
[0149]
通过处理器显示以自体荧光强度和侧向散射光强度为轴的二维图和用于自体荧光数据的光谱图,并显示在二维图中指定的自体荧光群体的光谱强度,其中,自体荧光群体
的光谱强度叠加在光谱图上。
[0150]
(7)
[0151]
一种程序,使计算机用作afp分离单元,该afp分离单元显示以自体荧光强度和侧向散射光强度为轴的二维图和用于自体荧光数据的光谱图,并显示在二维图中指定的自体荧光群体的光谱强度,其中,自体荧光群体的光谱强度叠加在光谱图上。
[0152]
(8)
[0153]
一种信息处理系统,包括:
[0154]
测量设备,包括多个测量单元,该测量单元使用多个光轴用光照射要测量的对象,并测量与要测量的对象的发光相关的光谱;以及
[0155]
信息处理设备,包括afp分离单元,该afp分离单元显示以特定波长的自体荧光强度和侧向散射光强度为轴的二维图以及关于由测量设备测量的自体荧光数据的每个光轴的光谱图,并且显示在二维图中指定的自体荧光群体的光谱强度,其中,自体荧光群体的光谱强度叠加在光谱图上。
[0156]
(9)
[0157]
根据(8)的信息处理系统,其中,
[0158]
测量设备还包括:
[0159]
存储单元,存储用于测量的参数。
[0160]
(10)
[0161]
一种粒子分析系统,包括:
[0162]
光检测器,获取通过用激发光照射粒子而生成的光;以及
[0163]
信息处理单元,输出光谱图,该光谱图包括在测量数据的二维图中指定的自体荧光群体的光谱信息和测量数据的光谱信息,每个测量数据对应于所获取的光,并且信息处理单元在荧光分离处理中记录自体荧光群体的光谱信息作为自体荧光参考光谱。
[0164]
(11)
[0165]
根据(10)的粒子分析系统,其中,
[0166]
二维图的一个轴表示预定波长范围内的光强度,并且信息处理单元输出该二维图。
[0167]
(12)
[0168]
根据(11)的粒子分析系统,其中,二维图的一个轴表示预定波长范围内的光强度,另一轴表示散射光的光强度。
[0169]
(13)
[0170]
根据(10)、(11)或(12)的粒子分析系统,其中,
[0171]
光检测器包括光接收元件单元,并且其中,光谱图的一个轴表示光接收元件单元的通道或检测波长,另一轴表示光强度。
[0172]
(14)
[0173]
根据(10)至(13)中任一项的粒子分析系统,其中,
[0174]
光检测器获取通过用具有不同波长范围的多个激发光束照射粒子而生成的光,并且
[0175]
以与多个激发光束相同的数量显示二维图和光谱图。
[0176]
(15)
[0177]
根据(10)至(14)中任一项的粒子分析系统,其中,自体荧光群体的光谱信息是对应于包括在自体荧光群体中的粒子的测量数据的光谱信息的平均值。
[0178]
(16)
[0179]
根据(10)至(15)中任一项的粒子分析系统,其中,
[0180]
在二维图中指定多个自体荧光群体,并且
[0181]
信息处理单元输出多个自体荧光群体的光谱信息作为列表,并记录列表中指定的自体荧光群体的光谱信息作为自体荧光参考光谱。
[0182]
(17)
[0183]
根据(10)至(16)中任一项的粒子分析系统,其中,显示光谱图,使得自体荧光群体的光谱信息和测量数据的光谱信息具有不同的颜色。
[0184]
(18)
[0185]
根据(10)至(17)中任一项的粒子分析系统,其中,
[0186]
光检测器获取通过用激发光照射用荧光染料标记的粒子而生成的荧光,并且
[0187]
信息处理单元通过使用所记录的自体荧光参考光谱对与所获取的荧光相对应的测量数据的光谱信息执行荧光分离处理来获取荧光染料的荧光强度信息。
[0188]
(19)
[0189]
根据(18)的粒子分析系统,其中,通过使用包括所记录的自体荧光参考光谱的光谱参考的最小二乘法或加权最小二乘法来执行荧光分离处理。
[0190]
(20)
[0191]
根据(10)至(19)中任一项的粒子分析系统,其中,粒子是细胞。
[0192]
(21)
[0193]
根据(10)至(20)中任一项的粒子分析系统,还包括:
[0194]
照射单元,照射激发光;以及
[0195]
流动路径部分,粒子流过该流动路径部分。
[0196]
(22)
[0197]
一种信息处理方法,包括:
[0198]
通过处理器
[0199]
输出光谱图,该光谱图包括在测量数据的二维图中指定的自体荧光群体的光谱信息和测量数据的光谱信息,每个测量数据对应于通过用激发光照射粒子而生成的光;并且
[0200]
在荧光分离处理中记录自体荧光群体的光谱信息作为自体荧光参考光谱。
[0201]
(23)
[0202]
一种程序,使计算机用作:
[0203]
信息处理单元,输出光谱图,该光谱图包括在测量数据的二维图中指定的自体荧光群体的光谱信息和测量数据的光谱信息,每个测量数据对应于通过用激发光照射粒子而生成的光,并且信息处理单元在荧光分离处理中记录自体荧光群体的光谱信息作为自体荧光参考光谱,其中,
[0204]
二维图的至少一个轴表示对应于由多个激发光束中的任何一个生成的光的光强度。
[0205]
参考标记列表
[0206]
1粒子分析系统
[0207]
2、2c自体荧光屏幕
[0208]
3步骤#1部分
[0209]
4步骤#2部分
[0210]
5步骤#3部分
[0211]
10信息处理设备
[0212]
20测量设备
[0213]
20a设置保存单元
[0214]
20b设置存储单元
[0215]
20c搜索单元
[0216]
21激光光源
[0217]
22微通道
[0218]
23光检测器
[0219]
31二维图
[0220]
41二维图
[0221]
42vf调整窗口
[0222]
43光谱图
[0223]
44带状图
[0224]
45选通
[0225]
46平均光谱强度
[0226]
47光谱强度
[0227]
51列表
[0228]
101测量数据获取单元
[0229]
102afp识别单元
[0230]
106目标选择单元
[0231]
107afp分离单元
[0232]
108afp选择单元
[0233]
110存储单元
[0234]
120ui控制单元
[0235]
230检测器
[0236]
231光接收元件单元。
再多了解一些

本文用于企业家、创业者技术爱好者查询,结果仅供参考。

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