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I型干扰素标记及使用方法与流程

2021-11-25 01:15:00 来源:中国专利 TAG:

技术特征:
1.一种治疗患有对用i型干扰素(ifn

i)抑制剂治疗有响应的ifn

i介导的疾病的受试者的方法,所述方法包括:a)提供来自所述受试者的生物样本;b)测定所述生物样本中基因dhx58、eif2ak2、herc5、ifi44、ifi44l、ifi6、irf7、parp9、plscr1和samd9l的基因表达;c)确定所述生物样本中所述基因dhx58、eif2ak2、herc5、ifi44、ifi44l、ifi6、irf7、parp9、plscr1和samd9l的组合表达值;以及d)当所述组合表达值等于或高于阈值时,用所述ifn

i抑制剂治疗所述受试者。2.根据权利要求2所述的方法,其中,所述组合表达值为基因dhx58、eif2ak2、herc5、ifi44、ifi44l、ifi6、irf7、parp9、plscr1和samd9的归一化阈值循环(ct)值的总和(sumδct),并且所述阈值为57.474的sumδct。3.根据权利要求1所述的方法,其中,所述组合表达值为所述生物样本与从一个或多个健康对照获得的生物样本之间基因dhx58、eif2ak2、herc5、ifi44、ifi44l、ifi6、irf7、parp9、plscr1和samd9l的归一化差异表达的log2倍数变化的总和(sumlog2(2^

ddct)),并且所述阈值为8.725的sumlog2(2^

ddct)。4.根据权利要求1所述的方法,其中,所述组合表达值为式i的poise评分:poise评分=70

|43.7251664

sumlog2(2^

ddct
)|
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(式i),并且所述阈值为在30与40之间的poise评分。5.根据权利要求4所述的方法,其中,所述阈值为35的poise评分。6.根据权利要求1所述的方法,其中,所述生物样本为血液样本或组织样本。7.根据权利要求1所述的方法,其中,所述ifn

i介导的疾病为系统性红斑狼疮(sle)、i型糖尿病、牛皮癣、原发性干燥综合征、系统性硬化症、类风湿性关节炎、移植排斥、皮肌炎、多发性肌炎、艾卡迪

古特雷斯综合征、sting相关的婴儿期发病血管病变(savi)或慢性非典型中性粒细胞皮炎伴脂肪代谢障碍及高体温综合征(candle)。8.根据权利要求7所述的方法,其中,sle包括狼疮性肾炎、皮肤狼疮或具有中枢神经系统(cns)表现的狼疮。9.根据权利要求1所述的方法,其中,所述ifn

i抑制剂为阻断ifn

i与ifnar相互作用的分子,结合ifn

i的拮抗性抗体,结合ifnar的拮抗性抗体,tyk2、jak1、tlr7、tlr8、tlr9或sting的抑制剂,浆细胞样树突状细胞的调节剂或耗减剂;或降解核酸的药剂。10.根据权利要求9所述的方法,其中,所述结合ifn

i的拮抗性抗体包含:a)seq id no:11的重链可变区1(hcdr1)、seq id no:12的hcdr2、seq id no:13的hcdr3、seq id no:14的轻链可变区1(lcdr1)、包含氨基酸序列gas的lcdr2和seq id no:16的lcdr3;b)seq id no:17的重链可变区(vh)和seq id no:18的轻链可变区(vl);或者c)seq id no:19的重链(hc)和seq id no:20的轻链(lc),或它们的任何组合。11.根据权利要求10所述的方法,其中,所述结合ifn

i的拮抗性抗体以约10mg/kg的剂量施用。12.根据权利要求11所述的方法,其中,所述结合ifn

i的拮抗性抗体以约10mg/kg的剂量每两周一次施用。
13.一种确定患有i型干扰素(ifn

i)介导的疾病的受试者是否对用ifn

i抑制剂治疗有响应并决定是否治疗所述受试者的方法,所述方法包括:a)提供来自所述受试者的生物样本;b)测定所述生物样本中基因dhx58、eif2ak2、herc5、ifi44、ifi44l、ifi6、irf7、parp9、plscr1和samd9l的基因表达;c)确定所述生物样本中所述基因dhx58、eif2ak2、herc5、ifi44、ifi44l、ifi6、irf7、parp9、plscr1和samd9l的组合表达值;d)当所述组合表达值等于或高于阈值时,诊断患有所述ifn

i介导的疾病的所述受试者对用所述ifn

i抑制剂治疗有响应,或者当所述组合表达值小于阈值时,诊断患有所述ifn

i介导的疾病的所述受试者对用所述ifn

i抑制剂治疗无响应;以及e)将所述ifn

i抑制剂施用给被诊断为对用所述ifn

i抑制剂治疗有响应的所述受试者或避免将所述ifn

i抑制剂施用给被诊断为对用所述ifn

i抑制剂治疗无响应的所述受试者。14.根据权利要求13所述的方法,其中,所述组合表达值为基因dhx58、eif2ak2、herc5、ifi44、ifi44l、ifi6、irf7、parp9、plscr1和samd9l的归一化阈值循环(ct)值的总和(sumδct),并且所述阈值为57.474的sumδct。15.根据权利要求13所述的方法,其中,所述组合表达值为所述生物样本与从一个或多个健康对照获得的生物样本之间基因dhx58、eif2ak2、herc5、ifi44、ifi44l、ifi6、irf7、parp9、plscr1和samd9l的归一化差异表达的log2倍数变化的总和(sumlog2(2^

ddct)),并且所述阈值为8.725的sumlog2(2^

ddct)。16.根据权利要求13所述的方法,其中,所述组合表达值为式i的poise评分:poise评分=70

|43.7251664

sumlog2(2^

ddct
)|
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(式i),并且所述阈值为在30与40之间的poise评分。17.根据权利要求16所述的方法,其中,所述阈值为35的poise评分。18.根据权利要求13所述的方法,其中,所述生物样本为血液样本或组织样本。19.根据权利要求13所述的方法,其中,所述ifn

i介导的疾病为系统性红斑狼疮(sle)、i型糖尿病、牛皮癣、原发性干燥综合征、系统性硬化症、类风湿性关节炎、移植排斥、皮肌炎、多发性肌炎、艾卡迪

古特雷斯综合征、sting相关的婴儿期发病血管病变(savi)或慢性非典型中性粒细胞皮炎伴脂肪代谢障碍及高体温综合征(candle)。20.根据权利要求19所述的方法,其中,sle包括狼疮性肾炎、皮肤狼疮或具有中枢神经系统(cns)表现的狼疮。21.根据权利要求13所述的方法,其中,所述ifn

i抑制剂为阻断ifn

i与ifnar相互作用的分子,结合ifn

i的拮抗性抗体,结合ifnar的拮抗性抗体,tyk2、jak1、tlr7、tlr8、tlr9或sting的抑制剂,浆细胞样树突状细胞的调节剂或耗减剂;或降解核酸的药剂。22.根据权利要求21所述的方法,其中,所述结合ifn

i的拮抗性抗体包含:a)seq id no:11的重链可变区1(hcdr1)、seq id no:12的hcdr2、seq id no:13的hcdr3、seq id no:14的轻链可变区1(lcdr1)、包含氨基酸序列gas的lcdr2和seq id no:16的lcdr3;b)seq id no:17的重链可变区(vh)和seq id no:18的轻链可变区(vl);或者
c)seq id no:19的重链(hc)和seq id no:20的轻链(lc),或它们的任何组合。23.根据权利要求22所述的方法,其中,所述结合ifn

i的拮抗性抗体以约10mg/kg的剂量施用。24.根据权利要求23所述的方法,其中,所述结合ifn

i的拮抗性抗体以约10mg/kg的剂量每两周一次施用。25.一种用于预测和/或诊断受试者患有ifn

i介导的疾病的体外方法,所述方法包括a)提供来自所述受试者的生物样本;b)测定所述生物样本中基因dhx58、eif2ak2、herc5、ifi44、ifi44l、ifi6、irf7、parp9、plscr1和samd9l的基因表达;c)确定所述生物样本中所述基因dhx58、eif2ak2、herc5、ifi44、ifi44l、ifi6、irf7、parp9、plscr1和samd9l的组合表达值;以及d)当所述组合表达值等于或高于阈值时,预测和/或诊断所述受试者患有所述ifn

i介导的疾病。26.根据权利要求25所述的方法,其中,所述组合表达值为基因dhx58、eif2ak2、herc5、ifi44、ifi44l、ifi6、irf7、parp9、plscr1和samd9l的归一化阈值循环(ct)值的总和(sumδct),并且所述阈值为57.474的sumδct。27.根据权利要求25所述的方法,其中,所述组合表达值为所述生物样本与从一个或多个健康对照获得的生物样本之间基因dhx58、eif2ak2、herc5、ifi44、ifi44l、ifi6、irf7、parp9、plscr1和samd9l的归一化差异表达的log2倍数变化的总和(sumlog2(2^

ddct)),并且所述阈值为8.725的sumlog2(2^

ddct)。28.根据权利要求25所述的方法,其中,所述组合表达值为式i的poise评分:poise评分=70

|43.7251664

sumlog2(2^

ddct
)|
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(式i),并且参考值为在30与40之间的poise评分。29.根据权利要求28所述的方法,其中,所述参考值为35的poise评分。30.根据权利要求25所述的方法,其中,所述生物样本为血液样本或组织样本。31.根据权利要求30所述的方法,其中,基因表达使用定量聚合酶链反应(qpcr)或微阵列或两者来测定。32.根据权利要求31所述的方法,其中,基因表达在mrna水平上测量。33.根据权利要求25所述的方法,其中,所述ifn

i介导的疾病为系统性红斑狼疮(sle)、i型糖尿病、牛皮癣、原发性干燥综合征、系统性硬化症、类风湿性关节炎、移植排斥、皮肌炎、多发性肌炎、艾卡迪

古特雷斯综合征、sting相关的婴儿期发病血管病变(savi)或慢性非典型中性粒细胞皮炎伴脂肪代谢障碍及高体温综合征(candle)。

技术总结
I型干扰素(IFN


技术研发人员:M
受保护的技术使用者:詹森生物科技公司
技术研发日:2019.10.25
技术公布日:2021/11/24
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