一种PCR检测方法与流程

技术特征：
1.一种pcr检测方法，其特征在于，包括：s1：采用光谱仪采集cycle 0
‑
40荧光强度a
i
，a
i
，i∈[0，40]；s2：将采集的cycle 0
‑
40荧光强度a
i
作归一化处理，得到归一化处理后的数据d
i
，d
i
＝c
i
‑
y
i
，i∈[1，40]；y
i
为基线baseline，c
i
为平滑处理后的数据；s3：对步骤s2得到归一化处理后的数据d
i
依次作一阶差分、二阶差分和三阶差分处理；s4：取二阶差分最大值，选出三阶差分中符合“正负负负”或“正负负”或“正负”规律的最大点，且要求对应cycle一阶差分大于0，该坐标 1即为二阶差分最大值对应坐标，另
±
1共计3点；s5：多项式拟合，将上述步骤s4得到的3点按二次函数y＝ax2 bx c拟合，取其中a是二次项系数，b是一次项系数，c是常数；s6：切线求ct值，过x处做d
i
拟合曲线的切线，其与基线baseline交点的横坐标即为ct值，进而可得threshold，s7：阴/阳性判别：若ct值≥38，判断为阴性；反之，则为阳性。2.如权利要求1所述的pcr检测方法，其特征在于，还包括步骤s8：绘图，将d
i
按cycle数绘制曲线。3.如权利要求1所述的pcr检测方法，其特征在于，采集的cycle 0
‑
40荧光强度a
i
归一化处理方法具体包括：s11：扣除基底：a1‑
a
40
作为信号，减去基底a0；b
i
＝a
i
‑
a0，i∈[1，40]，其中，b
i
为去除基底的数据；s12：平滑数据：对去除基底的数据b
i
进行平滑处理，得到平滑处理后的数据c
i
；b
i
→
c
i
s13：确定基线：选择c3‑
c
10
，根据最小二乘法拟合出直线作为基线baseline y
i
，y
i
＝a1χ
i
b1，i∈[1，40]，其中，a1为一次项系数，b1为常数项；s14：数据扣除基线baseline，得到d
i
＝c
i
‑
y
i
，i∈[1，40]。4.如权利要求3所述的pcr检测方法，其特征在于，以savitzky
‑
golay平滑算法函数sg_smooth去除基底的数据b
i
平滑处理，其中参数为窗口大小winsize：3，阶数degree：6。5.如权利要求1所述的pcr检测方法，其特征在于，一阶差分、二阶差分和三阶差分处理具体分别为：s31：一阶差分其中，d
′
i
为第i个点的1阶差分值，d
i 1
为归一化处理后的第i 1个点，d
i
‑1为归一化处理后的第i
‑
1个点；s32：二阶差分：其中d
″
i
为第i个点二阶差分值，d
′
i 2
为一阶差分值中的第i 2个点的值，d
′
i
‑2为一阶差分值中的第i
‑
2个点的值；s33：三阶差分：
d
″′
i
＝d
″
i 1
‑
d
″
i
，i∈[4，36]，其中为第i个点的三阶差分值，d
″
i 1
为二阶差分中的第i 1个点的值。

技术总结
本发明提供一种PCR检测方法，包括：S1：采用光谱仪采集cycle 0


技术研发人员：蒋鹏翀 顾陈 高静 蔡亦梅 范东雨 任鲁风
受保护的技术使用者：北京中科生仪科技有限公司
技术研发日：2020.12.30
技术公布日：2021/11/4