技术特征:
1.一种脱氧核糖核酸的密码标准化方法,其特征在于,包括:
步骤(a),将C、T、A、G的4种碱基分别命名为00、01、10、11;以及
步骤(b),当各碱基形成G和C以及A和T的碱基对时,在从5′到3′的方向,分别在G和C的情况下命名为1100,在C和G的情况下命名为0011,在A和T的情况下命名为1001,在T和A的情况下命名为0110。
2.一种利用脱氧核糖核酸的密码标准化来提供用于确认特定脱氧核糖核酸片段或适配体的特定模式或二级结构的最优化的信息的方法,其特征在于,包括:
步骤(a),将特定脱氧核糖核酸片段碱基序列的C、T、A及G分别命名为00、01、10、11;以及
步骤(b),比较以上述数值命名的密码的排列与各密码和的排列。
3.根据权利要求2所述的利用脱氧核糖核酸的密码标准化来提供用于确认特定脱氧核糖核酸片段或适配体的特定模式或二级结构的最优化的信息的方法,其特征在于,在上述比较密码的排列与各密码和的排列的步骤中,将上述步骤(a)的00、01、10及11的二进制数的数组转换为十进制数后,当在两端排列两对以上的各序列之和等于3的密码排列时,判断为能够形成茎状结构,当在中心连接3个以上的相向的序列的密码之和大于或小于3而无法形成互补结合的序列时,判断为形成环状结构。
4.一种利用脱氧核糖核酸的密码标准化来提供与在特定脱氧核糖核酸片段中是否存在碱基序列变异有关的信息的方法,其特征在于,包括:
步骤(a),将特定脱氧核糖核酸片段碱基序列的C、T、A及G分别命名为00、01、10、11;以及
步骤(b),比较由上述数值命名的密码之和。
5.根据权利要求4所述的提供与在特定脱氧核糖核酸片段中是否存在碱基序列变异有关的信息的方法,其特征在于,在上述比较密码之和的步骤中,将上述步骤(a)的00、01、10及11的二进制数的数组转换为十进制数后,求得其和,并与正常序列进行比较,当存在1至3的差异时,判断为存在变异。
6.根据权利要求4所述的提供与在特定脱氧核糖核酸片段中是否存在碱基序列变异有关的信息的方法,其特征在于,上述方法能够通过对将特定脱氧核糖核酸片段的碱基序列的C、T、A及G分别命名为00、01、10、11来获取的密码各自的数值进行比较来确认变异序列的位置。
7.一种存储在计算机可读介质的计算机程序,使计算机执行下述步骤,以提供用于确认特定脱氧核糖核酸片段或适配体的特定模式或者二级结构的被最优化的信息,其特征在于,上述步骤包括:
步骤(a),将特定脱氧核糖核酸片段的碱基序列的C、T、A及G分别命名为00、01、10、11;以及
步骤(b),将上述步骤(a)的00、01、10及11的二进制数的数组转换为十进制数后,当在两端排列两对以上的各序列之和等于3的密码排列时,判断为能够形成茎状结构,当在中心连接3个以上的相向的序列之和大于或小于3而无法形成互补结合的序列时,判断为形成环状结构。
8.一种存储在计算机可读介质的计算机程序,使计算机执行下述步骤,以提供与在特定脱氧核糖核酸片段中是否存在碱基序列的变异有关的信息,其特征在于,上述步骤包括:
步骤(a),将特定脱氧核糖核酸片段的碱基序列的C、T、A及G分别命名为00、01、10、11;以及
步骤(b),将上述步骤(a)的二进制数的数组转换为十进制数后,求得其和,并与正常序列进行比较,当存在1至3的差异时,判断为存在变异。
9.一种存储在计算机可读介质的计算机程序,使计算机执行下述步骤,以提供与特定脱氧核糖核酸片段的碱基序列变异序列有关的位置有关的信息,其特征在于,上述步骤包括:
步骤(a),将特定脱氧核糖核酸片段的碱基序列的C、T、A及G分别命名为00、01、10、11;以及
步骤(b),通过对上述步骤(a)的将特定脱氧核糖核酸片段的碱基序列的C、T、A及G分别命名为00、01、10、11来获取的密码各自的数值进行比较来确认变异序列的位置。
技术总结
本发明涉及一种脱氧核糖核酸(DNA)的密码标准化方法,其包括:步骤(a),将C、T、A、G的4种碱基分别命名为00、01、10、11;以及步骤(b),当各碱基形成G和C以及A和T的碱基对时,在从5′到3′的方向,分别在G和C的情况下命名为1100,在C和G的情况下命名为0011,在A和T的情况下命名为1001,在T和A的情况下命名为0110,在本发明的脱氧核糖核酸密码标准化方法中,提供容易掌握碱基序列内的特定模式及二级结构、碱基序列变异等的方法,提供利用单核苷酸多态性(SNP)等的疾病特异性序列变异来容易预测疾病等的能够容易掌握脱氧核糖核酸片段或适配体等的在碱基序列内存在的特定模式的方法。
技术研发人员:孙寅植;金显珠;
受保护的技术使用者:海瑟戈公司;
技术研发日:2019.03.27
技术公布日:2021.11.05
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