一种抗菌核病基因及与其紧密连锁的分子标记和应用

本发明属于农作物分子遗传育种学领域，具体涉及一种抗菌核病

qscl2.3及与其紧密连锁的分子标记和应用。

背景技术：

1、向日葵菌核病是一种危害严重且难防治的世界性病害，能侵染 400 多种植物，是影响向日葵产量和品质的最重要的病害之一，每年由菌核病造成的产量损失在10-20 %左右，发病严重时达80 %以上甚至绝产。选育抗菌核病品种是减轻菌核病危害最直接、经济、有效且环保的措施。然而，迄今为止还未找到免疫或高抗菌核病的种质资源，限制了向日葵抗菌核病育种工作的开展。因此，亟需开展向日葵抗菌核病种质鉴定，挖掘抗菌核病关键基因，借助现代育种技术手段创制抗菌核病新种质，培育抗菌核病的向日葵作物新品种。

技术实现思路

1、本发明的目的是提供一种抗菌核病

qscl2.3，及与其紧密连锁的分子标记和应用。

2、为实现上述目的，本发明采用技术方案为：

3、一种抗菌核病基因

，抗菌核病

qscl2.3为位于向日葵第2号染色体（chr02:122250375-chr02:1223469901）区域内0.82mb。

4、一种与所述的抗菌核病紧密连锁的分子标记，分子标记为向日葵第2号染色体（chr02:122250375-chr02:1223469901）区域内的caps标记位点，其核苷酸序列如 seqidno.1 所示。

5、一种所述分子标记的应用，所述分子标记在选育携带抗菌核病

qscl2.3向日葵品种中的应用。

6、一种用于检测所述与抗菌核病

qscl2.3紧密连锁的分子标记的引物，引物组合由如seq id no.2和 seq id no.3中碱基序列所示； 其中，seq id no.2正向引物 f序列是5′- attacaactatccaaaagg-3′，seq id no.3反向引物r序列是5′-actactaacaaacagtaagaac-3′。

7、一种所述引物的应用，所述引物在选育携带抗菌核病基因向日葵品种中的应用。

8、提取样品群体中单个植株的基因组dna，用所述引物组合进行pcr扩增，扩增产物进行maeii酶切，若酶切后片段长度为327bp和188bp，即标志着所检测向日葵样品携带抗菌核病

qscl2.3，若酶切后片段长度为515bp，即标志着所检测向日葵样品不携带抗菌核病

qscl2.3。

9、一种选育抗菌核病基因向日葵品种的方法：

10、1）提取向日葵样品基因组dna；

11、2）利用所述的引物组合对向日葵样品基因组dna进行pcr扩增；

12、3）扩增产物经扩增产物进行maeii酶切，所得片段长度为327bp和188bp标志着所检测向日葵样品携带抗菌核病

qscl2.3。

13、本发明的有益效果：

14、本发明抗菌核病基因通过向日葵抗病自交系c6和感病自交系b728杂交，经单粒传法衍生了178份f5:6重组自交系，利用slaf-seq对双亲及后代群体基因型进行检测，从c6中定位到一个抗菌核病基因wrky48，所得抗菌核病基因

wrky48可应用在向日葵育种中，并为提高该基因在育种过程中的选择效率和准确性，缩短育种周期，进而获得与

qscl2.3紧密连锁的分子标记，其在向日葵新品种选育过程中的应用方法，具体为：

15、1.本发明获得的与抗菌核病

qscl2.3紧密连锁的分子标记，其鉴定获得的抗菌核病基因作为在向日葵品种中定位的新基因，该基因可在向日葵抗病育种中应用，本发明的应用可显著提高

qscl2.3利用效率。

16、2.本发明提供的分子标记基于二代重测序结果开发，并经过一代测序验证，结果精确，特异性好。

17、3.本发明提供的分子标记位于抗病

qscl2.3的定位区域内，具体为该区域的第2号染色体，在遗传上与

qscl2.3连锁紧密，标记与基因共分离程度高。

18、4.本发明提供的分子标记为caps标记，该标记存在检测多态性好，便于通过琼脂糖凝胶电泳准确区分，应用的成本低、操作简便、准确性高。

1.一种抗菌核病基因，其特征在于：抗菌核病qscl2.3 为位于向日葵第2号染色体（chr02:122250375-chr02:1223469901）区域内0.82mb。

2.一种与权利要求1所述的抗菌核病紧密连锁的分子标记，其特征在于：分子标记为向日葵第2号染色体（chr02:122250375-chr02:1223469901）区域内的caps标记位点，其核苷酸序列如 seqid no.1 所示。

3.一种权利要求4所述分子标记的应用，其特征在于：所述分子标记在选育携带抗菌核病基因向日葵品种中的应用。

4.一种用于检测权利要求2所述与抗菌核病qscl2.3 紧密连锁的分子标记的引物，其特征在于：引物组合由如seq id no.2和 seq id no.3中碱基序列所示； 其中，seq idno.2正向引物 f序列是5′- attacaactatccaaaagg-3′，seq id no.3反向引物r序列是5′-actactaacaaacagtaagaac-3′。

5.一种权利要求4所述引物的应用，其特征在于：所述引物在选育携带抗菌核病基因向日葵品种中的应用。

6.按权利要求5所述的引物组合的应用，其特征在于：提取样品群体中单个植株的基因组dna，用权利要求3所述引物组合进行pcr扩增，扩增产物进行maeii酶切，若酶切后片段长度为327bp和188bp，即标志着所检测向日葵样品携带抗菌核病qscl2.3，若酶切后片段长度为515bp，即标志着所检测向日葵样品不携带抗菌核病qscl2.3。

7.一种选育抗菌核病基因向日葵品种的方法，其特征在于：