一种DNA甲基化测序文库甲基化转化率的评估方法、应用、终端设备及存储介质与流程

技术特征：
1.一种dna甲基化测序文库甲基化转化率的评估方法，其特征在于，所述方法包括对待测文库的dna进行酶学甲基化转化处理后，通过参照位点的位点甲基化转化率与文库甲基化转化率之间的相关性评估文库甲基化转化率，所述参照位点的位点甲基化转化率与文库甲基化转化率相关，且能够通过函数拟合。2.根据权利要求1所述的一种dna甲基化测序文库甲基化转化率的评估方法，其特征在于，所述参照位点在其上下游
±
10 bp内的其余位点的位点甲基化转化率与文库甲基化转化率不相关。3.根据权利要求1或2所述的一种dna甲基化测序文库甲基化转化率的评估方法，其特征在于，所述参照位点选自外源λdna；或选自内源基因组非cpg位点。4.根据权利要求3所述的一种dna甲基化测序文库甲基化转化率的评估方法，其特征在于，所述参照位点选自λdna基因组中位点4625位点或6443位点。5.根据权利要求4所述的一种dna甲基化测序文库甲基化转化率的评估方法，其特征在于，所述参照位点选自λdna基因组中6443位点，所述位点甲基化转化率与文库甲基化转化率之间的相关性为：y=-0.4773x2 1.0395x 0.4313，其中y为文库甲基化转化率，x为参照位点甲基化转化率。6.根据权利要求5所述的一种dna甲基化测序文库甲基化转化率的评估方法，其特征在于，所述参照位点的位点甲基化转化率通过ddpcr的方法检测，所述参照位点上游设计引物为seq id no:1，参照位点下游设计引物为seq id no:2，针对转化前c的探针为seq id no:3及转化后t的探针为 seq id no:4。7.根据权利要求6所述的一种dna甲基化测序文库甲基化转化率的评估方法，其特征在于，ddpcr的反应体系中模板浓度为1~10 ng/20ul，上游引物和下游引物的工作浓度为600～900 nmol/l，探针的工作浓度为200～300 nmol/l。8.权利要求1所述的一种dna甲基化测序文库甲基化转化率的评估方法中参照位点的筛选方法，其特征在于，所述参照位点的筛选方法是利用c-t甲基化转化率差异文库筛选与转化率相关的参照位点，首先构建不同甲基化转化率的文库获得甲基化转化率差异文库；再获得各甲基化转化率差异文库中所有c位点c-t位点转化率；统计c位点c-t转化率与文库转化率的相关性，选择位点甲基化转化率与文库甲基化转化率相关；且能够通过函数拟合的位点为参照位点。9.权利要求1-7任一所述的一种dna甲基化测序文库甲基化转化率的评估方法的应用，其特征在于，将其用于甲基化文库甲基化转化率快速质控中，评估文库甲基化转化率是否满足设定的质控阈值。10.根据权利要求9所述的一种dna甲基化测序文库甲基化转化率的评估方法的应用，其特征在于，所述质控阈值不低于0.980，当检测的文库甲基化转化率低于0.980时，判定文库质控不合格。11.一种终端设备，其特征在于，包括存储器、处理器以及存储在所述存储器上并可在所述处理器上运行的计算机程序，所述处理器运行所述计算机程序时实现权利要求1-7任一所述的一种dna甲基化测序文库甲基化转化率的评估方法或实现权利要求9-10任一所述的一种dna甲基化测序文库甲基化转化率的评估方法的应用。12.一种计算机可读存储介质，其特征在于，所述计算机可读存储介质存储有计算机程
序，所述计算机程序被处理器执行时实现如权利要求1-7任意一项所述的一种dna甲基化测序文库甲基化转化率的评估方法或权利要求9-10任一所述的一种dna甲基化测序文库甲基化转化率的评估方法的应用。

技术总结
本发明公开了一种DNA甲基化测序文库甲基化转化率的评估方法、应用、终端设备及计算机可读存储介质，属于基因检测技术领域。上述甲基化测序文库甲基化转化率的评估方法是选择位点甲基化转化率与甲基化文库甲基化转化率相关的位点作为参照位点，该评估方法克服了酶学转化法甲基化文库构建过程中甲基化文库C-T甲基化转化率受碱基序列影响的问题，利用该参照位点甲基化转化率能够快速评估甲基化文库甲基化转化率，并用于DNA甲基化检测中甲基化转化率的质控，方便快捷，解决了传统方法周期长、耗时、耗力等问题。同时提供了终端设备及计算机可读存储介质，能够根据参照位点的甲基化转化率输出文库甲基化转化率或输出文库是否合格的结果。合格的结果。合格的结果。


技术研发人员：王小庆 洪媛媛 王睿 聂佩瑶 夏瑞燕 吕芳 张琦 陈维之 杜波
受保护的技术使用者：臻悦生物科技江苏有限公司
技术研发日：2022.10.31
技术公布日：2022/11/29