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鉴别或辅助鉴别哺乳动物物种的探针组合物及其试剂盒与应用的制作方法

2022-11-16 15:58:12 来源:中国专利 TAG:

技术特征:
1.鉴别或辅助鉴别哺乳动物物种的探针组合物,其特征在于,所述探针组合物为对哺乳动物coi基因序列进行序列聚类得到代表性序列,针对代表性序列,每个snp位点设计探针覆盖,得到的探针组合物。2.根据权利要求1所述的鉴别或辅助鉴别哺乳动物物种的探针组合物,其特征在于:所述序列聚类为使用angiosperms353方法进行序列聚类,设置遗传距离为0.05,覆盖深度2x。3.根据权利要求2所述的鉴别或辅助鉴别哺乳动物物种的探针组合物,其特征在于:所述每个snp位点设计探针覆盖,为每个snp位点设计2条探针覆盖。4.根据权利要求1-3任一项所述的鉴别或辅助鉴别哺乳动物物种的探针组合物,其特征在于:所述探针组合物为由序列表序列1-序列3590所示的3590个单链dna组成的组合。5.利用探针组合物鉴别或辅助鉴别哺乳动物物种的方法,其特征在于:包括以权利要求1-4任一所述的探针组合物捕获待测哺乳动物的coi基因,建库,通过二代测序高通量检测获得coi基因的dna序列,根据得到的coi基因序列确定待测哺乳动物物种。6.鉴别或辅助鉴别哺乳动物物种的试剂或试剂盒,其特征在于:所述试剂或试剂盒包括权利要求1-4任一所述的探针组合物。7.权利要求1-4任一所述的探针组合物在鉴别或辅助鉴别哺乳动物物种中的应用。8.权利要求1-4任一所述的探针组合物在制备鉴别或辅助鉴别哺乳动物物种产品中的应用。9.权利要求5所述的方法在鉴别或辅助鉴别哺乳动物物种中的应用。10.权利要求5所述的方法在制备鉴别或辅助鉴别哺乳动物物种产品中的应用。11.权利要求6所述的试剂或试剂盒在鉴别或辅助鉴别哺乳动物物种中的应用。

技术总结
提供了鉴别或辅助鉴别哺乳动物物种的探针组合物及试剂盒。探针组合物为序列表序列1-序列3590所示的核苷酸探针。利用探针捕获目标物种的COI基因,以此建库用二代测序高通量检测的方法获得COI基因的DNA序列,可以同时兼顾一代测序灵活、方便、可以快速得到结果的优点,同时解决一代测序中存在的批量样本操作繁琐的问题,以及避免一代测序部分结果不稳定造成无法得到准确COI基因序列的风险。将探针开发成哺乳动物COI基因捕获试剂盒,可实现对哺乳动物物种的快速、批量鉴别。批量鉴别。


技术研发人员:由玉岩
受保护的技术使用者:北京动物园管理处
技术研发日:2021.05.28
技术公布日:2022/11/15
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